CcUC03G051750 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC03G051750
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr03: 12653211 .. 12656460 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC03G051750
SyntenyCcUC03G051750
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GATAAGAGTTATTTGGTCGAAAAAATTTACATTTCAAATAACTAGAGAGTCCTTCGATCCAACCCAACTCAACTCACCAATGCCCCTATTCTCCACAGTTCACACTCCCTATGCAACGGTTGCTTAGCTCTTCAATCTTGAACTTCACCCAGCCGATCGGCAGCTCCACCTCTACGACTGCAGCAGGAACAGCAGAGTCGCATACCCTCTCCACGGTACCCCTATCTCTTCCCGCACCAGAAGCTTGATTTTTGCTTCACCTCTCATTTTCAATTAATCAATTTCTAATTTCATTAAAGATATAGATTTTTGGGGATTCATATTTAGGTGACGCTTAAATTAATTTATTAGTTTTAAAAAAGTATGTTAGTTTCGAAAAGTGAAAAGAAAATTTTCTTTCTTATTTATTTAAGGATGTGTTTGCTATTGAGGAAATTTTTATGGCCATAGATCTCCTTGCATTTTGGGCTGGGATAAAGAAAAACGAACTAGGTTTAATCGAATCAAATCCACCTGAACCGAAAATCAGGTAGTTCGGTTCAAAATTCAAAACCGGGAAGCTTCAATTTTGGTTGATTCCAAAGATATTGAAAATTGACATGTTCGGTTCAGTAACTAATTTTGCTCAAAGTTTGACCGTACCAAACTGCAAACATCCCCACTCATGCATAGCAGCCCCATACAGTCAATATACAAGTGAAAAGACCAAAAATTGAAATTAGTATTTTAAATAAGAAAATTATTATAAATAGAAAAAATATAAAACTATTCATATATACAGAAAAATTGTTATAAACTGTGACGGATTTTTATTGCTAATATAGTTAAGTGAAATTTTTTATATTTGTAAATAGTTTGAATCATTTTACTTTATTTAGAAACAGTCCTTTTAAAGATAATAATAATTTTTCTTTGAAAACATTTTTAATATGCTACACAACTAATTATTATAATTTTTTAATAGAAAAAATTCTCGGTAATTAATTCCTTTAAAGCTTGTTCAAATCCAACAGACTTGGAAATCTGAATAGCAATGCGTGGAGAGTTTAAAATTGAAGGTGAAGTTGAGCAGAGGCAAAAAGCCATTTCACACCTCTGTCTCTACCATTAACAAAGTCAGTTTCATCTTCCTGTCAATTTCAGATAAGTTGTGGTTCTTGTCCATGGTTTGATTATGTCACTTGTGGTTACGAGTTGGAGTATGTTGTTGGAAGCATTCTTGTGGATGTTTAATAGGTTGGTGGGGTTTGATCATGGGATGTGCTCGAATTGGATTAAATTGGTTAGCTTTCTCATTTTTTGAGGATAAGCTTGAGTTGGTTAATGAAATAGGTCATTTTGAAAGTCAATTTAGCTTCTCTTAGAAGTGGAAAGCAGGTCATGTGGAACATAAGTCTAAGTATAAAAGGACACAGATTGCTCTTGGAACCACAAGTTCAAAGAGATCCCATATGTCCAAGGTACGATAATCACCTTGTTTTTTCACTTCTAACTCTGCACTCAACTTACTTTGATTCCAAAATTTGGAGCATATTCAATATATACGACCTAGGTTTATATTGGGTTTTAATTCCTAACTCTCTCTCCTCTTCTGCTTTTTCTCTTTTCTCAAAAATGTATATCATGTCTTTGTCCATGAATTCTGTTATGGTTCCCAAATGTTTGATTTGTTGTTAAACTTGAATGATCAAGTTTGTGCACTGGTGTTAGACAATGTATTAAGCATCTCCTTTTGATTGTCTTTTCATCTTTGTTCAAGGACTTGTCCTGTTTTAGTAGGAATGACTATATAACATAAAGGATGACTCCACTGTTAATTCAAGAAATTGGAAGGTAGACTTACTGTTTTAAAAATTAGAGGGAAAAGAAGAAAAAAAGCCTTCTAGGATCAAACAAAATTTCCTGTTCTGTATTTAATTTTCAACTTCTTATAGACTTATAGTCATAATATATTGTCGTTAACTTGTTACACAGTGGCGAACTGCAGTTTCCTATCAAGTCTTTGATGGCTTCCTCCTAATTGCTATACTGATAATTCTATTGGTAATTGGTAATGAGTGGCCATGGGCAGAGTGGAGGAGGAATATTCAACTGACATAAAGTGACGATGCCTAAATCACTAATTATGACATTTTGGTCCTATGGTGTAGATTGATGGTAACCTTCGTACATCATTATGGTCCTTGTCCTTGACCCTTGAAATCCTGTTTCAAATACCAAAATTTTAGTTGGACAAGCTATCCACTTATACCTCAAGTTAGCATTATTATGGCAAAATTATATTATCTTTGTAAGCTTCTTTTAGTTGTCAATGGTCGAGCAATTATGGAATATATCCATTAGCGACCACAACATGATTTATAAGAATAAAAAAATAGAGGAATAAGTTGCACCTATCTCTATGGATCCTTTTTTCAAAGGAAAAAAATATTAAAAATATATCATCTTTAGAAAAATGGTCATGTCGCAACTTGATTAAGCTTTAGAGTGGCTGCATAAATATGGGAGCTAATTAGGAATGCTTCTCGTCCGAATTTGAATATTGTTTTACTATACTACAAGGATACAAGTTTAAGCCAAAGTGAGCATAGGTTAGCGGTAATCAACATTACTCATTCGTTCCCTCGAGATTGAAGGTCTGAAAACAAATTTTCTTTATGCAAGGCATAACGCAGGAGTTGTTTAGATGGACCTTTTAATTGTTTATAAGCGTAGTGTCATGCCTAAACCAAATTAGACCTAAGCCCAGGTTGTCTAATCATCAACAACGTTATCAAGCATAGATTCTTTTTACATGCATGCCGTGGTTTGGAGATGATGGGTAAATTCCAATATTTTCTGGTGTTTAAAGTTGAGATTCAGAAGCAGGTTGAAAAATAAAGAAGAAGAAACCAGCAATTTAGTCAAGCGGGACAAAATGGGGCTTTCCAAAAATGAACAGCATGATTGCTGGGCTCCGACCAGATCAGAAGGGCTAGCTGCACCCACAGTACTTCGTGAGTTTGCTAATTCTCTACTTTTTTATTTTTTATTTATTAGTTTTTTTAAATTGAATTTTTTGCTCTCCCCACTATGATACATTACAGATGGACATGTGGTTTGGATGTAGACTCAATATTTTACATAGCATTGTACACTTTTTGGAAATACTTTGATCCCTCTTGGAGGCCATTTCTCTGGCAGAACAGTGGGTGGCAGATTGGTGTCTGAAAAGAAAGCATTCGTACGTTATGTTGCTTTCGTCTTGTAA

mRNA sequence

GATAAGAGTTATTTGGTCGAAAAAATTTACATTTCAAATAACTAGAGAGTCCTTCGATCCAACCCAACTCAACTCACCAATGCCCCTATTCTCCACAGTTCACACTCCCTATGCAACGGTTGCTTAGCTCTTCAATCTTGAACTTCACCCAGCCGATCGGCAGCTCCACCTCTACGACTGCAGCAGGAACAGCAGAGTCGCATACCCTCTCCACGATAAGTTGTGGTTCTTGTCCATGGTTTGATTATGTCACTTGTGGTTACGAGTTGGAGTATGTTGTTGGAAGCATTCTTGTGGATAAGTGGAAAGCAGGTCATGTGGAACATAAGTCTAAGTATAAAAGGACACAGATTGCTCTTGGAACCACAAGTTCAAAGAGATCCCATATGTCCAAGTTGAGATTCAGAAGCAGGTTGAAAAATAAAGAAGAAGAAACCAGCAATTTAGTCAAGCGGGACAAAATGGGGCTTTCCAAAAATGAACAGCATGATTGCTGGGCTCCGACCAGATCAGAAGGGCTAGCTGCACCCACACATTGTACACTTTTTGGAAATACTTTGATCCCTCTTGGAGGCCATTTCTCTGGCAGAACAGTGGGTGGCAGATTGGTGTCTGAAAAGAAAGCATTCGTACGTTATGTTGCTTTCGTCTTGTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCAACGGTTGCTTAGCTCTTCAATCTTGAACTTCACCCAGCCGATCGGCAGCTCCACCTCTACGACTGCAGCAGGAACAGCAGAGTCGCATACCCTCTCCACGATAAGTTGTGGTTCTTGTCCATGGTTTGATTATGTCACTTGTGGTTACGAGTTGGAGTATGTTGTTGGAAGCATTCTTGTGGATAAGTGGAAAGCAGGTCATGTGGAACATAAGTCTAAGTATAAAAGGACACAGATTGCTCTTGGAACCACAAGTTCAAAGAGATCCCATATGTCCAAGTTGAGATTCAGAAGCAGGTTGAAAAATAAAGAAGAAGAAACCAGCAATTTAGTCAAGCGGGACAAAATGGGGCTTTCCAAAAATGAACAGCATGATTGCTGGGCTCCGACCAGATCAGAAGGGCTAGCTGCACCCACACATTGTACACTTTTTGGAAATACTTTGATCCCTCTTGGAGGCCATTTCTCTGGCAGAACAGTGGGTGGCAGATTGGTGTCTGAAAAGAAAGCATTCGTACGTTATGTTGCTTTCGTCTTGTAA

Protein sequence

MQRLLSSSILNFTQPIGSSTSTTAAGTAESHTLSTISCGSCPWFDYVTCGYELEYVVGSILVDKWKAGHVEHKSKYKRTQIALGTTSSKRSHMSKLRFRSRLKNKEEETSNLVKRDKMGLSKNEQHDCWAPTRSEGLAAPTHCTLFGNTLIPLGGHFSGRTVGGRLVSEKKAFVRYVAFVL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC03G051750.1CcUC03G051750.1mRNA