Spg018220.1 (mRNA) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg018220.1
TypemRNA
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold3: 7147345 .. 7152361 (+)
Sequence length834
RNA-Seq ExpressionSpg018220.1
SyntenySpg018220.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGCTGTTGCGCAGTAGGTACAACCTTTGTCGTATCATATGGTCTGAGATCCTAACCTGCGATCACAAGAATGTGGGGAGGCTCTTCTTCCCAACCTTGATCACGAAGTTATGCAGGCTTGCAGGCGTCGAGCCTGAGGAGAAAGAAGAAAATGAGGTCACCAGAACTTTAATCAATTTGAGCTTGATCAAGAAGCTCATTACCAATTCAAAACTAAAGGTGACCTCCCCTAAGAAGAAAGCTCAAATTCCCACTCCTCCTCAGCTCAAGCCTCAATGCCTCCATAAAACGACACAATGGATGAAGCAGAAGATGTGGCCACAAACCCATCGCAAATTCCACCAGAAAATCCTCCACAGTAAGCACCACAACCTGAACCTAAAGATGATTTTGTTGGGTTTTATGTCCTAAAACTCGAAGTTTGTAATCCTTTTGCAATAAAAATGTTATTCAGTGAATTGTTTGTTTCGATACTCTAAATCCAATTTAAACATCCATGGTTATACTATGAGATACTCGAACTATATCGTGGATATGGATAGGGATCAAGTTCTAGTATATAACCTAAATGGTCTATAGTATAGGGATAAGGCTGGGTACCTTATCTTGGTAACACTATGGATGCGACCTACTTTGTGAATGAGGAAAATGACGTGATCCTGGATCGTTCATGTAGAGACATGCGAGTAGGGGCATCCTGTGTAAAAGATGTTTACACAAGATCGGACCAAGAAATAAGTCACACTTACTTTATAACACCGTTTACTGTCGAGACTTACTATTTCATACAATGACCTAGGTAACTCGATCTTAATCCTGAGCTTACTATGAACTCCTGTTCGTTTGGGATTATCCTTTGATTTGCATGGGTGAGAGTGGCCCAACATCGCCGCTCAATAAACCTACCATTTTGGGGATAAGACTGGATGGATAGATGGGGACATAGTATTGCAAAATGAAATTCACTCCTACCCGAATCAGGGATAGTAGAAAGGTTGTTCCCTTAAGTGCTGACTGCGAGGCTTGAACAAGGGGCCCCACCCTCTCATTGGCCCCAGAGGGGCTCTGTTTAGTGGTTGGACCATAAACAAATTGTTCATTAGAGGACCAGTGGACTTAAGGAATAAAGATGTGTTATAGGGGTAAAACAGACCTTTGACCTAGCTATAGTAATGAACGACCTGTGAAAGATTGACTTACTAATCATGGTTATATCGAGTGGACGGAAATATATCTACAGTGAGGGGAGTTCAACTACTAGGCTATAGTGGAGTGACCCAGTAGTTATCGAATGTTGGTTAACTGGGTTGAAAGGGTTTAATTGGTTAAACCTCAAACCGTTGGAGCCCATGATCTGTAGGTCCATTAGCTCCCCTTGCTAGCTTGAGAATAACCTTTGGAACAATATGATAGAAGGAATTAGAATAAGTTCGCATTCGGTTTAGGGAATTGGTTGGTCATATTTGATATTACCTACACGTCGGGTTTCGGATAAACCGAGCTAAGAGAGATTTAATATATTTAAATATGATTTAAATATCGAGCACATGAATAGGGATTTATGGTTGAAAAATAACATTTCGAAAATGTTCGAGATTGGTAGCAAAATATTAATTTAATATTAGATATTAAATTAATTATATATTTAATTATTTTAATTAATTTTGAATTAATTTAAAATTGGAAATTGAAAATTGGATTTTAAATTTTCAGATTATTAATGATTAAATTAAATAAACTAAAATCCAATTTAATTTTGAATTATGAAATTCAAAATTAAATTGAATTTTAGGAGGTGGAGTGCATGGTGACTAAACCCATGCACTCCCCCTCATCAAGCCACCAAATTACCCACTAATTCTTGGCTAATTTGGTGTCAATCTTTGGTGTTTCTTCTCAGCTTGAATCCCTCTATAAATGGAGGTGAATTTGGTAAAGAGGGGGTGCTGGAATCCTTAATGAAATGCTGCCAAAATCTCTCCAAAACTCAAGAACTTCAAACCTCCATTGAAGCTTAGTTTTCAAGCTCTTTCCCTTCTAAATTCCATCACTAGAGGATCTCACAATCCGTTTCAAAGGCTTGAGGATAGCAAGGAAGATCAAGTGGTCGTTCGTGACAATTTGGAGAAGAAAAACAAGCAACAAGTTCAGGCAATTTGAAAATTAAAGAGTTTGGTACTCACTGCCCCTGTTTTTCTTCATATGAACAACATGCTTTGTATGATCAAATTGAAGTTATTAAGTGGCTAAGATCCAAAATTGCTTCCGCATGTTAGATATTAACACCTTCAATTGGTATCAGAACCTGGTTTGGGCACCTAATTTGTTTTAATTTGATCATGGTGGGTAGCATTTTGAAAATCAATGTGTATGGGTGCTAAAATGGATATATTATGGTTTTGGCAAATTTTTCTCTTCAATTTGTTGATGAAAATGTAATTGCTCACATGTATATGAGCATTAATGTGTTGAGAAGAGTCTGTAATTTTTGGAGAGTCATTAGAGTCCATTTAGTGCTGTAATTGATCGAAAGAAGGAGATGAACTCATGTTGGTCGAAGAACAGAGGGGTTCCAGACGCATCAGCGTCTTCAGCGTCTCGACGCTGATGAGTTTTCAAAGAAGACGCGCGCATTTTCCAGATTTGGTCCGATTCAGCTTCTTTCGGTCTGGTTCGCTCAATCTCGGTTGGTTCAGTCCTATTTGACCCGGTTCAGTGATGTTCAAGCCTTTGGAGGTCCGGTTTGGTCCGTTTTAAGCAGGTTTGAGTTGGTTCGAGATTCCCGAGAGCTTCACAACATATTTATTCATTATTATTTGTAATAATTTAGTTAATTGTTTACTTGAGTTGCCAAAACAGGTCCATTTCAGTGTGGTTTAATTATTTATGCTTTATGAATGCATGTTATAATTAGAATGAATGTTATATGCATAAGAGTATGTCATATAGATTTAAAATTCCACCATAGGAAGCATGTTTCATGCATTTAAGTATGTTATAAAGAGTTATAATATAAGTATGAATGATTTAGGTTTCATGTTAGATGCATGCTGAATGAATAGTTCTCGTTAATTATAATCTTTATATAAATTAAACGAAAATGAACAAGCATGCAACATGAAACTTCCTTAGCTCGATATTAAAGCGTTAACATCGATTGGAAAGCATGTTATAGGTTGATCTCTTTTATAAATAAGTTATAAACCGAGATAGATGATAAATAGACGATAAAATCTATAACCAAGATAAAAGCATGCTCACCTAGGGTTAAACGAACCAAATCGATCAATTTCATAAAATAGGTCGATAACTTGTAAAGCTAAGGTTACAAGAGAACTCACCCGATTCGATGCTGTCTAAGGCTGGAGGTATTTAAGTTGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCAGGGCATCGGGTCGGTACTTGAGTTAAGTTAACCTAGGTTTTACGAGCATGCACGTGAGAGATGTAAGGTTATTTTCACTTAGACATCGTAGGTTAATATTAAACCTAGACTTAGGTAAATATTCAATTAGTCGGAATATGCCTAAGTGACAATATACCCAAAAACGTTAAAATAATTAGTGGGAGAAAAAGATAAATATAGTTTTTTCTCATGCTCTCCTTATAAGTTCACATGGTGAGATTTATGCTTGGCCTCGTGTTGCTTACTAACACAACTGTTCCATTCGGAAGGTGTTTGCATAAGTCAATATCAAGGTGAACGGAGAAAGTATTTATAGTAAGTGGGAGAAGGAAGTGTGTCAACACATCCTACGGTCTCTTCCATTGGGTTACACTGTGAGATCCCTATGTTGCGCCTGCTAAGTATGCCCTAGAGCTACTACACCATTCGGAGGGATGTAACATATAGGAATCGAAACAAAGTAAACTCCAGAAATGGATAGGGTTTCTTAGGGCCATTCCCAACATTAGCTTTTCCATTCGATAGCATTGTTGGGATCGTCCTCTGGGATCTGAAAATGGAAGGTCACACTTACAAGATAAACTAATTGTTAGTCTATTCTTGACCAAAGTAGCGGTAACTAATTGAAACAGAAATAAAGGAGTTATTTTGGTTATAGTATATTTAGTCAATAACGTCTTGGTTCAGTGAAGGAGTGATTGACTACCCGTCGGTAGCAGTTATTCTGACTCACTGAACTATCATTGCAAATTAATTAATGAGATGGGTACATTATTACTTTTGCTAAACTGAAATTTGATTTATTAAATAATCAATTCACTAATAAAGGATTTATTTTATGTTTTCAACATGTCCAGCTATTTAGTGCAACTATTAGCTTCTGAAAAACTTAACGACGACAACTACGGAACCTGGAAATCAAATTTATAACACAGTATTAGTGATTGATGATCTTCGATTCGTCTTGACGGAAGAATGTTCACCTAACTCTGGCTCAATAGGAACCCGAGTGAGTCGGGATGCCTATGACCGATGGACTAGAGCCAATGACAAGGCAAAAGTCTTCATCTTGACAAGCATATCTGATGTTCTGTCAAAGAAAAACGAGGGCATGGCTATGACCAAAGAAATAATGGACTCATTACAAGTGATGTTTGGACAATCGTCCTCATCTCTTCGACATGAGGCCCTTGATAAGGGTAAAAAATATACCTATTTTACCCTTATATTTAGCTCATTTCCTTGTCAAAAGTTGCATGTTTAGATCAATTTTACTATTTCCGAGCTCAAAATATGTTAAAGTTGATGAATCAGGGAGTTGAGAGTCACATTCGTCAAATTATGCTTACTTGTGCTTAAAAAGACTGAATTTTATATGAATTTGACCCAATTTGGTGTTATGCAGGAAAACAGAGGAGAACTGGAAATTGCCCAGAAATGCGACCGCGTTTTTGGGAAGGCCAAATTCAAATGCGACCGCATTTCAGGAAAAACAGAGGTCGTTCCGAGTCTGTCGCAGGTCGTTTTGAACGAGACTTTTGCGCACCTAACCGGCCGTTTTGACCCCGAAAATGACTGGGCTACCTACTAG

mRNA sequence

ATGCTGTTGCGCAGTAGGTACAACCTTTGTCGTATCATATGGTCTGAGATCCTAACCTGCGATCACAAGAATGTGGGGAGGCTCTTCTTCCCAACCTTGATCACGAAGTTATGCAGGCTTGCAGGCGTCGAGCCTGAGGAGAAAGAAGAAAATGAGGTCACCAGAACTTTAATCAATTTGAGCTTGATCAAGAAGCTCATTACCAATTCAAAACTAAAGGTGACCTCCCCTAAGAAGAAAGCTCAAATTCCCACTCCTCCTCAGCTCAAGCCTCAATGCCTCCATAAAACGACACAATGGATGAAGCAGAAGATGTGGCCACAAACCCATCGCAAATTCCACCAGAAAATCCTCCACAGCTGGGTACCTTATCTTGGTAACACTATGGATGCGACCTACTTTGTGAATGAGGAAAATGACGTGATCCTGGATCGTTCATGTAGAGACATGCGAACGCATCAGCGTCTTCAGCGTCTCGACGCTGATGAGTTTTCAAAGAAGACGCGCGCATTTTCCAGATTTGGTCCGATTCAGCTTCTTTCGGTCTGGTTCGCTCAATCTCGGTTGGTTCAGTCCTATTTGACCCGGTTCAGTGATGTTCAAGCCTTTGGAGGTCCGGTTTGGTCCGTTTTAAGCAGGTTTGAGTTGGAAAACAGAGGAGAACTGGAAATTGCCCAGAAATGCGACCGCGTTTTTGGGAAGGCCAAATTCAAATGCGACCGCATTTCAGGAAAAACAGAGGTCGTTCCGAGTCTGTCGCAGGTCGTTTTGAACGAGACTTTTGCGCACCTAACCGGCCGTTTTGACCCCGAAAATGACTGGGCTACCTACTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCTGTTGCGCAGTAGGTACAACCTTTGTCGTATCATATGGTCTGAGATCCTAACCTGCGATCACAAGAATGTGGGGAGGCTCTTCTTCCCAACCTTGATCACGAAGTTATGCAGGCTTGCAGGCGTCGAGCCTGAGGAGAAAGAAGAAAATGAGGTCACCAGAACTTTAATCAATTTGAGCTTGATCAAGAAGCTCATTACCAATTCAAAACTAAAGGTGACCTCCCCTAAGAAGAAAGCTCAAATTCCCACTCCTCCTCAGCTCAAGCCTCAATGCCTCCATAAAACGACACAATGGATGAAGCAGAAGATGTGGCCACAAACCCATCGCAAATTCCACCAGAAAATCCTCCACAGCTGGGTACCTTATCTTGGTAACACTATGGATGCGACCTACTTTGTGAATGAGGAAAATGACGTGATCCTGGATCGTTCATGTAGAGACATGCGAACGCATCAGCGTCTTCAGCGTCTCGACGCTGATGAGTTTTCAAAGAAGACGCGCGCATTTTCCAGATTTGGTCCGATTCAGCTTCTTTCGGTCTGGTTCGCTCAATCTCGGTTGGTTCAGTCCTATTTGACCCGGTTCAGTGATGTTCAAGCCTTTGGAGGTCCGGTTTGGTCCGTTTTAAGCAGGTTTGAGTTGGAAAACAGAGGAGAACTGGAAATTGCCCAGAAATGCGACCGCGTTTTTGGGAAGGCCAAATTCAAATGCGACCGCATTTCAGGAAAAACAGAGGTCGTTCCGAGTCTGTCGCAGGTCGTTTTGAACGAGACTTTTGCGCACCTAACCGGCCGTTTTGACCCCGAAAATGACTGGGCTACCTACTAG

Protein sequence

MLLRSRYNLCRIIWSEILTCDHKNVGRLFFPTLITKLCRLAGVEPEEKEENEVTRTLINLSLIKKLITNSKLKVTSPKKKAQIPTPPQLKPQCLHKTTQWMKQKMWPQTHRKFHQKILHSWVPYLGNTMDATYFVNEENDVILDRSCRDMRTHQRLQRLDADEFSKKTRAFSRFGPIQLLSVWFAQSRLVQSYLTRFSDVQAFGGPVWSVLSRFELENRGELEIAQKCDRVFGKAKFKCDRISGKTEVVPSLSQVVLNETFAHLTGRFDPENDWATY
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Spg018220Spg018220gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg018220.1-cdsSpg018220.1-cds-scaffold3:7147345..7147702CDS
Spg018220.1-cdsSpg018220.1-cds-scaffold3:7147936..7148030CDS
Spg018220.1-cdsSpg018220.1-cds-scaffold3:7149921..7150115CDS
Spg018220.1-cdsSpg018220.1-cds-scaffold3:7152176..7152361CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Spg018220.1Spg018220.1-proteinpolypeptide