Spg030964 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg030964
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 22718457 .. 22728626 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg030964
SyntenySpg030964
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGTCAGATTGGGGATTTTCAGATGATTCTGTGCAGATCCCACGAATCTCGGTATTTTGTCGGAAAGCTCAGTTGCGGCCGCATCTTGGGTGCATTTTTCACAGTGTTCTGCTTCAACAATTCTATCTTCAGCATGGGGCTTCTTTCCTTATATGGCTTTGCGGGCGCAACTTGTATGTTGATGATATTGAAAGTGTTAATATCTAAAATACGGAAGCAATTTTGGATCTTAGGCACATAATAAGCTCAATTTGATCAAAAATTGCATGTTGTTCATGAGATGAAAAACAGAGTTAGTTTACCAACCTCTTTTAAATGGAGAAATTGGTTGGATTCTCTTGTTGTTTTTCTTCACCAATCAATCACGAACCACCACTGGATCTTCCTTGCTATCCTCAAGCCTTTGGAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTGAAGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCTTATGGAGGTGAGTTTAGTGAGTAACAATTTTGGCAGCAATTCAGTAGGTTTCAAGCGATCTTCTTTCAGCTTTCTTCCTTCCTTTTATAGAGGGACCAACGAAGAAGAAAAGCCCCAGAATTTGACACCAATTCAGCTATGAAGAAAGTGGGAAATGGTGTGGCTTTCATGAGGGGAGTGCATGGGTTTAGTCACCATGCACTCCACCTCCAAAAAATCATAATTTTGAATTTTAATTAAATCAATAATTATCTTGATTTAATTAGATAATTATCTAATTTTTAATAATCTGAAAAATCAAAAATTAAATTTCAATTTTTCAATTTTAAATTAATTCAAAATTAATTTAAAATAATTAATAATTAATTTAATATCTAATATTAAATTAATATTTTGCCACCATTCCCGAACATTTCCGAAATTTTATTTTTCAATCATCAATCCATGTTCATGTTCTTGATATTTAAATCATATTTAAATATTAAATATCATACAAACCCGGTTTTCACAAAACCCGATGTATCGACAACGTCAATCACCTCTATCCATTTCCCTAAACATGAATATAAAGTCATTCATATTTTATCCATCATATTGTTCCAAAGGTTAGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGGTACGAGGTTTAACCGGTTAAACCCTTTTAATCTAGCTAACCAACATCCGTTAACTACCGGGACACTCCACTATAGCCTAGTAGTTGAACTCCCCTCACTGTAGATATATTTCTGTCCATTCGATATAACCATGATTAGTAAGTCAATCCTTCACAGATCGTTCGTTACTATAGCTAGGTCAAATGTCCATTTTACCCCTATAGCACATCTTAGTTCCTTAATTCCACTGGTCCTCTAATGAACAATTTGTTTATGGTCCAACCACTAAATAAAGTCCCTCTCGAGCCAATGAGAGGGTGGGGCCCCTTGTTCAAGCCTTGGATTTAGCATTTAAGGGAACAACCTCTCTACTGTCCCTGAATAGGGTAGGAGTGAATTCTATCTTGCTTTACTATGTCCACAGCTATCCATTTAGTCTTACCCCCAAAATGGTAGGATTATTGAATGGCTCTTTTGGACTACTCTCACCCATGCATATCAAAGGATAATCCTAAATGAACAGGAGTTCATAGCAAGCTCAGAATTAAGATCGAGTTACCTAGGTCATCGCATGAAATAGTCAGTCTTAACAGTAAAAGGCGTTATAAAGTAAGTGTGACTTATTTCTCAGTCCTGTCTTGTGTAAACATCTTTTACACAGGATGCCTCTTCTTGTATGTCTCTACATGAATGATCCAGGATCACGTCATTTTCCTTATTTGCAAAGTAGGCCGCATACATAGTGTTACCAGGATAAGGTACCCAGTCTTATCCATTTACTATAGACCATTTAGGTTATATAATCAAACTTGATCCCTGCCTATATCCACGATATAGTTCGAGTATTTAATATTATAACCCTGGATGTTTCTATTGGATTTAAGATATAAATAAACAATTTCACTGAATAACATCTTTATTATAAAAAGGATAACAAAACTTGAGTTCTAGGACATAAACCCCAACAGATATGTTTATTTTCGGTACGAATTTAGGAGTAATTAATGATACCAAGTTATTCTTGTCCTCACACTTTGGGATGAGAGATTTAGGTGAGGCTGATACTTGATGTTAAATTAACGAAAACCAAAAATGGGTATTCATTGAGTCAATCACACTACGTTGAAAAGATTCTAAAGAGATTTGATTGTTTTGATGATATACCTGTAAGAACACCTTATGATACTAGTATAAAACTTAAGAAAAATAAAGGGATAGTGTCTTTCAATTAGAATATGCAAAAATTATAGGTAGTGTTATGTACCTGATAAATTATACTAGACCTGATATTGCATATGTCGTGAGTAGATTGAATATGTATACACATAATCCTAATAAAGATAATTGGATTGCTCTTCATCTTTTATTAAGGTACCTTAAGGGTACAATAGATTAATGTTTGTGCTTTAACAAATTTTCTGCAGTATTAGAATGTTAATGTGATGAAAACTGGGTAACCGATAACGATGAAGTAAGCTCAACCAGCAGTTTTGTGTTCATCTTTGGTGGAGGAGTTATTTCATGGAAATCAATAAAGCAGATGTGCATTGCGCGATCCACCATGGAGTCTGAGTTTATAACTCTCGAACTTGCAGGGCAAGAGGCGGAATGGTTAAGAAGTTTACTTCGAGACGTACCACTGTGGGGGGCGTCAGTGCTAGTCTCCTTACACTGTGACTCACAAGTAGTCATAGGAATTTTCAAAAGCAATGTGTGTTGGGTTTTATGCTCTAAAACTCGTAGATAGTAAATGTAACGATTAACCGAATATTAATGAAATAATATTGATGTATTATTCAATTGAGTGTTATTAGTTATATTATGTTTGTCTTTTCCTAAATAACCCTAATCCAATAAACTAGACATCCTAGGTTGTAGTATGAGTCTTGAACTGTATGTGGAGACATATGGGGATCACTGTTCAAGATACAGCCTAAAGGCTCTATAGTATAAGGATAAGATTGGGTGCCTTATCCTGGTGACACTATGGATACGACCCACTTTGTATTTGATAAAAACGCCATGATCCAACATGTTTGTGTAGGAGACATGCAAGTGGGGCTATCCTATGCAATCAGTTTTCATAAGACTGGACCGTAAAATAGTAACCGTTGGTTATAACACTGTTAACTAGTTAGGTTTCTATTTCACTAGGACGACCTAGACAACTTAGTCTCAATCCTGAGTGGGTTATGGACTCTTGTTCATGAGGGATTGTCCTTTGATTTGTATGGGTGAGAGTGGCCAATACGCCGACTCAATAAGCCTATCATTTTGGGGACAAGACCGAGTGGGCAGCTGGGAACATAATCACACAAGATGAAATTCACTCCTTCCCAACTTTAGGGAAACATATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTGTCTCCGAGTCTTGAACAAATGGCCCTACCCTCTCATTGGCACGAGAGGGTTTTTGTTTAGTGGTTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTATAGGAGAACTGACATTTAAGGACATAGAAGTAACCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAGCTAGTGTTACGGACACTCATGAAGGACTAACTTGTTGTTATTGGTCTATATCCGTGGACACAGAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTGTGGGTCTATAGTAGAATGTACCCACACTTAACGAATAATGATTAATTTGGTTAATGATTTTAACCAATTAATCTCATATCGTTGGAACTTCTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCGTAAAGTAATTTGAGGCAACTAAGTCATAAATGTGAATTGAAGATGTTCAATTTACTAAGGGAAACAATATAATGTATGGTGATGAATTATGATAAATTATGAAAGAAATTATATTTGAAGAAGTTCAAATATTAATATGACTTTGATTCATATTAAATTTATAGGATATAAGAGAATTTGAAGGAGTTCAAATTTTAATATGAATTTGATTCATATTATAGAATTAATTAATTGAAGGTCAGAAATTAAATATATGATATTTAATTGGGTATTTAATTAATTAATTAATTAATTGAAGGCCCAAAATTAAATATATGATATTTATTTGGTGAATTATTAATTAAAGAATTAAATTAATTGGGTAATTAATCTATTATGGAAATGATTAATCAATTAAGGAAATAATTGATTATTTGTGAATATTATATTCATGTCATTTCTCCTATAAATAGAACACTAAACCTAAGGTTTCAATGACCAACACACATATTACACAAGACAAGATTGAAGGTTCATTCTTGTATTCTCTCAAGCCTCCCTCTTAGGAAAAGTCTCCCACCAGTCCATTGCCTCCTAGACCTAGAGTTATACCTGTGTAACCTTAGTGGTAGTGTGTTTTGGAGAAGAAACTTCAGGGTTGCTGCGTTTTTCATATTCCGAAGGAGAAAAGAGTTCGTGATCTTCCCAAGGAGTTGGTGAAAATCGTTCTAAGTCACAACGAAAGACCCTTGGGTTTTGAGACTATGTATCTCAAAACTTTTCAGTTTTTGATCCAGGATGTTTTTACACCTTTTACAATAGCTTTATGTATGATAAAAGTTGTGTTTTTTGCCTTTCGTATCGGTATCTTAATATTGATTAATATACGGTATGAGATCCTTTCGATACGCTTCCGTTGTGCTAAAGCTTTCATCCCTACAATGTGTATAATGGCAAGAGAAGATATATACACCTAAGACGTGGAGCTATGAAACGACTCTTGAAAACTGGAGCTATCTCCTTGGAGCATGTGAGGTCTGAGAGGAATTTAGCGGATCCTCTCACCAAAGGCCTGACAAGGAGAGTAATTCTAGAGTCCTCAACGTGTACGGGACTCAGACAAGTAAAATGAATCCATAGCCCTTTATTTGGGTGGTCCAGGTAAG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mRNA sequence

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Coding sequence (CDS)

ATGTCAGATTGGGGATTTTCAGATGATTCTGTGCAGATCCCACGAATCTCGGTATTTTGTCGGAAAGCTCAGTTGCGGCCGCATCTTGGGTGCATTTTTCACAGTGTTCTGCTTCAACAATTCTATCTTCAGCATGGGGCTTCTTTCCTTATATGGCTTTGCGGGCGCAACTTCCTTTGGAACGGATTGTGGGATCCTCAAGTGATGGAATTTGAAGAGAAAAGCTTGAAGAACAAGCTTATGGAGGTTAGTCTCGAGCTAGCAAGGGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGGCTCCAACGGATGCCTCTTCTTGGTTGCTGCGTTTTTCATATTCCGAAGGAGAAAAGAGTTCGTGATCTTCCCAAGGAGTTGGTGAAAATCGTTCTAAGTCACAACGAAAGACCCTTGGGTTTTGAGACTATGTATCTCAAAACTTTTCAGTTTTTGATCCAGGATGTTTTTACACCTTTTACAATAGCTTTATGTATGATAAAAGTTGTGTTTTTTGCCTTTCGTATCGACTTGATGAAGCATGACGTGATTGTGAAGGTTAGTTTGAGGATGGCTAATCGAGCCTTGGAGCTTAGTTTCGACATCTCCATGACAGGTAGCGATAATCCTATCGTGCGCGCTCGGGACTCAGAATCGGCACCAAACGGATCAAGTTTTGAAGCAGCCAAATCTGAAGGACCCAAGAGGTGGCATCGAGACGCCATCTTCTGGGGTCTCAATGCCTCGGATTTGGAGACGCAAAAAAATCAGCGTCGGCGTCTCAACGTCGGCCACGGCGTATCGACACTGGCGGCAAGAGCCCCGCGACACCGACGCGTCTACGCTGGTGAATGTAAATTTGCCTTGACGCATGGAGCCCGACAAGAAAGAGCACAGTCAGTGGCATTCATGCCATGCTTACGTGAGGACACGTGGCACGCATGTCAGGCGTTGGTTTTTTCAGTTATGCCAGATTAG

Protein sequence

MSDWGFSDDSVQIPRISVFCRKAQLRPHLGCIFHSVLLQQFYLQHGASFLIWLCGRNFLWNGLWDPQVMEFEEKSLKNKLMEVSLELARGPNGPTDHGLQRMPLLGCCVFHIPKEKRVRDLPKELVKIVLSHNERPLGFETMYLKTFQFLIQDVFTPFTIALCMIKVVFFAFRIDLMKHDVIVKVSLRMANRALELSFDISMTGSDNPIVRARDSESAPNGSSFEAAKSEGPKRWHRDAIFWGLNASDLETQKNQRRRLNVGHGVSTLAARAPRHRRVYAGECKFALTHGARQERAQSVAFMPCLREDTWHACQALVFSVMPD
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 211..231

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg030964.1Spg030964.1mRNA