Spg038438 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTCGGCCTCGGCCCAATACCGAGGCCGACCCAGGCCAAGGTTCCGAGGGCTTCCCTGGTGGTGACTTTGAGCCCGGCAGCAGTGGAAACCCTAAGGGGAGCCTATAAAAGGAAAGACCACACGCATGATTCAGGTATGCAAGCATCAAACCCTAAATACATACTACGTGCTTTCTGGCCACGGCTGACTTAAGCATCGGAGTGTGCGTGGCCTACACCACACCGGTGTGCAGCGTTTGCTCGTCTCGCAGGTCACGTTTTTCCCGCTCATCTACAAATTCACTGTTGACCGTCACGTGGAGCGAAGGGTAAATTCCTGAGCGAAATTTGACCATCAACAAAAATGATAGTTAAGGAACCTATTACATATGTTTTTAAAATGTTTCCACTCAAAATAAAATAAAATAAAATAAAATGTAGGGACTTATTAGACATAAAAATTAAGGAACCAAAGTTGTAATTTAACCATTGTAAAAAAAAAAAAAGTTGTAATTTAACCTAAAATTGATTAATATTTATGTGAAAATAAGATATAATATAATATAATTAATTTGAATTAAAAAATATGTGTAGGTCATGAATTCGAATCAAGAAAGTAGAGTACTTGTGACCAAGAGGTCATGAGTTCGAAAATTGTTCTTTAACACTTAATTTAAAAGAGTAAATTTATAATAGGTTTAAATCTCATTTTAGTCCTTAAACTTTTAAGTTTGTTTTACTTTAATTCTTAAACTTTTTAAACTTTCATTTTGGTCTTTAAACTTTCAAAATTGTTCTATTATGATCCGAACTTTCAAAATGTCTATTTTAGTCTCTAAAAAAAAACAATCACTTTGGTAACAATCTAATACACATGGTCAAAGATATGTTATTAATTTGTTAAAACTAAAATAAAAGTAAGAACCAAAAGAATCATTTTTCTCTTCTAAAATAAAATTATTTTTTGAAAGTTTATGGACCGAAATAAACATTTTAAAAGTGTAGAGACCAAAATAGGATTTAAATCTTTATAATACTAATAATAATTTAAAAAGAAAAGGAAAAAGAAATAGAAAAGGCGGGAAATTCTTCTGCCCTCTCCCCTGTTACTGCTAGAAAACCATTCTCCAGAATCGGGGATGCGGGGCGGGGATGGCAGCCGACGGCCCCGCCCCGCCACGGTTCCATTCTCGAAAAGAAAGCAATACGCCGACCACAAAACCCTAAATCTAGACGCTCATTTCCTCTCTTCTCTCAATCTCTCTCTATTCTGTTCTTCTTCGACCTCAAAACCCCTTCTGTACACCTACACTCGACAAATTTCTCTCAGCGCTCCCCTCTGTCTCCGGTGAGAATCCCTCCTTCTCTGTTTCTTCTTGTTCTGCCTTCTTGCGATGATGCCTGATTTTCAGTTGGAACGTGATTTGCCTCAACAGAGTGGCTCTTCACTGATTTTTGCTGCATTTTGAGGGGGGTGGGGTAATTTATGCTCTGTAGCTTCTTCTGTCGATCCATATTTCGGAACTTAATGGTGGGATTTGCTTAACTTTCAGTTTCAATTCTTGTTGGATGTTGGACGCTTGAGATGACGGTTTCACATGACCTGCTTAACTTTGCTACTTGGGCTTCATTTATTAGTTTTCTTCTACTCATATCACTGTTTCTTCCTGAGAGATTTTAAAGAAACAAATGTTCTATGGATGATGGTTATCTTATAGATTTACTTACTTTTGTGTTCTTTTGTTAAAACTTTTTGCTTTGTTAGTTATTTTTGTGGTTTCCTTGGATCAAGTTCCTGTTTGAAATTGGGTTAACTCTGTGCGGCTGGTGACTTATGTTTGATGCAAAAAATTAGCAAATGAATGTTGTTTAACCTCTTGTAATTTGTATGATACTGATTCTATTCGTTATGGAACAGATTTAACTTGCCCAGTATGGATCCTAGCAAAACTGGGGAGGACCCTAACATTGCAAAGAAATGTGAGTCAAATCCATCAAGTCCGATGAGGGAAAACAAGCGTATTAAAACTTCTGGGGCTCAGGATCATTTTAATGAAGTTGATATTGGGGATTCTGATTGTCCAAAGCCAACAGGTAAGTGTAATGTCATTGTAAATGCATGCGATGACGAACAAAAGAAAAACACCACCAAAGTAGAGCAGATAGTACTTAACTGTGAAAAGGATCCAAGTAGAACGTGTGGCTCGAAGCAAAAGGGGTTGATGGATTGTCAGTCAGAGGTTAAAGAGGGAGAAGGTCGTAATTTTAGTTTGTATGGCGATTTCTTTAGCATGGGGGGGAGGTGTAGGAAAGCGCTTTATAGGATGATTATTCTTCAGAAATTGCCTTTTTGGATGGTGGAGTCTAAATCATTTCAAACATTTTCCCATTCAATACAACCTGGATTTGTTATGCCTTCATGGAAAACAGCTGTTAGGGAGTTTAAAGAACTTTATTTAGAGGAGAGGGAAAAACTGAAAAGAATGTTAGTGGAAAAAGAGGGAAGAGTTTCTTTGGCAATGGAAATTTGGACGACGATCGACAAGATGAATGTGAATTACGTGGTTCTGACTGTGCAATTCATTGATGATGATTGGCAATTACAAAAAAGGATTTTGAATGTTTCATTGATCCCTGATCCTGATGAAGATACCATTGATCCTGATGAAGACACCAATGATCCTGATGAATATACCATTGAAGGTTATACCATTGATGGATATACCGTTGGACAAATGATTGAAACATGCCTATTGGAATGGGGAATTGAGAAGGTATTTACCGTGACAGTAGATAATGGAAGCTATAATGATAGAGCTCTTGCACACTTGGTAGAGAAAATAAGAAACTGGAATGGGGCTGTATTAAATGGCGACTTCATGCATGTAAAATCTTGTGTACACATTGTTAATCTTATGGTTGGTGATGCTTTGAAGGCACTTGATGGCTCGATTGTCAGGATTCGTAATGCTATCGAGTATGTAAAATATTCATCACCTTCACTATTGGAAAATTTCAAAAGTTTTGCAAGGGATAAAAACATATCGTGCAAGAATCCTCTTTATGTGGATGTTCCTACTAGGTGGAATTCCACATACACTATGTTGTACAGAGCTGAAAAATTTCAGAAGGCTTTTGAAAAGTTAGAGGCGGAAGATAAGGAGTTCTGGCACTTAGTATATATAGATCGTGACGTAAAAATGGACCCTCCCATTAGTGAAGATTGGGACAATGTTCGTGCTTTCTTAAAGCTTTTGAGATTCTTTCAAGATGTTACTTTGAGGGTTACAAGATCACCGTGTATAACATCGGATAGATATTTTCATGAGATCTGCTTAATAAAAAGAAAGATTGAAGAGTATTCAAGATCCGACAACTCTCTCTTGGCTAATACCGCACGAAATATCAAAGTGAAGTATGAAACATTGTGGGAGAATAATGACAAGACGAATTTTCTCTTCTATGTTTCCATCGTACTTGACCCTCGATACAAACTCCAATTTGTATTGTTCACTCTATCACTTTTGTATGGGGAGGAAAGGTCAAATGAAATTGTTAAGAAAATTGAGGATATGACGAGAAGTTTATACAATGAATACCAAACTTCAAATATGAAGAGTGAGACTGCATGTACATCTATGGGTCAACCATCAATGGAGGATGCAGGAGACGGTGAGACTGCTTGTACATCTATGGGTCAATCATTTATGGAGGATGCAGGAGAAGGAGAAGAAGAAGATGAAGACTATGCCTATATGTTTACTGAATACTTGATCGAGCAAGATACCAAGAATAATATATCAGAACTAGATAGGTATTTATCTCAACCTTGTGTGATAGCCGATGAAACATTTGATATATTAGATTGGTGGAGAAGGAATTCTTCAAGGTACAAAATCCTCGGAGAAATGGCCAAGGACGTATTTGCGATTTCCCTCTCAACTACTTCCCTGGAGCCAACTTTTAGCACCAGAGGCCGGGTGCTTGATTCATATCACAGTACATTAACTCGGCAATCTCCAAAAATGGTCGAGATTGTCATTTGTTTGCGAAATTGGCTTGGCTCACAAGATGAAACAGATGAGCGTGAGCTTGAAGAGTTGGAAGATGAAGAAGAGATGGATGATGACGAGCTGGAAGGTGAAGAAGATATGGAGGACGAATAGATGAAGGATGAAGAGTGGGGATATGAGCATGGTAATGATTAAGCAGAAACCATGTTTATTTATAACATGGAAGCGTAATAATTAGTGTTATTGAATCATTAGTTGGAATAGTTTATCCAAAATTATGTTATATTGCTTCAATGTTAACTTTTTTGTTTCTTTCCTTCTAGGGTGGACCGAAGAGGAGGAATAGAGGAAGAGAAACTCATGGCGACTGACTGTAACCATTGTGATTTTGGATTTGTGAACAAATTAGTGTTGACAATCTTTTGTTTGACTCTGGTTGATTTGGATTTGTTTCACAGTGATGTGTTTGTTCGACATATTTGTCAAATTGATAGGCTTGGCTTGGGTCTGAGACTCTGAACCGAACTATGCACGATCCTAATGGTAGTAAGTTTGCTTCTGAGTTTCTGTCTAAAACTGTGATAGTGCCAGGTGTTATTAATCTTGAATGTAGCCAATTTCTTTAGTGGGGTTCCCTTTTGTGGACTTGTTTTTTTTGTCCTTGTATTCTTTCGTCATTTCTCAATAAAAGTTGGTCTTTTTTTATAAAAAAAGAAAAAGAATTCAAAATAATGTTAGACACCGATTCATGGAGTGCTTACACCCGTGAAATGAGGAATGAGTAGCCAATTTATGCAATAGTCATTTCTACCTTAGATTTGTTATAAATTAACTTGAGAATTCCTACGTATTCAGAGCTTCCTTCTCAATTTCTATCGCCTAGGCCCCTTTTCTTGAGATTCATTACCGTGTGGATTTTTTTTTGGTTTAATTAGTTTAATAACATGTGGGGTTTGAGAATTCAAACTTCTAACCTTTTGATTAGATTTTGAAAAGATTT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ATGGTCGGCCTCGGCCCAATACCGAGGCCGACCCAGGCCAAGGTTCCGAGGGCTTCCCTGGTGGTGACTTTGAGCCCGGCAGCAGTGGAAACCCTAAGGGGAGCCTATAAAAGGAAAGACCACACGCATGATTCAGAAAACCATTCTCCAGAATCGGGGATGCGGGGCGGGGATGGCAGCCGACGGCCCCGCCCCGCCACGTTCCTGTTTGAAATTGGGTTAACTCTATTTAACTTGCCCAGTATGGATCCTAGCAAAACTGGGGAGGACCCTAACATTGCAAAGAAATGTGAGTCAAATCCATCAAGTCCGATGAGGGAAAACAAGCGTATTAAAACTTCTGGGGCTCAGGATCATTTTAATGAAGTTGATATTGGGGATTCTGATTGTCCAAAGCCAACAGGTAAGTGTAATGTCATTGTAAATGCATGCGATGACGAACAAAAGAAAAACACCACCAAAGTAGAGCAGATAGTACTTAACTGTGAAAAGGATCCAAGTAGAACGTGTGGCTCGAAGCAAAAGGGGTTGATGGATTGTCAGTCAGAGGCTTGGCTTGGGTCTGAGACTCTGAACCGAACTATGCACGATCCTAATGGTAGTAAGTTTGCTTCTGAGTTTCTGTCTAAAACTGTGATAGTGCCAGATTTTTGTGCTGATATTCAGCTTATTTTTGTTTTCTTAATATGGTTTCCTTGGGTCAAGTTCCTGTTTGAAACTGGGCTGATTCTGCTTCGCTTGTTTGGCTTGCCAAGCATGGATCTTAGCCATGGTGGGGAGCAGGATTCTAACATAGGAAAGAAACATGACTCTAATCCATCAAATCCAATAAGAAAGAACAAGCGAAGCAAGATTGAAGTTGATAGAGGGAATTTGGATACTGGTGATGGTGGGGACTCTGATGAATCTGATGCAAGAAAGAACAGCACCACCAATATGAAGCAAATGGAACTTAACTGCAAAAAGGATCCCAATCACCGCTCAATCTTCTTCTTTCTCTCTAACTTCATCTTCCAACTTCGACGCCGGCCGCCGCATTTCTCTCTCCCGGCGTCGGCCCTCGCCGCTCGGACCTCCGCAGTCGCCTTCCGTCGTCGGCGCCTCCGTGAGAATCTATTCCTTTCGCTCTCATCAACTCGGTTTGGCTTGCCAAGTATGGATCCTTGCCATACTAAGGAGGAGGATTCTAACATTGGAAAGAAACGTGAGTCTGATGACTCTGATCCATCAAATCCAACAAGAATGAACAAGAGAAGTAAGGCTGAAGTAGATAGAGAGAATTCTGATACTGATAGTGGAGATTCTGATAGTGTTAGGTGTTCTGATGAATCTGATGCACGAGAAAACAACACCACCAAGATGAACCAAATGGAACTTGACTCCAACAAGGATCCTAATCAATCAGAGGATATCAAGTACGAAACATTTTTGGAGGACAATGAAAGGACTAATTTTCTCTTGTATATTCCCATTGTACTCGACCCTCGATACAAGCTAAAATTTGTATCGTTCTCCCTCTCACATTATGAGGCAGAAAGGTCAGATGAAATTAGAAAGAAAATCGAGGATATGACAAGAAGTTTATATAATGAATACGAAACTTCAAACATGGAGAATGAGGCTTCATGTAAATCTATGGATCAACCATCAGTGAGGGATTCAGGAGGAGAAGATGATGATCTGGTCGCTCAATCTTCTTCTTCCTCTCTAACTTTTCATTCTTCCGACTTTGCCGCCGGCCGGATCTCTGCACATTCGCCTTCCGTTCCCTCTTCGTCGCCGCCGTCGGACTCTGTTTTTCTCGCTCTCATTAGCTCGACAGATTTATCTTCCCAAAGCATGGATTCTCCCCATACTGGGGAAGAGGATTCTAACATTGCCAAGAAATGTGAGTCAAATCCATCAACTCCACCAAGAAAAAAGAACAAACAAAGTATGTCTTCTATGGCTTTCAATCATTTCAATGAAGTTGAAAATGAGGATTCTGATTCTGATTCTGATTCTGAGTATAGAATGGAAACATGA MVGLGPIPRPTQAKVPRASLVVTLSPAAVETLRGAYKRKDHTHDSENHSPESGMRGGDGSRRPRPATFLFEIGLTLFNLPSMDPSKTGEDPNIAKKCESNPSSPMRENKRIKTSGAQDHFNEVDIGDSDCPKPTGKCNVIVNACDDEQKKNTTKVEQIVLNCEKDPSRTCGSKQKGLMDCQSEAWLGSETLNRTMHDPNGSKFASEFLSKTVIVPDFCADIQLIFVFLIWFPWVKFLFETGLILLRLFGLPSMDLSHGGEQDSNIGKKHDSNPSNPIRKNKRSKIEVDRGNLDTGDGGDSDESDARKNSTTNMKQMELNCKKDPNHRSIFFFLSNFIFQLRRRPPHFSLPASALAARTSAVAFRRRRLRENLFLSLSSTRFGLPSMDPCHTKEEDSNIGKKRESDDSDPSNPTRMNKRSKAEVDRENSDTDSGDSDSVRCSDESDARENNTTKMNQMELDSNKDPNQSEDIKYETFLEDNERTNFLLYIPIVLDPRYKLKFVSFSLSHYEAERSDEIRKKIEDMTRSLYNEYETSNMENEASCKSMDQPSVRDSGGEDDDLVAQSSSSSLTFHSSDFAAGRISAHSPSVPSSSPPSDSVFLALISSTDLSSQSMDSPHTGEEDSNIAKKCESNPSTPPRKKNKQSMSSMAFNHFNEVENEDSDSDSDSEYRMET Homology
BLAST of Spg038438 vs. NCBI nr
Match: CAN61798.1 (hypothetical protein VITISV_044291 [Vitis vinifera]) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 8.6e-05 Identity = 36/98 (36.73%), Postives = 55/98 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. NCBI nr
Match: KAA0057700.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK27486.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 59.3 bits (142), Expect = 1.5e-04 Identity = 36/98 (36.73%), Postives = 56/98 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. NCBI nr
Match: KZV38952.1 (hypothetical protein F511_41435 [Dorcoceras hygrometricum]) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 5.6e-04 Identity = 35/83 (42.17%), Postives = 50/83 (60.24%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. NCBI nr
Match: KAA0042176.1 (zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo var. makuwa] >TYK26750.1 zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 2-like [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 7.3e-04 Identity = 32/82 (39.02%), Postives = 46/82 (56.10%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. NCBI nr
Match: TYK28895.1 (putative transposase [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 7.3e-04 Identity = 34/98 (34.69%), Postives = 55/98 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A5BUV6 (BED-type domain-containing protein OS=Vitis vinifera OX=29760 GN=VITISV_044291 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 60.1 bits (144), Expect = 4.2e-05 Identity = 36/98 (36.73%), Postives = 55/98 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SX87 (Thiamine biosynthetic bifunctional enzyme TH1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold56G001560 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 2.7e-04 Identity = 33/98 (33.67%), Postives = 56/98 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A2Z7BWC4 (DUF4413 domain-containing protein OS=Dorcoceras hygrometricum OX=472368 GN=F511_41435 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 57.4 bits (137), Expect = 2.7e-04 Identity = 35/83 (42.17%), Postives = 50/83 (60.24%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UFZ0 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold1994G00070 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 3.5e-04 Identity = 34/98 (34.69%), Postives = 55/98 (56.12%), Query Frame = 0
BLAST of Spg038438 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CXI1 (Zinc finger BED domain-containing protein RICESLEEPER 3-like OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold21G004160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 3.5e-04 Identity = 34/98 (34.69%), Postives = 55/98 (56.12%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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