Spg028277.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028277.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold8: 27717999 .. 27723820 (+)
Sequence length645
RNA-Seq ExpressionSpg028277.1
SyntenySpg028277.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGTCAAGCGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCAAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGAATCCTTGGATTCGAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATACGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTACAAGAACCCAAAATGGTTACAAACTTTAGAGTATGTTAATTGGAAGATAAATCTCGGATTTAAGGAATTATTATGGTGAAAAGTTACATCCTTTCAAGATTCACAAAGGCACCTATTCAACCAAGAGACACAATGAACCTAGAAATTCATATTCATTCACATATTTAATGTATTATGTATCTTGTGAATTCATGAACTTGTATTTATGAAGGTTCATGCATTGATTTGAAAAGTTAGGGGTTGAATTTAGACCACATAGATGAAGGGTTGTATCCTTTCATGGTGTCTTTCCATTTAGTATAAATAGGGATGTAATTTGTCATTTGAAAAGAAGTTGAAGATTATGCATATTAAAAAGCTTTTGCTTATTCAACCCCTTTGGTGTTATCTTTTCTTTCAAATCTTGTTTAGGTTTGATGTTCAACCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTGAGTCGTCTTAGGATCTTTGAGTGACCATCATAGATTCTAAGTTTGATCTAAGAGTGATTCATCTTCTAACTAAACTCTTGGTTGGAATCATTTGGTAAGTTTGTCTTATTTGTGTCCGTTTACAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAACTTAAGCATATTGGGTGCTTATCCTTTGGTATCAGAGCCTTGGTCAACATCCTTTGGCCGACTCTAGAGGTGAAATATCTTTACTTTTTGTCATTTTTTTTTTCGAATTTGTATTCTCTTGTCTTGCTCTCGGATTATCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAATCATTAGCAAAAGAAAAAGAAATCGAGATGCTTATTGACAAGCAAGATTCAAAGCTTGCTTCAAATATGAGACAAAGTCGTGCACGAGAGAACTGTAGTACAAAAGGGCAACAAATGAAGCGACATTGGTATTTTGCTTCATCATTCATTCAAGGACGATGGTCAAGAGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCGAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGGATCCTTGGATTCAAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATATGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTCCAAGAACCCAAGATGATTACAAGCTTTAGAGGTTGCTAATTGGAATATGAAATAAGTGATCAATCAGCTCAATCCAATTATTATGGTGAGAAGTTGCATCATTTCAAGATTCACAAAGGCACCTATTCAACCAAGAGACACAACGACTCTAGAAATTCATATTCATTCACATATTTAATGTATTATGTATCTTGTGAATTCATGAACTTGTATTTATGAAGGTTCATGCATGGATTTGAAAAGTTAGGGGTTGAATTGAAGGGTTGTGTCCTTTCATGGTGTCTTTTCATTTAGTATAAATAGGGATGTAATTTGTCATTTGAAAACAAGTTGAAGATTATGAATATTAATAAGCTTTTGCTTATTCAACCCTTTTGGTGTTGTCTTTTCTTTCAAATCTTGTTTTAGGTTTGATGTTCAATCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTGAGTCGTCTTAGGATCTTTGAGTGACCATCATAGATTCTAAGTTTGACCTAAGAGTGATTCATCTTCTAACTAAACTCTTGGTTGGAATCATTCGGTAAGTTAGTCTTATTTGTGTCCGTTTACAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAACTCAAGCATATTGGGCGCTTATCAACTTATTTCTTGGTTCGGTCTTGTGCAAACTCATTGCACAGGATGCCCCTACTCGCATGTCTATACATGAATGATCCAGGATCACATCGTTTGCCTTATGTGCAAAGTAGGCCGCATCCATAGTGTTCCCAGGATAAGGTACCCAACCTTATCCCTATACTATAGACCATTTTGGTTATATACTAGAACTTGATCATAAAACCCAACAAAACGAGAAATTACATACTTGTGTATGGAGCTAAGGATTTGATCCTTATTGGATACACTGAATCTGATTTTCAAACTGATATATAATGATTCGAGGAAATTCACATCGGGACCAATATTCACTTTATGTGGAGGAGCTATAGTATGGAGGAGTATCAAAGAAAGATGTGTTGTAGACTCCACCATGGAAGCAGAATACGTAGTTGCTTGTGTAGCAACAAATGAAGTTTTTAAATGATTTGGAAGTGGTTCCAAACATGGACAAGCCTATCACTCTTTATTGTGATTGAAGGAGTGCACGACAAGCTAGCGGAAGCGATTTGGATTGAAAACATCTCAATTTCATTAATTTTATAAATTAAAAGCATGTCAAAAACAAAGAAAAAACAGAGACAGAATTGAACTGAACTTTTGGATGCAAATTGGATCACTTTGTTAGATGTTTCTTGTCATGATCAAGCCTTGGACTACCACGAGAGTCTTCCCCGCTATCCTTCGGCCTTAGAACGACTTGTGGGAGCCAATTGTGTGATCAATTTGGAAGGGAAAAGTGAGAAAATGATAGTTTGAACCTATGGTTTTTGAGAGAACATTCTAGCTTCGTGAAGAACAATTCTACAACAAATATGACCAAGATCCAACCCCAAACAATGTCTTCTTAGCATCATATATATGTGAAATCTAATGACTCCACATTGAGCAAGATGAAGACATAAGAGGTTATGTGAGAGTCATTAGGATAGGTGTCTTGAAGTCACAATTAACCTCTTAGGCTTTAATTTTAATCAAAATTAAAATTAAAACTAATTTTCTAAATTAATTTTAAATAAAAGTAATTTTATATAAAATTAATTTAAAATAAATAATTAATTAATCAAACCATTTAATTAATTATTTTAATTTAATATCAAATATTAATTTATTCTTTTGCACCAATCCCAATCTCTCTCAGTCCCGGTTTTTAATATGAATCCCTATTCATATTCAAACCTAAATATGTATCGTATACAAATCAACGATATTTAAATAATATTTAAATATCTCCAACTCTCCCTATAGTTTAATTCACAATTAAATTATGATACGTTAAGTATATCACATATAATTAACGTCAAATCCCTAAAACAAATTTAAACGCTTCAAATTCTTTCATCACATTGTTCTAAGATTTATTCCGTATGAGCTAGTAGGGGGACCTAATGGACCTACAGATCTGAAGGGGATGAAAGCCCCTACGCAGCGGAAGCACATCGATTGGACCTTACGCCGTATATTAATTAACAATAAAATACCGTTACGAAAAGGCAAAATAAACTTTAAACATGCTTTAAAGTTGCTGGAAATTGCTATAAACATGCTTGAAAATTAAATCTAAATTTATTTTCATGCTTTTCTAAAGAAACGGGAAAGAACCGTTACAAACCTTCATTGTAGACTTGACCGTTCTTCGCCAACGATGCTTCAACGAACAAAAACGCAGCAGCCTTGTTGTAGTTTATTCGCGGGAAATTTCTTCTTGAAAGACACAATAACCACAGAGGTTACACCGGTATGTCTCTAAGTCTAGGAGGCAAAAGACTTGTGGGAGTCTTTCTCTAAGAGGGAGGCTAGAGAGAATTCTAGGGTCTTGTCTTGTGAGTCTAAGAGCAAGAGGGCTACCAAACCAATTAGGTCTAGTGTTCTATTTATAGAAGAGTGACCATGAATAAAATATTCAATTAAATCAATCTTTTCCAAAATTGATTCAATCTTATTCCTTATTTAATCAATCCAAGATCAATCAATTCCATAATTGATTAATCTTTTCCACAAATGACTAATTACTTCCATAAGTGATTAGATCATTTCCATAAATGATTAATCACTTCCTTAAGTGATTAATTATTTCGATAAATGATTAATTTCCAGTTAATGAATTCTTTAATTAATTAACCACCAATTAAATATCACATATTTAATTTCCGGCCTTGAATTAATTAATTTGCCCAAATAGATTTTAGGCCTTAAAATTAATTCATTATTTGAACTCTTTCAAACTTCCATAAATTTAATGTGACTCAAATTTATATATTAATATTTGAATTTCTTCAAATATTAATTTCTCTTATAATAATATTTCAATATACATTATATTGTTTCCCTTAGTAAATTGAACACTTTTAATTTACATTTATTACTTTATGAGCTACCAGTGGGACCTAATGGACCTGCAGATCAGAAACTCCAACGATGTGAGATTAATTGGTCAAACTCATTAACCAAATTAATCAATATTCGTTAACTGTGTGTACATTCCACTATAGACTCACAGTTGCACTCTTCTCACTGCAGACATATTTTCTGTGTCCACGAATATAGACCAATAACGGCTAGTTAGTCCTTCACGAGTGTCCGTAACATTAGCTGGGTCTACCCCTTGGGTTACTTCTATTTCCTTAAGTACCAGTTCTCCTTTAATGAACAACCTGTTTGTGGTCCAACCATCAAACAGAAAACCCTCTCGTGCCATTGAGAGGGTAGGGCCCTTTGTTCAAGACTCGGAGTCACCACTTAAGGGAACACTCATCTGCTTCCCCAAAGTCGGGAAGGAGTAAATTCCATCTTGAACGATTATGTTCCCAGCTCCCCACTCGGTCTTGTCCCCAAAATGGTAGGCTTATTGAGTAGGCTTATTGGCCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAAATCCCTCATGAGCAGGAGTCCATAATCAACTCAGGATTAAGACCAAGTTGTCTAGGTCGTCCTAGTGAAATCGAAAACCAACTAGTTAATGGTGTTATAACAAGTGGTTACTATTTCGGGGTCCGGCCTTATGCAAACTCATTGCATAAGATAGCCCCACTCGCATGTCTCCTATATGAACGCGTTGGATCATAGTGTTTGTATCAAATACAAAGTGGGCCGTATCCATAGTGTCACCAGGATAAGGCACCCAGTCTTATCCCTATACTATAGACCCTTTAGGCTTTTTCTTGAACAGTGATCCCCATATGTCGCTACATATAGTTCAAGACTCATATTACAGCCTAGGATGTCTAGTTTATTGGATTGGGGTTATTTTAGGCAAAGACAAATATAAAATAATTAATAACATTTAATGGAAAAATATATCAATATTATTTCATTAATATCCGGTCAACGGTTACATTCACTATCTATGAGTTTTAGGGCAAAAAACCCAACAAGATCATGAACTCCAACGATCCGAGATTATTCGGTTAAACTCATTAACCTAGTTAATCAACATTCATTAACTATCGGAACACACCACTATAGCCCAGTAGTTGCACTCCCCTCACTGTAGATATATTTTTGTCCACCTGATATAACCATGATTAGTAAGTCGATCCTTCACAGGTTGTTCGTAACTACAGCTGGATCAAATGTTCGTTTTACCCCTGAAGTTACCTCTTGTTCCTTAAGTCCCACTGATTCTCTAATGAACAATTGGCTTGTGGTTCAACCAACAAACTGAGTCCCTCTCGAGTCAATGAGAGAGTGAGATTCCTTTGTTCAAACCCCCGAGTCAGCACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAATAACGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTAGAACTATGTCCCCAGCTATCTACCAGGTCTCATCCCCAAAATGGTAGGCTTACTGAGTCGGCGAACTCGGGTCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAATCCTGAATAA

mRNA sequence

ATGGTCAAGCGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCAAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGAATCCTTGGATTCGAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATACGAACCGAGGTTTGATGTTCAACCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGACGATGGTCAAGAGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCGAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGGATCCTTGGATTCAAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATATGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTCCAAGAACCCAAGATGATTACAAGCTTTAGAGGTTTGATGTTCAATCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTTGTTCGTAACTACAGCTGGATCAAATGTTCGTTTTACCCCTGAAGTTACCTCTTCACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAATAACGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTAGAACTATGTCCCCAGCTATCTACCAGGTCTCATCCCCAAAATGGTAGGCTTACTGAGTCGGCGAACTCGGGTCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAATCCTGAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTCAAGCGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCAAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGAATCCTTGGATTCGAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATACGAACCGAGGTTTGATGTTCAACCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGACGATGGTCAAGAGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCGAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGGATCCTTGGATTCAAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATATGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTCCAAGAACCCAAGATGATTACAAGCTTTAGAGGTTTGATGTTCAATCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTTGTTCGTAACTACAGCTGGATCAAATGTTCGTTTTACCCCTGAAGTTACCTCTTCACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAATAACGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTAGAACTATGTCCCCAGCTATCTACCAGGTCTCATCCCCAAAATGGTAGGCTTACTGAGTCGGCGAACTCGGGTCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAATCCTGAATAA

Protein sequence

MVKREELKESKSARCKRFQVCTTRESLDSRTNPLEEGEDDTNRGLMFNRFIGLVLINLILETMVKSEELKESKSARCKRFQVCTTRGSLDSRTNPLEEGEDDMNRGVLIKLQEPKMITSFRGLMFNRFIGLVLINLILELFVTTAGSNVRFTPEVTSSLKGTTSLLSLITGRSEFHLVELCPQLSTRSHPQNGRLTESANSGHSHPYKSKDNPE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 186..214
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 186..206

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg028277Spg028277gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg028277.1-cdsSpg028277.1-cds-scaffold8:27717999..27718128CDS
Spg028277.1-cdsSpg028277.1-cds-scaffold8:27718557..27718608CDS
Spg028277.1-cdsSpg028277.1-cds-scaffold8:27719094..27719275CDS
Spg028277.1-cdsSpg028277.1-cds-scaffold8:27719653..27719704CDS
Spg028277.1-cdsSpg028277.1-cds-scaffold8:27723475..27723530CDS
Spg028277.1-cdsSpg028277.1-cds-scaffold8:27723648..27723820CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg028277.1Spg028277.1-proteinpolypeptide