MS027262.1 (mRNA) Bitter gourd (TR) v1

Overview
NameMS027262.1
TypemRNA
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold1474: 288303 .. 297640 (+)
Sequence length720
RNA-Seq ExpressionMS027262.1
SyntenyMS027262.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGAAATCAGAGCCCAACCTGAGGAGACGAGGGGGTTCCATCTGATTCCAGTGGATTGGAGAAATGTGGAGCGCGTATGGCCAGTCCCAATGACGAACCGACGTTGCCGTCCACTCTCCAAGAGTTGGGAATTATGGGAATTGGAGAAGATTGGGAGTTTCGCAGTGTCCACAGTCGGCCATGGCCCCACGTGCTCCTCAATTAATGGTGGTGAAAGCGACCTGAGAGTGAATATCGCTCGTTCAATTTGCTTTCTTCGTCACTGCTTAAGAAGGTTCACTTTTCTGGATTTAGTTTCAACCAATTTGGTTTTGAAATCTTAACTAAATTATTCGAAACCCACTTTTAGTAGAGGGATAATTAAACTACGTTCCCTCTCAGTTCTTAGTTCATTTTAGTTTCATGCTAAAATTTTGATTCTCTTGTCACCAAGCAAATTAATGAAATCAATAATATATATTTTTTCAGTACAACGAGTGGGAACTGATAATCGAACTCGACCTCTTGATTAAAAACATATGTCGAATTAAGTTCATATTAATTGGAATGATATTTAAAACCAAACGTGGAATAATTTGCATAAAACTATTTTTTGTATGCAAATTAATAGTAAGAACTAAAACAAATTAAACCAAAATAATTACTAAAGAAAATTATTCATTTTTAACATTAAATACAAATGAATGAAAATAATGTTGTATTGCATTAATTGAATTCTTCCTATATTAAGTCTTGAGAAGAGAATTCTAAAGTCTAGTAAATAAATTCCTACAAATCAAATAATAATACTCCATCAACTATTCAATGAATCACGTTTATGTGGAAATTCAGAGAGTCCAAGATCTACGGGAGCTGACTAGCACCTCAATGGAGCGAGTTATGCAAGAAGACCTGCATGCAAATAATAAGTACTCTGACGTTCAAGTCATTCAAATGTTTGAATTCCTAGGTTAGTCCCCAACATAATTGCTTACCTAATTGAAGGGAGTGGTGATGTATTTTTAGGGGTTAGGAGGGAATCTTTGTGTTACGCCGGCGGTTAACTTGTTACGAAGATTGTTGAACAACTTCTAACTGTCTTTCAAGGCTGTCAGATTCCCAGCTCGAGCTGGACGAGCTTAGGTACATTTTGCCTTACCTAGGACTTCAAGTGTCTTCCACCTAGCTTTAATGAGAGTTATTAGCCGACAGAAGTCAAGACGTCGAGTGGACAGAAAATGATGCACTTGAGTGCTTTGTCTTTCCACATTTAGACAATCTACATCACTGATCGAGGGTGACATGGACGACTGGGATCAATCCATCTCCCTTTATATAAACCTGAAACTCTAACTCTCAAAATTCATGTTTTCTGAATCATTTTACTCTCAAACCAAGAAACTCTAACTCTCAAAATTCATGTTTTCTGAATTATTTTACTCTCAAACAAAGGTTGGTGGCTCGCTTACCATTTGTTTGTAATCTATTGTAGTTCTTAGTTATGTATAGAAGGAGGATGAGGAGCTTGGGACGGAGTCATAAGTCGAGCGAGAGTAGCTTGGGGGAAAATAACAAGTTGCACGAGAACAATGGTTCGCCCAATAGGAATAAATCCTCTAATAGTAGGTTGTCCTCTATCGATAAGCTGTCCACTAACAGTTTCTCTGAGGACAACTTTGAGACATAGAATATGGAAATTCAAGTCTGCGAAGACCGACCTTGCACCTCAGAACGAGACTATAACAATCAGTCCGAGCTCGCCGATGAGTTTCTAGCCTTTACATAGAGATGAGGTTCCCAATCAAAAGCGATATCATAGAATATCCACTTGAAAGACACGTAACCTTCTACCTCAACATGTTTGAGTTCAAGGTCCAACTTCCCCTCCACCCCAAGATTTTTTGGTAGAGGTGAATCTATCACCAACTCAAATAGCTCCCAATAATTGAGGGATCTTGCTTGGTTGTTGGATGTTGTGGTGGGGGGTCGATGTAGTATAGATGACTCAAAGTATTTGAATCTCGACCAATTTTAGTCAATTTATACTATAAAGACCCTACCTAAATACCTAGGTAGATTTTATCTAACTGCTAAGCGAGGTGTGGGGAAGCTAGTCAAGGGCCCCTCTCCATTAAGGATTGAAAGAGGGACAAATGAGTTTGATGTATACGGTGACTGGCTAGCACGAGATTCTGATGGCGAGCTGAGTTATCAAGTCCCCACAGCTTCAGTAACTTAGATAATGTCTCTCTCTTGAGCTTGCTTTTCCTGTGTTTAGCACTAATTGAAAATTTTATTTTGTAGTTCTTCCCAAACCAGTGCTACAAAGGAACGAACTCACCCAATGATGCTCCTGATGAGGGGGCTCGCAAGAAGACCCCTATGTGCGAAGTGGCGTAAGCCGAGCAAGGAGTATCTGAGTGAGATATCAAGGCGAGCCCTATCCAAACAGTGCATGCCTCTCCCTAAAAGAAGAAGAAGAAAAAACCTAAAGGAGCTTTGAGCAAGCCGAGCAAAAAGCCACCACCCATGCTGCACACCTCGACAATCTTTCAGCAGTCTAGATGATTGGGGAAGCTCTAGACTTTCAATTCCCCTTCCGAAGTTAGCCAACTCTATAAAAAATTAACTCACTGACGTGTTGGGTGGTGTGGGTGAGCTCTGACCGATCTCTTGCTCGTTTTGAGCGATTATCTAGCTCGTGGTCAACCATGCTAGCTGCTCAAGTAACTGTTCAGTTGAATAACTTCTTCTTGTTTAACCCGATACTAATCTAGCTCTTTCCTATAGGCTCATGCTCTTCCCTACAAGACGTTAGCCTTGGTAGCGGCTGAGCTACTTGGGCGCTAGTAGTGGGTCAAGCGGAAGAAAGCCAACTTTGCCAAGGCCATCAAGGAGATTGAGCACGCTTGAGCTGAGCTCAAGGACGCAAGGTCCAAACTACTGGAGGTGGTGCATAAAATTGGCGACCTTGAAATCAACTTAGAGACTTTGAGGAAAGAGGTAAAAAGTGGCCAAGATATGATTCGGAGGGCACAGACGCAAATCAACAACTCCAACGCCGAGTTGACAGACCTAAGGCTTGAAGTGACCAACCTCAAGAAGGCAAAGGCAAAAATGACTGAAAAACCTAAAGAGCAAGGCATACTTGGATACCACCTTCTAGAAGCTTCCCTCTTTCATAAACTTCAACGAGAGCTTGCAGACGACAGCTTCAAGTTCGCTCTCGTCTACTTGGAGAAGTACTTCTACATCAAAGGATGGACATGTTCGAAGATAGAATTGAGGCCCCTAAGGAGGCCATCCAGACGTACTTGAAGAAGCTAGATGAGCTTCCTCTTGTCGACCTGACTTAAGACGATCCAGTGGCTAAGGCTGCAAGGTTCGAGCTTTTTGAGGTCAAAGCTCCAATGACCGATGCTAACAAGAACGCCGCCTTCTGATCTCCTGCTTTACCTTTCAAGTTTTTCTTCCTGAAGTTAAAGCACATATTTCCAACTAAAAGATAATGAGTCCAAATCTCCACCGTCCTATGTTTTACTAAAACAAAAATCAAAATTGAAAGGTTATATATATAAGATCTCAAACTAAAAAATTTTGCCCTTCCCTATGAAATTTTTTGACTCCACCCTTAGACTAATTAACTCCCGATAACCATTCAGCCATGTATATATATTTTTTAGTGCAACAAATGTAGGGTACGAAAATCTGAATCTGAACCTTAAGAAAGTGAATTTCTTTTATCGTTGAGGTATATTCATGTTAATCGATTTGTATATATATTATGTTACGGAGGAAAAACCTTTTCTTTGTACGACAAAGTGGAGGTATGAGAATTTGGACCTCAAATCTTTAAAAAAAGAATAGATATAATTTGCTATTAAACTATGCTTATTTTAGCTCTATGTTACTATTCTGCCGTGTTTTTATTTTATTTTTATGAAATTAAAATATGTTGTGTTTATATGTGTGTGTATATATTATAGTACAACAACTGGGGGTGAGGAATCGAACTCAGAACCTCTTGGTTTGAGATATATATTAATTATCACTGAGCTATGCTCACTTTTTAACTGTTGTATTTTAATAAAAGTTAGTTGTAAGTCGTTATTTAATTAATTCTCTAAACTTGGATTATCATTTAATTTTTTTTAAGCACAACATATGAGTAAAGATTCGAATTTAGTCGAGTACTAATTATCGTTGAGCTATGCTCACTTTGACGATTTTATTTTAGGTTCTTATAGCTTGGATGTGATAAACCATTCCAAACAAAACTGCATTAACTAGTATTAATTTTTTGTATATATAAACAAATTTAATACCAAGTTTAGATTAAATGTATCATTTTAGTCTCTAATTTTTCAAAAGTTGTAATTGTGCCTTCAACTTTTGTGGGAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAATACCGCTGAAATAAAATAACAAGAAAGTGATGTTGAATCTATCTCATCCATATCCAATTTTGATGCATTATTGGTTTTATCCTAATTTTGATTTCTTTTTTCGTATCACTAGAGGTTGAATAATTAGAGGGGAATCTCCATATAGGGTAGTTTTATCTTATCATACTCCCACTTTTATGAAATTTAACTTTCCCAATTTATGGTTGACAGATTTTATGGACTTCTTCTTTTCCTTGACAAGTGTTTGTCAAACAATTTCGATAAAAAGAAAAAAAAGAAGGCGTTAAGAAACCTTCCTGGTTCAATTCTAGATGCTCTAAGATCATTTTTCAAACCTATTCCTCACTAATTGAGCGCTCTTGTGTCGAAGATGCACGGGACTAAGCAATCAGAAGTGAGATTGTCAGCTTGAGTAATGCAGAAATTGGTGAGAATCCAAAATGCCTTGGAAACCTAGGGGTTCCTCTGCCAGGAATATGTTTACATTTTTTAATACTTACAAGTATTTCCACACGTGTCTTGCGTATGGTATCTTAATTTTATTTTATCATATATTAATGTTAATTTGAATTTTATAAAAGTTGAGCATAT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mRNA sequence

ATGGAAATCAGAGCCCAACCTGAGGAGACGAGGGGGTTCCATCTGATTCCAGTGGATTGGAGAAATGTGGAGCGCGTATGGCCAGTCCCAATGACGAACCGACGTTGCCGTCCACTCTCCAAGAGTTGGGAATTATGGGAATTGGAGAAGATTGGGAGTTTCGCAGTGTCCACAGTCGGCCATGGCCCCACGTGCTCCTCAATTAATGGTGGTGAAAGCGACCTGAGAGTGAATATCGCTCGTTCAATTTGCTTTCTTCGTCACTGCTTAAGAAGAAGGAGGATGAGGAGCTTGGGACGGAGTCATAAGTCGAGCGAGAGTAGCTTGGGGGAAAATAACAAGTTGCACGAGAACAATGGTTCGCCCAATAGGAATAAATCCTCTAATAGTAGGTTGTCCTCTATCGATAAGCTGTCCACTAACACTTCAGCTGCCGCCTCCTCTAGCCTGCAGAAGAAGACGCTGCCACTGCTTCAGCCGCCGGCGGCATCCGTCACTGCTTTAGCCGCCGCTGCTGCTCCCATCCACGCAAAACACGCCGCAGCATCCTTCCTGGCTCTCACACCGCCGCACCATCCACGCCGACGCACGAACCGCCACCCCATCCATCAGTCGCCTAACGACTGCTCAGGCGAGTTCGTTTCCCATCCGTCGGAGCTTCGCCAGACGCCGCCGTCCAGTCATCGGTGGTTTGCCCAACTCGCAAGAACAGCCGCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAATCAGAGCCCAACCTGAGGAGACGAGGGGGTTCCATCTGATTCCAGTGGATTGGAGAAATGTGGAGCGCGTATGGCCAGTCCCAATGACGAACCGACGTTGCCGTCCACTCTCCAAGAGTTGGGAATTATGGGAATTGGAGAAGATTGGGAGTTTCGCAGTGTCCACAGTCGGCCATGGCCCCACGTGCTCCTCAATTAATGGTGGTGAAAGCGACCTGAGAGTGAATATCGCTCGTTCAATTTGCTTTCTTCGTCACTGCTTAAGAAGAAGGAGGATGAGGAGCTTGGGACGGAGTCATAAGTCGAGCGAGAGTAGCTTGGGGGAAAATAACAAGTTGCACGAGAACAATGGTTCGCCCAATAGGAATAAATCCTCTAATAGTAGGTTGTCCTCTATCGATAAGCTGTCCACTAACACTTCAGCTGCCGCCTCCTCTAGCCTGCAGAAGAAGACGCTGCCACTGCTTCAGCCGCCGGCGGCATCCGTCACTGCTTTAGCCGCCGCTGCTGCTCCCATCCACGCAAAACACGCCGCAGCATCCTTCCTGGCTCTCACACCGCCGCACCATCCACGCCGACGCACGAACCGCCACCCCATCCATCAGTCGCCTAACGACTGCTCAGGCGAGTTCGTTTCCCATCCGTCGGAGCTTCGCCAGACGCCGCCGTCCAGTCATCGGTGGTTTGCCCAACTCGCAAGAACAGCCGCCTAA

Protein sequence

MEIRAQPEETRGFHLIPVDWRNVERVWPVPMTNRRCRPLSKSWELWELEKIGSFAVSTVGHGPTCSSINGGESDLRVNIARSICFLRHCLRRRRMRSLGRSHKSSESSLGENNKLHENNGSPNRNKSSNSRLSSIDKLSTNTSAAASSSLQKKTLPLLQPPAASVTALAAAAAPIHAKHAAASFLALTPPHHPRRRTNRHPIHQSPNDCSGEFVSHPSELRQTPPSSHRWFAQLARTAA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 102..140
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 203..226
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 189..226
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 96..140

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
MS027262MS027262gene


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MS027262.1-cdsMS027262.1-cds-scaffold1474:288303..288577CDS
MS027262.1-cdsMS027262.1-cds-scaffold1474:289792..289940CDS
MS027262.1-cdsMS027262.1-cds-scaffold1474:297345..297640CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
MS027262.1MS027262.1-proteinpolypeptide