ClCG05G001890 (gene) Watermelon (Charleston Gray)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCCGCCGGTAGAGAAACCAAAAGATCCGCCGCTGTTTCCCGATGCATATCACATTCGCAACCCAATAAATCTCCGGCACGGCGGTTTGTCGGTGTCCGGCAGCGGCCGTCCGGCCGGTGGGTGGCGGAAATAAAAGACTCTTCCCAGAGAGTCCGCCTCTGGTTAGGCACTTACGACACGCCGGAGGAAGCCGCCAGAGCCTACGACGAGGCCGCCATTGCTCTCCGCGGCGAAAACGCGAGGACCAATTTCGTGTCTCCGGCGACCGGTCGGTCACCGGATGCGAAGTTTTCCGACCTCGGCGTGTTGAAAGCGAAATTGAGCAAGAATCTGCAGAGTATTATAGCGAGAACGAGCGAACAGAGCAAATCGTTGAAAAACAGAGTGAGTGATCGGTTCACTTTTGGTAATATTTTCAATTTCAGAAGCTATCAATCGGCAACAATGGCGGATTTGACGCCCATTGATAAGGCGGCTGTACAACCGAGCATAATTGTACCTCACATAGAAACCGATCAGCACGGTTCGTGGGATAGCAGCAACGGCGACGGATTCCAGCAACTGGGTTTCAGTTCCGATGGGTCAGAGGCCGCCGGAGATTGGTGGGTGGATCGAATATTGGAAGATGATTATTGTGATGAAGCTTTGAAGAGTAAGAGGTTTAGGGTTTCTTCTTCTGTCGTTGTACCTCCAACTTTTAGTGGTTCTCCTACCTATGGTGAATGTTAGATTTTCTTGAGAAAATTAAATTGGGATTAAGGACAATACGACCATAGTTGAATTAGTATAAATTTGTATTGTCAATTTCGAAATTAGTGGCTCAATTTTTCCGCTCTCTACATATTAAGAAAAAAAGATTAAAAAAATGATGGAAGTTGTCGAAATTATGTGTATATTATTTGAATGAAATATCAAAAATATTTGCGTATTGATTACCTCTCTTGTATTTTTAATCTTCATATGATGAAAATGAAAGTATTGGATTATAAGTAACGTGATAGAAAATATTAGAAAATTTTGGTTATCTTCAAGAACGCTAGATATTGCATTAGTTTATATTCTCAATTGATTTCGTATTTGGTTCATTCAAATCGTTCTCCCTAGAATTGTATGTTCAATTTTTATTTTCTTTTTTCTTTTTTGAAAAATTTGTGTGTTCAAATTTAGATGGATTGAAATTAATGGAATAATGAAAGAGTGGTTAACTAATTAGTGTAGTGTAAGTTTAATTTTGTTGATGATTTGTGTGTGCATGTAAGTCAACTGAAATTCATGGGGTAGTTTATAAGTTCTTCTTGCTATTTGTTATCAAGGACATAAATTAACTAAGTTTTAAAATTTTATTTTCCAATAATTTAGTCCAATTTTATTTATGTATTTTTAAAATTGTAATAATTTAATTTTTGAAATTTAATAAGTAACAATTTATTTTCTATATTTTATAATCAAACGATTTAGTTTTTATTATGAAAAATATTATTAAAATTTATTGAAATTTATTACGTAGATCAATAAGTCGATCAATAACCAATTTTTTTAAAGTTAAAAAACATTTTGGTCTCTGAACTTTTCTCGTAAAATTAACGATTTAGTCACTGAACATTGGTTTGTAACGATTTAGTAATATTTTCAATTTTGTAACAAATTAGTCCTTGAACTTTAGTATGTAACAATTTGATCCTTGTACTTTCAAATTTATAGCAATTTAGTCCTTAGCGTAAAAAAATTAGATGTCAATTTTTATTAATTTATCATGTAAACTTTGTATTATATAACAATATTGAGTCTCTAGTTTGTTTATCAGTTTATTTATGCAAAAAAATCTCATTAAATCTTAACACAAATTTTTAGGACTTTTTTTATTTAATAATAAATAATGACAAAAATAGGGTTGGATTGGGTCCACAATTTACCAACATCTCCAGTCCATATGACATGCAATTCGTGGACCGGGTCTATGATTTACCCACATCTCCAGTCGATGTTTGTGAGTGAGGAAAGGAAGCGAGACGAGTAAGAGTGAGAGAGAGAGCGAGAGAGATTAGACTGATTGTGAGTGACGAAAGAAAGCGAGACGAGAGAGAGCGAGAGAGCATGGCAACGTGACAGTTATGGCTGGATTGATCGAGACATGTGAGCAAAATCGTGGACCGCGATTTCATAAAGCCCACACGTGAACAAAATCGTGGACTGGGTCTACTATTTGCATGTCATGTGGGCTAATTTTATGAAATCGTGGACTCCGTCTACGATTTTCCTACCTATTTTTTAAAATACTTTTAACTCTACCATATTTTTGTCATTCTTTATTAAAATAACATTATTTTTTAAAAAATCTTAATTTCTACGACGGGGACTAAATCGTTATAAGTTTTAGAGTACAAAGACTAAATTATTAGGCAGTAAAGTTTATGGATTAAAATGTTACAAAATTAAAAATATGAGGATTAAATCATTATAAACCAAAGTTTATGGATTAAATTATTACTTTTATGAAAGTTTAGGGACTAAAAGTTATTTTTAGTCATTTATTTATAAACTATAAATATTAAGTCGTTACATAATAAAGTTGACACTTAATTTTGAATGGATTTTTCACAATATGGAGTAAATTGTCACATATTTAAAAATAAAGAACTAAATTGTTATAATTCTAGTTTAGAGACTAAATTGATGCAAGTCTGAGAATATAGGGACTAAATCTTTATTAACTCGGTTGAATGAAATTTAGGAACTATATATATATAGGAGTGAGAGCATTGAAATTTCCAAATGACTTCTTCATACACCATTTATGCAATGATGATGCCATAATGGTCTATTGTGAAGACGGCCCCACTACATGTAACTTAATTAAACAAATTACATAATTTTTCATTTGCTTTAATATTATTTTTAATACTTTTCTAATTTTCCCTTGTCCTCATTAATCTTATGTTTGAATTCATGATTTGGACTCAAGGACATTTAGCTTTTTTTGCTTGTATTTTCTAGTTTGGCTATAAGTAGTAACATGACTTTGACTTGGTAAACTATAAACTTAACTCAAACCAATTAATAAATAGTAGCCTAGTAAAACCATGTTAGACCTAAAGAATATAATACAACTATTTAAATAGTAGCACTAGTGCTAGTTAAAAATTAATGATAATAATAATTGTGATGATTTAAGAAAGTATTTATGAGGCATAATGATTAAGTTCTAACATTTAAAGCCAACAAGACTAAATCCTAAGTGGTTGTTTGAGCCCTACTCCATATATGAGGCTCAATTTTACATACAATTGACTATAATATTGAGATTTCAAGTTCCTATTCATTATCGTGTTTACTATTTCCTAGTAATCTCGCATTCCTTCTTGATTACAATGTTTACTATTTCTTACTTATACTAAAATAGTTTGTACCCTAAATAATATTAAAATGGTCTACATGCCAAACACGTACTTATTACTACCTACAGATTATAAGAATCAACTCAGGGTCTCAAATACCCCCCAACTTCCTTCAAGCGATAGAGACCAAATCTGCAAGTTAACCTTGAATATATCAAAAGTCGTCCAATTAACTCAAATGATAACATCTCCTATCCACTAAACTATATTCAAATTAACTGATATTTTTACAAATTAAAAATATGACATCGCAGTCTAAATCAAGAAAATATTTTATATATATATATATAGGAGGATAACATCTCCATTAAATAGGCATTCTATATTAAAAAAAAAAATCGTGAGAGTTTTTATAAATTAAAAATTAGAGAAATATGTGACCTATATTTAATAATAGATAATTTAAAGCTTATTTAGTATTTCATTCCTATTTTTGATTCATTGATTTAAATGAAACTAGTTATTCTCTTACTTGCTGAGTTGATTTTTTAAAATAGTATTTGTATTAATTTTACTTTATAAGTGGAAATTTTTAAATTTAAAACTAATACTCATATCTTATCAAAATTTGGAAAAAAAAAAAACATGAAATATGAGAATTTAGACATCCGACCTTAAAAGAATAATATACGTAAAATTTTCTTTAGTTATGTTCATTTTGAAAAATTTAAAATTAAATTACGTCTTTAATTAAAACTCTTGGTTGCATATCTATGTCTTTTAATCAATAAACAAACACTCAAATTTCTCTATTTTTTCTAAATTCAAATGGATCACTTTTGGAATGATCTCGACATAATAATCTAAATTTTAATTCCTTTTACAATATTAATAACTAATTTCATATATTTTTGGAAATTACATGAATTAACAATAAAAAAAATAAAAAATAAAAATGCCTCGACAAGGGGCTTCCGTTGACTTTGATTTATGACTTTGAGGATTCATTTATGTTATAATGTATTAATAATCATAAGGTCTATTGACTGTCTGCCCCCACAAATATATGACATTGCATTTTTCCATCTCATTGCTTTTTTCATAATTTTATAATAATCTTTTTTGGGGTATTTATCCCCCTACCTTTATTTTTATTCATTAATTCATGTGCTCATTCATCATATTTTTGGGTCCCTATAGTTTTTTTTTTCTTTTTTCCATTTAATATAAATGTATACTTTTTTTTATAGATTATTTTTAAATTAAACACATAAAATTATCTTAAATGACAAAACTGTTAAAAATATTTACAACTAAGAGCAAAATACACATTATCTACGATAAACTACTATAAGTGTCTATCGCGATATATCGTAGATAGACAATGAAATTTTGTTATATTTGTAAATATTTTGGTTACTTTTATTATATTTGAAAAGAGTCCTTAAATATATCAAGGAATTTTGTAAAAATTGGGACCGCTTTCTAATCAATTACTTGACTCCATCTGTCAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAAAAAATCATTTTAGTAAGTTTGTTCAATTTTAGTCATTATACTTTCAATGATCCAAATTTAGTCTCTCTACTTTCAATCAATCTTAAAGTTAGTCCCAATTGCTATTTTATTGTCGGTCTTG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BLAST of ClCG05G001890 vs. Swiss-Prot
Match: CRF2_ARATH (Ethylene-responsive transcription factor CRF2 OS=Arabidopsis thaliana GN=CRF2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 2.8e-17 Identity = 55/118 (46.61%), Postives = 71/118 (60.17%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. Swiss-Prot
Match: ERF55_ARATH (Ethylene-responsive transcription factor ERF055 OS=Arabidopsis thaliana GN=ERF055 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 1.8e-16 Identity = 48/99 (48.48%), Postives = 62/99 (62.63%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. Swiss-Prot
Match: CRF1_ARATH (Ethylene-responsive transcription factor CRF1 OS=Arabidopsis thaliana GN=CRF1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 2.4e-16 Identity = 41/61 (67.21%), Postives = 45/61 (73.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. Swiss-Prot
Match: RAP24_ARATH (Ethylene-responsive transcription factor RAP2-4 OS=Arabidopsis thaliana GN=RAP2-4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 6.8e-16 Identity = 53/127 (41.73%), Postives = 71/127 (55.91%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0L8Z9_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_3G124760 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 397.9 bits (1021), Expect = 9.1e-108 Identity = 199/220 (90.45%), Postives = 208/220 (94.55%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TrEMBL
Match: A0A067H4Y1_CITSI (Uncharacterized protein (Fragment) OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g037119mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 1.3e-50 Identity = 129/234 (55.13%), Postives = 145/234 (61.97%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TrEMBL
Match: A5BB59_VITVI (Putative uncharacterized protein OS=Vitis vinifera GN=VITISV_011417 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 205.7 bits (522), Expect = 6.6e-50 Identity = 133/257 (51.75%), Postives = 163/257 (63.42%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TrEMBL
Match: B9RDK4_RICCO (Putative uncharacterized protein OS=Ricinus communis GN=RCOM_1613750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 204.9 bits (520), Expect = 1.1e-49 Identity = 126/213 (59.15%), Postives = 143/213 (67.14%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TrEMBL
Match: V4VY88_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10023764mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 204.5 bits (519), Expect = 1.5e-49 Identity = 127/232 (54.74%), Postives = 143/232 (61.64%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TAIR10
Match: AT5G19790.1 (AT5G19790.1 related to AP2 11) HSP 1 Score: 100.9 bits (250), Expect = 1.2e-21 Identity = 69/209 (33.01%), Postives = 98/209 (46.89%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TAIR10
Match: AT4G23750.1 (AT4G23750.1 cytokinin response factor 2) HSP 1 Score: 90.5 bits (223), Expect = 1.6e-18 Identity = 55/118 (46.61%), Postives = 71/118 (60.17%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TAIR10
Match: AT1G36060.1 (AT1G36060.1 Integrase-type DNA-binding superfamily protein) HSP 1 Score: 87.8 bits (216), Expect = 1.0e-17 Identity = 48/99 (48.48%), Postives = 62/99 (62.63%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TAIR10
Match: AT4G11140.1 (AT4G11140.1 cytokinin response factor 1) HSP 1 Score: 87.4 bits (215), Expect = 1.3e-17 Identity = 41/61 (67.21%), Postives = 45/61 (73.77%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. TAIR10
Match: AT1G78080.1 (AT1G78080.1 related to AP2 4) HSP 1 Score: 85.9 bits (211), Expect = 3.9e-17 Identity = 53/127 (41.73%), Postives = 71/127 (55.91%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. NCBI nr
Match: gi|659075362|ref|XP_008438105.1| (PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF071-like [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 399.1 bits (1024), Expect = 5.8e-108 Identity = 200/220 (90.91%), Postives = 207/220 (94.09%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. NCBI nr
Match: gi|449433103|ref|XP_004134337.1| (PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF071-like [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 397.9 bits (1021), Expect = 1.3e-107 Identity = 199/220 (90.45%), Postives = 208/220 (94.55%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. NCBI nr
Match: gi|702326492|ref|XP_010053650.1| (PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF087-like [Eucalyptus grandis]) HSP 1 Score: 209.1 bits (531), Expect = 8.6e-51 Identity = 136/263 (51.71%), Postives = 164/263 (62.36%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. NCBI nr
Match: gi|641867306|gb|KDO85990.1| (hypothetical protein CISIN_1g037119mg, partial [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 1.9e-50 Identity = 129/234 (55.13%), Postives = 145/234 (61.97%), Query Frame = 1
BLAST of ClCG05G001890 vs. NCBI nr
Match: gi|568876806|ref|XP_006491461.1| (PREDICTED: ethylene-responsive transcription factor ERF027-like [Citrus sinensis]) HSP 1 Score: 208.0 bits (528), Expect = 1.9e-50 Identity = 129/234 (55.13%), Postives = 145/234 (61.97%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of watermelon (Charleston Gray)
Date Performed: 2016-09-28
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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