Sed0010208 (gene) Chayote v1

Overview
NameSed0010208
Typegene
OrganismSechium edule (Chayote v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP1-like
LocationLG11: 30146569 .. 30155912 (+)
RNA-Seq ExpressionSed0010208
SyntenySed0010208
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR
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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGGCGACAGAGCGCGAGGAGATTCGCTACGAAGGCGGCGGAAGAGGTGGGAAGTTCCAGAAACGGCCGCCGAGAAGGCCGCATACGACGCCGTATGATCGCCCGCCGGCTTCTCTGCGAAACAATTCCGCCGGAAAAGGATGGCTCTCTAAGATTGTCGATCCGGCGCAGAAGCTCATCGCCTCCAGCGCGCACAGGCTTTTTTCTAGCGTGTTTCGTAAACGCCTCCCTGCTCCGCCCCCGCCCCCGCCGCCGCTGCCATTCCCGGCTTCTCCAGAGGCTAATGACGAGATGGGAAATGAGAACCAAGAAGAAGTTGCAGCTGATCCTCCGGGAGTTCTAGAAGAGAAGAATCTCAGTTTGGTTCCAGGTATCGAATCTGATAACACACATGGGGTGACTGACCTTGAGCAAATGTTGAAGGAGAAGACCTTTACCAAATTTGAGATTGATCGCTTGACTGAACTTCTGAAATCAAGAGTGGCCGATGTTCCAAGTGGGGTTGAAGGGAGGAAATTTGAACAAGTTCCTTCAAAGCCTGTTATCAGTTACGGAATACACGAAAGATCTCCAAAATTTCCACCTCAAGATGGAGTTAGCTCTCACATTGTTCCAACCCATGATATGAGTGCAAAGGTCCTTAATGAGGATGTTGCTTCACCGGCACAGATTGCAAAAATGTACATGGGTGGCAGACCTCTTAAAGCAACTCCGTTGAGTATGGCGTCTAGCAGTCAAAAGTTAGGGGATAGTTTTGTTTCTGGAGATACCTCGAAATCCTCTACTTTATCTCTTGTGCCAAGGTCTCCTGGGAATTTTGATGTTAATGAAAATGGTTTTGTCACCCCAAGATCTCGAGGCAGATCTGCTCTATACAGTATGGCCCGTACACCATATTCTAGAGTTAGTGCAACCCCTAGTATAAAGAATAGTGTAGCAACGATAGATGCTTACAGCAGGGCAACAGGATCGTCATTGTCCCAGTCAGCGTTGGAGCAAGGGAGACTTTTGGGGTCTAATCAAGGGGCTTTAAAATGCAGACGCTCTGTTTTAGACGAGGAAATGGGATCTGTTGGTTCTATTCGAAGAATTCGTCAGAAATCCAATCTCCTTTACCCAAAAGGTTTGAGTACACCTAGCAGTTTCACTTTTATTCCAGTAAGGGGAATTGGTTCTGAGACTGCCCGGCATTTTCTGTCTTCAAAAGTGCATCCATTTTCATCTTCTGCTGGGAAGACACTTCATCCGGGCGACACGAAGGGCAGTTTGTCCAAAGTGTCTGCAGATTCCGAAAACGACATGAATCCTAGTTCAAGTTTCAATCAAATTCCCCTCAGGTCTAGTGAGATGGCATCGAAAATATTAGAGCAGCTTGAGACATTGACCCCTCAAAAGGAGAAGTCTTCGGAACTAAAGCTGCTTAGTGTGAGAAGTAATTCACCCATGAAGTTGTCACCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTGGATTCATCCAAGTATTTGAAAAATGTTGAAGACATTCGGTCTAATGATGCTCGGGATCATACTACTCTAGATAATGGCAAGGTTGAGGAAAGGTCTTCGTTAAAATTTAAAGTTCCCAATGATAAATCTATTTCTACAGCATGTGATGGTGCAAGTTCTTCAGGTCTTATGAAGGACGCTGTACCTAGTTCTGGTCTGCAAGTTTCATTTGTTGGCCCTTCCTCACAAACAAAATGTTCTTTCCAGATGAGTGCACTTGAGGATTTTGAGGATCTGGATGAAGAAGGATATTCTAATGGGCCAGTGACTGACATATCATTGGCAGTGAGTAAACCAAGTGACACTGAAGCCATCACAGTACTAGACAAACCTCGGGCTTCGGTCGAGGTTAAACCATCCACTTTATCTGAAATGAAGAAAATAAATGACCAAAGAAAATCTGATGCTCCTGTGACTACCGGAAAGAGTCCCATCTCCTTTGCAACAGCATCTTCACCTAGCATTACAGCCAATGCGATAGTTCCTGAATCAACCTCGAGACCTGAAATAACCGTTTCATCTGAGGTACCTAAAACAACCATTGCCCCTTTGTTTGGCTTTGGAAATAAGTTGCCATCACAAACGGAATCAATTTCTTCGGCCCCTACGTTTACCTTTGGTAACAAGGTTGCCACTTTAGCAAATGAACAAAATGCTGTCCCTGTTGTAGCTTCTGAAAGCAATGTTGCACCAACTCAACAAACTTCTGTTCCTTCCACATTTACATTTGGCGATAAAACTACAGCTTCTATTCCAGAAAACGCGGCTACAGAGAATGGAATTAAGAATGTTGGGTTGCCGTTGAAGTTTGCATCACCTTCAGTTAATGAAAAGGAAAGTGCTAGAGTTGATAGTGTTTCAGTTTTGAAAGCAGAGATTTCTAGCAGCAGCATCCGGTCGTTTGGAGTTTCGAAAGAGTTCATGTCTGGTAATAAAGCTGGTGATAAGAGTTCGAGTGCTGGTCTTTCAGTTGGTACATTTGAGAACTTGTTTTCATCTGTTTCAACATCAACGCCAACTCCCAGTTTATTTTCCTTAAGCTCCCCTAGCACTAATTCAAATCTTAATAATGGATCTCTTGTTCCTACCCCATCTATTGTCACCCCGTCTATTGTTTCCTTCTCAGCCACCTCATTTTCTAAAGATATATCAAATCAAAATTCATCCATCAAACCCTCCCTCACTGCTACCCCTCACAACAGTGAACCGGCCGCCACTGCTAGTCTTTCTACGTCTTCTCCTATCCCATCTTTTTCAGCTGCACCTATTTTCAAATTTGGGAGCCCTAGCGTTCCTTCAACTTCTGCACCAGCTTTATCAGCACCGAGTGGAGTTGGATCCGTAGAAACCAAGACCACACTAGAGACAACCCTTGGCAATTTAAGCGGCACTCCTCCAAGCGACACTTCTGCTGCTAAAGCATCTAGTACTGGAAACAGCATTTTTCAATTCGGAGCTCCAGCTACTGCAGATTCTAATAAACAACCAGTAAGTTCTACTTTTTCCCAAGGCAATGGTACTGCATTTGGTGCTCCAGTTTCGCCTGCTAGTAGTGGTCCTGCATCTTCTACTCAGAGTACGCCTGTTTTTCCATTTAGTTCATCATCTACATCATTTGGTTTGGCTGGGAATACGGGTCTGTCTTCTGGCAGTTCTCTTTTTGGTTCTTCAGCTCCAGCATCCAATTTGTTCACTTCTGGAACGACTCTCGGACTTGCTTCTTCCAGTTCGTCGGCTAGTAATTCTGTCAGCTCCGGTGCTGGCACTAGTTCAAGCTTATCTAACTGGCAATCATCCTCCACGCCATCGTTTTCTACTGGATTTAGCTCAACTCCAACTGGAGTGTTCTCCTTTGGTCTTTCATCTTCTTCGACTACTTCTAACAGTGCACCTGTCGTCTTTGGATCATCGTCCACTGGTGCAGCAACAGCCCCAATGTTCTCATTTACTTCAGCTGCATCGTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCAACGTCACAACCTGCTTTTGGTAATTCGTCGTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCGTCGTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCGTCGTCACAGCCTGCTTTCGGTACTTTGTCGTCACAGCCCGCTTTCGGTACTTCGTCGTCACAGCCCGCTTTCGATACTTCGTCGTCACAGCCCGCTTTCGGTACTTCGTCGTCACAGCCCGCTTTCGGTACTTCTTCGTCACAGCCCGCTTTTGGTACTTCGTCGTCACAGCCCGCTTTCGGGTCACAGCCTGCTTTCGGGTCACAGCCTGCTTTCGGGTCACAGCCTTCTTTCGGTACTTCGTCGTCACAGCCTGCTTTCGGTACTTCGTCGTCACAGCCTGCTTTCGGTCATTTGTCGTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCACAGCCTGCTTTTGGTAATTCGTCGTCACAGCCTGCTTTCGCTATTTCTAATCCTGGCTTCACTTTTGGTTCAACACCTCTTGCTAATAATTTTCAAGCCAACACGGAGGATAGCATGGCTGAGGATGGCGTTCAGGCAGTCGCAACGCCTACGCCAATGCCTACTTTTGGGCAACAGCCCCTCACACCACCTCCATCATCAGGTTATATGTTTGGTTCAACAGCCCCTTCTCCGCAAGCAGCAAGCCCTTTCCAATTTGGTAATCAGCAAAATGTTCCTAGCCCACAAAATCCCTCTCTATTTCAGGCTTCTGGTAGCTTCAATGCTCCCAGTGCTGGAGGGAGCTTCTCATTGGGCGCCGGTGGTGGCGACAAAGCGAACCGAAAATACATAAGAGTTAAAAACAGCAAATCACGAAGGAAGTAG

Protein sequence

MATEREEIRYEGGGRGGKFQKRPPRRPHTTPYDRPPASLRNNSAGKGWLSKIVDPAQKLIASSAHRLFSSVFRKRLPAPPPPPPPLPFPASPEANDEMGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELLKSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNEDVASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNENGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLLGSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARHFLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQLETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDARDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQTKCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDISLAVSKPSDTEAITVLDKPRASVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPISFATASSPSITANAIVPESTSRPEITVSSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPTQQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAEISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLFSSVSTSTPTPSLFSLSSPSTNSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLSTSSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGTPPSDTSAAKASSTGNSIFQFGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFPFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSSSLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAATAPMFSFTSAASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQPAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQNVPSPQNPSLFQASGSFNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK
Homology
[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. NCBI nr
Match: XP_022956154.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita moschata])

HSP 1 Score: 1414.4 bits (3660), Expect = 0.0e+00
Identity = 900/1369 (65.74%), Postives = 971/1369 (70.93%), Query Frame = 0 

Query: 1    MGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELL 60
            MGNEN EEVAAD PG  E  N    P I++DNTHGVTDLEQ+LKEKTFT+FEIDRLTELL
Sbjct: 91   MGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELL 150

Query: 61   KSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNED 120
            KSRV DVPSG E RKFEQ PS PVISY I E SPKF  QDG+SSH+VPT  M A VL+ED
Sbjct: 151  KSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDGISSHVVPTQVMRANVLDED 210

Query: 121  VASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNE 180
            VASPA+IAK YMG RP K+TPLSMAS S K GDSF S + SKSS L+LVPRSPGNFDV E
Sbjct: 211  VASPAEIAKAYMGSRPPKSTPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIE 270

Query: 181  NGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLL 240
            NGFVTPRSRGRSALY+MAR PYS VSAT SIKNSVAT DAY RATGSS SQ A E+GR+L
Sbjct: 271  NGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAY-RATGSSSSQLAWERGRVL 330

Query: 241  GSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARH 300
            GS QGALK R SVLD+EMG VG IRR+R KSNLLYP GLS PSS T IPV GIGSE A+ 
Sbjct: 331  GSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQ 390

Query: 301  FLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQ 360
            F S+KVHPFSSS+GK L+      SLSK SA+SEND+ PSSSF+QIPLRSSEMASKILEQ
Sbjct: 391  FQSTKVHPFSSSSGKGLY----SRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQ 450

Query: 361  LETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDA 420
            LE LTP K+KSS+LKLLSV +NSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYL+NVEDI+SNDA
Sbjct: 451  LEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDA 510

Query: 421  RDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQT 480
            R+ T+  N KVEE SSLK+K+P +K IS A DG  S    KD V SS  QVSFVG S QT
Sbjct: 511  RELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEIS-AGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQT 570

Query: 481  KCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDIS-----------LAVSKPSDTEAITVLDKPRA 540
            KC+FQMSA EDF D+DEEG SNGPVTDIS           +A+SKPSDTEAITV DKP+A
Sbjct: 571  KCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITV-DKPQA 630

Query: 541  SVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITV 600
            S EVKPST+SE+ KIN QRKSD PVT  KSPI SFATAS PSIT NA  PEST RPE  +
Sbjct: 631  SAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNI 690

Query: 601  SSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPT 660
            S E PK   AP+FGFG+KLPSQ ES SSAPTF FGNK A   NEQNAVPV  SESNVAP 
Sbjct: 691  SPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP- 750

Query: 661  QQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAE 720
                         K T  IP NAATENG KN G P KFASP VNEKESA+V S SV KAE
Sbjct: 751  ------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAE 810

Query: 721  ISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLF-SSVSTSTPTPSLFSLSSPST 780
             +SSSI SFGV KE MS +KAGDKS SAGLSVGT ENLF SSVSTST  PSLFS SSPST
Sbjct: 811  SNSSSILSFGVPKESMS-DKAGDKSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPST 870

Query: 781  NSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLST 840
            NSNLNNGSLV      TPSI S  AT+FS +I+NQN SIKPSLT  P NSEPA T SLS 
Sbjct: 871  NSNLNNGSLVS-----TPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSM 930

Query: 841  SSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGTPPSDTSA 900
             SP+PSFSAAPIFKFGSPSVPS+SAPALSA       ETKT  ETT GNLSG PPSDTSA
Sbjct: 931  PSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSA------AETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSA 990

Query: 901  AKASSTGNSIFQFGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFP 960
            AK SSTG S+FQFGA AT DSNK+P +ST + GN   FGAPV PA+SG ASSTQSTPV P
Sbjct: 991  AKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLP 1050

Query: 961  FSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSS 1020
            FSSSSTSFGLA NTGLSSGSSLFGSSAPASNLF+SGTT GL  +SSSA+NSVSSGAGTSS
Sbjct: 1051 FSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSS 1110

Query: 1021 SLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAATAPMFSFTS 1080
            S  NWQ+SSTPSFSTGFSSTPTG F FGLSSSS  SNS+P++FGSS+T A+T  MFSFTS
Sbjct: 1111 SFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS 1170

Query: 1081 AASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQP 1140
            AASSQPAF N                                                  
Sbjct: 1171 AASSQPAFSN-------------------------------------------------- 1230

Query: 1141 AFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTSS 1200
                                                                        
Sbjct: 1231 ------------------------------------------------------------ 1272

Query: 1201 SQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQAN 1260
                                                     SN GFTFGSTP ANN QAN
Sbjct: 1291 -----------------------------------------SNHGFTFGSTPPANNDQAN 1272

Query: 1261 TEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQNVPS 1320
             EDSMAED VQAV  PT  PTFGQQPLTPPPSSG+MFGS AP P AASPFQFG+QQN P+
Sbjct: 1351 MEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPT 1272

Query: 1321 PQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            PQNPS F ASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDKANRKY++VK SKSR+K
Sbjct: 1411 PQNPSPFHASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVK-SKSRKK 1272

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. NCBI nr
Match: KAG7032922.1 (Nuclear pore complex protein NUP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma])

HSP 1 Score: 1409.8 bits (3648), Expect = 0.0e+00
Identity = 902/1378 (65.46%), Postives = 972/1378 (70.54%), Query Frame = 0 

Query: 1    MGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFT---------KF 60
            MGNEN EEVAAD PG  E  N    P I++DNTHGVTDLEQ+LKEKTFT         KF
Sbjct: 91   MGNENHEEVAADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRQVFECLLVKF 150

Query: 61   EIDRLTELLKSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHD 120
            EIDRLTELLKSRV DVPSG E RKFEQ PS PVISY I E SPKF  QDG+SSH+VPT  
Sbjct: 151  EIDRLTELLKSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDGISSHVVPTQV 210

Query: 121  MSAKVLNEDVASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPR 180
            M A VL+EDVASPA+IAK YMG RP KATPLSMAS S K GDSF S + SKSS L+LVPR
Sbjct: 211  MRANVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPR 270

Query: 181  SPGNFDVNENGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQ 240
            SPGNFDV ENGFVTPRSRGRSALY+MAR PYS VSAT SIKNSVAT DAY RATGSS SQ
Sbjct: 271  SPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAY-RATGSSSSQ 330

Query: 241  SALEQGRLLGSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVR 300
             A E+GR+LGS QGALK R SVLD+EMG VG IRR+R KSNLLYP GLS PSS T IPV 
Sbjct: 331  LAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVS 390

Query: 301  GIGSETARHFLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSS 360
            GIGSE A+ F S+KVHPFSSS+GK L+      SLSK SA+SEND+ PSSSF+QIPLRSS
Sbjct: 391  GIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLY----SRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSS 450

Query: 361  EMASKILEQLETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKN 420
            EMASKILEQLE LTP K+KSS+LKLLSV +NSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYL+N
Sbjct: 451  EMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLEN 510

Query: 421  VEDIRSNDARDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQV 480
            VEDI+SNDAR+ T+  N KVEE SSLK+K+P +K IS A DG  S    KD V SS  QV
Sbjct: 511  VEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEIS-AGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQV 570

Query: 481  SFVGPSSQTKCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDIS-----------LAVSKPSDTEA 540
            SFVG S QTKC+FQMSA EDF D+DEEG SNGPVTDIS           +A+SKPSDTEA
Sbjct: 571  SFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEA 630

Query: 541  ITVLDKPRASVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPE 600
            ITV DKP+AS EVKPST+SE+ KIN QRKSD PVT  KSPI SFATAS PSIT NA  PE
Sbjct: 631  ITV-DKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPE 690

Query: 601  STSRPEITVSSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVV 660
            ST RPE  +S E PK   AP+FGFG+KLPSQ ES SSAPTF FGNK A   NEQNAVPV 
Sbjct: 691  STLRPEKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVA 750

Query: 661  ASESNVAPTQQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARV 720
             SESNVAP              K T  IP NAATENG KN G P KFASP VNEKESA+ 
Sbjct: 751  TSESNVAP-------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKG 810

Query: 721  DSVSVLKAEISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLF-SSVSTSTPTPS 780
             S SV KAE +SSSI SFGV KE MS +KAGDKSSSAGLSVGT ENLF SSVSTST  PS
Sbjct: 811  GSSSVSKAESNSSSILSFGVPKESMS-DKAGDKSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPS 870

Query: 781  LFSLSSPSTNSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSE 840
            LFS SSPSTNSNLNNGSLV      TPSI S  AT+FS +I+NQN SIKPSLTA P N E
Sbjct: 871  LFSFSSPSTNSNLNNGSLVS-----TPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTAAPSNGE 930

Query: 841  PAATASLSTSSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLS 900
            PA T SLS  SP+PSFSAAPIFKFGSPSVPS+SAPALSA       ETKT  ETT GNLS
Sbjct: 931  PATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSA------AETKTKQETTFGNLS 990

Query: 901  GTPPSDTSAAKASSTGNSIFQFGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPAS 960
            G PPSDTSAAK SSTG S+FQFGA AT DSNK+P +ST + GN   FGAPV PA+SG AS
Sbjct: 991  GIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVAS 1050

Query: 961  STQSTPVFPFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNS 1020
            STQSTPV PFSSSSTSFGLA NTGLSSGSSLFGSSAPASNLF+SGTT GL  +SSSA+NS
Sbjct: 1051 STQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNS 1110

Query: 1021 VSSGAGTSSSLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAA 1080
            VSSGAGTSSS  NWQ+SSTPSFSTGF STPTG F FGLSSSS  SNS+P++FGSS+T A+
Sbjct: 1111 VSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSAS 1170

Query: 1081 TAPMFSFTSAASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQP 1140
            T  MFSFTSAASSQPAFGN                                         
Sbjct: 1171 TTSMFSFTSAASSQPAFGN----------------------------------------- 1230

Query: 1141 AFGTSSSQPAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFG 1200
                                                                        
Sbjct: 1231 ------------------------------------------------------------ 1281

Query: 1201 SQPSFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGST 1260
                                                              SN GFTFGST
Sbjct: 1291 --------------------------------------------------SNHGFTFGST 1281

Query: 1261 PLANNFQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQ 1320
            P ANN QAN EDSMAED +QAV  PT  PTFGQQPLTPPPSSG+MFGS AP P AASPFQ
Sbjct: 1351 PPANNDQANMEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQ 1281

Query: 1321 FGNQQNVPSPQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            FG+QQN P+PQNPS FQASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDKANRKY++VK SKSR+K
Sbjct: 1411 FGSQQNAPAPQNPSPFQASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVK-SKSRKK 1281

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. NCBI nr
Match: XP_023527371.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo])

HSP 1 Score: 1403.3 bits (3631), Expect = 0.0e+00
Identity = 896/1370 (65.40%), Postives = 970/1370 (70.80%), Query Frame = 0 

Query: 1    MGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELL 60
            MGNEN EEVAAD PG  E  N    P I++DNTHGVTDLEQ+LKEKTFT+FEIDRLTELL
Sbjct: 91   MGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELL 150

Query: 61   KSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNED 120
            KSRV DVPSGVE RKFEQ PS PVISY I E SPKF  QDG+SSH+VPT  M A VL+ED
Sbjct: 151  KSRVVDVPSGVEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDGISSHVVPTQVMRANVLDED 210

Query: 121  VASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNE 180
            VASPA+IAK YMG RP KATPLSMAS S K GDSF S + SKSS L+LVPRSPGNFDV E
Sbjct: 211  VASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIE 270

Query: 181  NGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLL 240
            NGFVTPRSRGRSALY+MAR PYS VSAT SIKNSVAT DAY RATGSS SQ A E+GR+L
Sbjct: 271  NGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAY-RATGSSSSQLAWERGRVL 330

Query: 241  GSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARH 300
            GS QGALK R SVLD+EMG VG IRR+R KSNLLYP GLS PSS T IPV GIGSE A+ 
Sbjct: 331  GSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQ 390

Query: 301  FLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQ 360
            F S+KVHPFSSS+GK L+      SLSK SA+SEND+ PSSSF+QIPLRSSEMASKILEQ
Sbjct: 391  FQSTKVHPFSSSSGKALY----SRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQ 450

Query: 361  LETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDA 420
            LE LTP K++SS+LKLLSV +NSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYL+NVEDI+SNDA
Sbjct: 451  LEKLTPPKDRSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDA 510

Query: 421  RDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQT 480
            R+ T+  N KVEE SSLK+K+P DK+IS A DG  S    KD V SS  QV+FVG S QT
Sbjct: 511  RELTSQKNNKVEESSSLKYKLPIDKAIS-AGDGLGSLVPTKDTVLSSRPQVAFVGASPQT 570

Query: 481  KCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDISL-----------AVSKPSDTEAITVLDKPRA 540
            KC+FQMSA EDF D+DEEG SNGPVTDIS            A+SKP+DTEAITV DKP+A
Sbjct: 571  KCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDGSLAAMSKPNDTEAITV-DKPQA 630

Query: 541  SVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITV 600
            S EVKPST SE+ K+N QRKSD PV   KSPI SFATAS PSI ANA  PEST RPE  +
Sbjct: 631  SAEVKPSTASELNKMNGQRKSDVPVIAEKSPIFSFATASPPSIIANAKDPESTLRPEKNI 690

Query: 601  SSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPT 660
            S E PK   AP+FGFG+KLPSQ ES SSAPTF FGNK A   NEQNAVPV  SESNVAP 
Sbjct: 691  SPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVANSESNVAP- 750

Query: 661  QQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAE 720
                         K T  IP NAATENG KN G P KFASP VNEKE A+V S SV KAE
Sbjct: 751  ------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKERAKVGSSSVFKAE 810

Query: 721  ISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLF-SSVSTSTPTPSLFSLSSPST 780
             +SSSI SFGV KE MS +KAGDKSSSAGLSVGT ENLF SSVSTST +PSLFS SSPST
Sbjct: 811  SNSSSILSFGVPKESMS-DKAGDKSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSSPSLFSFSSPST 870

Query: 781  NSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPA-ATASLS 840
            NSNLNNGSLV      TPSI S  AT+FS +I+NQN SIKPSLT  P NSEPA  T SLS
Sbjct: 871  NSNLNNGSLVS-----TPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTTSLS 930

Query: 841  TSSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGTPPSDTS 900
              SP+PSFSAAPIFKFGSPSVPS+SAPALSA       ETKT  ETT GNLSG PPSDTS
Sbjct: 931  MPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSA------AETKTKQETTFGNLSGIPPSDTS 990

Query: 901  AAKASSTGNSIFQFGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVF 960
            AAK SSTG S+FQFGA AT DSNK+P +ST + GN   FGAPV PA+SG ASSTQSTPV 
Sbjct: 991  AAKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVL 1050

Query: 961  PFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTS 1020
            PFSSSSTSFGLA NTGLSSGS LFGSSAPASNLF+ GTT GL ++SSSA+NSVSSGAGTS
Sbjct: 1051 PFSSSSTSFGLAANTGLSSGSYLFGSSAPASNLFSPGTTFGLTATSSSANNSVSSGAGTS 1110

Query: 1021 SSLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAATAPMFSFT 1080
            SS  NWQ+SSTPSFSTGFSSTPTG F FGLSSSS  SNS+P++FGSS+T A+T  MFSFT
Sbjct: 1111 SSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFT 1170

Query: 1081 SAASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQ 1140
            SA SSQPAFGN                                                 
Sbjct: 1171 SAVSSQPAFGN------------------------------------------------- 1230

Query: 1141 PAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTS 1200
                                                                        
Sbjct: 1231 ------------------------------------------------------------ 1273

Query: 1201 SSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQA 1260
                                                      SN GFTFGSTP ANN QA
Sbjct: 1291 ------------------------------------------SNHGFTFGSTPPANNDQA 1273

Query: 1261 NTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQNVP 1320
            N EDSMAED VQAV  PT  PTFGQQPLTPPPSSG+MFGS AP P AASPFQFG+QQN P
Sbjct: 1351 NMEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAP 1273

Query: 1321 SPQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            +PQNPS F ASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDKANRKY++VK SKSR+K
Sbjct: 1411 TPQNPSPFHASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVK-SKSRKK 1273

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. NCBI nr
Match: KAG6602242.1 (Nuclear pore complex protein NUP1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia])

HSP 1 Score: 1402.1 bits (3628), Expect = 0.0e+00
Identity = 897/1369 (65.52%), Postives = 969/1369 (70.78%), Query Frame = 0 

Query: 1    MGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELL 60
            MGNEN EEVAAD PG  E  N    P I++DNTHGVTDLEQ+LKEKTFT+FEIDRLTELL
Sbjct: 91   MGNENHEEVAADLPGTQEGTNHDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELL 150

Query: 61   KSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNED 120
            KSRV DVPSG E RKFEQ PS PVISY I E SPKF  QDG+SSH+VPT  M A VL+ED
Sbjct: 151  KSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDGISSHVVPTQVMRANVLDED 210

Query: 121  VASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNE 180
            VASPA+IAK YMG RP KATPLSMAS S K GDSF S + SKSS L+LVPRSPGNFDV E
Sbjct: 211  VASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIE 270

Query: 181  NGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLL 240
            NGFVTPRSRGRSALY+MAR PYS VSAT SIKNSVAT DAY RATGSS SQ A E+ R+L
Sbjct: 271  NGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAY-RATGSSSSQFAWERVRVL 330

Query: 241  GSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARH 300
            GS QGALK R SVLD+EMG VG IRR+R KSNLLYP GLS PSS T IPV GIGSE A+ 
Sbjct: 331  GSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQ 390

Query: 301  FLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQ 360
            F S+KVHPFSSS+GK L+      SLSK SA+SEND+ PSSSF+QIPLRSSEMASKILEQ
Sbjct: 391  FQSTKVHPFSSSSGKGLY----SRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQ 450

Query: 361  LETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDA 420
            LE LTP K+KSS+LKLLSV +NSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYL+NVEDI+SNDA
Sbjct: 451  LEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDA 510

Query: 421  RDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQT 480
            R+ T+  N KVEE SSLK+K+P +K IS A DG  S    KD V SS  QVSFVG S QT
Sbjct: 511  RELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEIS-AGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQT 570

Query: 481  KCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDIS-----------LAVSKPSDTEAITVLDKPRA 540
            KC+FQMSA EDF D+DEEG SNGPVTDIS           +A+SKPSDTEAITV DKP+A
Sbjct: 571  KCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPSDTEAITV-DKPQA 630

Query: 541  SVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITV 600
            S EVKPST+SE+ KIN QRKSD PVT  KSPI SFATAS PSIT NA  PEST RPE  +
Sbjct: 631  SAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAVKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNI 690

Query: 601  SSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPT 660
            S E PK   AP+FGFG+KLPSQ ES SSAPTF FGNK A   NEQN VPV  SESNVAP 
Sbjct: 691  SPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNDVPVATSESNVAP- 750

Query: 661  QQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAE 720
                         K T  IP NAATENG KN G P KFASP VNEKESA+V S SV KAE
Sbjct: 751  ------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVSKAE 810

Query: 721  ISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLF-SSVSTSTPTPSLFSLSSPST 780
             +SSSI SFGV KE MS +KAGDKSSSAGLSVGT ENLF SSVSTST  PSLFS SSPST
Sbjct: 811  SNSSSILSFGVPKESMS-DKAGDKSSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPST 870

Query: 781  NSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLST 840
            NSNLNNGSLV      TPSI S  AT+FS +I+ QN SIKPSLTA P N EPA T SLS 
Sbjct: 871  NSNLNNGSLVS-----TPSIFSSPATTFSNNIT-QNPSIKPSLTAAPSNGEPATTTSLSM 930

Query: 841  SSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGTPPSDTSA 900
             SP+PSFSAAPIFKFGSPSVPS+SAPALSA       ETKT  ETT GNLSG PPSDTSA
Sbjct: 931  PSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSA------AETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSA 990

Query: 901  AKASSTGNSIFQFGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFP 960
            AK SSTG S+FQFGA AT DSNK+P +ST + GN   FGAPV PA+SG ASSTQSTPV P
Sbjct: 991  AKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSASGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLP 1050

Query: 961  FSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSS 1020
            FSSSSTSFGLA NT LSSGSSLFGSSAPASNLF+SGTT GL  ++SSA+NSVSSGAGTSS
Sbjct: 1051 FSSSSTSFGLAANTVLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTNSSANNSVSSGAGTSS 1110

Query: 1021 SLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAATAPMFSFTS 1080
            S  NWQ+SSTPSFSTGF STPTG F FGLSSSS  SNS+P++FGSS+T A+T  MFSFTS
Sbjct: 1111 SFFNWQTSSTPSFSTGFGSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS 1170

Query: 1081 AASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQP 1140
            AASSQPAFGN                                                  
Sbjct: 1171 AASSQPAFGN-------------------------------------------------- 1230

Query: 1141 AFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTSS 1200
                                                                        
Sbjct: 1231 ------------------------------------------------------------ 1271

Query: 1201 SQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQAN 1260
                                                     SN GFTFGSTP ANN QAN
Sbjct: 1291 -----------------------------------------SNHGFTFGSTPPANNDQAN 1271

Query: 1261 TEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQNVPS 1320
             EDSMAED +QAV  PT  PTFGQQPLTPPPSSG+MFGS AP P AASPFQFG+QQN P+
Sbjct: 1351 MEDSMAEDTIQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPA 1271

Query: 1321 PQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            PQNPS FQASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDKANRKY++VK SKSR+K
Sbjct: 1411 PQNPSPFQASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVK-SKSRKK 1271

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. NCBI nr
Match: XP_038884354.1 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida])

HSP 1 Score: 1398.6 bits (3619), Expect = 0.0e+00
Identity = 902/1377 (65.50%), Postives = 982/1377 (71.31%), Query Frame = 0 

Query: 1    MGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELL 60
            M N NQEEVAADPP   E  N+  VP I S+NTHGV+DLE++LKEKTFT+FEIDRLTELL
Sbjct: 91   MENRNQEEVAADPPVTQEGTNVDFVPSINSNNTHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELL 150

Query: 61   KSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFP--PQDGVSSHIVPTHDMSAKVLN 120
            KSRVADVPSGVE  K EQVPS PVISYG  E  PKFP   QDGVS H+V TH +SA VL+
Sbjct: 151  KSRVADVPSGVESGKLEQVPSTPVISYGKQEGCPKFPAQSQDGVSPHMVSTHVVSANVLD 210

Query: 121  EDVASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDV 180
            EDVASPA+IAK YMG RP KATPLSMAS SQK GD F  G+ SKS TLSL+PRSPGNFDV
Sbjct: 211  EDVASPAEIAKAYMGSRPPKATPLSMASHSQKFGDGFSLGNPSKSPTLSLMPRSPGNFDV 270

Query: 181  NENGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGR 240
             ENGFVTPRSRGRSALYSMAR PYSRV ATPSIKNSVAT DAY RAT SS SQSA  QGR
Sbjct: 271  -ENGFVTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDAY-RATSSS-SQSAWGQGR 330

Query: 241  LLGSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETA 300
            LLGS QGALK R SVLD+EMGSVG IRRIR KSN L+PKGLS PSS T IPV GIGSET+
Sbjct: 331  LLGSEQGALKRRNSVLDDEMGSVGPIRRIRHKSNHLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETS 390

Query: 301  RHFLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKIL 360
            +H  S+KVHPFSS+ GK L+  +TK +LSK+SA+SENDM PSSSF QIPLRSSEMASKIL
Sbjct: 391  QHLQSTKVHPFSSTGGKGLYSSETKRNLSKMSAESENDMIPSSSFPQIPLRSSEMASKIL 450

Query: 361  EQLETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSN 420
            EQL+ LTP KEKSSELKLLSVR+NSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KYL+NVE IRSN
Sbjct: 451  EQLDKLTPPKEKSSELKLLSVRNNSPSKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEGIRSN 510

Query: 421  DARDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSS 480
            DA D T+  N K EE S LKFKVPNDKSIST  +G  SS + K+ V  SG QVSFVGPS 
Sbjct: 511  DACDLTSKKNDKFEESSPLKFKVPNDKSISTG-NGVGSS-VPKETVSGSGQQVSFVGPSL 570

Query: 481  QTKCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDISL----------AVSKPSDTEAITVLDKPR 540
            QTKC+FQMSA EDF D+DEEGYSNGPV DIS+          AVSKP++TEAITV DKP+
Sbjct: 571  QTKCAFQMSAHEDFVDMDEEGYSNGPVADISIERQEKVNSLVAVSKPNNTEAITV-DKPQ 630

Query: 541  ASVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEIT 600
            AS+E KP T+S M KINDQ KSD PVTT KSPI SF T SSPSITAN I PES  RPE  
Sbjct: 631  ASIEAKPPTVSAMNKINDQGKSDVPVTTEKSPIFSFPTTSSPSITANVIGPESNMRPEKI 690

Query: 601  VSSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAP 660
             SSEVPK    P+FGFG K PSQ E++S APTF F NK+ T  NEQNA+PVV SE NV P
Sbjct: 691  ASSEVPKAATTPIFGFGEKFPSQKEAVSFAPTFAFVNKITTSTNEQNAIPVVTSEGNVQP 750

Query: 661  TQQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARV-DSVSVLK 720
            TQQ S P+TF FGDK T  IP NAATENG KN G PL FASP VNEKE A+   S SV K
Sbjct: 751  TQQASAPTTFKFGDKATFPIPANAATENGNKNEGSPL-FASPLVNEKEGAKEGGSASVFK 810

Query: 721  AEISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLFS---SVSTSTPTPSLFSLS 780
            AE SSSSI SFGV KE MS  KAGDKSSSAG +VGT  +LFS   S S STPT  LFS S
Sbjct: 811  AESSSSSIPSFGVPKESMS-EKAGDKSSSAGFAVGTSGSLFSSSVSTSISTPTSGLFSFS 870

Query: 781  SPSTNSNLNNGSLV-PTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAAT 840
            SPSTNSNLNNGSLV  TPS  TP      AT+FS +I+NQNSSIKPS  A   NSEP  T
Sbjct: 871  SPSTNSNLNNGSLVSTTPSFPTP------ATTFSNNITNQNSSIKPSFNAAASNSEPVTT 930

Query: 841  ASLSTSSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGTPP 900
             SL TSS +PSFSAAPI KFGS SVPSTSAPALSAPSGVGS+E+KT  ETT GNLSG PP
Sbjct: 931  TSLPTSSLMPSFSAAPISKFGSSSVPSTSAPALSAPSGVGSIESKTKQETTFGNLSGIPP 990

Query: 901  SDTSAAKASSTGNSIFQFGAPAT-ADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQ 960
            SD SA K SSTG+S+FQFGA +T +DSNK+P +STF+  N   FGA  SP SSG ASSTQ
Sbjct: 991  SDLSAVKVSSTGSSVFQFGAASTPSDSNKRPANSTFTPSNVPTFGASFSPVSSGLASSTQ 1050

Query: 961  STPVFPFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSS 1020
            STPV  F+SSSTSFGL GNTGL+SGSSLFGSSAPASNLF SG T GLASSSSS +NSVSS
Sbjct: 1051 STPVLQFNSSSTSFGLTGNTGLASGSSLFGSSAPASNLFASGPTFGLASSSSSVNNSVSS 1110

Query: 1021 GAGTSSSLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAATAP 1080
             AGTSSS  NWQ SSTPSFSTGFSSTPTG FSFGLSSSS  SNSAPV+FGSSSTG+ T  
Sbjct: 1111 SAGTSSSFFNWQPSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSAPVLFGSSSTGSLTPS 1170

Query: 1081 MFSFTSAASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFG 1140
            MFSFTSAA++      +TSQPAFGN                                   
Sbjct: 1171 MFSFTSAATA------TTSQPAFGN----------------------------------- 1230

Query: 1141 TSSSQPAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQP 1200
                                                                        
Sbjct: 1231 ------------------------------------------------------------ 1290

Query: 1201 SFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLA 1260
                                                           SN GFTFGSTP A
Sbjct: 1291 -----------------------------------------------SNHGFTFGSTPPA 1300

Query: 1261 NNFQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQF-G 1320
            NN QAN EDSMAED VQ V   +PMP+FGQQPLTPPPSSG++FGSTAP P  ASPFQF G
Sbjct: 1351 NNDQANMEDSMAEDTVQTVT--SPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAP-PLGASPFQFGG 1300

Query: 1321 NQQNVPSPQ-NPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            +QQNVP+PQ NPS FQASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDK+NRK+++VK SKSR+K
Sbjct: 1411 SQQNVPTPQNNPSPFQASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVK-SKSRKK 1300

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CAF4 (Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 238.4 bits (607), Expect = 4.7e-61
Identity = 398/1258 (31.64%), Postives = 582/1258 (46.26%), Query Frame = 0 

Query: 17   LEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELLKSRVADVPSGVEGRKF 76
            +E+ N S+ P  +     G TDLE++L+ KTFT+ E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ 
Sbjct: 131  MEDTNASVDPPKD-----GFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRN 190

Query: 77   EQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNEDVASPAQIAKMYMGGRP 136
            E      V     HER  +  P +G  + +V T   S + L+E +ASPAQ+AK YMG RP
Sbjct: 191  E--VGMVVRHPPSHERD-RTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGSRP 250

Query: 137  LKATPLSMASSSQK-LGDSFVSGDT---SKSSTLSLVPRSPGNFDVNENGFVTPRSRGRS 196
             + TP  +    Q    DS     T    KS T+SLV +  G   + ENGFVTPRSRGRS
Sbjct: 251  SEVTPSMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTKPSGQRPL-ENGFVTPRSRGRS 310

Query: 197  ALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLLGSNQG---ALKC 256
            A+YSMARTPYSR  ++  I +                S S  E+    GS QG    LK 
Sbjct: 311  AVYSMARTPYSRPQSSVKIGSLF------------QASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLKR 370

Query: 257  RRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARHFLSSKVHPF 316
            R SVLD ++GSVG +RRIRQKSN L  + L+ P S + + VR  G E             
Sbjct: 371  RSSVLDNDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSVRANGGE------------- 430

Query: 317  SSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQLETLTPQKE 376
                 KT H           S DS  D+ P SSFN +P +SSEMASKIL+QL+       
Sbjct: 431  -----KTTH----------TSKDSAEDI-PGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------- 490

Query: 377  KSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDARDHTTLDNG 436
                 KL+S R  SP KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+ + ++N     ++    
Sbjct: 491  -----KLVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKANS--PDSSYQKQ 550

Query: 437  KVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDA-VPSSGLQVSFVGPSSQ---TKCSFQ 496
            ++   S  +  +   +    A DG S +G  KD  +   G+ +       +    K SF+
Sbjct: 551  EISRESVSREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTNSLEEHPPKKRSFR 610

Query: 497  MSALEDFEDLDEE-GYSNGP--VTDISLAVSKPSDTEAITVLDKPRASVEVKPSTLSEMK 556
            MSA EDF +LD++ G ++ P  V +   A        ++ + +KP    E  PST     
Sbjct: 611  MSAHEDFLELDDDLGAASTPCEVAEKQNAFEVEKSHISMPIGEKPLTPSEAMPSTSYISN 670

Query: 557  KINDQRKSDAPVTTGKS-----PISFATASSPSITANAIVPESTSRPEITVSSEVPKTTI 616
                Q  S+  + T ++     PI     S+ +    +   + T +  I+      +   
Sbjct: 671  GDASQGTSNGSLETERNKFVAFPIEAVQQSNMASEPTSKFIQGTEKSSISSGKPTSEEKR 730

Query: 617  APLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPTQQTSVPSTF 676
             PL     + P +  ++   P  +F      L N+ +     +++  +  T  T+     
Sbjct: 731  IPL-----EEPKKPAAV--FPNISFSPPATGLLNQNSG---ASADIKLEKTSSTA----- 790

Query: 677  TFG-DKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEK-ESARVDSVSVLKAEISSSSIR 736
             FG  +  A   E+  T +   +       A+P++N    SA  ++V+   +  S +S  
Sbjct: 791  -FGVSEAWAKPTESKKTFSNSASGAESSTSAAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSNGSLTSSP 850

Query: 737  SFGVS-KEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTF--ENLFSSVSTSTPTPSLFSLSSP-STNSNL 796
            SF  S     S N  GD  S+      T    ++F  + TS  + S  + +SP S+ S  
Sbjct: 851  SFPPSISNIPSDNSVGDMPSTVQSFAATHNSSSIFGKLPTSNDSNSQSTSASPLSSTSPF 910

Query: 797  NNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLSTSSPI 856
              G   P      P+ VS S+   SK+   +N++   + T         A+A  ST    
Sbjct: 911  KFGQ--PAAPFSAPA-VSESSGQISKETEVKNATFGNTST---FKFGGMASADQSTGIVF 970

Query: 857  PSFSA----APIFKFGSPSV-------PSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGT 916
             + SA     P F FGS SV       PST+  A SAP   GS+    T  +T G  +  
Sbjct: 971  GAKSAENKSRPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTA--AASAPESSGSLIFGVTSSSTPGTETSK 1030

Query: 917  PPSDTSAAK------------------------ASSTGNSIFQFGA--PATADSNKQPVS 976
              + ++A                          ++STG+S+F F A   A+A S++   S
Sbjct: 1031 ISASSAATNTGNSVFGTSSFAFTSSGSSMVGGVSASTGSSVFGFNAVSSASATSSQSQAS 1090

Query: 977  STFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPV-FPFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSS 1036
            + F  GN     A      SG  +STQS P  F  S S+ SFGL+GN+ L+S SS FG S
Sbjct: 1091 NLFGAGN-----AQTGNTGSGTTTSTQSIPFQFGSSPSAPSFGLSGNSSLASNSSPFGFS 1150

Query: 1037 APASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGA---GTSSSLSNWQSSSTPSFSTGF--SSTP 1096
                 +FTS +T  L+S++SSAS+S +  +   GTS    N   +S P FS+ F  SSTP
Sbjct: 1151 KSEPAVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMSSPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSSSFTTSSTP 1210

Query: 1097 TGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGA-ATAPMFSFTSAASSQPAFGNSTSQPAFGNS 1156
            T  FSFG SS++T S++   +FG+S+    + +P+F F S   + P       QP FGNS
Sbjct: 1211 T-TFSFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNTPSPSPIFGFGSTPPTTP------QQPVFGNS 1270

Query: 1157 SSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQPAFDT--SSSQPAFGTSSSQP 1198
                    + SQ  FGNS+   AFG  ++      +      D+    +  A   S   P
Sbjct: 1271 -------GTPSQSLFGNSTPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSMEDSMAEDTDQANRASMVAP 1275

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GY88 (nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111457932 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1414.4 bits (3660), Expect = 0.0e+00
Identity = 900/1369 (65.74%), Postives = 971/1369 (70.93%), Query Frame = 0 

Query: 1    MGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELL 60
            MGNEN EEVAAD PG  E  N    P I++DNTHGVTDLEQ+LKEKTFT+FEIDRLTELL
Sbjct: 91   MGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELL 150

Query: 61   KSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNED 120
            KSRV DVPSG E RKFEQ PS PVISY I E SPKF  QDG+SSH+VPT  M A VL+ED
Sbjct: 151  KSRVVDVPSGAEERKFEQAPSTPVISYEIQEGSPKFRAQDGISSHVVPTQVMRANVLDED 210

Query: 121  VASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNE 180
            VASPA+IAK YMG RP K+TPLSMAS S K GDSF S + SKSS L+LVPRSPGNFDV E
Sbjct: 211  VASPAEIAKAYMGSRPPKSTPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIE 270

Query: 181  NGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLL 240
            NGFVTPRSRGRSALY+MAR PYS VSAT SIKNSVAT DAY RATGSS SQ A E+GR+L
Sbjct: 271  NGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAY-RATGSSSSQLAWERGRVL 330

Query: 241  GSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARH 300
            GS QGALK R SVLD+EMG VG IRR+R KSNLLYP GLS PSS T IPV GIGSE A+ 
Sbjct: 331  GSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQ 390

Query: 301  FLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQ 360
            F S+KVHPFSSS+GK L+      SLSK SA+SEND+ PSSSF+QIPLRSSEMASKILEQ
Sbjct: 391  FQSTKVHPFSSSSGKGLY----SRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQ 450

Query: 361  LETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDA 420
            LE LTP K+KSS+LKLLSV +NSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYL+NVEDI+SNDA
Sbjct: 451  LEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDA 510

Query: 421  RDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQT 480
            R+ T+  N KVEE SSLK+K+P +K IS A DG  S    KD V SS  QVSFVG S QT
Sbjct: 511  RELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEIS-AGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQT 570

Query: 481  KCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDIS-----------LAVSKPSDTEAITVLDKPRA 540
            KC+FQMSA EDF D+DEEG SNGPVTDIS           +A+SKPSDTEAITV DKP+A
Sbjct: 571  KCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITV-DKPQA 630

Query: 541  SVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITV 600
            S EVKPST+SE+ KIN QRKSD PVT  KSPI SFATAS PSIT NA  PEST RPE  +
Sbjct: 631  SAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFSFATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNI 690

Query: 601  SSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPT 660
            S E PK   AP+FGFG+KLPSQ ES SSAPTF FGNK A   NEQNAVPV  SESNVAP 
Sbjct: 691  SPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP- 750

Query: 661  QQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAE 720
                         K T  IP NAATENG KN G P KFASP VNEKESA+V S SV KAE
Sbjct: 751  ------------GKATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAE 810

Query: 721  ISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLF-SSVSTSTPTPSLFSLSSPST 780
             +SSSI SFGV KE MS +KAGDKS SAGLSVGT ENLF SSVSTST  PSLFS SSPST
Sbjct: 811  SNSSSILSFGVPKESMS-DKAGDKSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPST 870

Query: 781  NSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLST 840
            NSNLNNGSLV      TPSI S  AT+FS +I+NQN SIKPSLT  P NSEPA T SLS 
Sbjct: 871  NSNLNNGSLVS-----TPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSM 930

Query: 841  SSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGTPPSDTSA 900
             SP+PSFSAAPIFKFGSPSVPS+SAPALSA       ETKT  ETT GNLSG PPSDTSA
Sbjct: 931  PSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSA------AETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSA 990

Query: 901  AKASSTGNSIFQFGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFP 960
            AK SSTG S+FQFGA AT DSNK+P +ST + GN   FGAPV PA+SG ASSTQSTPV P
Sbjct: 991  AKVSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLP 1050

Query: 961  FSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSS 1020
            FSSSSTSFGLA NTGLSSGSSLFGSSAPASNLF+SGTT GL  +SSSA+NSVSSGAGTSS
Sbjct: 1051 FSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSS 1110

Query: 1021 SLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAATAPMFSFTS 1080
            S  NWQ+SSTPSFSTGFSSTPTG F FGLSSSS  SNS+P++FGSS+T A+T  MFSFTS
Sbjct: 1111 SFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS 1170

Query: 1081 AASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQP 1140
            AASSQPAF N                                                  
Sbjct: 1171 AASSQPAFSN-------------------------------------------------- 1230

Query: 1141 AFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTSS 1200
                                                                        
Sbjct: 1231 ------------------------------------------------------------ 1272

Query: 1201 SQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQAN 1260
                                                     SN GFTFGSTP ANN QAN
Sbjct: 1291 -----------------------------------------SNHGFTFGSTPPANNDQAN 1272

Query: 1261 TEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQNVPS 1320
             EDSMAED VQAV  PT  PTFGQQPLTPPPSSG+MFGS AP P AASPFQFG+QQN P+
Sbjct: 1351 MEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPT 1272

Query: 1321 PQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            PQNPS F ASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDKANRKY++VK SKSR+K
Sbjct: 1411 PQNPSPFHASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVK-SKSRKK 1272

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JSL2 (nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487168 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1379.4 bits (3569), Expect = 0.0e+00
Identity = 892/1372 (65.01%), Postives = 965/1372 (70.34%), Query Frame = 0 

Query: 1    MGNENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELL 60
            MGNEN EEVAAD  G  +E N    P I++DNTHGVTDLEQ+LKEKTFT+FEIDRLTELL
Sbjct: 91   MGNENHEEVAADLSGT-QEGNCDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTRFEIDRLTELL 150

Query: 61   KSRVADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNED 120
            KSRV DVPSGVE RKFE   S PVISY I E SPKF  QDG+SSH+VPT  M A VL+ED
Sbjct: 151  KSRVVDVPSGVEERKFEHASSTPVISYEIQEGSPKFRAQDGISSHVVPTQVMRANVLDED 210

Query: 121  VASPAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNE 180
            VASPA+IAK +MG RP KATPLSMAS S K  D+F S + SKSS L+LVPRSPGNFDV E
Sbjct: 211  VASPAEIAKAFMGSRPPKATPLSMASHSHKFRDNFASENLSKSSALTLVPRSPGNFDVIE 270

Query: 181  NGFVTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLL 240
            NGFVTPRSRGRSALY+MAR PYS VSAT SIKNSVAT DAY RATGSS SQ ALE+GR+L
Sbjct: 271  NGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAY-RATGSSSSQLALERGRVL 330

Query: 241  GSNQGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARH 300
            GS QGALK R SVLD+EMG VG IRR+R KSNLLYP GLS PSS T IPV GIGSE A+ 
Sbjct: 331  GSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQ 390

Query: 301  FLSSKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQ 360
            F S+KVHPFSSS GK L+      SLSK SA+SEND+ PSSSF+QIPLRSSEMASKILEQ
Sbjct: 391  FQSTKVHPFSSS-GKGLY----SRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQ 450

Query: 361  LETLTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDA 420
            LE LTP K+KS +LKLLSV +NSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYL+NVEDI+SNDA
Sbjct: 451  LEKLTPPKDKSLKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDA 510

Query: 421  RDHTTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQT 480
            R+ T+  N KVEE SSLK+K+P +K+IS A DG  S    KD V SS  QVSFVG S QT
Sbjct: 511  RELTSQKN-KVEESSSLKYKLPINKAIS-AGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGASPQT 570

Query: 481  KCSFQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVTDIS-----------LAVSKPSDTEAITVLDKPRA 540
            KC+FQMSA EDF D+DEEG SNGPVTDIS           +A+SKP+DTEAITV DKP+A
Sbjct: 571  KCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDGSLVAMSKPNDTEAITV-DKPQA 630

Query: 541  SVEVKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITV 600
            S EVKPST SE+ KIN Q KSD PVT  KSPI SFATAS PSITANA  PES  RPE  +
Sbjct: 631  SAEVKPSTESELNKINGQSKSDVPVTAEKSPILSFATASPPSITANAKDPESILRPEKNI 690

Query: 601  SSEVPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPT 660
            SSE PK   AP+FGFG+KLPSQ ES SSAPTF FGNK A   NEQNAVPV  SESNVAP 
Sbjct: 691  SSEAPKAANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP- 750

Query: 661  QQTSVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAE 720
                         K T  IP NAATENG KN G P KFASP VNEKES +V S SV KAE
Sbjct: 751  ------------GKATFPIPANAATENGNKNTGAPFKFASPLVNEKESTKVGSSSVFKAE 810

Query: 721  ISSSSIRSFGVSKEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTFENLF-SSVSTSTPTPSLFSLSSPST 780
             +S SI SFG  +E MS +KAGDK SSAGLSVGT ENLF SSVSTST  PSLFS SSPST
Sbjct: 811  SNSGSILSFGFPQESMS-DKAGDKRSSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPST 870

Query: 781  NSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLST 840
            NSNLNNGSLV      TPSI S  AT+FS +I+NQN SIKPSLT  P NSEPA T SLS 
Sbjct: 871  NSNLNNGSLVS-----TPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSM 930

Query: 841  SSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGTPPSDTSA 900
             SP+PSFSAAPIFKFGSPSVPS+SAPALSA       ETKT  ETT GNLSG PPSDTSA
Sbjct: 931  PSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSA------AETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSA 990

Query: 901  AKASSTGNSIFQFGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFP 960
            AK SS G S+FQFGA AT DSNKQP + T + GN   FGAPV PA+SG ASSTQSTPV P
Sbjct: 991  AKVSSIGGSVFQFGAAATTDSNKQPENLTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLP 1050

Query: 961  FSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSS 1020
            FSSSSTSFGLA NTGLSSGSSLFGSSAPASNLF+SGTT GL  +SSSA+NSVSSGAGTSS
Sbjct: 1051 FSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSS 1110

Query: 1021 SLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAATAPMFSFTS 1080
            S  NWQ+SSTPSFSTGFSSTPTG FSFGLSSSS  SNS+P++FGSS+T A+T  MFSFTS
Sbjct: 1111 SFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFSFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS 1170

Query: 1081 AASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQP 1140
             ASSQPAFGN                                                  
Sbjct: 1171 TASSQPAFGN-------------------------------------------------- 1230

Query: 1141 AFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTSS 1200
                                                                        
Sbjct: 1231 ------------------------------------------------------------ 1272

Query: 1201 SQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQAN 1260
                                                     SN GFTFGSTPLANN QAN
Sbjct: 1291 -----------------------------------------SNHGFTFGSTPLANNDQAN 1272

Query: 1261 TEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFG---QQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQN 1320
             EDSMAED VQAV  PT  PTFG   QQPLTPPPSSG+MFGS AP P AASPFQFG+QQN
Sbjct: 1351 MEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQN 1272

Query: 1321 VPSPQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
             P+PQNPS F ASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDKANRKY++VK SKSR+K
Sbjct: 1411 APTPQNPSPFHASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVK-SKSRKK 1272

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FKS9 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1369.4 bits (3543), Expect = 0.0e+00
Identity = 876/1370 (63.94%), Postives = 972/1370 (70.95%), Query Frame = 0 

Query: 4    ENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELLKSR 63
            +NQEEVAADPPG  E  N   VP I S+N HGV+DLE++LKEKTFT+FEIDRLTELLKSR
Sbjct: 94   KNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSR 153

Query: 64   VADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNEDVAS 123
            VADVPSGVE RKFE V S PVISY I E SPKFP Q+GV  H+VPTH ++A V +EDVAS
Sbjct: 154  VADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVAS 213

Query: 124  PAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNENGF 183
            PA+IAK +MG RP KATPLSM + SQK GD+F  G+ SKSSTLSLVPRSPGNFDV EN F
Sbjct: 214  PAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDV-ENDF 273

Query: 184  VTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLLGSN 243
            VTPRSRGRSALYSMAR PYSRV ATPSIKNSVAT D+Y RAT +S SQSA EQGRLL SN
Sbjct: 274  VTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSY-RATVTSSSQSAWEQGRLLESN 333

Query: 244  QGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARHFLS 303
            QGALK R SVLD+E+GSVG IRRIR KSNLL+PKGLS PSS T IPV GIGSET++H  S
Sbjct: 334  QGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQS 393

Query: 304  SKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQLET 363
            +KVHPFSS AGK  +  +TK +LSK+SA+SEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+ 
Sbjct: 394  TKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDK 453

Query: 364  LTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDARDH 423
            LTP KEKSSELKL SVR+NSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KYL+NVEDIRSND RD 
Sbjct: 454  LTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDL 513

Query: 424  TTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQTKCS 483
            T+    K E+ S LK KVP+DKSIST   G  SS   KD V SSGLQVSFVGPSS TKC+
Sbjct: 514  TSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTG-GGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCA 573

Query: 484  FQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVT-----------DISLAVSKPSDTEAITVLDKPRASVE 543
            FQMS  EDF D+D+E YSNGPV+           D  +AV KPSDTEAITV DKP+AS++
Sbjct: 574  FQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITV-DKPQASIQ 633

Query: 544  VKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITVSSE 603
             KPS +SEMKKINDQ KSD PVTT KS I SF TAS  S TAN I PEST+RPE   SSE
Sbjct: 634  AKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSE 693

Query: 604  VPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPTQQT 663
            VPK   AP+FGFG KLPSQ + + S+PTFTFGNKV T  NEQNAVP V SE NVAPT Q 
Sbjct: 694  VPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQA 753

Query: 664  SVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAEISS 723
            S P+TF FGDK T  IP + ATENG    G P KFAS  VNEKE A+  S SV K+E SS
Sbjct: 754  SAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSASVFKSESSS 813

Query: 724  SSIRSFGVSKEFMSGNKAGD-KSSSAGLSVGTFENLFSSVSTSTPTPSLFSLSSPSTNSN 783
            SS  SFGV KE MS  KAGD KSSSAGLSVGT  NL  S  +STPTPSLFS SSP+TNSN
Sbjct: 814  SSTLSFGVPKESMS-EKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSN 873

Query: 784  LNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLSTSSP 843
            L NGSL  TPS   PS     + +F  +I+NQNSSIKPSL A   NSEP  T SLSTSSP
Sbjct: 874  LINGSLGSTPS-TFPS----PSNTFPSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSP 933

Query: 844  IPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETT-LGNLSGTPPSDTSAAK 903
            +PSFSAAPIFKFGS SVPS+     SAPSGVGSVETKT  ETT  GN+SG  PSDTSAAK
Sbjct: 934  MPSFSAAPIFKFGSSSVPSS-----SAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAK 993

Query: 904  ASSTGNSIFQFGAPA-TADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFPF 963
              STG+S+FQFGA + T+DSNKQP  STF+  +  +FGAPV PASSG ASSTQSTPV PF
Sbjct: 994  VFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPF 1053

Query: 964  SSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSSS 1023
            SSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLFTSG T G   SSSSA+NSVSSGAGTSSS
Sbjct: 1054 SSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSS 1113

Query: 1024 LSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAA-TAPMFSFTS 1083
              NWQ+SS PSFS+GF STPTG FSFGL+SSS  S+S+P++FGSS+TGAA T  MFSFTS
Sbjct: 1114 FFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMFSFTS 1173

Query: 1084 AASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQP 1143
            AA++ P                                                      
Sbjct: 1174 AATAAP------------------------------------------------------ 1233

Query: 1144 AFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTSS 1203
                                                                        
Sbjct: 1234 ------------------------------------------------------------ 1293

Query: 1204 SQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQAN 1263
            SQPAFGT                                  SN GFTFGSTP ANN  AN
Sbjct: 1294 SQPAFGT----------------------------------SNHGFTFGSTPPANNDHAN 1297

Query: 1264 TEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQF-GNQQNVP 1323
             EDSMAED VQ VA+PTPMP+FGQQPLTPPPSSG++FGSTAPSP  A+PFQF G+QQNVP
Sbjct: 1354 MEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVP 1297

Query: 1324 SPQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            +PQNP+ FQASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDK+NRK+++VK SKSR+K
Sbjct: 1414 TPQNPNPFQASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVK-SKSRKK 1297

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FF52 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111444902 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1364.7 bits (3531), Expect = 0.0e+00
Identity = 876/1374 (63.76%), Postives = 972/1374 (70.74%), Query Frame = 0 

Query: 4    ENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELLKSR 63
            +NQEEVAADPPG  E  N   VP I S+N HGV+DLE++LKEKTFT+FEIDRLTELLKSR
Sbjct: 94   KNQEEVAADPPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSR 153

Query: 64   VADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNEDVAS 123
            VADVPSGVE RKFE V S PVISY I E SPKFP Q+GV  H+VPTH ++A V +EDVAS
Sbjct: 154  VADVPSGVESRKFEMVSSTPVISYDIQEGSPKFPAQEGVRPHMVPTHVLNANVPDEDVAS 213

Query: 124  PAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNENGF 183
            PA+IAK +MG RP KATPLSM + SQK GD+F  G+ SKSSTLSLVPRSPGNFDV EN F
Sbjct: 214  PAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDV-ENDF 273

Query: 184  VTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLLGSN 243
            VTPRSRGRSALYSMAR PYSRV ATPSIKNSVAT D+Y RAT +S SQSA EQGRLL SN
Sbjct: 274  VTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSY-RATVTSSSQSAWEQGRLLESN 333

Query: 244  QGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARHFLS 303
            QGALK R SVLD+E+GSVG IRRIR KSNLL+PKGLS PSS T IPV GIGSET++H  S
Sbjct: 334  QGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETSQHLQS 393

Query: 304  SKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQLET 363
            +KVHPFSS AGK  +  +TK +LSK+SA+SEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+ 
Sbjct: 394  TKVHPFSSPAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDK 453

Query: 364  LTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDARDH 423
            LTP KEKSSELKL SVR+NSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KYL+NVEDIRSND RD 
Sbjct: 454  LTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDL 513

Query: 424  TTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQTKCS 483
            T+    K E+ S LK KVP+DKSIST   G  SS   KD V SSGLQVSFVGPSS TKC+
Sbjct: 514  TSKKKDKFEDSSLLKSKVPSDKSISTG-GGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCA 573

Query: 484  FQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVT-----------DISLAVSKPSDTEAITVLDKPRASVE 543
            FQMS  EDF D+D+E YSNGPV+           D  +AV KPSDTEAITV DKP+AS++
Sbjct: 574  FQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVSAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDTEAITV-DKPQASIQ 633

Query: 544  VKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITVSSE 603
             KPS +SEMKKINDQ KSD PVTT KS I SF TAS  S TAN I PEST+RPE   SSE
Sbjct: 634  AKPSPVSEMKKINDQAKSDVPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTANVIEPESTTRPEKIASSE 693

Query: 604  VPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPTQQT 663
            VPK   AP+FGFG KLPSQ + + S+PTFTFGNKV T  NEQNAVP V SE NVAPT Q 
Sbjct: 694  VPKAAAAPIFGFGEKLPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQA 753

Query: 664  SVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAEISS 723
            S P+TF FGDK T  IP + ATENG    G P KFAS  VNEKE A+  S SV K+E SS
Sbjct: 754  SAPTTFKFGDKATFPIPASTATENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSASVFKSESSS 813

Query: 724  SSIR----SFGVSKEFMSGNKAGD-KSSSAGLSVGTFENLFSSVSTSTPTPSLFSLSSPS 783
            SS      SFGV KE MS  KAGD KSSSAGLSVGT  NL  S  +STPTPSLFS SSP+
Sbjct: 814  SSFNCSTLSFGVPKESMS-EKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPT 873

Query: 784  TNSNLNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLS 843
            TNSNL NGSL  TPS   PS     + +F  +I+NQNSSIKPSL A   NSEP  T SLS
Sbjct: 874  TNSNLINGSLGSTPS-TFPS----PSNTFPSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLS 933

Query: 844  TSSPIPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETT-LGNLSGTPPSDT 903
            TSSP+PSFSAAPIFKFGS SVPS+     SAPSGVGSVETKT  ETT  GN+SG  PSDT
Sbjct: 934  TSSPMPSFSAAPIFKFGSSSVPSS-----SAPSGVGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDT 993

Query: 904  SAAKASSTGNSIFQFGAPA-TADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTP 963
            SAAK  STG+S+FQFGA + T+DSNKQP  STF+  +  +FGAPV PASSG ASSTQSTP
Sbjct: 994  SAAKVFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKQPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTP 1053

Query: 964  VFPFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAG 1023
            V PFSSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLFTSG T G   SSSSA+NSVSSGAG
Sbjct: 1054 VSPFSSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFTSGATFGF-GSSSSANNSVSSGAG 1113

Query: 1024 TSSSLSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAA-TAPMF 1083
            TSSS  NWQ+SS PSFS+GF STPTG FSFGL+SSS  S+S+P++FGSS+TGAA T  MF
Sbjct: 1114 TSSSFFNWQASSAPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSSPMLFGSSTTGAASTTSMF 1173

Query: 1084 SFTSAASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTS 1143
            SFTSAA++ P                                                  
Sbjct: 1174 SFTSAATAAP-------------------------------------------------- 1233

Query: 1144 SSQPAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSF 1203
                                                                        
Sbjct: 1234 ------------------------------------------------------------ 1293

Query: 1204 GTSSSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANN 1263
                SQPAFGT                                  SN GFTFGSTP ANN
Sbjct: 1294 ----SQPAFGT----------------------------------SNHGFTFGSTPPANN 1301

Query: 1264 FQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQF-GNQ 1323
              AN EDSMAED VQ VA+PTPMP+FGQQPLTPPPSSG++FGSTAPSP  A+PFQF G+Q
Sbjct: 1354 DHANMEDSMAEDTVQTVASPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFVFGSTAPSPLGANPFQFGGSQ 1301

Query: 1324 QNVPSPQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            QNVP+PQNP+ FQASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDK+NRK+++VK SKSR+K
Sbjct: 1414 QNVPTPQNPNPFQASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVK-SKSRKK 1301

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K059 (nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111488998 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 1351.3 bits (3496), Expect = 0.0e+00
Identity = 867/1370 (63.28%), Postives = 966/1370 (70.51%), Query Frame = 0 

Query: 4    ENQEEVAADPPGVLEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELLKSR 63
            +NQEEVAAD PG  E  N   VP I S+N HGV+DLE++LKEKTFT+FEIDRLTELLKSR
Sbjct: 94   KNQEEVAADSPGTQEGTNNDFVPSINSNNIHGVSDLEKILKEKTFTRFEIDRLTELLKSR 153

Query: 64   VADVPSGVEGRKFEQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNEDVAS 123
            VADVPSGVE RKFE+VPS PVISY I E SPKFP Q+ V  H+VP H ++A V +EDVAS
Sbjct: 154  VADVPSGVESRKFEKVPSTPVISYDIQEGSPKFPAQERVRPHMVPNHVVNANVPDEDVAS 213

Query: 124  PAQIAKMYMGGRPLKATPLSMASSSQKLGDSFVSGDTSKSSTLSLVPRSPGNFDVNENGF 183
            PA+IAK +MG RP KATPLSM + SQK GD+F  G+ SKSSTLSLVPRSPGNFDV EN F
Sbjct: 214  PAEIAKAFMGSRPPKATPLSMVAHSQKFGDTFALGNPSKSSTLSLVPRSPGNFDV-ENDF 273

Query: 184  VTPRSRGRSALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLLGSN 243
            VTPRSRGRSALYSMAR PYSRV ATPSIKNSVAT D+Y RA+ +S SQSA EQGRLL SN
Sbjct: 274  VTPRSRGRSALYSMARMPYSRVRATPSIKNSVATTDSY-RASVTSSSQSAWEQGRLLESN 333

Query: 244  QGALKCRRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARHFLS 303
            QGALK R SVLD+E+GSVG IRRIR KSNLL+PKGLS PSS T IPV GIGSET +H  S
Sbjct: 334  QGALKRRSSVLDDEIGSVGPIRRIRHKSNLLFPKGLSLPSSSTSIPVSGIGSETYQHLQS 393

Query: 304  SKVHPFSSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQLET 363
            +KVHPFSS+AGK  +  +TK +LSK+SA+SEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+ 
Sbjct: 394  TKVHPFSSTAGKAPYSSETKRNLSKMSAESENDRTPSSSFPQIPLRSSEMALKILEQLDK 453

Query: 364  LTPQKEKSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDARDH 423
            LTP KEKSSELKL SVR+NSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KYL+NVEDIRSND RD 
Sbjct: 454  LTPPKEKSSELKLHSVRNNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSAKYLENVEDIRSNDGRDL 513

Query: 424  TTLDNGKVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDAVPSSGLQVSFVGPSSQTKCS 483
            T+  N K E+ S LK +VP+DKSIST   G  SS   KD V SSGLQVSFVGPSS TKC+
Sbjct: 514  TSKKNDKFEDSSLLKSEVPSDKSISTG-GGVGSSVPSKDTVSSSGLQVSFVGPSSLTKCA 573

Query: 484  FQMSALEDFEDLDEEGYSNGPVT-----------DISLAVSKPSDTEAITVLDKPRASVE 543
            FQMS  EDF D+D+E YSNGPV            D  +AV KPSD EAI ++DKP+AS++
Sbjct: 574  FQMSVQEDFVDMDDEEYSNGPVAAKSFERREKVDDSLVAVGKPSDNEAI-IVDKPQASIQ 633

Query: 544  VKPSTLSEMKKINDQRKSDAPVTTGKSPI-SFATASSPSITANAIVPESTSRPEITVSSE 603
             KPST+SEMKKINDQ KSD PVTT KS I SF TAS  S TA  I PEST+RPE    SE
Sbjct: 634  AKPSTVSEMKKINDQAKSDIPVTTEKSSIFSFPTASPSSTTATVIEPESTTRPEKIAFSE 693

Query: 604  VPKTTIAPLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPTQQT 663
            VPK  +AP+FGFG K PSQ + + S+PTFTFGNKV T  NEQNAVP V SE NVAPT Q 
Sbjct: 694  VPKAAVAPIFGFGEKFPSQKDPVFSSPTFTFGNKVTTSTNEQNAVPAVTSEGNVAPTLQA 753

Query: 664  SVPSTFTFGDKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEKESARVDSVSVLKAEISS 723
            S P+TF FGDK T  IP +  TENG    G P KFAS  VNEKE A+  S SV K+E SS
Sbjct: 754  SAPTTFKFGDKATFPIPASTTTENGNSEAGSPFKFASSLVNEKEGAKAGSASVFKSESSS 813

Query: 724  SSIRSFGVSKEFMSGNKAGD-KSSSAGLSVGTFENLFSSVSTSTPTPSLFSLSSPSTNSN 783
            SSI SFGV KE MS  KAGD KSSSAGLSVGT  NL  S  +STPTPSLFS SSP+TNSN
Sbjct: 814  SSILSFGVPKELMS-EKAGDKKSSSAGLSVGTSGNLLLSSVSSTPTPSLFSFSSPTTNSN 873

Query: 784  LNNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLSTSSP 843
            L NGSL  TPS   PS     + +F  +I+NQNSSIKPSL A   NSEP  T SLSTSSP
Sbjct: 874  LINGSLGSTPS-TFPS----PSNTFPSNITNQNSSIKPSLNAATSNSEPVTTTSLSTSSP 933

Query: 844  IPSFSAAPIFKFGSPSVPSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETT-LGNLSGTPPSDTSAAK 903
            +PSFSAAPIFKFGS SVPST     SAP+G GSVETKT  ETT  GN+SG  PSDTSAAK
Sbjct: 934  MPSFSAAPIFKFGSSSVPST-----SAPNGAGSVETKTKQETTPFGNVSGISPSDTSAAK 993

Query: 904  ASSTGNSIFQFGAPA-TADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFPF 963
              STG+S+FQFGA + T+DSNK+P  STF+  +  +FGAPV PASSG ASSTQSTPV PF
Sbjct: 994  VFSTGSSVFQFGAASTTSDSNKEPEKSTFAPVSVPSFGAPVLPASSGVASSTQSTPVSPF 1053

Query: 964  SSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSSS 1023
            SSSSTSFGL GNTGL+SG+SL GSSAPASNLF SG T G   SSSSA+NSVSSGAGTSSS
Sbjct: 1054 SSSSTSFGLTGNTGLASGNSLVGSSAPASNLFASGATFGF-GSSSSANNSVSSGAGTSSS 1113

Query: 1024 LSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGAA-TAPMFSFTS 1083
              NWQ+SS PSFS+GF STPTG FSFGL+SSS  S+SAP++FGSSSTGAA T  MFSFTS
Sbjct: 1114 FFNWQASSGPSFSSGFGSTPTGGFSFGLASSSAASSSAPMLFGSSSTGAASTTSMFSFTS 1173

Query: 1084 AASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQP 1143
            AA++                        +SSQPAFGN                       
Sbjct: 1174 AATA------------------------ASSQPAFGN----------------------- 1233

Query: 1144 AFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQPSFGTSS 1203
                                                                        
Sbjct: 1234 ------------------------------------------------------------ 1293

Query: 1204 SQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLANNFQAN 1263
                                                     SN GFTFGSTP ANN  AN
Sbjct: 1294 -----------------------------------------SNHGFTFGSTPPANNDHAN 1297

Query: 1264 TEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAASPFQF-GNQQNVP 1323
             EDSMAED VQ VA PTPMP+FGQQPLTPPPSSG+MFGSTAPSP  A+PFQF G+QQNV 
Sbjct: 1354 MEDSMAEDTVQTVALPTPMPSFGQQPLTPPPSSGFMFGSTAPSPLGANPFQFGGSQQNVS 1297

Query: 1324 SPQNPSLFQASGS--FNAPSAGGSFSLGAGGGDKANRKYIRVKNSKSRRK 1355
            +PQNP+ FQASGS  FNA SAGGSFSLGAGGGDK+NRK+++VK SKSR+K
Sbjct: 1414 TPQNPNPFQASGSLDFNA-SAGGSFSLGAGGGDKSNRKFVKVK-SKSRKK 1297

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. TAIR 10
Match: AT3G10650.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1); Has 61042 Blast hits to 31782 proteins in 2093 species: Archae - 202; Bacteria - 16480; Metazoa - 16017; Fungi - 12552; Plants - 1653; Viruses - 629; Other Eukaryotes - 13509 (source: NCBI BLink). )

HSP 1 Score: 238.4 bits (607), Expect = 3.3e-62
Identity = 398/1258 (31.64%), Postives = 582/1258 (46.26%), Query Frame = 0 

Query: 17   LEEKNLSLVPGIESDNTHGVTDLEQMLKEKTFTKFEIDRLTELLKSRVADVPSGVEGRKF 76
            +E+ N S+ P  +     G TDLE++L+ KTFT+ E+DRLT LL+S+ AD  +  E ++ 
Sbjct: 131  MEDTNASVDPPKD-----GFTDLEKILQGKTFTRSEVDRLTTLLRSKAADSSTMNEEQRN 190

Query: 77   EQVPSKPVISYGIHERSPKFPPQDGVSSHIVPTHDMSAKVLNEDVASPAQIAKMYMGGRP 136
            E      V     HER  +  P +G  + +V T   S + L+E +ASPAQ+AK YMG RP
Sbjct: 191  E--VGMVVRHPPSHERD-RTHPDNGSMNTLVSTPPGSLRTLDECIASPAQLAKAYMGSRP 250

Query: 137  LKATPLSMASSSQK-LGDSFVSGDT---SKSSTLSLVPRSPGNFDVNENGFVTPRSRGRS 196
             + TP  +    Q    DS     T    KS T+SLV +  G   + ENGFVTPRSRGRS
Sbjct: 251  SEVTPSMLGLRGQAGREDSVFLNRTPFPQKSPTMSLVTKPSGQRPL-ENGFVTPRSRGRS 310

Query: 197  ALYSMARTPYSRVSATPSIKNSVATIDAYSRATGSSLSQSALEQGRLLGSNQG---ALKC 256
            A+YSMARTPYSR  ++  I +                S S  E+    GS QG    LK 
Sbjct: 311  AVYSMARTPYSRPQSSVKIGSLF------------QASPSKWEESLPSGSRQGFQSGLKR 370

Query: 257  RRSVLDEEMGSVGSIRRIRQKSNLLYPKGLSTPSSFTFIPVRGIGSETARHFLSSKVHPF 316
            R SVLD ++GSVG +RRIRQKSN L  + L+ P S + + VR  G E             
Sbjct: 371  RSSVLDNDIGSVGPVRRIRQKSN-LSSRSLALPVSESPLSVRANGGE------------- 430

Query: 317  SSSAGKTLHPGDTKGSLSKVSADSENDMNPSSSFNQIPLRSSEMASKILEQLETLTPQKE 376
                 KT H           S DS  D+ P SSFN +P +SSEMASKIL+QL+       
Sbjct: 431  -----KTTH----------TSKDSAEDI-PGSSFNLVPTKSSEMASKILQQLD------- 490

Query: 377  KSSELKLLSVRSNSPMKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLKNVEDIRSNDARDHTTLDNG 436
                 KL+S R  SP KLSPSML GPAL+SL++V++ K+L N+ + ++N     ++    
Sbjct: 491  -----KLVSTREKSPSKLSPSMLRGPALKSLQNVEAPKFLGNLPEKKANS--PDSSYQKQ 550

Query: 437  KVEERSSLKFKVPNDKSISTACDGASSSGLMKDA-VPSSGLQVSFVGPSSQ---TKCSFQ 496
            ++   S  +  +   +    A DG S +G  KD  +   G+ +       +    K SF+
Sbjct: 551  EISRESVSREVLAQSEKTGDAVDGTSKTGSSKDQDMRGKGVYMPLTNSLEEHPPKKRSFR 610

Query: 497  MSALEDFEDLDEE-GYSNGP--VTDISLAVSKPSDTEAITVLDKPRASVEVKPSTLSEMK 556
            MSA EDF +LD++ G ++ P  V +   A        ++ + +KP    E  PST     
Sbjct: 611  MSAHEDFLELDDDLGAASTPCEVAEKQNAFEVEKSHISMPIGEKPLTPSEAMPSTSYISN 670

Query: 557  KINDQRKSDAPVTTGKS-----PISFATASSPSITANAIVPESTSRPEITVSSEVPKTTI 616
                Q  S+  + T ++     PI     S+ +    +   + T +  I+      +   
Sbjct: 671  GDASQGTSNGSLETERNKFVAFPIEAVQQSNMASEPTSKFIQGTEKSSISSGKPTSEEKR 730

Query: 617  APLFGFGNKLPSQTESISSAPTFTFGNKVATLANEQNAVPVVASESNVAPTQQTSVPSTF 676
             PL     + P +  ++   P  +F      L N+ +     +++  +  T  T+     
Sbjct: 731  IPL-----EEPKKPAAV--FPNISFSPPATGLLNQNSG---ASADIKLEKTSSTA----- 790

Query: 677  TFG-DKTTASIPENAATENGIKNVGLPLKFASPSVNEK-ESARVDSVSVLKAEISSSSIR 736
             FG  +  A   E+  T +   +       A+P++N    SA  ++V+   +  S +S  
Sbjct: 791  -FGVSEAWAKPTESKKTFSNSASGAESSTSAAPTLNGSIFSAGANAVTPPPSNGSLTSSP 850

Query: 737  SFGVS-KEFMSGNKAGDKSSSAGLSVGTF--ENLFSSVSTSTPTPSLFSLSSP-STNSNL 796
            SF  S     S N  GD  S+      T    ++F  + TS  + S  + +SP S+ S  
Sbjct: 851  SFPPSISNIPSDNSVGDMPSTVQSFAATHNSSSIFGKLPTSNDSNSQSTSASPLSSTSPF 910

Query: 797  NNGSLVPTPSIVTPSIVSFSATSFSKDISNQNSSIKPSLTATPHNSEPAATASLSTSSPI 856
              G   P      P+ VS S+   SK+   +N++   + T         A+A  ST    
Sbjct: 911  KFGQ--PAAPFSAPA-VSESSGQISKETEVKNATFGNTST---FKFGGMASADQSTGIVF 970

Query: 857  PSFSA----APIFKFGSPSV-------PSTSAPALSAPSGVGSVETKTTLETTLGNLSGT 916
             + SA     P F FGS SV       PST+  A SAP   GS+    T  +T G  +  
Sbjct: 971  GAKSAENKSRPGFVFGSSSVVGGSTLNPSTA--AASAPESSGSLIFGVTSSSTPGTETSK 1030

Query: 917  PPSDTSAAK------------------------ASSTGNSIFQFGA--PATADSNKQPVS 976
              + ++A                          ++STG+S+F F A   A+A S++   S
Sbjct: 1031 ISASSAATNTGNSVFGTSSFAFTSSGSSMVGGVSASTGSSVFGFNAVSSASATSSQSQAS 1090

Query: 977  STFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPV-FPFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSS 1036
            + F  GN     A      SG  +STQS P  F  S S+ SFGL+GN+ L+S SS FG S
Sbjct: 1091 NLFGAGN-----AQTGNTGSGTTTSTQSIPFQFGSSPSAPSFGLSGNSSLASNSSPFGFS 1150

Query: 1037 APASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGA---GTSSSLSNWQSSSTPSFSTGF--SSTP 1096
                 +FTS +T  L+S++SSAS+S +  +   GTS    N   +S P FS+ F  SSTP
Sbjct: 1151 KSEPAVFTSVSTPQLSSTNSSASSSSTMSSPLFGTSWQAPNSSPNSGPVFSSSFTTSSTP 1210

Query: 1097 TGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSSTGA-ATAPMFSFTSAASSQPAFGNSTSQPAFGNS 1156
            T  FSFG SS++T S++   +FG+S+    + +P+F F S   + P       QP FGNS
Sbjct: 1211 T-TFSFGGSSAATVSSTTTPIFGASTNNTPSPSPIFGFGSTPPTTP------QQPVFGNS 1270

Query: 1157 SSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSSSQPAFDT--SSSQPAFGTSSSQP 1198
                    + SQ  FGNS+   AFG  ++      +      D+    +  A   S   P
Sbjct: 1271 -------GTPSQSLFGNSTPGFAFGAPNNGNGINNNQQVSMEDSMAEDTDQANRASMVAP 1275

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.1 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 3.1e-12
Identity = 158/407 (38.82%), Postives = 215/407 (52.83%), Query Frame = 0 

Query: 951  SSTSFGLAGNTGLSSGSSLFG--SSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSSS 1010
            SS  FG +  T      SLFG  S+  ++N F   T  G  +S+  A+ S SS  G++S+
Sbjct: 4    SSNPFGQSSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFG--TSAPFAAQSGSSIFGSTST 63

Query: 1011 LSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSS--------STGAATA 1070
                     P  S+ F+STPT    FG SSS    NS P  FG+S        S+G    
Sbjct: 64   ----GVFGAPQTSSPFASTPT----FGASSSPAFGNSTP-AFGASPASSPFGGSSGFGQK 123

Query: 1071 PMFSFTSAASSQPAFGNST--SQPAFGNSS----------SQPAFGNSSSQPAFGNSSSQ 1130
            P+  F++  S+   FGNST  SQPAFGN+S          + PAFG + S P+FG ++S 
Sbjct: 124  PL-GFSTPQSN--PFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFG-APSTPSFG-ATST 183

Query: 1131 PAFGTLSSQPAFGTSSSQPAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAF---GTSSSQPAF 1190
            P+FG  SS PAFG +++ PAF  S+S P+FG +++ PAFG S + PAF   GT+     F
Sbjct: 184  PSFGA-SSTPAFGATNT-PAFGASNS-PSFGATNT-PAFGASPT-PAFGSTGTTFGNTGF 243

Query: 1191 GSQPAFGSQ--PAFGSQ--PSFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFG-NSQPAFGNS 1250
            GS  AFG+   PAFG+   P+FG S + PAFG SS+ PAFG  SS PAFG +S PAFG S
Sbjct: 244  GSGGAFGASNTPAFGASGTPAFGASGT-PAFGASST-PAFG-ASSTPAFGASSTPAFGGS 303

Query: 1251 SSQPAFAISN-PGFTFGSTPLANNFQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPS 1310
            S+ P+F  SN   F+FGS+P      A  + + A       +TP+P   FG    + P  
Sbjct: 304  ST-PSFGASNTSSFSFGSSP------AFGQSTSAFGSSAFGSTPSP---FGGAQASTPTF 363

Query: 1311 SGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQ--NVPSPQNPSLFQASGSFNAPS 1325
             G  FG +           FG QQ  +   P  P++   +G+   P+
Sbjct: 364  GGSGFGQST----------FGGQQGGSRAVPYAPTVEADTGTGTQPA 366

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. TAIR 10
Match: AT1G10390.2 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 72.4 bits (176), Expect = 3.1e-12
Identity = 158/407 (38.82%), Postives = 215/407 (52.83%), Query Frame = 0 

Query: 951  SSTSFGLAGNTGLSSGSSLFG--SSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSSS 1010
            SS  FG +  T      SLFG  S+  ++N F   T  G  +S+  A+ S SS  G++S+
Sbjct: 4    SSNPFGQSSGTSPFGSQSLFGQTSNTSSNNPFAPATPFG--TSAPFAAQSGSSIFGSTST 63

Query: 1011 LSNWQSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSS--------STGAATA 1070
                     P  S+ F+STPT    FG SSS    NS P  FG+S        S+G    
Sbjct: 64   ----GVFGAPQTSSPFASTPT----FGASSSPAFGNSTP-AFGASPASSPFGGSSGFGQK 123

Query: 1071 PMFSFTSAASSQPAFGNST--SQPAFGNSS----------SQPAFGNSSSQPAFGNSSSQ 1130
            P+  F++  S+   FGNST  SQPAFGN+S          + PAFG + S P+FG ++S 
Sbjct: 124  PL-GFSTPQSN--PFGNSTQQSQPAFGNTSFGSSTPFGATNTPAFG-APSTPSFG-ATST 183

Query: 1131 PAFGTLSSQPAFGTSSSQPAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAF---GTSSSQPAF 1190
            P+FG  SS PAFG +++ PAF  S+S P+FG +++ PAFG S + PAF   GT+     F
Sbjct: 184  PSFGA-SSTPAFGATNT-PAFGASNS-PSFGATNT-PAFGASPT-PAFGSTGTTFGNTGF 243

Query: 1191 GSQPAFGSQ--PAFGSQ--PSFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFG-NSQPAFGNS 1250
            GS  AFG+   PAFG+   P+FG S + PAFG SS+ PAFG  SS PAFG +S PAFG S
Sbjct: 244  GSGGAFGASNTPAFGASGTPAFGASGT-PAFGASST-PAFG-ASSTPAFGASSTPAFGGS 303

Query: 1251 SSQPAFAISN-PGFTFGSTPLANNFQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPS 1310
            S+ P+F  SN   F+FGS+P      A  + + A       +TP+P   FG    + P  
Sbjct: 304  ST-PSFGASNTSSFSFGSSP------AFGQSTSAFGSSAFGSTPSP---FGGAQASTPTF 363

Query: 1311 SGYMFGSTAPSPQAASPFQFGNQQ--NVPSPQNPSLFQASGSFNAPS 1325
             G  FG +           FG QQ  +   P  P++   +G+   P+
Sbjct: 364  GGSGFGQST----------FGGQQGGSRAVPYAPTVEADTGTGTQPA 366

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. TAIR 10
Match: AT2G45000.1 (structural constituent of nuclear pore )

HSP 1 Score: 63.2 bits (152), Expect = 1.9e-09
Identity = 141/391 (36.06%), Postives = 190/391 (48.59%), Query Frame = 0 

Query: 946  FPFSSSSTSFGLAGNTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGT 1005
            FPF  S+           S G   FGSS+  ++   S TT  L+ S + +SN  S+G G 
Sbjct: 4    FPFGQSN-----------SVGGFSFGSSSATNSSSASSTTSPLSFSFNQSSNPSSTGFGF 63

Query: 1006 SSSLSNW-QSSSTPSFSTGFSSTPTGVFSFGLSSSSTTSNSAPVVFGSSS--TGAATAPM 1065
             SS+S+   SS+TPSF  G SSTP+  F FG S+SS+T +     FGSS+  T A+T P 
Sbjct: 64   GSSVSSTPASSTTPSFGFGASSTPS--FGFGSSASSSTPSFG---FGSSASVTPASTTPS 123

Query: 1066 FSF-TSAASSQPA---FGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQP 1125
            F F T+A+SS PA   FG+ST+  +     S P FG  +S  +   + S   FG  +S  
Sbjct: 124  FGFGTAASSSAPAPSLFGSSTTNASSAAPGSSP-FGFVTSSASSTATPSSSLFGAPASSA 183

Query: 1126 AFGTSSSQPAFDTSSSQPAFGTSS---SQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGS-Q 1185
            A  +SS   A   S S P FG+S    S P+  ++S+   FG SSS  A  + P FG+  
Sbjct: 184  ATPSSSPFGAAPASGSTPLFGSSPSLFSAPSSASASNSSLFGASSS-AATSTSPLFGAPS 243

Query: 1186 PAFGSQPSFGTSSSQPA-----FGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAIS 1245
             A G+ PSF  +SS P      FG + S P+F   SS  A G+S   FG + S P F  S
Sbjct: 244  SATGATPSFSVASSAPGSSSSIFGATGSSPSFSVASS--ASGSSPSIFGATGSSPFFGSS 303

Query: 1246 NPGFTFGSTP--LANNFQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMF--- 1305
            +   + GSTP   A++    T  S +  GV    + +   T          S+G+ F   
Sbjct: 304  S---SAGSTPSLFASSSSGATTSSPSPFGVSTFNSSSTSNTSNASASPFSASTGFSFLKS 363

[Close]
BLAST of Sed0010208 vs. TAIR 10
Match: AT1G59660.1 (Nucleoporin autopeptidase )

HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 1.2e-08
Identity = 154/413 (37.29%), Postives = 203/413 (49.15%), Query Frame = 0 

Query: 900  FGAPATADSNKQPVSSTFSQGNGTAFGAPVSPASSGPASSTQSTPVFPFSSSSTSFGLAG 959
            FG+       +  +SS F     + FG   + AS+ P ++       PF  +ST F    
Sbjct: 2    FGSSNNNPFGQSSISSPFGTQTHSLFGQTNNNASNNPFATK------PF-GTSTPF---- 61

Query: 960  NTGLSSGSSLFGSSAPASNLFTSGTTLGLASSSSSASNSVSSGAGTSSSLSNWQSSSTPS 1019
              G  +GSS+FG           GT+ G+  +  ++S   +S     SS   + +SSTPS
Sbjct: 62   --GAQTGSSMFG-----------GTSTGVFGAPQTSSPFGASPQAFGSSTQAFGASSTPS 121

Query: 1020 FSTG---FSSTPT-GVFSFGLSS------SSTTSNSAPV----VFGSSST-GAATAPMFS 1079
            F +    F  T T G  SFGLS+       STT  S P      FGSS+  GA+T P F 
Sbjct: 122  FGSSNSPFGGTSTFGQKSFGLSTPQSSPFGSTTQQSQPAFGNSTFGSSTPFGASTTPAF- 181

Query: 1080 FTSAASSQPAFGNSTSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGNSSSQPAFGTLSSQPAFGTSS 1139
                ASS PAFG S +   FG +++ P FG +++   FG SS+ P FG  SS PAFG S+
Sbjct: 182  ---GASSTPAFGVSNTS-GFG-ATNTPGFG-ATNTTGFGGSST-PGFGA-SSTPAFG-ST 241

Query: 1140 SQPAFDTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGTSSSQPAFGSQPAFGSQPAFGSQ--PS 1199
            + PAF  SS+ P FG+SSS PAFG S + PAFG+S +  AFG+   F S  AFGS   P+
Sbjct: 242  NTPAFGASST-PLFGSSSS-PAFGASPA-PAFGSSGN--AFGNN-TFSSGGAFGSSSTPT 301

Query: 1200 FGTSSSQPAFGTSSSQPAFGHLSSQPAFGNSQPAFGNSSSQPAFAISNPGFTFGSTPLAN 1259
            FG S++  AFG SSS P+F +  S PAFG S  AFG+SS             FGST    
Sbjct: 302  FGASNTS-AFGASSS-PSF-NFGSSPAFGQSTSAFGSSS-------------FGST---Q 350

Query: 1260 NFQANTEDSMAEDGVQAVATPTPMPTFGQQPLTPPPSSGYMFGSTAPSPQAAS 1296
            +   +T       G QA  +     TFG Q        G      AP+   AS
Sbjct: 362  SSLGSTPSPFGAQGAQASTS-----TFGGQSTIGGQQGGSRVIPYAPTTDTAS 350

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Sed0010208 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
XP_022956154.10.0e+0065.74nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita moschata][more]
KAG7032922.10.0e+0065.46Nuclear pore complex protein NUP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma][more]
XP_023527371.10.0e+0065.40nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo][more]
KAG6602242.10.0e+0065.52Nuclear pore complex protein NUP1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sorori... [more]
XP_038884354.10.0e+0065.50nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 [Benincasa hispida][more]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match NameE-valueIdentityDescription
Q9CAF44.7e-6131.64Nuclear pore complex protein NUP1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NUP1 PE=1 S... [more]
BLAST of Sed0010208 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A6J1GY880.0e+0065.74nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC11145... [more]
A0A6J1JSL20.0e+0065.01nuclear pore complex protein NUP1-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC1114871... [more]
A0A6J1FKS90.0e+0063.94nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... [more]
A0A6J1FF520.0e+0063.76nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 ... [more]
A0A6J1K0590.0e+0063.28nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN... [more]
BLAST of Sed0010208 vs. TAIR 10
Match NameE-valueIdentityDescription
AT3G10650.13.3e-6231.64BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.... [more]
AT1G10390.13.1e-1238.82Nucleoporin autopeptidase [more]
AT1G10390.23.1e-1238.82Nucleoporin autopeptidase [more]
AT2G45000.11.9e-0936.06structural constituent of nuclear pore [more]
AT1G59660.11.2e-0837.29Nucleoporin autopeptidase [more]
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 75..91
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 74..114
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1171..1349
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..18
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1372..1423
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 900..925
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 406..442
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1171..1451
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 423..442
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 969..1040
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33416:SF20NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP1coord: 1190..1449
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33416FAMILY NOT NAMEDcoord: 1..1195
coord: 1190..1449
NoneNo IPR availablePANTHERPTHR33416:SF20NUCLEAR PORE COMPLEX PROTEIN NUP1coord: 1..1195

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Sed0010208.2Sed0010208.2mRNA
Sed0010208.1Sed0010208.1mRNA


GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0071763 nuclear membrane organization
biological_process GO:0016973 poly(A)+ mRNA export from nucleus
cellular_component GO:0005635 nuclear envelope