Spg032425 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg032425
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold2: 29607425 .. 29610708 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg032425
SyntenySpg032425
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGGGGAGCTGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTTCCCTTAAGTGGTTACTCCGAGTCTTGAACAAAGGGCCCTACCCTCTCAATGGCACGAGAGGGTTTTCTGTTTGATGGTTGGACCACAAACAGGTTGTTCATTAGAGGAGAATTTGTACTTAAGGAAATAGAGGTAACCCAGGGGTAAAACGGTAATTTGACCCAGCTGGTGTTACGGACACTTGTGAAGGACTAACTAGTCGATATTGGTCTATATCCGTGGACACAGAAAATATGTCTGCAGTGAGAAGAGTGCAACTTTGAGTCTATAGTGGAATGAACACACAGTTAACGAATATTGATTAATGTGGTTAATGAGTTTGACCAATTAATCTCACATCGTTGGAGCTTCTGATCTGCAGGTCCATTAGGTCCCACTGGTAGCTCATAAAGTAATTTGAGGCAACTAAGTAATAAATGTAAATTGAAAATGTTCAATTTACTAAGGGAAACAAATATAATATATATTGATATATTATTATGAGAGAAATTAATATTTGAAGAAATTCAAATATAAATTTATGGAAGTTTGAAAGAGTTCAAATAATGAATTAATTAATTTAAGGCCTAAAATGTGTTTGGGCAAATTAATTAATTCTAGGCCGGAAATTAAATATGTGATATTTAATTGGTGGGAATTAATCAATTATGGAAATAATTAATCACTTAAGGAAGTGATTAATCATTTATGGAAATGATCTAATCACTTATGGAAGTAATTAGTCATTTGTGGAAAAGATTAATCAATTGTGGAATTGATTGATCATGATTGATTAATTAAGGAATAAGATTGAATCAATTTTGGAAAAGATTGATTTAATTGAATATTTTATTCATGGCCTCTCTTCTATAAATAGAACACTAGACCTAATTGGTCGAGGACACTTGACACTTTGCTCTTGCTCTTAGACTCTCAAGACAAGACCTAGAATTCTCTCTAGCCTCCCTCTTAGAGAAAGACTCCCACAAGTCTTTTGCCTCCTAGACCTAGAGTCATATCTGTGTAACCTCTGTGGTTATTGTGTCATTCAAGAAGAATTTTCCAGCGATCACAAGACAAAGGAGGCTGCTGCGTTTTGTTCGTTGGAGCATCGTTGGCGACGAACGGTCAAGTCTACAACGGAGGTTTGTAACGGTTCTTCCCCTTTTCTTTAGAAAAGCATGAAAATAAATTTAGATTTATTTTTAAGCATGTTTAAACTGATTTTCCAGCAACTTTAAAGAGTGTTTAAAGTTTGTTTGAGTTTTCGTAACGGTATTTTAATGTTAATTAATATACGGCGTAAGGTCCAATCGATGCGCTTCCGCTGCGTGGGGACTTTTATTCCCTTCAATTGAGTCGGCGAAAAGGCCACTCTCACCCGTACAAATCAAAGGACAATCCCTCATGGACAGGAGTCCATAATCCACTCAGGATTAAGGCCAAGTTGCCTAGGTCATCCTAGTGAAATAGAAACCGAGCTAACTAACGGTGTTACAGTTAGTGGTTAACTATTTCGCGGTCCAGTCTTTGTGCAAACTCATTGCACAGGATACCCCTACTCGCATGTCAACTACATGAACGCGTTGGATCACTACGTTTGTATCAATATACAAAGCGGGCTGTATCCATAGTGTCACCAGGACAAGGTACCCAGCCTTATCCCTATACTACAGACCCTTTAGGCTAAAACTTGAACATTGATCCCCGTATGTCCCTACATACTAGTTCAAGCCTCATTCTATTAGCCTTGGATGTTTAGTTTATTGGATTAGGGTTAATAAGGCAAGATATAATACAAACATTGAATAATACATTACTTTTATTAATGTTCGGTCAAATGTACATTTACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAACCCAACAATATTATCGTTATCGGCGTCATAATAATATGGTGTTTAATAATTAGAATATGATTGTTATTTTTCCAACACCATAGAAGCATGTTATAGGGCTAATCATTAAATTTTTATAATAAATTATAAAATTGATTAGAAACCGTCAACCTATAACAAAGAGTTGCATGCAAACATAGGACCTTAGGTTAAAATGAATTAATTTTAAAATGTTTAAAATTAATTAGACCTAAGCTCATTATAATTCTAATAGGATTAGAATTATTTTCTTACTTAGAATTAAAAATAGTTTTAATTGACTAAGTAGGAAAAACATTACTATGATTATAAGGGAACTCCACCGGTTAAGTTCTGTCTAAGGCTGGGGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGAAACTAACCCGGAATACCGGAGTTGAATTAGTCATAGTTAAATGTTAGTATGCAATATCACTAGGTTTATTAAAAGAGTTTAATTCACCTAGATTTTTAGAGTAAAGAGTTTACTTTACTATGGTTATAAGGGAACTCTCCCGATGAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTGCTACCTGGGAACTGACTCGGAACTTGAGTTAAATTAACCATAGTTATGTTAGCATGCAATATCACTAGGTCAATTAAAAGAGTTTAGTTCACCTAGATCTTTAGAGTAAAGATTTATCATAACTATTGGTTATAAGGGAACTCTACTGGTAAAGTTCTGTCTATGGCTGGAGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTGCTACCTGGAAACTGAGCCGGAACATGAGTTGAATTAACCATAGTTATATTAGCATGCAATGTCTCTAGGTAATTAAAAGTGTTTAATCCACCTAGACATTAGAGAAAAGACCTATATATATAAAAGTTATATACAGGCATAGACTTAGATAGATTCACTTAGCCGGAATTTACCTAAGTAATAGACCCTATAATTATAAAAATACTTAGTGGGAGGAAATATATCAAAACAAGATTTTCATAAATCAAGTTTTGCTCTCACGTCCTCAAAAGTTCACAACGTGAGGTTCATGCTTGGCCTCGAGTCACCCTGGGAGTGACTCCCTACGGATGGTGTTTGCATGGATCAATATCAAGGTGAATGAGGGAGTATTTTATAGTAAGTGGGAGCAGGAACGTGTCAACGTATCCTACGGTCTCCTCCATTAGGTTGCACCGTGAGATCCCAATGATCTGCCTGCGAGTCGCCCTGGGAGCGATCACCCTACGGAGGGCTTGATCATGGGAGTCGAAACAACGCAAGCTCCAGAAATGGATAGGGTTTCTTAG

mRNA sequence

ATGGGGAGCTGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTCCATTAGGTCCCACTGAAGAATTTTCCAGCGATCACAAGACAAAGGAGGCTGCTGCGTTTTGTTCGTTGGAGCATCGTTGGCGACGAACGGTCAAGTCTACAACGGAGGGAACTCCACCGGTTAAGTTCTGTCTAAGGCTGGGGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGAAACTAACCCGGAATACCGGAGTTGAATTAGTCATAGTTAAATGGAACTCTCCCGATGAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGGGAACTCTACTGGTAAAGTTCTGTCTATGGCTGGAGATCCCAATGATCTGCCTGCGAGTCGCCCTGGGAGCGATCACCCTACGGAGGGCTTGATCATGGGAGTCGAAACAACGCAAGCTCCAGAAATGGATAGGGTTTCTTAG

Coding sequence (CDS)

ATGGGGAGCTGGGAACATAATCGTACAAGATGGAATTCACTCCTTCCCGACTTTAGGGAAGCAGATGAGTGTCCATTAGGTCCCACTGAAGAATTTTCCAGCGATCACAAGACAAAGGAGGCTGCTGCGTTTTGTTCGTTGGAGCATCGTTGGCGACGAACGGTCAAGTCTACAACGGAGGGAACTCCACCGGTTAAGTTCTGTCTAAGGCTGGGGGTACTTAAGATGACGGTTTACGGAACACCTCCTACCTGGAAACTAACCCGGAATACCGGAGTTGAATTAGTCATAGTTAAATGGAACTCTCCCGATGAAGTTCTGTCTAAGGCTGGAGGGAACTCTACTGGTAAAGTTCTGTCTATGGCTGGAGATCCCAATGATCTGCCTGCGAGTCGCCCTGGGAGCGATCACCCTACGGAGGGCTTGATCATGGGAGTCGAAACAACGCAAGCTCCAGAAATGGATAGGGTTTCTTAG

Protein sequence

MGSWEHNRTRWNSLLPDFREADECPLGPTEEFSSDHKTKEAAAFCSLEHRWRRTVKSTTEGTPPVKFCLRLGVLKMTVYGTPPTWKLTRNTGVELVIVKWNSPDEVLSKAGGNSTGKVLSMAGDPNDLPASRPGSDHPTEGLIMGVETTQAPEMDRVS
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 109..158

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg032425.1Spg032425.1mRNA