Spg030964.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg030964.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 22718457 .. 22728626 (+)
Sequence length972
RNA-Seq ExpressionSpg030964.1
SyntenySpg030964.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGTCAGATTGGGGATTTTCAGATGATTCTGTGCAGATCCCACGAATCTCGGTATTTTGTCGGAAAGCTCAGTTGCGGCCGCATCTTGGGTGCATTTTTCACAGTGTTCTGCTTCAACAATTCTATCTTCAGCATGGGGCTTCTTTCCTTATATGGCTTTGCGGGCGCAACTTGTATGTTGATGATATTGAAAGTGTTAATATCTAAAATACGGAAGCAATTTTGGATCTTAGGCACATAATAAGCTCAATTTGATCAAAAATTGCATGTTGTTCATGAGATGAAAAACAGAGTTAGTTTACCAACCTCTTTTAAATGGAGAAATTGGTTGGATTCTCTTGTTGTTTTTCTTCACCAATCAATCACGAACCACCACTGGATCTTCCTTGCTATCCTCAAGCCTTTGGAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTGAAGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCTTATGGAGGTGAGTTTAGTGAGTAACAATTTTGGCAGCAATTCAGTAGGTTTCAAGCGATCTTCTTTCAGCTTTCTTCCTTCCTTTTATAGAGGGACCAACGAAGAAGAAAAGCCCCAGAATTTGACACCAATTCAGCTATGAAGAAAGTGGGAAATGGTGTGGCTTTCATGAGGGGAGTGCATGGGTTTAGTCACCATGCACTCCACCTCCAAAAAATCATAATTTTGAATTTTAATTAAATCAATAATTATCTTGATTTAATTAGATAATTATCTAATTTTTAATAATCTGAAAAATCAAAAATTAAATTTCAATTTTTCAATTTTAAATTAATTCAAAATTAATTTAAAATAATTAATAATTAATTTAATATCTAATATTAAATTAATATTTTGCCACCATTCCCGAACATTTCCGAAATTTTATTTTTCAATCATCAATCCATGTTCATGTTCTTGATATTTAAATCATATTTAAATATTAAATATCATACAAACCCGGTTTTCACAAAACCCGATGTATCGACAACGTCAATCACCTCTATCCATTTCCCTAAACATGAATATAAAGTCATTCATATTTTATCCATCATATTGTTCCAAAGGTTAGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGGTACGAGGTTTAACCGGTTAAACCCTTTTAATCTAGCTAACCAACATCCGTTAACTACCGGGACACTCCACTATAGCCTAGTAGTTGAACTCCCCTCACTGTAGATATATTTCTGTCCATTCGATATAACCATGATTAGTAAGTCAATCCTTCACAGATCGTTCGTTACTATAGCTAGGTCAAATGTCCATTTTACCCCTATAGCACATCTTAGTTCCTTAATTCCACTGGTCCTCTAATGAACAATTTGTTTATGGTCCAACCACTAAATAAAGTCCCTCTCGAGCCAATGAGAGGGTGGGGCCCCTTGTTCAAGCCTTGGATTTAGCATTTAAGGGAACAACCTCTCTACTGTCCCTGAATAGGGTAGGAGTGAATTCTATCTTGCTTTACTATGTCCACAGCTATCCATTTAGTCTTACCCCCAAAATGGTAGGATTATTGAATGGCTCTTTTGGACTACTCTCACCCATGCATATCAAAGGATAATCCTAAATGAACAGGAGTTCATAGCAAGCTCAGAATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGCATGAAATAGTCAGTCTTAACAGTAAAAGGCGTTATAAAGTAAGTGTGACTTATTTCTCAGTCCTGTCTTGTGTAAACATCTTTTACACAGGATGCCTCTTCTTGTATGTCTCTACATGAATGATCCAGGATCACGTCATTTTCCTTATTTGCAAAGTAGGCCGCATACATAGTGTTACCAGGATAAGGTACCCAGTCTTATCCATTTACTATAGACCATTTAGGTTATATAATCAAACTTGATCCCTGCCTATATCCACGATATAGTTCGAGTATTTAATATTATAACCCTGGATGTTTCTATTGGATTTAAGATATAAATAAACAATTTCACTGAATAACATCTTTATTATAAAAAGGATAACAAAACTTGAGTTCTAGGACATAAACCCCAACAGATATGTTTATTTTCGGTACGAATTTAGGAGTAATTAATGATACCAAGTTATTCTTGTCCTCACACTTTGGGATGAGAGATTTAGGTGAGGCTGATACTTGATGTTAAATTAACGAAAACCAAAAATGGGTATTCATTGAGTCAATCACACTACGTTGAAAAGATTCTAAAGAGATTTGATTGTTTTGATGATATACCTGTAAGAACACCTTATGATACTAGTATAAAACTTAAGAAAAATAAAGGGATAGTGTCTTTCAATTAGAATATGCAAAAATTATAGGTAGTGTTATGTACCTGATAAATTATACTAGACCTGATATTGCATATGTCGTGAGTAGATTGAATATGTATACACATAATCCTAATAAAGATAATTGGATTGCTCTTCATCTTTTATTAAGGTACCTTAAGGGTACAATAGATTAATGTTTGTGCTTTAACAAATTTTCTGCAGTATTAGAATGTTAATGTGATGAAAACTGGGTAACCGATAACGATGAAGTAAGCTCAACCAGCAGTTTTGTGTTCATCTTTGGTGGAGGAGTTATTTCATGGAAATCAATAAAGCAGATGTGCATTGCGCGATCCACCATGGAGTCTGAGTTTATAACTCTCGAACTTGCAGGGCAAGAGGCGGAATGGTTAAGAAGTTTACTTCGAGACGTACCACTGTGGGGGGCGTCAGTGCTAGTCTCCTTACACTGTGACTCACAAGTAGTCATAGGAATTTTCAAAAGCAATGTGTGTTGGGTTTTATGCTCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTAACGATTAACCGAATATTAATGAAATAATATTGATGTATTATTCAATTGAGTGTTATTAGTTATATTATGTTTGTCTTTTCCTAAATAACCCTAATCCAATAAACTAGACATCCTAGGTTGTAGTATGAGTCTTGAACTGTATGTGGAGACATATGGGGATCACTGTTCAAGATACAGCCTAAAGGCTCTATAGTATAAGGATAAGATTGGGTGCCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGACCCACTTTGTATTTGATAAAAACGCCATGATCCAACATGTTTGTGTAGGAGACATGCAAGTGGGGCTATCCTATGCAATCAGTTTTCATAAGACTGGACCGTAAAATAGTAACCGTTGGTTATAACACTGTTAACTAGTTAGGTTTCTATTTCACTAGGACGACCTAGACAACTTAGTCTCAATCCTGAGTGGGTTATGGACTCTTGTTCATGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGCCAATACGCCGACTCAATAAGCCTATCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGCAGCTGGGAACATAATCACACAAGATGAAATTCACTCCTTCCCAACTTTAGGGAAACATATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGAGTCTTGAACAAATGGCCCTACCCTCTCATTGGCACGAGAGGGTTTTTGTTTAGTGGTTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTATAGGAGAACTGACATTTAAGGACATAGAAGTAACCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAGCTAGTGTTACGGACACTCATGAAGGACTAACTTGTTGTTATTGGTCTATATCCGTGGACACAGAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGGTCTATAGTAGAATGTACCCACACTTAACGAATAATGATTAATTTGGTTAATGATTTTAACCAATTAATCTCATATCGTTGGAACTTCTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCGTAAAGTAATTTGAGGCAACTAAGTCATAAATGTGAATTGAAGATGTTCAATTTACTAAGGGAAACAATATAATGTATGGTGATGAATTATGATAAATTATGAAAGAAATTATATTTGAAGAAGTTCAAATATTAATATGACTTTGATTCATATTAAATTTATAGGATATAAGAGAATTTGAAGGAGTTCAAATTTTAATATGAATTTGATTCATATTATAGAATTAATTAATTGAAGGTCAGAAATTAAATATATGATATTTAATTGGGTATTTAATTAATTAATTAATTAATTGAAGGCCCAAAATTAAATATATGATATTTATTTGGTGAATTATTAATTAAAGAATTAAATTAATTGGGTAATTAATCTATTATGGAAATGATTAATCAATTAAGGAAATAATTGATTATTTGTGAATATTATATTCATGTCATTTCTCCTATAAATAGAACACTAAACCTAAGGTTTCAATGACCAACACACATATTACACAAGACAAGATTGAAGGTTCATTCTTGTATTCTCTCAAGCCTCCCTCTTAGGAAAAGTCTCCCACCAGTCCATTGCCTCCTAGACCTAGAGTTATACCTGTGTAACCTTAGTGGTAGTGTGTTTTGGAGAAGAAACTTCAGGGTTGCTGCGTTTTTCATATTCCGAAGGAGAAAAGAGTTCGTGATCTTCCCAAGGAGTTGGTGAAAATCGTTCTAAGTCACAACGAAAGACCCTTGGGTTTTGAGACTATGTATCTCAAAACTTTTCAGTTTTTGATCCAGGATGTTTTTACACCTTTTACAATAGCTTTATGTATGATAAAAGTTGTGTTTTTTGCCTTTCGTATCGGTATCTTAATATTGATTAATATACGGTATGAGATCCTTTCGATACGCTTCCGTTGTGCTAAAGCTTTCATCCCTACAATGTGTATAATGGCAAGAGAAGATATATACACCTAAGACGTGGAGCTATGAAACGACTCTTGAAAACTGGAGCTATCTCCTTGGAGCATGTGAGGTCTGAGAGGAATTTAGCGGATCCTCTCACCAAAGGCCTGACAAGGAGAGTAATTCTAGAGTCCTCAACGTGTACGGGACTCAGACAAGTAAAATGAATCCATAGCCCTTTATTTGGGTGGTCCAGGTAAG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GTTTTAATAGAGCCCCGCGACACCGACGCGTCTACGCTGGTGAATGTAAATTTGCCTTGACGCATGGAGCCCGACAAGAAAGAGCACAGTCAGTGGCATTCATGCCATGCTTACGTGAGGACACGTGGCACGCATGTCAGGCGTTGGTTTTTTCAGTTATGCCAGATTAG

mRNA sequence

ATGTCAGATTGGGGATTTTCAGATGATTCTGTGCAGATCCCACGAATCTCGGTATTTTGTCGGAAAGCTCAGTTGCGGCCGCATCTTGGGTGCATTTTTCACAGTGTTCTGCTTCAACAATTCTATCTTCAGCATGGGGCTTCTTTCCTTATATGGCTTTGCGGGCGCAACTTCCTTTGGAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTGAAGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCTTATGGAGGTTAGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGGATGCCTCTTCTTGGTTGCTGCGTTTTTCATATTCCGAAGGAGAAAAGAGTTCGTGATCTTCCCAAGGAGTTGGTGAAAATCGTTCTAAGTCACAACGAAAGACCCTTGGGTTTTGAGACTATGTATCTCAAAACTTTTCAGTTTTTGATCCAGGATGTTTTTACACCTTTTACAATAGCTTTATGTATGATAAAAGTTGTGTTTTTTGCCTTTCGTATCGACTTGATGAAGCATGACGTGATTGTGAAGGTTAGTTTGAGGATGGCTAATCGAGCCTTGGAGCTTAGTTTCGACATCTCCATGACAGGTAGCGATAATCCTATCGTGCGCGCTCGGGACTCAGAATCGGCACCAAACGGATCAAGTTTTGAAGCAGCCAAATCTGAAGGACCCAAGAGGTGGCATCGAGACGCCATCTTCTGGGGTCTCAATGCCTCGGATTTGGAGACGCAAAAAAATCAGCGTCGGCGTCTCAACGTCGGCCACGGCGTATCGACACTGGCGGCAAGAGCCCCGCGACACCGACGCGTCTACGCTGGTGAATGTAAATTTGCCTTGACGCATGGAGCCCGACAAGAAAGAGCACAGTCAGTGGCATTCATGCCATGCTTACGTGAGGACACGTGGCACGCATGTCAGGCGTTGGTTTTTTCAGTTATGCCAGATTAG

Coding sequence (CDS)

ATGTCAGATTGGGGATTTTCAGATGATTCTGTGCAGATCCCACGAATCTCGGTATTTTGTCGGAAAGCTCAGTTGCGGCCGCATCTTGGGTGCATTTTTCACAGTGTTCTGCTTCAACAATTCTATCTTCAGCATGGGGCTTCTTTCCTTATATGGCTTTGCGGGCGCAACTTCCTTTGGAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTGAAGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCTTATGGAGGTTAGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGGATGCCTCTTCTTGGTTGCTGCGTTTTTCATATTCCGAAGGAGAAAAGAGTTCGTGATCTTCCCAAGGAGTTGGTGAAAATCGTTCTAAGTCACAACGAAAGACCCTTGGGTTTTGAGACTATGTATCTCAAAACTTTTCAGTTTTTGATCCAGGATGTTTTTACACCTTTTACAATAGCTTTATGTATGATAAAAGTTGTGTTTTTTGCCTTTCGTATCGACTTGATGAAGCATGACGTGATTGTGAAGGTTAGTTTGAGGATGGCTAATCGAGCCTTGGAGCTTAGTTTCGACATCTCCATGACAGGTAGCGATAATCCTATCGTGCGCGCTCGGGACTCAGAATCGGCACCAAACGGATCAAGTTTTGAAGCAGCCAAATCTGAAGGACCCAAGAGGTGGCATCGAGACGCCATCTTCTGGGGTCTCAATGCCTCGGATTTGGAGACGCAAAAAAATCAGCGTCGGCGTCTCAACGTCGGCCACGGCGTATCGACACTGGCGGCAAGAGCCCCGCGACACCGACGCGTCTACGCTGGTGAATGTAAATTTGCCTTGACGCATGGAGCCCGACAAGAAAGAGCACAGTCAGTGGCATTCATGCCATGCTTACGTGAGGACACGTGGCACGCATGTCAGGCGTTGGTTTTTTCAGTTATGCCAGATTAG

Protein sequence

MSDWGFSDDSVQIPRISVFCRKAQLRPHLGCIFHSVLLQQFYLQHGASFLIWLCGRNFLWNGLWDPQVMEFEEKSLKNKLMEVSLELARGPNGPTDHGLQRMPLLGCCVFHIPKEKRVRDLPKELVKIVLSHNERPLGFETMYLKTFQFLIQDVFTPFTIALCMIKVVFFAFRIDLMKHDVIVKVSLRMANRALELSFDISMTGSDNPIVRARDSESAPNGSSFEAAKSEGPKRWHRDAIFWGLNASDLETQKNQRRRLNVGHGVSTLAARAPRHRRVYAGECKFALTHGARQERAQSVAFMPCLREDTWHACQALVFSVMPD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 211..231

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg030964Spg030964gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22718457..22718629CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22718857..22718929CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22719528..22719583CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22720225..22720237CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22722947..22723154CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22723520..22723548CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22724146..22724203CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22724391..22724412CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22727112..22727283CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22728194..22728201CDS
Spg030964.1-cdsSpg030964.1-cds-scaffold10:22728467..22728626CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg030964.1Spg030964.1-proteinpolypeptide