Moc09g00530 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview


Name	Moc09g00530
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	Unknown protein
Location	chr9: 542089 .. 560729 (+)
RNA-Seq Expression	Moc09g00530
Synteny	Moc09g00530

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide

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mRNA sequence

ATGCCGCCAATGGCCATTAGTTTTGCACCCATCATGCCAGGAAGATCAACAGTCATGAAGTTTTCAGTTCTTATTGAAATTGTCTCAATAGAACCTTGTTTAATGAACATGGTTCTCGAAGTTGCGATGATTATTACCCCTACCGCTCCCAGGAATGTTGTGGATTTCATAACGAAAGTGCTTTTTAGCCTCTCAAATTCAAGGTGTTCTATATTATGGTGCAATGCTATAGGCTCAGCCTTATGGCACCTTTGGTTGGAGCGTAACACCAGTGTCTTCAAAGACAAAGAGAAGCTATCTATGGGAAGACATAAAGAGTTGCAACTTCCTCATGGTCCTATAGATCAAAGCAGGAAAAAGAAAAAGCTAGCCAAATTCAAGATAATCAAGCTTTCTACTCAAACCGAGGAAGAGGTAATGGGAGAGGACGACAATTCTCCTCTCGAGGAAGAGGATTCCATCATAGTAGGCAACCAAAGGATCACAACAAATCTCAGCAAGGATAACAACATCTATGCTGATTCTGGAGCAACGTCACACGTAGTGAATGATCTAGGTAAAGTACAATTTGCTCACTCCTATTATGGTTCTGACAAACTATTTGTTGGTGATGGTAAAGGGACGTTAGACAAAAATGAGGTATCAACCCAAAAGGAAATAAATGATGTGTTGGCCAACAATGTTAGAACTCATATATCTCTTGAAGAACCTGAAAACCCCAACCCAGCTACTGATCCAAGAAGCAAAGACACAATTGAAACACATGAAGACAATTCACATACAACAAATGAGGATGCTGATCACCAAAGCCTTGACATTGCCTTAGCAGATGAAGCCAAGCACACAATAGAGCAACTTGAAAAATCGATCATGCCATCTCTTATCCAAAATGATACTTCTCACCACTCCAACCAAGTGAACTCTTCCTCTTTACCTGATATAAGTAACCAACTCTTTGTTGATTTACCTATTTCTTGTGCAGGAATTTCACTCACGCCAACAAATGAGAACAATCAATCACTCACTTCCACCCATCAGATGATCACAAGAAGGAAGTTGGCAATTGATCCATCTTTAGATCCTACTTTATCTAAGGAAATCAACCACCTGAGAACAACACAAACTCATCACTCTTATCTTATTGAGAATCTTCCAACTAAGCCAAAGAATTACAAGACCTCATTTCCCAGATTGATTGATAACTTTATTAAGGAGCATCTCTCTAGGCCTCTCAAAACCAAACGTAACATTCTCTTGAGCAATGCTGTTGGATCGCTTCTATGGAACCTTTGGCTCCGCAACAACCGTCTCTTTTCGAAGGCATCTAGATCCCCTGCATATCCCTCTGTGGGAAGACATCATTACCACTGCCTCCACTTGGGTACAACGGCTGGGATGAAGGCACAAAGTAGGAAATCAGGCCTGTGGCTTGTCTTGCGTGTAAGAAATGAGGAGTACTTCCCTATCGATCTTCCTGGCGTGATGGGTGAAAACCCAATGGATAATGGAGGCACCCTAAAGTGCAAGTCAAAAGGCTCTGTTTCTTCTTCTTCATGCAATGGTGGACTCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGCCGCCAATGGCCATTAGTTTTGCACCCATCATGCCAGGAAGATCAACAGTCATGAAGTTTTCAGTTCTTATTGAAATTGTCTCAATAGAACCTTGTTTAATGAACATGGTTCTCGAAGTTGCGATGATTATTACCCCTACCGCTCCCAGGAATGTTGTGGATTTCATAACGAAAGTGCTTTTTAGCCTCTCAAATTCAAGGTGTTCTATATTATGGTGCAATGCTATAGGCTCAGCCTTATGGCACCTTTGGTTGGAGCGTAACACCAGTGTCTTCAAAGACAAAGAGAAGCTATCTATGGGAAGACATAAAGAGTTGCAACTTCCTCATGGTCCTATAGATCAAAGCAGGAAAAAGAAAAAGCTAGCCAAATTCAAGATAATCAAGCTTTCTACTCAAACCGAGGAAGAGGTAATGGGAGAGGACGACAATTCTCCTCTCGAGGAAGAGGATTCCATCATAGTAGGCAACCAAAGGATCACAACAAATCTCAGCAAGGATAACAACATCTATGCTGATTCTGGAGCAACGTCACACGTAGTGAATGATCTAGGTAAAGTACAATTTGCTCACTCCTATTATGGTTCTGACAAACTATTTGTTGGTGATGGTAAAGGGACGTTAGACAAAAATGAGGTATCAACCCAAAAGGAAATAAATGATGTGTTGGCCAACAATGTTAGAACTCATATATCTCTTGAAGAACCTGAAAACCCCAACCCAGCTACTGATCCAAGAAGCAAAGACACAATTGAAACACATGAAGACAATTCACATACAACAAATGAGGATGCTGATCACCAAAGCCTTGACATTGCCTTAGCAGATGAAGCCAAGCACACAATAGAGCAACTTGAAAAATCGATCATGCCATCTCTTATCCAAAATGATACTTCTCACCACTCCAACCAAGTGAACTCTTCCTCTTTACCTGATATAAGTAACCAACTCTTTGTTGATTTACCTATTTCTTGTGCAGGAATTTCACTCACGCCAACAAATGAGAACAATCAATCACTCACTTCCACCCATCAGATGATCACAAGAAGGAAGTTGGCAATTGATCCATCTTTAGATCCTACTTTATCTAAGGAAATCAACCACCTGAGAACAACACAAACTCATCACTCTTATCTTATTGAGAATCTTCCAACTAAGCCAAAGAATTACAAGACCTCATTTCCCAGATTGATTGATAACTTTATTAAGGAGCATCTCTCTAGGCCTCTCAAAACCAAACGTAACATTCTCTTGAGCAATGCTGTTGGATCGCTTCTATGGAACCTTTGGCTCCGCAACAACCGTCTCTTTTCGAAGGCATCTAGATCCCCTGCATATCCCTCTGTGGGAAGACATCATTACCACTGCCTCCACTTGGGTACAACGGCTGGGATGAAGGCACAAAGTAGGAAATCAGGCCTGTGGCTTGTCTTGCGTGTAAGAAATGAGGAGTACTTCCCTATCGATCTTCCTGGCGTGATGGGTGAAAACCCAATGGATAATGGAGGCACCCTAAAGTGCAAGTCAAAAGGCTCTGTTTCTTCTTCTTCATGCAATGGTGGACTCTAA

Protein sequence

MPPMAISFAPIMPGRSTVMKFSVLIEIVSIEPCLMNMVLEVAMIITPTAPRNVVDFITKVLFSLSNSRCSILWCNAIGSALWHLWLERNTSVFKDKEKLSMGRHKELQLPHGPIDQSRKKKKLAKFKIIKLSTQTEEEVMGEDDNSPLEEEDSIIVGNQRITTNLSKDNNIYADSGATSHVVNDLGKVQFAHSYYGSDKLFVGDGKGTLDKNEVSTQKEINDVLANNVRTHISLEEPENPNPATDPRSKDTIETHEDNSHTTNEDADHQSLDIALADEAKHTIEQLEKSIMPSLIQNDTSHHSNQVNSSSLPDISNQLFVDLPISCAGISLTPTNENNQSLTSTHQMITRRKLAIDPSLDPTLSKEINHLRTTQTHHSYLIENLPTKPKNYKTSFPRLIDNFIKEHLSRPLKTKRNILLSNAVGSLLWNLWLRNNRLFSKASRSPAYPSVGRHHYHCLHLGTTAGMKAQSRKSGLWLVLRVRNEEYFPIDLPGVMGENPMDNGGTLKCKSKGSVSSSSCNGGL

Homology

[Close]

BLAST of Moc09g00530 vs. NCBI nr
Match: TXG53642.1 (hypothetical protein EZV62_018898 [Acer yangbiense])

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 5.7e-04
Identity = 49/157 (31.21%), Postives = 76/157 (48.41%), Query Frame = 0


Query: 252 IETHEDNSHTTNEDADHQSLDI---------ALADEAKHTIEQLEKSIMPSLIQNDTSHH 311
           ++  ED ++ T+   D QS  I             E+   IEQ  +S  P   ++     
Sbjct: 107 LQEQEDATNNTDSLTDMQSPQIFENIQGSTYNQIQESHEEIEQNIESQAPQFDRDTNLQD 166

Query: 312 SNQVNSSSLPDISNQLFVDLPI-------SCAGISLTPTNENNQSLTSTHQMITRRKLAI 371
             Q  +  +PDI + LFVDL         S  G +   +++   S  + HQMITR+KL  
Sbjct: 167 QPQRLNPGMPDIISNLFVDLRTFDENAGNSLQGNNFKASHQVEPSSQTEHQMITRKKLNA 226

Query: 372 DPSLDPTLSKEINHLRTTQTHHSYLIENLPTKPKNYK 393
           +P+L+PTL+ EI  +R  +TH S L+     +PK+YK
Sbjct: 227 NPNLNPTLTVEIKKMREQRTHTSLLMLTENEEPKSYK 263

[Close]

BLAST of Moc09g00530 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5C7HAT9 (Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_018898 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 2.7e-04
Identity = 49/157 (31.21%), Postives = 76/157 (48.41%), Query Frame = 0


Query: 252 IETHEDNSHTTNEDADHQSLDI---------ALADEAKHTIEQLEKSIMPSLIQNDTSHH 311
           ++  ED ++ T+   D QS  I             E+   IEQ  +S  P   ++     
Sbjct: 107 LQEQEDATNNTDSLTDMQSPQIFENIQGSTYNQIQESHEEIEQNIESQAPQFDRDTNLQD 166

Query: 312 SNQVNSSSLPDISNQLFVDLPI-------SCAGISLTPTNENNQSLTSTHQMITRRKLAI 371
             Q  +  +PDI + LFVDL         S  G +   +++   S  + HQMITR+KL  
Sbjct: 167 QPQRLNPGMPDIISNLFVDLRTFDENAGNSLQGNNFKASHQVEPSSQTEHQMITRKKLNA 226

Query: 372 DPSLDPTLSKEINHLRTTQTHHSYLIENLPTKPKNYK 393
           +P+L+PTL+ EI  +R  +TH S L+     +PK+YK
Sbjct: 227 NPNLNPTLTVEIKKMREQRTHTSLLMLTENEEPKSYK 263

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Moc09g00530 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
TXG53642.1	5.7e-04	31.21	hypothetical protein EZV62_018898 [Acer yangbiense]	[more]

BLAST of Moc09g00530 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Moc09g00530 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A5C7HAT9	2.7e-04	31.21	Uncharacterized protein OS=Acer yangbiense OX=1000413 GN=EZV62_018898 PE=4 SV=1	[more]

BLAST of Moc09g00530 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 231..268
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 248..268

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Moc09g00530.1	Moc09g00530.1	mRNA