CcUC09G170380 (gene) Watermelon (PI 537277) v1

Overview
NameCcUC09G170380
Typegene
OrganismCitrullus colocynthis (Watermelon (PI 537277) v1)
DescriptionUnknown protein
LocationCicolChr09: 6682204 .. 6692876 (-)
RNA-Seq ExpressionCcUC09G170380
SyntenyCcUC09G170380
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR
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mRNA sequence

ATGAGTTATACCCTAAAAAAGGAAAATAAGAGCTCCGAGATTATAATGAAATCAGAGTCCTCTCTCCCGCGCACCGTCATACCCACGCACGACCGCCGCCAACCACAGCCAACCGTCGGCCGTCCGCCTCCCTCCGACCGGCTGCCGATCGTCACTCCACCGCGCCAGCCGTCGATCAATTCTTGCTTGCTTCTCTTTTGCAAGGAGGGAGGCGACTGGAAGTTTGAAAATTTTGCTTTCTAATGAAGACGCAAGGAGGAGATGAAGTTATTGACATAGACAGGAAAACACTATTGTTAGAACCAGAGAATAATATTGAAGGGGGATTGTCAGTTCCGGGAAAGGATAGACCGGTGTTTAGACCTCCAGAGAGGAGATCTCATCTAGCTTCCTAGGAGCCTTAGAAAACAGCAAATGATAGCCCTTTGGAGAAACCTTCTAGAACGCCTGGCAACACCACCTTGGACGTAGGGAACCTTCCTTGGACACAGGGTAGCTAACACAACACCAGTTGGATGCAAAGTAGCTTCTTGAGCACAAAATAGCCTTTTGTTGCGTCCAATATCCTTGGACGCAATACAACCTTGCTTGGATGCAGGACAGTGGCAAATTGTGTCTCTTGAATGCAAAGCAGAGCTTCAAATCCTTCGAGAACTTGGGGATTTGGATGGATG

Coding sequence (CDS)

ATGAGTTATACCCTAAAAAAGGAAAATAAGAGCTCCGAGATTATAATGAAATCAGAGTCCTCTCTCCCGCGCACCGTCATACCCACGCACGACCGCCGCCAACCACAGCCAACCGTCGGCCGTCCGCCTCCCTCCGACCGGCTGCCGATCGTCACTCCACCGCGCCAGCCGTCGATCAATTCTTGCTTGCTTCTCTTTTGCAAGGAGGGAGGCGACTGGAAGTTTGAAAATTTTGCTTTCTAA

Protein sequence

MSYTLKKENKSSEIIMKSESSLPRTVIPTHDRRQPQPTVGRPPPSDRLPIVTPPRQPSINSCLLLFCKEGGDWKFENFAF
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
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NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..54
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..27

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
CcUC09G170380.1CcUC09G170380.1mRNA