Cucsat.G14089 (gene) Cucumber (B10) v3
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GTCAATTACACAAAGACTGTGGAAGAGTAAGGGAAGGATCCTTTGTTGGGTGGAGACAATAAAATAAGATGGCGAAATGTTCAAAGTCTTCGCAGTCGCTGCGTTGCCTTGGTCACCTCTTTTACTATTACAACCTCCTCTTCATTCTCACAATGAAGTTGCAGTTGCCGACTTCAACTCTTCACACTTTCACTTTCTCCCTCTCTCTTCTTTCTCTATGGAATTCGCTTTGGAGTCCAGTCCTAAGTAGCCTTCTCCATCTCCATCTCTCTCACTCTCAGGTTTGCCTTTTCACTCCTCTTCTTCTTACAATTTCTTTCTCTCTCTTCCTTATTTTTACTGTTCATGTATTATCCGGATGTTTTTTCACCACGCAAAGGTCGAATTCCTTGGTTCTTTCAATCGTCCTGTCTTGTACACGCATGAATTCCTTCACCACACTGTATCTCACATTTCCAGCTTTCCATAATTCCTTCTGCACACTGTCTTATATATCCATTACTGTTCATTTCCGTACTATGCGTTGGATTTGCTTTTTATAATCTACATTCCAACTTCAGTTATTAATTTACTAATCATAAAATTCAGTAATCCTATATACAAGGAATCGAGTATTCAGGTGAAACTCCCGCGGAAAATTGAGGTTCTAAGTCAAGAACTAAACCATACTGATTTACCTGAGTATCATAATCGTTGAGCTGGTGATGGTATTAGTTCAAAGTTTATGAAGTAAAACGTGATCGTCGAGTCATTGATGGTAAAATCCCATGGTTTATGAAGCGGAGGAAGTAACATGTTTTAGCAAATTTTCATTGTATTCTATGTGATGTTTGATAATATTTCTAAGAACGCGTATCCTATGTTTAAATGGAAATTGTTCCATTTTTTTTTTAAAAAAAATATTGAATAGAGCACTTCTAGCTTTATTTAAACGAATTGCTTGAAAAGAAACAAGGTAAACTTTGATGATGTTCGTTAGAGTTAAAAGTAGTCTAAAATAGTAAAAGATCTTTAGATTTTGGTATTTCTTTTGCCTAGTAGCATTCTAGGTGGGTAAACATTTTAGAATTTGTTTTTATTTGTGTATAACCTTCTATTTATTTATGCTGTATTTGTTGTTGTTGTTCTTTTCCCCAGTAAATGAGAGTTTTATGTTGACCTACATATGTCCAAGACATGCATATTTCTGAATTATTTCTTTTGGGGGTATTGACATTCTATTCATCATCTATAATCTGAGCTCCACATGGAACAATGATGCCTTTATTTCCTTGTGTGTTATCTATTTAATTAGTTGCTTCAAATTGGTTACAGTCATTGCTTCTGAATATATGGTGTGTTATTGCTCAATTTTTGTCCCAATATCACTAGTTTTACAAGCAGGGGATGTGAACTTGAGTTCCACGCAGTTGAGATTTCATTAAGTTCAGACTAACGACTCATGGTTGTCACATCATGAGGAAAAAACTCCATGTCTCTTGTGCACGTCTCATTATCGTCTCACATTTTTCTTATAATGATGTTTACCTTCAGCATTTTTGTCTTGTATTTAACTTGTTAAAATTTCCAGGTCTAGATTCTTAGGCATGGCTGCTTTTGAAAAAGACGATATACCAATGCTATCAAACACTGATCCACCAATGTTTGACGAACAAGTGGATTCTTATTTTCCTTCATATGCATCCTTGGGCCGGAGTTCGTCACTATCAATTCCAGAAAATTCTTCTGGGATGTATGGTAGCGAAGCAAATCTTGTTGGTCATACTGGTCCCCTACGGATAGAAAGAAGTTCATTCATGGTGAGTGGTTCAAAAAAAACTGGCAGTAAGCCCAAAAAACTTTCACAGTCAAAGCCAGGAGTGACTGAAAGCAAGACAGCAGAGCCGCTGGCAGAAAAATTTCCTTCGTTCAAGATTGTAGATGAGTCTGATTGGTCCATTCATAACTATGCCGGTAGGAACGAACACTTAATAAAGTCTGGCCAGCTGGGATTGTGTAATGATCCTTTCTGTATAACTTGCCCAACATATAATTCCAAAGCATCACAACAGAAAAGCTCAAGAATGTCAGGCATATTTGATGCCAAGGTATTTTCTCTCCCACTCAAACCAATGGGCTACTTTTACACGTCATGCTTATAGGATTTACTTGATACAATTTTTAGTTTTGACCTTTTTATGCATATCTCATTTAACACGTACTTTCTGTACCACGCACACAGATAGATATTCTCAACGTTTCTTTCAAAGGCAATTGGACAGCTAATGGCATCTAGCCGTTACCATCACATATACTTTCAAACTCAACCATTGATAATGATATAAAACATCTTCATGGAGATAAATAACACCTCTTCATGTGTATTCATTTATCTGCATGATAATGAAAATCTTCACACGTGTTTAATGAGTCAAACGCTGACTTATTTGTTAAATGGAAAGGGGTTGATTTTTGTACTTCTTTTGGAGGTTATATAGCATATGCATCTTCTTGTACAAAGTTGCACTATGATTTTGCTGTTTTCCCTCCTCTTTAATCAATTTTTGTGTCTCTGGATCCAGCCCTAAACTTGTGCATCAAATATAATAAAAAGTTCCATAAGTGGCCTGGCGTAGGAGAAGTAAAAACTAGCACGATGTTCTTCTCAAACTCTTCTTGTAACATTACAAGGGGTAAATGAAGTGATACTCCTTTACAAGGCACACACTATTGTCCATTGGAGGTTTATGTAAAACCTAAGCTGGGGGTTTCAAATTTATTTTGATTGTATCGAACCTTACGTTTTATGGCATTCTCAACTTCGAAATCATATCAGTATACTTGCTCACTCTTGAGTTTTCAAATAAATCTTCCCATTTACTGTTAATAAAAAATCTGTCCAACAAAGATCTTGCAGCAGTGCCACTCTTTCTTGACCAAGTAAATTTGCCATTTTCATGACCTTAGTATTGTTCTTGTTCTTTGTTTTTGGATATGATGAGGGTGCTATGGGGTTGTCAACCTAGTTGAAATGTCCGGGTGCACCTACTGATCCTCTCTCTCTCTCCCATTCCTTGGCTTCCCTATTATTCTCATTGTATAACTCTCTTGTACTTTGAGTTTATTAATAATAAAGAAGCTTGTCTCCTTTTAAAAAATATTAGAGTTAGATGAAAATGCATAACCTGTCAGTCACACACAATGGTCCTTGGTAAACCATGTGCATGTATGATTTTCCTTTTTCTCCTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTCTGTCTGTCTGTCTCTCTCTCACGCTCTCTATATGTATTTTAACGAAGGAAAAAAAAACTCTGCCTACTTCCTTGCCAGTGAATGGATGTTCAAGTGGTCAGAAATGACAATAGTTGGCTTTCTACCATGACCAGGTTAGTATCACCTCCTTGAAAGTTGAAACTTAAGGAAATCATCTGCGAAGTCTATAGGGATACATTTTACATCATATGCTCTCAAGTGTAGTATGATATGGGTAGTGAATAGAGTAAACTAGCAGGGGATGTAGTCAATCATTTGCTTTGTTTGCACATGGCATGGTGTCTAACAAACTCCTTAGTTCACATATTTTTAAATGCCAATGGAGCACACCCTTAAGCCGAATCATGATAGGTTTTCATAATTCTCAAGTGATCTCAAATAGAACTACGGTAGAGTTTTTGCAACAAAAAAGGAATATGATAGGTATTAGGCGGAATGTGCACACATTATTGATTATAGTGTGAGCAGTCTTTCTTTCTATCTGTTGCTTGTAGCTAGCTGCAAGGCTACCTTGACACTTCATGGGTGGCACTCTTCTCAATCTTTCTAGTCATTCTTGTAAATTCCTATCAGCTACTATTTTTGGAGAACATATCAACTTGTGGTTGTATTCAAGATAAAACATCTGCCTCCATAATCTCTCTCCCTGTTTTGTACAGCGAGTTGAATCTCTATGCTAACAAGTTAGCAGCCTGTTATCTGTTACCTATCCTTCTTAAGCAACTTTCTCATCAAGTATAAGTGCATATATGCAGACTTGTGCATAAGTAGGCAAGGTCATATGATGCACAGAGTAGTTTTGAAGGAGAGGTTTAAATATTTGAAGTATTAAAAAAATATTAAATTTAGGGTTTAAATCTTATTTTGGTCCTTGAACTTTGAATTTTGTTCTATTTTGGTCCCTAAACTTTCAAAAACGTTTATTTTAGTTTTTGAACTGTTAAAAAGTGCTTACTTTAGTCCCTACTACTAAGATTCCGTTATCTTTTTAACATAATGGTGATGTGGCTTGTATTAAACAAAAGGAATTTCTAACACGTACATATATAAAGGAAACCTGCCAAAGTTTGTTGCAAAAATCATAATTGAAAAATAACAAAGTTACTAAATATATAATAGTGCTGGTTGCATAAAAAGCAAAAAGCTCATATCATATATGGCACAGGGATAAAATAATTGCATACATAGCACAAGCATTGATAAAGACTAAAAAACCCATGTCCAACTCACCATTTCACTTGCTTCTTCTTGATTTTCTCAAATGAAAAGACAGTGATAGTCACTGATAGAAGCTATCAGTTGCCATTGCCGTTAGCTGCTATCAGTTGCCGTCACCGATAGCTGCTATCAGTTGTCGTCACCGATAGCTGCTATCAGTTGCCATCATCACTAATTTTCAATTCGAGAAATGTGTTATTTGTTGCTATAATTTTCAAGTATAATTTTTGGGCTTCTTGATAATAGTCAGAAAATGAGCTTCATAGCTGATGAATCTAATTTTTTTATTGTCATCAGAGGAACTGAAGGGCTACACAAACTACCTCATTTTCTTCCAACATATTTAAAGGCAATTGAATTATAAATAGATTATAAAAAATCCTCAAGTAACATATAATAGCGCAAGTAAACCAATAAACTATGGGCAGGAGATATTTTCAAATACTCACCGGAAACTTTAAAAATGCAGGCCACCTCATCATTATATTAAAACTGAACTTAATGTTC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MNPHAKVVQQWNKFFVISCLVAIFLDPLFFFLLSVQENNKCIVIDWPLTTTLVVFRSMTDFIYFLHMLLQFRLAYVAPESRVVGAGELVDHPKKIAMNYLKGNFFIDLLVVLPLPQIIIFLILPKSLGSSGANYAKNLLRTAVTVQYIPRLYRFLPLLAGQSPSGFVFETAWANFVINLLTFMLAGHIVGSFWYLLGLQRVTRCFREACINTGNRSCLEYIDCGHGDESRSQILDPHRDSWTHNVNATACFGSEGFDYGIYLQAVKLTTKNSIITRYTYSLFWGFQQISTLAGNQVPSYYVYEVLFTMGIIGLGLLLFALLIGNMQNFLQALGRRRLEMSLRRRDVEQWMEHRRLPEGLRRQVRQAERYNWASTRGVNEERIFENLPEDLQKNIRRHLFKFVNKVRIFALMDYEPILDAIRERLRQKTYIEGSEVFSAGDIIEKMVFIVRGKMESRVDGNGIVVPLSEGDVCGEELLTWCLEHSSLNKDMKRQQVPAPRLVSNRTVRCLSNVEAFSLRAVDLEEVTSMFSRFLRNPRVQGAIRYESPYWRYLAAMRIQVAWRYRKRRLSRVQTSQSN Homology
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy Swiss-Prot
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BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LDR2 (Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 19 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC19 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 654.1 bits (1686), Expect = 1.4e-186 Identity = 338/524 (64.50%), Postives = 409/524 (78.05%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FXH6 (Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 8 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC8 PE=3 SV=2) HSP 1 Score: 368.6 bits (945), Expect = 1.1e-100 Identity = 228/527 (43.26%), Postives = 307/527 (58.25%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8RWS9 (Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 5 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC5 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 363.6 bits (932), Expect = 3.7e-99 Identity = 227/519 (43.74%), Postives = 309/519 (59.54%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: O65717 (Cyclic nucleotide-gated ion channel 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CNGC1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 361.3 bits (926), Expect = 1.8e-98 Identity = 216/530 (40.75%), Postives = 306/530 (57.74%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. NCBI nr
Match: XP_011649574.1 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031742793.1 probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 [Cucumis sativus] >KGN63956.2 hypothetical protein Csa_013104 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1031 bits (2666), Expect = 0.0 Identity = 520/520 (100.00%), Postives = 520/520 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. NCBI nr
Match: XP_031742801.1 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1031 bits (2666), Expect = 0.0 Identity = 520/520 (100.00%), Postives = 520/520 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. NCBI nr
Match: XP_008467252.1 (PREDICTED: probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 999 bits (2583), Expect = 0.0 Identity = 502/520 (96.54%), Postives = 508/520 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. NCBI nr
Match: KAA0036044.1 (putative cyclic nucleotide-gated ion channel 20 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 999 bits (2583), Expect = 0.0 Identity = 502/520 (96.54%), Postives = 508/520 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. NCBI nr
Match: XP_008436960.1 (PREDICTED: probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo] >XP_008437038.1 PREDICTED: probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 999 bits (2583), Expect = 0.0 Identity = 502/520 (96.54%), Postives = 508/520 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3ATK8 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504623 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 999 bits (2583), Expect = 0.0 Identity = 502/520 (96.54%), Postives = 508/520 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SXH8 (Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 20 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold112G00360 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 999 bits (2583), Expect = 0.0 Identity = 502/520 (96.54%), Postives = 508/520 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3CT38 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103504623 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 999 bits (2583), Expect = 0.0 Identity = 502/520 (96.54%), Postives = 508/520 (97.69%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1KKW9 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111495122 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 926 bits (2393), Expect = 0.0 Identity = 461/520 (88.65%), Postives = 487/520 (93.65%), Query Frame = 0
BLAST of Cucsat.G14089 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EDG0 (probable cyclic nucleotide-gated ion channel 20, chloroplastic isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431524 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 919 bits (2374), Expect = 0.0 Identity = 458/520 (88.08%), Postives = 485/520 (93.27%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (B10) v3
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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