Spg028277 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028277
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold8: 27717999 .. 27723820 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg028277
SyntenySpg028277
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGGTCAAGCGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCAAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGAATCCTTGGATTCGAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATACGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTACAAGAACCCAAAATGGTTACAAACTTTAGAGTATGTTAATTGGAAGATAAATCTCGGATTTAAGGAATTATTATGGTGAAAAGTTACATCCTTTCAAGATTCACAAAGGCACCTATTCAACCAAGAGACACAATGAACCTAGAAATTCATATTCATTCACATATTTAATGTATTATGTATCTTGTGAATTCATGAACTTGTATTTATGAAGGTTCATGCATTGATTTGAAAAGTTAGGGGTTGAATTTAGACCACATAGATGAAGGGTTGTATCCTTTCATGGTGTCTTTCCATTTAGTATAAATAGGGATGTAATTTGTCATTTGAAAAGAAGTTGAAGATTATGCATATTAAAAAGCTTTTGCTTATTCAACCCCTTTGGTGTTATCTTTTCTTTCAAATCTTGTTTAGGTTTGATGTTCAACCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTGAGTCGTCTTAGGATCTTTGAGTGACCATCATAGATTCTAAGTTTGATCTAAGAGTGATTCATCTTCTAACTAAACTCTTGGTTGGAATCATTTGGTAAGTTTGTCTTATTTGTGTCCGTTTACAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAACTTAAGCATATTGGGTGCTTATCCTTTGGTATCAGAGCCTTGGTCAACATCCTTTGGCCGACTCTAGAGGTGAAATATCTTTACTTTTTGTCATTTTTTTTTTCGAATTTGTATTCTCTTGTCTTGCTCTCGGATTATCAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAAAGAAAAAAAATCATTAGCAAAAGAAAAAGAAATCGAGATGCTTATTGACAAGCAAGATTCAAAGCTTGCTTCAAATATGAGACAAAGTCGTGCACGAGAGAACTGTAGTACAAAAGGGCAACAAATGAAGCGACATTGGTATTTTGCTTCATCATTCATTCAAGGACGATGGTCAAGAGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCGAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGGATCCTTGGATTCAAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATATGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTCCAAGAACCCAAGATGATTACAAGCTTTAGAGGTTGCTAATTGGAATATGAAATAAGTGATCAATCAGCTCAATCCAATTATTATGGTGAGAAGTTGCATCATTTCAAGATTCACAAAGGCACCTATTCAACCAAGAGACACAACGACTCTAGAAATTCATATTCATTCACATATTTAATGTATTATGTATCTTGTGAATTCATGAACTTGTATTTATGAAGGTTCATGCATGGATTTGAAAAGTTAGGGGTTGAATTGAAGGGTTGTGTCCTTTCATGGTGTCTTTTCATTTAGTATAAATAGGGATGTAATTTGTCATTTGAAAACAAGTTGAAGATTATGAATATTAATAAGCTTTTGCTTATTCAACCCTTTTGGTGTTGTCTTTTCTTTCAAATCTTGTTTTAGGTTTGATGTTCAATCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTGAGTCGTCTTAGGATCTTTGAGTGACCATCATAGATTCTAAGTTTGACCTAAGAGTGATTCATCTTCTAACTAAACTCTTGGTTGGAATCATTCGGTAAGTTAGTCTTATTTGTGTCCGTTTACAAGGATCCTAGAAGGACCTCTAGCTTTGTAAACTCAAGCATATTGGGCGCTTATCAACTTATTTCTTGGTTCGGTCTTGTGCAAACTCATTGCACAGGATGCCCCTACTCGCATGTCTATACATGAATGATCCAGGATCACATCGTTTGCCTTATGTGCAAAGTAGGCCGCATCCATAGTGTTCCCAGGATAAGGTACCCAACCTTATCCCTATACTATAGACCATTTTGGTTATATACTAGAACTTGATCATAAAACCCAACAAAACGAGAAATTACATACTTGTGTATGGAGCTAAGGATTTGATCCTTATTGGATACACTGAATCTGATTTTCAAACTGATATATAATGATTCGAGGAAATTCACATCGGGACCAATATTCACTTTATGTGGAGGAGCTATAGTATGGAGGAGTATCAAAGAAAGATGTGTTGTAGACTCCACCATGGAAGCAGAATACGTAGTTGCTTGTGTAGCAACAAATGAAGTTTTTAAATGATTTGGAAGTGGTTCCAAACATGGACAAGCCTATCACTCTTTATTGTGATTGAAGGAGTGCACGACAAGCTAGCGGAAGCGATTTGGATTGAAAACATCTCAATTTCATTAATTTTATAAATTAAAAGCATGTCAAAAACAAAGAAAAAACAGAGACAGAATTGAACTGAACTTTTGGATGCAAATTGGATCACTTTGTTAGATGTTTCTTGTCATGATCAAGCCTTGGACTACCACGAGAGTCTTCCCCGCTATCCTTCGGCCTTAGAACGACTTGTGGGAGCCAATTGTGTGATCAATTTGGAAGGGAAAAGTGAGAAAATGATAGTTTGAACCTATGGTTTTTGAGAGAACATTCTAGCTTCGTGAAGAACAATTCTACAACAAATATGACCAAGATCCAACCCCAAACAATGTCTTCTTAGCATCATATATATGTGAAATCTAATGACTCCACATTGAGCAAGATGAAGACATAAGAGGTTATGTGAGAGTCATTAGGATAGGTGTCTTGAAGTCACAATTAACCTCTTAGGCTTTAATTTTAATCAAAATTAAAATTAAAACTAATTTTCTAAATTAATTTTAAATAAAAGTAATTTTATATAAAATTAATTTAAAATAAATAATTAATTAATCAAACCATTTAATTAATTATTTTAATTTAATATCAAATATTAATTTATTCTTTTGCACCAATCCCAATCTCTCTCAGTCCCGGTTTTTAATATGAATCCCTATTCATATTCAAACCTAAATATGTATCGTATACAAATCAACGATATTTAAATAATATTTAAATATCTCCAACTCTCCCTATAGTTTAATTCACAATTAAATTATGATACGTTAAGTATATCACATATAATTAACGTCAAATCCCTAAAACAAATTTAAACGCTTCAAATTCTTTCATCACATTGTTCTAAGATTTATTCCGTATGAGCTAGTAGGGGGACCTAATGGACCTACAGATCTGAAGGGGATGAAAGCCCCTACGCAGCGGAAGCACATCGATTGGACCTTACGCCGTATATTAATTAACAATAAAATACCGTTACGAAAAGGCAAAATAAACTTTAAACATGCTTTAAAGTTGCTGGAAATTGCTATAAACATGCTTGAAAATTAAATCTAAATTTATTTTCATGCTTTTCTAAAGAAACGGGAAAGAACCGTTACAAACCTTCATTGTAGACTTGACCGTTCTTCGCCAACGATGCTTCAACGAACAAAAACGCAGCAGCCTTGTTGTAGTTTATTCGCGGGAAATTTCTTCTTGAAAGACACAATAACCACAGAGGTTACACCGGTATGTCTCTAAGTCTAGGAGGCAAAAGACTTGTGGGAGTCTTTCTCTAAGAGGGAGGCTAGAGAGAATTCTAGGGTCTTGTCTTGTGAGTCTAAGAGCAAGAGGGCTACCAAACCAATTAGGTCTAGTGTTCTATTTATAGAAGAGTGACCATGAATAAAATATTCAATTAAATCAATCTTTTCCAAAATTGATTCAATCTTATTCCTTATTTAATCAATCCAAGATCAATCAATTCCATAATTGATTAATCTTTTCCACAAATGACTAATTACTTCCATAAGTGATTAGATCATTTCCATAAATGATTAATCACTTCCTTAAGTGATTAATTATTTCGATAAATGATTAATTTCCAGTTAATGAATTCTTTAATTAATTAACCACCAATTAAATATCACATATTTAATTTCCGGCCTTGAATTAATTAATTTGCCCAAATAGATTTTAGGCCTTAAAATTAATTCATTATTTGAACTCTTTCAAACTTCCATAAATTTAATGTGACTCAAATTTATATATTAATATTTGAATTTCTTCAAATATTAATTTCTCTTATAATAATATTTCAATATACATTATATTGTTTCCCTTAGTAAATTGAACACTTTTAATTTACATTTATTACTTTATGAGCTACCAGTGGGACCTAATGGACCTGCAGATCAGAAACTCCAACGATGTGAGATTAATTGGTCAAACTCATTAACCAAATTAATCAATATTCGTTAACTGTGTGTACATTCCACTATAGACTCACAGTTGCACTCTTCTCACTGCAGACATATTTTCTGTGTCCACGAATATAGACCAATAACGGCTAGTTAGTCCTTCACGAGTGTCCGTAACATTAGCTGGGTCTACCCCTTGGGTTACTTCTATTTCCTTAAGTACCAGTTCTCCTTTAATGAACAACCTGTTTGTGGTCCAACCATCAAACAGAAAACCCTCTCGTGCCATTGAGAGGGTAGGGCCCTTTGTTCAAGACTCGGAGTCACCACTTAAGGGAACACTCATCTGCTTCCCCAAAGTCGGGAAGGAGTAAATTCCATCTTGAACGATTATGTTCCCAGCTCCCCACTCGGTCTTGTCCCCAAAATGGTAGGCTTATTGAGTAGGCTTATTGGCCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAAATCCCTCATGAGCAGGAGTCCATAATCAACTCAGGATTAAGACCAAGTTGTCTAGGTCGTCCTAGTGAAATCGAAAACCAACTAGTTAATGGTGTTATAACAAGTGGTTACTATTTCGGGGTCCGGCCTTATGCAAACTCATTGCATAAGATAGCCCCACTCGCATGTCTCCTATATGAACGCGTTGGATCATAGTGTT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mRNA sequence

ATGGTCAAGCGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCAAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGAATCCTTGGATTCGAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATACGAACCGAGGTTTGATGTTCAACCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGACGATGGTCAAGAGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCGAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGGATCCTTGGATTCAAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATATGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTCCAAGAACCCAAGATGATTACAAGCTTTAGAGGTTTGATGTTCAATCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTTGTTCGTAACTACAGCTGGATCAAATGTTCGTTTTACCCCTGAAGTTACCTCTTCACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAATAACGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTAGAACTATGTCCCCAGCTATCTACCAGGTCTCATCCCCAAAATGGTAGGCTTACTGAGTCGGCGAACTCGGGTCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAATCCTGAATAA

Coding sequence (CDS)

ATGGTCAAGCGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCAAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGAATCCTTGGATTCGAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATACGAACCGAGGTTTGATGTTCAACCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGACGATGGTCAAGAGTGAAGAACTTAAGGAGAGCAAGAGTGCGAGATGCAAAAGATTTCAAGTTTGCACTACAAGGGGATCCTTGGATTCAAGGACGAATCCTCTTGAAGAAGGGGAGGATGATATGAACCGAGGTGTCTTAATCAAGCTCCAAGAACCCAAGATGATTACAAGCTTTAGAGGTTTGATGTTCAATCGATTCATTGGATTAGTTTTGATCAATCTAATTCTGGAGTTGTTCGTAACTACAGCTGGATCAAATGTTCGTTTTACCCCTGAAGTTACCTCTTCACTTAAGGGAACAACCTCTCTACTATCCCTAATAACGGGTAGGAGTGAATTCCATCTTGTAGAACTATGTCCCCAGCTATCTACCAGGTCTCATCCCCAAAATGGTAGGCTTACTGAGTCGGCGAACTCGGGTCACTCTCACCCATACAAATCAAAGGACAATCCTGAATAA

Protein sequence

MVKREELKESKSARCKRFQVCTTRESLDSRTNPLEEGEDDTNRGLMFNRFIGLVLINLILETMVKSEELKESKSARCKRFQVCTTRGSLDSRTNPLEEGEDDMNRGVLIKLQEPKMITSFRGLMFNRFIGLVLINLILELFVTTAGSNVRFTPEVTSSLKGTTSLLSLITGRSEFHLVELCPQLSTRSHPQNGRLTESANSGHSHPYKSKDNPE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 186..214
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 186..206

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg028277.1Spg028277.1mRNA