Tan0018182 (gene) Snake gourd v1

Overview
NameTan0018182
Typegene
OrganismTrichosanthes anguina (Snake gourd v1)
DescriptionUnknown protein
LocationLG04: 16866551 .. 16869996 (-)
RNA-Seq ExpressionTan0018182
SyntenyTan0018182
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GATCCTCTTTTTTTCGTTTAGGGTTTTCACGCATTTTTCCCCAAATCTTTTCATCTTCTCACTCATTTTCTCTCTAGGGTACGATGTTGCTACCACTTCTTCTTCTGAAATTTGTCCATAAAGATGGCGATAATTGGTTGTTGTTTGTTTGTTACCTTGTAGAGTTTAATTTCGTCCACGATAGTCAAAGAATCACTCACTTCGGGCTTTCCTTGCAGATAAGGTACATTCCATTTTCACTTTTGCAATGGCTAGCTGAATCAGCGATGGTCCTTTCCGGAGGCTGACAAGGATTTAAAATCGTTCGCTTTTCAAATAATGTTTGTTTCAGAGCTCAGACCAGTGAAGACGACGATCGAATTGAGATTTGAAGCTTCGGTTCTTGGCAATTGATATGCTTGTGATCTGTAACTTATAATTTGTTTTTGTTGTTTGATTTGTTCTTGATCTATTTCCAATGACAGCTTCAACCCTAGCAAGCCCTCATTGGTGGCGACACGAAGGATCCCTGTGTGCTGACTTGTAGCAGCAACGACAAAAGAAGTCATAAAACATAGCTCACAAAATCCATGATAAAAAGATCAAATAGATCGCAAAGAGGGAGAAAAAACTTATGCGACCTGGATTCGAAGGTCGCAAGGAAGGTTTCATCAACAAAAGCACATCATAAAGTAAAGAGAAGTAAGTTTAATCTTTGCAATTACTGTCCCAGTTTTGCTTCTTTGCTCGAGGCGGAAAAGAAATTTGCTCATGATGTCAATCATCGTATTCTCATATACTTTATTCATATCCTTGATAATCTCAGGGTCATATATGTTTGGGGAAGATATTTTAACATGAAAATCTCCAACCCAATTCCACAATCAGATCAGTTATGTTTTGTTGGAAACTTTGTAAATTTATAATCTATAAATATAGTATTAAGAGAGGATTCTTTAACCCAAGTTTATTTTGCTCACAAAATAAAAAGTATTTAGATTAAATCATAAGTTTACGTCTAAAGTGTTAAATAGGTGGTGTTTGAACTTTCAATTTTATTTTAAATTTTGTTTTTTCTAAAATTAAATAGTTGAAATTTGTTCATTCTTTTTTTCTTTAATTTTTTTTAATTCGAGGTTTATTAGAGATAGAATTGAATTAAAACACTACAATTTCTTGTATGATAATTGGCAATGGTAATATTTCTACTTGCATTTCTTATGATAAAACTCTAAAGTGCTAAATTTAAATGAGGGTTGTAAGTTAATTTCTTACTATGAAAGGACAACTCAAGGATTTTTTTTGTAAGCTTTTTAAATCAAATATGAGATAAACTCCTCAAGGGTTCAAGGATTTAAATTCTCTAAAATGTAAATCTAGTCTAAATTCTCTAAGATATTAATCTAGTCTATATATCCATATTTGAATCTTCAAATAGGTGCACAACTTGCATCTTCACATGTTACTAGTTTACATCAATTAGCTTAGCATATCACTCTCATCGACGGTTTATGAAACAGAATGTTGATTCAAGGCCTATTGGTTTCTTGATACATGTTGTTGGGCAATCACTGTAATGTTTGTGAAAACACGATTGGGTTCGAAAACCTTGCTCTTTTTCTTTTCCCTGACATATTTTCATTCCTTTGATGTTTGACCTCTAATGAAGCAAATCAATGTAATGTTTGTGTTCGAAAGTTCTTCTCAGACTCTAGAGAATAAGATATTTTGTCATTTCATTTTCCTTTTCTTTTGGGTGCGTTTAATATTTTTTGTGCAATGCTAAACACATTTCTTTCTTTTTTCATATGCAATTGACTCATTCTTGAATCTGAAATAAATATAGAAACTTTATACTTTAGAATATGTTGTTTTGAATATTCAAGTTAATTTTTTCCTTATTAAATATGTGAATATTTATTCCAGCAAGCACTACCTTTCCTTGGTTATCTCCTCATCTAGGGTTGGAGTTCATTCCAAATAGGAGACATGTATTATGTGAAACTAACAGCTGCCTTGCAATTTGAGCTTCTCTTTCATTACAGTCGGAGCTAAAGAGAGCCACTGCCCATTTTCAATACTTCGACCACCTTGCTCCATGAGTTTTTCAGGTAATTCCTGAGGTATTGTTGGCTTTTAACTGAGTGCTTTCGAATCCAATTGTCGCCTAAAACTGGTCCTAATTCACTGTCTTTCACTTTCTGAACAATGTATCGACCATTGTTCATCAGAAACACAGAGCTTAAGAAAAGATCCTTGTATATCTTCGACCTTGCTTCCAAATTGCTATCTAAAAAGCTCCATGATCCAGTCCATTTGAACTGATAACGAAGATGATGCTGCAACTCTGTCCTCGAGCTTGGTGTAATCCTGCGAGGGAAGAGTGACTTCTTCGAAAACTTGCTCAAAAGTCTGCTGCGATTTAAAGGTTGTTATAAGGTAATTCATCACACATTGAGCAATTGGATGAATATATATATAGTATTTGTGTTCCTGATAAGTTTGAGTTGTTATGTTCTTGAGTTTAGCTTTAATTTTATATTTCATAGGCATCCAATATATATAATTGTTGCTCCATTATTTGTGTATGCAATTTGAACTTCTGTTTTATTCTCAGTTCGTTGAATGTGTTCATTGAGTGAAATAAACTTGTTTTGCTTGTGCATGTAATTAACATTTGATAGAACTTCAACATTAATGTTTAACCCCAACCCTTGTGTATTTGAAGTTAGTGGGTGGTTGGGAAGAATGGTTTGTTTTTGAAGTGTTTCTGATGTTAAAACAGGTCATTGAAATTTTCGAAAAGTCCTAGTAGCGTTGTTATCTTTGCGAAATTTTCGAGTGAACAACGTATCTTAAGTTACGCTTAAGTTAGGTTCACTCCTGAATTTAGGGTCGTTACACTTTGCATGCTTCTTAGGATTAGCGTGAGGTTACTTTCCTTCACTATTCGGGATGTAAGAGAGTTAGTGTAGTAGGAAGATGGGTAGTCGATGATTCGAGATCGTTGTGTTTTAAGAGGGGTTGGCATGATTGAGTAAATTCACTTGTTGCATGTTTTAGAGTTACGAATTATTAGAGGTAGGTTGCTTACTTAGTATGTTTATGCTCACCCTTGTTGCTTAATGTTGTGTTTTGTAGGTAATACTCAACTACTTGGCGGGTGACAAAGTGGTGTTCTTGAGAATTATGGTGACATTTTCAAAGTTTTGGTCATAATGTTGCCAATAAGTTTCATGTTTAAACCATTTACAGTGTGTTAGGTTAATGAATGTAAAGTTCTCTTGTATTGTAAACTTGTTTGAAGTGTTAGTTGAGTTTATGGCTTAGGATCGTTACAATAGTTCTTATAATTTTTGAATTGTTGACATGAGGTTTGATAAGTTCTTGTAATTTTACAATTGTTCATGAGCTTACGTTCAATATAATTTATTGGAATGCAATGCAGAAAATTCAGTGATTTTAGG

mRNA sequence

GATCCTCTTTTTTTCGTTTAGGGTTTTCACGCATTTTTCCCCAAATCTTTTCATCTTCTCACTCATTTTCTCTCTAGGATAAGGTACATTCCATTTTCACTTTTGCAATGGCTAGCTGAATCAGCGATGGTCCTTTCCGGAGGCTGACAAGGATTTAAAATCGTTCGCTTTTCAAATAATGTTTGTTTCAGAGCTCAGACCAGTGAAGACGACGATCGAATTGAGATTTGAAGCTTCGGTTCTTGGCAATTGATATGCTTGTGATCTGTAACTTATAATTTGTTTTTGTTGTTTGATTTGTTCTTGATCTATTTCCAATGACAGCTTCAACCCTAGCAAGCCCTCATTGGTGGCGACACGAAGGATCCCTGTGTGCTGACTTGTAGCAGCAACGACAAAAGAAGTCATAAAACATAGCTCACAAAATCCATGATAAAAAGATCAAATAGATCGCAAAGAGGGAGAAAAAACTTATGCGACCTGGATTCGAAGGTCGCAAGGAAGGTTTCATCAACAAAAGCACATCATAAAGTAAAGAGAAGTAAGTTTAATCTTTGCAATTACTGTCCCAGTTTTGCTTCTTTGCTCGAGGCGGAAAAGAAATTTGCTCATGATGTCAATCATCGTATTCTCATATACTTTATTCATATCCTTGATAATCTCAGGGTCATATATGTTTGGGGAAGATATTTTAACATGAAAATCTCCAACCCAATTCCACAATCAGATCAGTTATGTTTTGTTGGAAACTTTGTAAATTTATAATCTATAAATATAGTATTAAGAGAGGATTCTTTAACCCAAGTTTATTTTGCTCACAAAATAAAAAGTATTTAGATTAAATCATAAGTTTACGTCTAAAGTGTTAAATAGGTGGTGTTTGAACTTTCAATTTTATTTTAAATTTTGTTTTTTCTAAAATTAAATAGTTGAAATTTGTTCATTCTTTTTTTCTTTAATTTTTTTTAATTCGAGGTTTATTAGAGATAGAATTGAATTAAAACACTACAATTTCTTGTATGATAATTGGCAATGGTAATATTTCTACTTGCATTTCTTATGATAAAACTCTAAAGTGCTAAATTTAAATGAGGGTTGTAAGTTAATTTCTTACTATGAAAGGACAACTCAAGGATTTTTTTTGTAAGCTTTTTAAATCAAATATGAGATAAACTCCTCAAGGGTTCAAGGATTTAAATTCTCTAAAATGTAAATCTAGTCTAAATTCTCTAAGATATTAATCTAGTCTATATATCCATATTTGAATCTTCAAATAGGTGCACAACTTGCATCTTCACATGTTACTAGTTTACATCAATTAGCTTAGCATATCACTCTCATCGACGGTTTATGAAACAGAATGTTGATTCAAGGCCTATTGGTTTCTTGATACATGTTGTTGGGCAATCACTGTAATGTTTGTGAAAACACGATTGGGTTCGAAAACCTTGCTCTTTTTCTTTTCCCTGACATATTTTCATTCCTTTGATGTTTGACCTCTAATGAAGCAAATCAATGTAATGTTTGTGTTCGAAAGTTCTTCTCAGACTCTAGAGAATAAGATATTTTGTCATTTCATTTTCCTTTTCTTTTGGGTGCGTTTAATATTTTTTGTGCAATGCTAAACACATTTCTTTCTTTTTTCATATGCAATTGACTCATTCTTGAATCTGAAATAAATATAGAAACTTTATACTTTAGAATATGTTGTTTTGAATATTCAAGTTAATTTTTTCCTTATTAAATATGTGAATATTTATTCCAGCAAGCACTACCTTTCCTTGGTTATCTCCTCATCTAGGGTTGGAGTTCATTCCAAATAGGAGACATGTATTATGTGAAACTAACAGCTGCCTTGCAATTTGAGCTTCTCTTTCATTACAGTCGGAGCTAAAGAGAGCCACTGCCCATTTTCAATACTTCGACCACCTTGCTCCATGAGTTTTTCAGAAACACAGAGCTTAAGAAAAGATCCTTGTATATCTTCGACCTTGCTTCCAAATTGCTATCTAAAAAGCTCCATGATCCAGTCCATTTGAACTGATAACGAAGATGATGCTGCAACTCTGTCCTCGAGCTTGGTGTAATCCTGCGAGGGAAGAGTGACTTCTTCGAAAACTTGCTCAAAAGTCTGCTGCGATTTAAAGGTTGTTATAAGGTAATACTCAACTACTTGGCGGGTGACAAAGTGGTGTTCTTGAGAATTATGGTGACATTTTCAAAGTTTTGGTCATAATGTTGCCAATAAGTTTCATGTTTAAACCATTTACAGTGTGTTAGGTTAATGAATGTAAAGTTCTCTTGTATTGTAAACTTGTTTGAAGTGTTAGTTGAGTTTATGGCTTAGGATCGTTACAATAGTTCTTATAATTTTTGAATTGTTGACATGAGGTTTGATAAGTTCTTGTAATTTTACAATTGTTCATGAGCTTACGTTCAATATAATTTATTGGAATGCAATGCAGAAAATTCAGTGATTTTAGG

Coding sequence (CDS)

ATGATAAAAAGATCAAATAGATCGCAAAGAGGGAGAAAAAACTTATGCGACCTGGATTCGAAGGTCGCAAGGAAGGTTTCATCAACAAAAGCACATCATAAAGTAAAGAGAAGTAAGTTTAATCTTTGCAATTACTGTCCCAGTTTTGCTTCTTTGCTCGAGGCGGAAAAGAAATTTGCTCATGATGTCAATCATCGTATTCTCATATACTTTATTCATATCCTTGATAATCTCAGGGTCATATATGTTTGGGGAAGATATTTTAACATGAAAATCTCCAACCCAATTCCACAATCAGATCAGTTATGTTTTGTTGGAAACTTTGTAAATTTATAA

Protein sequence

MIKRSNRSQRGRKNLCDLDSKVARKVSSTKAHHKVKRSKFNLCNYCPSFASLLEAEKKFAHDVNHRILIYFIHILDNLRVIYVWGRYFNMKISNPIPQSDQLCFVGNFVNL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Tan0018182 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0018182 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0018182 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Tan0018182 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Tan0018182.1Tan0018182.1mRNA
Tan0018182.2Tan0018182.2mRNA