Cucsat.G21644.T2 (mRNA) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GGCTTCGTGTGGATATCTCACCTCTCTTGCATTTTGGATTTTGCCTGTCCTCAGTTTTTAATGAGAATTTTCTTTTTCTATTCACAAAATTATGTTATGTGATTTGTTTTATCTGTCACTGAGTATAATATTATTGTTAATAAAAAAAGTTCCTGTTGTAGTAAGAATGTTGTTTAATGATCAGATAATGGGCAGATGCATGAAAATCATCTATTACAGCTCCTTTTGGGGATAATACAGTGGATTGATCCTCCGGATGCTGTTTCGAGAGCAATTGAAAGTGGAAAATGTGAAAGGTTAGCTTGCACTTTTGATTTCTTCATGATCCTTCTGTTCAATATTTTGTCTGTTTTTCTCATGTACAATATCTTTTTCTTGGGTTAAGTGAAATGCTTGATGGTTGTCGTGCATTGCTATCCATTGCAACCGTAACAAGTCCCCTCTGTGTTTGACCAACTACTTAAATCAATCAGGTCAGTAAAAGAGCGTTCCTTGTGATTCAGTAACAAATTTATAGTCATGCTTTGTAACTATTCCATTTTTAATTTATATGGTTGGTCACGTTTGATCGGATTCTTTTGCATTGATATTCCAGACCGTTTGGCACCCTTCAACTGTTATCTAGTTTAATGGGTGAAGTTGTAAAGGTTCTTATGACCCATAACAGCGAGGAGGAGACGTGGAGTTGGCAGGCCCGTGATATATTACTTGATTCCTGGACAGCCCTCCTCATAGTATGTAGCACTCAATATTTAATAAATTGTCTTGTAATTGTATTAAGTTTGAACTAGTAAATCTTCATTACCAAGAACAATGCAGTTATGGGGTGATTGGATAAAGTTTGGCTAGTCAATCTTCTTCATTAAGGAGAACAATATAATTATTCTGCCTTGATTCTTCTTCCGTTCTTCTTTCAAACACTAGGAGACGTCCGTCTAAAAATTTTATCTTTAGATTGTCTTGTCCTAGTTTTTAGTGGAGTGTCTTGTCTTGTCTCTCTTATGCCTCTCATTTTCTGCTTTTAATGCTAAAAGGACCATTGGCTTCCAGAAACACTATTGCTTGCACTTGGTTGAAGATGAGTCACAGTTCTTAATTGCACGGATATTTATCTGTATATTTTAAATATTTCTGACATTGTATGATTTTGGAACTAATTATTGCAATAAGTAGTCTAAATTGAGATTTCTTTTGCCCTTGTTTTCTTCAGCCATTAGAGAGGTGTGGTCAGAATTCATTGCTTCCACAAGAAGGTATCAGCGCTGCTGCTAACTTGTTTGCTTTGATTGTGGAATCAGAGCTAAAAGGTGGTTAGAGCTTGCTTCTAAATTTGAGAAATCTTCTCTTAACTTATATTATTAGCTAATGGTGATATGGGGTCGCAGCTGCATCTGCCTCTGCATTAGATGACAATATTGAATCTGAATATTTTCAAGCTTCCGTTTCTGGTGAGAGAATTATAGTAACCTACTTTTCAAAACCATTATTGTGATAAATGATGTTCTACCTGCTACCATTTGTCACTATCTGCATTTTGTTGCTTCTGCAGCCATGGATGAAAGATTAAGTGCTTATGCTCTTATTGCGAGGGCAGCAATAAATGTCACAGTTCCCTTCCTCATAAGATTGTTCTCAGAGCGTCTCTCGAAGCTTAATCAGGTTCCTTTCCATGCACTAAGGATACCTTTGTGGAACATTCTACGATGTTAACTGCTTGAATAATGGGTTTGTTATTTAGTTTTCAACATTTCAAATGTGGAAAAAGAAAAAAAGAATTAGACCATGCTGGGTTCAGAGTTAACCTGATTTGTAGTTCAAGTTCATCTGTCATTTGACCCATCTAGCTCAAGGGGTACAATCATCCCATGCATGAGAGTCAGCGACTGATAAAGTGAAGTCCATATAAACTATTTGATATGTATAAAACGAAGTACAATGACCATTTGAAAGGTTCTTATCCTTAGGTACAAAACTACTTGACGTGTATATATTTTTTTCCAAGAAAAAACCTTTTGATTAAATTAGTCGTATGTCTTCAAGTAGTAATGGTGGAATCCCCCAAAATGTGATAGAAAGTGTTCAAGTGTGAGAATCAGAAACTGATCAAGCTTACACTAAAGTTATGATGCCTACAAGAAGAAATGAAATCGCTATTTGGAAGATGCTTGTTTTCAGAATAGAAGATTTTAGTTTTAAATCAACCTGTCTAATCTGTTCATGCTTTTATTTTTTGAAAAGCTCTTTATTAATATATTAATAATGAAACAGAAACTCATAGTACAAGAGAATTATACAATGAGCATGTAAACCATGGATCACGAGGTGCACCTAGGCATCTCAATTAGGTTGACACCCATAGCACCCTCGTCATATCCAAAGAAGCTAAAAAAACCAAAAACAAAGGTGTATGTCCAAAAGCAAAACAAAACAACTCAAAGGAAGTACAAAGAAATAGAAATAAGAAGACTAAACACACTAAACATCCAATTGAAGAAAAGACGACTGATTAGGCTTATATCTTGCACTGAGTCAATCTTGAAATCCTTGGTGAGGGAACACCATGAGGAGGCTAAAATTTTATTGACTCCAACGGGTTCTTACACCAGGAAGCTTGAAGGTGTTCATGCATTTATTAGTGAACTTTTTATTAGAAGAAATGAAATGCTATTTGGATGCATTTCATTTCCTCCTCAATCCACTGTTTGGGGAGAGGTCGTTTTCTCTTGTGCGCTAGTGTTTGTGCCACCTTATGGGTGTTCTGGGATGAGAGGAATAGTAGGGTGTTTAGGGATAAAGAGGGAGTGGAGAAATCTGGTCTCTTGTTCATCTTCTTGTTTCTCGTTGGGCTTCAATTTTGAAGACCTATTGCAATTAAGCTTTAGACATGATTTTGTATAGTTGGAGTCCCTTCTTGTTGAGGGAGTCCCTTTTTTTGTGGACTTGGTTTTTGCATGCTCGTGTATTCTTTCATTTTTTTTTTCAATGAAAGTTGTTCTTATAAAAAAAACGCTTTATTGAGACTGTGAGGGAGAGGGGGAAGGCATTGTTTTAGCAAATTTGGCATATGCGGAATTTGTAGATCTGTTGAGCATTGTGGAGAAGAGAGTACTCTCGAAACTCCCTTGGCTTTCTCTAATTAGTAAATATGTTATTTTAGACTTATCAATTTCCACGGAGCATGTTCAATTCTGATGTGAATAATTCACTTGAAAACTTCCATGTGGTTCTAGTTCTATTAATTTACCCATAAATATTCAGCAGTTTATATATCCTCCACGTCTGTGACAATAAGCCTTGTTTCTTAACTAACTTTTTTGGTTTCTTATTTTTATATCTTTTACTGTCTCCACATAATGCGAAGATTGATATATTTTTGTCGGTGGTGTTTTGTAGGGAAGGGGCATCATTGACCCAACTGAAACACTAGAAGAAATTTACTCACTTCTGTTAATAATTGGGCACGTGCTTGCTGATGAAGTGGAGGGGGAAACACCGTTGGTAAGCCTCTTTTTGGGCAACAAATTGTATTATTTATATGGTCTCTTTTTGCTTCCATCTATTTATAAAGTTTCTGTAGTATTTCTTGTAAAATTTACCATAGCATTTTGACATTCTCGCTGTTTCCCTATCTTTATTAGTTTGAGATGTTCAACTTGAGTATTGAAGAAAGGAATATTCACTTTTCAATTTTTAGGATTTGTTTGTCAACATATGGTTCTTCTCATTCCTGTTATTTATCTTAGACAAATTATTGGATTGGTTCTCTTGGTTAAGTGGTGATAACTATAGGACATAAGTTTTTGTTTATTTTTATGCATCATTTTATTATTTAGTGATACCATCAGAAATCAACAAAAAAAATCAAAGGCTTTGAGAATTATAAGTTAAATTATTTTCTTATGTTGCTCAAGATTGCCAGCTTCCTCTAGATTAGCAATCCCATATTGCACCTTGCTTGGATTTCGCTCGCACTCTTGATGCGAGTTCAGTGTACTTCGCTTGGTAGTGCAACTTATAAGGGTTCCTTCCAGTGAGTTGATGTTGACCTCTGATGAAGATGAAGAAAACAACCTTTCAGACAACTTATAAGGGTTCCTTTGTGTGCTTGGGATGGAGTTTGAAGGATGAAGAAATTCAAACTTGGAGCTAAATGAAACTTCCTCAAAACCTTCATCCTTCGTAGCTTGGTTTATTATGGCAATATCTAATGGATTTGAGAAATCATGAGTAAATAAATTACCTTGTACTTTGCTGGGTGGATTAAAAACAGAAATATCCCCGAAATTCAAAAAAGTGTTTCGTTTTCTTTCATCAGAAATCTCATTGGTTTCCGGAATGAAACTACACTTATTCTCCTTCACTTGAATCTTGGCTTCTAAGACATTAATGAAGTTGATACTTTCAGCTGCAATATTTTCTAATCCTCCAAATGAGCTCCAATCACTTCAAAAGTTTTATTACACCAATAATCAAAAGGTAGATTTTTTATTATAATCCACCCTCCATAGCGTTTCGAATATATTGGTCTTCCATGGATGAGATTGTTCCACTTTTCAAACTTTAAATGAAAGCCATCAAAATATTGCCATTTGCCTGGATTTTCAATGAACTCCTTCAAAAGACCACGTTCCAATTCAATCAGAGCATTGTCTGCAGATAAAGGGTTGATGATAACTTTTGAATCGAAAAAGAGTTCTAATGCTTCATTAATTTTTACCCAACTATCAAATTAGAAAAGTTTTGAAACAACCCAAAGATTATCAAAGTGCTTTGAAGACTATCGAATTTTTAATCCCCCAATATTTGCTTGAACTCTGTGATGCAGTATTGGAGAGAGATCCTGGATGTCTCTTTTGATTCTGCTATCTCTGCATAGCTTCCTTTCATACTTTTAATTGGCTGCTTCATGATGGTGTTGAACTTGGTGAGGAGAACCAAATTTTATATTCATGGACTTCCTTGAAGTCTCCCAACATTTTTCCAAAGCTTTTCCA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MGHTATHLVEMASRKDLTSIAQQPDVMMMISCLLERLRGAACALEPRTQTSIYELGFSVMNPVLVLLAVYKDESAVVYMLLKFVVHWVDGQINYLEARETATVVDFCMRLLQLYSSHNIGKISLSLSSSLLNEAKNEKYKDLRALLQLLSNLCSKDLVDFSSDNSDVPATDISQVVYFGLHIISPLISLDLLKYPKLCRDYFSLLSHLLEVYPETVAKLNHEAFAQVLRTLDFGLHHQDTEVVDMCLKALKSLASYHLKEIGSGKIGLGSQVITRKDASDSEAVQEGILSGFLKSLLQLLLFEDYSPDLVGNAADALFPLILCDQGLYQKLATELIERQENPIFKSRIVNALHSLTSANQLSSVLDRINSQRFRKNLHNFLIEVRGFLRTV Homology
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZMR9 (Exportin-4 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=XPO4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 167.5 bits (423), Expect = 2.9e-40 Identity = 105/393 (26.72%), Postives = 198/393 (50.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q499Y0 (Exportin-4 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 167.5 bits (423), Expect = 2.9e-40 Identity = 107/393 (27.23%), Postives = 198/393 (50.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ESJ0 (Exportin-4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Xpo4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 166.8 bits (421), Expect = 5.0e-40 Identity = 106/391 (27.11%), Postives = 198/391 (50.64%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C0E2 (Exportin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 166.0 bits (419), Expect = 8.5e-40 Identity = 107/393 (27.23%), Postives = 197/393 (50.13%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q802D3 (Exportin-4 OS=Danio rerio OX=7955 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 163.3 bits (412), Expect = 5.5e-39 Identity = 107/391 (27.37%), Postives = 197/391 (50.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. NCBI nr
Match: XP_011660267.1 (exportin-4 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 750 bits (1936), Expect = 1.94e-262 Identity = 391/391 (100.00%), Postives = 391/391 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. NCBI nr
Match: KAE8653609.1 (hypothetical protein Csa_007263 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 750 bits (1936), Expect = 1.77e-261 Identity = 391/391 (100.00%), Postives = 391/391 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. NCBI nr
Match: XP_011660266.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 750 bits (1936), Expect = 4.51e-261 Identity = 391/391 (100.00%), Postives = 391/391 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. NCBI nr
Match: XP_008443789.1 (PREDICTED: exportin-4 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 744 bits (1921), Expect = 3.58e-260 Identity = 387/391 (98.98%), Postives = 389/391 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. NCBI nr
Match: XP_008443788.1 (PREDICTED: exportin-4 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 744 bits (1921), Expect = 8.26e-259 Identity = 387/391 (98.98%), Postives = 389/391 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B9M8 (exportin-4 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487293 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 744 bits (1921), Expect = 1.74e-260 Identity = 387/391 (98.98%), Postives = 389/391 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B9L0 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487293 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 744 bits (1921), Expect = 4.00e-259 Identity = 387/391 (98.98%), Postives = 389/391 (99.49%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HMV7 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466059 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 698 bits (1802), Expect = 3.40e-241 Identity = 364/391 (93.09%), Postives = 376/391 (96.16%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F4P1 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440841 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 694 bits (1790), Expect = 2.18e-239 Identity = 361/391 (92.33%), Postives = 375/391 (95.91%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644.T2 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ73 (exportin-4 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024872 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 685 bits (1768), Expect = 2.24e-237 Identity = 358/391 (91.56%), Postives = 371/391 (94.88%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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