ChyUNG228270 (gene) Cucumber (hystrix) v1

Overview
NameChyUNG228270
Typegene
OrganismCucumis hystrix (Cucumber (hystrix) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold26_size3936274: 1442605 .. 1450274 (+)
RNA-Seq ExpressionChyUNG228270
SyntenyChyUNG228270
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptide
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GTGTCAATGGCATATTTTGGGTAATAGGGTATTCCACAGGGAGCATGGGCAGCTCTTTGGTATATTCCTCATAAACTTGCAGGTATGAATAAGGGAATACCATTTTTCTTTAGTTAAATGCTCAAAAATCAATGTTGAAATGTAGAATTAATAAAAATGAACTTCAATAATTTATTAGAGTTTCAATGTATTAAAAGTAGATGATAGTTAAATATAGTTTAAAAATTAGATTTGAATTCAGAGTTCAGAGTTTTATTGTTGTTCATTTTATTAATGTCTAAGTAATAGTAGGAGCTACTCATTTTCATAACTATACTAGGAAGAATTGGTTTTTGGATCGTCCGAAGATGGAGCCTATAATGCAAATTGAAGGTGCAATTCAGATCAGACTTATAAGAACATGGTTAAAACTTTGTAGATTTTTAATTGCTATTAGTTATTCCCTTGTATGTGCTTTACTTTCAACTTATACTAGAGACTCCTATTGTTGTGTTTAATTGGTTCTTAGTGCCTTTTAAAATAATGTCTATGAACTGCTATGTGTGTAAGAGATTATACTTAAGATTGACATTCCATATTATGAAGGTTGACAGACCAATCCAAGAAGGTTTTGATGGAGTGGCACAGGCATTTGAATCAACAATCAATGGACATAACCATGAAGATTCAGTTGTTCAATCAAATGGAGCCCTACCAAGCTCGTCATGGCTTTAGATCCATTTGCCTGTCTTGAGGTTGTTCTACGTTGTTTCCAGTTTTTTATGTTGTTCTTAAAGCCAGTGACATGAAATCTTTCTGGAGTTTCGAATTTGTTTTGGTTGGAAGTGTGGTTTTCTTTGCTCTGTTTAGTCGAAGATCGTAATTAAGAGTTATGCCTTCTTGTGTGTTCTCCATCTACCATGTTTTCATAACAACAGTATCCTGGTATTTGATAGTTCCTTCAAAGACATAGCGCACCATGGATTTGTAAGCTTTGTTTTGTTTTTCTTACTATTTTATTTCTTATCCAAATTTGAAGGTGTTGCATAATAACAACATTTCCAGTCCAATTTCCACTGAACTTGCAACTCTTCCATTGCCTCGAACATTAGATCTCTCAAACAACCGGTTCTCTGGTTCGATACCAACATCTTTTGCTAAGCTAATAGGTCTACGCTATTTGTATGTATTTGAAAATTTCTCCCCTGTATTTTCTGTTTGGTTTTCTGGAATATGGAGGATGTAAAAAACACCTCAGAATTTTCACTTTGCGCAGAGATTTCATCATTTTACATGTACGACTCCAACAAAATTTCAATTTCTGAAGTTGGACATTTTTATATTATTTGAAGCTCTTTATTCTCAATTATTCTTAGAAACCATTTAGTTGATGCATAAGTTGCTGCTTGTCTACTTGCTCCTTTTCTGTTATTTATGAAAATAACTTGCTCTTTCTTATTTTGTCTTGTAATGAGTAGGAGGCTGAACAATTTCTGTAAATAGACACTTGAATTTTGTAGTACACAATCATGAAGTTGGGCTTGTGCGCTTAGGCAACTTGAGAAACTTTACTTTCAAAGAGCTCCAATTAGCAGCAGACCATTTTAGTTCCAAGAATATACTTGGGGCTGGAGGATTTGGTAATGTGACAAAGGATAGCTAGGAGATGGGACTATGGTGGTAGTCAAACAAATTGCTTGTTATTAGTTATCGCAGTTTTTCAATTAATGGAGACCAAAGCATCTTAATAGAAAGTGAGATCTTATTATTCTATCTCTATTCTATCTTTGAAATTAATAGAAATTGAGGTTCCATTTGTAAAAATTACTAAAGAAGCTTATGCTTCTCAAACTGTAACTTTTGTGATATTAACAATATAGGCATATACTGTAGTTATGTAGGTGAGCTGAGTCTCCTTTCATTTCTCTCCCTCTCTTAATCAGTTTATTAGGAATTTTTTTTTAAATATGTTTTTGAATTCTTACATCTTTTTGTTTGTCTTTGAGATTCTTTAATATATAGAATTTTTATTAAGTCTAATGGAATTCTAATCAGGATGTTGACTATGGTTGTTTAAAAATGGAGGACTTGGTCTTGGGTACTTATATCACCATATGGCAATGGAAGAAATAAGTCGTGCTTATGGGTCTGTTGCACATTTTGTTTGTGATGTCTTATTGTGATTAGATAGTCTTATTAGACAATATGGACTCCATTTGTTATCTTAATCATCTATTTTCTTCTTCAGGTGAGGAATGGAAACCCAACTCAAAAGGAGAAGTACTTGCCTAAGGTTTGTGCATTTCTGCCTACGCTCAATATTGTTCTTGATTTCCTTAAGAATGTTCATGTTATAATGATTACCTAACTGCACATACACAACAATGTCATATTGTAAGATAGAACGATAGCTCATGGCCTGTATCAACCAGTTCTCTATACTTTCTTCATTTTCTTGTCTTTGCATTAATTCTTGGTCTCTTTACATCTCTATATATTTAAGTATTTTTCTTGTTCTTCATTGATTTTTTTTAGTGCATTGAAGTTGCTAGGATGTCACATTCTTTTTCAAAGCTGCCTTGTTAGAATTCTAAAGATGGTTTATTTTGATATTGTTTATAGAATGATTAAAGCCATATTGGGTTGAAAGCTAAGTGCTTGTGTAGATAGCCAGGCGATCGTTGAAGGTTGAAAGATTGTGAAGACATTTAGAATTTCTTATTTAAGTCTTGTATTAGGATCTTGGTTCATGTACGGTTGTAGAATATATATACAAACACAATATTAAAATTTCATTTCGTGTATACAAATGTAAAAGGCAAATATTATAGTTTCTAAAATAATATTAATTTTATTGATTTATTGGCGTGAGAAAAAAAATATTTATCTATATGGACCCAATGTTGATTTATAAAAAATGGACAAAAATGCAACAATTAAATAAAAATAAATTTTTAAAAATAAATAAAAAAAAACTAGACGTTAATGTCGGTTTTAAAACGACATCAAAGGCCAACCGACACTAAAGATCTTCAATAACACCATAAAAAATGTTGGTTTAAAAATGACATTAAAGGCCATATTTCTTCTAGTGGATGAAGAAATGCTTTACATACGACAGAAAGGCTATTTCTTTCCATCAACTTTCTAGAACGTTGGACATCTCTTCAGGTGTACGAATGGCGGTCTATTCAGATGCCAATCATTTTCAAATGGTGAAAAAGGAGGCTTTTTATAGGCAACTTTTTGGCTAGAAACTATTCTTCTGGTTGTGTCAACATCGAAAGCAACCTCTATCATCAAGTCACATAAACTCCAACTACCACTTTTGTCTTCTAGCGAACTTCTTCTTGCGTTTTGATATGGTTTTCTCTCATAATCTTTGCGCTAGTTCCCATGTGATTCGCTAGCTTCTTCTTTTGTTCATAAACTTGCACTAAAACACTAAAAACAGAGTAAAATAGGCATTAATGCTTATATAAAGTGTATTTCCGAATATTTATAGATTTTCAACATAAGATATGCGTTTTGGCACTTTTACTATGTGTTTTGGCCTCATTATTTTGCCTAAAAGGCTATAATAACTTGTGTTTCTACAAGTTATCATATCACCATCTCCCAAATTTAATTCAAAAGTCGTTAATGACCCAAACGGTTCATCAAGTTTCATAGTTGTAACATCATTAACTTTTTCTATGGCAGTGACTTTCATACTGAAGCGTTGAGGAAGCAATTGTAGAACTTTCCTTATAATTTTAGTATTTGAAATCTTCTGTTCGAGAGCATAAGACTCATTTGTTATATCATGAACATAAACATTGAATTACGCAATAGGTTTATCATCAGACATTTTGAGTGCGTCAAATTTTGAAGTCAATATCTGCAATCATGGCATTTTCACCTTCGAAGTTCCTTCATAAGCCACCTCTAAGATACTCCACGCTTCCCTAACAGATGTACAAGTGGTAATGAGCTTGAATACATTTTGATCCACTTCATTAAAAATCACATTCAAGACACGAGAATTTCCCAAGGATGCTTCATTTTAAGCATTTGACCACGAAATCTTAGATTTGAGAGACACTTTTCCAGTTGCATTGTCTTGCTTGAATGTTCCCATCCTATTACAACAACTTTCTAAGATTTATTGTCAATAGACTTTAGAAATGTTGTCATCCTTGCTTTCCAGTATAGTAACCGTAGTTTGATCCATTAAGAACAAAAGGTCTAGTAGTTAAACTTCCTTCTCGAATTGGTTCCATGGCACAAAACACCTTTGTAACTCGCTCTGATACCAAATGAGAAAACACACACTTAGTTATCGTTGTATCATTTATTAGAACTTATGTTAATAATTGGAAGAACAACTCAAGAAACACATAATTAGCACAGGTAGAACATAAGATTTTGTTAACCTAGTTTGATGACACAACATCTACACTTGGGAGATCCTTGACCCATAATAAGAGATAATTTATTGCCTTGTGTAATATTTCATTACTACAACGTTATGACTCAAAGTACAGACAAATTTACAAATCTCAACATGTTGCACATATACTAATCTGAACATCAGAAATAAATGATGCGTAAACAATTGTCATAAACTCGAGAATTACTCCTCTTTAATCAGTATCCCACACATCACATTGGTATCAAGATCTCTTGATATTCTTAAATCTCTTATTATGAAAAACAAAGGGTCAATCTATCTATCATCATAGAGTTTTTCAACACATTGCTTTTTCACTTTTTCTTTAACCCTGTTACACACCACAACACTCGAACTTGAAGAAAAGACTTAGAATCACACTCGATCACAATGCCGAACTAAACCAGAAAATAAGGAAAGCAACCACAAAATACCCAACCGCACCTTGAGAAAAAATAGGATCCAAGCCAAACAACTTGCCGAAATCCCAACAACCCTATCTAGAAGGACTATTAATAAAATAAATAAAGAAAGTGAGACCACACAAACTAAGAAACATATTTTCTCGTCTACCAATAATAATGTACAT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mRNA sequence

GTGTCAATGGCATATTTTGGGTAATAGGGTATTCCACAGGGAGCATGGGCAGCTCTTTGGTATATTCCTCATAAACTTGCAGGTTGACAGACCAATCCAAGAAGGTTTTGATGGAGTGGCACAGGCATTTGAATCAACAATCAATGGACATAACCATGAAGATTCAGTGTTGCATAATAACAACATTTCCAGTCCAATTTCCACTGAACTTGCAACTCTTCCATTGCCTCGAACATTAGATCTCTCAAACAACCGGTTCTCTGGTTCGATACCAACATCTTTTGCTAAGCTAATAGGTCTACGCTATTTGTATGTGAGGAATGGAAACCCAACTCAAAAGGAGAAGTACTTGCCTAAGATGTATATCTCAAATCTTCAAGTTTCCAAGGCCAAGTATGAAGCAAGTAAGTTGATGAAGAAGCATGAAAATAATGACGAAGGTGTTCCACTTAAAGCTTTCGATGACATTCCTCCAGCTTCAACTCAAATCAACAACAAGCAAGCAATGGCAACGGAAATTTTCCTGAAACCTAGTAATCATCCTGTTGCACACTACCTTACATCAAATGCCTATATGATACCAAGTAAGCAATTGGGAGCTGGAAAAGCTCAAGTAACCACCACAAGTGTTCTTGATATAAAGGCTTCTAATATGCAATTTAGTCGAGAGCAAATAAAAGAAATTTTTCAGTATCATGATGGCGACAATGATGGTTTTCTCAACCTAAGGGAGGTAACCAAAGCTTTTGCTTTTCTAGGCACAATTCTTCCATTATACAAAGCCTACCATGGCATGGTATACGCTGATGCTAATAAAGATGGTCTTATTAGCAAGGATGAACTCGAAAAACTCGTTGATTATGCATATAAGTTTTTCAAGAAACGATGA

Coding sequence (CDS)

GTGTCAATGGCATATTTTGGGTAATAGGGTATTCCACAGGGAGCATGGGCAGCTCTTTGGTATATTCCTCATAAACTTGCAGGTTGACAGACCAATCCAAGAAGGTTTTGATGGAGTGGCACAGGCATTTGAATCAACAATCAATGGACATAACCATGAAGATTCAGTGTTGCATAATAACAACATTTCCAGTCCAATTTCCACTGAACTTGCAACTCTTCCATTGCCTCGAACATTAGATCTCTCAAACAACCGGTTCTCTGGTTCGATACCAACATCTTTTGCTAAGCTAATAGGTCTACGCTATTTGTATGTGAGGAATGGAAACCCAACTCAAAAGGAGAAGTACTTGCCTAAGATGTATATCTCAAATCTTCAAGTTTCCAAGGCCAAGTATGAAGCAAGTAAGTTGATGAAGAAGCATGAAAATAATGACGAAGGTGTTCCACTTAAAGCTTTCGATGACATTCCTCCAGCTTCAACTCAAATCAACAACAAGCAAGCAATGGCAACGGAAATTTTCCTGAAACCTAGTAATCATCCTGTTGCACACTACCTTACATCAAATGCCTATATGATACCAAGTAAGCAATTGGGAGCTGGAAAAGCTCAAGTAACCACCACAAGTGTTCTTGATATAAAGGCTTCTAATATGCAATTTAGTCGAGAGCAAATAAAAGAAATTTTTCAGTATCATGATGGCGACAATGATGGTTTTCTCAACCTAAGGGAGGTAACCAAAGCTTTTGCTTTTCTAGGCACAATTCTTCCATTATACAAAGCCTACCATGGCATGGTATACGCTGATGCTAATAAAGATGGTCTTATTAGCAAGGATGAACTCGAAAAACTCGTTGATTATGCATATAAGTTTTTCAAGAAACGATGA

Protein sequence

VSMAYFG**GIPQGAWAALWYIPHKLAG*QTNPRRF*WSGTGI*INNQWT*P*RFSVA**QHFQSNFH*TCNSSIASNIRSLKQPVLWFDTNIFC*ANRSTLFVCEEWKPNSKGEVLA*DVYLKSSSFQGQV*SK*VDEEA*K**RRCST*SFR*HSSSFNSNQQQASNGNGNFPET**SSCCTLPYIKCLYDTK*AIGSWKSSSNHHKCS*YKGF*YAI*SRANKRNFSVS*WRQ*WFSQPKGGNQSFCFSRHNSSIIQSLPWHGIR*C**RWSY*QG*TRKTR*LCI*VFQETMX
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Cucumber (hystrix) v1
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 134..153

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
ChyUNG228270.1ChyUNG228270.1mRNA