Cucsat.G18709.T24 (mRNA) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.TCCTCTATTCTATTTACGTAATTAACAAAAAAAAAAGAAAAGAAAAAAGAAAGAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGAAAAAAAAGGGAAAAACACTTTTACGTGAACTCTTTCGCACAGTATACGCCGAACGGCGGTCGTTCCTTTCGTCTTCTTCTTCTTCATTTCTAACAGTCTTCACCGCCGGAAAATTCTCTCAACTTCTCCCTTACAGCATGAAGCGCGTCTTCGAAGAAATTTCCGACGAAGAGTGGTCCAATCACTCCTTCAAGCCCTCTCGCGTCTTCACAAAACCACAGACTGAACCTTCGATCCCTCCTCCGATTGAATCTTTCGCATACCGACCCCACCAGCTCTATATTTCCGACGAGAGTAGCGACGATTGTGTCGTAGTCATGGAAAGTTCCAAAAATTATGAGGAAAATTTGGAGGACGAGGATGTCGAGGTTGAGGGAGTGAAATCCACCACGGCAGTGAGTCGTGGCCGTCGGTTTGTGGTTGATGACGAAGATGATGAAAGTGAGAGGGAATTGACTGAGGTTTGTGATGTAAAGTCGACGAGCGAGGAGGAGCTGGAGGAGGGTAGGGAGGATGACGATGATGTCGTCGGTAAGGCTTTGCAGAAGTGTGCAAAATTATCTGCCGAGTTGAAGAGAGAGCTGTACGGCTCTTCGGTTTCTGCCTCTGAACGATATTCAGAAGTGGAGTCTTCTTCCGTTAGGATAGTCACCCAGGTACATCTCAGAGTTCAATCTGAATTGGAGCGCTTTTATTTCCTCAGCATAATTATGGATTGATGTTGAATGGTCTTCTTGCTCGGTTTTGTTTTGTCCCTTAACAGATTTAATAGTTTTTGTTTAATAAGTGGATGCCATAAATCAACATCTAACCCTTTTATGATCCGTTAAATGTGTATATTGTTTGTTCTTTTTGTAAAACGAACCTCACAAGGAGAAATGAAAAAAATGAACAAGAACAAAGCCCGTACAATTGAGCCAAAGACTTTGCAGGATAGAGCTTCAATTGTTGCCATTTTTTTTTTGTTTGGTATGAAATAATTTTATTAATGTTGTGAAATTTACAAAAAAAAAAAGAAAAAGAAAAAAAAGAGGAGAATCTTCTTAGAGATGACAAGAGGTTTCCAATTTGTTTAAAGGGAAGCATAGGTATAAGACTTAAAGGAAGTTGGCACTGTACACCAGGATATAGCAAGATAAATTACCTGATCATAAGACCTATTGCAAGCATGTTTCTTATAGTAGACAGAATTCTTTTATTTCTTTTCATCTAAAAGGTCCCAAAAGAAAGACATAAAAATGTGCAACCACAACAATGCCTCATCCTTCTTTAGAAGGTGGCCAGAGAGGATGGTGAAGCGAAGGGTCTTCATGTCAATAGGGAGGGTCATCCCTCTTGACGATCTTCAACCTTTTACTCCAATTTTTCTGGTTTGGAGATTAATATGGCGAAGTGCCAACTCTTGGGGTAAATTGTCATTTGAACACAACTTGGGGTAAATTATCATTTGAACAAGGTGGGTAGGTGCGTTGATATGGTTGGATGTGAGGTGGGGTCCTTCCTTTATCTTGTCTTGGTCTTCCCGCTGGTCATAGCTTAAAATGTCTAAAGTCTTGGGATCCTGTGGTGAGTAAGAGTAAGATTTGAAAGAAGTTGGCACTTTGGAAGGGGGTTTTTGTCTCTTGAAAAGAGGCAGGATCCTGATCTAGTATTTCTATGTTTTGAGTTGGATTCCAACCTACTTCCTATCTCTCTTCAGGATTTGGTGTCAGTTTGTAAACTTTAGAGAAGATCAGGAGTGATTTCCTTCAAAATGATGGTGGAGGAGAGGAAAGGGGCACACTTAATAAATTTGTGCTGTCCTCTTTTGAGTTGATCCTTTATCTCTCTTTCTTTTCCTAATTATAAGTGAAGTCCTTGTGCTTTTGTTTCTCGAATTCATGAGAATGGAGTTTTTGAAGGTCTCATGGTGGAAAAAGATAAAATTCACGTCTCAATTTCGCAAGAAACAACTCTTGTGGTTGGATGATCCACTTTTATTCTGCAAGTATAATGAAGCTATGTTGGATATTCTGATCCAAACTATTAGGTTCTTTGAATGGTGCTCCGGACTCAAGGTAAAGGAACAAATCATTCTTCTGTGGTGTTAATGTTGATGATAAATTTATGCTTTCTACCTTCTCCATCTCCAAGCTGAAATGTAAAGCTGAAAAGCTACTGTTTTTGTATTTGGGTTTCACTTTCGGTGAGATATCCAAAGCAACTATCTTTTTCGTGGCTAATTATAGATAAAGTTTATAAAAAGCTAGACAGATGGGGTGGGGGCAGTATATTCGCAGGAGGTTGATTAACTTTGAGTAATGCAGTTTTGGCAAATTTACCTGCCCATTATATGCCAATGTTCCTAATGCCCAGTTTGGTGATCTCAGAAATGGAAAGAACTATTTGCTCATTCTTATGGGAAGTTTAAAAAGGGAGTAAACTGGAACATCTTGTGAATTAGGATTCCACTTCAAAGTCTTTACAGGGTGGAGGTATCGACTTGGGAAACTTGGAAAACAGGAACTTGGCTTTATTAAACATATGGAGTTGGAGATTTATTAGGAAACCTGATGCACTTTGGTGCAAAGTAATAAAGAGCATTCATGGTGTTACTTGTTAGCACCTTTCAGTGACATACATTAGGAAAGTATGGTTTGAGTTTGAGAAGCCCATGTTTTAGGATTTCAAGATTTGGAGTAAATTCTACTATCTAGTTAGGAAATGGGGGGAATATTTACTTGTTGCTTGATGTTCGGAGTCTTGATTCTTCATTCGAACTGCATTTCCCTCAACTATTTGATATAGCTTCATTCCCAAATGGTAATATATTTGATAATTGAGATTTAGAAACTTGTTCAAGTAACTTTCTTTTCCAAAGCAACTAAATGATAAAGAAATTTTAAAATTTACAACAGTTGAGGAGGAGCAATTTGGCTGACAAGCATTAATCTCAATCACCTCTTTTCTATTCTGGGTGATGACCATTGGATTCTTCAAGGAAATTTACTGTTAAGTGCTAACTCCTCATCCAACCACTTGATTACCTCGTCCCCTTTAAGAAAAGGAGATTGATTAGGCTTTGTGGAAATCTAAGAGCCCTGAGCTTATTAATATTTTGGTGTGAATAATTATTTTTGGAATCCTGAATTGTTCTACTACTTTGCAACATAAGCTTCAGGTGCACTAACTTTTGCCTTCTATTTGTACATTATGTATGGTGAACTGTGAAGATTTACAACAAATCTTGGTTGGCCCCATATTATCTTCAATGTCAAATATTACTGTTCAATATAGTCAAGGGGACCCACTCTCCCCTTTCTTATTTCTTCTGGTAAGTGAAGTTTTGAGTTCTTTGATTGCAAGACTACACGAAAAGGGGCTGTATTAAGGATTTTGGGTTGGAAAAGAAAAGGTGTATGTCTCTATTCTCCAATTCGCTGATGACACCTTAATTTTCTGCAAGTTTGATGATGAAAATGCTTGATAATCTTGTGCACCAGAAAATAAATTGGGAAAGATTTGCTGTACGTGGCATTAATGTTGATGATGGGAAACTTCTCTCAGTGGCAGCAAGGCTAAATTGTAAGGTGGAGCACCTTCCACTTGTGTATCTAGGCCTACCCTTGGGTGGCTGTCTGAAGGAGGTGGAGTTTTGGCAACCGGTTATTGATAAATTACAACGCAAGCTGGACAAGTGGAGAAGATACAATCTTTCTCGAGGAGGAAGAGCTACCCTTTGCAAATCAGTTCTCTCTAACCTTCCTATTTATTACATGTCTTCCTCCAGGTAAGGTTTTATCAAAGATAGAACAAGTTCTGAGGAACTTCTTTAAGGAAGGGAACAAAGGTGGAAAAATTAATCATCTCTCTTTGGCTTCTCCGCTTGACATGGCTCTAAAGAAGGCTTTTTGGAGGACGAGAAGTCCTAGACGAGTTAATATTCTGGTATGGATTATAATAGTTGGTCACTTAAATTGCTCCTCGGTCTTACAAAGAAAGTATCCTTCCCATTGTGTGTCTTCAAGTATTTGCGCACTGTGCAAAGGAGAAGAGAAAGACATTCAGCACATCCTCTTTGAGTGCGGTTATGCTCAAAACTGTTGGTTTGCATTATTTTAAATTTTTTGGCATCAGCTGGGTTTTTGGAAAAACAGCCGCGAGCAATGTTTTTCAGATTTTGGTGGGGCCAAAGCTTAAAAAGAATCAATAAATCCTGTGGATTAATGGGATGAAAGCTGTGTTGACTTATTGTGGTTTGAAAGAAACCAGAGGGTCTTCCATGATAAGGAAACTCCTTGGTTACTAGATTTGAAGCAGCTCGATTGAACGCATCCCTTTGGACCTCTCTCTCCGAGGCTTTTGCTGATTATTCAAGTCAAGATATTAGTTTAAACTGAAGTGTTCTCGTTTCCATGAATCGCGGATGATACCTTAGTTTGCTTGGTTTTTCAGTTTTAAGAAAACTTAAAGGTTGAAGAAGTGAAAACTTGAAGGTTGAAGAAGTGAGTGAGTTTCAGATTATTAAGGGGCTTTAGTCACACAGGAAAGAAAGGGTTGTAATCAACCAAAGTTAGTGGTTGTTGGCTCCTATTGGAAATTTTTGAGTTAATTCATTCCTCCGAGTTAAAGCTGTAATAATTCTATGGTATTACAGAAGTCTTAGTCGAAAATCGTTAATCTAATTTGGAAAATGGCTTTTGGTCACTGCTTGTCTTCTTCAATCTGCACTTTTGCTTTGCTGCTAGTGACTCTTCACACAACCTAGTTTTGATTGCTTATTGTCAACTTGTTTGCATCGTTTTCAGAATTTTGTGTTTGGGAAGATCCTAGAGATTTATTTTCGAGCAAGCTTCTCAGCGTAAGACCTCGATGGAGTCGTCAACTTTTAGCCTCCTCGTGGTGTTCCTTCTCCAAGGATCTCGAGTTTGTC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ATGGGTCTGGGGAAGACAATACAAGCTATAACATACCTTGTGATGTTGAAATATTTGAACAATGATTCGGGGCCTCACCTAATTGTATGCCCTGCATCTGTTCTGGAGAATTGGGAAAGAGAACTCAAAAAGTGGTGCCCATCCTTTTCTGTACTCCACTATCATGGGGCCGCCCGGTCGGCATATGCTAAGGAATTGAATTCTCTGGCTAAGTCAGGGTTGCCTCCTCCGTTTAATGTTCTTCTTGTTTGTTATTCTCTCTTTGAAAGACACAGTTCCCAGCAAAAAGATGAACGTAAAATCCTGAAACGCTGGCAATGGAGTTGTGTTCTTATGGATGAGGCTCATGCCTTGAAAGATAGAAACAGCTATCGGTGGAAAAATTTAATGTCTCTTGCACGTAATGCAAAGCAACGATTAATGTTGACAGGGACACCGCTTCAAAATGATTTGCATGAGCTGTGGTCACTGTTGGAGTTTATGATGCCCAATCTCTTCGCTACTGAGGATGTGGACTTGAAAAAACTATTAACAGCTGAGAATAATTCATTGATTAATCATATGAAATTCATTTTGGGTCCATTTATTTTGAGACGGTTAAAATCTGATGTTATGCAGCAACTTGTTCCAAAGATACAGCAGGTTCGGTATGTTGCAATGGAAAAACAACAAGAAGATGCCTACAAGGATGCTATTGATGATTATCGAAATGCTTCTCGCGGCCGCGTTGGTAGAAATGGCAATACTAATTCAGATAACATATACAATATTCTTCCCCGTCGTCAGATATCTAATTATTTTGTTCAGTTCCGCAAGATTGCTAATCATCCTTTACTAGTACGGCGCATTTACAAAGACGAGGATGTTACCCGTTTTGCTAAAAAGTTACACCCTTTAGGTGCATTTGGATTCGAGTGTACCGTGGAAAGGGTAGCTGAGGAACTTAAAAGTTATAATGATTTTTCCATTCACCGGTTATTACTTTCTTATGGCATTACTGACAGAAAGGGAGTTCTATCAGATAACGAAGTGCTACTTTCGGCGAAGTGTCGGGAATTAGCACAACTACTTCCTTCACTGAAGCGAGATGGACATCGAGTTCTTATTTTCAGTCAATGGACTTCAATGCTTGACATCCTAGAATGGACATTGGATGTGATTGGGTTTACTTATAGACGACTAGATGGAAGTACGCAGGTAGCAGAAAGACAGACGATAGTTGACACTTTCAATAATGACACGTCTATATTTGCATGCTTGCTTTCTACTAGAGCAGGGGGACAGGGGTTGAACTTAACTGGGGCCGACACTGTTGTCATTCACGACATGGATTTCAATCCACAGATTGACCGCCAAGCAGAAGATCGTTGTCATCGAATTGGCCAAACCAAACCTGTCACTATATACAGATGCTGA MGLGKTIQAITYLVMLKYLNNDSGPHLIVCPASVLENWERELKKWCPSFSVLHYHGAARSAYAKELNSLAKSGLPPPFNVLLVCYSLFERHSSQQKDERKILKRWQWSCVLMDEAHALKDRNSYRWKNLMSLARNAKQRLMLTGTPLQNDLHELWSLLEFMMPNLFATEDVDLKKLLTAENNSLINHMKFILGPFILRRLKSDVMQQLVPKIQQVRYVAMEKQQEDAYKDAIDDYRNASRGRVGRNGNTNSDNIYNILPRRQISNYFVQFRKIANHPLLVRRIYKDEDVTRFAKKLHPLGAFGFECTVERVAEELKSYNDFSIHRLLLSYGITDRKGVLSDNEVLLSAKCRELAQLLPSLKRDGHRVLIFSQWTSMLDILEWTLDVIGFTYRRLDGSTQVAERQTIVDTFNNDTSIFACLLSTRAGGQGLNLTGADTVVIHDMDFNPQIDRQAEDRCHRIGQTKPVTIYRC Homology
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9ZUL5 (Protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=ETL1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 788.1 bits (2034), Expect = 5.5e-227 Identity = 373/470 (79.36%), Postives = 424/470 (90.21%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9VL72 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 homolog OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Etl1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 340.5 bits (872), Expect = 3.0e-92 Identity = 206/484 (42.56%), Postives = 281/484 (58.06%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: E7F1C4 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1B OS=Danio rerio OX=7955 GN=smarcad1b PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 336.7 bits (862), Expect = 4.4e-91 Identity = 196/481 (40.75%), Postives = 290/481 (60.29%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5FWR0 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 OS=Xenopus tropicalis OX=8364 GN=smarcad1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 327.0 bits (837), Expect = 3.5e-88 Identity = 189/480 (39.38%), Postives = 282/480 (58.75%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9H4L7 (SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=SMARCAD1 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 320.1 bits (819), Expect = 4.2e-86 Identity = 186/482 (38.59%), Postives = 278/482 (57.68%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. NCBI nr
Match: XP_004140399.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 [Cucumis sativus] >XP_031741288.1 protein CHROMATIN REMODELING 19-like [Cucumis sativus] >KAE8648070.1 hypothetical protein Csa_018841 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 947 bits (2449), Expect = 0.0 Identity = 470/470 (100.00%), Postives = 470/470 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. NCBI nr
Match: KAA0067170.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa] >TYK26018.1 protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 933 bits (2412), Expect = 0.0 Identity = 462/470 (98.30%), Postives = 466/470 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. NCBI nr
Match: XP_008460214.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 933 bits (2412), Expect = 0.0 Identity = 462/470 (98.30%), Postives = 466/470 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. NCBI nr
Match: XP_008460215.1 (PREDICTED: protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 933 bits (2412), Expect = 0.0 Identity = 462/470 (98.30%), Postives = 466/470 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. NCBI nr
Match: XP_038877194.1 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 918 bits (2373), Expect = 0.0 Identity = 454/470 (96.60%), Postives = 463/470 (98.51%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KSU2 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_5G272400 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 947 bits (2449), Expect = 0.0 Identity = 470/470 (100.00%), Postives = 470/470 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DR37 (Protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold1567G00230 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 933 bits (2412), Expect = 0.0 Identity = 462/470 (98.30%), Postives = 466/470 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC04 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 933 bits (2412), Expect = 0.0 Identity = 462/470 (98.30%), Postives = 466/470 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CC36 (protein CHROMATIN REMODELING 19 isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103499098 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 933 bits (2412), Expect = 0.0 Identity = 462/470 (98.30%), Postives = 466/470 (99.15%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G18709.T24 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1FXC0 (protein CHROMATIN REMODELING 19 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111447914 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 895 bits (2314), Expect = 0.0 Identity = 441/470 (93.83%), Postives = 454/470 (96.60%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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