Moc09g00530.1 (mRNA) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview
NameMoc09g00530.1
TypemRNA
OrganismMomordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
DescriptionUnknown protein
Locationchr9: 542089 .. 560729 (+)
Sequence length1572
RNA-Seq ExpressionMoc09g00530.1
SyntenyMoc09g00530.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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mRNA sequence

ATGCCGCCAATGGCCATTAGTTTTGCACCCATCATGCCAGGAAGATCAACAGTCATGAAGTTTTCAGTTCTTATTGAAATTGTCTCAATAGAACCTTGTTTAATGAACATGGTTCTCGAAGTTGCGATGATTATTACCCCTACCGCTCCCAGGAATGTTGTGGATTTCATAACGAAAGTGCTTTTTAGCCTCTCAAATTCAAGGTGTTCTATATTATGGTGCAATGCTATAGGCTCAGCCTTATGGCACCTTTGGTTGGAGCGTAACACCAGTGTCTTCAAAGACAAAGAGAAGCTATCTATGGGAAGACATAAAGAGTTGCAACTTCCTCATGGTCCTATAGATCAAAGCAGGAAAAAGAAAAAGCTAGCCAAATTCAAGATAATCAAGCTTTCTACTCAAACCGAGGAAGAGGTAATGGGAGAGGACGACAATTCTCCTCTCGAGGAAGAGGATTCCATCATAGTAGGCAACCAAAGGATCACAACAAATCTCAGCAAGGATAACAACATCTATGCTGATTCTGGAGCAACGTCACACGTAGTGAATGATCTAGGTAAAGTACAATTTGCTCACTCCTATTATGGTTCTGACAAACTATTTGTTGGTGATGGTAAAGGGACGTTAGACAAAAATGAGGTATCAACCCAAAAGGAAATAAATGATGTGTTGGCCAACAATGTTAGAACTCATATATCTCTTGAAGAACCTGAAAACCCCAACCCAGCTACTGATCCAAGAAGCAAAGACACAATTGAAACACATGAAGACAATTCACATACAACAAATGAGGATGCTGATCACCAAAGCCTTGACATTGCCTTAGCAGATGAAGCCAAGCACACAATAGAGCAACTTGAAAAATCGATCATGCCATCTCTTATCCAAAATGATACTTCTCACCACTCCAACCAAGTGAACTCTTCCTCTTTACCTGATATAAGTAACCAACTCTTTGTTGATTTACCTATTTCTTGTGCAGGAATTTCACTCACGCCAACAAATGAGAACAATCAATCACTCACTTCCACCCATCAGATGATCACAAGAAGGAAGTTGGCAATTGATCCATCTTTAGATCCTACTTTATCTAAGGAAATCAACCACCTGAGAACAACACAAACTCATCACTCTTATCTTATTGAGAATCTTCCAACTAAGCCAAAGAATTACAAGACCTCATTTCCCAGATTGATTGATAACTTTATTAAGGAGCATCTCTCTAGGCCTCTCAAAACCAAACGTAACATTCTCTTGAGCAATGCTGTTGGATCGCTTCTATGGAACCTTTGGCTCCGCAACAACCGTCTCTTTTCGAAGGCATCTAGATCCCCTGCATATCCCTCTGTGGGAAGACATCATTACCACTGCCTCCACTTGGGTACAACGGCTGGGATGAAGGCACAAAGTAGGAAATCAGGCCTGTGGCTTGTCTTGCGTGTAAGAAATGAGGAGTACTTCCCTATCGATCTTCCTGGCGTGATGGGTGAAAACCCAATGGATAATGGAGGCACCCTAAAGTGCAAGTCAAAAGGCTCTGTTTCTTCTTCTTCATGCAATGGTGGACTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCCGCCAATGGCCATTAGTTTTGCACCCATCATGCCAGGAAGATCAACAGTCATGAAGTTTTCAGTTCTTATTGAAATTGTCTCAATAGAACCTTGTTTAATGAACATGGTTCTCGAAGTTGCGATGATTATTACCCCTACCGCTCCCAGGAATGTTGTGGATTTCATAACGAAAGTGCTTTTTAGCCTCTCAAATTCAAGGTGTTCTATATTATGGTGCAATGCTATAGGCTCAGCCTTATGGCACCTTTGGTTGGAGCGTAACACCAGTGTCTTCAAAGACAAAGAGAAGCTATCTATGGGAAGACATAAAGAGTTGCAACTTCCTCATGGTCCTATAGATCAAAGCAGGAAAAAGAAAAAGCTAGCCAAATTCAAGATAATCAAGCTTTCTACTCAAACCGAGGAAGAGGTAATGGGAGAGGACGACAATTCTCCTCTCGAGGAAGAGGATTCCATCATAGTAGGCAACCAAAGGATCACAACAAATCTCAGCAAGGATAACAACATCTATGCTGATTCTGGAGCAACGTCACACGTAGTGAATGATCTAGGTAAAGTACAATTTGCTCACTCCTATTATGGTTCTGACAAACTATTTGTTGGTGATGGTAAAGGGACGTTAGACAAAAATGAGGTATCAACCCAAAAGGAAATAAATGATGTGTTGGCCAACAATGTTAGAACTCATATATCTCTTGAAGAACCTGAAAACCCCAACCCAGCTACTGATCCAAGAAGCAAAGACACAATTGAAACACATGAAGACAATTCACATACAACAAATGAGGATGCTGATCACCAAAGCCTTGACATTGCCTTAGCAGATGAAGCCAAGCACACAATAGAGCAACTTGAAAAATCGATCATGCCATCTCTTATCCAAAATGATACTTCTCACCACTCCAACCAAGTGAACTCTTCCTCTTTACCTGATATAAGTAACCAACTCTTTGTTGATTTACCTATTTCTTGTGCAGGAATTTCACTCACGCCAACAAATGAGAACAATCAATCACTCACTTCCACCCATCAGATGATCACAAGAAGGAAGTTGGCAATTGATCCATCTTTAGATCCTACTTTATCTAAGGAAATCAACCACCTGAGAACAACACAAACTCATCACTCTTATCTTATTGAGAATCTTCCAACTAAGCCAAAGAATTACAAGACCTCATTTCCCAGATTGATTGATAACTTTATTAAGGAGCATCTCTCTAGGCCTCTCAAAACCAAACGTAACATTCTCTTGAGCAATGCTGTTGGATCGCTTCTATGGAACCTTTGGCTCCGCAACAACCGTCTCTTTTCGAAGGCATCTAGATCCCCTGCATATCCCTCTGTGGGAAGACATCATTACCACTGCCTCCACTTGGGTACAACGGCTGGGATGAAGGCACAAAGTAGGAAATCAGGCCTGTGGCTTGTCTTGCGTGTAAGAAATGAGGAGTACTTCCCTATCGATCTTCCTGGCGTGATGGGTGAAAACCCAATGGATAATGGAGGCACCCTAAAGTGCAAGTCAAAAGGCTCTGTTTCTTCTTCTTCATGCAATGGTGGACTCTAA

Protein sequence

MPPMAISFAPIMPGRSTVMKFSVLIEIVSIEPCLMNMVLEVAMIITPTAPRNVVDFITKVLFSLSNSRCSILWCNAIGSALWHLWLERNTSVFKDKEKLSMGRHKELQLPHGPIDQSRKKKKLAKFKIIKLSTQTEEEVMGEDDNSPLEEEDSIIVGNQRITTNLSKDNNIYADSGATSHVVNDLGKVQFAHSYYGSDKLFVGDGKGTLDKNEVSTQKEINDVLANNVRTHISLEEPENPNPATDPRSKDTIETHEDNSHTTNEDADHQSLDIALADEAKHTIEQLEKSIMPSLIQNDTSHHSNQVNSSSLPDISNQLFVDLPISCAGISLTPTNENNQSLTSTHQMITRRKLAIDPSLDPTLSKEINHLRTTQTHHSYLIENLPTKPKNYKTSFPRLIDNFIKEHLSRPLKTKRNILLSNAVGSLLWNLWLRNNRLFSKASRSPAYPSVGRHHYHCLHLGTTAGMKAQSRKSGLWLVLRVRNEEYFPIDLPGVMGENPMDNGGTLKCKSKGSVSSSSCNGGL
Homology
[Close]
BLAST of Moc09g00530.1 vs. NCBI nr
Match: TXG53642.1 (hypothetical protein EZV62_018898 [Acer yangbiense])

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 5.7e-04
Identity = 49/157 (31.21%), Postives = 76/157 (48.41%), Query Frame = 0 

Query: 252 IETHEDNSHTTNEDADHQSLDI---------ALADEAKHTIEQLEKSIMPSLIQNDTSHH 311
           ++  ED ++ T+   D QS  I             E+   IEQ  +S  P   ++     
Sbjct: 107 LQEQEDATNNTDSLTDMQSPQIFENIQGSTYNQIQESHEEIEQNIESQAPQFDRDTNLQD 166

Query: 312 SNQVNSSSLPDISNQLFVDLPI-------SCAGISLTPTNENNQSLTSTHQMITRRKLAI 371
             Q  +  +PDI + LFVDL         S  G +   +++   S  + HQMITR+KL  
Sbjct: 167 QPQRLNPGMPDIISNLFVDLRTFDENAGNSLQGNNFKASHQVEPSSQTEHQMITRKKLNA 226

Query: 372 DPSLDPTLSKEINHLRTTQTHHSYLIENLPTKPKNYK 393
           +P+L+PTL+ EI  +R  +TH S L+     +PK+YK
Sbjct: 227 NPNLNPTLTVEIKKMREQRTHTSLLMLTENEEPKSYK 263

[Close]
BLAST of Moc09g00530.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7HAT9 (Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_018898 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 2.7e-04
Identity = 49/157 (31.21%), Postives = 76/157 (48.41%), Query Frame = 0 

Query: 252 IETHEDNSHTTNEDADHQSLDI---------ALADEAKHTIEQLEKSIMPSLIQNDTSHH 311
           ++  ED ++ T+   D QS  I             E+   IEQ  +S  P   ++     
Sbjct: 107 LQEQEDATNNTDSLTDMQSPQIFENIQGSTYNQIQESHEEIEQNIESQAPQFDRDTNLQD 166

Query: 312 SNQVNSSSLPDISNQLFVDLPI-------SCAGISLTPTNENNQSLTSTHQMITRRKLAI 371
             Q  +  +PDI + LFVDL         S  G +   +++   S  + HQMITR+KL  
Sbjct: 167 QPQRLNPGMPDIISNLFVDLRTFDENAGNSLQGNNFKASHQVEPSSQTEHQMITRKKLNA 226

Query: 372 DPSLDPTLSKEINHLRTTQTHHSYLIENLPTKPKNYK 393
           +P+L+PTL+ EI  +R  +TH S L+     +PK+YK
Sbjct: 227 NPNLNPTLTVEIKKMREQRTHTSLLMLTENEEPKSYK 263

The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of Moc09g00530.1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
TXG53642.15.7e-0431.21hypothetical protein EZV62_018898 [Acer yangbiense][more]
BLAST of Moc09g00530.1 vs. NCBI nr
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of Moc09g00530.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
A0A5C7HAT92.7e-0431.21Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_018898 PE=4 SV=1[more]
BLAST of Moc09g00530.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 231..268
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 248..268

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
Moc09g00530Moc09g00530gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc09g00530.1.exon1Moc09g00530.1.exon1exon
Moc09g00530.1.exon2Moc09g00530.1.exon2exon
Moc09g00530.1.exon3Moc09g00530.1.exon3exon
Moc09g00530.1.exon4Moc09g00530.1.exon4exon
Moc09g00530.1.exon5Moc09g00530.1.exon5exon
Moc09g00530.1.exon6Moc09g00530.1.exon6exon
Moc09g00530.1.exon7Moc09g00530.1.exon7exon
Moc09g00530.1.exon8Moc09g00530.1.exon8exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1CDS
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1_2CDS
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1_3CDS
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1_4CDS
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1_5CDS
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1_6CDS
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1_7CDS
cds.Moc09g00530.1cds.Moc09g00530.1_8CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
Moc09g00530.1Moc09g00530.1-proteinpolypeptide