Cucsat.G19977.T12 (mRNA) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CAAAATAAGCAATGGGCACAAAAAAGGGAAACGGAAATAATTATAATAATTTATAGAAACGGCTTCCAAAGCCGAACTTCAGTACGCTGGTCCCTCACATTACAGAGATTCGACTCTTCAGAGCTTCGGAGAAGAAGACGAGAGAGAGAGAGAGCTAAATTTTCTACTGCCATTCTTCAAACCTCCGAATCACCATCATTTTCATTCTCCTCAAAGAAGGAAGCCATTTTGGCAATGGATTCCGTGTTCGTTAGAGCCTACCGAAGTCATCTTACAATTACCGCAGGTACGCCTCAAAAGTGACTTCAGACTGCTTCAGTGTTCAATCTTCGATTTCTCCGCTGGAACTTCTGCATCGTGTTTTAGCTTCTTCTTTTTCTTTTTGTTGATTGGTGCATTTTTGTTATCGAGTCTGTTTTCTTTTTCTTTTTCTGTTTTGATGATTCATTTTTATTTGCGCTTGACGAGTAACTCGATTATGTTCTCGCGATTTTCATCTTATTTGGTTGATTGAAGCTAATTTGTTGTTTCTGTTTCAGTTGGTGGGATTGGAAACGGGTGGACGAATCGTGACGTCAACAACGTCCGGCTTCCAGGTAAGATTAATTCGTTTTTTAACCTTTATTTTCTTTGCATTTATCGCTTTCGCCTTTCGTCTTCGTTCGTATCTTTAATTCGTCAGTGGCATTTTCGCTCGTTTCTTCGAATTTCATGTCTCGTATTGCAATTTTTGAAAGAATTTGTTGTTGATTGTGGAAGTTGGATGAATTGAACTGGTGGAGGGGATTATCTAGGCGGCGAATTCCCATGTAACCTTTGGAGGGGCTATTTGAGAGTTGAGAACAATGGTTTTTTTTTTTTCTTCTTTCCATTGCAATAAAAATTAAATCATTTTTTATAAAATTTAATTTGGAGTGTGTATATGTATATTGAAGGGAATTTGGAAAGTATTATATGAACTCACCTGCCAATCAGCGCCAGTGGCAATTAAAATTCTGGAAAGTGTTTTCTTTGTTCCATAGGAATAATAGATTTGAATCTCTTGATCGTCGACGTCATTTCACTGCAATTTCAGTTTAAAACTGAAATTAAAAAAAAAAAATTACAGTTCTCAAAATTACATTTTCTTTAGAAACAAAATCAATATTTGTAATATATTTTTCTATAATAATGTTTTTGGCATTTTCTTTTGGACCAAATTGCGAATATTTGGATGCCAAAGATGATAAATGAATAGTTTAATATTGATTGAGTGGCCATTTTTCGTTTGGAAGTCATTAATATATCTCCAAGGAGTTTCAAACGAACCACGAGAGATGGAAGAGGGCAAAATACAATTTGATAGTATATTAGTTTATTAATAATTGTATTTCTTTTGCTTGAGAAAGAAGTATCCCACAATCGTGTTTGTTGTGTTGGCAGCAGCATGAACCACGAAATTTTAAAGCATAGATCAACTAGATTTTCACCCTTTTTTAGAAGAAAAGACTTCGACCTCATTTAAATGGCAGCTCTGAAGGAAAAAAAGTGAATTACTAAAGATTATGAATGTCCTCGAATAATAAATTTCCATCTTTGACCTCATAAATGTGGGAGAACACTGCATTGAACCTAAGTTGCCTAATGTCTGACGTGATTGACGCAAGTAGGACACGTTTGATAGCGAATGTTCGAACGCTGGTCCATTAACAGAAGTGCCTGCATGCGAGATATTGCCCTTCTGTCACTGACTAGTGGCACATGGCGTATCGTAATTTAGTTCCAAGTCCATGACCGAAAAGGAAACTAGAAAGCAACGAAGAAAATCAGGAAAGATAATAGGAGAAAAGATTCTTATACGCGCATATGTATGTTGGGAAAAACTTCCCAATATGGCAGAATAAACAGAAAAGTAACAGTACTGTAAAAAAAATAAACCTTGGGAAATTGTAAAAAAAATGATAATAATAGAGAAATAACAAAAATAGTAAAATTGATAACAAAAAGTTATCTGAGAAAACTTCAAATTCAAAAAGGAATATCGATCATAAAGGAACTTTACTACGTGAAAAGTCACCACAATTACAAAAAAAAAAACTCATGTTTAAAGGTATAGACTCTTTTTATGGTGTTAGGAGCCTATCACTTTCTTGAATTTTTCAATGTGAGATTATTAGACTCTTAATGCCAAAACACGTGTGAATCTGACATAGTATTTCAACTACATATGCCGTCTTGCATGTGTACATCTCTGTGCCATAAGAGTGGGAAGGTGCGGATCAATACTAAAGAAGTATATGCTTATAAAGTAGATCTAAGGAAGACCTTACTTTAACCTTACATGGACTTGATCTACTCTATTACTCGTACTTGTTCTATAATTTGTACAACTGTGCTGATTCTACAGAGATTTTGGAAATCTCAAGGCCGGTGTCCAGGATCTGGAAACAATTCTTCTAGCAGGAACAAGATCTTGCACTTGTGTAAACCAAAAGTTGGACTTTTCATCCAAATGATTACTCTCTCAAATGAGTTGAGAAATGTTGTATTCATGTAGAAATATGAGTACAAGTTCCAAACTATCTTTCTAATTAACTTTCTAACTTCCCTTTTTTAAAAACAAGCAACTCTCTTTTAATACAAGTAACTCTCACTCTCTCGGGTACACCATATTCCACCCCTTCGAAAATCAAACTCGTCTTCAAGGGTGTGACTATTTAGAATCCCAATTGTGTAACACTTTAAAAAGCCCCAGCTGTCTGCTTACAGGAATTCTAGCTTTGCATAGATGAATTATTACAAAGTTAACCACCCTTCGAGATTTAACCCAAGCCAAGAAATGGGTTATTTTACTAAATCGATCTGCCACAACCATCACGACATTATACCCTCGCTGAAATTTTGGAAACTCATCAAACAAATTCTGCATTTCTTGATGAACTTCACCATTTTTTTTATTTTCTACAATTTTAACTACTACAAGGCCCAATCTACCTCCCTTTCTTTATCAAACTTTTTGCAATGTATTTGAGGATTAAAATCTCCTTTGAGAGCAATCTGCATCGTTAGGAGAAGACAAGACATCCTACCACCTTCATCCGTGGACCGCGTCAATATAATTGGTTTCTTTCTCATTATCTTCACTGCATCCAGCCAACAAATTCTCTTTTTCTTCATCCATATATGTTCCTGTTTTATGTTGGGGACACTCAGTAGACAAGTGCCTCACTTGGTTACCCACTTAAACATTTTTCCAATATAGGCCAATTATAAAGATTTTGAACTTTCTGCTTGCAAACAACCTCTTTTCTTTCTCACCAACCTCTTCTTGCTCTTCTTTATCCATTTCCTTTAACAACTTCTTTACACTGATTATGACAAACAAATGATTGCATCTACTCTTCTTGGAATTAACACTTTCATTTTCCTTCTGGGTCTGAGGCAACAATACAATCTTTTTATCCATCCATTGAAATTCATAAGCATTCTCTCTCCCATTATGTAAGGCTTGCGTATCGTATCGCCATGATCTCTCCAATAGAATGTGACACACATCCATCTCCAAAACGTCACAAACTATTTGATCTTTGTAGCTATTCCAATTGTCAATGGAACGGTGCATATCTCATTAACTTGAGCTTCTCCTCTTTTCTTCTAGGCATTTGGATGAGACTCAGTTTTCAAATTCAAGGCTGCCACTAACTTCTTGGCAATGAAATTCTTACTACTTCATCTATGATGACATTGCAAACTTTGTTGTTGATTGTGCATATTGTCTTGAAAAGACAATGCCGTTGAGGATGTAATTCTCCCTTTTGGTGTGATCAAGACTCTTTGAAGAACACAAGAAACTTGATCTCTATCATCCGCTCCAATCATCTCCGCTTCTTCTTCACTTTCTTTATTGTTCTCGAATGAATCTTCATTTTCTTCATCAACAAATGCCATTGTTTTACATTGAGGACAAGCACTGGAAGGGTGCCCCGTTTGGCCACACCTATAGCAAACACTCTTAAAGGGTCGAACATAAGGATTTTGGTCAGTCTTCTTGCCATTTGCTTCTTGATTGTCTTTTCCCACCTCTTTGCCTTTATTTGTAGCTGTTTGATATTTGATGGACAATCTCCTTGTTCTTGCTACTAAAGTTGGTTTTCTACCTGTGGATGCTTCCCATGTTGTCTTTCTTGAAGCATTCTTGGAATGAATCTCATTAATTTCTTCCACTATTTCACCAAAACAAATTGGTTCAGAAAGCCGATTAAAAGATTGGAGTTTTACCTTCTCCTTGATATCCATGCGTTCTGTTTTTGTGAGAATTTTACACACAAAACAAAAGGATGCTTAATAATCTTTAAAAAGTGTGTGAGCTGTGGGAAATTATTGTTAGTTTTTTTCTTCCTGGAGTAGACTCTTTTTTTAAAACATATTTTTAAATAACTGGTGACCTTTATTAGGTCTTCTTTTTGTGAGTTTTGTATACAAACGACATTGTTACCACCTTTTAAAAGCATTGTGGATGTACTTCCTAAAGACTAAAAAAGGGAGGGTTTTTTTTTTTTTTTATTTATTATAAATATTATCATTTTGCTCTCTTCTTTTGATATATGCATCTGTCTTATTTTGTTTTTTATTTGTAACGTAGTATAATTAAGGAAATTGGTAGAAAATGCTTACTCATCTGTTCACATGTTACAATTGAAGGTCCAAGGCCTGGAGCATTGAAGATTTCTAAAAGGCACTGTTGTGTTGAATCTGAATATGAATCACATCATTGTGAATTTGTTTTTAGAAGACATCGGGAAAGGTACACCTTCTATCAGAAAAAAGATGATAGAATCCAAGTTAGAAAAGCAGCCTCTAATCAGCCTTTTGAAACTGAATCCGAAGCCTTGAGTTCCAAAAATTATGGTGATTCTGTAAGGAGTTTTTTAGATGCTTTTTACAGGTTTTCACGGCCGCACACAGTTATTGGTACAGTTACGTTTTTTCAAACTCATGTCCTTTTAGACCAATAA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ATGCTTTTTACAGGTTTTCACGGCCGCACACAGTTATTGGCGTTGAGCATTGTATCAGTTTCTCTACTAGCAGTTGAGAAACTATCCGACTTGTCACCATTATTTTTAACTGGAGTGTTGGAGGCTATAGTTGCGGCCCTCTTTATGAATATTTACATTGTAGGTCTGAATCAATTATTTGACATTGAAATAGACAAGATTAACAAGCCATATCTTCCATTAGCATCGGGAGAATATTCTTTTGGAACAGGCGTTGCAATTGTCTCCACGTTTTCCATTATGAGTTTTTGGCTAGGATGGGTTGTTCGTTCATGGCCATTGTTTTGGGCTCTTTTCGTCAGCTTTATTCTCGGGACTGCTTATTCCATTGATCTGCCACTGTTGAGATGGAAGAGATTTGCTGTCGTTGCCGCTATGTGTATACTAGCTGTTAGAGCCGTGATTGTTCAACTTGCCTTTTTTCTACACATGCAGACCCATGTGTTCCAGAGACCTCCGGTTTTTTCACGTTCTTTGATCTTTGCAACTGCATTTATGAGTTTCTTCTCGATCGTTATAGCATTATTTAAGGATATACCAGATATTGATGGAGATAAGATATTTGGCATCCGTTCCTTTACAGTACGTCTAGGGCAAGAGCGGGTGTTTTGGAGTTGTATTTCCTTGCTTGAAGTAGCATATACTTCTGCTGTTTTAATGGGAGTTGCCTCTTCTTCCCCGTGGAGTAAATGGCTAACGGTTTTGGGACACGTCACTTTGGGGTCAATTCTTTGGATTCGTGCCAAATCAGTTGATTTGAAAAGCAAAGCTGCAATAACATCCTTCTACATGTTTATATGGAAGCTCTTTTATGCTGAGTATTTGCTGATACCCTTTGTTAGGTGA MLFTGFHGRTQLLALSIVSVSLLAVEKLSDLSPLFLTGVLEAIVAALFMNIYIVGLNQLFDIEIDKINKPYLPLASGEYSFGTGVAIVSTFSIMSFWLGWVVRSWPLFWALFVSFILGTAYSIDLPLLRWKRFAVVAAMCILAVRAVIVQLAFFLHMQTHVFQRPPVFSRSLIFATAFMSFFSIVIALFKDIPDIDGDKIFGIRSFTVRLGQERVFWSCISLLEVAYTSAVLMGVASSSPWSKWLTVLGHVTLGSILWIRAKSVDLKSKAAITSFYMFIWKLFYAEYLLIPFVR Homology
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VWJ1 (Homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=HPT1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 429.1 bits (1102), Expect = 4.0e-119 Identity = 214/280 (76.43%), Postives = 252/280 (90.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B7FA90 (Probable homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HPT1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 419.9 bits (1078), Expect = 2.5e-116 Identity = 219/281 (77.94%), Postives = 249/281 (88.61%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB13 (Homogentisate geranylgeranyltransferase OS=Triticum aestivum OX=4565 GN=HGGT PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 311.6 bits (797), Expect = 9.4e-84 Identity = 167/280 (59.64%), Postives = 214/280 (76.43%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XB14 (Homogentisate geranylgeranyltransferase OS=Hordeum vulgare OX=4513 GN=HGGT PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 309.3 bits (791), Expect = 4.7e-83 Identity = 167/280 (59.64%), Postives = 212/280 (75.71%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q0DAK7 (Homogentisate geranylgeranyltransferase, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=HGGT PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 308.1 bits (788), Expect = 1.0e-82 Identity = 167/280 (59.64%), Postives = 208/280 (74.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. NCBI nr
Match: XP_031736945.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 562 bits (1448), Expect = 1.68e-201 Identity = 294/294 (100.00%), Postives = 294/294 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. NCBI nr
Match: XP_004148327.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN61152.1 hypothetical protein Csa_021364 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 535 bits (1378), Expect = 5.11e-189 Identity = 281/281 (100.00%), Postives = 281/281 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. NCBI nr
Match: XP_008451585.1 (PREDICTED: homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 530 bits (1366), Expect = 3.42e-187 Identity = 277/281 (98.58%), Postives = 281/281 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. NCBI nr
Match: XP_022153312.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X6 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 523 bits (1346), Expect = 4.71e-185 Identity = 275/294 (93.54%), Postives = 281/294 (95.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. NCBI nr
Match: XP_038889438.1 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X3 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 523 bits (1348), Expect = 1.81e-184 Identity = 273/281 (97.15%), Postives = 279/281 (99.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LKA3 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G059830 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 535 bits (1378), Expect = 2.47e-189 Identity = 281/281 (100.00%), Postives = 281/281 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BRS9 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103492819 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 530 bits (1366), Expect = 1.66e-187 Identity = 277/281 (98.58%), Postives = 281/281 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DIJ3 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic isoform X6 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111020832 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 523 bits (1346), Expect = 2.28e-185 Identity = 275/294 (93.54%), Postives = 281/294 (95.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K7F2 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X2 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 518 bits (1334), Expect = 1.03e-182 Identity = 268/281 (95.37%), Postives = 277/281 (98.58%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G19977.T12 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1K9K8 (homogentisate phytyltransferase 1, chloroplastic-like isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111492342 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 518 bits (1334), Expect = 1.07e-182 Identity = 268/281 (95.37%), Postives = 277/281 (98.58%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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