Cucsat.G9024 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CATTGATGCACTAAACATAATACGTTTGTTGCATTGTCGATACATTTGTTACGATTTGTTCATACACTTGATGAGTTTAATACACTCTCTCTATAAGTTTGATACACCAAATACACTACTGATAAACGTTTTATACTTCACCGATACACTTGAAAAATTCAATGCACTTGATACAGTTCATATGTTTGATACCCTTGATGTATTGATACACTTTCTATATCTACCGATACACTCAATTGATTAAAATACACTTGAGATTCTCTGTTGATACACTTAATATACTTCACTAGTAAACATTGATACATATTATATGTTTGATACACTAAGTTATATCATTCATGTACTTAATAATACTAAAACGAATGTATATCAACCAACTAACAGTTTAATACTAAAATGGATGTTGTGAATTATTTTGGACTAAAAGATTAAAAAGAAGAAACTCTAAAAGAGTTTGGAAAATTATAAAGTCTCACGAAAAAGACAGAATTTCAAAGTCATAAACCATAAAGGTTGGACCCAAATTCGCCTTGGAAAATAAAATAGTTTAGATCATAGACTTGAACCAAGCTACGTTCAATCTTGACCAAGGTTGAAGTTGAAGCCTTCCTTTTCAACGAATTGGTTGATTGATCATTAACCCAACTAAACATGGAGATCAAGAGAGGAATAAGGTATGCCAAATATATCATAGGTGATCAAATCCTCTTTATTTTACATCTCTCAAAGAAAGAAAGAAAAGTAAACTAAAACAAGGGTAGTGATGAAACCACGTAACAAAAGGGTATTTGTGATCGAAATCAAAATTAAAAATCAAAAACAAAAAGAAGAAGAAAAGATCCCTTTGAAGAAATACCACAAGATAATTTTGTGTCTTAAATGAAACCTCTGATCTTCTAGTTGTTTTTCTTTTTGACAAACCATTCTCCTTCCTCCACGTTTTCTTATTTTTTGTATTTTCCAACCGTCTCCATCAAATATTAAAAAATATCCAAAACAATGATATATGATAACAATTTCTTCTTCAACAAACTGAAACTAATAATACATTATTATTACTTCTATTATCTCTTAAACCGTGCGGTGGCGCCGCCGTAGAACCATGGCTTCGGCCTTCCATTATTACAGCTGCTGCTGCTGCTTCTTTTCCATAAATGGTGGGAAAGGCAATAATAGAGTTTCTCCAGTGAGGCCGAGGGCAGTGGCTCCTAATTTTGAGGTAATATATTTCTTTAATACTTTGCCCTTCATAATCTAACATCTCTTATTTATGCTTAAAATACTCTTTTTTTATTTTTTACAACTATGGAGTGTAAATGGTTTGTGAATTTTTTAACTCAAAAACCAAAACAAAGGTTAGGAAATGGAAGCTTAATTAATGTTATAAAGCTTGGTGGTATATATAAATTTTGTATGTATGTAATGACAGGAAGAGAAAGTGATCAAGTTGGGGGGTTCTGAAGTGAAGGTAAGTAGGCTTGGAATTGGAGCTTGGTCTTGGGGAGATAACATCTATTGGAATAATAATAGCTTTGATTGGGATGGTACATTTCATCTCTAGCTCTTTCTCTCTCAAAATAATAATATATCATGTGTATTTTGATTTCTTTTTTCTATTCACTAACTATTTTGGTTAAACAAAATTTCTTACCAAAGTTAATGTAGAGAAAGAAGAGATTGAGATTGGTAATACAGAAATTGTTGTTTTCTTTTTTTCCTGGAAAATGATGAAAGGAAAGGAGAGAGAGTTGTTATGTTCCTATAAACTACAAAGCCAAAATTGATGTTAAGATAGTGATTAATGTCGTATCTGCTAACGTATACTTGGATTGAATAATTGATGTTTGGAAATTTTCTTTCTTGGCGTGTGACTTCAGATAGGAAGATGAAAGCTGCTAAAGCTGCTTTTAATGCCAGTATTGACAATGGCATTACGTTCATTGATACTGCTGAAATTTATGGCGCTCCAGTGAGATATATCACTATTTTATTTTTGTTAATATAGTTCTCGTCTGGTAACAATTTTATTCTTTTTTTAAAAAAAAATTATGCCTATTTTTGTTGTACTTGTTACAATGATTTGCATTTTTCTTAAACATAATAGTTAAATTCTTAATCAAATTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAACAACTTTTGTCTTGTTTTTTTAAAACTATTGGTAGAATGTAGATAACAAATAAAGAAAGCTGAAGGCTGAAGCAGTATCTATAACTTAATTTTTTTTAAAAAAAAAAACTAATAACAAAATAGTTAACAAACGAGGTCTGTGTTGTTAATTATGTTCCAAAAGTGACATTTGCTAATTGAAATCGTTAATTCCTTTTCTTATGCAGTACACGTTAGGCTCAATAAATTCAGAAACTCTTCTAGGAAGGTATTGTTTGAAACACTAAGGGAATATTTGAAAAACAACTTTAAACGGGTGGATTGTTCTATTACAGCACACTGCATACGTTTGAGACTTCAATATCAGTTAGTGTTTACAACTATTATAATAATCTATAATTAACTGCATAATATTACTATTTTAATTCTCTTTACACTTTTAACTATTTGATATAACATTTACTATTTACTCATCATTTATATTTTTCTCTTTTGTTGCTACATTTCCTATTTTCTTTCCAAAACTAAAATGATATGCACTCTAAACACAAACTATCATATATAACATATAATTAACTATAACAACCAACTCTCATCAGTGTTCTAAACACCCATAAAATCAGTTTAGGAATATTTATGTTTATCTTGTTCGTTTTGTTTCTTATCTTTTTAAGAGACTAGATTATTTTGATAACAATTTTTCTTTTTAGTTTCTTAATAATTTAGAACTAAGAAATACATAAACAATTATCAAGCAATTTTTTCTCTTAAAAGATGAGAAACAAAAAACAAGAAACTTTATCAACGAATTTGTAGTAATTATCAAATGCTTAATTATGTTTCTATAAACTACAAAGCAAAAAGTATGTCACTTTTTAACGACCCCTAAGGTTATGCATTAGTGGCAGCCACTTGCTCGAAATCCTTCTAATAAAAAACAATTCCAAGTTTTTCTTTAGATTCATTAAAGAAAGAAAGCGAAAGGATCCTGGATTTGAGATCACAATTGCTACCAAATATGCGGTTTTTCCATGGAGGCTCGGTCGTCACAGTGTCGTAAGTGTTCTCAAAGAATCACTTTGTCGTCTCGGTCTCGAATCGGTTGACTTGTATCAACTTCATTGGTATGCGCTGCTCTTTAAACTCTCTTCTCATGTTCTTGTTTTACTGTAGTTATTTACTCATCGATCCCTTTGAATTTCAGGCCTGGAATATGGGGAAATGAAGGTTTGTTCAAAGTAGTTTGAAAGTTATTTGAATTTTTTTTTTCTTTTGAAGGATTTAATGACCATATGATTGTGAAGAAGAAGCCTAATTAAGTTCATAAAGAAATCATTTTTCAGAGTATATTGATGGTCTTGGAGATGCTGTTGAGCAAGGACTTGTGAAGGGTGTTGGTGTTTCTAATTATAATGGTATATGTTCTAATCTTAATTTTGGTATATATACAAACTTAATTAATAATGTGATGGCAAACCTTTTATAATTTTTGTTGTCCTATAAAAATGAAATATATTTGTTAATAAAAGTGTGTAGTTCTGGTCGTATATGTATCCTATTTTCTTCTATAAATTTCCACTGCATGCATGCATGCATGTCATGTTGTGTTTATGTCTTATATTCATTTTCTATAATGTAGAGAAGCGACTTCGAGATGCGTATGAAAAACTAAAGAAAAGAGGTATTCCACTAGCTTCAAATCAAGTGAATTATAGCCTCATATATAGATTACCTGAAGAGAACGGTGTGAAGGCTGCTTGTGATGAACTTGGGGTCACCTTGATTGCTTATGCACCTTTAGCTCAAGGTAATTAATTCCACACCTAACACTAAATGTATTTTATAGAAAATTATTTCATTCACGTATATTCTGAGTCGCATCTTCAATGATTGATTTTTTTTTTATAAAGATACTTTAGGATAGCTGATGCAAGGATATCTCCACATGGGGGACATATCATAGCATCAGCTATAGTCCCACTTTATTAATAATAAAAGGTGATTATAAGAAGCGGGGGAATAGAAAGGCTAGAGGGCAGCCCGATTATCCCAAAACGAAAGCATGTAAATTTAAAGCAAAAGTATTAGACGAGTAGTTTTTGAAAAGTGAAGATCGGCTTGTCCATAGACCGGTTGTGGCTTGAATGTCTTCAATGATTGATGCAATATTAAATTCATATTCACCCACTAGCTTAAGTGTCTTTTGGGTCGGTCAAACTTCTTCATTATTGTTTTACTCCCAAATTAATATTCATTTCCACCTTGTTGGATTATATAGAATTAAATTCACCTTTACCCACTTAGGTTAAACTTTTGGATCGAGTTGGTGATTTAAGATACTCAATTTTTGCAGTTGAACTTAGTTAGTGGTTCGATTGGAGTTCTCAATAACAATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTATAAATATTTTTTAAATTTTTCTACCCTTACAAACCGAAAATGCACCCAAATATTGTTTGGATGCACATACACATTTTTATTCACTTTTATTTGGCAAATATATTTAGATTACTAATTAAAGGAGAGATATATACCTCACCAACAATTGTCTCTACTTTTCTTTTTCTTTTTACAATTTGGAAACTTTGGGATCTTTCTTCAACCTCTTCTTAAGAATATATTGAAAAACCTAAAATACATTAGTTAATTAAGTTTTTAAAAAATGTAAATAATTTTAATATGGTATTATGAGAATTAAGTAAAAAGAAAAAGTTATAATTTTGAATTTTGCCATGATTAAAAGATTTTGTCATTTTTATACATGTGAGTCAACCGTTGTTTTGTTGTCCTTCTCTTTGATTGAACATGATTCATATCTTATAACGATCGTCTAAATGAATTATTTGTTGAATT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ATGGCTTCGGCCTTCCATTATTACAGCTGCTGCTGCTGCTTCTTTTCCATAAATGGTGGGAAAGGCAATAATAGAGTTTCTCCAGTGAGGCCGAGGGCAGTGGCTCCTAATTTTGAGGAAGAGAAAGTGATCAAGTTGGGGGGTTCTGAAGTGAAGGTAAGTAGGCTTGGAATTGGAGCTTGGTCTTGGGGAGATAACATCTATTGGAATAATAATAGCTTTGATTGGGATGATAGGAAGATGAAAGCTGCTAAAGCTGCTTTTAATGCCAGTATTGACAATGGCATTACGTTCATTGATACTGCTGAAATTTATGGCGCTCCATACACGTTAGGCTCAATAAATTCAGAAACTCTTCTAGGAAGATTCATTAAAGAAAGAAAGCGAAAGGATCCTGGATTTGAGATCACAATTGCTACCAAATATGCGGTTTTTCCATGGAGGCTCGGTCGTCACAGTGTCGTAAGTGTTCTCAAAGAATCACTTTGTCGTCTCGGTCTCGAATCGGTTGACTTGTATCAACTTCATTGGCCTGGAGTATGGGGAAATGAAGGGTATATTGATGGTCTTGGAGATGCTGTTGAGCAGGGACTTGTGAAGGCAGTTGGTGTTTCAAATTACAGCGAAAAGCGACTTCGAGAAGCTTATGAGCAGCTCAAGAAAAGAGGTATTCCACTAGCTTCAAACCAGGTCAATTATAGTCTTATATACAGACTACCAGAAGAGAACGGTGTGAAGACTGCCTGTGACGAACTTGGAATCACCTTAATTGCTTATTCGCCTATTGCTCAAGGCGTTCTCACGGGAAAGTACACTCCTGAAAATCCTCCAACTGGTCCTCGAGGCCGAATATATACTCCAGAGTTTTTAGCAAAGCTCCAACCTCTTCTGAACCGGATCCGTGACATAGGACAGAATTACAATAAAACACCCACACAGGTAGCGTTGAACTGGTTAATAGCACAAGAAAACGTCGTGCCGATCCCGGGAGCAAAAACTGCTGAACAAGCTATTGAATTTGCAGGTGCATTGGGTTGGAGAATCTCCAATGAAGAAATCAATGAACTTCGCTCCTTGGCCAAAGAAATCAAACCTGTTGTTGGTTTCCCTGTTGAGAAGCTCTAA MASAFHYYSCCCCFFSINGGKGNNRVSPVRPRAVAPNFEEEKVIKLGGSEVKVSRLGIGAWSWGDNIYWNNNSFDWDDRKMKAAKAAFNASIDNGITFIDTAEIYGAPYTLGSINSETLLGRFIKERKRKDPGFEITIATKYAVFPWRLGRHSVVSVLKESLCRLGLESVDLYQLHWPGVWGNEGYIDGLGDAVEQGLVKAVGVSNYSEKRLREAYEQLKKRGIPLASNQVNYSLIYRLPEENGVKTACDELGITLIAYSPIAQGVLTGKYTPENPPTGPRGRIYTPEFLAKLQPLLNRIRDIGQNYNKTPTQVALNWLIAQENVVPIPGAKTAEQAIEFAGALGWRISNEEINELRSLAKEIKPVVGFPVEKL Homology
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94A68 (Uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=At1g06690 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 236.9 bits (603), Expect = 1.9e-61 Identity = 113/159 (71.07%), Postives = 133/159 (83.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q56Y42 (Pyridoxal reductase, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=PLR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 92.8 bits (229), Expect = 4.5e-18 Identity = 54/135 (40.00%), Postives = 76/135 (56.30%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P80874 (Aldo-keto reductase YhdN OS=Bacillus subtilis (strain 168) OX=224308 GN=yhdN PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 68.9 bits (167), Expect = 6.9e-11 Identity = 45/142 (31.69%), Postives = 69/142 (48.59%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XQ45 (Probable aldo-keto reductase 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os04g0339400 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 1.2e-07 Identity = 43/135 (31.85%), Postives = 70/135 (51.85%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P77735 (1-deoxyxylulose-5-phosphate synthase YajO OS=Escherichia coli (strain K12) OX=83333 GN=yajO PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 58.2 bits (139), Expect = 1.2e-07 Identity = 37/130 (28.46%), Postives = 69/130 (53.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. NCBI nr
Match: XP_004149518.1 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus] >KGN54951.1 hypothetical protein Csa_012699 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 366 bits (939), Expect = 1.27e-124 Identity = 181/181 (100.00%), Postives = 181/181 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. NCBI nr
Match: XP_011653986.1 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 366 bits (939), Expect = 2.91e-124 Identity = 181/181 (100.00%), Postives = 181/181 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. NCBI nr
Match: XP_008466804.1 (PREDICTED: uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 334 bits (856), Expect = 5.12e-112 Identity = 162/181 (89.50%), Postives = 172/181 (95.03%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. NCBI nr
Match: XP_038898043.1 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic-like isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 311 bits (797), Expect = 6.25e-104 Identity = 153/181 (84.53%), Postives = 167/181 (92.27%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. NCBI nr
Match: XP_038898042.1 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 311 bits (797), Expect = 4.43e-103 Identity = 153/181 (84.53%), Postives = 167/181 (92.27%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L491 (Aldo_ket_red domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_4G615230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 366 bits (939), Expect = 6.13e-125 Identity = 181/181 (100.00%), Postives = 181/181 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CS16 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504124 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 334 bits (856), Expect = 2.48e-112 Identity = 162/181 (89.50%), Postives = 172/181 (95.03%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CNJ8 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111012897 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 281 bits (719), Expect = 1.42e-91 Identity = 137/181 (75.69%), Postives = 157/181 (86.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FHH6 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111445810 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 280 bits (716), Expect = 4.03e-91 Identity = 137/181 (75.69%), Postives = 157/181 (86.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G9024 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IZC3 (uncharacterized oxidoreductase At1g06690, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111481268 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 280 bits (715), Expect = 5.72e-91 Identity = 137/181 (75.69%), Postives = 157/181 (86.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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