ChyUNG228270.1 (mRNA) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChyUNG228270.1
TypemRNA
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold26_size3936274: 1442605 .. 1450274 (+)
Sequence length889
RNA-Seq ExpressionChyUNG228270.1
SyntenyChyUNG228270.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
GTGTCAATGGCATATTTTGGGTAATAGGGTATTCCACAGGGAGCATGGGCAGCTCTTTGGTATATTCCTCATAAACTTGCAGGTATGAATAAGGGAATACCATTTTTCTTTAGTTAAATGCTCAAAAATCAATGTTGAAATGTAGAATTAATAAAAATGAACTTCAATAATTTATTAGAGTTTCAATGTATTAAAAGTAGATGATAGTTAAATATAGTTTAAAAATTAGATTTGAATTCAGAGTTCAGAGTTTTATTGTTGTTCATTTTATTAATGTCTAAGTAATAGTAGGAGCTACTCATTTTCATAACTATACTAGGAAGAATTGGTTTTTGGATCGTCCGAAGATGGAGCCTATAATGCAAATTGAAGGTGCAATTCAGATCAGACTTATAAGAACATGGTTAAAACTTTGTAGATTTTTAATTGCTATTAGTTATTCCCTTGTATGTGCTTTACTTTCAACTTATACTAGAGACTCCTATTGTTGTGTTTAATTGGTTCTTAGTGCCTTTTAAAATAATGTCTATGAACTGCTATGTGTGTAAGAGATTATACTTAAGATTGACATTCCATATTATGAAGGTTGACAGACCAATCCAAGAAGGTTTTGATGGAGTGGCACAGGCATTTGAATCAACAATCAATGGACATAACCATGAAGATTCAGTTGTTCAATCAAATGGAGCCCTACCAAGCTCGTCATGGCTTTAGATCCATTTGCCTGTCTTGAGGTTGTTCTACGTTGTTTCCAGTTTTTTATGTTGTTCTTAAAGCCAGTGACATGAAATCTTTCTGGAGTTTCGAATTTGTTTTGGTTGGAAGTGTGGTTTTCTTTGCTCTGTTTAGTCGAAGATCGTAATTAAGAGTTATGCCTTCTTGTGTGTTCTCCATCTACCATGTTTTCATAACAACAGTATCCTGGTATTTGATAGTTCCTTCAAAGACATAGCGCACCATGGATTTGTAAGCTTTGTTTTGTTTTTCTTACTATTTTATTTCTTATCCAAATTTGAAGGTGTTGCATAATAACAACATTTCCAGTCCAATTTCCACTGAACTTGCAACTCTTCCATTGCCTCGAACATTAGATCTCTCAAACAACCGGTTCTCTGGTTCGATACCAACATCTTTTGCTAAGCTAATAGGTCTACGCTATTTGTATGTATTTGAAAATTTCTCCCCTGTATTTTCTGTTTGGTTTTCTGGAATATGGAGGATGTAAAAAACACCTCAGAATTTTCACTTTGCGCAGAGATTTCATCATTTTACATGTACGACTCCAACAAAATTTCAATTTCTGAAGTTGGACATTTTTATATTATTTGAAGCTCTTTATTCTCAATTATTCTTAGAAACCATTTAGTTGATGCATAAGTTGCTGCTTGTCTACTTGCTCCTTTTCTGTTATTTATGAAAATAACTTGCTCTTTCTTATTTTGTCTTGTAATGAGTAGGAGGCTGAACAATTTCTGTAAATAGACACTTGAATTTTGTAGTACACAATCATGAAGTTGGGCTTGTGCGCTTAGGCAACTTGAGAAACTTTACTTTCAAAGAGCTCCAATTAGCAGCAGACCATTTTAGTTCCAAGAATATACTTGGGGCTGGAGGATTTGGTAATGTGACAAAGGATAGCTAGGAGATGGGACTATGGTGGTAGTCAAACAAATTGCTTGTTATTAGTTATCGCAGTTTTTCAATTAATGGAGACCAAAGCATCTTAATAGAAAGTGAGATCTTATTATTCTATCTCTATTCTATCTTTGAAATTAATAGAAATTGAGGTTCCATTTGTAAAAATTACTAAAGAAGCTTATGCTTCTCAAACTGTAACTTTTGTGATATTAACAATATAGGCATATACTGTAGTTATGTAGGTGAGCTGAGTCTCCTTTCATTTCTCTCCCTCTCTTAATCAGTTTATTAGGAATTTTTTTTTAAATATGTTTTTGAATTCTTACATCTTTTTGTTTGTCTTTGAGATTCTTTAATATATAGAATTTTTATTAAGTCTAATGGAATTCTAATCAGGATGTTGACTATGGTTGTTTAAAAATGGAGGACTTGGTCTTGGGTACTTATATCACCATATGGCAATGGAAGAAATAAGTCGTGCTTATGGGTCTGTTGCACATTTTGTTTGTGATGTCTTATTGTGATTAGATAGTCTTATTAGACAATATGGACTCCATTTGTTATCTTAATCATCTATTTTCTTCTTCAGGTGAGGAATGGAAACCCAACTCAAAAGGAGAAGTACTTGCCTAAGGTTTGTGCATTTCTGCCTACGCTCAATATTGTTCTTGATTTCCTTAAGAATGTTCATGTTATAATGATTACCTAACTGCACATACACAACAATGTCATATTGTAAGATAGAACGATAGCTCATGGCCTGTATCAACCAGTTCTCTATACTTTCTTCATTTTCTTGTCTTTGCATTAATTCTTGGTCTCTTTACATCTCTATATATTTAAGTATTTTTCTTGTTCTTCATTGATTTTTTTTAGTGCATTGAAGTTGCTAGGATGTCACATTCTTTTTCAAAGCTGCCTTGTTAGAATTCTAAAGATGGTTTATTTTGATATTGTTTATAGAATGATTAAAGCCATATTGGGTTGAAAGCTAAGTGCTTGTGTAGATAGCCAGGCGATCGTTGAAGGTTGAAAGATTGTGAAGACATTTAGAATTTCTTATTTAAGTCTTGTATTAGGATCTTGGTTCATGTACGGTTGTAGAATATATATACAAACACAATATTAAAATTTCATTTCGTGTATACAAATGTAAAAGGCAAATATTATAGTTTCTAAAATAATATTAATTTTATTGATTTATTGGCGTGAGAAAAAAAATATTTATCTATATGGACCCAATGTTGATTTATAAAAAATGGACAAAAATGCAACAATTAAATAAAAATAAATTTTTAAAAATAAATAAAAAAAAACTAGACGTTAATGTCGGTTTTAAAACGACATCAAAGGCCAACCGACACTAAAGATCTTCAATAACACCATAAAAAATGTTGGTTTAAAAATGACATTAAAGGCCATATTTCTTCTAGTGGATGAAGAAATGCTTTACATACGACAGAAAGGCTATTTCTTTCCATCAACTTTCTAGAACGTTGGACATCTCTTCAGGTGTACGAATGGCGGTCTATTCAGATGCCAATCATTTTCAAATGGTGAAAAAGGAGGCTTTTTATAGGCAACTTTTTGGCTAGAAACTATTCTTCTGGTTGTGTCAACATCGAAAGCAACCTCTATCATCAAGTCACATAAACTCCAACTACCACTTTTGTCTTCTAGCGAACTTCTTCTTGCGTTTTGATATGGTTTTCTCTCATAATCTTTGCGCTAGTTCCCATGTGATTCGCTAGCTTCTTCTTTTGTTCATAAACTTGCACTAAAACACTAAAAACAGAGTAAAATAGGCATTAATGCTTATATAAAGTGTATTTCCGAATATTTATAGATTTTCAACATAAGATATGCGTTTTGGCACTTTTACTATGTGTTTTGGCCTCATTATTTTGCCTAAAAGGCTATAATAACTTGTGTTTCTACAAGTTATCATATCACCATCTCCCAAATTTAATTCAAAAGTCGTTAATGACCCAAACGGTTCATCAAGTTTCATAGTTGTAACATCATTAACTTTTTCTATGGCAGTGACTTTCATACTGAAGCGTTGAGGAAGCAATTGTAGAACTTTCCTTATAATTTTAGTATTTGAAATCTTCTGTTCGAGAGCATAAGACTCATTTGTTATATCATGAACATAAACATTGAATTACGCAATAGGTTTATCATCAGACATTTTGAGTGCGTCAAATTTTGAAGTCAATATCTGCAATCATGGCATTTTCACCTTCGAAGTTCCTTCATAAGCCACCTCTAAGATACTCCACGCTTCCCTAACAGATGTACAAGTGGTAATGAGCTTGAATACATTTTGATCCACTTCATTAAAAATCACATTCAAGACACGAGAATTTCCCAAGGATGCTTCATTTTAAGCATTTGACCACGAAATCTTAGATTTGAGAGACACTTTTCCAGTTGCATTGTCTTGCTTGAATGTTCCCATCCTATTACAACAACTTTCTAAGATTTATTGTCAATAGACTTTAGAAATGTTGTCATCCTTGCTTTCCAGTATAGTAACCGTAGTTTGATCCATTAAGAACAAAAGGTCTAGTAGTTAAACTTCCTTCTCGAATTGGTTCCATGGCACAAAACACCTTTGTAACTCGCTCTGATACCAAATGAGAAAACACACACTTAGTTATCGTTGTATCATTTATTAGAACTTATGTTAATAATTGGAAGAACAACTCAAGAAACACATAATTAGCACAGGTAGAACATAAGATTTTGTTAACCTAGTTTGATGACACAACATCTACACTTGGGAGATCCTTGACCCATAATAAGAGATAATTTATTGCCTTGTGTAATATTTCATTACTACAACGTTATGACTCAAAGTACAGACAAATTTACAAATCTCAACATGTTGCACATATACTAATCTGAACATCAGAAATAAATGATGCGTAAACAATTGTCATAAACTCGAGAATTACTCCTCTTTAATCAGTATCCCACACATCACATTGGTATCAAGATCTCTTGATATTCTTAAATCTCTTATTATGAAAAACAAAGGGTCAATCTATCTATCATCATAGAGTTTTTCAACACATTGCTTTTTCACTTTTTCTTTAACCCTGTTACACACCACAACACTCGAACTTGAAGAAAAGACTTAGAATCACACTCGATCACAATGCCGAACTAAACCAGAAAATAAGGAAAGCAACCACAAAATACCCAACCGCACCTTGAGAAAAAATAGGATCCAAGCCAAACAACTTGCCGAAATCCCAACAACCCTATCTAGAAGGACTATTAATAAAATAAATAAAGAAAGTGAGACCACACAAACTAAGAAACATATTTTCTCGTCTACCAATAATAATGTACATCAAAAGAATAACATTCTCCTTTAGATTGACTTCATGTCATTTAATTTATATTTAAATTAAAGCGTAATCTAATTCTTGTAAAGTAAACAATGAAAAAAAGTTAATAAAAAGTTTTATAGAGGGTGTACTTTTTAATATTATAATTGACAAAACTTTAATATTGTTATATGGATGACTTTAGCTTGCCTTCTTTAAGCTTGCATTGTTTTTTAGTATTTTATAAAATTTACCGATATAATTTAGAATTTTTTTTAAATATAGTAAATGAACTAAAATATTTACAAAGTATAGTAAAATTTTAGATTCTATCGATGATAAGTATTGATAGACTATATCGATAGAATTTAATATTTTATTATATTTTGTAAAAAACAGTTTTATCATTTTTAATAATTTTCATGTAATTTAAATTAGCCTGCATTAAATGTTTTAATAATAATGAGCAACATTTTCAAGTACATATTTTACTTATTCTTAATAGATAAAATGATTTTTTAAAAAAGTAAAATTAAGAGAATAAAGTTTAGAGAACAAAATCTTTATTTTTGACTAAACCATTTAATCTTATTGTTAACATAATGGACCTTTACATATCTCTTCTTGTGGATCTCTGTGTGTCACAAATACACATAAATTTTCCGAACACGAGCTTAATTAGTGTTCATAAATAGCATAAATTTTGTAGTGTGGACAGTTTACAAAGTTTTTTTTTTGTAGGCCACCAACCTAATAAAACAAGTCATGGGTTTATATTGTTGAGCATTTAAAATTTCATTAAGTTGTTCTTGTGTTTGACATAAATATAGGTTTAGGGTGGAAATATATATTATTTTATGGTTAATTTTCATAAATATAACAAATAGAAATTGTCAAAAATAATAAATTTGACAAAATATTTACAACATATAGTAAAATTTTCAGATTCTATCAGCAATAAACATTGATAAACCTACTATGCTTCTATAAGTGGCATTGTAGACAGTGATAAAAGTCTATCAGTTTCTATCATTGATAAAATCTAAAATTCTGTTATAACTTGTAAATATTTTAATTTATTTTGCTATTTTAAAAAATGCCTCTATAATAAAACACCAACATCTAAATCAAAAAGTCCATGAAGTTGACTATTTTTCTTTTAAGCATTCTAGGTTTGCTCTTCCTTTCTATCTTCTTTTTTCTTCAATTTTTCTTTTCATTGCCCTCGTCCTTTTGTCTTCTTCTATTCCATTTTTTTTCCTTATTTGGTTGTTCAAAATTGTGTGCCAATTATAAAAGACCGTGAAAAAAAATAATTGGGATATTGGAGTAACCAAATCTAGATGATCATATTAACCAAATCTAAACGATCGTGTACCAAATCTAAGTGGTCATGTACCAAAAAAATATTGAAAAAAAAATTGTTTAGATTTGGCAACCCAAATTTAAATGATCATGTACCAAAGAATAGTCAAATCTAAATGATGGTGTACCAAAAGAATCTTAAAATAAAATGTTTAGGTTTGGACCAAATCTAAATGATAAAATCTAAACGGTCGTGTACTAAATCTAAACGATCGTGTACCAAAAAATTTGAAAAAAATTTATTGATTTGGCTACCCAAACTTAAACAATCAAATCTAAACAATCGTGTATAAAGAATAGTTAAATCTAAACTCGTGTACCAAAGAATCTTAAAAAAAATCATCAATGATAGTGTAGAATAGTCAAATTTAAACGATCGTTTACTAAATATATTACGTCCGCTGGGTGCTAATTAATCAAGGGGATATTTTGTATATTTTTCATTGTAAATGTGTGGGCTTTTTTCATTTTCGAAATTATTCTATAACGTGTAAATATTTTTTCGCTTTGTTAGAATTTTGAAAAAGCTCCTTATTTTATTCAATTTAAAATGCATTGTATCAATGTCTGGAACATGTGCAACTACTGTTATAAAAAAGGATACAAATATGAAATTCTATTTATTAGTACTTTTTTTTTTTTTTTGCAAATGATAATATTTTAAGTTATATTCAATTCACCTTAAAAAAAATTAAGATTCCGAAGTCTCTTCTTGAGTTGATATAAAAGACTAATACTCTACTGAACTTTGTTCCATCTTCAACATTTTCATAGAAACAAATATATAGTATTAACCAGATGTATATCTCAAATCTTCAAGTTTCCAAGGCCAAGTATGAAGCAAGTAAGTTGATGAAGAAGCATGAAAATAATGACGAAGGTGTTCCACTTAAAGCTTTCGATGACATTCCTCCAGCTTCAACTCAAATCAACAACAAGCAAGCAATGGCAACGGAAATTTTCCTGAAACCTAGTAATCATCCTGTTGCACACTACCTTACATCAAATGCCTATATGATACCAAGTAAGCAATTGGGAGCTGGAAAAGCTCAAGTAACCACCACAAGTGTTCTTGATATAAAGGCTTCTAATATGCAATTTAGTCGAGAGCAAATAAAAGAAATTTTTCAGTATCATGATGGCGACAATGATGGTTTTCTCAACCTAAGGGAGGTAACCAAAGCTTTTGCTTTTCTAGGCACAATTCTTCCATTATACAAAGCCTACCATGGCATGGTATACGCTGATGCTAATAAAGATGGTCTTATTAGCAAGGATGAACTCGAAAAACTCGTTGATTATGCATATAAGTTTTTCAAGAAACGATGA

mRNA sequence

GTGTCAATGGCATATTTTGGGTAATAGGGTATTCCACAGGGAGCATGGGCAGCTCTTTGGTATATTCCTCATAAACTTGCAGGTTGACAGACCAATCCAAGAAGGTTTTGATGGAGTGGCACAGGCATTTGAATCAACAATCAATGGACATAACCATGAAGATTCAGTGTTGCATAATAACAACATTTCCAGTCCAATTTCCACTGAACTTGCAACTCTTCCATTGCCTCGAACATTAGATCTCTCAAACAACCGGTTCTCTGGTTCGATACCAACATCTTTTGCTAAGCTAATAGGTCTACGCTATTTGTATGTGAGGAATGGAAACCCAACTCAAAAGGAGAAGTACTTGCCTAAGATGTATATCTCAAATCTTCAAGTTTCCAAGGCCAAGTATGAAGCAAGTAAGTTGATGAAGAAGCATGAAAATAATGACGAAGGTGTTCCACTTAAAGCTTTCGATGACATTCCTCCAGCTTCAACTCAAATCAACAACAAGCAAGCAATGGCAACGGAAATTTTCCTGAAACCTAGTAATCATCCTGTTGCACACTACCTTACATCAAATGCCTATATGATACCAAGTAAGCAATTGGGAGCTGGAAAAGCTCAAGTAACCACCACAAGTGTTCTTGATATAAAGGCTTCTAATATGCAATTTAGTCGAGAGCAAATAAAAGAAATTTTTCAGTATCATGATGGCGACAATGATGGTTTTCTCAACCTAAGGGAGGTAACCAAAGCTTTTGCTTTTCTAGGCACAATTCTTCCATTATACAAAGCCTACCATGGCATGGTATACGCTGATGCTAATAAAGATGGTCTTATTAGCAAGGATGAACTCGAAAAACTCGTTGATTATGCATATAAGTTTTTCAAGAAACGATGA

Coding sequence (CDS)

GTGTCAATGGCATATTTTGGGTAATAGGGTATTCCACAGGGAGCATGGGCAGCTCTTTGGTATATTCCTCATAAACTTGCAGGTTGACAGACCAATCCAAGAAGGTTTTGATGGAGTGGCACAGGCATTTGAATCAACAATCAATGGACATAACCATGAAGATTCAGTGTTGCATAATAACAACATTTCCAGTCCAATTTCCACTGAACTTGCAACTCTTCCATTGCCTCGAACATTAGATCTCTCAAACAACCGGTTCTCTGGTTCGATACCAACATCTTTTGCTAAGCTAATAGGTCTACGCTATTTGTATGTGAGGAATGGAAACCCAACTCAAAAGGAGAAGTACTTGCCTAAGATGTATATCTCAAATCTTCAAGTTTCCAAGGCCAAGTATGAAGCAAGTAAGTTGATGAAGAAGCATGAAAATAATGACGAAGGTGTTCCACTTAAAGCTTTCGATGACATTCCTCCAGCTTCAACTCAAATCAACAACAAGCAAGCAATGGCAACGGAAATTTTCCTGAAACCTAGTAATCATCCTGTTGCACACTACCTTACATCAAATGCCTATATGATACCAAGTAAGCAATTGGGAGCTGGAAAAGCTCAAGTAACCACCACAAGTGTTCTTGATATAAAGGCTTCTAATATGCAATTTAGTCGAGAGCAAATAAAAGAAATTTTTCAGTATCATGATGGCGACAATGATGGTTTTCTCAACCTAAGGGAGGTAACCAAAGCTTTTGCTTTTCTAGGCACAATTCTTCCATTATACAAAGCCTACCATGGCATGGTATACGCTGATGCTAATAAAGATGGTCTTATTAGCAAGGATGAACTCGAAAAACTCGTTGATTATGCATATAAGTTTTTCAAGAAACGATGA

Protein sequence

VSMAYFG**GIPQGAWAALWYIPHKLAG*QTNPRRF*WSGTGI*INNQWT*P*RFSVA**QHFQSNFH*TCNSSIASNIRSLKQPVLWFDTNIFC*ANRSTLFVCEEWKPNSKGEVLA*DVYLKSSSFQGQV*SK*VDEEA*K**RRCST*SFR*HSSSFNSNQQQASNGNGNFPET**SSCCTLPYIKCLYDTK*AIGSWKSSSNHHKCS*YKGF*YAI*SRANKRNFSVS*WRQ*WFSQPKGGNQSFCFSRHNSSIIQSLPWHGIR*C**RWSY*QG*TRKTR*LCI*VFQETMX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 134..153

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
ChyUNG228270ChyUNG228270gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ChyUNG228270.1.exon1ChyUNG228270.1.exon1exon
ChyUNG228270.1.exon2ChyUNG228270.1.exon2exon
ChyUNG228270.1.exon3ChyUNG228270.1.exon3exon
ChyUNG228270.1.exon4ChyUNG228270.1.exon4exon
ChyUNG228270.1.exon5ChyUNG228270.1.exon5exon


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ChyUNG228270.1.cds1ChyUNG228270.1.cds1CDS
ChyUNG228270.1.cds2ChyUNG228270.1.cds2CDS
ChyUNG228270.1.cds3ChyUNG228270.1.cds3CDS
ChyUNG228270.1.cds4ChyUNG228270.1.cds4CDS
ChyUNG228270.1.cds5ChyUNG228270.1.cds5CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
ChyUNG228270.1ChyUNG228270.1-proteinpolypeptide