Spg032216 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg032216
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold2: 34310627 .. 34317930 (+)
RNA-Seq ExpressionSpg032216
SyntenySpg032216
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: CDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
ATGATTGGGACTGATTCGTAATTAATTTTGTTTAATATAAAATACCAATACATTGACAACAATCTTAGAACTATTCTAGATTTATATTAAGGCTAAGCATAGAAAAATATTAGATCTAAATCTAATTTATATAGTAACAAATTACTTACTCTCGTTGACGACTCAGATTAAATTCACCAACTGCTTGTGAATTAATCACGAACTACTGCGAACACCACCACTATGGCTACACAGGTATGACTCTGAGAGTTCTAGAGGCAAGAGACTGGTGGGAGTCCAGAGGAAGCCTTGAGGGGAATTCTCTGAGTAGAAGAATGAATGGGATGCCTTTCACCCCACCCCAGGGGTCCTATATATAGTAAAGGCCAAGACCTTTTTCCTGATAGGAAAAAGGAAGACCTTTTCCTAATAGGAAAAAGGAAGACCTTTTCCTAATAGGAAAAAGTCTCTAATTTTAATAAATAATTAATTAATTTCCCAATTAAATATCATATATTTAATCTTAGGGATTTTATTAAAATTAAAATTAATATGAATCCAATTCATATTAAATTTATTTGAACTCTTTCAAATATATTCTTTCCTAATAGGAAAATGTCTCTAATTTTAATAAATAATTAATTAATTCCATAATTAATTAATTACCCAATTAAATATCATATATTTAATCTTAGGGATTTTATTAAAATTAATATGAATCCAATTCATATTAAATTTATTTAAACTCTTTCAAATATTTTCTCTCAAGAATTAATTTTTGAAATTAATTCAAAAATTATATTATAATGTTTCATAAACTTTATATTATCATGCATCAATATACATTATTCGATTCCCCAAATAAATTGAACACTTTTAATTTATAATTTATACTTAATTGCCTTAAGTCTCTTTACGAGCTACTAGTGGGACCTAATGGACCTACAGATCAGAAGCTCCAACGATACGAGACTAATTGGCCAAACTCATTAACCAAGTTAGTCAACATTCGTTAATTGTGGGTCACTCCACTAAAGACCCATAGCTGCACTCTTCTCACTGTAGAATATTTCTGTGTCCACGGATATCGACCAATGCAGTAAGTCAATCCTTCACGTGTGTTCGTAACACCAGCTGGGTCAAATTACCGTTTTACCTCTGGGTTACCTCTGGTTCCTTAAGTACCACTGATTCCTCTAATGAACAAGTTGTTTAGGGTCCAACCACTAAACAGGAGTTCCTCTCGAGCCAGGAGAGGACAGCGCGCCTTTGTTCAAGTCCCTGAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTACTTACCCCAATAGGGGAAGGAGTGAATTTCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGGTAGGCTTATTGAGTCGGTGAACTGGCCACTCTCACCCATACAAATCTAAGGACAATCCCTTCTGAAAGGGGTTCATAACAGACTCAGGATTGAGATTGAGTTACCTAGGTCATCCTATTGAAATAGAAACCTAAACTAGTTAACGGCATTACATCTAGTGGTTACTATTTCGCGGTCCAGTCTTATGCAAACTCATTGCATAGGATATCCCCACCCGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAGGTGGGTCGTATCACATAGTGTCACCAGGATAAGGTACCTAGCCTTATCCCTATACTATAGACCTTTTAGGTTGTTACTTGAACACCGATCCCCGTATGTCCCCACATACTAGTTCAAGTTTCATTTAAACAACCCTGGATCTTAGTTTATTGGATTTAGGGTTTATTAACGCAAACCCGATTATTCAATAACCAAATTACTGAATTACTGAAATAACGCTTTATTGAGATCGATTAATTTGTTTCATTTACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAACCCAACATACATCACATGCATAATTAAATTAAAACTACCAAAATTGAACGGCATATTTGGCATATCCTAAGAAATTGAAAGCAATTTAAATTACAATAATTTAAATCCAAGACATATCTTGGTCTTCAAATCTTTCCTTTTTGACATTTACAATTGATCTAATCAAAAGTATAAATCTAATGCCAACAAATATGCCTAAATAATCAATTTTGTAAATTAAACCACATATCACATATATGAAATTAAAATACCCACCATTGAACCAATGCTAATTTTAGAGAAACGAAATTAAATCTACGATCAGCTCTGATACCAATTGAAGGATTTGGAATTCCCTAATTCCGGTAAAGCGGAAGTGTAATTGGGACTGATTCGTAGTTAATTTTGTTTATCCAAAAATACCATTACATTGGCAAAAAACATAGAACAAATTCTATACAAACTTAAGGCTAAGCATACAAAAATTATTCGATCTAAATCTAAAGGGGAGAAACAAACATATCGTCGTTTTCGTCTCTGAAATATCAAGAACGTCCTTCTTGATTTTGGACAGAGCGTCAACAATTGGGACACCACCAATTGATCTTCCCCGCTATAACTCTAAGATTAGGAACATAGTTGTGGGACTACCTAATCTTGAATGGGAAAAACTCTAGAGAGAAAATTCTCCCTAGAGTTCTTGAATTGAGAGAATATGAAAGGGAGGCTACAATGACCTTATGGTGGCCATCTGTTGTAATCTCTAAACCCTAGGTTTAGTGTTCTATTTATAGGAGAAAGGCCACGAATAAAATATTCATTTAAAATCAATTATTTCCATAACTGATTTAATCTTTTCCATAATTAATCAATTCCATAACCAATCAATTCTATAATTGATTAATCTTTTCCATAAATGATTGATCACTTCCATAAGTTATTAAATCATTTCCATAAATGATTAATTACTTCCATAAGTGATTAATCATTTTCATAATTGATTAATTTCCAATTAATTAATTCTTTAATTAATTAATCAACAAATAAATATCATATATTTAATTTCTGACCTTCTATTAGTTAATTAATTAATTACCCAATTAAATATTATATATTTAATTTCAGGCCTTCAATTAATTAATTCTATAATATGAATCAAATTCATATTAAAATTTAAACTCCTTCAAATTCTCTTATATCCTATAAATTTAATATGAATCAAACTCATATTAATATTTGAACTTCTTCAAATATTTATTTCTCTCAAAATAATAAAGTTTAATCTCAAATTAGACTTTATATTTTAATGTATCACTATACATCATATTAATTTGTATCTCATACAATTAACTTAATTCCCAATATGAATTTGAACTATTCAAATTCTCTCAAGATATAATTATTCCTAATTACTCTTTACGAGCTAGCAGGGGGTCTAATGGATCTACAGATCAGAAGCTCTAATGATATGAGGTTAACTGATTAAACTCATTAATCAGGTTAACCAATATTCATGAACTGTGGGTTATTTCACTAAAGGCCCGCAACTGAACTCTACTCATTGTAGAACAGTTTTGTATCCACGGATATAAACCTATACCGGTAAGTCAATCCTTCACGAGTGTCCGTAATCACAGCTGGGTCAAATTACCGTTTTACCCTTGTGTTACATCTGTCTCCGTAAGTACCAGCGCTCCTCTAATGAACAACCTGTTTATGGTCCAACCATTAAATAGAAAGTCCCTCTCAGGCCAGTGAGAGGGCAAGAACCCTTTGTTCAAGTCCTGGAGTTACCACTTAAGGGAACACTCATCTACTTCTCCTTGAAGTGGGAAGGAGTGAATTCATTCTTGTGTTGTCATGTCCCCAGCCTCCCACTTGGTCTTGTGCCCAAAAAGGAAGACATATTGAGTCGGCGTATTGGCCACTCTCACCCATGCTAATCAAAGGACAATCCCTCATGAGAAGGAGTTCATGACACACTCAGGATTAAGACTGAGTTACCTAGGTCATCCTATGGAAACAATAACCTGACTAGTTAACAGTGTTATATCTAGTGGTTTACTATTTTATGGTCCGGTCTTGTGCAAACTCATTGCATGGGATACCCCCGCTTGCATGTCTACTACATGGACGCTTTGGATCAATACGTCTGTATCAAATACAAAGCGAGCCATATCTCATAACCAGGATAAGGTACCCAACCTTATCCTTGTACTATAGACCTTTAAAGTTTTTACTTGAACACATCGATCCCCGTATGTCCCCACATACTAGTTCAAGTTACATACAAACAACCTTGGATCTTAGTTTATTGGATTTGGGTCAAATTGTGCAATATTTAACAATAACACTTTATTGTAGAAACTCAATAACACTTTATTGAAACAAGTATACAATTTGTTTACATTCACTATCTACGAGTTTTAGGGCATAAAACCCAACATGTATCAAGGACCACCACTTGGATCTTTTCTACTAATCTCAGACCTTATAACGGATTGTGGGAACCTCTAGTGATAGGAATTGGAGGGATAAGCTTGAGGGTTCAAGCACTTTTGAGAGTTTGAGCTTTGGTTATTCTAGAACCAAATTGGCAGCATTTCAAGTTGAAGTCTCATAATAGTTTCCATCAACTAATCCTATATTTCTAGAGGAAATTCATGCATTCAAAATGCACAAAAGATTGACAGCAATTTGGGATTAATTTGAGCCAGAGGATCATGTGGAACAAGAAGGCTAATCTATAATGATTAGTGACTAAGCACCACCTCCTAAAATTGTGAATTTTTTAACTTCTTTAAATTAAAAAATTTGTAATTTTAATTTGTAATTTATCAACTTCAAAAATCCAGATTTAATTTTCAATTCTAATTTAAAATTAATTTTAATTACAAATTTATAATTAATTACAATATAATTAATCAATAATATTAATTTAATATCAAATATTAATTAATAGTATTCTATCGATCTCGACTCTTCTCTAAACAAGTATTCTCAAACATGAGACACTTTTCAAGTGTTTAATATTTCAATCATATTTAAATACAACCAACCCTCAAATTATAGTTTAATTCGAAATTAAACCAATATGTCGTTAATGTCATATATAATCGACATTTATACCATAATCCGAATTTGAACGTTTCAAACACTCCTATCATATTGTTCCAAGGTTTATTCCTATATGAGCCAGTAGATGGACCTAATGGACCTACAGATCATGGTTTCCAACGATCCGAGAATAACCAGCAAAACTCATTAACCTAGTTATTCGAAATTCGTTAGCTACCGAGACACTCCACAATAGCCCGTAGTTGCACTCCCCTCACTGTATATATATTTCCAACTACCTGATATAACCATAATTAGTAAGTCGACCCTTCACAGGTTGTTTGTAACTCGAGCTGGGTCAAAATTTCGTTTTACCCCTAAAGTCACATTTTGTTCCTTAAGTCCCACTGATCCTCTAATGAATAATTGGTTCATGGTTCTTCCCCCGAATCGAGTCCCTTTCGGGCCAATGAGAAGGTGGAGCCCCTTGTTCAAGACCTGGAGTAAGTACTTAAGGGAACAACCTCTCTATTATCCCTAATATGGGTAGGAGTGAATTTTGTCTCGCAAGACTATGTCCCCAGCTATCTATCCAGTCTCATCTCTAAGATGGTACGTTTATTGAGTTGGCAAACTCGGGCCACTCTCACTCATGCAAATCGAAGGACAATCTTGAATAAACAGGAGTTCATAGTTAGCTCAAGATTAAGATCGAGTTACCTAGGTATCGCATGAGATAGTCAATTTCATCAGTAAACAACGTTATAAAGTGAAAGTGACTTATCTCGCGATTTGGTCGCTATGCAAGCTCATTGCACAGGACGCCCTCACTCACATGTCACTACATGAACGATTCAGGATCACATCATCTGTATTAAATACAAAGTGAGACGCGTCAATAGTGTCCCCAGGATAAGGTACCAATCCCTATCCTTATACTGTAGACTATTTAGGCTATTTACCTGAACTTGATCCAAATTTATGTCGCTTCACAAAGTCCAAGTATTCACAATATAACCAGGGGTTATTTGGTTATTTTAGGCATGAGGAACATATATAATCAATAACGCTTTATTAGTGAACAATCAAGCGTTACATTTACTATCTACGAGTTTTAGGGCACAAAACCCAACAACTATTTCGTGGTTGGATCTTATGCAAACTCATTACATAGGATACCCCCACTCGCATGTCTTCTACATGAACACGTTGAATCACTGTATTTATATCAAATACAAAGCGGGTCGTATCTATAGTGTCACCAGGATAAGGTACCCAACCTTATCCCTATACTATAAACCTTTTAGGTTGTTACTTAAACATTGATCTCCATATGTCCCCACATACAGTTCAAGTTACATACAACAACCTTAGATGTTTAGTTTATTGGATTTAGGGTTAATTAATGCAAAACGAAAAATAACAAATTCAATAACTTGTTATTGATATAAATTAATTTTAATTAAAAAACATCTTATTAAATAATTTCAATAACTCTTTATTGATATAAACTATATTAATTCAATAACACCTTATTGAATAATTTAAATAACTCTTTATTGATATAAACTAATTTGTTACATTTACTATCTACGAGTTTTATGGCATAAAACCCAACAAACATAATATGCATTTTCCAAAGGGTAGGAATAATGAACAGTAGCGTGCAAATTTGATCAACAGAGACCTCAATATTGAAACAAATTATACATGAATAGAGGACACATTCCATGCCCGTGAGGAGAGAAACAAAACACAGTATCTGAATCAACATAGCCCACAAACGAAACACACAGAAGGTAGTTCAGATCGGAGGCCTTAAGCATGCAAAATCATCATTTTCAAATAAAAAAACGTGTGAAACAAACTCCTCATCATCGACCATAAGGAAGAAAAACGAACCTGTTTTGTAAATATACGAACGCACCTACCAAGCTTGACGGTACTGAACCCTTCTCCTACCCAAACTCTTGACTCATTCATCACGCGGTTGTGCTTCTCAGTCTCAAATCACCCACCAAACCAAGAATGAGGTTGTCAAATGGGAGGAAATCACAGCTAGTAAAGTTGAACATCCTAGACGCGGTAAGAGACAAGGCTCGGAGCTTCTCGAGTGGCAAGGGTTTGGGTAAATGGAATCAACGGAATGACAGATCCATGGAAAAGACGGATCCACAGACCTATTGTGGAGAAAAGTTAGATCCATGGAAAATTGGGTTGCGTATGGAGGAAGAGAGTGTTTGGAAGAAGAAACCAGACGAAGACGGTCTAAAACACGAAATAAAGTCGTCGAACTTCAACCATGTCGTTAGGTCGAATGGAAGACGGTCGTCGACGACCATGCGAGAATAG

mRNA sequence

ATGATTGGGACTGATTCATTAAATTCACCAACTGCTTGTGAATTAATCACGAACTACTGCGAACACCACCACTATGGCTACACAGGAGTTCCTCTCGAGCCAGGAGAGGACAGCGCGCCTTTGTTCAAGTCCCTGAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTACTTACCCCAATAGGGGAAGGAGTGAATTTCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGGATATCCCCACCCGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAGGTGGGTCGTATCACATAGTGTCACCAGGATAAGTGGTTTACTATTTTATGGTCCGGTCTTGTGCAAACTCATTGCATGGGATACCCCCGCTTGCATGTCTACTACATGGACGCTTTGGATCAATACGTCTGTATCAAATACAAAGCGAGCCATATCTCATAACCAGGATAAGGATCACATCATCTGTATTAAATACAAAGTGAGACGCGTCAATAGTGTCCCCAGGATAAGTCTCAAATCACCCACCAAACCAAGAATGAGGTTGTCAAATGGGAGGAAATCACAGCTAGTAAAGTTGAACATCCTAGACGCGGTAAGAGACAAGGCTCGGAGCTTCTCGAGTGGCAAGGGTTTGGGTAAATGGAATCAACGGAATGACAGATCCATGGAAAAGACGGATCCACAGACCTATTGTGGAGAAAAGTTAGATCCATGGAAAATTGGGTTGCGTATGGAGGAAGAGAGTGTTTGGAAGAAGAAACCAGACGAAGACGGTCTAAAACACGAAATAAAGTCGTCGAACTTCAACCATGTCGTTAGGTCGAATGGAAGACGGTCGTCGACGACCATGCGAGAATAG

Coding sequence (CDS)

ATGATTGGGACTGATTCATTAAATTCACCAACTGCTTGTGAATTAATCACGAACTACTGCGAACACCACCACTATGGCTACACAGGAGTTCCTCTCGAGCCAGGAGAGGACAGCGCGCCTTTGTTCAAGTCCCTGAATCAGCCCTTAAGGGAACACACATCTACTTACCCCAATAGGGGAAGGAGTGAATTTCATCTTGTACTGTTATGTTCCCAGCCCCCATTCGGTCTTGCCCCTGAAATGGATATCCCCACCCGCATGTCTCCTACATGGATGCTTTGGATCATTGCATCTGTATCGAATACAAGGTGGGTCGTATCACATAGTGTCACCAGGATAAGTGGTTTACTATTTTATGGTCCGGTCTTGTGCAAACTCATTGCATGGGATACCCCCGCTTGCATGTCTACTACATGGACGCTTTGGATCAATACGTCTGTATCAAATACAAAGCGAGCCATATCTCATAACCAGGATAAGGATCACATCATCTGTATTAAATACAAAGTGAGACGCGTCAATAGTGTCCCCAGGATAAGTCTCAAATCACCCACCAAACCAAGAATGAGGTTGTCAAATGGGAGGAAATCACAGCTAGTAAAGTTGAACATCCTAGACGCGGTAAGAGACAAGGCTCGGAGCTTCTCGAGTGGCAAGGGTTTGGGTAAATGGAATCAACGGAATGACAGATCCATGGAAAAGACGGATCCACAGACCTATTGTGGAGAAAAGTTAGATCCATGGAAAATTGGGTTGCGTATGGAGGAAGAGAGTGTTTGGAAGAAGAAACCAGACGAAGACGGTCTAAAACACGAAATAAAGTCGTCGAACTTCAACCATGTCGTTAGGTCGAATGGAAGACGGTCGTCGACGACCATGCGAGAATAG

Protein sequence

MIGTDSLNSPTACELITNYCEHHHYGYTGVPLEPGEDSAPLFKSLNQPLREHTSTYPNRGRSEFHLVLLCSQPPFGLAPEMDIPTRMSPTWMLWIIASVSNTRWVVSHSVTRISGLLFYGPVLCKLIAWDTPACMSTTWTLWINTSVSNTKRAISHNQDKDHIICIKYKVRRVNSVPRISLKSPTKPRMRLSNGRKSQLVKLNILDAVRDKARSFSSGKGLGKWNQRNDRSMEKTDPQTYCGEKLDPWKIGLRMEEESVWKKKPDEDGLKHEIKSSNFNHVVRSNGRRSSTTMRE
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 261..277
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 261..295
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 278..295
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 218..240
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 226..240

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg032216.1Spg032216.1mRNA