Lsi07G002800 (gene) Bottle gourd (USVL1VR-Ls)
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGGTGAAAAAGTGGAAAATGTATAGCCCCAACTAGGCATTTAGCAACAAACAGAAATGGTGGGCAGTAGTTTTAAGGATTTTTTTTTAATTAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACGTTTTAAGGAGATGTTTTTATAAGTTTTGTTTATAAAGATGTGGACTTTGGGACTTCAATAATTATAATTAATGCTTTGAAATGGCAGACAAATTGAACTGTCTTTGAAATTGTTGTAATGTTTGTCCACTGCTCACTCTCTTAGCTCGTCAGCTTTCAGTAGGGTGTAGGACATTTTTTAATTAATTAATGAAAAAAAATATATGATTTTGGTCTTAAATTTTGAGTCTATTTTTATTTCTTTAATTTTGACTTTATTAATTTCTGTTTGGCCTTAAATTTTAAAAGATTACGTTTTAAATCTTTTAAGTTTTGAATTTAATTTTCATTTAGTTCTAGATTTCAATATTTTATATTTTTTTTACTAATGCCCACGATGGAATTAGATGTTAAGTTTTAATTAATTTTAAATAATTATGATGTGAAATTTTTTAATTAATTTTAATAGTAATAAAAATTTAATAAAAAATAATTTAATTATAATTATTTTAAACTAATTACCGACATTAATACCAAAATACGTAGTTAGTAAAAAATTAAAGTTAAAAGTGTGAGTTTTGAAACTCTAGGACTAAATTAAAACAAAACTAAAAATTCAATGGAGTACAAATATAACACTTTGAAACCTATGTACCAAATAGAAATTAACTCAAACTCATGGATAAAAGTATAACATTTTAAAATTTATGGACTAAATGAAAAGTAGACTTAAATTTAGGGATTAAAAGTTTTTTTTTTTACTCAGATTGACCCTATGTTATATGGGCGATATGGGGCCTTGTCATTCATATTTAAAAAGGACTTCGTACACTCAGATACTAACCAATGAATCATTGAACTTGCAATCAATCAATAAATCACTTTTTTTATAAACGGATGATTGAAGATACCAACTACAAGAAGAATGATCTTTGCAACAAAGTTCAAAAGACGTTTGTCCTAAATTCAAAACTATGTTTAAGAACAAACAAGTAGATAGCTTTCTTTAAGGTACTATTGTTGTTAAAAATAGAACCTTCCTTAATGGTGAAGTCTACGAGATAAGAACCCAAATCTTGTAGGTCAATGATATCAAGAGTGTTATTGGAGGTTCTGGATGAGGAACTTATTTTAAGGTTAGTAGCACCTGTAAACACTGTAATTGCATAAATTGGTTGACAAGATGGAACATGGTCAACAACACACAAACATCATTGTGGGATGAATTTGAAATAAAGGACATCAACCATAATGCATCTTTGTCCTCTACGATCCTAACAACGTTAAAATTATTGCAGGCATCACGGTCCATGGTTAAACAAGAAATATTGTACTCCAATGTTGGAAAAAGCTTAGATTAAATTAAATTGACAAAATGATTAAAATATGTGTTTGTAGCGACAAAATTTTAATAAACCGAAAGTCATGGTAGTGATTATTTTCATCCAACCTACCATTAAACAAAATCCTTAATCGTTGAATAGCCATATCAAGCTATGGGATAGATTAAGAACAATGAAACAATGAAAGAACAAATAGATAATTAATTAAAAGTAAACTATGGCCGTTTTTAGTCTAATTTGATAAAAATATGAGGTTGATTTCGTTGATAAATAAAGGAAATATGAACTAAACACTATATTTCATGTTTAAAACAAAATTAAAATAAATTTCAATGATGAAGTCAAATTTAAAATTAAGAAGATTTGGTTAGAAACGATATACATATCCTTATATTTCATGTTTAAAACGGAATTATAATAAAGATAATGATAAAAACAATTTAAAAATCGAATGATTTAGTTAGGATTAATAGAAAAGAGAATATAAATAAATGAAAACTAATATAATATGGGATGTGAAAATTCAAATTAATATTTGAAGATAGAAGATTTTTTAATACAAATTTGTAGAATTTTCAAATTAAAAAAAATTAGGTCAAAATATCTGCCTGGAAAGAGGAACTTAATTCACTTTGAATATTCTATATGAGAAATGATAGAGTCCAAATTATGAATTTGATAAATTAATTACAATATAATTATCAAAGTTGTTAGATTAATTGTAGTACAATTAAAGAAGTTGTTAAGAGCATTTTAGGATTAACATAAAATGAATTCATATGCATTTCATGTATCTTGCTATAATTTTGAAAATTTTCGTATTTGGCTATATTTTCAAGTGAAAGTGTAAATTGTGCTACATGACTCAATTTCCCTACTTTTAAAAGGAAATGAGGCCCAAATGATCAGCCCAAGAAAAAGTTCCAGCCCTTTTGGTCTTTAATTTGTGGTTATTAAAAAAAAATAATAATGAAAAATAAGTTCCACCCTTTTAGCCAGGGGTGTTCGTTGAAATCGCAAAACCGAATACCCACCGCGAATAATTTGGTTTGGTTTGGTTTACTATAATTTTAAAATTGAATTAATCCGGTTTGGTTAAAATATATATATATATACTATTTATCAACTCCCTGACTAAGCCGCCGCCGCCCCCCTCACGGCCTCTCGTCTATCGTCTCTAGTTTGAGTTCACTTCGCCGTTTCTTTACATTTTTTTTTTGTTCGTTTTGAACTTAGAGTACAGATCAACTGACCACCGTCATCAATCTATCCTCCATCGTAAATCCACAGATCCGATCCAAACATTCACCCAAACTTTTATAAACCGAAGTCTGACTCAAACAAAACCGAGTCAGAAAGAGTGGTTCGGTTCAAAATCAAAACCCAGGTATATTCGGTTTAGCAACATCCTGTGAATATTATCCTTATTTGATTGAGATATTTAGTTTTTACTTTGTGTGTGTGTTGTTTTGAAAGGAAAAAAAATACTCAAGGAAAAAAAAGGGGAAAAAAAAAGTTTTAGTGAGTGAACTAAGTTGGGTTCAAGCCAGAAGTTGGTGAGCTAATTCAATTAAGTGTATTTTCGATGTTTGAAAGTATATTTTATACCATTCAAAATTGAAGTTGTTTGGGATGTTTTTAATGTTTTACTATTAGAAAACATTTTTATGAGATTTGAGAATCGATCAAAATTGTTTTATATATTTTTAATCAATGTCGTCAAATAAAAGTATGTGATTGTTGTGAATGATAGTTGGAAAAATGTTTAATTCAAAGTATTTTTGTTTGAATTTTGTTATTGAAATGAAACTACATGTTTTGTTTCAAATGTTCCAATAGTTTTATTTTAGGAATTATATGCTATTTTGTTATTGTCAAATTTAAAATGGATATTAATGATTTGACTGAAGCTTATGAAAAGACATATTTTGGTGATTTGACATTTTTTTTTTTTATGAAGATTTATGTGTTTGTTGCACTCATAATTGTGAAATACTCATTGGAAGACAACTGTTGCAATGCCATCGGGGAGAAAAAATTAAAAAAAAATAAATAAGAAACTCAGGTTGATTTAATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTTCCTGTCATTGTAGATTAAATGAGGTTTGGATTTAGGTTTTGAAGGCACCTTGTAAATTCCGACTATTTAATATCATGCTTAGATTTAATTATGTTATGTTTTTCCTTGGATATGTACAATCACAAAAATGTTAACATCTCGTTGTAAACATAATTTTGAGAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAATTTATAAATGTTCCTATTATTAATATGGTGATCAACTTATTTGAAATTTTATTGAGTTTGAAAAGAACTAATTTTAGAACAAATTATATAAATATCTTCATTATATATATATATATATATATATATATATTCTTTTTTTTCAATTATTATATTGATTTTCTCAACAACTAAAATAAAAATAAAAATTTTAAGTTAAAACATAAAATTCCACAAACTTTCGATATCAAAATAAGTGTTTAAATAAATTTTTAAATTTTTAAGGTGCAGACAATGAAAATTGTATGCATGTTTTAGGTGCATACAATGGAATAAAATTGAGACATTTAAAACTATAAGAATTAAATTGATTTTTTTAAAAAATAGTTCTAACATGAGGGTGGAGGATTATCTCAATGTTTTAATAAAAAATATATATTTAAATCAAATTTTTATGGGTGGTTTTAGATTAACGGGTATACTTGACAAAAAAAATAAAAATAAAAGTAAAAAAATAAAAGCTTTAGTCCAAAAATAGCATCCTAGCCTCAGAATGGGCTTAAGGGAGATGGTTAGTTCAGACCAGATCCAAATTGGCGTGCTCGGTCGAGGCCAACTAGCAAAGTAGCTAGAGGGCATGTCTCACGCATGTCCTGGTCCAAAGCATTGCCCTAGGCCCATTTTGGGGCTAAGGGAGATGCTCGACCTCAACCCAAGACTAAAGCCAATCGTAGCCAAACATGAAATCAAGCACTCCCCTTGGTTCTAGTAGGTCATGCAATTATACTAGAGTGACTCCAAAACCATGAACAACCTAGGCCAATTATCTCTATAAATACATCATTATAACTTATAGTCTGAATCTTACTCTCAAACTCTCTAGATTTCACTCTTTCACTCTCTAATTAAGCATCGGAGTGTGTGTGGCGAGTACGCGTGTGCAGTTTTTTTTGTAGGTCATATTCTTCTCCTCTTTAAACAAATTTACTAGTGATATCACAGAACGTTTGGTGGTCCAAAATTTGGCATTAACAAGTCCTCAGTTATGAGGATGTTTGCAAAAGTAAATTAAAAACTATAAACTATCCCATTTTATTTTATGGTTTACTTCCTAATCACTCCAACATTAACATTCTTTGTACTTTAATAACTGTTTTGTCTTCAAATATTTAAAAATATCGTATTTTGACCCCTTTAAATATTCTATTTTTACATTTTCCAAACGTCCCATTCAATCTAAAAGGCGCGGTCACGATACCTTCGTCTTCGCCGGCAAGTTTCTTCTCCGTCGTCTATCCGATGCCAATTTCCGCCGATTCTTCTTCCTCTTCCTCCCGCTCCTCTTCATTTCTAGAATGCGCCACTCCGACGAGTCCGAGCATTCAACTCGTTTCCAAATCGGTGTCGGATCGGCTTCTCGGCAAGTTCTTTGACGCCTCTAAATTCGACTTCGATTCTGAACAGAGTAGCTTGTGGTCCCCGCCGATTCCTCGGCGAGTGTTTCTGGATTCTCCGACCGATGTTTGCTCCGGTTACGAGGTTCTCTTGAAGCTTGACAATGCGAAGAAGGCATGGAGGAAATTCATTATCTGTTTCAGAGTAAGTTCTCTCATGATTGCATTGTGATTTATGCAGTGATTGCAAAATAGATTCCGTGTAATGTGAAAGAATCTGAAGTAGATTTAGGACTGTTTGAGAAATCGTGAAGAAATTGCGTTCTATGCTTGAGAAATTGCATTCAAGCGAATGAGAAATCGAATAGAAAATGAAACGGAAACACTATATTTACTTTTGTAATTGTCAAAGCACAAAATTAGAATCATAAACATGATTTTCCTTTTCAGTCTAGAGATATGAACCCTAAAAATGTATGGAACTGAACTATATATAACCGTTGTGTTTATATGCAGGAGGAACGGAAATTACCTTGTCATTGATTGTTTGATTGTAATCGGAAATTTATGGTCTTCATTGCAGGGATTTTGGTGTTGTTGGAATCATTGATTTCACCTTACAAGTTTTGAGCAATTCTCTCTCACAAATGATTCAGGAAGAGAAATTAGGTTGTTCTTTTGAGTATTGTGTTAATTGTATTTCTTACTATTGAATGAAGAACAAGAAGAAATCAAAATTCAGTAATCTTATAACTTTTGGTTAGAAGAATATTCACATTTTCTTTGGCTTCTCATTTTTCACACTAGAATTTGAATTTGGTATATACAGTACAGTGACCCTTCAAACTCAGGCATGCTCAGTACAGTCCTGCAACTGCAAATGGGATATTTTAAGAAGAAAAACAAAAGGGAATTTCTCTGCAATTGTCTGCTGAACAGGTAAGGTCAAGAATAACTCTGGCTAATTTGCTTTTTGGATAAGCTAAAGCAGCACATATGGAACAACCATCAACACCATGCATTGCTTTTTGCTTCCTTTTTCTGATTATAGTCCTCCTTTTGTCTGTTATAAGCTTGGATTAGATTCCTTTCCACTTCTTCTTCATCATACATATTCATACACAATATGATATATATTGACTCTTGGTGTTCTTCTTTCTGAGTGTATCCCGTTTAGGCTTCTCCTTTTTATTTCTTTTTACTTAAAACTAATATTTGGTTCACGTCTTACCCTTCGAACATATTTAGGAGTGTTTTTAAAATGACTAAAATCACTTTTGTCATTTATAAAATTACCGTGAAATATGTTTTTCATCCTTCAAAACTAATCTTAATGATTGAAAATTACATTTAAAAGTGTAAAATTGAAAATTAAATTAACTTTGAGTGATTAAAGTGTGTTTTTGAGTGATTTTAAAATCACTCCCAAACATACTCCTAATCAAGTTACCATCTATGATTGGATAATTTACTTATTTATTAAAAGACAATGATTAGGTGCAGTCTATATCATGCATCTCTTTTGTATAAGATAAGATAGTAAAAAAATACACCTGACAATTTTTCATTGGGTAACTAGTTGGGCTGCACAAAGATATGTGCCACCAACCATTAACTAATTTTTTTTTTTTTTATTAAATATGGGACAAAGGACTAAAATTTTAATTTCAAGTAAAGTAAGTAGTGTCTTATCTATTAAACTATGCTTGAATTGACTTAAGTAGGATAAAGACTAGCATAAGTAACCAAATGAAATTTAGGTTATATTCATTTATCTTTCGATTAAATCTCTTTCAACACAAAGTGAAGATTTAATTTTCTTTTCTAAAAAATAATAATTTTCTAAAAAGTACAAATACAAACAATCATATATATATTTTCCAACGTCACCATTTATGATTGAATAATTTACTTTTTATTTATTTATTTATTAAAGGATAATGATTACAGTTTATATCATGCAATTCTTTTGTATAAGATAA ATGGGCGCGGTCACGATACCTTCGTCTTCGCCGGCAAGTTTCTTCTCCGTCGTCTATCCGATGCCAATTTCCGCCGATTCTTCTTCCTCTTCCTCCCGCTCCTCTTCATTTCTAGAATGCGCCACTCCGACGAGTCCGAGCATTCAACTCGTTTCCAAATCGGTGTCGGATCGGCTTCTCGGCAAGTTCTTTGACGCCTCTAAATTCGACTTCGATTCTGAACAGAGTAGCTTGTGGTCCCCGCCGATTCCTCGGCGAGTGTTTCTGGATTCTCCGACCGATGTTTGCTCCGGTTACGAGGTTCTCTTGAAGCTTGACAATGCGAAGAAGGCATGGAGGAAATTCATTATCTGTTTCAGATACAGTGACCCTTCAAACTCAGGCATGCTCAGTACAGTCCTGCAACTGCAAATGGGATATTTTAAGAAGAAAAACAAAAGGGAATTTCTCTGCAATTGTCTGCTGAACAGGATAATGATTACAGTTTATATCATGCAATTCTTTTGTATAAGATAA ATGGGCGCGGTCACGATACCTTCGTCTTCGCCGGCAAGTTTCTTCTCCGTCGTCTATCCGATGCCAATTTCCGCCGATTCTTCTTCCTCTTCCTCCCGCTCCTCTTCATTTCTAGAATGCGCCACTCCGACGAGTCCGAGCATTCAACTCGTTTCCAAATCGGTGTCGGATCGGCTTCTCGGCAAGTTCTTTGACGCCTCTAAATTCGACTTCGATTCTGAACAGAGTAGCTTGTGGTCCCCGCCGATTCCTCGGCGAGTGTTTCTGGATTCTCCGACCGATGTTTGCTCCGGTTACGAGGTTCTCTTGAAGCTTGACAATGCGAAGAAGGCATGGAGGAAATTCATTATCTGTTTCAGATACAGTGACCCTTCAAACTCAGGCATGCTCAGTACAGTCCTGCAACTGCAAATGGGATATTTTAAGAAGAAAAACAAAAGGGAATTTCTCTGCAATTGTCTGCTGAACAGGATAATGATTACAGTTTATATCATGCAATTCTTTTGTATAAGATAA MGAVTIPSSSPASFFSVVYPMPISADSSSSSSRSSSFLECATPTSPSIQLVSKSVSDRLLGKFFDASKFDFDSEQSSLWSPPIPRRVFLDSPTDVCSGYEVLLKLDNAKKAWRKFIICFRYSDPSNSGMLSTVLQLQMGYFKKKNKREFLCNCLLNRIMITVYIMQFFCIR
BLAST of Lsi07G002800 vs. TrEMBL
Match: A0A0A0KVF5_CUCSA (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus GN=Csa_4G082960 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 152.5 bits (384), Expect = 4.6e-34 Identity = 81/103 (78.64%), Postives = 88/103 (85.44%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. TrEMBL
Match: A0A067KFA4_JATCU (Uncharacterized protein OS=Jatropha curcas GN=JCGZ_10567 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 6.8e-22 Identity = 59/95 (62.11%), Postives = 71/95 (74.74%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. TrEMBL
Match: A0A061F9F8_THECC (Uncharacterized protein OS=Theobroma cacao GN=TCM_031878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 105.1 bits (261), Expect = 8.4e-20 Identity = 64/117 (54.70%), Postives = 75/117 (64.10%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. TrEMBL
Match: V4T630_9ROSI (Uncharacterized protein OS=Citrus clementina GN=CICLE_v10022947mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 3.5e-18 Identity = 52/91 (57.14%), Postives = 64/91 (70.33%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. TrEMBL
Match: A0A067DQ60_CITSI (Uncharacterized protein OS=Citrus sinensis GN=CISIN_1g036709mg PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 3.5e-18 Identity = 52/91 (57.14%), Postives = 64/91 (70.33%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. NCBI nr
Match: gi|700198412|gb|KGN53570.1| (hypothetical protein Csa_4G082960 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 152.5 bits (384), Expect = 6.6e-34 Identity = 81/103 (78.64%), Postives = 88/103 (85.44%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. NCBI nr
Match: gi|643725940|gb|KDP34787.1| (hypothetical protein JCGZ_10567 [Jatropha curcas]) HSP 1 Score: 112.1 bits (279), Expect = 9.8e-22 Identity = 59/95 (62.11%), Postives = 71/95 (74.74%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. NCBI nr
Match: gi|590610430|ref|XP_007021812.1| (Uncharacterized protein TCM_031878 [Theobroma cacao]) HSP 1 Score: 105.1 bits (261), Expect = 1.2e-19 Identity = 64/117 (54.70%), Postives = 75/117 (64.10%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. NCBI nr
Match: gi|567899920|ref|XP_006442448.1| (hypothetical protein CICLE_v10022947mg [Citrus clementina]) HSP 1 Score: 99.8 bits (247), Expect = 5.0e-18 Identity = 52/91 (57.14%), Postives = 64/91 (70.33%), Query Frame = 1
BLAST of Lsi07G002800 vs. NCBI nr
Match: gi|731431929|ref|XP_010644110.1| (PREDICTED: uncharacterized protein LOC104877493 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 97.4 bits (241), Expect = 2.5e-17 Identity = 59/102 (57.84%), Postives = 70/102 (68.63%), Query Frame = 1
The following BLAST results are available for this feature:
The following terms have been associated with this gene:
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
Analysis Name: InterPro Annotations of Lagenaria siceraria
Date Performed: 2017-09-18
The following gene(s) are orthologous to this gene:
The following gene(s) are paralogous to this gene: None The following block(s) are covering this gene:
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