CcUC02G025570 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC02G025570
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr02: 10251569 .. 10260803 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC02G025570
SyntenyCcUC02G025570
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAAGTACAAGAAGGAAAAGATTAATGATATCTTTATGTATTAAGGTGCTTGATAAGTTGTCTCCTTTGCAGAAAGGTGTTTTAGGGAAAGGGAATTATTCGTGAAAAGAATAGATGTTATAACTTACTATTAAAGGAGGGTATAATGGGAATATGTTTAAAAATCAAGAGCAAAATTGGAATGTGAAAATTCTCGTACTTACCCTCTTTTAATATAGTATAGATATATCCAAGATGGAATTAATTATCAAGAAAATATTATCATTCTTTTATTTAGTTTAGGGGTCGTATGATAACTATTTTAGTTTTTTTAAAAAAAACAATTCTATTAGGTAACTAATTAAGGCTCCGTTCGGTAATTATCTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTGAAAATTAAGTCTATTTCCTCATATTTTCTTACAATGGTTTGCATATTTCTTGAATACAAGAGTTGAATTCTTAGCCGAATTCCGAAAATAAAACACAAGTTTTTAAAAATTACTTTTTTTAGTTTTCAAAATTTGGTTGGATTTTTGAAAATATGGGTAAAAAGAAGGTAAGAAAGCAAGACATTTAGGGGTGAGAGGGGTGTTTATAGGCTTAATTTTCAAAAAATAAAAACTAAAAATTGACTCCGTTTTGTAACCATTTTGTTTTTTATTTTTGTTTTCGAAAATTAAGCCTACACTACTTTTCCATTCAGATATATTTATTTGTTATCTACTTTTTACTAATGATTTAAAAACCAAACCAAAATTTGAAAATTAAAAAAAATAGTTTTTAAAAACTTGTTTTTGTTTTTGGAATTTGGCAAAGAATTCAACTATTGTATATAAGAGAGATGAAAATCAAGATACATGGGGAGAAAATATGGTTAATTTTCAAAAACAAAAAATGAAATTGTTACCAAACGGAGTTCAAATTATTATCAAATGAGACTAAATTTTTTGTTTGTTGCATTTTAAAAACGTTTTTTAGATTGTTAAGAAAAATTAAAAACAAGAAAAGAACGTTTTTAAAACGGTTTCAGTTTTTATAAAACCACGCGCTTAATAGCGCATTGAAAATGCCTTCTAGTTTGGTGGTTGGCAATCATATGTCCATACAATATGTAGTGGGATAATAGTTTTGTTATAAATATTTTGTTTTGTTTATTTTTATTTTTTGTTTTTTCTTTTCTATTTTAGAATAATAGTTGTGTTATAAATATTATGTATTTAATTAGATTTCCATCGTATTTACTTATTCTTCTCCTGAGCTAATTCATTATTGAATTTAACCTTTAAACACTTCATCACTCTATTTTAAACACTTCATCACTCTATTTTAAGTACTATCAAATTTATGTCTACTCCATTCTATCACTATAAATAAGAAATTTGTAAACCTTTTAAAACAGACATCTCACATTTTGAGAATAAAAGAGCTCTTTTCTTTATTCTCTATTTCTTTTGAGTTGTTATTATTCTTGTTATTTTTATATTCTAATTTTACAACAAATTTCTATTTTTTATGTAAAAATAAATGGTAAATGATGTCAAAATTATTTTCTTGTCTTAACACTTTATTTCCACATTATACTCATTTTTCATTTTAACATATATCTTAAAAAAAATTCAAATTTCAAGGTAAAAATAGTTGAAAAATATGGATAAATTAAAATGATTAATTTTGTTATTTTAATATAGAAAATTAAAACTCTTCATGAGAGCGTGTTTTTTGAAAAATTATCAAACATTAATGGAATGATATGTTTTTCCCAAAAGATATTAAGAAACTAAAATTATTCTTTTTTGTATACTATCAATATATTGATTTAGAAAAACTATCAATATATTGATTTATTTTTATTTTTCTATATTTTATTTGTGATTAATTTATGTGTTTAAAAATATTGATAGTGTTCTATAAATATGGATGTTTTTTAAGAAAAAAATTAAAATAAAAGTATAATTTTATAACTATGTATATTAGATAGAAAATTCTTAAAAAAAAACACGATTTTATGTTTATTAAAAATATATAAAGCTAAAAAAATCATCAAAAACTTTTTTAAATTTTTTAAAAATGACAAAAGAACACAATTATCAAACATGAAGGTGAAATAGAGAAGGAAACTTAGTTAGGTGACCTCCGACTATAATTGAGAATATTATGGGCCTTGGCTAGCCAATCGAAGTACTACTATTATTCTATTATTCCATCAGGGCCTCTGCTGATACTTTCCTTTGTCGCTAGACCCCTGCTTTCCAAGTCCAAAAAGGAAGACTTGGATGATCCACTCAAACTCATTTCCAATAAGTTTGCCCAACTTAAAAGGCATGAGTGAGTATCCAAAGTAAGTAGAAGTAGATCCTCTTTGTTTTATTTTTTTTTAAATCTTTTAGTTTAAAAAATAGAGAAAAGAAAAAAAACTACCAAACATGTTTTTGGTTTTTTGTTTTTAAAAAACAAAAAACAAAAAATAGTTACCAAACATGTATGGTTTTTGTTTTTTGAAAACTAAAAACAAAAGAGAGACTTTCAAAAACTAAAAACTAAAAACAAAGAAACAAAAATCAAATAATTATCAAATGGGCCTACTCATTATTTGTAATGTTAAGTAAATTTATTCCGAAATTGTATTTATTTATTTTTTTTATATTAAACTTAACTTTCTTGTGGAACTAATATATATAGTTATAAAGTTAAAACTTTTGAAAAATAATATCATTTTAAAAGTTATTAGGAGTCATTTGTTTCCTGGGAATCCAATATTAATTCCCTTACACGTTTGTCTTATGATAATGTAAGTGTTGACTTTTTGGCCCTTAATCTCAAATTAATTAATTTTAATTAATTAATTAATCAATATTTTGACGATAACAAACCTGAATTAATTTACTAATAATTTGATTATTTTGGAGTATCCATTGCATGGAGCATGGAATAATGAATCAAACGCGTTTTGAATCACTCAAATTGGAGCTCAAACGAAAAAAATATTATTGAGTCAAGTTTAACGGAAAAATCTCGAGCTGATGACGTGGCAGATTTTTTCATCAAAGTTGACCAATTGAAATGTGCCACTTGGAGAAATGGAGAAGTGAAACTTGGTGGATTTTTTATTTTTGGATTGATGTTAAAAAGAAAATGATTTTAAAAGGAAATGAATTTAAAAAGAAGATAAATTTAATATTATTATATATGTTTGTGTCTAACGATTAGTTGCTTTTAAAAAAAATGAATTTAATATTATTTAATGTTTGTGTCTAACGACTACTTGAGTTTAAATCTCCATCATTCAGTTTTTTTTTACAAAGATCTAATGGTCCAAATTGAATTTGGTTTTCACCGACTTCCATCTTTTCTTAAACACTTCATATTCTCCAAATTTTTACAACTTTTATTATTTTCAATCCTCCATAATTCACCAAGCCACCATTGTTGCTCTCTCTTCAAGCTTCAATGTTTCTTCCTTTCATCTAATTCTTGAGAGAGATCTATGTATGGTGATGATTGATTTATTGTGAATTCAAAACTTGTAAATCCACTCTATTTAGAGAGTTTGTCAAGTGTGCTTTTTGTTTTTCCAAACTTTTGTATGGGTTGGCTCTTGATCCCGAGAAAAGAGTTGTTATAACCTTTTGATCCCCAACCATGAAAAAAATTAGGTTTGTTCTTGCGTCTGAAAAATGAACGTTATAGCGGTTCGACTCTAAGCCGTGAAAAGAATAAAAAACTTCTACTGAAGTACTCAATAGGACCTTGGGAAGTGGATGTAGGCCAGTTTGTGCCAAACCACTATAAAATTCTTAGTGTTAATTTCTCTATCCCTCTCCTACTTTAATTTTGCAATTAATTTGTTTTATTTTATTACACGAAATTAGTTGCAATATTTGTTTCTTAATTTAATTGCTTAATGTTTATTTAGGTTGGTTGAAATAATTGATCTTTATAAATCTCATACCAATCTTTTTATTAAAATTAAATTGGTTGCTTAAAAGTGTTAGATCTAAATACTTGGCTTCTTGGGGTTGAAATTATTTGCATAAAACTCTTGTTTAAATGACTTGATAGCAAAAATTGGTTAATTTGCTTAATTAGGCCCACTTTAGGAAAAAGTTTTAATTAGTTTTAAGAAACCTTATTCACCCCCTCTAAGGTTACCATACCGATCCTACAGTAAGATGCATTTACTAACGGAGGACATCATAGACTCTTTAGATGTCCTAAAATACGAATCCTCGAAATTCTTGAAAGAGCCATTTGCTGTAAGTTGCAAATGACCAATAAAAAACAATTTGTAATACCAAACTCTACTACCTATACTATTGAGTAGTACAAGTGACAAGTTTGGTTGATCTGTATGGAAGCACGAGATATGTTTTGTTAAGCCAATTTCCTAGCTATAGTAGTAAATGAGGGAATATGTGTGGATAGAGTCATAAGCGCAGAAAATAAATTTTGATAAAGGGTAAATGTAATTTAACATTGGAAATTCTAGTTCTAGAAGCAATAGAAATTCCAATGCAATTCCCTATCATCGACTTCTCTTAATTAAGCATGTACTCGATTTATAGTTCACAATGATTTAGTTGATTCAATCAACTTATCGACGCTACAGGCAACCAAATCATTGAATTAAACCAAGCAAACACCGCATTTATTAATTAAAGCCTAAACCTGATTAAACTAATTGCTTTACTTCTAATTGGTTCAAAAGCATCCATATAGAATTAAAAACATTTGCATTAAGCATAAGGCTTCTATTTTGTGATTAACTAATTAGGTAGCCTAACTAATCGATTTATCTTTGAACCTAGGTTTAGCATACATTTTAAGGTCTACGGGTAACCTATATTCCTTATCGTGCATATATTAAACCTTTGATACTCAGGATTTTAGCTAGACAAACAAGAAAGGGCGCACAAGCCATAAATCTTAGCTAAAACATACATTCAAGAGTAGAGGTTTCAATCTATTCAAGAACATGTATATCTAAATTAAACAGGAATCAAAGAACATAAATCATAATACATTAAATTTGATCAAGAAAAAATCTCAAAAAAATTACATTGGGTTATTGCTTCCAAAAACTATAAAATCCAACTAACCCTCGAAAATACATAGACAAGATGTAAAGGAGATTAGGGCATCCAATCTTCAAATTACAACCCAAACAGAAAATAAAAACATAAACCAAGAGATAGAAAATAAAGGTAGAAACTTAGTTGGTGGTTGCTTCTCCCAAAATCTCAATGGCCTCCATTTTTTTCTTGCTCTCAAGCTTTGTCTTCTTATTTACTATTATTATTATTACTACCTTTGCATAACCCTAAATTCAAGAACTATAATTGTAGAATGTGGCCTTCTCTAGCCGTCAACCCTTCGCGTAGTGTTGCAACACTCAGGGGGCACTACGGCACTCAACCTCCACTCTGCTTATGAATTTTATGGTAATTGCTTTCGATTAATATGCAATTCGTAGAAAGCAGTAGGTTAGGTTAACTTGTGAATCGAACACGACAAATATTGCTCTAATCGACCTAGGATTAAGTCAAAAGAATATTAATTATGACATTTCCAGTTAAATATTCCCCCTAACAATCCCTAGATCTTAATACAATTAGGTCAATTTGGACATGCATGCCTTCCATCTTTTCAAATTGGACTAATTAGTTATTTATGACAATTTAATTAGTCTTTCTAATTGAATTTAGTTAGTGGAAAACAATTAATTAACTTCGATAATGAAAATTCGATGATCAAATTGCTTGAATATTGAAAATCCATTATAACCTAAACTAGACTTTTCGCATATAAACTTTAACTATTTTACTTGTTGCATGTATTTTTGTGCTATTTAATTTTCTTGCAAACAAAACAACTTCAAAACCCCTCTTCAGTTACCTAGGACTATTAGCTATTCAATTGGAAAATTCAAGTGCTCCCGACATTCGACCTGGTCTTACCATTATTACTATTTTGGTGAATATGGTTTTTTATTTGGCACGAAATTGCACAACGAATTCTGTCTGCCACTTCATTAGTGCCACGACATTGCTAGAAAATGGAGTATCAGATAATTGCGTAATGCCGCAACGTTGAGGTGGTGCTATGGCGCCAGCGAACATTCATGCACGTGATTACTTCGGAGCGCGACAACATCCAAGGGTATCGCTGCAACGTTGTGGCCTTTCCTCAAAATGTTGCTCTCGAGAAATTGCGAAGCCCTTGCACCGTGGGTCTAGGAGAAAAATGATAATATTCACATCTTTTTCGGTTGATGCAATTGAGCTTTATTTTGCCCGTTTTAGCTTAATTACAACTCTAACGCCCGACTCCACCTTTCAAGAGCTCGATATCTGTAAAATCACTAATTTAAACATGTAAAACCTAGGAACAACCTCGAATTAAGCAAAGTTAGATAACACATTTTAGATAAAGTGTTTAAATCAATAATAATTATTTAAATTTAGATTTATTAAAAATGGTAAGAAATTTTTTTATTTTCTATTCGATAAAAGAAAAAAAGATCTTCAAATTTGTATAACTCCTGGCTTGAACTAAGATCTACAGTAAAACACAACGAAGCCATTATGCAAAACATGTACCTATTTTGAATTTTGGGACTTTATTCTACATAAAATATATCATTATTAAAGTTTATTTATCCTGCTAGCTTGAAAAATTGCACAAAATGACCCAAAAACCAAAAACTTTTCTATAGATGACATCTTCTTAAAAACTTTATTATTAGTGACCTTTTTTCCATGTGAAATACCCATTTTACCCCCAAAATTAAAATAGCAGGCACGCGTGTTTCTCGTTTTCTTTAAGTTACCGCTCCAACGTTCACATTCCTATGCTTCATACTTTTCGCTTTCTCTCAACCTTCTGCTTTCCATCAACATTTTGTCGTCGTCCTCATCTTCGTCTTCGGCTTCATCTAAAAGGTATTTGACGTCCCTTAAGTTTAGTTTAGGCAATTGCTTAATAGAAGTTAAACGATCGTTTAGTTTTTCTAAGCGATCGTTTAGTATTTCTAAGCAAAAGTTTAGGATTTGGTAAGCAATCGCCTATCTTTTGTTAAACTGACTATTGTATTGCATTTCCTCGCTGTAGGTTAATCATGGTCGTCTTTGAGGATGGATATTTCTCTGCTATCGTCTTCTGTATGGTCCACAAAACCGGTACCTTGATTAAGAACAAGCTTACAACTGATCAAATGGACATGTTTAGGAAGACATGTTTTGGTCCATTGCTGGACGTGGACTTCGTGTTTAATAGGCAACTCTTGCACCACTTCTTGCAATGAGAGGTTAGGGATGATAGCACCGACTCAATTAGCTTCAACATACTAGGGAAGAAAGTTATGTTCACACAAGAAGACTTCAATATTATAACCGGGTTGTGGTTGACTGAAGAAACAGTTGAAAGAGATACTTGCGACAAGAGACTACGGCATCTCATCCTTAGACCAAAGGACCCGAATGATAAGAAGGAAAAACTTGGCAAGGATGTTGAGGCGACCTTTGAAAAATTTTGATTTACAAACGATCAAGATGCCGTGAAAGTTGTGCTCGCATTGTACATTGAAATGGTCATGATGGACAAAGACAAGAAGACCCAATTTGATATGAAGACATTTGGGTTTGTCGATGACCCTGAAGTCTTCGCCAATTACAATTGGTCGTCTGTCTTCTTCAAGCGTCTACTGAATGACATGAAGACTATTATGTGCGAGAAGAAAGAGGTACACGATATCAAGAAGGCAAACAACTCGAAGCACATCACACACTACTACATAAAAGGATTTGTGCTTGCACTCCAAGTACGTGCTCTTCGATTCAAAACTCATTATGTATTTGTGCTTGATAGCCTTATGTGTAACCCATTTGTGACATGTCTGTTATAGGTTTGGGCTTATGAAATTAGTCCACATCTAGCAAGTTTGTGGCCACCAAAGTAAGCAAGAATGCAATACCACAAATCTTGAGGTGGACCTATTCTTAAGCACCATCCTACAAGTCGTTGGAGATGAATTTATTCCAATCGAAAAAGGTAACGGACCGTTTAGTATTTCTAAACGATCATTTAGGTTAACTTATATGATCGTTGTGAGACATCTACATGATCGTTTAGAAGAATCTACATGATCGCCTAGCTTCTCTAAGCGATCGTGTAGTAAAATCTAAAAGATCGACTAGTTTCTCTAAGCGATCATGTAGTTTTTCTAAGTGATCGTTTATATTAATTTAAGAGATCGTTTATATTAATCTAAGTGATTGCTTATATTAATCTAAGAGATCGTTTATATTAATCTAAGCGATTTTTTAGAATAATATACACGATCATTTAGTCGTTTGTTGTTTTCAATACGTCCTGACTTGTTGTTTACATCATAGACAATTATCGTCGCGAGATTTGTGCCTACACCAGATGAAATAAAGGTACAAAGAGGATATAATAAGAGGGATTGAGTTGATGCCAGGTGTTAACCCCACATCAAGAGATCAACCTTTAGTTGATATCGAGGCTGAACATCACGAGTCCTCTTATGAAGACCAAGTGGAGCAGCCTATGACAGAGCATCATATTGAACCCCCTCGGCCACACGAAGAACAAGTCGAGCACCCTACCACTAAGATAAAAACACTTATATTGGGTCTGACTAGTGCTCAGAGGGGTAAAAAAAGGCGCGTCGAATCTTCACTGAAGCAATCCAAGTCCTCCAAGACCTTGAGAAGGCACAAACACTTGAAATCATATAAGGTGCTGAGAGAGGAAATATCCGAAGTTCGCTAGGATTTGGCAAACTTCACGACCACGGTTCGTGAACTTCACGACCACGGTTCGTGAGCAACACGAACATTTAAGCAATCATATAGAAGATTTGAAGATGTTTCTTCAACGTTTATGTCAGGTTAGAAATCTTATTGATCATATGGTCGACATATTTCTAAATGATCGCCTTAGGAGTTTCTCTATGTGATCGCTTAGGACTTTTATGCGATCGCTTAAGACTTCCATGCCTATGCGATCGTTTAGGACTTCTATGTGATTGTTCATTACTTTATGCGATTGTTTATCTAATACTTTACGTTCTTTGTCTGATACAGGTTAACAACGAAGAAGATAACAATCAGAGAAGTACCCCTAATGATGCCCCCAATGCTGATGGATCAGATAAGAATGGGGAACATGAAGGGGGTGGTAGGGATGACCAGGTTGATATGAACGAGGATAATGGT

mRNA sequence

ATGAAACTTCCATGCCTATGCGATCGTTTAGGACTTCTATGTGATTGTTCATTACTTTATGCGATTGTTTATCTAATACTTTACGTTAACAACGAAGAAGATAACAATCAGAGAAGTACCCCTAATGATGCCCCCAATGCTGATGGATCAGATAAGAATGGGGAACATGAAGGGGGTGGTAGGGATGACCAGGTTGATATGAACGAGGATAATGGT

Coding sequence (CDS)

ATGAAACTTCCATGCCTATGCGATCGTTTAGGACTTCTATGTGATTGTTCATTACTTTATGCGATTGTTTATCTAATACTTTACGTTAACAACGAAGAAGATAACAATCAGAGAAGTACCCCTAATGATGCCCCCAATGCTGATGGATCAGATAAGAATGGGGAACATGAAGGGGGTGGTAGGGATGACCAGGTTGATATGAACGAGGATAATGGT

Protein sequence

MKLPCLCDRLGLLCDCSLLYAIVYLILYVNNEEDNNQRSTPNDAPNADGSDKNGEHEGGGRDDQVDMNEDNG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 33..47
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 49..72
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 33..72

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC02G025570.1CcUC02G025570.1mRNA