CmoCh01G015770.1 (mRNA) Cucurbita moschata (Rifu) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGAATAGAGTGAAGACGAACATTAAAAGTGATGGCAGAGTGAATAATGAGGAGCGCATCTCCGACCCAAAACCCGACCTCAACCTTGTCCCCGACCCCGACCCCGACACGCCTCATTACTTTGGCTCCCTTTTAAGTACGCAAGTCATCCTTGAAATCATTTATTTTGGTCCCATGGAAATTGATTTTGACAGAACAGATAATTTAATTCAATCACGAGGGGTATTGGACCTATTTTCCCCTTCCACTTTAACATTTATTATCACTGTAAATATTCATTTAATATTTATCCTCTTTCTTTCCTTCAAAAATTATTATATAAAGAATTTTTTATTTTGTTATTTACTGTCCCTTTAAATATCGTTTATAAATACATTCATGGTTGTGTCATAAAAATAAATAATCCAAAATTATTGTTAATTTATATATATATATATATTTCAAAATTTTTATTATTTATTCTAGTTAATTTTTTTATTTTATAAATTTTAATTAAATATTTGAAATTAAATCAATATATATTTTATAAACTAAAATTTTATTTTTATTTAAAAATCTAATAAATTATTCCAGCCATCCCATCTGGACTGAATAAGGTTAAATTTATTATTTAATAAGAGTTGTTCGAGTTGAAAAATTTATAACTGGAATAATTGATTTAGGTCTTAAAAAAATGTTCCAATATGACTGGACCCATGAACGCTCGGTAATTGAATACAAAAAATGAAACAACTTTACAAATATATATTTCAATTATGGTCGATGATTAAATAATAAGTTTGGAGGTATAATTCTATAAAATTTTAGTATATGTAGTTTTTTTTAAAAAACGTCATTTACTATTTTAAAAGTCGATAGTTTGACTTTTACATTACAATTGTTGAACTAAAAAAACCTCTATATTTTGACGATCATTGCGTTTTTTTTTCTAGTTGTACTAATAGATGATTTAGTTGAACACGTGTACGAGAGAAGGTAATTTATGAGAGGAGTCGAGTAGTGAAACTACTATTCAAATATGGATTTGTTTTTAGTAAACGATTAGAACCTTGGGCCCGACTACGAAACTCAATGAAACCCGAAGCCATACCTGGCACCCCACATGACCTTATATAGGTTTCGTTGTTTCACGAGATATTTTCTTACTATTTCAAACGACTATAATGAAAATCACGTGTCAATGGAAGGAAAGGAAGTTGTATGCTGCTTTCGTGTTCTTTTTAGGTTATCTTATAAAAATACATTTAAATTTCAACATTTGTTCGGAAAATACGTCTATGATTTTAAAAATGACCATATTACCCTTAACATTTCACACGTGCCCCAAAAAAAACTCAAACCCGAAGCCAGACCTCGCACCCCACACGACCTCGTATAGGTTTCGTTGTTTCACGAGATATTTTCTTACTATTTCAAACGACTATAATGAAAATCACGTGTAATGGGAGGAAAGGAAGTTGTAGGCGGCTTCCATGTTCTTTTTAGGTTATCTTATAAAAATACTTTTAAATTTCGTCATTTGTTCGGAAAATACGTCTATGATTCTAAAAATGACCATATTACCCTTAACATTTCACACGCGCCCTAAAAAAACTCAAACCCGAAGCCAGACCCTGCATCACACACGACCTCATATAGGTTTTGTTGTTTCACGAGATATTTTCTTACTATTTCAAACGACTATAATAAAAATCACATGTAAATGGAAGGAAAGGAAGTTGTATTTTAAATTTCGTCATTTGTTCGAAAAATACATCTATAATTTTAAAATGGCCATATTACCCTTTAACATTTCACATGCGCTTAAAAAATTATCCTATAAATATAAAAATATTAGAATATTAGATAAAAAGTGGTCTAAAAATAAAATTGCACGAGGATATATTTAAATAATATAAATTTATCGCATTTATTATTTTAAATGGAAGTTCAAACTGTACCCTTATCCCGCTCACGCTCCTTTGACGCTCTCTATTTCTCTGTCTCTGTCTTTCATTTTCTGACTCTCTGTCCAAAGTTCAATTTCTCCCGCTCTCTGTATTTCTGCTGAGAGCTCTCCAGATCGCCATGGAAGCGGTGGAGCTCTAGTTAGAGATGTAAGCCGAACCTTGGCAGTGTTATTTTTTGTTTTGATAATCGGTTCATCTAATCTCTCGTGCTCATTTACGAGTATTTATTTTATGCGTTTGAACGTTTGTTTGGTTGTTTTAGCGGTTTCGAATCTCGGACGGATAATGATTGTTGTGGACGTTTCGATTTATTTGTTTTGGTGCATGGCGTGGATCTTCAATGCCGATTTCTTTTGTATTTAAGTCTATTTGGAAATCTATATTGCGCTTGATGATTTGGCCTTCGTCTGGCAGTTCAAATCCGGCGGATTTTAGAGGCTACTGTATGATTCCTTGTTGTTGCTTCCATGTTACTCGTTTTGGAGGGAAATTTGATTTCTTAAGTTCTTGGAAGCGTGCGTGATTTCTCTTCCCTATTTGGCTGGCAGCGATATCGAGAGGTCTTGTATTGGTTGGGTGGATGGAAGGAGAGAAGAAATAGGGAGTTTCTTACGGTTACGATACGAAAATAAACGTATGCGGTTTGCATCAGGGGATTCTGTGTTGTCTATTGTTTACTGTTGCTGTAATCTAGGTCCGTAACTTTCTTTGAAACTGTTACATACCATTTTCGCTACTCTTCACTTCTATTGGAACACCTTTACCATTAAATTATTGGTCGAGTATTATCACAGTAGTTCTCCATGTTTATCAGATTTTTCTCGAAAATTTTTTAGAGGTGAAAAATGTTTTACGCTATAGCTTTTCCATGAAGTTTTCAATCAAGCGTTGCATGTTATTTCACTTTCTGTAGTAGCCGCATGGTTTTTTTTCTCAATTTTCCTCTGTACCTCCACGTTAAATTATTTTCAGTTTAGCGTCGGTTCTTACCCATTTATCTTATGTTGGTAATGCAGGTTCAATGAAATTGATTTTTGATCTACTGTAA ATGAATAGAGTGAAGACGAACATTAAAAGTGATGGCAGAGTGAATAATGAGGAGCGCATCTCCGACCCAAAACCCGACCTCAACCTTGTCCCCGACCCCGACCCCGACACGCCTCATTACTTTGGCTCCCTTTTAAGGGATTCTGTGTTGTCTATTGTTTACTGTTGCTGTAATCTAGGTTCAATGAAATTGATTTTTGATCTACTGTAA ATGAATAGAGTGAAGACGAACATTAAAAGTGATGGCAGAGTGAATAATGAGGAGCGCATCTCCGACCCAAAACCCGACCTCAACCTTGTCCCCGACCCCGACCCCGACACGCCTCATTACTTTGGCTCCCTTTTAAGGGATTCTGTGTTGTCTATTGTTTACTGTTGCTGTAATCTAGGTTCAATGAAATTGATTTTTGATCTACTGTAA MNRVKTNIKSDGRVNNEERISDPKPDLNLVPDPDPDTPHYFGSLLRDSVLSIVYCCCNLGSMKLIFDLL Homology
BLAST of CmoCh01G015770.1 vs. NCBI nr
Match: KAG6608176.1 (hypothetical protein SDJN03_01518, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 144.1 bits (362), Expect = 4.6e-31 Identity = 69/69 (100.00%), Postives = 69/69 (100.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucurbita moschata (Rifu) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
|