Cucsat.G18709 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTCTAAATGAGTGCTTTCGGCATGTGAAGTAAACCTCCCTAAAATGAAAATTGGTCCTCTATTCTATTTACGTAATTAACAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGAAAAACACTTTTACGTGAACTCTTTCGCACAGTATACGCCGAACGGCGGTCGTTCCTTTCGTCTTCTTCTTCTTCATTTCTAACAGTCTTCACCGCCGGAAAATTCTCTCAACTTCTCCCTTACAGCATGAAGCGCGTCTTCGAAGAAATTTCCGACGAAGAGTGGTCCAATCACTCCTTCAAGCCCTCTCGCGTCTTCACAAAACCACAGACTGAACCTTCGATCCCTCCTCCGATTGAATCTTTCGCATACCGACCCCACCAGCTCTATATTTCCGACGAGAGTAGCGACGATTGTGTCGTAGTCATGGAAAGTTCCAAAAATTATGAGGAAAATTTGGAGGACGAGGATGTCGAGGTTGAGGGAGTGAAATCCACCACGGCAGTGAGTCGTGGCCGTCGGTTTGTGGTTGATGACGAAGATGATGAAAGTGAGAGGGAATTGACTGAGGTTTGTGATGTAAAGTCGACGAGCGAGGAGGAGCTGGAGGAGGGTAGGGAGGATGACGATGATGTCGTCGGTAAGGCTTTGCAGAAGTGTGCAAAATTATCTGCCGAGTTGAAGAGAGAGCTGTACGGCTCTTCGGTTTCTGCCTCTGAACGATATTCAGAAGTGGAGTCTTCTTCCGTTAGGATAGTCACCCAGGTACATCTCAGAGTTCAATCTGAATTGGAGCGCTTTTATTTCCTCAGCATAATTATGGATTGATGTTGAATGGTCTTCTTGCTCGGTTTTGTTTTGTCCCTTAACAGATTTAATAGTTTTTGTTTAATAAGTGGATGCCATAAATCAACATCTAACCCTTTTATGATCCGTTAAATGTGTATATTGTTTGTTCTTTTTGTAAAACGAACCTCACAAGGAGAAATGAAAAAAATGAACAAGAACAAAGCCCGTACAATTGAGCCAAAGACTTTGCAGGATAGAGCTTCAATTGTTGCCATTTTTTTTTTGTTTGGTATGAAATAATTTTATTAATGTTGTGAAATTTACAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGAGGAGAATCTTCTTAGAGATGACAAGAGGTTTCCAATTTGTTTAAAGGGAAGCATAGGTATAAGACTTAAAGGAAGTTGGCACTGTACACCAGGATATAGCAAGATAAATTACCTGATCATAAGACCTATTGCAAGCATGTTTCTTATAGTAGACAGAATTCTTTTATTTCTTTTCATCTAAAAGGTCCCAAAAGAAAGACATAAAAATGTGCAACCACAACAATGCCTCATCCTTCTTTAGAAGGTGGCCAGAGAGGATGGTGAAGCGAAGGGTCTTCATGTCAATAGGGAGGGTCATCCCTCTTGACGATCTTCAACCTTTTACTCCAATTTTTCTGGTTTGGAGATTAATATGGCGAAGTGCCAACTCTTGGGGTAAATTGTCATTTGAACACAACTTGGGGTAAATTATCATTTGAACAAGGTGGGTAGGTGCGTTGATATGGTTGGATGTGAGGTGGGGTCCTTCCTTTATCTTGTCTTGGTCTTCCCGCTGGTCATAGCTTAAAATGTCTAAAGTCTTGGGATCCTGTGGTGAGTAAGAGTAAGATTTGAAAGAAGTTGGCACTTTGGAAGGGGGTTTTTGTCTCTTGAAAAGAGGCAGGATCCTGATCTAGTATTTCTATGTTTTGAGTTGGATTCCAACCTACTTCCTATCTCTCTTCAGGATTTGGTGTCAGTTTGTAAACTTTAGAGAAGATCAGGAGTGATTTCCTTCAAAATGATGGTGGAGGAGAGGAAAGGGGCACACTTAATAAATTTGTGCTGTCCTCTTTTGAGTTGATCCTTTATCTCTCTTTCTTTTCCTAATTATAAGTGAAGTCCTTGTGCTTTTGTTTCTCGAATTCATGAGAATGGAGTTTTTGAAGGTCTCATGGTGGAAAAAGATAAAATTCACGTCTCAATTTCGCAAGAAACAACTCTTGTGGTTGGATGATCCACTTTTATTCTGCAAGTATAATGAAGCTATGTTGGATATTCTGATCCAAACTATTAGGTTCTTTGAATGGTGCTCCGGACTCAAGGTAAAGGAACAAATCATTCTTCTGTGGTGTTAATGTTGATGATAAATTTATGCTTTCTACCTTCTCCATCTCCAAGCTGAAATGTAAAGCTGAAAAGCTACTGTTTTTGTATTTGGGTTTCACTTTCGGTGAGATATCCAAAGCAACTATCTTTTTCGTGGCTAATTATAGATAAAGTTTATAAAAAGCTAGACAGATGGGGTGGGGGCAGTATATTCGCAGGAGGTTGATTAACTTTGAGTAATGCAGTTTTGGCAAATTTACCTGCCCATTATATGCCAATGTTCCTAATGCCCAGTTTGGTGATCTCAGAAATGGAAAGAACTATTTGCTCATTCTTATGGGAAGTTTAAAAAGGGAGTAAACTGGAACATCTTGTGAATTAGGATTCCACTTCAAAGTCTTTACAGGGTGGAGGTATCGACTTGGGAAACTTGGAAAACAGGAACTTGGCTTTATTAAACATATGGAGTTGGAGATTTATTAGGAAACCTGATGCACTTTGGTGCAAAGTAATAAAGAGCATTCATGGTGTTACTTGTTAGCACCTTTCAGTGACATACATTAGGAAAGTATGGTTTGAGTTTGAGAAGCCCATGTTTTAGGATTTCAAGATTTGGAGTAAATTCTACTATCTAGTTAGGAAATGGGGGGAATATTTACTTGTTGCTTGATGTTCGGAGTCTTGATTCTTCATTCGAACTGCATTTCCCTCAACTATTTGATATAGCTTCATTCCCAAATGGTAATATATTTGATAATTGAGATTTAGAAACTTGTTCAAGTAACTTTCTTTTCCAAAGCAACTAAATGATAAAGAAATTTTAAAATTTACAACAGTTGAGGAGGAGCAATTTGGCTGACAAGCATTAATCTCAATCACCTCTTTTCTATTCTGGGTGATGACCATTGGATTCTTCAAGGAAATTTACTGTTAAGTGCTAACTCCTCATCCAACCACTTGATTACCTCGTCCCCTTTAAGAAAAGGAGATTGATTAGGCTTTGTGGAAATCTAAGAGCCCTGAGCTTATTAATATTTTGGTGTGAATAATTATTTTTGGAATCCTGAATTGTTCTACTACTTTGCAACATAAGCTTCAGGTGCACTAACTTTTGCCTTCTATTTGTACATTATGTATGGTGAACTGTGAAGATTTACAACAAATCTTGGTTGGCCCCATATTATCTTCAATGTCAAATATTACTGTTCAATATAGTCAAGGGGACCCACTCTCCCCTTTCTTATTTCTTCTGGTAAGTGAAGTTTTGAGTTCTTTGATTGCAAGACTACACGAAAAGGGGCTGTATTAAGGATTTTGGGTTGGAAAAGAAAAGGTGTATGTCTCTATTCTCCAATTCGCTGATGACACCTTAATTTTCTGCAAGTTTGATGATGAAAATGCTTGATAATCTTGTGCACCAGAAAATAAATTGGGAAAGATTTGCTGTACGTGGCATTAATGTTGATGATGGGAAACTTCTCTCAGTGGCAGCAAGGCTAAATTGTAAGGTGGAGCACCTTCCACTTGTGTATCTAGGCCTACCCTTGGGTGGCTGTCTGAAGGAGGTGGAGTTTTGGCAACCGGTTATTGATAAATTACAACGCAAGCTGGACAAGTGGAGAAGATACAATCTTTCTCGAGGAGGAAGAGCTACCCTTTGCAAATCAGTTCTCTCTAACCTTCCTATTTATTACATGTCTTCCTCCAGGTAAGGTTTTATCAAAGATAGAACAAGTTCTGAGGAACTTCTTTAAGGAAGGGAACAAAGGTGGAAAAATTAATCATCTCTCTTTGGCTTCTCCGCTTGACATGGCTCTAAAGAAGGCTTTTTGGAGGACGAGAAGTCCTAGACGAGTTAATATTCTGGTATGGATTATAATAGTTGGTCACTTAAATTGCTCCTCGGTCTTACAAAGAAAGTATCCTTCCCATTGTGTGTCTTCAAGTATTTGCGCACTGTGCAAAGGAGAAGAGAAAGACATTCAGCACATCCTCTTTGAGTGCGGTTATGCTCAAAACTGTTGGTTTGCATTATTTTAAATTTTTTGGCATCAGCTGGGTTTTTGGAAAAACAGCCGCGAGCAATGTTTTTCAGATTTTGGTGGGGCCAAAGCTTAAAAAGAATCAATAAATCCTGTGGATTAATGGGATGAAAGCTGTGTTGACTTATTGTGGTTTGAAAGAAACCAGAGGGTCTTCCATGATAAGGAAACTCCTTGGTTACTAGATTTGAAGCAGCTCGATTGAACGCATCCCTTTGGACCTCTCTCTCCGAGGCTTTTGCTGATTATTCAAGTCAAGATATTAGTTTAAACTGAAGTGTTCTCGTTTCCATGAATCGCGGATGATACCTTAGTTTGCTTGGTTTTTCAGTTTTAAGAAAACTTAAAGGTTGAAGAAGTGAAAACTTGAAGGTTGAAGAAGTGAGTGAGTTTCAGATTATTAAGGGGCTTTAGTCACACAGGAAAGAAAGGGTTGTAATCAACCAAAGTTAGTGGTTGTTGGCTCCTATTGGAAATTTTTGAGTTAATTCATTCCTCCGAGTTAAAGCTGTAATAATTCTATGGTATTACAGAAGTCTTAGTCGAAAATCGTTAATCTAATTTGGAAAATGGCTTTTGGTCACTGCTTGTCTTCTTCAATCTGCACTTTTGCTTTGCTGCTAGTGACTCTTCACACAACCTAGTTTTGATTGCTTATTGTCAACTTGTTTGCATCGTTTTCAGAATTTTGTGTTTGGGAAGATCCTAGAGATTTATTTTCGAGCAAGCTTCTCAGCGTAAGACCTCGATGGAGT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MKRVFEEISDEEWSNHSFKPSRVFTKPQTEPSIPPPIESFAYRPHQLYISDESSDDCVVVMESSKNYEENLEDEDVEVEGVKSTTAVSRGRRFVVDDEDDESERELTEVCDVKSTSEEELEEGREDDDDVVGKALQKCAKLSAELKRELYGSSVSASERYSEVESSSVRIVTQDDINAACKAEDSDFEPVLKPYQLVGVNFLLLLYQKGVGGAILADEMGLGKTIQAITYLVMLKYLNNDSGPHLIVCPASVLENWERELKKWCPSFSVLHYHGAARSAYAKELNSLAKSGLPPPFNVLLVCYSLFERHSSQQKDERKILKRWQWSCVLMDEAHALKDRNSYRWKNLMSLARNAKQRLMLTGTPLQNDLHELWSLLEFMMPNLFATEDVDLKKLLTAENNSLINHMKFILGPFILRRLKSDVMQQLVPKIQQVRYVAMEKQQEDAYKDAIDDYRNASRGRVGRNGNTNSDNIYNILPRRQISNYFVQFRKIANHPLLVRRIYKDEDVTRFAKKLHPLGAFGFECTVERVAEELKSYNDFSIHRLLLSYGITDRKGVLSDNEVLLSAKCRELAQLLPSLKRDGHRVLIFSQWTSMLDILEWTLDVIGFTYRRLDGSTQVAERQTIVDTFNNDTSIFACLLSTRAGGQGLNLTGADTVVIHDMDFNPQIDRQAEDRCHRIGQTKPVTIYRLVTKGTVDENVYEIAKRKLVLDAAVLESGIEMDNERESSEKTMGEILSAILLG Homology
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZUL5 (Protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ETL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 839.0 bits (2166), Expect = 2.9e-242 Identity = 398/509 (78.19%), Postives = 459/509 (90.18%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E7F1C4 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1B OS=Danio rerio OX=7955 GN=smarcad1b PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 338.2 bits (866), Expect = 1.6e-91 Identity = 198/515 (38.45%), Postives = 302/515 (58.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VL72 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Etl1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 336.3 bits (861), Expect = 6.2e-91 Identity = 201/481 (41.79%), Postives = 283/481 (58.84%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5FWR0 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=smarcad1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 3.4e-89 Identity = 187/485 (38.56%), Postives = 288/485 (59.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9H4L7 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCAD1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 321.2 bits (822), Expect = 2.1e-86 Identity = 185/498 (37.15%), Postives = 288/498 (57.83%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. NCBI nr
Match: XP_004140399.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 [Cucumis sativus] >XP_031741288.1 protein CHROMATIN REMODELING 19-like [Cucumis sativus] >KAE8648070.1 hypothetical protein Csa_018841 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1018 bits (2631), Expect = 0.0 Identity = 509/509 (100.00%), Postives = 509/509 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. NCBI nr
Match: KAA0067170.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK26018.1 protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 997 bits (2578), Expect = 0.0 Identity = 498/509 (97.84%), Postives = 504/509 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. NCBI nr
Match: XP_008460215.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 997 bits (2578), Expect = 0.0 Identity = 498/509 (97.84%), Postives = 504/509 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. NCBI nr
Match: XP_038877194.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 984 bits (2544), Expect = 0.0 Identity = 490/509 (96.27%), Postives = 501/509 (98.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. NCBI nr
Match: XP_038877196.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 984 bits (2544), Expect = 0.0 Identity = 490/509 (96.27%), Postives = 501/509 (98.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KSU2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G272400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1018 bits (2631), Expect = 0.0 Identity = 509/509 (100.00%), Postives = 509/509 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DR37 (Protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1567G00230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 997 bits (2578), Expect = 0.0 Identity = 498/509 (97.84%), Postives = 504/509 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC04 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 997 bits (2578), Expect = 0.0 Identity = 498/509 (97.84%), Postives = 504/509 (99.02%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXC0 (protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447914 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 966 bits (2496), Expect = 0.0 Identity = 480/509 (94.30%), Postives = 493/509 (96.86%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1JU99 (protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111487952 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 963 bits (2489), Expect = 0.0 Identity = 479/509 (94.11%), Postives = 492/509 (96.66%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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