Clc09G18000.1 (mRNA) Watermelon (cordophanus) v2

Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
CTCCCCTTTTTTTCCTTCTCTCGATCTTCTTTTCCCTGTTGCCGTCGCCCATCGCCGATCGCCGCTCCACCGCTACTTTTCTTTCTCCTCTTCTTACCTCACTCTCGGCTGCAACCTAACGCCGCCACGCTAACCACGCTGACCCCGGATTCACAGCACAGACCAAAAAATCAGTTAAGCAAAAGTAACGAGAGAAACTATCGGTTAGCATTTTTTTTCACAGGCCTTCGTTTTTCTTTGTAATTTCTCCTCTTTTTATGTCTCTCGTCTCGTTAAATTTCTCGTAGACGGTTTCTGAAGTATTGATATTTTGAAATCCTTCTGTAGCATACTAGCTCCAAAATCTATGCTAGCTCATTATGCATGATTGAAGCTCGCTTTTGAATCTAGGGCTTGAGATTCTTGTACGGGAAAGTGTGGGACGAAACTCTTTCTTGATCATCCGATTGAATTTGGCCTAGTTGAATTCTTTGTCACTGTAGATAGTTAGACTAGTTTGAACTGTGTTGTGAAAAAATTCGTTATCGGATTGAATTTGGGTTCGAGAGACTTCGTTGCAGGCTCATTGTTGTGAATGGAGTAATTTGATCCCGGCCTCGCCCTTGCCCCAAGGATTTTGGCTGTATGAGTTAGCGATGTCTGTAAATAACAACAGTGCTAATAGTAACAGCGTGGTGAGGAATGTTGGGGCAACTATTCCGGTGAATAACAGCCCTAGTAGTAACAATTTGGGGAGAAATGTTGGGGCGGCTCCACATTTTGGGAATTCAGGCATTGTTCCGCAAACAAGGCCAATGAACCATCATGGCCATCTACTCTCTCAGTCACAGCCCCAAATACATAGTGGGTCACATTTTTCAGGTCATTTTCAGTTGTCCGAGCCACAGGCACGTACAATGTCTCATGTACAGTACACGCAGGCTCATGCTCAGGCACAAGCTCAATCTGCTCATGCACATTTGCAAGCTCATACTCAACCTGTCCAGCTGCATAGTGCCAATGCTAGTAATGTTAGTATAACATCCTCTATTTCAACACCTGGAACAGGGAGTTCTAAGAGGCCCACTCAGAAGCCACCTTCTAGACCTGCAGGGTCTTCTAACACTAGCGCTAGTTCACCATTTAAAACCATGGAGCTGGCTCCAGCCACTAGAAGAAAGAAGGTTAAGCTTCCTGAGAAACAAATACCTGATAAAGTTGCTTCTCTTCTGCCAGAATCTGCTATCTATACCCAATTGCTCGAAGTTGAGGATCGTATAGATGCAGCTCTAGCAAGAAAGAAAAAGGATATTCAAGAGTCTTTAAAGAATCCTTCACGCATTCAAAAAACTCTACGGATCTATGTCTTCAATACATTTGAAAATCAGAATCGAAATAATTCTGATCAGAATAGTGTAGAATCCCCTTCATGGTCGCTTAAGATAATTGGGAGGATCTTGGAAGATGGAAAAGATCCTGTTATCACTGGAGCCATGCAAAATTATAATTCTACATACCCAAAATTTTCATCTTTCTTCAAGAAAATTACTATATACTTAGATCAAAGCCTTTATCCAGATAACCACATAATTTTATGGGAGAGTGCCCGTTCTACTGTTCTGCAAGAGGGCTTTGAAGTGAAGAGAAAAGGAGATAAAGAATTTACTGCAGTGATAAGATTGGACATGAATTACACGCCCGAAAAGTTTCGTCTTTCGCCTTCTCTGTCAGATGTGCTTGGAATTGAAACAGACACCCGCTCAAGAATTATGGCTGCATTATGGCATTACGTGAAAGCTAACAAGTTGCAGAATTCAAATGATCCTTCTTTCATTACATGTGATACAGGCCTTCGAAAAGTGTTCGGTGAAGAGAAGGTGAAATTTTCTATGGTCTCTCAGAAGATATCGCAACATTTAATTCCTCCCCAACCTATAAACTTACAACACAGAGTTAAGATTTCGGGAAATTCTCCTGTTGGAACTACATGTTATGATGTCACGGTGGACGTGCCTTTTCCAATAGAAAAACAAAAGTTGGCATTCTTAGCAAACCTGGAGAAGCATAAAGATATAGATTCCTACGATGAATTGATTACTGCTGCAGTAAGGAAGCTCCATGAGCACGGTCGAAGGCGAGCTTTCTTTCTTGGCTTCAGTCAGTCTCCAGCAGATTTTATCAATAACTTGATATCTTCTCAAACTAAAGATTTAAAGATTGTTGCTGGAGATGCTAGCCGTCTTGCAGAGAAAGAACGTCACTCTAATTTCTACAGTCAATCATGGTGAGCAATAGTTGTTTATTTTATCTGTTTTCCTTTCTTGTTTGCCTATTTTATTGTACATAGAGGTCATTCATTGAGATCGTGTGATGAATGTTTTTATGAATTCAGTTACTATCTTAAGCATATTTTACACCGTATAGAGGAGGCAGAGTGGTTTTTTTTTCAAGTTTTTATTTCTTTTTTAATGAATTTTGCACAAGTGATTTAGAGCATGAGCATATTTGGGAACGGTTACAATCACTTTTTTTTATGTTCATAATCACTCCGCAATGTGCTTTTTATTCTTCAAAATGGACTTTGATAATATGAAAATCATACTTAAAAGTGTTAAATCAAACGTTAAATTAATTTTGGATGATTAAAGATATTTTCCAGAGTGATTTTTTTTTCTTCTCTTTTTTGAAGAGTTTTTTAGAGTGATTTTGAACATAAAAAAGTGATCTTAATTATTTCAAAATCACATTTAAATATGTCCTTAATTGTAAATGGTTATGTAAGAAGTGTTTAACAATAATTTGTTTTAATATAGGTGTCCCACTTTTTAAAATGATTTTGGATTATCAATGTTGGACTTAAATGTTATTTCAGAATCATCAAATTACTAAAAAATCAACTGTGAAATAATAGTTGTTTTCTTAGTGATTCTTAATTAATCACATTAAAGCGATTATGGTTATTTCTAAGTTCACCTCTTTGTTATTGCAAACATCACTATTCAAAATGATAGTGATTTTGGGGATGTTTGGGGCACTGAGTTGGTTATTATATTCAGTAAGTTATAATAGTTAGTGTTTGGGGTGCTAGTATGGGTTATAATAATTTGTGTTTGGGGTGCAAACTATTTTTGTATAGTAAACATCGTAGCAAAGAAGAAAAAAGAGGATTAGTGAAAAATAGTAAGGGGCTGTTTGGCACGCTGAATTGAGTTCACATGTCTGGAGTTCATATGTCTGTGGAGTTTATATGTATGTGGAGATCATATGTTTGTGTTTTGGTGTTTGGGGTGTTGAGTTCATATGTCAGGGGTATCTGGTGTAGTTTTCTATATATATATATATATATATATATATATATTTTAATAAACTATAGATTGCACTTTATTTTATTGTGTTTTAAGCACACATGTATTGTTAGGAGTTTTGGAAAATGGAGTTTAGGGTTCACTTTTGGATCATGCATTTAGATTCTTTTTTTTAAAACTTAAGCAATCATTTTACAAATTTGTGTATGTGACGTTTCTAGTTAAGTGATTTTTATTTTAACACTTTTGATAAAACTTTTTTGCAATAAACAAACTCATGAATTTGACACTTTTTTTCTCAAAAGTGTTTTTACATACAAGTTTGTTTCATTTCTTACATGATAAAAGTGATTTTATTAATGTTAAGTTAATATAAAGAACAACTATAAAATACTATAGCTAATTAAAAAATTGAAAATTCAATGTTTTGACGGAACTTACATACTTTTGTGTCAACAAATGTGTTTTTATTGACAATTTTGTGCGTCAACTTAAATATAAATATTTATTGATATGTTATATGCATGTTTAAATTAATAGTTATTTTTAAGTTTTAAATTAAGGTTTTATCAACGGTTTTATGTGACGAGCATCAACAAAACAAAAAACTCATGTGTCAACATAGCCCAAATTTGTAGTAGTCATAATTTAAAATAATGGTTGTTGGAGTTGGTGGAGCGGCCACTTGTCCGAGTTGACCGTCAATAGTGGTGGTTGAATGTTGTTGGAGTTGGCCGCAAGCGGTGGTTGTCGGAGTTGGCCGTTGGAGGTGACCATCGGAGTTGGACGTCGGAGGTGGTTGTCGGATTTAGCCGTTGAAGGTGGTCATCAGAAGTTGGCCGTCGAAGATGGTTGTCGGAGTCGGACGTCACAAGTGGTCGCCAGATTTGGCCGTCGGAGGTGGTCGTCGTAGTTGGCCATCAAAGGTGGTCGCCGAAGTTGATCATCGAAGGTGGTCGTTGGACTTGATCAACGAGGCATCAGTGGTGATGAGGCTGAGTGCACTGTTGGTGGACATAGTAAAAAATATCGGTGACATATGAAGTTGGCCTCCCAAATAATGAGTTGAGTTCATATTTCAACTCATCTCATCTTATCTCCTCACCCCAAACACCCCCTAAATACTATAGCAAAGAGGGTGTTGGAATAGGATTTATTATACTTAATTGTTGGTTATAAATAGTTGTACACCCTATTATTATATTTGGTGTCCCAAACAAGGAGTGAGCTATAATAACTCACTCCACCAACTTGTAGTTGGTGCCTCAAATGGCCCCGTAGTGATTTTGGCAATAATGAAAGCAATTTTGGCATGTTTGTCAAAATCACTCCCAAATATGTCGTATGTAGCTTTCTAATTACAGGCTATGTCAACAATGGCTCTCATGATTGATGCTATTTTTTTCTCGAATTTTGGCTAGAGTGACCCACTAGATGGCCATTTGTCTCCTGCTCTTTGTTTTGGTGGAGGTGCGGGAGGAAGAACCATTGGATTACAGCGATTGATACTCTGAGATAACTAACAAGACAGAATTGTTTTTAAAAAGATTATTGATAAATTTATGTAACTGTGTTGAATCAGGGTGGAGGATGCTGTCATTCGGTATCTGAACCGTAAACCTTCTGGAAGTGATGTTCCTGGAAACACTTAAGGATCCCGCTCGACATCAATATTGAAATCGGTGATGTCGGTCTGATATTAGTCTCTTTTATAGT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mRNA sequence

CTCCCCTTTTTTTCCTTCTCTCGATCTTCTTTTCCCTGTTGCCGTCGCCCATCGCCGATCGCCGCTCCACCGCTACTTTTCTTTCTCCTCTTCTTACCTCACTCTCGGCTGCAACCTAACGCCGCCACGCTAACCACGCTGACCCCGGATTCACAGCACAGACCAAAAAATCAGTTAAGCAAAAGTAACGAGAGAAACTATCGCATACTAGCTCCAAAATCTATGCTAGCTCATTATGCATGATTGAAGCTCGCTTTTGAATCTAGGGCTTGAGATTCTTGTACGGGAAAGTGTGGGACGAAACTCTTTCTTGATCATCCGATTGAATTTGGCCTAGTTGAATTCTTTGTCACTGTAGATAGTTAGACTAGTTTGAACTGTGTTGTGAAAAAATTCGTTATCGGATTGAATTTGGGTTCGAGAGACTTCGTTGCAGGCTCATTGTTGTGAATGGAGTAATTTGATCCCGGCCTCGCCCTTGCCCCAAGGATTTTGGCTGTATGAGTTAGCGATGTCTGTAAATAACAACAGTGCTAATAGTAACAGCGTGGTGAGGAATGTTGGGGCAACTATTCCGGTGAATAACAGCCCTAGTAGTAACAATTTGGGGAGAAATGTTGGGGCGGCTCCACATTTTGGGAATTCAGGCATTGTTCCGCAAACAAGGCCAATGAACCATCATGGCCATCTACTCTCTCAGTCACAGCCCCAAATACATAGTGGGTCACATTTTTCAGGTCATTTTCAGTTGTCCGAGCCACAGGCACGTACAATGTCTCATGTACAGTACACGCAGGCTCATGCTCAGGCACAAGCTCAATCTGCTCATGCACATTTGCAAGCTCATACTCAACCTGTCCAGCTGCATAGTGCCAATGCTAGTAATGTTAGTATAACATCCTCTATTTCAACACCTGGAACAGGGAGTTCTAAGAGGCCCACTCAGAAGCCACCTTCTAGACCTGCAGGGTCTTCTAACACTAGCGCTAGTTCACCATTTAAAACCATGGAGCTGGCTCCAGCCACTAGAAGAAAGAAGGTTAAGCTTCCTGAGAAACAAATACCTGATAAAGTTGCTTCTCTTCTGCCAGAATCTGCTATCTATACCCAATTGCTCGAAGTTGAGGATCGTATAGATGCAGCTCTAGCAAGAAAGAAAAAGGATATTCAAGAGTCTTTAAAGAATCCTTCACGCATTCAAAAAACTCTACGGATCTATGTCTTCAATACATTTGAAAATCAGAATCGAAATAATTCTGATCAGAATAGTGTAGAATCCCCTTCATGGTCGCTTAAGATAATTGGGAGGATCTTGGAAGATGGAAAAGATCCTGTTATCACTGGAGCCATGCAAAATTATAATTCTACATACCCAAAATTTTCATCTTTCTTCAAGAAAATTACTATATACTTAGATCAAAGCCTTTATCCAGATAACCACATAATTTTATGGGAGAGTGCCCGTTCTACTGTTCTGCAAGAGGGCTTTGAAGTGAAGAGAAAAGGAGATAAAGAATTTACTGCAGTGATAAGATTGGACATGAATTACACGCCCGAAAAGTTTCGTCTTTCGCCTTCTCTGTCAGATGTGCTTGGAATTGAAACAGACACCCGCTCAAGAATTATGGCTGCATTATGGCATTACGTGAAAGCTAACAAGTTGCAGAATTCAAATGATCCTTCTTTCATTACATGTGATACAGGCCTTCGAAAAGTGTTCGGTGAAGAGAAGGTGAAATTTTCTATGGTCTCTCAGAAGATATCGCAACATTTAATTCCTCCCCAACCTATAAACTTACAACACAGAGTTAAGATTTCGGGAAATTCTCCTGTTGGAACTACATGTTATGATGTCACGGTGGACGTGCCTTTTCCAATAGAAAAACAAAAGTTGGCATTCTTAGCAAACCTGGAGAAGCATAAAGATATAGATTCCTACGATGAATTGATTACTGCTGCAGTAAGGAAGCTCCATGAGCACGGTCGAAGGCGAGCTTTCTTTCTTGGCTTCAGTCAGTCTCCAGCAGATTTTATCAATAACTTGATATCTTCTCAAACTAAAGATTTAAAGATTGTTGCTGGAGATGCTAGCCGTCTTGCAGAGAAAGAACGTCACTCTAATTTCTACAGTCAATCATGGGTGGAGGATGCTGTCATTCGGTATCTGAACCGTAAACCTTCTGGAAGTGATGTTCCTGGAAACACTTAAGGATCCCGCTCGACATCAATATTGAAATCGGTGATGTCGGTCTGATATTAGTCTCTTTTATAGTTTTATGACCCTCTATTATGACTCTTTCCTGGTAGGGGACTAAGTTATCTGGAGAATTATAGGAATTCTGTATTGTAACCCATGGCTTGTTTGACTGGGTCATTATCTTGCCAGGGATAGTCATCTTAATTGAACTATAACTAAGATATTTCCATTTTGTACCATTTTTCAGCTAGATGTTAGAATCATAGATGGTTTTGCTTGTCTGTTGCCTAAAGTTCCTTTTCATACAAATTACATTCCAACTCAGGCAATTTTTTGTTTCTTAGTGGCCTCTCTTAAAGCTATTAGATGTACAATATGCATTGTATTCTAGAGAGTTTCCTGCAGGCTGCAGTTTCCTTCATTCTCTGGAGGTTGCTAATGGCTAATGTACCAGGATAGACGCAGCGATTAATGGACGAATCGGACTTTTGAAACCAACGCAACCCTAACCGGGGCTATAAGAGTGAAGGTCCTCCCCTCCTCTTAGCTTGTTCTGATAAATCTGACCAAACTTTGTGATCAGTTTAACTCATTGCTTTGGTGCTTTCACTTTGCTATGCACATAAAATGTGCTCGCACTTGTACTTGATACAAATTCTTATTGTGTACATAACATTTATGAATGCTTAGGATTGTAACTTGAACTAGTTTTGAGGTTTTCATTTGAAATTTATTTATTCCTATATCTACTTTGCCTTTGTTTGTTTGTTTTTATGTAAAGAAAATATAAAAATATTTTTGAATTAGGTTAAATCTACTGTTGAACATTTGAATTATTGTTGGATAAAGAGTTTGCTGTGTAATTTAGGAAGTGTTGATCACAAGTTTGTGATTTTTTA

Coding sequence (CDS)

ATGTCTGTAAATAACAACAGTGCTAATAGTAACAGCGTGGTGAGGAATGTTGGGGCAACTATTCCGGTGAATAACAGCCCTAGTAGTAACAATTTGGGGAGAAATGTTGGGGCGGCTCCACATTTTGGGAATTCAGGCATTGTTCCGCAAACAAGGCCAATGAACCATCATGGCCATCTACTCTCTCAGTCACAGCCCCAAATACATAGTGGGTCACATTTTTCAGGTCATTTTCAGTTGTCCGAGCCACAGGCACGTACAATGTCTCATGTACAGTACACGCAGGCTCATGCTCAGGCACAAGCTCAATCTGCTCATGCACATTTGCAAGCTCATACTCAACCTGTCCAGCTGCATAGTGCCAATGCTAGTAATGTTAGTATAACATCCTCTATTTCAACACCTGGAACAGGGAGTTCTAAGAGGCCCACTCAGAAGCCACCTTCTAGACCTGCAGGGTCTTCTAACACTAGCGCTAGTTCACCATTTAAAACCATGGAGCTGGCTCCAGCCACTAGAAGAAAGAAGGTTAAGCTTCCTGAGAAACAAATACCTGATAAAGTTGCTTCTCTTCTGCCAGAATCTGCTATCTATACCCAATTGCTCGAAGTTGAGGATCGTATAGATGCAGCTCTAGCAAGAAAGAAAAAGGATATTCAAGAGTCTTTAAAGAATCCTTCACGCATTCAAAAAACTCTACGGATCTATGTCTTCAATACATTTGAAAATCAGAATCGAAATAATTCTGATCAGAATAGTGTAGAATCCCCTTCATGGTCGCTTAAGATAATTGGGAGGATCTTGGAAGATGGAAAAGATCCTGTTATCACTGGAGCCATGCAAAATTATAATTCTACATACCCAAAATTTTCATCTTTCTTCAAGAAAATTACTATATACTTAGATCAAAGCCTTTATCCAGATAACCACATAATTTTATGGGAGAGTGCCCGTTCTACTGTTCTGCAAGAGGGCTTTGAAGTGAAGAGAAAAGGAGATAAAGAATTTACTGCAGTGATAAGATTGGACATGAATTACACGCCCGAAAAGTTTCGTCTTTCGCCTTCTCTGTCAGATGTGCTTGGAATTGAAACAGACACCCGCTCAAGAATTATGGCTGCATTATGGCATTACGTGAAAGCTAACAAGTTGCAGAATTCAAATGATCCTTCTTTCATTACATGTGATACAGGCCTTCGAAAAGTGTTCGGTGAAGAGAAGGTGAAATTTTCTATGGTCTCTCAGAAGATATCGCAACATTTAATTCCTCCCCAACCTATAAACTTACAACACAGAGTTAAGATTTCGGGAAATTCTCCTGTTGGAACTACATGTTATGATGTCACGGTGGACGTGCCTTTTCCAATAGAAAAACAAAAGTTGGCATTCTTAGCAAACCTGGAGAAGCATAAAGATATAGATTCCTACGATGAATTGATTACTGCTGCAGTAAGGAAGCTCCATGAGCACGGTCGAAGGCGAGCTTTCTTTCTTGGCTTCAGTCAGTCTCCAGCAGATTTTATCAATAACTTGATATCTTCTCAAACTAAAGATTTAAAGATTGTTGCTGGAGATGCTAGCCGTCTTGCAGAGAAAGAACGTCACTCTAATTTCTACAGTCAATCATGGGTGGAGGATGCTGTCATTCGGTATCTGAACCGTAAACCTTCTGGAAGTGATGTTCCTGGAAACACTTAA

Protein sequence

MSVNNNSANSNSVVRNVGATIPVNNSPSSNNLGRNVGAAPHFGNSGIVPQTRPMNHHGHLLSQSQPQIHSGSHFSGHFQLSEPQARTMSHVQYTQAHAQAQAQSAHAHLQAHTQPVQLHSANASNVSITSSISTPGTGSSKRPTQKPPSRPAGSSNTSASSPFKTMELAPATRRKKVKLPEKQIPDKVASLLPESAIYTQLLEVEDRIDAALARKKKDIQESLKNPSRIQKTLRIYVFNTFENQNRNNSDQNSVESPSWSLKIIGRILEDGKDPVITGAMQNYNSTYPKFSSFFKKITIYLDQSLYPDNHIILWESARSTVLQEGFEVKRKGDKEFTAVIRLDMNYTPEKFRLSPSLSDVLGIETDTRSRIMAALWHYVKANKLQNSNDPSFITCDTGLRKVFGEEKVKFSMVSQKISQHLIPPQPINLQHRVKISGNSPVGTTCYDVTVDVPFPIEKQKLAFLANLEKHKDIDSYDELITAAVRKLHEHGRRRAFFLGFSQSPADFINNLISSQTKDLKIVAGDASRLAEKERHSNFYSQSWVEDAVIRYLNRKPSGSDVPGNT