Cucsat.G21644 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGCTTTTGATAATGAAAAAAAACTGTTCTTGTTAGATTCTGCTCACCAGGTAACGTGGCTTTGCCTCCAGCTTACCTATGCCTTGCCATTTGAATACATAGTCATTAACTCTTCTCTTCAGCGTTCACTTGCCCAAACATTAGTGCGTTCAGCTTCTGGGGTGAGAAATATCGAATCATCAAATCAGTGAGCACTATAATCCTCTGCTACTTTCTCATTTGCTTTATTCTTACATTCAGATCCTTGCCATGATCACGGTTTTCATTTTGTAAGGTATGTAAGGGACCTTATGGGCCATACAGCAACACATCTGGTCGAAATGGCTAGCAGGAAGGATTTAACAAGTATAGCTCAACAACCTGATGTTATGATGATGGTAATTTAATTTAAAAAATATTAAATGACCACTTCATGTGAAGTTTCGAGTCCCTTGTATATAGAAAAACGATACTGGTAATCTTAGTTTGGAATTTGTTTCCTAAAGTTTTGATGGGTTCAATGATGGACAAGCATTGTTCTCAATTAACATTACACAGTACTATTCTTTTTTTTAGAAAAAAATAAAACATCACATTATATTTGCAGATAAGTTGTTTGTTGGAGCGGCTTCGTGGAGCTGCTTGTGCTTTAGAACCTCGGACTCAGACATCAATTTATGAGTTGGGATTTTCTGTTATGAACCCTGTTTTGGTTCTTCTTGCAGTTTACAAAGATGAGGTACACAAATTTCTGTATCCATAATGGTTTCGTTTATTGATAAACACTGCTGAGTTTTCTACCATAAAAAATAAAATTAAGGGGGCGGATTGAGCTACCATTTGGAAATATATACATTCTTTTTTTAAAAAAGAATAGTGAGGTTAAGCAAGGAATGTCATAACAGAAAGTTATTCCTGATTCATCCTAAAATCATTTTGAGAACTTCTGTGGTTGGTTGCTTTTAGATAAGTAATGAAAGATTGAATAGTCATTTCAATTTAAACAATTTTAATTATATTATCCTTTTTTTCTTTTTGGATAATACTTAAATTTATTTTTTTCATAATTTATTCTACTGATTCATTTTTTTTTGTTTCCTATATGGATTATCTTTCTAGTTAGCGTGAAGGGGAAATAAAATAATGGTGTTGTTGTGGGTCAAATTTATAACATACTATAAAATTGAACATCCCATATGCCTTGAAAGTCTTTCAATGTTAGAAAATGGTGTACCTAAAAGTTGCATATATCTCTCATTGATAAAAAAATATATTTATAAAAATGGCAATTGCTTCTGGGTTCTGTGGTTTGGGTTACTTTGAAGTTAAGTCACATTATGTTGTACCTTTTAAATGGTATTCAATCAGAACCTTTTCAGGTTCTTTTTGTCTGTGAGTTGACATTTAGATAGAAAGATCTACACCAAGAGATTCACTAGGTGCCTTAAAAAATGTATATGTGCTGGTTCTACAATTTATTTTATATATACTGATGGATTATGTTTTATTAGTCTGCAGTTGTGTATATGCTACTGAAATTTGTTGTTCACTGGGTGGATGGTCAAATTAATTACTTAGAAGCTCGAGAAACAGCTACTGTTGTTGATTTTTGCATGCGTTTGCTCCAGCTGTATTCATCACATAACATTGGCAAGGTAAGTTTCTACTTTATCCAATTAATTTGTAAATATTATTACTTAAAGTTTAGATCTCCTGTTAGATAGAGTTGCACATTTTAGTTTATAGTAATTTAGTTAAGAGAAATCTAGTTTTCCTTGGAAGTTAAAATCGTTGGACTCTCAACCCCTTCTATTCTTGGCCCTTGGGATATTAATAAAATTTAAGGTCTTTTTGGTAGAGAAACTAAAAACAAAGATTTGAAAACAAGGAATTAAATGAAAACAGAGTTGTATTCATGTTTTCATACACGTGTTTGGTAGAAGAATTCAGAAATTAAATTCTTATTTATCAATTGTAGACTAGTTGTAGTTAAACACTAAATATTAGTTAGTTGACTAGAAATTATTATTAATTTATTTATGTTTAAAAAATTGTATAATTATTGTTTAGAAATTGTTACATATTATATTAAATTTGTCTTCATCCTCTAGCATAAGCTTAAGAGTTGTATTGGTGATTTTTGATTCGAGTTCATCCTCTAGCATAAGCTTAAGAGTTGAATTGGTGATTTTTGATTCGAGTTGAATTGGTGATTTTTGATTCGAGTTGAATTGGTGATTTAAGATAGAATCAAGTTAAATGAGTATGATTGTCTATAAAGGTTACAAAGCAATGCTTACCATTATGAGTTTAGACGGACTCCAAACATCCGTGTGAAGTAAGGAAAAAGGTAAGAAACCTTGTAAAGTTTGGGCAAATAAGTGGATCAATGATGTTTGGCAAAATGCAACTTTCACATCGACAAAAATGAATAATCAAGACCTCTAAATAAATTTGGAAACAAAAACTTTTAAGTAAAAGACATTAGCATGTGCTAATTTACGATACCAGAGCATTATACATTAACCGAAGGAGAATAGACACTACTTAGCCCTGAACTTGTTTATGACTAGCTGAAACTTCATCAAAGTATCAGAGACCACCAATCATCCTAGCACATCCAATCGTCTCTCCGGAGTCCTGATTCTGAAAGGCATAATGAGTGTCCCATAAGATAACTCGACAGTTAGTATCCTTAGAGGTTTACTAACCAACAACAAATTGCAAGCTAATTTTTGAACATGAAGGGATGACCTTCAAATTTTGGAGCAGTTAGTATCTTTAAAATTACCTTTAAATTTTGGCACTCCTTCTAGCGTCATGTTATATATTATATTAAATTTGCCTTCATAACTATTTGTTTGGTCACAAATGCAGAATCAATAGATTTTTTTCCAATCATAACATTCTTTCATTCCTGCCAACTTCAGAAAATAGGTTATTAATAGATGGAAGAGAGGTTTTACCAAGTATTGGACCTCTCTAACCTCATAAAAGTCAACATTTAGATCAGAAAGAAACTTGTAAATACGACCGTCAGAGGATGTACATGGGCAGCGGCGGGCTGTAAAAGATTTAGGGTTTTGTAGGTTTTTCATAAAGTTGAGTTTTATTGGGTTTTCAAAGAACCTGCACTGATACCACATCTTATAATCATCCATTTAATCCAAAATCCAAAAGTTTTAGTTAGTGGGTGAAGGCAATTTTAATATATTATAAAACTTATAGAAAAATTTGAACCTTTGGTCCCTATGGTTTGGAGTAAGTTAAAATTTAGGTCGGTTTATAATTTAAATTTACCCTTCATGGTTTGTTAAAATCTACATAATAAACAGTCCTTATTGTATGGACCATTTAAGAGAATTTAACAAACCACAGGGACTATATAGGACGATGTCACAGTATGGCATTCTGACAAAGAGTGGTCGTTGTGTGTCACCACCTCCCACCTATTCTATACATTCAATCAAAGTCGTCACTGTAAAGCTATTTTTATGTGCACAGGGTCTTACTATCTAATCTGATCATAATGTGCATTATTAGTGGAGTTTATAGCTGTGATTTATATTATTGTGAATAAAGATTATCATGACGCTGGACTTAATTGTTCTTGAAGATTGAAAATCCTTGTGGATTGTGACAACCAATAAATTTTCATGTTGATCTTGGAGATAAGGTAGGTAAGTACTCTCTCTCCCTTCTCTTTCCCTCTTCCCCCTCTTCCATCCCTTCCAGCAGACCCTCCTCCCAACAACATGGAAGTGAAGAGCTGTAAAATTACCGAGTCCTTTTAATGCATGTGGTTCGAAAAGGGGCATTTCAATATAGAAGACGATAATTTTCGAAGAATTCTACAAGTCTTGAAGAACCAACTGAGATGGTTTATCGGGCCTTATCGGATTTAACTCAAGATGAGGAACACAAATTCTTCCTCAACAGTGGTAGAGATGCCGATGGAACTACAAGACTGACAAAGTTCAAAGCTTCTTCTGGATGGATAGTCATATGTGTTGCTCGAAATTCCTCAGGGTATCAGTCTTTTGTGCATGTCCATTTAGGGATTGCAAAACAAGGATGGGTTTCTTTCTTACACGTGCTGAAAAGTTTCTTAATGAATCATGACCATGGGTTGTGGCACTCATCTCTTCAACTGACACCTCGCTTCTATGGAAACCAGGTGAAGCATTTTACTCGCGACTCGCGCAGAGCCAAGCTATGCAGATAAAGTAAAAGTTTCAATTACATACTTTCCCCTGCGCAACATATGATAAAACAGAGTTTGATGCTAAAAGAAGCCAACTCCAGTCATTCCTCTGTTCCTCTTTCAGAATTACAGAGCTCTCAACAACAATGGGTTCGAAAATGTGATAAGGTTATTAGAGAAGATTTTATGATTTATGGATCATCAAAGGTTATTCATCTTTGGTGATTGGAAGGATATTTCTATTTCGGAAGATTCATTCCAGGTGAAAATCGTTATTAACCCTTTATTCGGCAATCAGGTGAAATCGTTTTGAATCCAGGTGAACCCTCCATTACAAAATGTCTTTCTAAAAATTTATGGTTTTTGTTAACAAAATGTCTTTCTAAAAAATCGTTATTAACCGTCCAAGGAATCAACCAGGCAAACAAAAAGAATTTCCTTTTCTACAAGGGTATAAGACTTGTTCAAATGAGCTTCAGTTAGCGAATCACCCTTCCTTTGCTGTTCGAATCAAACTCACAAGAGAAGAATTTGTTTTCGATTTTTGTCAATGTCCGTCTTGAGGTCCCCATAGTCGTTCAGTGAAGAGATGACCGGAGAAGGTAGAGCAATAGGGGCGGGGGATGGAAAGGTAAGCGGAGGAAGTAGGTAGAGCAGTGCGGACGGGGAAGGAATAGTCGGAGGCCATCAACACGAAGGACGGCGGCAAGGGAGCTCTCTCTCTCTCTCTCTAACATTTAAGCGTAAAAGTTATTCTCTTTAGTAGAGCTGAAGAATGAGGGCAAGGGCAACTTCTTACTTAATTTTGGCG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ACACAATTTCCTAATTGAAGTTCGTGGCTTTTTGCGGACGGTTTGATATATTTGATTCATGTTACCTTGTTTAGACGTCAGTTGGCCAGCTTCGAAGATTAGGTTTCATAGTGGGGCATAATTCAAAATCATCCTCAACCTGAAGCTAGAAGATGCACAAATCCCAGAGGGCTGAAGTGAGCATTTGAAGACTTCAGCTAACTTGGCTCTTGTAAGAAGCCACACTATCAGGTCTGCTGCTTGTTTCTGGAAAAACTGTTGCCCCAAAATTTCAATGGTTGCTGGAGAAAATGTTTGGATACGCTGACTGTGGTGTGGTATTGCCTTTGTTGGTTTGGTGTTGGACAATTCTCATTTTATGTTCTTTGGTTGTGGTTGGGTGGAATATGATCGATGTACGTTTAGGTACACAATGCAGTAGAGTTGAGTTTAGAACATTGTTAAATGTACAGTTTGAAGGTGCTTGTAAAGTTTTGATCTATTATAGTTCCGTTTCTATATCTGGAAGATAGAAGATTGTAACTAGGAACAAGATGGGATTTGATTTTCTTATGTTCTGAAAAACACTGGTTGGACAACGATTCCTAAAGGGTGATTGATAACTAACTTTGAGAACTTTTAGGGATGCTTGACACACCAATATGAGTCGGGTTAAATTGATGAAAATCACCAACTTAATA ATGGGCCATACAGCAACACATCTGGTCGAAATGGCTAGCAGGAAGGATTTAACAAGTATAGCTCAACAACCTGATGTTATGATGATGATAAGTTGTTTGTTGGAGCGGCTTCGTGGAGCTGCTTGTGCTTTAGAACCTCGGACTCAGACATCAATTTATGAGTTGGGATTTTCTGTTATGAACCCTGTTTTGGTTCTTCTTGCAGTTTACAAAGATGAGTCTGCAGTTGTGTATATGCTACTGAAATTTGTTGTTCACTGGGTGGATGGTCAAATTAATTACTTAGAAGCTCGAGAAACAGCTACTGTTGTTGATTTTTGCATGCGTTTGCTCCAGCTGTATTCATCACATAACATTGGCAAGATATCGTTAAGTCTTTCAAGCAGCTTACTTAATGAGGCAAAAAATGAGAAGTACAAGGATTTACGTGCTCTTCTTCAACTTCTGTCAAATCTTTGTTCAAAAGATTTGGTTGATTTTTCATCTGATAACTCTGATGTGCCGGCAACAGATATTTCTCAGGTCGTCTACTTTGGTCTCCACATTATCAGTCCTTTGATATCTTTGGATTTGTTGAAGTATCCAAAACTTTGCCGGGATTACTTCTCTTTGTTGTCGCATTTGCTGGAGGTTTATCCTGAAACAGTTGCAAAACTGAATCATGAAGCTTTTGCCCAAGTGCTTAGGACTCTTGACTTTGGTCTCCACCATCAGGACACAGAAGTTGTTGATATGTGTCTCAAAGCCCTAAAATCTCTTGCTTCATACCACCTAAAGGAAATTGGGTCAGGTAAGATTGGTTTGGGCTCCCAAGTAATTACCAGAAAGGATGCAAGTGACAGTGAAGCTGTGCAGGAAGGTATTCTGAGTGGATTCCTCAAGTCTCTTCTGCAGTTGCTTCTTTTTGAAGATTACAGCCCTGACTTGGTGGGGAATGCAGCCGACGCTCTCTTTCCTCTGATTCTCTGTGATCAAGGACTATACCAGAAATTAGCTACGGAGTTAATAGAGAGGCAGGAAAATCCAATATTCAAGTCAAGGATTGTAAATGCGTTACACTCTCTGACCAGTGCAAACCAGCTTTCTTCAGTGCTTGATCGTATTAATTCCCAAAGATTTCGGAAAAATTTACACAATTTCCTAATTGAAGTTCGTGGCTTTTTGCGGACGGTTTGA MGHTATHLVEMASRKDLTSIAQQPDVMMMISCLLERLRGAACALEPRTQTSIYELGFSVMNPVLVLLAVYKDESAVVYMLLKFVVHWVDGQINYLEARETATVVDFCMRLLQLYSSHNIGKISLSLSSSLLNEAKNEKYKDLRALLQLLSNLCSKDLVDFSSDNSDVPATDISQVVYFGLHIISPLISLDLLKYPKLCRDYFSLLSHLLEVYPETVAKLNHEAFAQVLRTLDFGLHHQDTEVVDMCLKALKSLASYHLKEIGSGKIGLGSQVITRKDASDSEAVQEGILSGFLKSLLQLLLFEDYSPDLVGNAADALFPLILCDQGLYQKLATELIERQENPIFKSRIVNALHSLTSANQLSSVLDRINSQRFRKNLHNFLIEVRGFLRTV Homology
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5ZMR9 (Exportin-4 OS=Gallus gallus OX=9031 GN=XPO4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 183.7 bits (465), Expect = 4.5e-45 Identity = 120/453 (26.49%), Postives = 222/453 (49.01%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ESJ0 (Exportin-4 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Xpo4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 183.0 bits (463), Expect = 7.7e-45 Identity = 121/451 (26.83%), Postives = 222/451 (49.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q499Y0 (Exportin-4 OS=Xenopus laevis OX=8355 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 183.0 bits (463), Expect = 7.7e-45 Identity = 121/453 (26.71%), Postives = 223/453 (49.23%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C0E2 (Exportin-4 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=XPO4 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 182.2 bits (461), Expect = 1.3e-44 Identity = 122/453 (26.93%), Postives = 221/453 (48.79%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q802D3 (Exportin-4 OS=Danio rerio OX=7955 GN=xpo4 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 177.6 bits (449), Expect = 3.2e-43 Identity = 120/451 (26.61%), Postives = 222/451 (49.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. NCBI nr
Match: XP_011660267.1 (exportin-4 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 849 bits (2193), Expect = 2.41e-300 Identity = 442/442 (100.00%), Postives = 442/442 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. NCBI nr
Match: KAE8653609.1 (hypothetical protein Csa_007263 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 849 bits (2193), Expect = 2.46e-299 Identity = 442/442 (100.00%), Postives = 442/442 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. NCBI nr
Match: XP_011660266.1 (exportin-4 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 849 bits (2193), Expect = 6.57e-299 Identity = 442/442 (100.00%), Postives = 442/442 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. NCBI nr
Match: XP_008443789.1 (PREDICTED: exportin-4 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 842 bits (2175), Expect = 1.28e-297 Identity = 437/442 (98.87%), Postives = 440/442 (99.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. NCBI nr
Match: XP_008443788.1 (PREDICTED: exportin-4 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 842 bits (2175), Expect = 3.46e-296 Identity = 437/442 (98.87%), Postives = 440/442 (99.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B9M8 (exportin-4 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487293 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 842 bits (2175), Expect = 6.20e-298 Identity = 437/442 (98.87%), Postives = 440/442 (99.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B9L0 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103487293 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 842 bits (2175), Expect = 1.68e-296 Identity = 437/442 (98.87%), Postives = 440/442 (99.55%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HMV7 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111466059 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 796 bits (2055), Expect = 2.27e-278 Identity = 414/442 (93.67%), Postives = 426/442 (96.38%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1F4P1 (exportin-4 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111440841 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 791 bits (2043), Expect = 1.47e-276 Identity = 411/442 (92.99%), Postives = 425/442 (96.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G21644 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DZ73 (exportin-4 isoform X2 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111024872 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 780 bits (2015), Expect = 1.04e-273 Identity = 407/442 (92.08%), Postives = 420/442 (95.02%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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