Lcy10g005400.1 (mRNA) Sponge gourd (P93075) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACTGCTTTAAAAGAAATACCCAAGAAAATGGTAAAAACTTTGTTAAACTACTGCACTTCTCGAAATAGATTTTAAAATATAATATTTATTTGAAAGTCCATCAAAACTGAGTCATATTAACTAATGCGGCAAATAAAGAGGCTTTTGCCAACAAGAGCATAACTCAACATAAAGTTGTACTGATAACCACGACGTCTGTGGTTCAAATCCCCCATCCCATATTGTCAAAAAAATAAATAAATAAAAAGGCTTTTTTTTTCTTTATTTTATTTTATTTTATTTCGAATTCGGCAAAGAAAGTTATTTTTTATTTTTAGAACGCGAATAAAGAGTTCTTATGTGTAGTAATAATAGTTCTTTTCACCTTTGGAATAAAGTCAATTTTATAAACAGAAAAAAGAGAATATATATGCACAATTTTTTTTTTATATTGTAGTAGTTATCCACCATGATTATATTAGGTGCTACATTTATATGAAAATTTATTTCTTTATTACTTGAACTTTGAAATTTATTTCGAAACATGTCGTTGGAAACTTTAAAATTGGTCATAAAATTCTATTAAAAAAAGAATGAAAATTGACGTGACAGTCGATGCGTAAACATTAAACGGCGTACGTGACATTATTCACAACTATATAAAAGATTAAGATTGTTATTGCCTAATTTCGTTTTAAAAGATATTATTAAGGTCATTTACATAATCAATCTTTACACATCAATTTTCATACCAGGTTAATGATATTGTAATAATGACATAACATATATGTCTTTCAAATTTATTTCCATAGTTAAGGTAAAAATTGAAATATCTTGTCGAACTCCAATCATGAAGACCACCTTTTTTGTTTGTTTTTTTTTTCCTTCCATTGAAGTTGATGTGGTTTGTTTTGTTGTTGGAAAGAGTTGGATTATAGCAGAAGAATATAGCATGTTGATGCAGTTTTTCATTTGTCATTTTCAGAAAATGTAAAAATTGCCGGCGTTAATCTCCTCACCTCTAAAACACTTTCTTTTTGTCAATTGGTCCAACGTTTTTCTACTTGGAACTTTCATCACAAGCATCCATATAATTGCAGCCCTTGGCCGGCTTTTGCCTATTTTCCATTTTTCAATTTAAAACAATTCCGAGACTTTAATTTGTTTGGCATGATTTTCTAAGTGTTTAAAAAAGTGTTTTTAAATGTTAAAAAAGTGAAATCATTCCAAAAAACTAATTCAGACTAGAGGATACTTAAATGGATAATAGCATACCGGTGTGTAGGTATCTCCTTACATACCCACATTAAAATGCTGACAATTAAGGGAGATAAATCATTCTTCTCATTTTTCACGTTTCTCTCTCTCTTAGTTGTCAAGATTTTAATATAGGAAGATTTCACGCCGTTAAATATTATTCTTAAACACAATGCTTTGAGTATAGCTCAGAGGTAATTGACATGAATCTTGGATAAAAAAGGTTCGAATCTCCCACCCCAAATGTTGTTGTACTCAAATAATAATATTAATAATAATAATAAAACACAATGCTGTGAAAACTTCTTTACTACTGGAGATTTTATCCTCATTTGTGAATCTTTCAAGGACAACATAACATTTCTATTTGTTTGTTTCTTATTTTTCATTTTTTTATTTTTATTATTAAAAAAAATGTTTGGTAACGGTTATTATTATTATTTCTTATTGTTTCCTTTTTTTTAATTTAAAAAGTAAGAAAAGAGTAATATGTTTGGCAATTTTTTCTTATTCTCTCCAATTTTAAATTAATTTCTTTTATGTAAAAAATAAAAGTTTACATGAAAATTACTTTTTTAAAGTATAAAAGTCAAATTATTGTGCGATGTATAATTTTTAAATTATTATTACACATTTTATAAGTAAAAAAAATGATAAAATAGAATTTTTATTGATGTTTTTGAAAAACTATAGTTACTAGCTAGAAACCTAAATTTAATTTTTGTTATTTAGGTCCCGTTTGATAACCATTTGGTTTTTGGTTTTTGGTTTTTGAAAATTAGGCTTGTTTTCTTTAAATTTCCTCACCATAGTTTTCATTTTTGTTAAAGACATACTTGAATTCCTAACCAAATTCTAAAAACAAAAACAAGTTTTTGAAAACTATTTTTTTTAGTTTTCTAAAATTGGCTTGGTTTTTGAAAACATAGGAAGAATGTACGTGAAAAGCCAAAGAAACTTAGAGTCGGGAGTGATGTTTATAAGCTTAAAAACCAAAAACCAAAAACAAAAAACCAAATGGTTATCAAACGGGACCTTACAAACTTGGTTTATAGGTATATATCAAGAGAAGTGTTTGATCTATATGCAACTTTAGAGGAGATGATGGTGTTGGATATTATAAAAAATAAAATGTGAAAGAAAGTGATATTTATATTCAATTCATAAAAAGTTTCAAGATGGACAATTACAAATTTAACATATGGAAGTTAAATTTGGTGTTATAACTCAATTGAGTTATATTTACATATGTTTCAATTTTATTTAATTTTGTTCTTTGGAGTTACTAAGTTGCTAGCTTATAAATAGTAACTTGTTTCTTCATTTGAATCATCGCATTCCATTTGGAGCATTCTTCCTTCTTTCTTTGTTTCTTTTGATCTTGAGTCGAGTTGAGAGCAAATATCCAAGAGTTCTACCAGATCCGAGTAGTTCGAGGTTGCTGTTCTACCGGAATTAGTCGTTGTATCCTGCTGAGACGATCGTTGTAGCCTGCTTGCAACCTGTGCAGAGCGAATAATTGTCTTCAGGACAACGCTTTGTAAGTGTGCCTCGACTATTTAGTGTCAATGTATTTTGCAACATTTGTCATATATACAGTGTCTGTATTGTTATTTACACTGTAATTGTTAGTATCTAGTTTAGGTGTAATCAGTTTGCTAGTGTAATTCAGTTTTTATTTGAGCATATTTCCAACAATCTTAAGACAATTAGGCGAACTGATGGCTGCAAACTCCTCCATTAATGTTGCTAGTGCGACGATGGGATCGACCATCCTCAAAACTCATGCTGAAAAACCAGAGAAATTCAAGGGACAAAATTTCAAGAGGTGGCAACAGAAGATGATCTTCTACCTCACCACACAGAACCTTGCTCACATCTTGAAGGAAGATTGCCCAGTTATCCAACCAGAAGCTGTCACTCCTGAAACTGAAGCTGCCAAAAAAGCATGGATGCATTCAGACTTTTTGTGTTGCAATTATATCCTGAGTGGTCTTGAAGACACTTTGTATAGTGTCTACTGCAATGCCTATACTACTTCAAGGCTATTGTGGGAGGCATTAGGCAAGAAGTATAAGCTGGAAGATGCTGGTACTAAGAAGTTTCTCGTGGGAAAATTCTTAGATTATAAGATGATTGATACCAAGTTGGTAGTCAATCAGATGGAAGAATTGCAAATTATCATTAGTGATTTGCAAAGTGAGGGATTGGACATCAGTGAACCATTCCAAGTTGTTGCTGTGATTGAGAAGCTACCTCCTTCTTGGAAGGACTTCAAGTGCTATCTTTGAAGGATTGGAATTCCGTAATTCCATAAAGCGAAAGCGAATTGGGACCGTCCATAGTTAATTTTGTTTCCACCAAAATACCAATACATTGACAAAATTTAGAAAACTATTCTAAATCAATTATTAAGACTAAGCATACAACCTTAGAACTAATCTAAAGGGGAGAAGCAAACATACCGTCATTGTCGTCTCTGAAATATCAAGAACATCTTTCTTGATTTGGACCAAGCGTCAACAATTGGGACACCACCAATTGATCTTCCCCGCTATAACTTTGAGATTAGGAATGTAGTTATGGGACTACCTAATCTTGAATGGAAAAAACTCCAGAGAGAAAATTCTCTATAGAGTTCTTGGGTTGAGAGAATATGAGAGGGTCTTGTGGTGGCCATATGTTGTAGTACCTAAACCCTAGGTTTAGTGTTCTATTTATAGGAGAAAGACCATGAATAAAATATTCATTTAGGGGCTGTTTGAGGCACTGAATTGGTTATAATATCTGGTGGTTATAATGATCTGGGGATTATAATAGTCTGGGGGTTATAATAATATGTGTTTGAGGTGCAGATTATTATAGTATGGGATAAAATAATTTGTGTTTGGGGTGCAGATTATTTTAGTCTGGGATAAAATAATCTGTGTTTGGGATGCAGATTATTTTAGTCTGGGTTAAAATAGTCTGTGTTTGGATTGCTGATATGTTTAACATGAGATTCTAAATCAAATGTTCAAGTTGACTGTTTTTTTCCTGACTTTTTTTTTCCCTCATACAACATTGTATGTCAAATATTATATTTTGCAAATATCAATAAAAAAATTGTTTGGATTCAGTTGTAAAAAAAATAAAGTATTGGGTATACGGGTTAAATGATGTGTTTAACTTAAAAGGAAACAAAAATAACCTAAGGTTAGAGTTGATTTTCTTTGTTTTAGGGTCATGATTTTTTCACAGAAGAAGTCATTTTATGATTTCATATTGGAAAACCATATTTGTTTCATTTCTGTATTTTCAACGTAAAAAATGCTTATGTACAAAGAAATTATATAATAAAACTTCATATTTAATAAAACTCCATATTTATATATGTAGAAAGACAACTGAGAAACTGGTAAGTGTTTCTAACATGGAATGACCAAAAATCACTTTTTTCTTTTTCTTTTTTCCTTCTTTTTCATTTTCTTCCTCCATCTTTATCTTCTTCCTCCATCACCATCATCTTCATCTTATTCCTCCATTTTCATCTTCATCTTCATCATCTTCTTCCTCCATTTCCATCATCATCTCCATCTTCTTCCTCAACCTCAAACTTCATCTTCATCATTTTCTTCTTCCTCTAACCCTAATGCCGACAACGTTTTCAACGACTTTTCCGGCGGTTGCCAACAAATTTTTCGACGACCAATTTTTTTTTCCTCGTTTTCTTTCTTTTCTTCTTATTTTTTCTTTATTTTCATTTTTTATATTTT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ATGACTGCTTTAAAAGAAATACCCAAGAAAATGGAGCATTATGAGTGCATTAGTAGGATTCACAATGTGGTAAGATTTGTGAGATCTTCTCCCGCACGTGCTACGAAATTTAAGAAGTGTATTGAAATTGAAAAGATTACTTCTAAGAGTTTGGTGTGTCTAGATGTTTCCACTAGATGGAACTCAACATATATGATGCTTGAGGCGGCTACAAAGTTCCAAAAAGCTTTTGAAAGATTAGAGGATGAAGACTCAACTTTTATGAATGAATGTCAACCAACTAGAGAAGATTGGGAGTATGCTAAGATGTTGGTTAGGTTTTTGAAAGTGTTTTATAATGTCACTTTAAAGATTTCAGGCTCTTTATATACCACGTCTAATATGATTTTCCACCAAATTAGCACAATTCAAAATTGCATACAATTGAATTCTATGGATAGTGAAAATCATATTCTTTGTGATGTGGCTAAGAGCATGAAGTCTAAGTTTGAGAAGTACTGGGGAAATAATGAGAAGACTAATTTGTTGTTGTATGTTGTTGTTGTGTTGGACCCACGATATAAGTTGAAATTTTTGTTGTATTGTTTCAACAACTTGTTAGAGCCAACTTCTGCTAAAAGCATGACAGATAAAGTAGAGCAGGTTTTTAGACAACTTTTCCATGCATATAGTTCTACTTCATCTTTTGCTGGTGGTAGTGGTAGTGGCACTACATGTACAAGTGTCATTACTAAAGAAAAGGGTGGGGCTCAAACAATGGATGTTGATGATGAGATTTCAACCGTAGCATCTGAGTCTGCTTTTAGCACTGGAGGACGTGTAGTTGATTCCTCTCGTTCTTCATTGGCTCAAAAAACAGTTGAGGCTATTATATGCACTCAAAATTGGCTCAATTCCAACCCAATAGATATTGAGTTTTTCAATCTTCTGGAGGAAGACTCAACACTGGAAGAAGATAATGGTTTTACTTTGTTTTCTTTTTTGAATAAGAAACCCACTGGGTTTTATGGAATTGCTATGTATTTCGAATCTCGATTGGGAACAGTCAGCAAGAGGGAAGAACTTGAAACCCTAATTGACGACGTTGAAGAAGAAGATCAGTTTCAAAGATATTGCAGAGATGGAAAAAAAAAATTTAGGAAGAAGAAGAAGTTTCACGATTTTGGGGAGGGAAATTGCGTGGTTTAA MTALKEIPKKMEHYECISRIHNVVRFVRSSPARATKFKKCIEIEKITSKSLVCLDVSTRWNSTYMMLEAATKFQKAFERLEDEDSTFMNECQPTREDWEYAKMLVRFLKVFYNVTLKISGSLYTTSNMIFHQISTIQNCIQLNSMDSENHILCDVAKSMKSKFEKYWGNNEKTNLLLYVVVVLDPRYKLKFLLYCFNNLLEPTSAKSMTDKVEQVFRQLFHAYSSTSSFAGGSGSGTTCTSVITKEKGGAQTMDVDDEISTVASESAFSTGGRVVDSSRSSLAQKTVEAIICTQNWLNSNPIDIEFFNLLEEDSTLEEDNGFTLFSFLNKKPTGFYGIAMYFESRLGTVSKREELETLIDDVEEEDQFQRYCRDGKKKFRKKKKFHDFGEGNCVV Homology
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P08770 (Putative AC transposase OS=Zea mays OX=4577 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 5.8e-28 Identity = 103/346 (29.77%), Postives = 161/346 (46.53%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6AVI0 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os03g0733400 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 119.4 bits (298), Expect = 9.2e-26 Identity = 99/356 (27.81%), Postives = 165/356 (46.35%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q75HY5 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0583200 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 114.8 bits (286), Expect = 2.3e-24 Identity = 91/352 (25.85%), Postives = 155/352 (44.03%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B9FJG3 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 1 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os05g0239150 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 114.4 bits (285), Expect = 3.0e-24 Identity = 97/352 (27.56%), Postives = 165/352 (46.88%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0JMB2 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 4 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=Os01g0518400 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 110.2 bits (274), Expect = 5.6e-23 Identity = 65/218 (29.82%), Postives = 115/218 (52.75%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DZY7 (Putative transposase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold2406G00150 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 3.8e-91 Identity = 198/379 (52.24%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CXI1 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G004160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 344.7 bits (883), Expect = 5.0e-91 Identity = 197/379 (51.98%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BX83 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold863G001050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 1.4e-90 Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CR68 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold84G001050 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 5.5e-90 Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DAN8 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold237G001750 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 5.5e-90 Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. NCBI nr
Match: TYK28895.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 345.1 bits (884), Expect = 7.9e-91 Identity = 198/379 (52.24%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. NCBI nr
Match: TYK16593.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 344.7 bits (883), Expect = 1.0e-90 Identity = 197/379 (51.98%), Postives = 242/379 (63.85%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. NCBI nr
Match: TYK03730.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 343.2 bits (879), Expect = 3.0e-90 Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. NCBI nr
Match: TYK23433.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 1.1e-89 Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. NCBI nr
Match: TYK14363.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 341.3 bits (874), Expect = 1.1e-89 Identity = 196/379 (51.72%), Postives = 241/379 (63.59%), Query Frame = 0
BLAST of Lcy10g005400.1 vs. TAIR 10
Match: AT3G42170.1 (BED zinc finger ;hAT family dimerisation domain ) HSP 1 Score: 101.7 bits (252), Expect = 1.4e-21 Identity = 81/328 (24.70%), Postives = 149/328 (45.43%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (P93075) v1
Date Performed: 2021-12-06
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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