CmaCh03G015080 (gene) Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TTACTTTTCCTAATACGAAAAAACAATCCATTCCATTATAAATTATGATTCGTATTTCTAAAATTGATCCGATATTTTGCAGGCACGCCCAGCGATAGTCGGGATCGGAACATCTAATTCTCTGCACTTCTGAACATCCGCTTCGAAAGTCCATCGCTTCAATACTCTTCCACTGCAACTCATACTTCGCCACGCTGCTTCCACCACCACTTTCTCAATAGTCATGCCACCAGGTTCCACTTTTGCTTTCAGCTCTCATTCTATTTCCTTCCTTTCAATCTCTCATCAATGTCAAATTTTGCTTTCTATACTTCCGTGCAGAGCTCCCTGGTTATTACTATGATGTCCAGAAGAACAGGTATTTCCCTCTCAAAGGCCCAATTCCTGGTTCTTCTCGCACTTCCTCCTCCTCTTCTTCAGCCCCTCATCACAAACGAGCTTCTAAGCCCACCCCGGTGTGTATTACTCTATCTCTGGATACTACCAATTTCACCTTTTCTGTTTAGGATTTATGCTTTTCAATGCGTATTCTGCTTCCCACAAAATTTCCGTGCTTAGTTGTTTTATTAAACACGGTATCTGACTTCTCTATCACTCTAGGCCCTGAATTTTGAGGTTGCTTAGTAGTCGTGGATGTTCTCTCGAGGATTAGGGCTGGACTAGGGTTCGTAGTGCTGACTTAAATCTGGGTCGAGTCAGTTTCCTCTTGGAGCGCTTTTAGAAAGAAAAAAAAGAAAAAACTGTTCAAGCTTTTGGGGGCAGACCTGGGCTTTAAAATAATATTTTCAAAAGCTCATTATTTGGCACTTATTTTTATTTATTTATTTATTTTGTATTTTCTTCTTATCAATGAAGTTCCATGTTTCCACAAACCATTCTCCATTTTTTCCTCTCTCCTTTTGGCCATTTCTTTCTCTCATCTTCTCAAACAAAACTAATGAACAACAACCTTCAAATCTTGACGTATGAGGGCAAGGTAATAATTGGGGACGACTAAAGCCGTTTTTTCTCAGTGTGAGACCTTTTTGGGAAGGTTTAGATTGGTGTTCCCTTTCAAACTGAAACATGGAGGAGTTGGAAGCTTCTTTCTCTTCTGAAAGAGAGGTGGTCTTTGGTTTTGAGAGAGAAAAAAATACCTGGTCCAAATGGTTTTACGGGCTTTCTTCTAGGATAATTGGGGTGGTATTGAGGAGGACCTTTGGAATGTCTGTAAGGAGTTTTGTGAGACATTTATAACAAAATAATTTTAGAAGAGAGGGATCCTGGATGCTTCTTTGAGGGAATCCTTTGTTTGTATCATTCCCAAAAAGGAGAGAAGGTATAGACTAACCACAAAAGAAATACAGCCTAAAAGCGAAGAAAAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAACAACAAGAAGGAGAGAGGGAGAAAAGTGAAGGAGTTCAGACCCATTGACATGGTAACGTGTTCATACAAAATAATTGGTGAGGTTTATGCAAATAGTAGATTATGAAGGTTTTCCTTGGTGCAATTTTTTTATTCTTCAGTGGCCTTTATTGGTAGGAAAATTATGGATCCAATTGATCTAGTTCTTATCACTAATGTGGCTATTGAGGAGCAAAGGAAGGGTTTGCCTTCAAAATCTATTTTGAAAAGGCTTATGGATTTAGATTGGGACATCCTTGATAAGGTGCTCTGGAAGAAGGTTTTTAGTTTTAAGGGGAGATTTTTGATTTAGAATTGCATCAAGATTATGAACTTTTTCATTCGTATCAGTGGTAGATCAAGAGGTAGCGTTTTGGCTTTTAGATAAGAGACCCCCTTTCTCCCTTTCTCTTCTGGTTGGTTGTGGATATTCTTAGCATAAAAATTTTGAGGCAGATAGATAAGGGCGTGATCGAGGGTTTTCGGATAGGTAAGGATAGCTTATCTTGAATATATTAACTTAACTAACTATTTCTTTCTTATGCCTGTGCTTTGTGTATCCCTTTTCCTACACCAGCTGCCTCTGTGTTTTCCTCTCTTTATCTTGTTAAAGTTCCGACCAAGGTTAAGGTGTTTGTTTGACCTGTTTTACATAGGAGAGTGAATTAAAAAAAAGATTCTGAAACTTCTTTTTGGGAAGACACTTGATAGAGTGACATACATCTTTGTAGGTTTCTTTGTCTTCATCATCTGTTCTCTAAGAAGTTCATTTATGTGGCTTCCAATATTTTAAAAATTGTTCAAGGCGGCCTTGAGGTGTCTCAACGCTTACGCCTGTGCTTATGCCTGTGCTTATGCCTTGGAATTTTGATTTAATAATGTGAACCAACTCCCTTAACTCACAAAAAAAAAAAAAAAAAAGTATTCTTGTTTCCAATATTTTATTCTAACTACTTTTTGTTAATTTTCCATATTTTTTTTAAAATGTTTTTTCTTACAATTTTACCTATTTAAAATGAGGCTTACGCCTTATACTGGCTTGAGGCTTATGCCTTGCCTCTAGATGAGAAAAAGTCTCAAGTCTGCCTTAAGCGTTTTAAACATTAGTAACTTCCATTATTCCTTTTTCAGGTAGTTTTTCATCATTTTCTCTTGGCTTCTGTCACCCTGTGTTTGATAGGTAATCAAAAAATGTGTTTGATTGCCTTTCTTTGCTGGGTCGCTCCTAGGGAAAAAGATCTTCAAATCTTGGCCCTTGACCTTCTGAGATTTTCTTGTAGCTCTTGATTAATAATTTTGAGCAATCTTCCCTTCTAGCTGCTCTTGTTGTGGAACATTAAATTTTCAAAGAAGGTTAATTTTTTTGGTTGCAGGACTTGCTTGGGAGGGTAAATAGTCTAGTTTTTTTGTGTGTTGAAGGACCTAAATCATATCTATCTCTTAACATTTGTTTGTTCTATATGGGATAGTCTCTCTCTCTATATCTAGATGTTTGATATTGCATAGCTAGGATCGTCGACTCCTGCTCTATGGTGGAGAAGGTTCTTTTTCCTTCGTTGTTTCGTGATAAGGTCCAGATTCTGTGGTAGGTTGGCTTCTTTGCGCTCCGCTTGGGTCATTTGGCTTGAAGGGAGTAACAGAACTTTTAGGGATTTGAAGAGATTTTAGAGGAGGCTTGGTCATTTGCTAGGTTTAACACTTGTATGTGGGCGTTGGTTTTCAAGAACCTTTATCATTACACGTTAGGTCTTATTTTTGTTGATTGAAGTCCCCTTTTGTAAAATTAGTTGGGTGGGTCCTTTAGTTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGGTGTGTGTGTGCCAGTTGGCCTTTTATTTTGTATTCTTTCTTTTCTTTTCAATTAAAGCTTGGTTTTTCAAATATAATTTGCTGGAAGTTTTTTTAACTTTGGGTTCAAAAAATAATTTTTGAAATTATCTTTTTATGTAAGAAGATAAAACTACAGCATTTAAAAAAAATGTTAATAATAAAAGAAGCCATATAAAAGTCTATTAAATGTTTTAAAGTTGAAATACACTACAAAAATAATTAATATTATTAACTATTTTTTTAATTGAAAGCAACTTCACAAATTTAAAAGTGAATAATTAAAATTCCTCTTGTTTTTAAGAATGAATAAATTAAATTTAAAATATGTAATTACAAACTAAATTTAAAATTGTTAAAATATTTATTGGATAGTAAAAGTAGAATAACATATTGAAGTGAAGGCAAAACAGGTTATTAAAACTTTCTTCTCCTCGGTCACTTTTTGATATGTTATAGATTATATAAAGTTTAGATGGATTGCAATTACTATGCTATTGTTTTCACTTCCTTAGGTTGTATACTTCGAGGACTATTGCATTTTTCTTAGTTGGTAAGCTAATGTTTCATGATAGTCCTCGGTTCTGTCATGTGATAGTTTTGGCCTCACTTTAGAAATTATTTTATCATAATTAGGTACTTGATATCAATACATTAAAAAACAACTTTTCACCTACAGATAGTCGATTCATGTTCGAAGGCAGATTTAAGAGCCGTGAAGCTGATTCAAGCCAGGGAGTTGTATGGTGATGTTATTGCTTCCAGTAAAGGAAAGTGGAACTTCAAGGAAAAATTCCAAAATTTACTGGCATCCAAACCTGTGGTATGTTCCTTATCAACGATCGTCCTAAACTTGAGAGCACTTGTTCCAATTTCACTTAAATGGAATGTCGAATTAGGCCTTAATATATTAGTTGAATTATTTTATTGATGTTCGTGGTGGAAACCACATAAGAAAGAAGGGTAATCTAAGCGTTATGAGGAAGCTCTTAGCTTTGGACATCATTTTCCTTCTACTTTTGATGAACTGATAGGTTTGGGCTATGGTAAATAACTAAATCAGTGTAAGATAGTGATTGTTTTGTTTCCATTAAAGACCCTTCAGAAGATGTAAAACTCCATTTGGTTTTATTCTTTAAATATCTTCTAAGCAATCATCATGTCGTTTTTCATTGTTTTGCCAAACCAATGATATCCTTCAGGAATTTTTAATGTATATTCTACATAGCAGAATATTTTTCTGTTTCTTTATTATAATAAGTTGAACAAGATATTCTATGCAGGTTTGGAAGTACCGAGGAACTGATAGAATGGGGGATAGTGCTTTGCAAGAAATACCTATTAATGTGCACACCCTGGAGGGTCAAATGGAATCTACTGTTCTATTGACGGGCAATATAAGTGGCTCCTTGAGGTATTTATGGAGTTTCTCTACTGTGTGAATGCATTTGTGCTTAGACAATGCAAGAGAGTTTAATCTTTAAATCCAGTTTTTTATTAAATGGTAATCAATTCAGATTAGTTTTGTTTGTGTATGTCCGGACCATTTGGTTAGCTTTGAGTAAAGTTATGTGTAAAACAGTGCAAGGCATTTTTTGTTGGGTTGGGTTGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCTCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAACAATATGAACTAAATAGAAACCTATAAAATCTTAGGGATTAAATTG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Homology
BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LTZ9 (Galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS2 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GALS2 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 605.1 bits (1559), Expect = 2.4e-171 Identity = 308/522 (59.00%), Postives = 389/522 (74.52%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O22807 (Galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=GALS1 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 1.9e-123 Identity = 235/474 (49.58%), Postives = 317/474 (66.88%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IHV7 (uncharacterized protein LOC111477598 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477598 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1319.7 bits (3414), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/715 (98.18%), Postives = 705/715 (98.60%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ECL3 (trichohyalin-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432973 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1240.3 bits (3208), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/734 (92.78%), Postives = 689/734 (93.87%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IPC6 (Glycosyltransferase family 92 protein OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111477599 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1131.7 bits (2926), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/561 (100.00%), Postives = 561/561 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EFM2 (Glycosyltransferase family 92 protein OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111432976 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 997.7 bits (2578), Expect = 6.2e-287 Identity = 495/502 (98.61%), Postives = 498/502 (99.20%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ILI1 (uncharacterized protein LOC111478534 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111478534 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 944.5 bits (2440), Expect = 6.3e-271 Identity = 467/506 (92.29%), Postives = 468/506 (92.49%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. NCBI nr
Match: KAG6581531.1 (Protein neuralized, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 2171.4 bits (5625), Expect = 0.0e+00 Identity = 1149/1258 (91.34%), Postives = 1159/1258 (92.13%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. NCBI nr
Match: XP_022977222.1 (uncharacterized protein LOC111477598 [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1319.7 bits (3414), Expect = 0.0e+00 Identity = 702/715 (98.18%), Postives = 705/715 (98.60%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. NCBI nr
Match: XP_022925581.1 (trichohyalin-like [Cucurbita moschata] >KAG7034825.1 Protein neuralized, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]) HSP 1 Score: 1240.3 bits (3208), Expect = 0.0e+00 Identity = 681/734 (92.78%), Postives = 689/734 (93.87%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. NCBI nr
Match: XP_023544795.1 (probable serine/threonine-protein kinase DDB_G0286465 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1234.9 bits (3194), Expect = 0.0e+00 Identity = 675/730 (92.47%), Postives = 686/730 (93.97%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. NCBI nr
Match: XP_022977223.1 (galactan beta-1,4-galactosyltransferase GALS3-like [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1131.7 bits (2926), Expect = 0.0e+00 Identity = 561/561 (100.00%), Postives = 561/561 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. TAIR 10
Match: AT4G20170.1 (Domain of unknown function (DUF23) ) HSP 1 Score: 625.9 bits (1613), Expect = 9.5e-179 Identity = 305/503 (60.64%), Postives = 388/503 (77.14%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. TAIR 10
Match: AT5G44670.1 (Domain of unknown function (DUF23) ) HSP 1 Score: 605.1 bits (1559), Expect = 1.7e-172 Identity = 308/522 (59.00%), Postives = 389/522 (74.52%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. TAIR 10
Match: AT2G33570.1 (Domain of unknown function (DUF23) ) HSP 1 Score: 446.0 bits (1146), Expect = 1.3e-124 Identity = 235/474 (49.58%), Postives = 317/474 (66.88%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. TAIR 10
Match: AT5G17370.1 (Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 337.4 bits (864), Expect = 6.7e-92 Identity = 203/530 (38.30%), Postives = 289/530 (54.53%), Query Frame = 0
BLAST of CmaCh03G015080 vs. TAIR 10
Match: AT2G34920.1 (RING/U-box superfamily protein ) HSP 1 Score: 136.3 bits (342), Expect = 2.3e-31 Identity = 168/577 (29.12%), Postives = 269/577 (46.62%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita maxima (Rimu) v1.1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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