Lcy10g005400 (gene) Sponge gourd (P93075) v1

Overview


Name	Lcy10g005400
Type	gene
Organism	Luffa cylindrica cv. P93075 (Sponge gourd (P93075) v1)
Description	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like
Location	Chr10: 15699645 .. 15751818 (-)
RNA-Seq Expression	Lcy10g005400
Synteny	Lcy10g005400

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

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mRNA sequence

ATGACTGCTTTAAAAGAAATACCCAAGAAAATGGAGCATTATGAGTGCATTAGTAGGATTCACAATGTGGTAAGATTTGTGAGATCTTCTCCCGCACGTGCTACGAAATTTAAGAAGTGTATTGAAATTGAAAAGATTACTTCTAAGAGTTTGGTGTGTCTAGATGTTTCCACTAGATGGAACTCAACATATATGATGCTTGAGGCGGCTACAAAGTTCCAAAAAGCTTTTGAAAGATTAGAGGATGAAGACTCAACTTTTATGAATGAATGTCAACCAACTAGAGAAGATTGGGAGTATGCTAAGATGTTGGTTAGGTTTTTGAAAGTGTTTTATAATGTCACTTTAAAGATTTCAGGCTCTTTATATACCACGTCTAATATGATTTTCCACCAAATTAGCACAATTCAAAATTGCATACAATTGAATTCTATGGATAGTGAAAATCATATTCTTTGTGATGTGGCTAAGAGCATGAAGTCTAAGTTTGAGAAGTACTGGGGAAATAATGAGAAGACTAATTTGTTGTTGTATGTTGTTGTTGTGTTGGACCCACGATATAAGTTGAAATTTTTGTTGTATTGTTTCAACAACTTGTTAGAGCCAACTTCTGCTAAAAGCATGACAGATAAAGTAGAGCAGGTTTTTAGACAACTTTTCCATGCATATAGTTCTACTTCATCTTTTGCTGGTGGTAGTGGTAGTGGCACTACATGTACAAGTGTCATTACTAAAGAAAAGGGTGGGGCTCAAACAATGGATGTTGATGATGAGATTTCAACCGTAGCATCTGAGTCTGCTTTTAGCACTGGAGGACGTGTAGTTGATTCCTCTCGTTCTTCATTGGCTCAAAAAACAGTTGAGGCTATTATATGCACTCAAAATTGGCTCAATTCCAACCCAATAGATATTGAGTTTTTCAATCTTCTGGAGGAAGACTCAACACTGGAAGAAGATAATGGTTTTACTTTGTTTTCTTTTTTGAATAAGAAACCCACTGGGTTTTATGGAATTGCTATGTATTTCGAATCTCGATTGGGAACAGTCAGCAAGAGGGAAGAACTTGAAACCCTAATTGACGACGTTGAAGAAGAAGATCAGTTTCAAAGATATTGCAGAGATGGAAAAAAAAAATTTAGGAAGAAGAAGAAGTTTCACGATTTTGGGGAGGGAAATTGCGTGGTTTAA

Coding sequence (CDS)

ATGACTGCTTTAAAAGAAATACCCAAGAAAATGGAGCATTATGAGTGCATTAGTAGGATTCACAATGTGGTAAGATTTGTGAGATCTTCTCCCGCACGTGCTACGAAATTTAAGAAGTGTATTGAAATTGAAAAGATTACTTCTAAGAGTTTGGTGTGTCTAGATGTTTCCACTAGATGGAACTCAACATATATGATGCTTGAGGCGGCTACAAAGTTCCAAAAAGCTTTTGAAAGATTAGAGGATGAAGACTCAACTTTTATGAATGAATGTCAACCAACTAGAGAAGATTGGGAGTATGCTAAGATGTTGGTTAGGTTTTTGAAAGTGTTTTATAATGTCACTTTAAAGATTTCAGGCTCTTTATATACCACGTCTAATATGATTTTCCACCAAATTAGCACAATTCAAAATTGCATACAATTGAATTCTATGGATAGTGAAAATCATATTCTTTGTGATGTGGCTAAGAGCATGAAGTCTAAGTTTGAGAAGTACTGGGGAAATAATGAGAAGACTAATTTGTTGTTGTATGTTGTTGTTGTGTTGGACCCACGATATAAGTTGAAATTTTTGTTGTATTGTTTCAACAACTTGTTAGAGCCAACTTCTGCTAAAAGCATGACAGATAAAGTAGAGCAGGTTTTTAGACAACTTTTCCATGCATATAGTTCTACTTCATCTTTTGCTGGTGGTAGTGGTAGTGGCACTACATGTACAAGTGTCATTACTAAAGAAAAGGGTGGGGCTCAAACAATGGATGTTGATGATGAGATTTCAACCGTAGCATCTGAGTCTGCTTTTAGCACTGGAGGACGTGTAGTTGATTCCTCTCGTTCTTCATTGGCTCAAAAAACAGTTGAGGCTATTATATGCACTCAAAATTGGCTCAATTCCAACCCAATAGATATTGAGTTTTTCAATCTTCTGGAGGAAGACTCAACACTGGAAGAAGATAATGGTTTTACTTTGTTTTCTTTTTTGAATAAGAAACCCACTGGGTTTTATGGAATTGCTATGTATTTCGAATCTCGATTGGGAACAGTCAGCAAGAGGGAAGAACTTGAAACCCTAATTGACGACGTTGAAGAAGAAGATCAGTTTCAAAGATATTGCAGAGATGGAAAAAAAAAATTTAGGAAGAAGAAGAAGTTTCACGATTTTGGGGAGGGAAATTGCGTGGTTTAA

Protein sequence

MTALKEIPKKMEHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFHQISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKFLLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFAGGSGSGTTCTSVITKEKGGAQTMDVDDEISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNSNPIDIEFFNLLEEDSTLEEDNGFTLFSFLNKKPTGFYGIAMYFESRLGTVSKREELETLIDDVEEEDQFQRYCRDGKKKFRKKKKFHDFGEGNCVV

Homology

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P08770 (Putative AC transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=2 SV=2)

HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 5.8e-28
Identity = 103/346 (29.77%), Postives = 161/346 (46.53%), Query Frame = 0


Query: 17  ISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKA 76
           I +I  +V  V+SSP +  +  KC     +     +  DVSTRWNSTY+ML  A  ++ A
Sbjct: 421 IEKIKAIVLAVKSSPLQWEELMKCASECDLDKSKGISYDVSTRWNSTYLMLRDALYYKPA 480

Query: 77  FERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFHQISTI 136
             RL+  D    +   P  E+W+ A  L + LK F+++T  +SG+ Y+T+N+ +     I
Sbjct: 481 LIRLKTSDPRRYDAICPKAEEWKMALTLFKCLKKFFDLTELLSGTQYSTANLFYKGFCEI 540

Query: 137 QNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKFLLYCF 196
           ++ I    +  E  ++  +A +M  KFEKYW   + +N+ L V   LDPRYK K L+  +
Sbjct: 541 KDLIDQWCV-HEKFVIRRMAVAMSEKFEKYW---KVSNIALAVACFLDPRYK-KILIEFY 600

Query: 197 NNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFAGGSGSGTTCTSVIT------------ 256
                  S K   D   +V R+L+  YSS S  A  + + T  +   T            
Sbjct: 601 MKKFHGDSYKVHVDDFVRVIRKLYQFYSSCSPSAPKTKTTTNDSMDDTLMENEDDEFQNY 660

Query: 257 ----KEKGGAQTMDVDD---------------------------------------EIST 308
               K+    ++ ++D                                        ++ST
Sbjct: 661 LHELKDYDQVESNELDKYMSEPLLKHSGQFDILSWWRGRVAEYPILTQIARDVLAIQVST 720

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AVI0 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os03g0733400 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 9.2e-26
Identity = 99/356 (27.81%), Postives = 165/356 (46.35%), Query Frame = 0


Query: 17  ISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKA 76
           I  I   ++F+++SP+R  KF +     +I S   +CLDV+T+WN+TY+ML AA  +++A
Sbjct: 361 IYNIRESIKFIKASPSREEKFAEIALQLEIPSTKTLCLDVTTQWNTTYLMLLAALDYKQA 420

Query: 77  FERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFHQISTI 136
           F  LE  D  + NE  P+ EDW+  +    +LK+ Y+    I  +   TSN+ FH+   +
Sbjct: 421 FSTLETSDDNY-NEA-PSAEDWKKVEAACNYLKLLYDSAHSIMAAANPTSNLFFHEAWKL 480

Query: 137 QNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKFLLYCF 196
           Q  +  N+   E+ +   +AK M  +F+KYW   +  NL+L + VV+DPR+K+K + + +
Sbjct: 481 QLELS-NATGHEDPVFSSIAKDMHERFDKYW---KDCNLVLAIAVVMDPRFKMKLVEFSY 540

Query: 197 NNLLEPTSA---KSMTDKVEQVFRQ-------LFHAY--SSTSSFAGGSGSGTTCTSVIT 256
           + +    +A   K + D V +++++       L  AY      + A  S +GT  T+  T
Sbjct: 541 SKIYGVEAAKYVKVVDDAVHELYKEYVAQPLPLTPAYVEQGDGNNAPASENGTQATAPST 600

Query: 257 KEKGGAQTMDVDDEISTVAS---------------------------------------- 302
               G   +D D  +S +A+                                        
Sbjct: 601 ----GDGLVDFDMYLSEIATSQPTKSELEQYLDESLTPRIQEFDILNWWKLNTLKFPTLS 660

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75HY5 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0583200 PE=2 SV=1)

HSP 1 Score: 114.8 bits (286), Expect = 2.3e-24
Identity = 91/352 (25.85%), Postives = 155/352 (44.03%), Query Frame = 0


Query: 14  YECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKF 73
           +  I  I   ++F+++S     KF +     +I S   +CLDV+T+WN+TY+ML AA  +
Sbjct: 399 HSVIYHIRESIKFIKASSVHEDKFAEIALQLEIPSAKTLCLDVTTQWNTTYLMLLAALDY 458

Query: 74  QKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFHQI 133
           Q+ F  LE  D  + NE  P+ EDW+  +    +L + Y+    I  +   TSN+ FH+ 
Sbjct: 459 QQVFASLETCDGDY-NEA-PSTEDWKKVEAACSYLSLLYDSAHNIMAAPNPTSNIFFHEA 518

Query: 134 STIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKFLL 193
             +Q+ +  N++  E+ I    AK M  +F+KYW   +  NL+L + VV+DPR+K+K + 
Sbjct: 519 WKLQSELS-NAIAHEDPIFRSTAKIMHERFDKYW---KDCNLVLAIAVVMDPRFKMKLVE 578

Query: 194 YCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFAGGSGSGTTCTSVITKEKGGAQTM 253
           + ++ +    +AK     V+    +L+  Y++         +  T  S       G + +
Sbjct: 579 FSYSKIHSVEAAK-YVKVVDDAIHELYSEYATQGE--ANRDAHVTDNSAAVTPPNGDELL 638

Query: 254 DVDDEISTVASE------------------------------------------------ 306
           D D  +S +A+                                                 
Sbjct: 639 DFDIYLSEIATSQPSISELEQYLEEALMPRIQDFEILEWWKLNTIKFPTLSKMARDVLAI 698

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9FJG3 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0239150 PE=3 SV=1)

HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 3.0e-24
Identity = 97/352 (27.56%), Postives = 165/352 (46.88%), Query Frame = 0


Query: 17  ISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKA 76
           I  I   ++F+++SP+   KF +     +I S   +CLDV+T+WN+TY+ML AA  +++A
Sbjct: 361 IYNIRESIKFIKASPSCEEKFAEIALQLEIPSTKTLCLDVTTQWNTTYLMLLAALDYKQA 420

Query: 77  FERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFHQISTI 136
           F  LE  D  + NE  P+ EDW+  +    +LK+ Y+    I  +   TSN+ FH+   +
Sbjct: 421 FSTLETSDDNY-NEA-PSAEDWKKVEAACNYLKLLYDSAHSIMAAANPTSNLFFHEAWKL 480

Query: 137 QNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKFLLYCF 196
           Q  +  N+   E+ +   +AK M  +F+KYW   +  NL+L + VV+DPR+K+K + + +
Sbjct: 481 QLELS-NATGREDPVFSSIAKDMHERFDKYW---KDCNLVLAIAVVMDPRFKMKLVEFSY 540

Query: 197 NNLLEPTSA---KSMTDKVEQVFRQ-------LFHAY-------------SSTSSFAGGS 256
           + +    +A   K + D V +++ +       L  AY             +ST + A  +
Sbjct: 541 SKIYGVEAAKYVKVVDDAVHELYNEYVAQPLPLTPAYVEQGGGNNAPASENSTQATAPST 600

Query: 257 GSGTT-----CTSVITKEKGGAQTMDVDDE------------------------------ 302
           G G        + + T +   ++     DE                              
Sbjct: 601 GDGLVDFDMYLSEIATSQPTKSELEQYLDESLTPRIQEFDILNWWKLNTLKYPTLSKMAR 660

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0JMB2 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0518400 PE=2 SV=3)

HSP 1 Score: 110.2 bits (274), Expect = 5.6e-23
Identity = 65/218 (29.82%), Postives = 115/218 (52.75%), Query Frame = 0


Query: 17  ISRIHNV-------VRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEA 76
           ++ +HNV       ++F+++  A   KF +     KITS + +CLDV++ WN+TY+ML A
Sbjct: 321 LASVHNVIYLIRESIKFIKADDAHENKFAEIAVELKITSNNSLCLDVTSEWNTTYLMLLA 380

Query: 77  ATKFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGS--LYTTSN 136
           A  +++ F  LE     +     P+ EDW+  +    FLK+ Y  TL I  +   + T+N
Sbjct: 381 ALDYRQVFTLLESYYDNY--GTAPSTEDWKKVEAACGFLKLLYAFTLNIMSAEGNHQTAN 440

Query: 137 MIFHQISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRY 196
           M FH    +Q  +Q N M   + ++  +   +  KF+KYW   +  N++L + V +DPR+
Sbjct: 441 MFFHDAWVLQLELQ-NGMAHGDDVIRGIVIGIHEKFDKYW---KDCNVVLAIAVAMDPRF 500

Query: 197 KLKFLLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSS 226
           K+K + + ++ +  PT A      V+     L+  Y++
Sbjct: 501 KMKMVEFAYSKIYGPTDAAKYVKLVDDAILDLYKEYAA 532

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DZY7 (Putative transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2406G00150 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 3.8e-91
Identity = 198/379 (52.24%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 124 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 183

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 184 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 243

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 244 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 303

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSV------- 251
           + +C  N   P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T         
Sbjct: 304 VSFCLKNFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 363

Query: 252 --------------------------ITKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                     IT  + G+  +D+                     
Sbjct: 364 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSITPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 423

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 424 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 483

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CXI1 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G004160 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 344.7 bits (883), Expect = 5.0e-91
Identity = 197/379 (51.98%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 215 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 274

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 275 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 334

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 335 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 394

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C  N   P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 395 VSFCLKNFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 454

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 455 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 514

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 515 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 574

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BX83 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold863G001050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 1.4e-90
Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 331 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 390

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 391 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 450

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 451 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 510

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C  N   P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 511 VSFCLKNFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 570

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 571 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 630

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STV SESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 631 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVVSESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 690

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CR68 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold84G001050 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 5.5e-90
Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 331 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 390

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 391 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 450

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 451 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 510

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C      P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 511 VSFCLKIFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 570

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 571 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 630

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 631 NSDRFEVLGHMARDILAILVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 690

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DAN8 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold237G001750 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 5.5e-90
Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 266 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 325

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 326 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 385

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 386 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 445

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C      P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 446 VSFCLKIFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 505

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 506 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 565

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 566 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 625

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. NCBI nr
Match: TYK28895.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 7.9e-91
Identity = 198/379 (52.24%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 124 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 183

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 184 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 243

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 244 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 303

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSV------- 251
           + +C  N   P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T         
Sbjct: 304 VSFCLKNFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 363

Query: 252 --------------------------ITKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                     IT  + G+  +D+                     
Sbjct: 364 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSITPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 423

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 424 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 483

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. NCBI nr
Match: TYK16593.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 344.7 bits (883), Expect = 1.0e-90
Identity = 197/379 (51.98%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 215 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 274

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 275 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 334

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 335 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 394

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C  N   P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 395 VSFCLKNFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 454

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 455 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 514

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 515 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 574

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. NCBI nr
Match: TYK03730.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 3.0e-90
Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 331 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 390

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 391 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 450

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 451 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 510

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C  N   P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 511 VSFCLKNFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 570

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 571 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 630

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STV SESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 631 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVVSESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 690

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. NCBI nr
Match: TYK23433.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 1.1e-89
Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 148 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 207

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 208 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 267

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 268 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 327

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C      P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 328 VSFCLKIFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 387

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 388 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 447

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 448 NSDRFEVLGQMARDILAIPVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 507

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. NCBI nr
Match: TYK14363.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa])

HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 1.1e-89
Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0


Query: 12  EHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAAT 71
           EH +CI RI   VRF+RSSPAR  KFKKCIE+EKI  KS VCLDV TRWNSTYMMLEAA 
Sbjct: 331 EHNDCIDRIRYAVRFIRSSPARFLKFKKCIELEKIACKSYVCLDVPTRWNSTYMMLEAAV 390

Query: 72  KFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFH 131
           KF+KAF+RLEDED+++ ++  P +EDW  A+ML+RFLKVFY+VTLKISGSLYTTSN++FH
Sbjct: 391 KFEKAFDRLEDEDASYRHDMSPNKEDWTNARMLIRFLKVFYDVTLKISGSLYTTSNLVFH 450

Query: 132 QISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKF 191
           QI+ +QNCI+LN+  S N +L  +A +MK+KFEKYWGNNEK NLLLYV +VLDPR KL+F
Sbjct: 451 QITVVQNCIRLNA-GSANALLVGMANNMKAKFEKYWGNNEKNNLLLYVAIVLDPRKKLRF 510

Query: 192 LLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFA--GGSGSGTTCTSVI------ 251
           + +C      P  A+SM + VEQ  R+LFH YS+T S +  G S + TT T  +      
Sbjct: 511 VSFCLKIFFGPEVAESMGNVVEQCCRRLFHEYSTTRSGSRQGCSSTSTTSTQTVSGLDAN 570

Query: 252 ---------------------------TKEKGGAQTMDV--------------------- 311
                                      T  + G+  +D+                     
Sbjct: 571 IDFDSNENVGEDFVYDTIVEEFEDDSTTPFEQGSSEIDIYLLEANVRTEGDFDILQWWKM 630

Query: 312 -DDE---------------ISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNS 319
             D                +STVASESAFSTGGRVVDSSR SLA KTVEA+ICTQNWLNS
Sbjct: 631 NSDRFEVLGHMARDILAILVSTVASESAFSTGGRVVDSSRCSLAPKTVEALICTQNWLNS 690

[Close]

BLAST of Lcy10g005400 vs. TAIR 10
Match: AT3G42170.1 (BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain )

HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 1.4e-21
Identity = 81/328 (24.70%), Postives = 149/328 (45.43%), Query Frame = 0


Query: 15  ECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQ 74
           + I  I + V+ V++S +   +F +  E  ++ S+ ++ LD  T+WN+TYMML AA++ +
Sbjct: 354 DVIKNIRDSVKHVKTSESHEERFTELKEQLQVPSEKVLSLDDQTQWNTTYMMLVAASELK 413

Query: 75  KAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFHQIS 134
           + F  L+  D  +     P+ EDW + + L  FLK  +     +  +   ++   FH++ 
Sbjct: 414 EVFSCLDTADPDYKK--PPSAEDWRHVEALCTFLKPLFEAVSTLQSTGNPSAVTFFHEVW 473

Query: 135 TIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKFLLY 194
             Q+ +   ++  E+  +  +AK+M+ K +KYW      +L+L + VV+DPR+K+K + +
Sbjct: 474 KTQSDLS-RAIAGEDPFVTGIAKTMQEKVDKYW---RDCSLVLAMAVVMDPRFKMKLVEF 533

Query: 195 CFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSS-----TSSFAGGSGSGTTCTSVITKEKGG 254
            F+ +    + K++   V+    +LF  Y +      ++  GG   G +       E  G
Sbjct: 534 SFSKIFGEDAGKNI-KTVDDGIHELFTEYMALPSPQNTTSEGGKADGLSDFDTYIMETTG 593

Query: 255 ------------------AQTMDVDD----------------------EISTVASESAFS 298
                              Q  DV D                       +S  A +  F 
Sbjct: 594 QNLKSELDQYLDETLLPRVQEFDVLDWWKQNKLKYPTLSKMARDILSIPVSAAAFDYVFD 653

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy Swiss-Prot


Match Name	E-value	Identity	Description
P08770	5.8e-28	29.77	Putative AC transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=2 SV=2	[more]
Q6AVI0	9.2e-26	27.81	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]
Q75HY5	2.3e-24	25.85	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]
B9FJG3	3.0e-24	27.56	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]
Q0JMB2	5.6e-23	29.82	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 4 OS=Oryza sativa subsp. j...	[more]

BLAST of Lcy10g005400 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5D3DZY7	3.8e-91	52.24	Putative transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold240...	[more]
A0A5D3CXI1	5.0e-91	51.98	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]
A0A5D3BX83	1.4e-90	51.72	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]
A0A5D3CR68	5.5e-90	51.72	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]
A0A5D3DAN8	5.5e-90	51.72	Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var...	[more]

BLAST of Lcy10g005400 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
TYK28895.1	7.9e-91	52.24	putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
TYK16593.1	1.0e-90	51.98	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ...	[more]
TYK03730.1	3.0e-90	51.72	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ...	[more]
TYK23433.1	1.1e-89	51.72	putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]	[more]
TYK14363.1	1.1e-89	51.72	zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. ...	[more]

BLAST of Lcy10g005400 vs. TAIR 10


Match Name	E-value	Identity	Description
AT3G42170.1	1.4e-21	24.70	BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain	[more]

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
IPR008906	HAT, C-terminal dimerisation domain	PFAM	PF05699	Dimer_Tnp_hAT	coord: 259..297 e-value: 1.0E-10 score: 41.3
IPR025525	hAT-like transposase, RNase-H fold	PFAM	PF14372	DUF4413	coord: 119..223 e-value: 2.0E-23 score: 82.5
None	No IPR available	PANTHER	PTHR23272	BED FINGER-RELATED	coord: 11..297
None	No IPR available	PANTHER	PTHR23272:SF137	ZINC FINGER BED DOMAIN-CONTAINING PROTEIN DAYSLEEPER-LIKE	coord: 11..297
IPR012337	Ribonuclease H-like superfamily	SUPERFAMILY	53098	Ribonuclease H-like	coord: 12..300

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Lcy10g005400.1	Lcy10g005400.1	mRNA

GO Annotation

GO Assignments

This gene is annotated with the following GO terms.

Category	Term Accession	Term Name
molecular_function	GO:0003677	DNA binding
molecular_function	GO:0046983	protein dimerization activity