MS027262 (gene) Bitter gourd (TR) v1

Overview
NameMS027262
Typegene
OrganismMomordica charantia cv. TR (Bitter gourd (TR) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold1474: 288303 .. 297640 (+)
RNA-Seq ExpressionMS027262
SyntenyMS027262
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
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ATGGAAATCAGAGCCCAACCTGAGGAGACGAGGGGGTTCCATCTGATTCCAGTGGATTGGAGAAATGTGGAGCGCGTATGGCCAGTCCCAATGACGAACCGACGTTGCCGTCCACTCTCCAAGAGTTGGGAATTATGGGAATTGGAGAAGATTGGGAGTTTCGCAGTGTCCACAGTCGGCCATGGCCCCACGTGCTCCTCAATTAATGGTGGTGAAAGCGACCTGAGAGTGAATATCGCTCGTTCAATTTGCTTTCTTCGTCACTGCTTAAGAAGGTTCACTTTTCTGGATTTAGTTTCAACCAATTTGGTTTTGAAATCTTAACTAAATTATTCGAAACCCACTTTTAGTAGAGGGATAATTAAACTACGTTCCCTCTCAGTTCTTAGTTCATTTTAGTTTCATGCTAAAATTTTGATTCTCTTGTCACCAAGCAAATTAATGAAATCAATAATATATATTTTTTCAGTACAACGAGTGGGAACTGATAATCGAACTCGACCTCTTGATTAAAAACATATGTCGAATTAAGTTCATATTAATTGGAATGATATTTAAAACCAAACGTGGAATAATTTGCATAAAACTATTTTTTGTATGCAAATTAATAGTAAGAACTAAAACAAATTAAACCAAAATAATTACTAAAGAAAATTATTCATTTTTAACATTAAATACAAATGAATGAAAATAATGTTGTATTGCATTAATTGAATTCTTCCTATATTAAGTCTTGAGAAGAGAATTCTAAAGTCTAGTAAATAAATTCCTACAAATCAAATAATAATACTCCATCAACTATTCAATGAATCACGTTTATGTGGAAATTCAGAGAGTCCAAGATCTACGGGAGCTGACTAGCACCTCAATGGAGCGAGTTATGCAAGAAGACCTGCATGCAAATAATAAGTACTCTGACGTTCAAGTCATTCAAATGTTTGAATTCCTAGGTTAGTCCCCAACATAATTGCTTACCTAATTGAAGGGAGTGGTGATGTATTTTTAGGGGTTAGGAGGGAATCTTTGTGTTACGCCGGCGGTTAACTTGTTACGAAGATTGTTGAACAACTTCTAACTGTCTTTCAAGGCTGTCAGATTCCCAGCTCGAGCTGGACGAGCTTAGGTACATTTTGCCTTACCTAGGACTTCAAGTGTCTTCCACCTAGCTTTAATGAGAGTTATTAGCCGACAGAAGTCAAGACGTCGAGTGGACAGAAAATGATGCACTTGAGTGCTTTGTCTTTCCACATTTAGACAATCTACATCACTGATCGAGGGTGACATGGACGACTGGGATCAATCCATCTCCCTTTATATAAACCTGAAACTCTAACTCTCAAAATTCATGTTTTCTGAATCATTTTACTCTCAAACCAAGAAACTCTAACTCTCAAAATTCATGTTTTCTGAATTATTTTACTCTCAAACAAAGGTTGGTGGCTCGCTTACCATTTGTTTGTAATCTATTGTAGTTCTTAGTTATGTATAGAAGGAGGATGAGGAGCTTGGGACGGAGTCATAAGTCGAGCGAGAGTAGCTTGGGGGAAAATAACAAGTTGCACGAGAACAATGGTTCGCCCAATAGGAATAAATCCTCTAATAGTAGGTTGTCCTCTATCGATAAGCTGTCCACTAACAGTTTCTCTGAGGACAACTTTGAGACATAGAATATGGAAATTCAAGTCTGCGAAGACCGACCTTGCACCTCAGAACGAGACTATAACAATCAGTCCGAGCTCGCCGATGAGTTTCTAGCCTTTACATAGAGATGAGGTTCCCAATCAAAAGCGATATCATAGAATATCCACTTGAAAGACACGTAACCTTCTACCTCAACATGTTTGAGTTCAAGGTCCAACTTCCCCTCCACCCCAAGATTTTTTGGTAGAGGTGAATCTATCACCAACTCAAATAGCTCCCAATAATTGAGGGATCTTGCTTGGTTGTTGGATGTTGTGGTGGGGGGTCGATGTAGTATAGATGACTCAAAGTATTTGAATCTCGACCAATTTTAGTCAATTTATACTATAAAGACCCTACCTAAATACCTAGGTAGATTTTATCTAACTGCTAAGCGAGGTGTGGGGAAGCTAGTCAAGGGCCCCTCTCCATTAAGGATTGAAAGAGGGACAAATGAGTTTGATGTATACGGTGACTGGCTAGCACGAGATTCTGATGGCGAGCTGAGTTATCAAGTCCCCACAGCTTCAGTAACTTAGATAATGTCTCTCTCTTGAGCTTGCTTTTCCTGTGTTTAGCACTAATTGAAAATTTTATTTTGTAGTTCTTCCCAAACCAGTGCTACAAAGGAACGAACTCACCCAATGATGCTCCTGATGAGGGGGCTCGCAAGAAGACCCCTATGTGCGAAGTGGCGTAAGCCGAGCAAGGAGTATCTGAGTGAGATATCAAGGCGAGCCCTATCCAAACAGTGCATGCCTCTCCCTAAAAGAAGAAGAAGAAAAAACCTAAAGGAGCTTTGAGCAAGCCGAGCAAAAAGCCACCACCCATGCTGCACACCTCGACAATCTTTCAGCAGTCTAGATGATTGGGGAAGCTCTAGACTTTCAATTCCCCTTCCGAAGTTAGCCAACTCTATAAAAAATTAACTCACTGACGTGTTGGGTGGTGTGGGTGAGCTCTGACCGATCTCTTGCTCGTTTTGAGCGATTATCTAGCTCGTGGTCAACCATGCTAGCTGCTCAAGTAACTGTTCAGTTGAATAACTTCTTCTTGTTTAACCCGATACTAATCTAGCTCTTTCCTATAGGCTCATGCTCTTCCCTACAAGACGTTAGCCTTGGTAGCGGCTGAGCTACTTGGGCGCTAGTAGTGGGTCAAGCGGAAGAAAGCCAACTTTGCCAAGGCCATCAAGGAGATTGAGCACGCTTGAGCTGAGCTCAAGGACGCAAGGTCCAAACTACTGGAGGTGGTGCATAAAATTGGCGACCTTGAAATCAACTTAGAGACTTTGAGGAAAGAGGTAAAAAGTGGCCAAGATATGATTCGGAGGGCACAGACGCAAATCAACAACTCCAACGCCGAGTTGACAGACCTAAGGCTTGAAGTGACCAACCTCAAGAAGGCAAAGGCAAAAATGACTGAAAAACCTAAAGAGCAAGGCATACTTGGATACCACCTTCTAGAAGCTTCCCTCTTTCATAAACTTCAACGAGAGCTTGCAGACGACAGCTTCAAGTTCGCTCTCGTCTACTTGGAGAAGTACTTCTACATCAAAGGATGGACATGTTCGAAGATAGAATTGAGGCCCCTAAGGAGGCCATCCAGACGTACTTGAAGAAGCTAGATGAGCTTCCTCTTGTCGACCTGACTTAAGACGATCCAGTGGCTAAGGCTGCAAGGTTCGAGCTTTTTGAGGTCAAAGCTCCAATGACCGATGCTAACAAGAACGCCGCCTTCTGATCTCCTGCTTTACCTTTCAAGTTTTTCTTCCTGAAGTTAAAGCACATATTTCCAACTAAAAGATAATGAGTCCAAATCTCCACCGTCCTATGTTTTACTAAAACAAAAATCAAAATTGAAAGGTTATATATATAAGATCTCAAACTAAAAAATTTTGCCCTTCCCTATGAAATTTTTTGACTCCACCCTTAGACTAATTAACTCCCGATAACCATTCAGCCATGTATATATATTTTTTAGTGCAACAAATGTAGGGTACGAAAATCTGAATCTGAACCTTAAGAAAGTGAATTTCTTTTATCGTTGAGGTATATTCATGTTAATCGATTTGTATATATATTATGTTACGGAGGAAAAACCTTTTCTTTGTACGACAAAGTGGAGGTATGAGAATTTGGACCTCAAATCTTTAAAAAAAGAATAGATATAATTTGCTATTAAACTATGCTTATTTTAGCTCTATGTTACTATTCTGCCGTGTTTTTATTTTATTTTTATGAAATTAAAATATGTTGTGTTTATATGTGTGTGTATATATTATAGTACAACAACTGGGGGTGAGGAATCGAACTCAGAACCTCTTGGTTTGAGATATATATTAATTATCACTGAGCTATGCTCACTTTTTAACTGTTGTATTTTAATAAAAGTTAGTTGTAAGTCGTTATTTAATTAATTCTCTAAACTTGGATTATCATTTAATTTTTTTTAAGCACAACATATGAGTAAAGATTCGAATTTAGTCGAGTACTAATTATCGTTGAGCTATGCTCACTTTGACGATTTTATTTTAGGTTCTTATAGCTTGGATGTGATAAACCATTCCAAACAAAACTGCATTAACTAGTATTAATTTTTTGTATATATAAACAAATTTAATACCAAGTTTAGATTAAATGTATCATTTTAGTCTCTAATTTTTCAAAAGTTGTAATTGTGCCTTCAACTTTTGTGGGAAAAAAAAAAGAAAAAAGAAAAAGAAAAAATACCGCTGAAATAAAATAACAAGAAAGTGATGTTGAATCTATCTCATCCATATCCAATTTTGATGCATTATTGGTTTTATCCTAATTTTGATTTCTTTTTTCGTATCACTAGAGGTTGAATAATTAGAGGGGAATCTCCATATAGGGTAGTTTTATCTTATCATACTCCCACTTTTATGAAATTTAACTTTCCCAATTTATGGTTGACAGATTTTATGGACTTCTTCTTTTCCTTGACAAGTGTTTGTCAAACAATTTCGATAAAAAGAAAAAAAAGAAGGCGTTAAGAAACCTTCCTGGTTCAATTCTAGATGCTCTAAGATCATTTTTCAAACCTATTCCTCACTAATTGAGCGCTCTTGTGTCGAAGATGCACGGGACTAAGCAATCAGAAGTGAGATTGTCAGCTTGAGTAATGCAGAAATTGGTGAGAATCCAAAATGCCTTGGAAACCTAGGGGTTCCTCTGCCAGGAATATGTTTACATTTTTTAATACTTACAAGTATTTCCACACGTGTCTTGCGTATGGTATCTTAATTTTATTTTATCATATATTAATGTTAATTTGAATTTTATAAAAGTTGAGCATAT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mRNA sequence

ATGGAAATCAGAGCCCAACCTGAGGAGACGAGGGGGTTCCATCTGATTCCAGTGGATTGGAGAAATGTGGAGCGCGTATGGCCAGTCCCAATGACGAACCGACGTTGCCGTCCACTCTCCAAGAGTTGGGAATTATGGGAATTGGAGAAGATTGGGAGTTTCGCAGTGTCCACAGTCGGCCATGGCCCCACGTGCTCCTCAATTAATGGTGGTGAAAGCGACCTGAGAGTGAATATCGCTCGTTCAATTTGCTTTCTTCGTCACTGCTTAAGAAGAAGGAGGATGAGGAGCTTGGGACGGAGTCATAAGTCGAGCGAGAGTAGCTTGGGGGAAAATAACAAGTTGCACGAGAACAATGGTTCGCCCAATAGGAATAAATCCTCTAATAGTAGGTTGTCCTCTATCGATAAGCTGTCCACTAACACTTCAGCTGCCGCCTCCTCTAGCCTGCAGAAGAAGACGCTGCCACTGCTTCAGCCGCCGGCGGCATCCGTCACTGCTTTAGCCGCCGCTGCTGCTCCCATCCACGCAAAACACGCCGCAGCATCCTTCCTGGCTCTCACACCGCCGCACCATCCACGCCGACGCACGAACCGCCACCCCATCCATCAGTCGCCTAACGACTGCTCAGGCGAGTTCGTTTCCCATCCGTCGGAGCTTCGCCAGACGCCGCCGTCCAGTCATCGGTGGTTTGCCCAACTCGCAAGAACAGCCGCCTAA

Coding sequence (CDS)

ATGGAAATCAGAGCCCAACCTGAGGAGACGAGGGGGTTCCATCTGATTCCAGTGGATTGGAGAAATGTGGAGCGCGTATGGCCAGTCCCAATGACGAACCGACGTTGCCGTCCACTCTCCAAGAGTTGGGAATTATGGGAATTGGAGAAGATTGGGAGTTTCGCAGTGTCCACAGTCGGCCATGGCCCCACGTGCTCCTCAATTAATGGTGGTGAAAGCGACCTGAGAGTGAATATCGCTCGTTCAATTTGCTTTCTTCGTCACTGCTTAAGAAGAAGGAGGATGAGGAGCTTGGGACGGAGTCATAAGTCGAGCGAGAGTAGCTTGGGGGAAAATAACAAGTTGCACGAGAACAATGGTTCGCCCAATAGGAATAAATCCTCTAATAGTAGGTTGTCCTCTATCGATAAGCTGTCCACTAACACTTCAGCTGCCGCCTCCTCTAGCCTGCAGAAGAAGACGCTGCCACTGCTTCAGCCGCCGGCGGCATCCGTCACTGCTTTAGCCGCCGCTGCTGCTCCCATCCACGCAAAACACGCCGCAGCATCCTTCCTGGCTCTCACACCGCCGCACCATCCACGCCGACGCACGAACCGCCACCCCATCCATCAGTCGCCTAACGACTGCTCAGGCGAGTTCGTTTCCCATCCGTCGGAGCTTCGCCAGACGCCGCCGTCCAGTCATCGGTGGTTTGCCCAACTCGCAAGAACAGCCGCCTAA

Protein sequence

MEIRAQPEETRGFHLIPVDWRNVERVWPVPMTNRRCRPLSKSWELWELEKIGSFAVSTVGHGPTCSSINGGESDLRVNIARSICFLRHCLRRRRMRSLGRSHKSSESSLGENNKLHENNGSPNRNKSSNSRLSSIDKLSTNTSAAASSSLQKKTLPLLQPPAASVTALAAAAAPIHAKHAAASFLALTPPHHPRRRTNRHPIHQSPNDCSGEFVSHPSELRQTPPSSHRWFAQLARTAA
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
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InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 96..140

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MS027262.1MS027262.1mRNA