Cucsat.G14089.T14 (mRNA) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.AAAATAAGATGGCGAAATGTTCAAAGTCTTCGCAGTCGCTGCGTTGCCTTGGTCACCTCTTTTACTATTACAACCTCCTCTTCATTCTCACAATGAAGTTGCAGTTGCCGACTTCAACTCTTCACACTTTCACTTTCTCCCTCTCTCTTCTTTCTCTATGGAATTCGCTTTGGAGTCCAGTCCTAAGTAGCCTTCTCCATCTCCATCTCTCTCACTCTCAGGTTTGCCTTTTCACTCCTCTTCTTCTTACAATTTCTTTCTCTCTCTTCCTTATTTTTACTGTTCATGTATTATCCGGATGTTTTTTCACCACGCAAAGGTCGAATTCCTTGGTTCTTTCAATCGTCCTGTCTTGTACACGCATGAATTCCTTCACCACACTGTATCTCACATTTCCAGCTTTCCATAATTCCTTCTGCACACTGTCTTATATATCCATTACTGTTCATTTCCGTACTATGCGTTGGATTTGCTTTTTATAATCTACATTCCAACTTCAGTTATTAATTTACTAATCATAAAATTCAGTAATCCTATATACAAGGAATCGAGTATTCAGGTGAAACTCCCGCGGAAAATTGAGGTTCTAAGTCAAGAACTAAACCATACTGATTTACCTGAGTATCATAATCGTTGAGCTGGTGATGGTATTAGTTCAAAGTTTATGAAGTAAAACGTGATCGTCGAGTCATTGATGGTAAAATCCCATGGTTTATGAAGCGGAGGAAGTAACATGTTTTAGCAAATTTTCATTGTATTCTATGTGATGTTTGATAATATTTCTAAGAACGCGTATCCTATGTTTAAATGGAAATTGTTCCATTTTTTTTTTAAAAAAAATATTGAATAGAGCACTTCTAGCTTTATTTAAACGAATTGCTTGAAAAGAAACAAGGTAAACTTTGATGATGTTCGTTAGAGTTAAAAGTAGTCTAAAATAGTAAAAGATCTTTAGATTTTGGTATTTCTTTTGCCTAGTAGCATTCTAGGTGGGTAAACATTTTAGAATTTGTTTTTATTTGTGTATAACCTTCTATTTATTTATGCTGTATTTGTTGTTGTTGTTCTTTTCCCCAGTAAATGAGAGTTTTATGTTGACCTACATATGTCCAAGACATGCATATTTCTGAATTATTTCTTTTGGGGGTATTGACATTCTATTCATCATCTATAATCTGAGCTCCACATGGAACAATGATGCCTTTATTTCCTTGTGTGTTATCTATTTAATTAGTTGCTTCAAATTGGTTACAGTCATTGCTTCTGAATATATGGTGTGTTATTGCTCAATTTTTGTCCCAATATCACTAGTTTTACAAGCAGGGGATGTGAACTTGAGTTCCACGCAGTTGAGATTTCATTAAGTTCAGACTAACGACTCATGGTTGTCACATCATGAGGAAAAAACTCCATGTCTCTTGTGCACGTCTCATTATCGTCTCACATTTTTCTTATAATGATGTTTACCTTCAGCATTTTTGTCTTGTATTTAACTTGTTAAAATTTCCAGGTCTAGATTCTTAGGCATGGCTGCTTTTGAAAAAGACGATATACCAATGCTATCAAACACTGATCCACCAATGTTTGACGAACAAGTGGATTCTTATTTTCCTTCATATGCATCCTTGGGCCGGAGTTCGTCACTATCAATTCCAGAAAATTCTTCTGGGATGTATGGTAGCGAAGCAAATCTTGTTGGTCATACTGGTCCCCTACGGATAGAAAGAAGTTCATTCATGGTGAGTGGTTCAAAAAAAACTGGCAGTAAGCCCAAAAAACTTTCACAGTCAAAGCCAGGAGTGACTGAAAGCAAGACAGCAGAGCCGCTGGCAGAAAAATTTCCTTCGTTCAAGATTGTAGATGAGTCTGATTGGTCCATTCATAACTATGCCGGTAGGAACGAACACTTAATAAAGTCTGGCCAGCTGGGATTGTGTAATGATCCTTTCTGTATAACTTGCCCAACATATAATTCCAAAGCATCACAACAGAAAAGCTCAAGAATGTCAGGCATATTTGATGCCAAGGTATTTTCTCTCCCACTCAAACCAATGGGCTACTTTTACACGTCATGCTTATAGGATTTACTTGATACAATTTTTAGTTTTGACCTTTTTATGCATATCTCATTTAACACGTACTTTCTGTACCACGCACACAGATAGATATTCTCAACGTTTCTTTCAAAGGCAATTGGACAGCTAATGGCATCTAGCCGTTACCATCACATATACTTTCAAACTCAACCATTGATAATGATATAAAACATCTTCATGGAGATAAATAACACCTCTTCATGTGTATTCATTTATCTGCATGATAATGAAAATCTTCACACGTGTTTAATGAGTCAAACGCTGACTTATTTGTTAAATGGAAAGGGGTTGATTTTTGTACTTCTTTTGGAGGTTATATAGCATATGCATCTTCTTGTACAAAGTTGCACTATGATTTTGCTGTTTTCCCTCCTCTTTAATCAATTTTTGTGTCTCTGGATCCAGCCCTAAACTTGTGCATCAAATATAATAAAAAGTTCCATAAGTGGCCTGGCGTAGGAGAAGTAAAAACTAGCACGATGTTCTTCTCAAACTCTTCTTGTAACATTACAAGGGGTAAATGAAGTGATACTCCTTTACAAGGCACACACTATTGTCCATTGGAGGTTTATGTAAAACCTAAGCTGGGGGTTTCAAATTTATTTTGATTGTATCGAACCTTACGTTTTATGGCATTCTCAACTTCGAAATCATATCAGTATACTTGCTCACTCTTGAGTTTTCAAATAAATCTTCCCATTTACTGTTAATAAAAAATCTGTCCAACAAAGATCTTGCAGCAGTGCCACTCTTTCTTGACCAAGTAAATTTGCCATTTTCATGACCTTAGTATTGTTCTTGTTCTTTGTTTTTGGATATGATGAGGGTGCTATGGGGTTGTCAACCTAGTTGAAATGTCCGGGTGCACCTACTGATCCTCTCTCTCTCTCCCATTCCTTGGCTTCCCTATTATTCTCATTGTATAACTCTCTTGTACTTTGAGTTTATTAATAATAAAGAAGCTTGTCTCCTTTTAAAAAATATTAGAGTTAGATGAAAATGCATAACCTGTCAGTCACACACAATGGTCCTTGGTAAACCATGTGCATGTATGATTTTCCTTTTTCTCCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTCACGCTCTCTATATGTATTTTAACGAAGGAAAAAAAAACTCTGCCTACTTCCTTGCCAGTGAATGGATGTTCAAGTGGTCAGAAATGACAATAGTTGGCTTTCTACCATGACCAGGTTAGTATCACCTCCTTGAAAGTTGAAACTTAAGGAAATCATCTGCGAAGTCTATAGGGATACATTTTACATCATATGCTCTCAAGTGTAGTATGATATGGGTAGTGAATAGAGTAAACTAGCAGGGGATGTAGTCAATCATTTGCTTTGTTTGCACATGGCATGGTGTCTAACAAACTCCTTAGTTCACATATTTTTAAATGCCAATGGAGCACACCCTTAAGCCGAATCATGATAGGTTTTCATAATTCTCAAGTGATCTCAAATAGAACTACGGTAGAGTTTTTGCAACAAAAAAGGAATATGATAGGTATTAGGCGGAATGTGCACACATTATTGATTATAGTGTGAGCAGTCTTTCTTTCTATCTGTTGCTTGTAGCTAGCTGCAAGGCTACCTTGACACTTCATGGGTGGCACTCTTCTCAATCTTTCTAGTCATTCTTGTAAATTCCTATCAGCTACTATTTTTGGAGAACATATCAACTTGTGGTTGTATTCAAGATAAAACATCTGCCTCCATAATCTCTCTCCCTGTTTTGTACAGCGAGTTGAATCTCTATGCTAACAAGTTAGCAGCCTGTTATCTGTTACCTATCCTTCTTAAGCAACTTTCTCATCAAGTATAAGTGCATATATGCAGACTTGTGCATAAGTAGGCAAGGTCATATGATGCACAGAGTAGTTTTGAAGGAGAGGTTTAAATATTTGAAGTATTAAAAAAATATTAAATTTAGGGTTTAAATCTTATTTTGGTCCTTGAACTTTGAATTTTGTTCTATTTTGGTCCCTAAACTTTCAAAAACGTTTATTTTAGTTTTTGAACTGTTAAAAAGTGCTTACTTTAGTCCCTACTACTAAGATTCCGTTATCTTTTTAACATAATGGTGATGTGGCTTGTATTAAACAAAAGGAATTTCTAACACGTACATATATAAAGGAAACCTGCCAAAGTTTGTTGCAAAAATCATAATTGAAAAATAACAAAGTTACTAAATATATAATAGTGCTGGTTGCATAAAAAGCAAAAAGCTCATATCATATATGGCACAGGGATAAAATAATTGCATACATAGCACAAGCATTGATAAAGACTAAAAAACCCATGTCCAACTCACCATTTCACTTGCTTCTTCTTGATTTTCTCAAATGAAAAGACAGTGATAGTCACTGATAGAAGCTATCAGTTGCCATTGCCGTTAGCTGCTATCAGTTGCCGTCACCGATAGCTGCTATCAGTTGTCGTCACCGATAGCTGCTATCAGTTGCCATCATCACTAATTTTCAATTCGAGAAATGTGTTATTTGTTGCTATAATTTTCAAGTATAATTTTTGGGCTTCTTGATAATAGTCAGAAAATGAGCTTCATAGCTGATGAATCTAATTTTTTTATTGTCATCAGAGGAACTGAAGGGCTACACAAACTACCTCATTTTCTTCCAACATATTTAAAGGCAATTGAATTATAAATAGATTATAAAAAATCCTCAAGTAACATATAATAGCGCAAGTAAACCAATAAACTATGGGCAGGAGATATTTTCAAATACTCACCGGAAACTTTAAAAATGCAGGCCACCTCATCATTATATTAAAACTGAACTTAATGTTCAGGGAGTAAATAGACATTTTTAAAGTTTAATAACCAAAATAGAATAAGTTTAAAGTAGAT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TAAAACCAAACAAGTGAGTGATTTGTTGTTGAAATTTTATTACAAAAAATGTTTATAATTAATGGGATAGTTTCTTTATTCACCCTCTCGAACTTTTGTAGCTTTCAAATGTTCTTCTTCAAGGATGC 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MAAFEKDDIPMLSNTDPPMFDEQVDSYFPSYASLGRSSSLSIPENSSGMYGSEANLVGHTGPLRIERSSFMVSGSKKTGSKPKKLSQSKPGVTESKTAEPLAEKFPSFKIVDESDWSIHNYAGRNEHLIKSGQLGLCNDPFCITCPTYNSKASQQKSSRMSGIFDAKFRLAYVAPESRVVGAGELVDHPKKIAMNYLKGNFFIDLLVVLPLPQIIIFLILPKSLGSSGANYAKNLLRTAVTVQYIPRLYRFLPLLAGQSPSGFVFETAWANFVINLLTFMLAGHIVGSFWYLLGLQRVTRCFREACINTGNRSCLEYIDCGHGDESRSQILDPHRDSWTHNVNATACFGSEGFDYGIYLQAVKLTTKNSIITRYTYSLFWGFQQISTLAGNQVPSYYVYEVLFTMGIIGLGLLLFALLIGNMQNFLQALGRRRLEMSLRRRDVEQWMEHRRLPEGLRRQVRQAERYNWASTRGVNEERIFENLPEDLQKNIRRHLFKFVNKVRIFALMDYEPILDAIRERLRQKTYIEGSEVFSAGDIIEKMVFIVRGKMESRVDGNGIVVPLSEGDVCGEELLTWCLEHSSLNKDMKRQQVPAPRLVSNRTVRCLSNVEAFSLRAVDLEEVTSMFSRFLRNPRVQGAIRYESPYWRYLAAMRIQVAWRYRKRRLSRVQTSQSN Homology
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LDR2 (Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC19 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 662.5 bits (1708), Expect = 5.0e-189 Identity = 378/747 (50.60%), Postives = 472/747 (63.19%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FXH6 (Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC8 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 360.9 bits (925), Expect = 3.1e-98 Identity = 223/517 (43.13%), Postives = 303/517 (58.61%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9S9N5 (Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 7 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC7 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 353.2 bits (905), Expect = 6.5e-96 Identity = 221/517 (42.75%), Postives = 301/517 (58.22%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RWS9 (Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 352.1 bits (902), Expect = 1.4e-95 Identity = 253/657 (38.51%), Postives = 351/657 (53.42%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. NCBI nr
Match: XP_031742801.1 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1318 bits (3410), Expect = 0.0 Identity = 674/707 (95.33%), Postives = 674/707 (95.33%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. NCBI nr
Match: XP_011649574.1 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031742793.1 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN63956.2 hypothetical protein Csa_013104 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1292 bits (3343), Expect = 0.0 Identity = 674/774 (87.08%), Postives = 674/774 (87.08%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. NCBI nr
Match: XP_008467252.1 (PREDICTED: probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1239 bits (3207), Expect = 0.0 Identity = 645/774 (83.33%), Postives = 655/774 (84.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. NCBI nr
Match: KAA0036044.1 (putative cyclic nucleotide-gated ion channel 20 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1239 bits (3207), Expect = 0.0 Identity = 645/774 (83.33%), Postives = 655/774 (84.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. NCBI nr
Match: XP_008436960.1 (PREDICTED: probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo] >XP_008437038.1 PREDICTED: probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 1239 bits (3207), Expect = 0.0 Identity = 645/774 (83.33%), Postives = 655/774 (84.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3ATK8 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504623 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1239 bits (3207), Expect = 0.0 Identity = 645/774 (83.33%), Postives = 655/774 (84.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SXH8 (Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 20 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold112G00360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1239 bits (3207), Expect = 0.0 Identity = 645/774 (83.33%), Postives = 655/774 (84.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CT38 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504623 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1239 bits (3207), Expect = 0.0 Identity = 645/774 (83.33%), Postives = 655/774 (84.63%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1C626 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111008737 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1122 bits (2903), Expect = 0.0 Identity = 592/775 (76.39%), Postives = 624/775 (80.52%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089.T14 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KKW9 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495122 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1102 bits (2851), Expect = 0.0 Identity = 577/775 (74.45%), Postives = 618/775 (79.74%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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