MS021971.1 (mRNA) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAAGGTGGTGGCATTGGTGAGCGGCGGCAAGGACAGTTGCTTCGCCATGATGAAGTCTATTCAATACGGCCACGAGGTTTCGTTTTCCTTTCAGATTTTGCCTCTTAATTCATCATCCTTGTCTTCCTTTCGAGAACAATGTAAATTGGCCGTTGTAAGCTTGCACTGCTGCTCAGTTAATGTTGTTCAATGTCTGTTCTAGATTGTAGCGTTGGCTAATTTGATGCCTGCCGATGATTCCGTGGACGAGCTTGACAGCTACATGTATCAAACTGTACGTCTTTCTGTTTCTGACTTCCTCCTTAGGCAAAATACGGATGGACAAGTTCACTTACATTTTGAAGTAAATGGTTGATATGATTTGGTTTATGAGTTATGACAGTAAATCGTTGCCCTTAATCATGAAAGTGATTGTTTATGTTTTTTAGTTTTGTACTCTCCAACTAGAGCCCTGTCTTACATTTTGAGACATTCTCCATGAAAAAACAGGTTTAAAGTGTTCATTTCGTTGGAAATAATTATGAGTTTCCTGTATAATCGTCATGATTATGTTATAACTGTTTCCTTATCATTTTCAAAACGGCAATAAGAACTAAATACCTGCATCGGTAATTGGGTTGGCAAGGTTTAATTTTCTCTATTTTCCCCTTCTTTTCTACCAGGAAGATTTTCTTTTATATGACTTTGAGATTCAAGTTTGTTATAAAACCGTTCGCTTGACCCTTGGGTTACCTTACTTCTTTGAACTACTGTTGATATTTTTCTTATAGACACCGAGCTATAGGTGTGTTGAAAGCTAGATGACCCAAAAAAATTGATTAACTCAATGTATTGGGTTATAACCTTCTTTGTTTTGGTTTGGGTTTAAACAAATTGAACACTTATTAGTTGGTTTATGGGTTCTCCTAATTATTTTTGGTCTAAGTGAACCAACCTAAATTATTATTAATTGAAAAGATAGATAAATTTACTTTTTCTATTTATTACAAAATTTTGAACAAATAATTTTGACAACCCAAACTGAACCTACCGAAATATTCTATGGTTGGGTTGCGTCCATTTAATAAGGGTTTTTTAGATTACAAAAATTTGCAACTTGAATGATTAAATAGAATCGAGTCTAAAAATATCTAAACCAAACCCAACCCAACCCAACCCAACCCACGAATACCCCAATGAGTTACCTCGCTCCTTTGAGTTCTGAATTATCTCACTCCTTCTGGGTTTATATATTTTTTATCCTTTTTTTATCCTTTTTTTCATTTGAAAGGGTATTCTAGGACTTTTAAATTTGTAATCTATGATTGCTAATTTGGGTTATTGGCCATATTTCTTCAGGTTGGACATCAAATTATTGTTAGCTATGCAGAATGCATGGGAGTTCCATTGTTTAGAAGGCGAATTCAAGGATCCACAAGGCAAGCTTTTTAAAATAAAATTCTTTGGCAAAGAGCATAAGCTTGGTTTATTATTATTATTTTTTTAAATAAGAAACTTGATACTTTTCATTAAAAAGACGGGAACATACAACACAATCATTCATGGTCAAATTTGAGAAAAGAGGATGTATGGTCTCAAATTAATTGATTCCTTGTATCACATGACTGGGAACTGATGTTCAAAGACTCAAGAGCTGTCTGAATGCCAAGACACACTTCTGACCATGTTACCTATCCTCATGGAAACATGAACTTTCAAATGGGGTCTTCCTGAAAATTTATGGCTTCATCCTTGTTTTATTTTGCTGTTTGAATCTTGGAGGTTGAAAACTAAAGTGAAAGGATGACCAAGATTCTCTTTACATAAAAAGCTCAAGAAGATGAAAGGGTTTCTCAAAGAATGGAGCAGATCAACGTTTGGCAATACCAAAGAGATTCTGGAAAATATTTCGGTTGAAATTAAAGAGTTTGATCAAATTAAAGAAGCTGATGCAATCCCAAAGCAAGATGGAACCTTGTAGGGGGACCTCAAGATCCAGCTGAAAGAATTGAGAGTTAGAGAAACAAGAAGATGGGCTTAGAAGTGATCTTGTCCTTTTTCATCTCCCTTTTCTTCCTATTTGTGCTCAACCTTTCGTTGAAGGTTTAAACTTGTTCCCCATCTTAGGGGGAGGGAAAGGCTTGAGCAGGCTTGCCCCCTTCACATTCATATTGGATTAAGAAGGCGGTTTTCAAAGCTTCCAAGGGGCAGCCCAATTGGCAAGGGTTTGGGGTCTCTTGGTCACACTGACTTAGAGGTCTCAAGTTCGAACCTTCTAGTGAGCTAAATACCAAAAATCTTTGATGTATCCTGATTTCGGGTCTTGGGGCGGGCACGGGTGCCCCTGTGTATAGGGGAGCAAAGTTCGGACTCCCAATTTTCAAAAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAGAGAAAAGAAAAAGAAGGTGGTCTTCAACTCTGATCGGAACAAGGCTCGGGTTCAATAGATTCACCATGAATTTCTTTCAATTGGGACCCAATTAAGGGGGATATGGGAATTGTGTTCAGCAAATACTATGAGAGAGGTAAAGGAGCGACTGCTAGGAGAGTGAAGCATTTTAGACTCATCAGCCTTGTCACTAACTTGTATAAGATTGTTGCAAAGGTGCTACCGGAAAGATTTAAGAAAGTTTTCCCTAGCACTATCTCACAGTGCCAAAAGCCTTTGTTGAAGGGTGACAAATTCCAGACAAGGTATTTATTGCGAATGAGGCGATTAAAGATTAGATGCTTAAAGTCCTTGATTTTCTTGAAGTGGATGGAAATCTTTCACCGGAGCATTTTGAGGAAAGGTGTAGGTTGAAGGGTCTGTTTGGTAAGATTCTTCGTAAGGAGGATCAAAGTTGGAGACAAAAAGCTAAGTTCAAATGGGCTAAAGAAGGTGACTGTAACTCCAGGTTTTTCCATAGTTTGGCTAATGGTAGAAGAGGTAAGAATGTTATTTCTTCCTTGGTTAATGAGTTTGAGGAGGTGCTGCGGGAGGATCAGAAAATTGAGCAGGAAGTGATTTTGTTCTTTAAGAATTTATACTCCCCAGCGCCGTGTTCCAGGCCTTTCTTGGAAGGTTTTGATTGGAACCCCATCTCGGTGTTAGAGAAAGAAAACCTTGAAGCTCCCTTCTCGTTAGAAGAAGTTTGTAGGGTTGTGTTTGGTTTCGATAGAGATAAGTCCCTTGGCCCGGATGGTTTCACTATGGCGTTCTTTCAGGATAACTGGGACGGAGTTATGGAGGACTTGATGAAAGTGTTTCGGGAGTTCCATGAAAGAGGGTTGATTGACGCTTCTATGAATGAGACGTATGTGTGTCTCATTCCGAAGAAACTTAATGCAGTCAAAGTCAAAGAGTTTAGACCTATCAGTCTGGTTATAAGCCTTTATAAAATAATTGCCAAGACCCTCGTTGACAGGTTTAGAAAGGTTATGCCGGCTACCATTTCAGATATGCAAGAGGCTTTTGTTGCAGGGAGAAATTTTGGATAAGGTGTTGATTGCCAATGAGGTGATTGAGGATTATAGAAAGAGCAAAAAAGAGGGTGTGATCTTTAAGATTGATTTTGAAAAGGCCTATGATCATGTGGATTGGGATTTTTTGGATAAGGTTTCGTGGAAGAAAGGTTTTGGCTACAAATGGAGAGGGTGGATTTGGAATTGCATTAGGTTGGTGAATTTCTCTATTTTGGTGAATGGGAGACCTAGGGGGAAAATCCTAGCCTCGAGAGGCCTCAGGTAAGGTGATCCTTTGTCCCTTTTCCTGTTTATTCTGGTGGTGGATATCCTGAGTAGACTTATCTCTGTTGGAGTGGAGAAAGGGGCTTTCAGCTTTTGAAGTGGGTAGGGAGAAAATCCGTCTCTCTCACCTTCAGTTTGCTTATGATACCATCCTTTTCTGTTCCGGCAATCTTTATGCGTTTAAGAATCTTAATTGCATTATTGGTTTCTTCGAAGCTATTTCGGGTCTGAAGATTACTAGGGGCAAGAGTTCTTTATTGGGAATTAATTGTGAGGACGTTAAGATTAGTGAGTGGGCGACTCTTGTAGGGTGTGAAGTTGGTAAGTTTCCGTCCTCTTATCTCGGTCTTCCGTTAGGTCACAATCCAAAGTCTGCTATCTTTTGGGCGTCGGTGCAGGAAAAGTTTCAGAAGCGTCTCTCTACTTGGAAGAAGGCCTTTTTCTCCTTAGAGGGAGACTCACTTTAATTCAATCTGTTCTCAAAGGCATTCCGAATTACTTTTTGTCCCTTTTCAGATTCCAGTGACTGTGAGTGAAGGGTTAGAGAAATTAATGAGGGATTTTCTTTGGGAAGGTGTGGAGGAGGGGGGTGGGGCTCATCTCGTTAACTGGAAAGAGGTGTCTAAGCCTCTGGAGGAGGGAGGTCTGGGCATTGGGAACTTGGTGATCAGAAATGAGGCTTTCCTGGCTAAATGGTTATGGTGGTTCTTCCACGAACCTAATGCCTTGTGGCGAAAGATTATAGTGAGTAAGTATGGGCTACATCCCTTTGGTTGGGTACCGGGAGATGAGGCTAGAGTAAGCAACTACAATCCCTGGAAGGCTATTGCTTTGGGTTTCCCTGTTCTCTCATTCTTTACGTGTCTCTGTGGGGGATGGTCTTAATACGTACTTCTGGGAGGATACTTGGATAGGCGACAAACCCTTGTGTCTTGCTTTCCCTCAGATCTACTTTCTATCTGATAAGAAACTCTTTTCAGTGGCCGAGGTTTTAAGTTCTGGAGAAGAGGGTTTGTCCATCTCTTGGGCTCACCCATTCCTTGACTAATCAAGAATCATCAGAGGTTTCCAATTTACTGGATCTGCTGTCTAGAGTTTCCTTATCTGTTGGGAGGGAAGATGTGAGGGTGTGGACCCCATCCTTCGAAAGGTTTTTCTTGTAGTTCTTTTTTCCATGTCCTGAACTTCTCATCGTCTTCTTCTTCTCCGCCCCTGTTGACCCCTTGGTTCACCTCGCTTTGGAAGATTAAAATTCCTAAGAAGATTA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ATGAAGGTGGTGGCATTGGTGAGCGGCGGCAAGGACAGTTGCTTCGCCATGATGAAGTCTATTCAATACGGCCACGAGATTGTAGCGTTGGCTAATTTGATGCCTGCCGATGATTCCGTGGACGAGCTTGACAGCTACATGTATCAAACTGTTGGACATCAAATTATTGTTAGCTATGCAGAATGCATGGGAGTTCCCCTCTTTCTAATGGTTATTATTTTCTGGAATTATTTTAGGCATCAAAAGCTTAACTATAGAATAACTCCAGGTGATGAAGTGGAAGATATGTATATTTTGTTACATGAAGTGAAGAGGCAATTACCTTGTGTCACTGCAATATGCTCTGGTGCCATTGCATCTGACTATCAAAGATTGCGGGTAGAGAGTGTTTGTGCAAGGCTAGGACTTGTTTCTCTAGCATATTTGTGGAAACAAGATCAATCATTGCTTCTACATGAAATGATAAACAATGGAATTTTGGCCATCACGGTGAAGGTTGCTGCAATGGGGTTGGATCCTGTGAAGCACTTGGGCAAAGAACTAGCATCTTTGGATTCAGATCTACATAAGTTGAACAAATTATATGGGATCAATGTATGTGGTGAAGGTGGAGAATATGAAACGTTGACCCTTGATTGCCCTCTTTTTAAGAATGCTAGGATTGTGCTCGATGAATACAAAGTTGTGATGCACTCGTCAGATTCCATAGCACCAGTGGGGATCCTTCATCCTGTTTCCTTCCATTTGGAGTATAAGGCAAAGACCTCTTCTGTTGGTATCTGTGACAACAGCAAGTCAGTTGACGATGAGAAAATGGATCTTCTATTTGAAATACAAGGAGATTGCTTTAACAGTTGCGACACATTACAGTCTATTGCTGATGCCACTGGTGCCAGTAATATACTTGATGATGTTCCAGATGACAGACTTCAAATTTCTTGTTCAAGGATGCACAATACATTTTCGATTTGTTGCTGGTTGCAAGATTCATGCGGCACTTCTCAAGGTCTGCAGGATGATCTAAAGACTGTTCTTAGGAAAATAGAATCAGAACTTCTAGGACGCGGTTTTGGATGGAAAAATGTGCTTTATATTCATCTTTATCTTGCTGACATGGATGCATTTGCTTTGGCTAATGAAGCATATGTCAGTTTTATAACACAAGAGAAGTGCCCTTTTGGCGTTCCATCACGCAGTACAATTGAATTACCTCTACTGCAAGTGAAATTAGGACATGCATATATTGAAGTTCTGGTGGCGAACGACCAAACGAAAAGAGTTCTTCATGTTCAAAGTATATCATCTTGGGCGCCTAGTTGCATTGGACCATATAGCCAGGCAACTTTGCATAAGGAAATCCTTTACATGGCTGGACAATTGGGGCTTAACCCTCCCACTATGACACTTTGTAGTGGAGGTGCTACAAATGAACTGGAACAAGCATTAGAAAATTGTGAAGCAGTGGCAGAATGTTTTAACTCTTCAATATGTACTTCTTCTGTTATATTTGTCACATATTGTTCTACTCATATTCAACCAGAGGAGAGAAGGAAAATACAGGACAAGTTGCATGGTGCACTCGAGGAAATGAGGCACTCCGATAAAGATAGTTTGTCAAAAGCGCTTGATACCATTTTTCTATATATTAATGTACCCAATCTTCCTAAAGGAGCACTTGTTGAAGTAAAGCCCATTCTATACGTTCAGGAGAATGTAGATACAGTAACAGAAATTGTTCACGACTTACCGAAGTTACATACCCCTAGATATTGGGGTTTCCAGCATGAACACTGGCACAATTCTTGCATTCAGAAATGCGTTGTTAATGGGAGGATATGTGCAGTTGTGTTGTCCGTGACAAATGAACTTGCTCGGAATATTTGTTCTTGCTCGCTAGGAAATCTGATTACCGAGGAGCACTTGGAATTGGTTTCCAAGTTTTGTATTTATCTTCTCAACGAAGTTCTCTTGGATAGCGCCCTCTTTTGGGAAGATATAAAGAATTTAAGGTTCTACTTCCCAACAAACCTTAATATTACTCTGGAGGTTGCTTCACTCATATTCTCACGTGCTTTCAATGAACTTGCGGTATCAAATCCAACTGTCGATGTTGGTCGGTTCTTCAACCTCATCCCAGTCTTGGGTGCAGGACGGACACCAACATCCATGGATAATATATTGACTTGCGAATTATTTGCTCAGAAATCC MKVVALVSGGKDSCFAMMKSIQYGHEIVALANLMPADDSVDELDSYMYQTVGHQIIVSYAECMGVPLFLMVIIFWNYFRHQKLNYRITPGDEVEDMYILLHEVKRQLPCVTAICSGAIASDYQRLRVESVCARLGLVSLAYLWKQDQSLLLHEMINNGILAITVKVAAMGLDPVKHLGKELASLDSDLHKLNKLYGINVCGEGGEYETLTLDCPLFKNARIVLDEYKVVMHSSDSIAPVGILHPVSFHLEYKAKTSSVGICDNSKSVDDEKMDLLFEIQGDCFNSCDTLQSIADATGASNILDDVPDDRLQISCSRMHNTFSICCWLQDSCGTSQGLQDDLKTVLRKIESELLGRGFGWKNVLYIHLYLADMDAFALANEAYVSFITQEKCPFGVPSRSTIELPLLQVKLGHAYIEVLVANDQTKRVLHVQSISSWAPSCIGPYSQATLHKEILYMAGQLGLNPPTMTLCSGGATNELEQALENCEAVAECFNSSICTSSVIFVTYCSTHIQPEERRKIQDKLHGALEEMRHSDKDSLSKALDTIFLYINVPNLPKGALVEVKPILYVQENVDTVTEIVHDLPKLHTPRYWGFQHEHWHNSCIQKCVVNGRICAVVLSVTNELARNICSCSLGNLITEEHLELVSKFCIYLLNEVLLDSALFWEDIKNLRFYFPTNLNITLEVASLIFSRAFNELAVSNPTVDVGRFFNLIPVLGAGRTPTSMDNILTCELFAQKS Homology
BLAST of MS021971.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022149926.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1451.0 bits (3755), Expect = 0.0e+00 Identity = 720/736 (97.83%), Postives = 724/736 (98.37%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. NCBI nr
Match: XP_022149928.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X2 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1300.8 bits (3365), Expect = 0.0e+00 Identity = 640/647 (98.92%), Postives = 644/647 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008441829.1 (PREDICTED: diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1283.5 bits (3320), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/736 (86.01%), Postives = 674/736 (91.58%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038889528.1 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1279.6 bits (3310), Expect = 0.0e+00 Identity = 630/736 (85.60%), Postives = 676/736 (91.85%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. NCBI nr
Match: XP_004152819.2 (diphthine--ammonia ligase isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1279.2 bits (3309), Expect = 0.0e+00 Identity = 630/737 (85.48%), Postives = 676/737 (91.72%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9USQ7 (Diphthine--ammonia ligase OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=mug71 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 296.2 bits (757), Expect = 1.0e-78 Identity = 187/505 (37.03%), Postives = 277/505 (54.85%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A2RV01 (Diphthine--ammonia ligase OS=Danio rerio OX=7955 GN=dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 275.4 bits (703), Expect = 1.9e-72 Identity = 143/259 (55.21%), Postives = 183/259 (70.66%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7L8W6 (Diphthine--ammonia ligase OS=Homo sapiens OX=9606 GN=DPH6 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 262.7 bits (670), Expect = 1.3e-68 Identity = 143/257 (55.64%), Postives = 180/257 (70.04%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q2HJF5 (Diphthine--ammonia ligase OS=Bos taurus OX=9913 GN=DPH6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 262.3 bits (669), Expect = 1.6e-68 Identity = 146/275 (53.09%), Postives = 187/275 (68.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5M9F5 (Diphthine--ammonia ligase OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Dph6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 260.0 bits (663), Expect = 8.1e-68 Identity = 143/261 (54.79%), Postives = 177/261 (67.82%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D9W6 (Diphthamide synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018223 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1451.0 bits (3755), Expect = 0.0e+00 Identity = 720/736 (97.83%), Postives = 724/736 (98.37%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1D827 (Diphthamide synthase OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111018223 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1300.8 bits (3365), Expect = 0.0e+00 Identity = 640/647 (98.92%), Postives = 644/647 (99.54%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4Z6 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1283.5 bits (3320), Expect = 0.0e+00 Identity = 633/736 (86.01%), Postives = 674/736 (91.58%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKJ7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G075360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1279.2 bits (3309), Expect = 0.0e+00 Identity = 630/737 (85.48%), Postives = 676/737 (91.72%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3V7 (Diphthamide synthase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485878 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1272.3 bits (3291), Expect = 0.0e+00 Identity = 630/736 (85.60%), Postives = 671/736 (91.17%), Query Frame = 0
BLAST of MS021971.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G04480.1 (endoribonucleases ) HSP 1 Score: 852.4 bits (2201), Expect = 2.6e-247 Identity = 439/740 (59.32%), Postives = 548/740 (74.05%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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