Pay0008475 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonfive_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTGACGCGATTCTTTTGAATTGAGAGATCTTCTCCCTCGGAGACCTCAGTTGCCATCTTCGCCCTCACTGGGTTTATTCTTTTATTTCATATATAGTATTAATTTTTAGTTTTAATTTTTATATATAATTTTAATATTTACTTTGTTCTTCTTCTTGTTGGTTGTCAGAGGCAGAGGACAGTCTCTGTTCCTCTTGGAGTCGATCTCAAACTCCATAGCCATCCCTTTGCTTCGACCAGATGGCACAACATTCTTCCTCTTCTCAATCCGATCTATCTCTTTCTCGCAACTCTTCTCTCAGTCGTCTCAACGCTCAGGCTCCTGAGTTCGTCCCCACTCGTCCCTCCACTCGTCCCGATCTACAACCACTGCCCCCTCCACCCAAGCAATCTCCACGTATTCTCATCCCTTCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCCGGCTATGATGCATGGTTATCCTCCCCCTCCTCCTGGATCTCCCTTCCATGTTCCCATTCAGACAACCCCTGTCCCTGTCCCCACTCACGTCGTTTCCCTTCAGAATCATCCCTATCATCCTCATCATCGCCACCACCACCATTCTCATCACGTTCCTGTGCTCTATCACCCTCATAATCCTCAGTATTATGCGGACAATGGCGGGTTTCATGACCCCGACACGCCGGTTGTGCAGCCAGCTCAGAAGCCTCTGCTTGAGTCCGACTACGCTGCTCCATCTAGGAGTAAACTCACCGATGAAGTCTCCCAAAAGCTTTTGAATCAGGTTGCCTTTTTCTTTGGACTACTAGATCTTTTATGTTTATGTTCTTCTTTCTTTGTTAATATTTTGCTATAATTACTCTGCTAATGGAGCTGTTGTATTTTGGGCCTGCGAATTCTGTTGCTTCTATAGGCATACATTCAGTTAGCTGCTAGTCGTGGTTACTTGAGAAAGGTTTCAGAACTTGCTGGGAATTTTGTTCTGGTCTCTCTTTTCCTGTTGTACTAATATTGTCGTTATCTGCAAAATTTATGTTTGCTTGAGACTGTAGATTAGCTACCAACTTGCCTTCTCTGATGTTATATCTTTGGATAGAAAAAGAGTGTCTGCTATCCGTAATTGATTGCTACCTTTTATGGTTGAGGGAATACGAAACTACAAAGTAACTGTAGCAACTAAGACCTATCTTTCCAAGAGTGCCTTCTTTAAGCTTGTACGTTAGGTGCCATAGAGTTCGTAGGAGATGAAAATGCCTCCAAATTGCTTTCTATGGCTCAGTTGTCCACTATTGATGAAACTGCTCAATTAAATCATATCATGTTTCAGAGAAGAAAGTCTATTCTTTAAGTCGGACAATTACATACATGGTCTGGTCCATCTGCTAAAGCAAAGCAAACACCTAGTTCACAATAAAGAAAGCTTCTACCTCAGGTGTAGGGAGGTGAAAGATGTTAATTTCTTCCTAGCTTTGGTCACGTAGGCTTAAATAGGGCTTTGAGGCCTTTTGTTCTAAGAAAGTTATGGTTTTCTTGTGGATCTATTCTTTTGAAAGACTAAACACCTGTGATCGGTGCATCCTTTGAAATTATGGTCTTTTTCCTTATTGCCAGAAAGCTTCAGATGCCCTTTTACAGTTAGTTGAAGGTTCTCAATTTAAGACTTAGGCGAAAATCCTTTGGTTCAATGGGATCTTCACTCTCCTTTGGAGGCTATAGATTGAAAGAAACTCTAGAATTTTTCATGATCAAGATAACAGCAACTTCTTTTGGAGTTTGGTCACTCTTTTTGCTTCTACTTGATCCTTTACTTCTAAATTCTCTTTTAATTATAGCCTAACCCAAATACTAGTTGGGTTTCTTGTTTGTAAGCTATTGTTATGTGGGTTTTTCATTTTCATTTTAATTTGTCCCAATTTTAGACATTTATTGTGAGACCATGTTTGAAATAGAAGGTTCATTCTTCAAATAAGAGTTTGAGTAAAGGATTTTGCAGAAGGCGTCATGAGGCAATGTTTTGAGAAGTTAAGTGTTCTGATGAATCACGTTGGAGCTAGGCGATGCGAGGAAAGGAGGTGGCGTTGAAAGATAGGAATTTCTGGGAAATTTCCTAGTTGAACTTAATTAACGGGCCACATGTAAGAGTTTAAGCTAAACATGGTTTGAAAAGTTATTAGGCTCATATGAGTAGTACTTTAAGTAGGATTTAAAGAGTTTATGAGAAATTGAGGATGACTAATCCAATTTGGGATTAGTATAAATAGGGGAGAAAGGTAAGTAGAAAGGTTAGTAGAAAGGAGGATTACGTTGAAATTCTTAAGAGTTACTCTGCTGAAAAGAAGAAGTATTAGGCGAGAAGAAGAGACCCGAAGCTAGGCGTTCTGAAGGAAGAACTTAACGTAGTGAGTGATTTTCCAAAATGTTCAAAGATTTAAAGTTTTCTTCTAAATTTCTTGTTGATTTGTAATGATGTTCATATGTTAATGTTTATAAAGGAATGATTTTGAAAGAAAGCTTGTATTATGTTTAATGATTGTACTGTATGCTATGTTTGTTTGTAAACCATTAGTCTTTTTCCTATCAATGAAGCTAACTATTATGTGCACATAAGGAGTAAAGGCAACCATGTAAAAAAGGATTGCATGGTGGATTGAAGTTGGCCAATGCGTAAAAGGAGCGTATTGAGCTTAGCGGCCTAAGCAACGGGAAGTGAACCAAGAAATTCTCCAAGGGATGCTGTTGATGAAAAGGACATCATAATAGTCTATGCGTGGGAATGGTTCATGTTCTTGGAAGAAAGGAATATGAAAGACTAATGTGTGATTTCTGTTTTATGAAATGAGGCGAAGGAAGCCATGCTTATGAAAATGATTTTGTATAATGTGCCAAAAAGTTTTTCAAAACTATCACTCACTAAGTTTTGATTTATGCTTTAAGATCCCCCCCCCCCCCCAAGGTGTTAAGACTAAGCTGGGATAAGAAAGGCGAGCTACCAAACGTTGAAGCTATGGAAGGCGTTAAAAGCTTATTGTTTTAGTTCATGTATTTAAGAAAGCATGTAAAATGTATTTGGATCGTGCTAACTTAATAAAGAGATTGTTGTTAATATTTCAAATGCGTTGTGTTATTTTCATTGCTTAGTAGTTTAAGTTGTTAAGTTGAACTAGGCAATAATGCCAAGATCTAGGACTTAAGTTGAATGTTTTGGTGTTTCACCTGAGGTGTTAGGGCTGCTCAGGTTGCGTTGCGTGTCATAATGCGAGGTTAGGATGCATGCGGGGCGGGTCGTGACACTTATGGGACTCACTGGACGAATTGGTAGACACTTTGAGGCATACTCTAGGGATGTGGATGGCATTTCGAGAAGAGAAAATGAAGAAATTTATGTTTGAGGTGTAAATGAAAACCTAAGTTTAAAAAAACTGGTTGAAGAACAAGAGATGGAGTTCCAACCTAGTTGAGATGCTAGTGTGCATCTATTGATCCTAGCGTGTTCTTGTACTATGAGACTTCGTTTCTTTTCATTAAATCAATGAAAATTGTGTTTCCATTTTAAAAGTAACGAGATGGGAAATATTCAAATATGTTTGGGGCACCATTGAACCTTTCTAATAAACCCAAGTTTGACAAACTAATGAGGTAAACATGCCGCCCAATTCTAAACTCTCTCCCAAACTCATCCTTTTCCCTTTTAGTCCGTTGATTGACTAGGGCATCTAGGATCCAACATTGTATAATTACTGATCTACTTCAATATGCTGATGTTTTGGAAGGCTCAAAGCTGTTAGTATATCAATATCTTTTGCTTATTGAAGGGACTGAAGAACATGATCTCGAAGGTTGCATATCAACCTCTGCTTTTTGGGACGATAATTAACATGCTACACCATAACACATTGGATCATTTATCTGCTGGATGATGACTTTCCATTGTCATCCAGAAGACTAATTGATTGGTTGCAAATTGAAAGGTGATGCTACAAAAGACTTTAAAGCTGTCAAATGGATTTTCTACATCTACCGTATATCTTCCAGGAGTGATGATTGAAGTAGGTACCTTATACCTGACACTAAGGGGCAAAAAAAAAAAGGAAGTGGGTTGTGGAACAATGGTTTTTGAAGTTGCTATAGTGGTGAACTGTTTTTTCAGTCTCTTTATGATGTAATTCTTAAAACAGGGAGTTGCTTCACGTATTTGCCTCCTTGGCCTGGAGGTGCTGTTCCTAGTGTTTATGTAATTGTGGTGAGGTTGGTATCGTTGAAATAATTAAGCTAATGCCCCTCATGACTGGAAAACTACCACTTACAATTGGAAATTGAATAAAATTTAAATCTTCTACTCATAATTAATTACAAAATGCAGCTACTACTTGTTTTAAGGATGTTGGAGCCGACATTTTCAAGATTATATATAATGCTTGCTGTGTCAGTAGAATCCAACACTTTGAGGTTTTTGACATTGAGTCCCTGGGTTTTACTTCTGTGATTATTGAAGTAAATTTATGTTGAAAGTTTCTAATGATTGCCAGTTTTAGTAAGTTGGATTATTCCTTAAAGCTTTTGGTGCTCAATATTCTTTCAAATAGTTTAACTTTGGCGTTTTTCTTTGATGACTTTGAAATGATAAAGTTAAATGTTTGTGACTGTCCGTCTAGGATGTTGTTTAACAAATGTACTTTGAAAATTGAAGTTAGTAAGTACTATTTAAAAGTACCAAATTAGCTACAATAAACACTATTTCGATATCCTCATTGGCTACAGGGTTCTCTATTTGCAACAATTTTTACTGTTTTACATTCATCATTTTTTTTATTATTTGCTACTGTGTTTACTATTTCCTTCTCAAACTAAAGTAGTTTACATCTCAAGCACATATTATTATAACTTAAATTAAAATAATCTACATCCCAAAAACACAAATTATTATAGTCCACATATAATAACCAATTCCTTGCCTCAAACGGCTCCTTAGAAGTTGAATGGTTGATATAGTACGTTTTATGCCTGGTACTATGTTTTTAAA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BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O80567 (La-related protein 6B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LARP6B PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 3.7e-117 Identity = 282/529 (53.31%), Postives = 349/529 (65.97%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LHL3 (La-related protein 6C OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LARP6C PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 228.0 bits (580), Expect = 2.3e-58 Identity = 150/356 (42.13%), Postives = 217/356 (60.96%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q94A38 (La-related protein 6A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LARP6A PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 189.1 bits (479), Expect = 1.2e-46 Identity = 129/336 (38.39%), Postives = 184/336 (54.76%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7ZWE3 (La-related protein 7 OS=Danio rerio OX=7955 GN=larp7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 76.6 bits (187), Expect = 8.5e-13 Identity = 59/188 (31.38%), Postives = 98/188 (52.13%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8BN59 (La-related protein 6 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Larp6 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 63.9 bits (154), Expect = 5.7e-09 Identity = 78/340 (22.94%), Postives = 147/340 (43.24%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BGU3 (la-related protein 6B isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103489697 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 952.2 bits (2460), Expect = 8.5e-274 Identity = 492/492 (100.00%), Postives = 492/492 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EJ80 (la-related protein 6B-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111434957 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 804.3 bits (2076), Expect = 2.9e-229 Identity = 440/517 (85.11%), Postives = 459/517 (88.78%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I059 (la-related protein 6B-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111468508 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 803.1 bits (2073), Expect = 6.4e-229 Identity = 439/517 (84.91%), Postives = 455/517 (88.01%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1GLH8 (la-related protein 6B-like OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111455073 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 802.4 bits (2071), Expect = 1.1e-228 Identity = 443/509 (87.03%), Postives = 460/509 (90.37%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I3E0 (la-related protein 6B-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 799.7 bits (2064), Expect = 7.0e-228 Identity = 443/504 (87.90%), Postives = 456/504 (90.48%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. NCBI nr
Match: XP_008447184.1 (PREDICTED: la-related protein 6B isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 952.2 bits (2460), Expect = 1.8e-273 Identity = 492/492 (100.00%), Postives = 492/492 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. NCBI nr
Match: XP_031744248.1 (la-related protein 6B isoform X2 [Cucumis sativus] >KAE8646076.1 hypothetical protein Csa_016910 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 938.7 bits (2425), Expect = 2.0e-269 Identity = 484/492 (98.37%), Postives = 489/492 (99.39%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. NCBI nr
Match: XP_031744247.1 (la-related protein 6B isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 925.2 bits (2390), Expect = 2.3e-265 Identity = 484/516 (93.80%), Postives = 489/516 (94.77%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. NCBI nr
Match: XP_038888029.1 (la-related protein 6B [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 857.1 bits (2213), Expect = 7.7e-245 Identity = 459/499 (91.98%), Postives = 465/499 (93.19%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. NCBI nr
Match: XP_023553969.1 (la-related protein 6B-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 808.1 bits (2086), Expect = 4.1e-230 Identity = 444/504 (88.10%), Postives = 459/504 (91.07%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. TAIR 10
Match: AT2G43970.1 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 423.3 bits (1087), Expect = 2.6e-118 Identity = 282/529 (53.31%), Postives = 349/529 (65.97%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. TAIR 10
Match: AT2G43970.2 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 387.5 bits (994), Expect = 1.6e-107 Identity = 269/529 (50.85%), Postives = 334/529 (63.14%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. TAIR 10
Match: AT3G19090.1 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 228.0 bits (580), Expect = 1.6e-59 Identity = 150/356 (42.13%), Postives = 217/356 (60.96%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. TAIR 10
Match: AT5G46250.1 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 189.1 bits (479), Expect = 8.4e-48 Identity = 129/336 (38.39%), Postives = 184/336 (54.76%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0008475 vs. TAIR 10
Match: AT5G46250.2 (RNA-binding protein ) HSP 1 Score: 153.3 bits (386), Expect = 5.1e-37 Identity = 94/247 (38.06%), Postives = 139/247 (56.28%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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