CcUC09G170380.1 (mRNA) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC09G170380.1
TypemRNA
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr09: 6682204 .. 6692876 (-)
Sequence length674
RNA-Seq ExpressionCcUC09G170380.1
SyntenyCcUC09G170380.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGAGTAAGGATTAGATCTTTATCAAGAAAGTTGTTAAACTATTGAAATTCCATTTGTAAACATGATTAAATCAAAAATCATTAATCTTATAATTAATTTAGATCAATTAAAAATTTAAAACCATACTTTCAAGATTATAGCTTTTCATATTCCAACTTTCCAAGATTCTTATACTAATTAGTTTTCTAATTCATATTATATTTTAAATATGCATTAAAATGTTATAATTAAGAGGAAAATTTGATAATAGATAATCTACTTGTAACGATTTGATTTCTTAGGGCTTGAACTAGGTCGTCATTATATGCATGCAAACATCTCAAACAACTCTTTTACACAATTTCACTGAAAATCAAAGGAAATATTATTAAAAATAAATATCTTTTGCAAAATCTAAATAACTAAAAAATCTTTGATCAGGGTACCCTTTATACAATTTAATAAAACAAGAAACTTGCATAAACCAAAATTCTTAAGGACGAAAACATGAAATCTTATGCGAAAGCATCTGACTAGTCTTAATGCCACTATCAAAGTTTTCTTTTGTCACATCAAGGTGTCCTTTCCCTTACCTGAAAAGAAATATCATGAAAAGGGTGAGTACAAGATACTCAGGGTCAGGCTAAACACTTATATCAAATAAGTGCAACAATCAAGTGAAAGATGCATAAGTAAGCTAATCCTGGATGGCCACCTAGTGAACGATTTAACCAATCCTAACACGCATCTAGTGGTTTGAAGCTCACAAACATAGTAGGACACCCGTCGGCATCCAATATTGTAGTAGGAAATCCGTTGGTTTCTGGGGCATAGCAAGAGACCCATAAGCTTCCGATAACATAGTAATGTTAAGAGGGCAACCGCCACTTCTCAATTTAGATATAACTCCGATACCTTTTAATAATTTTCACATAAACCATAGAACATGCCTCAAAGCCCCACACATAAACATATCAAATACATGCTAGTATCATCAAACTAATGAAAACAGTTCAAATCATAATAGGCTTCTCATTTCATCTAGATAACCCAAATGAAATCAGTTTAAATCGCCTGGCTTAAGGGTGATTCCAGTAATAAGATTAAGGACTAAGTCTAAATAGTTATTCAAGCGGCCAATTCTTACAAAATCCCTAGATTAAAACCGAGAGAAAAAACCCCAAACTTAAATTAAATCTCTAGGTTTAATTTCCAATCACAAATTAAACAAATTTAAACCAAATAATTTTATCCAAAGGTAGCTTAACTTGAAATAGCTTCCAACCTTCCAAATCAAAGCAACTTTAAGCCATCTAACCAGAAATAAGAATTTAAGATTGACCTTCCGGCATTACAATTGTTCTAAGTGAAAGGATTTAAATCCTTTTGGCGAAAGTGTTTAATCGCTTTGCCCCAATTTTGTTTCTATGAATTTTTACAAAACAAGAATAAATAAACATGCTTTAAAACACACCATAAGATTCATGGAAAAAATAAAATAAAATCAAATACCTTTGTAGATCTTATCTCCAAGATAATAATCACTCCTTTTGAAAGAACACCACCAACGGATCTTCTCTAGAAGTTTGTGGAAACCTTGTGAAAAATAGAGGGAAAAAAAAAAAAAAGTAGACAATTCCTTTTGAGAGTACAGGGTGAGGGAGAGTTTTTGTATGATTTTCACGTAAAAACTCAATTAAGATCTCACTGTGAAATTTGCATGCTTCTGCTAGCAGATGGGATGTGGTAGCTGAGCTTATTAGAAACACCATGAAGGAAAGAGGTCTAAGGAAGGCTCCTGGCTGTAGTGGGGTTAACATTAATACAAAGATCCATTGTTTTGATGTTGCTAATAAAACACATCCAAGTTCCAAGTTGATTTATGAAGTTCTAGACCATGTTTTTATTACCATGAAGCAACCCCATTGTTCTGATGATATACAATATTTGATCTTTTTATTTGTGAGGTTATACCCTAAAAAAGGAAAATAAGAGCTCCGAGATTATAATGAAATCAGAGGTAACTAAAGTCTAAAACAATGTCACCTCTTATTATTATTATACAAATTTGTTATCATATAATTTTTAAATCTCCAATAAATTTTCAATTAACTTGTAGTTAGGAATATCTATAGTCTATAATCTATTTTAAGGGGATTTAAAGGGAGAAATTTTTTATTTCCTCTTGTGCCCTTTTTAATAAGTATTATTTCAACATATCTTTCTATATATGAGTTGGTTTATGCATACACGATATATCTTTCTATATATTTTTCTTGCTTCTTTTATTCATAGAGCATAAAATGTGAAAGTTGTAGGAAGAAAGCCTGAAGTTGGCTTCACTAGGAGAGATCTCTGGTATTTCAATTGTTTTGATGCTCTTTCGTATAGCTTTTACTTCAAATCAGCAGGCATCATGTTCTTGGGTTGGCCAAAATATTATTGTAAGTGTTCTTCCTTCTCTTCTCTTCTCTTCTCTCCCCCTCCCCAATTTTCCAATGATGATAGATATATTTACTGATAGAGATGTAAGGGTCCTTCCAAGCCATAGACTAGCTTGGCAGTTTTTAACCTTCTATAGAACTTTACTTCTTATCTCACTCCAAACAACTAAACTACTTTCTCCTATCATAACTCAAGCTACTCAATGGTATTTACGGTAATTAACATATATTCCTTTTCTTTAGGTCGGAGATTCAAATCCTCATACCACACATGTTGTACTAGCAATCAAAACACCACCCAATCTTTTGAACCTCAGCCTTCTATTGTTAAAACCTCCTCGAATGCATTAGTTGATGATGATACATTTGACTTCTTCAATTATTCCGTTGCGAGTACTTGAATGCCCTGTTCCAAATAGTTTTTCTTCAAACCCCTCCGTATTCTTAACTTACAAGCTAACCCTAGAAAAACCATGGTTTCACATCTTCAAATGATCTTCAAAACTCCACCTTTTTTGCTCAAACTGCATCGACACCCCCGCTCAATGGTTTGAATGTCTCAGCATTGGCTCACTTTTTGGATCTCGATCACATTTATACATGATACATAAGATTCTCCATTTGTTTTCTTTATATTTTCCTTCCAATCATATAGGATTATTGATATTAAGTGATTGAGATAATAAATCCTTTTGATGTAAATCAAAGTTGACTTTAGAATTATCTACATTGTTTGTTTGTTTTAGAATATTAGTCGGTGATATTTAGTATATTTTTTCATTCTCATGTTCTTTTTGCAGCAGCCGCAATGATGTGAAGATGGAGGAACTTTAAGAAATAGTTTAAGGGGATATTTGGCCTACGAACTTCATGTTAAATAACTCCATTAACTTCATTTGTCAGTGTTAAGTAATTCAACTCCAATGTTTACTATTGAAGTTTATACATTTATCGAAAAATTTCATCTTTTATCTCTTTTGCATGTTTATTGAGGAATTCTAACTAAACAAATTTGCACCCAAAACACAGACTTTCTAACTCAATCATTTTAACTCAAAACTTCAAAACTCAACTCAGTGTCCCAAACACCCCTTTAGTTAGTTATAATGTATTTTGAAGACAATAGTACTCCTTGCAAATGGATTAGTGGTGAAGCTTGTATGACTAAGGTAGTGTTTCGCTCATCAACATGAGTTGGATTGAGTTGGTAAAAATTACCAACTCAATGTTTGGTTCACCAACTTTAAATATTGGTGAAATTAAGTTGGTTATTTTTACCAACTCAACCCAACTCTCCCTCTCTCCAATGTTTTCAATGGCTCCACCCGTCCACCGCCAAGGACTACCGCCACCACTCTCCTACATTTAGTCCATTTGACACAATTTTTCTTATAATAATAAGGAAATTTAACTATTATAATGGGAGTAGGGATGTTTGCGGTTCGGTAAATCGGTTTAGAAATTATATGAAACCGAACCGAACCGCGTATTTGTGGTTCGGTTTTGCGGTTTCACCTTTTCTTTTTGCTTTTTTTTCCCTCTATTTCGTATTTTCTAGGAGCGTTCGCAGTTCGATTTGGTTCGGTTTGGGGCTAAAACCGAACCGAACCGCATAAATTCTAAAAGAAGAAAAGGTAAGATAAAAGGGAAAAAAATAAATATTATTTTTTAAAACATACTAATCTGTTCCACGTTGGTTTATTTGCTTTTGATGAATATGATCCTCCTAAAACTTCAATAATGCAAATCAGAAAATCATAGCAAAAGGATCTATATAAAGGAAAGCAATCTACAAGAATAAAAAGTGAACAGAGAGAGAAGAGGTGGAAACCTATCCAGTCCATGAAACAATGTGTCGTTCCTTCTTGAAACTGATTAGAAATTTACAAGTCATATAGCTCCTAATGAGTCTATCAATAGGTGTCTTATTGTCAATGTCGACACTCTTGGACAGGAAATCTTGGAAGCAAGTCTAGACATTCTTGATATTTTTCATCTTTGCAAAGCATGTCTACTACTATGGCGCAAGTCATGGCATCTGATGACACATCATTCTGAGCCATCTTATGGAGAAGTTGAACCACCTCTAATTTATTATTCTTGCAGAAACCACGTAGAAGGGTATTATAAGTCATTATGTCAGGAGTACAACCATTTTCTTCCATCTTTTGAAACAAAATATTTGCCTTATCTACTTGTCCCTCTTTACAAAACTCATGGATCATAATGGTATAAGTCACAACATTTGGTTGATGCCCTTCATGGGACAGCTTTCCGAAAAGCTCCTAGGCAGTTTCAAGTTCCTTGCTTTACATAAGCCATCAATTAGACAATTAAAGATTCTAATGTCCAATTTCAAGTTGCATGATGTTAGCTCTTTAAAAAGTTCCATCGCTTCAAATAAACAACCATTCTTACACAACTCATCTAAGAAAATAAGATATATACATGAATCTGTAGCAATACCATAAGCTTTCGTAACACCAAGTAGCTCTTTTGCATCACCAACCTTGCCTGCCTGAAAAAACCCTGTTAACATGGCACCATATGTTTTCACATCTGGTCTCTTTCCCTCTAGAAGCATTTCATTGTAAAGCTTCATTGCGTCTTCGACCTTCTAAGTTTTACAATACCCATTGATGAGCACATTGTAGCTAATCACATTAGGTTCACATCCCTTACTTAGCATACTAACAAAGAGCTCCCTTACACTATTCAAGTCACCAACCAAACAAAACCCCTCGACCAGTGAATTATAAGTAAACGAATCTGGAACATTTCCTGTGTGAATCATCACTCTAGCAACTCTTGAGCCTGGATGGCCTTTCCTTCCTTGCAAAGCATATCAATCAACACACTGAATGTGACCACATTGGTCGAACACCTTGATCCACCATATCAATTAATGAATGTTTAGCCTCCTTCCAGTTTCCACCACAGGTAAATCAAAGAGGTATAAATAACCACATTAGGCATACAACCTAAGTTCAGGTAGGTGCATTTTATTATAGAGAGAAAATACTTGAGAGTAATGCTTAATGTAAGTAAGTCCAGCAAGTAAACGATGATTAGGTGAAAGAAATGTAATGCTTCAGTTGCAGTAATGTTACCTATTGTGCAATTTTGTAAGAAGGAAAGGAAGTCGGTGAATTGAAGTAGTATTCGGGTGATGGAAGGGGTTGGGGCGGGCATTTCCATTTAAGATGATTTGATGATGAAATTGTTGGAGAGGAGTGAGTAAATTGTTAGGTTTGGAAGAAGCGGAAGCCATGTTTGATTTGATGAGTGAATTGTTGGAGAGCAGTGAGTAAATAGAGAGGAGAAGCGGTTAGGTTTGGACTTTTTGGAAGAAACTGAAAGAATGGAAGAATGGGAAGCCACAGTCTTTGTAGCCATATCTTTTTTTGATTTTGCAGCACCAAAACTACTTAACTACTTTTACTTTTATTAATTTTTTTTTTTAAAAAAAACTATAAATTAAAATGTAAAACTAGTGGCATCTATGGAATTTCCCAACATTAACAAGGCCTATAAGGATGCCCCACATATGATGTGGCCTCTAACCTATGATAGTTGGATCACCCCGTACGTGCTTATTGACGTTAATGGACTATTTGGGGGGTGGAACGTAATAAGATTACTGGGAATCATAGGAGTATTGAAATGCGTGAATACTTAAAAAAAATAAACGACAATGAGATCGCAAACCATGGAAATAGTGGGAAGTAGGATTTGGTTGAAAACTGTCGGAACGAAATGACTTTTGTATTACAAATCGGGGCTAAAACGCTCAATCCAAACATTCATTTTGGATTACATTACAATACAAGCCTATCCTATTATGATTCTCCAAACACCCCTTTAATTTCTTTTGAGAAAAATTTCTTCAAAATTTTAATTTTAGCAAAATGAGAAATTAGTTAGTCAACTTTCGAAATGGGAAGATAGATGGTCCAAGGTTCAAAAATTGTTGGGGCAAAGACATGGAGGCAATGGACCTTCAAATACTTTGGTATTTTTTAAAGTTAAAGTTCAAAATTATGTGTAGCTATCCTGCATTTATGGTAGCCAATTCATGCATCTTCGATTTTGTTGGAAAGTGAAAGTTTCACTTAGAATTAATTTGTCACTTAAGCATTTTTGGAGTTTTGTTCAAGTATAGGAGACTTCAAAGTGAAAATGTTGGTTGTGGACACTTTTGAGAACTTAATGTGCATGTTTTGAACTTTGTTTTTTGGGCACTTTTGGAAACAATATGAACGTTTTAGACACCTTTTAGGAACTTAGACACTTTTTGGTAGTTTTTATTTGGTTTGATAGTAAAAGTGTTACTTAGACATTTTTATGTAGTTTTTAGGTTTGGTTGTTGAGTGAAAGTTGCACTTAAGCATTTTTAGGTTATTTTGAAAATCAAGTTGACTCATATGAACTATTTTGGTTGTCTTCGAAGTTAAATTGTCTTTTGAACTCCCTTTTTGGTAGTTTTTATGTTGATTTGATAGTAAAAGTGTTACTTAGACACTTTTCATTTAAATTTTAGGTTTGGTTGGAGAGTGAAAGTTGCACTTAAGCATTTTTAGTTTATTTTGATAATCAAGTTGACTCATATGAATTACTTAGACACTTATTATATAGCATATGAGACTTGAAAGTCATGCAAGTTCATTTTAATTTGATACTTTAATTGTACTATAAAATTTCATAGACTTTTGTTACTTTAATTAATTTGAAAACGATTGATTTTTCTTTTTATCATAATATGCTAACTTATAATTGAAATAAACCAGTATTTTTATGTTAAATTAAATTATTGAAAAACTATAATTTATAGGAACAAAAAATCATAAATTTTGAGTTTTGATTTTTATTTGGCCACTGAGTTGTTTCCATCATTTTAAACCTTCACACTTAAAAAATTATTCCACGTCTTCGAGCTAGTTAAATTGACCAACGAAAAAAATTGTTATTAGCTTAAATTAGGGATTTCTACCTATATACCCTAAATAAATATGCCGCCGGTGACTTGTTTGGAATGGCTTAGAAAAAGATGCTTTTCAAAAATTTTTTTTATATTTATACACTTTTGATAAAAGCTCCTTGAAATAAAAAACACACATATATTTAACAACTCTTTCTTGAGAGTGTTTTTATATACAAGTTTGTTTAGTTTGTTTATATATTAAGAGTATTTTTATTGAGGGATAGTTGCAAATATAGTAATTAGGTTCAAAGTATTTGCAGATATAGCAAAATGAAAAGAAAAAAAATTTGTAATAGCATGGTCTATCAGTGATAGATTTTGCTATATTTGCTATTTTATAAAAATGTTGCTATACACTTAATTATTATCCCTAAAAGTGCAGTCTGATGTAATTACACATTTTATTAATGTTTTTTCAGGTTGGCCGGCGACGTTGGTGGTCGAAAGTTGGCCAACAGGGGAGGGTCATTGGAGGTTGGCCGACGACAATTATCAGAGTTGGCCACCGGAGTTGGTCGACGGTGGTGGCGACCAGTGTTGACCTACGGTGATCACCTGAGGTGGTTCTGGAAGTGGGCCGACAAACTTCCTAAATTAAATTAGAACGAAAAAAATGAAGGGTAACCCATGGGTTTGAATAGTATTTACTATTCAAAATCCATAAGAAAAGATGTACAAAGTCAAAACTTAGTAGATCCTTGCCTCAAACAAAGGTTGAGTTTAAGATGTTTAATCTATCCATTGAATTAATTTTATTTAACTTAAAAGATTTAGAAAGGAGAGTTTGATTTTCAAATTGCATTATGATAGACTAATATCATATATCAATTATCCTTTAAAAAAAAAAAAGAAAAAAACTGCACCCCTTCCTTTTTATTCCCTTCCTCACGCCCGCGAGAAGCCTCTTCTCTCTCTCTCTAGTCCTCTCTCCCGCGCACCGTCATACCCACGCACGACCGCCGCCAACCACAGCCAACCGTCGGCCGTCCGCCTCCCTCCGACCGGCTGCCGATCGTCACTCCACCGCGCCAGCCGTCGGTGAGTTTCTCCTTCCCGTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAAGTTGTCATGTGCAGCGCCTGCCAGCTGCCTTTGCCGCGCGTCGCCGCCGCTCCTCGCCGGTTTCGTGTGGGTAAGAGTTTTTGGTGATTTTGCGAGGGTTTTTGAGTTTTTCTTGAGAGTTCTTGAACACCCATTGGGTTTTGGTCTGTTTTGATGTACCCATGACTTCTGGATGCTAGATTGGAGATTTGGAGAGTTTTGACCATTAGTAATTAGGGATTTCGCCGTTCTTTTTGGTAAGTTTGGTGGATTTTTCTTGGGGAACTTGAATACCCATTGAGTTTGAACTGGATTTAATGTTTACCCATAATATTTGGATCTTAGATTGAGTTTTGGAGGACTTAGCGTGCTATCTAGAAGGTTGAGATCGTTCCGGAAACTTTTTGGTAAGTATTAAGGCTCCAAAACCTAAAATTTAAAGAAAACAAAAATCAAATCCCATCTTCCATTAGCCAGTATTTCATTTGCTTTATATGGTTTTCTATTTCTTATGTCTTCCTTCGGCTTTGTTTGGAAGTGTATGTTTTATATTAAACCATTCTAATTATAACATTGTTATGGCTAATTTTGTTGTGGGTCTTTTTTTTTTTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTCAGATCAATTCTTGCTTGCTTCTCTTTTGCAAGGAGGGAGGCGACTGGAAGTTTGAAAATTTTGCTTTCTAATGAAGGTAATTAAATTGTGTCTGAAGCGTTTATATTGCTATGTTTGAACTCATTTTTTCAATATATTTGATATCTTTATGTATTTTTTCTACTCTTGCATTTAGTAACCTTTGGTTATGTTTGTTTTGATGGTTAGACGCAAGGAGGAGATGAAGTTATTGACATAGACAGGAAAACACTATTGTTAGAACCAGAGAATAATATTGAAGGGGGATTGTCAGTTCCGGGAAAGGATAGACCGGTGTTTAGACCTCCAGAGAGGAGATCTCATCTAGGTATGATTATTGTTGACATGCATTTGTATATTTGTTTTATTACTTCTAAACTAAACTAGAAAGTTACATGGTTAAGTTTTTGGTGCTAAATTTTAGAGATTTTTAATTATGGTAGGGATTGGTGGTTATTGTTCATATAAAGGCGTGCCTATTGTAACATCAACTATCCATTTCTAGTTCTCTTTAACATGCTTAAACATACAAAATCATAAAGAACTTTTAATTTAATGCAACAACTTAGAGTTTGTCTACACTGTAAAATGTTTCACAACTTTATATCCAACCTTAAATTCAATATACTATAGCTATAGTATCGCAGACTTTGACTTCACATAGCAACGGAAGCTCTTCTACTACCTGAAAAGAACATTAAAAAAAATGAGCTTACAAAGTGTAGTGAGTGGTTAAACAAACAACTAAGGTACACACAACCTCATCACAACATCATAATATAGATAGTCATAAAGATATCAAGAATCATAACCGAGGTTATCTACTCAAACCTCAAATAGGTAGCTTATCTTGGTATCGTATTTACTCTATTGGCTCCCTTTTGGCTTAGCAACTGAATCTGTACTCTATGTGTGCATAGCCTTATCTCTGAGGGATCAGAAGCTAGACCCGTCAGTCCTCTGACCATCCCATAAGAGGTATCCTACATTATCAGAAACTAGGTTTCTAGCAATCCTCTAACCATCCCGTAAGCTTTTAACCCCGACACAGAATCAGAAACTAGATCTTTAAATTCTCTGACCATCCCGTGCGGCCTTAGCTTCCTTATCAAGAATTCACAAATGCATATGCATAGCAAATATATCTTAACTTGTAATGAAATCACAGTATAACTTAAGGAAACAAACTAGTAACCACGCACAGTTGACATTCTAGCTCTTTAAAGCTTCCTTCTCCTGCTCTTAACTTAGCTTGAACTTCCTAGCTTCCTAGGAGCCTTAGAAAACAGCAAATGATAGCCCTTTGGAGAAACCTTCTAGAACGCCTGGCAACACCACCTTGGACGTAGGGAACCTTCCTTGGACACAGGGTAGCTAACACAACACCAGTTGGATGCAAAGTAGCTTCTTGAGCACAAAATAGCCTTTTGTTGCGTCCAATATCCTTGGACGCAATACAACCTTGCTTGGATGCAGGACAGTGGCAAATTGTGTCTCTTGAATGCAAAGCAGAGCTTCAAATCCTTCGAGAACTTGGGGATTTGGATGGATG

mRNA sequence

ATGAGTTATACCCTAAAAAAGGAAAATAAGAGCTCCGAGATTATAATGAAATCAGAGTCCTCTCTCCCGCGCACCGTCATACCCACGCACGACCGCCGCCAACCACAGCCAACCGTCGGCCGTCCGCCTCCCTCCGACCGGCTGCCGATCGTCACTCCACCGCGCCAGCCGTCGATCAATTCTTGCTTGCTTCTCTTTTGCAAGGAGGGAGGCGACTGGAAGTTTGAAAATTTTGCTTTCTAATGAAGACGCAAGGAGGAGATGAAGTTATTGACATAGACAGGAAAACACTATTGTTAGAACCAGAGAATAATATTGAAGGGGGATTGTCAGTTCCGGGAAAGGATAGACCGGTGTTTAGACCTCCAGAGAGGAGATCTCATCTAGCTTCCTAGGAGCCTTAGAAAACAGCAAATGATAGCCCTTTGGAGAAACCTTCTAGAACGCCTGGCAACACCACCTTGGACGTAGGGAACCTTCCTTGGACACAGGGTAGCTAACACAACACCAGTTGGATGCAAAGTAGCTTCTTGAGCACAAAATAGCCTTTTGTTGCGTCCAATATCCTTGGACGCAATACAACCTTGCTTGGATGCAGGACAGTGGCAAATTGTGTCTCTTGAATGCAAAGCAGAGCTTCAAATCCTTCGAGAACTTGGGGATTTGGATGGATG

Coding sequence (CDS)

ATGAGTTATACCCTAAAAAAGGAAAATAAGAGCTCCGAGATTATAATGAAATCAGAGTCCTCTCTCCCGCGCACCGTCATACCCACGCACGACCGCCGCCAACCACAGCCAACCGTCGGCCGTCCGCCTCCCTCCGACCGGCTGCCGATCGTCACTCCACCGCGCCAGCCGTCGATCAATTCTTGCTTGCTTCTCTTTTGCAAGGAGGGAGGCGACTGGAAGTTTGAAAATTTTGCTTTCTAA

Protein sequence

MSYTLKKENKSSEIIMKSESSLPRTVIPTHDRRQPQPTVGRPPPSDRLPIVTPPRQPSINSCLLLFCKEGGDWKFENFAF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 37..51
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..54
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..27

Relationships

This mRNA is a part of the following gene feature(s):

Feature NameUnique NameType
CcUC09G170380CcUC09G170380gene


The following exon feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G170380.1-exonCcUC09G170380.1-exon-CicolChr09:6682204..6682490exon
CcUC09G170380.1-exonCcUC09G170380.1-exon-CicolChr09:6683428..6683566exon
CcUC09G170380.1-exonCcUC09G170380.1-exon-CicolChr09:6683698..6683771exon
CcUC09G170380.1-exonCcUC09G170380.1-exon-CicolChr09:6684434..6684550exon
CcUC09G170380.1-exonCcUC09G170380.1-exon-CicolChr09:6690877..6690929exon
CcUC09G170380.1-exonCcUC09G170380.1-exon-CicolChr09:6692873..6692876exon


The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G170380.1-three_prime_utrCcUC09G170380.1-three_prime_utr-CicolChr09:6682204..6682490three_prime_UTR
CcUC09G170380.1-three_prime_utrCcUC09G170380.1-three_prime_utr-CicolChr09:6683428..6683566three_prime_UTR
CcUC09G170380.1-three_prime_utrCcUC09G170380.1-three_prime_utr-CicolChr09:6683698..6683702three_prime_UTR


The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G170380.1-cdsCcUC09G170380.1-cds-CicolChr09:6683703..6683771CDS
CcUC09G170380.1-cdsCcUC09G170380.1-cds-CicolChr09:6684434..6684550CDS
CcUC09G170380.1-cdsCcUC09G170380.1-cds-CicolChr09:6690877..6690929CDS
CcUC09G170380.1-cdsCcUC09G170380.1-cds-CicolChr09:6692873..6692876CDS


The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G170380.1CcUC09G170380.1-proteinpolypeptide