CcUC04G061360.1 (mRNA) Watermelon (PI 537277) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideexonCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGACAAGTTTGAGTTTATATTTTTGGTATGATTATGTGAATATTTAATTTTCAATTCAAATTTGGTTATTTCCTCAACAGCTTAATGTATATTTCATTTCATTTTCCACGAACTTGCTTGCTTTTTTCCATAACTTTTTAAAAATAGATTTCAATTCAATGCAAACCGCCGTCACCTGTCAGAGAATGAAACAGTCATGAGATGGAGGACATTGGAATATGCTAAAAAGTTATAATATGCTAAAAAAATGACAAATAATGATTGTCATTATTTGTTCATTGTTGACAATTAATCATTGTCATAAGAAAACCATTTATGACATTTTTCAACAAATGTCATTGAAGCTTGTACCTTTATAGGCAATTCAATAACTAAAAATAAATTTTAAATCCGATAGTTTTTAAATGTCATTAAATCTCAATTTTCTTCTAGTGATTGAAGTTAATTACTCTATGATTTGCAGGTTATTTTAACCCCAATGCATCTAGCTATATTGATTTGAAAGAATTTGCAAGGCTGAACGTTTTAGTGAAGATCATGAAGTCTATTATTTACTTTATCCTTCTCTCTCATACACACTATGAACTGCTAGCTTTATTCTTTGAAGGCTTCCTAGTAGAAAGGGGTTGAATCACTGCAATAAATTTCACTTTTCATGATGAAAAGCGCTTGAAAAGTGCTTTCTATTCTCTCAAATTAAGGAAGTTTATATTATATTGCACTTGTTTGCTAGTGGTTTTAGATCAAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAACTAGAATTGAAAGCCAAAAGATCAAAACTTAGCCAAAATCCAGTGAAAAAGAGAAGAAAAACACAAATCTGCCATAAACAGGGCAGTGCTGCGACGCTTTTTCCTGCATCCGCTCTCAGCACAATGCCACCTTTGCGACGCTACGGCATGATGCTGTGGGTAGGTTGCCATTGACTAGTCCGCGGCGCCAATTTTCCATATTTGAAGAATATGCATTTTTGGAAAGAATTTTGGGTGGCTAACTCTATAAATTGGAGGGTTTCCAGCAACCATAGACATCAAGAAATCAGATAAAAACACACCAAAGAGTGAGTTCGCTGGAAGGAAGAGAGAAGAGTTTGAGAGAGAGCTTGGTGTCGTTCGAGTTCCCGATATGAAGACCAAAGGACATCTTGGCGGTTCCTCCTCAATCAAGGGCTTCTTTCTAGTAGAGTATTCCTTTCTTTACACTCTTTCTATGCTTAATTTGTTTATGAACATGTTGCTTAAAGCTATGAGTGGCTAAACTCTTTAGTTTTAGAATATTGATGAATTGTTTATGAAGTTATGTTGATATTGTAGACTACTCATGGATTTATTGTAATGATTATGCTTTTCATTGTTATTGTGCTTAATTCATGTTGATTGGCCATCTTCGAATGTTAGGTTAGATGTATGGTTGAGAGATTGTATGTCTAACTAGATCTATAACAATGAATTGTTCTTAATCTATCATGAAAATAGTTAGGTTAACAATGAAAGTTGCTAAAGACTATGCTTAATGCCATGTAATTTGTATTGGTTTCAAGAAATTAGTAATCAATTGAGTTGCATGAGAAAATGTTGTTTTTGAGAGAAATAACTTGGATTTATGTTTCTAGACTTAAGCATAAGAATTGCAATAAAATCCATGAACCCTAGAATATTGCATGATGAAGTAAACAAGGATTCATTACCCTTGAACTCTCTTTGACTCTTGTGTTTCTCATTTACTTGCTTTCCTTTTTGGTTTTCTTAAATCACAACTTCAATTCCAATCCTCAAATAAAATTAATTCAATTCTAGAATAGCTAAGTAACTTAAACTTCACACTTGGATCCTCAATGGAACGATATTCGGACTTCACCGTCTTATATTATAACTTGACCTATGCATTTGCAGTTAACATGAAAAGTGCGCATCACATGACTCTTGAACCGTAGCAAAAATAGAAGAGAAAAAGAAAAAACAGTCATTAAAGCAAAAATCACACGTTTTTTTGCAGGAAAAAACAGACTTTTTCGGATTTGTCGAAATTGATGATTGGTTTTTTGTGTCATTAATTTATGACTGAAAAAACAGTCATTAAATATAAGAAAACGAAAAAGACGTGAATTTTTGAATTTTTTTCGACTATTTTGACATTTTTTTGTGTCACCAAATTATGACTACAATTAATAGTCATTAAAAGGCGATAGATTTTAACAGTCATTAATATTTTTTAATATTTGAACTTTTATGACTATTTGTTTGTGTCATCAATCTATGACCCGTATTAATTATCATTAAAGAGCATTAAAACAGAAAAAAACTAGTAATAATGTTAGATAAATTGAGGGCACCTTTGGATTGACTAGAGAAAAAAAGTATTTTTCAAAAAACTTGTTGGGAATGACTCACATCATTTAAGACCAAGTTTCCAATAGTAAAAAGAGATTATGATAAACTTGTAGTTAGTTGTTAGTATATGTTTTCAAATTTTAAATGATTCTGTTTTTTATACCAATTGTTTTTCTTATACTTTTATTAAGTAACTTAGATGAAACAAAATTAGTTGAAATTCCAATTAACCGAATACAAATTTAAATAACTAATAACTCAAAATCTTTGTGTGATTTTGGCTTCTCCAAGGTCTTTGAATAAGAGAATTTAATTAATATGCTCATTTGAAGCTAATATGTTGTCAATTTCTTCTGTAGTCATCCCTATCGCATTCAAAACCTAATACAGCTGCAATTAGAACAATTCAAAAATAGATTCTCTTAGATTCCAACTCCAAAACGACTTATTGTCTTTACTTCCATTGTGAATAATGGCTGTACAATATAAAAATACCACACCATGTTCACATATCTAAAGATTGTCAGACGCCTACTGATCTCTCCCATCTTTGTTCCAAATCCGTCCAAGCTAATTTTCTGTGACAAACTAATATGTTTGTTAGTTTTGTTTGGTAAACTTCTAATATGGTAAAATGGTAGTGTAGGGACTCCATCGACCTCAATAGGCCCTACCGCATTCATTTATTTATTTATTTAAATTTAATGCCAAAACGAAAAATTATCGTTCTCACACTATGTTAGTTTTGTTTTCTTTATCTAAATTCATTTTTAGTGGTTATGTATTTTCATCACCTATTTGTTAAATTGACTATAAATAGTGGCATTTGGTGATGTTGAAAATACACACATTGGTGAGAAAAGAAGAGAAATGATTTGAGAAATTTTAGAGATTTCTAAATTTCCATAAAATTCTATTTCCTATATTTTCATAATTTTGTATTTTGTTAGTTTCTTTTCTTTTATTTATTATATTTATTTTACTATTTATTTATTTTAAATTATAATTTCTCAGTATTTGTGTTCTTGTTATTCGTCATTTTGCTCCTCAATTTTATAATACGTTATTAGCACATTTCTTGTCATTTTCTGGCTAAAGTGAAGTTTTGAAGGTATGTCAATTTTCTCTTTACTATAATTAGTAAATTAAATGTTGTTTTTGTTGGATTGTATGTCCTAAAAACTCGTAGTTTTTGTAAATAAATGAATTTTAGTACATATAAAATTATTCAAGTGAATTAATTATTTATTAACTCTAAATCCAATTAAACTATGAACCCTTGGCTATTATCATGAGTACTTGGACTTTATGTCGAGACATAAACAGGATCAAGTTCGAGTAAGTAGCCTAAAGAAATCTATAGTACATGGATCAGGTTGGATACCTCTTCCTGGAAACACTATTGAATACGACCTGCTTCATGATTGTTACAAATGTTGTAAGGTGTCATAAATGAAGTGATCTTGATTTGTTCATGTAGAGACATGTGAGTAAGGGTATTCTATATAATAACATTGTGTAAGACTGATCCTGAAATAATCACTGTTACGTATTAACACCATTTACGATTAACACTGATTAATTTCACTTATCGAGGATCTAGATAACTTGATCTAAATCTTGAGCTATCTATAAACTCCTGTTTATTCAGAATTATCCCTTGATCTGCATAGGTGAGAGAGTAAGCTCAATAGCGCTGCTCAACATTCCTCCTATTTCAGGGATAAGACCGGGTAGATAGCTGGGGACATAGAATTTGCAAGACGGAATTCACTCCTACCCAACTTAGGGATAGTAGAGAGGTTGCTCTCTTAAGTATTGTTCCCGGGACTTGAACAAGGGGCCCCATCCTCTCACTAGCCCGAGAGGGAATGGATTTGGTGATTAGATCCTAAATCAATTGTTCATTAGAGCGACAGTGGTACTTAAGAAGAAAAGACGTAACTTAGAGGTAAATCGGTATTTGACCTATCTGAAATTATGAACGACTTGTGAAGGATTGACTTATCGATGACAATTATATCAAATGAACACAAATATATCTATAGTGAGGAGAGTGCAGCTACGGGCTTTAGTGGAGTGTCTCGTTAGTTAATGAATGTTGGTTAACTAGGTTAAAGAGTTTGGCCGGTTAATCTTGGATTGTTGGAGCTCATGATCTTAAGTTTCTTAGGTCCCTCTACTAGCTCATAAATGGACTAAAATCTTAGATAGTGAGGTGAATAAGTTTGAACTGTTCAAATCTTCGCTTAAGGAATGAAAGTTAAATATATACGATATATCGACCTTTAATTACGAATTAAACGTACAAATAGAGTTAATTATAGTATTTAAATATGATTTAAATATTAATCATATAAATAGGGGTTCACACCAGTTTTTAGAAAAATTGGGACAAGTGAGAAAAATAATATTATTTTATTATTTAATATTAATGTAATATTTAATTAATTAAATATTAATTAATTAATTTATTTATTTAATTATTTTTTGAAATTAAAAAAATCAATTTTAATTCAATTTTTGGAAATTCATTGAAAATTGATTTTAAAATTGATTTTTGAAGATTGAATTTTTCCACTAACTAAGCTAGGAGCTTGGTTGACTTCTTCACAATTAACCAACAAATAACCATTTTGTGA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ATGACAAAAATAATGGAGAAGTACGAAGTTGTTAAGGATTTAGGTGCTGGAAGTTTTGGTGTTACCAGACTTTGTAGGCATAAACAAACCAAAGAGTTTGTGGCTGTCAAGTTCATAGAACGTGGTCCTAAGATTGATGAGAATGTGGAAAGAGAGATTATAAACCATCGATCGCTTCGCCATCCAAATATCGTTCGTTTCAAGGAGGTTATTTTAACCCAAACCCATTTGGCTTTGGTGATGGAATATGCTTCTGGGGGAGAACTTTTCGAAAGAAAAATGATGGTCGATCAAAATGAACAGTTGATAACACTAACAGTGGACTTCGGCCCTTTATCTCCTCTATTAGACACCTTGATCTCAAGCCTAGACAACCACATGGCCTTAGATTCATTACCATCTCCTTCACAATTAGACATACTTATGGACAACCGCAGCAATAGACAGTTCGAGGAAAATGAAGATGAACTGGAGAGCAAGATCAATGAAGAAGACTTCAAAAAAGAGCTCATTGCTTGGCTCAGAGAAAACAATCTCAAATTGACTCCAGCCAACGAACTTGAAGCCAGAGATATCATTAAAAAGGAGAAAGAAGCGAGACATTACTTCCAGCAACTGATTTCTGGAGTCAATTATATTCACTCAATGCAAATATGTCATAGAGATTTGAAGCTAGACAATATCCTTTTAGACGGAAGGAAATCCCAACGCTTGAAGATATGTGATTTTGGCTACTCCAAGCAAATAGGTCGTCATAGAGATTTGATGCTAGACAATACTCTTTTAGATGGAAGCCCAGCCCCACAGTTTAAGATATGTGATAATGGCTTCTCCAAGTTGCATTCAAAACCAAATACAAATGTTGGTTCTGCAACTTACGCAGCACCAGAGGTTGTATCTCACGGACAGTATGATGGAAAGATGGCAGATGTATGGTCATGTGGAGTTACTCTCTATGTTATGTTGGTCGCTGCATATCCTTTCGAAGACGCCAACGATACTAAAAACCTCCAGAAAACTATTAAGCGAAGAATGTCTGGACGCTATAAAATACCAGACTATGTTCATATATCTCAAGATTGTCGACACTTACTCTCTTGCGTCTTTGTCCGAAATCCCTCCAAGAGAATTTCGGTAAAAGAGATCATGAGTCATCCGTGGTTTTTAAAGAACTTGCAACGGCAACTGACAGAACCAGCCCAAGCAATCTATTACAAGAGGGATAATCAAACCTTCTCTCATCAAAGTGTGGAAGAAATCATGAAAATCGTGGGGGAAGCGAGAAAGCAGCTGCCCTCATCATCAACAACCATCATGGGCTACCAATCGAAAACTGAAGAAGATGACGAGATAGAGCTGGAAGAAGAGGATGAAGATGAAGAAGACGACGAGATGGAGCTGGATGAAGAGGAGGAAGATGAAGAAGATGAGTACGTATGA 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BLAST of CcUC04G061360.1 vs. NCBI nr
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BLAST of CcUC04G061360.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038906809.1 (serine/threonine-protein kinase SRK2H-like isoform X1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 542.7 bits (1397), Expect = 3.1e-150 Identity = 307/475 (64.63%), Postives = 338/475 (71.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. NCBI nr
Match: XP_008442074.1 (PREDICTED: serine/threonine-protein kinase SRK2H-like isoform X2 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 501.5 bits (1290), Expect = 8.0e-138 Identity = 282/471 (59.87%), Postives = 311/471 (66.03%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. NCBI nr
Match: XP_038906810.1 (serine/threonine-protein kinase SRK2H-like isoform X2 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 498.0 bits (1281), Expect = 8.8e-137 Identity = 291/475 (61.26%), Postives = 320/475 (67.37%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. NCBI nr
Match: XP_031739609.1 (LOW QUALITY PROTEIN: serine/threonine-protein kinase SRK2H [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 473.4 bits (1217), Expect = 2.3e-129 Identity = 274/471 (58.17%), Postives = 305/471 (64.76%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9FFP9 (Serine/threonine-protein kinase SRK2H OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRK2H PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 403.3 bits (1035), Expect = 3.9e-111 Identity = 241/474 (50.84%), Postives = 287/474 (60.55%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9C958 (Serine/threonine-protein kinase SRK2B OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRK2B PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 382.5 bits (981), Expect = 7.1e-105 Identity = 234/475 (49.26%), Postives = 281/475 (59.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P43292 (Serine/threonine-protein kinase SRK2G OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRK2G PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 382.1 bits (980), Expect = 9.2e-105 Identity = 232/476 (48.74%), Postives = 282/476 (59.24%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XQP4 (Serine/threonine-protein kinase SAPK7 OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=SAPK7 PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 379.8 bits (974), Expect = 4.6e-104 Identity = 233/476 (48.95%), Postives = 282/476 (59.24%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P43291 (Serine/threonine-protein kinase SRK2A OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRK2A PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 375.2 bits (962), Expect = 1.1e-102 Identity = 231/475 (48.63%), Postives = 281/475 (59.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4D4 (serine/threonine-protein kinase SRK2B-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486040 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 553.9 bits (1426), Expect = 6.5e-154 Identity = 305/471 (64.76%), Postives = 336/471 (71.34%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B4W0 (serine/threonine-protein kinase SRK2H-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103486040 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 501.5 bits (1290), Expect = 3.9e-138 Identity = 282/471 (59.87%), Postives = 311/471 (66.03%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3C1Y7 (Serine/threonine-protein kinase SRK2B-like isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold83G00720 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 434.5 bits (1116), Expect = 5.8e-118 Identity = 231/386 (59.84%), Postives = 254/386 (65.80%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C2K4 (serine/threonine-protein kinase SRK2H-like isoform X1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496177 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 434.1 bits (1115), Expect = 7.6e-118 Identity = 256/476 (53.78%), Postives = 305/476 (64.08%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3C399 (serine/threonine-protein kinase SRK2H-like isoform X2 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103496177 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 428.3 bits (1100), Expect = 4.1e-116 Identity = 256/476 (53.78%), Postives = 304/476 (63.87%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. TAIR 10
Match: AT5G63650.1 (SNF1-related protein kinase 2.5 ) HSP 1 Score: 403.3 bits (1035), Expect = 2.7e-112 Identity = 241/474 (50.84%), Postives = 287/474 (60.55%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G60940.1 (SNF1-related protein kinase 2.10 ) HSP 1 Score: 382.5 bits (981), Expect = 5.0e-106 Identity = 234/475 (49.26%), Postives = 281/475 (59.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G60940.2 (SNF1-related protein kinase 2.10 ) HSP 1 Score: 382.5 bits (981), Expect = 5.0e-106 Identity = 234/475 (49.26%), Postives = 281/475 (59.16%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. TAIR 10
Match: AT5G08590.1 (SNF1-related protein kinase 2.1 ) HSP 1 Score: 382.1 bits (980), Expect = 6.6e-106 Identity = 232/476 (48.74%), Postives = 282/476 (59.24%), Query Frame = 0
BLAST of CcUC04G061360.1 vs. TAIR 10
Match: AT1G10940.2 (Protein kinase superfamily protein ) HSP 1 Score: 381.7 bits (979), Expect = 8.6e-106 Identity = 234/475 (49.26%), Postives = 285/475 (60.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Watermelon (PI 537277) v1
Date Performed: 2022-01-31
Relationships
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following three_prime_UTR feature(s) are a part of this mRNA:
The following CDS feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
GO Annotation
GO Assignments
This mRNA is annotated with the following GO terms.
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