Spg031012 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg031012
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold10: 23119171 .. 23123993 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg031012
SyntenySpg031012
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDS
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ATGCGCGACAGGGGCGATAGCGTCGCGACGCTATTGGCAGATTTCCTATTTAATGTTCTTTTCATGCTACGACCAAGGAGAGTCCAATTTGAGAGATTTTAGCCCTAATTTCGACTAGAGACCTTCTGTGGGAGCTGAAGCAAGGACAAGGAGCGGGAATCTAACTTGGAAGCGTGGAGATCGTGACGGGGACGTGCCAGTTTCGACGACTTTGAGTGTTTCCTTTCCTTTTCCTTTTCTTTAGTTAGATTTAATGGTTTTTTCATGCTTAGTTGATCTTGTAACGCCATGTATGAGTAGCTAAGCTTGTTAATTAGGGATTGATGTAGTCTTTTTAGTTTATGGATTGATTTATGGGATGATTTGTGAAATGGTTATTATGTTTGCAATCTTAATTTAATGCTTTCAATTAATTGGCCACTAGTTGAATGTTTTAAGTGTTGAGTTTTGCTCGGGAGAGGGGATTTAGCGTAGACTTTATTAAGATTGCATGACTAAAGTTTATGTTCTAAGCTCGTGACGGAATTTAGAGTAACTTTAGAATTGGTCAAAAAGAACTAAATGCCTTGCATGTTAATGAACTTAGATAGGGATATCAAGTTGGTTAATTTGCATGAGAATCAATTATACTCGGGAGAGGTAGTTGTGATTAAAGGTTCTTAGGCTCATAAATCCATTGTGCGTTATAACTCATTCCCTAAAATCAATCATAGACTAAATTGGCAAAATCAATTCCCTAAGTGTTTTTTCAATTGAATCTCCGTTGTTTGTTTGCATTGATCTAGTTTTCTATCATTCACTACTTTTTGGTCCCTAAATAAAATTGAACAAGAATATTCATGGTAATTGATTTAACTTAAAAATCCAATCCAGAGAACGACACTCGATTTTACGATCACTTTATTATTACTTGACCCGTGCGCTTGCGGTAGGAAAATTCCACATCAAGTTTTTGAGTTGAGATCTAAGCCATCATCTTCTTCCTTCATCTCTTCCTCTCTCTTTACCCGATACCTTTCTTCTCCACCATCTCTTCATCATCTTCTTCTTCTATTTTTCTCCCCCACCGTGAGCCTAAGAGATCGCCAGTCGCCGTTTGTCTTTCTTCAATCGTCCCTAGTGTGTAGTAGCTCGCGGCAGTAGGCTTCGTCGACAGCGTTCGCAAGATTTTTGGTGGTGATAGTAGGAAGCTTTCAGGCGCGGTAAGCAATGGGGTTCTCGTTCCGACGATTCCTCAACCCAATGTCTCCTCCTTGGTAGTCAAGCACCAGAACCAGTCGTTGCAGCCCCTCTCAAATGCGACAACATCGTCTTCTTTGCGTTTTTCAGAGATCCAGCGCGTGAGGGTTTGTTTCTGGCCATTTCAGTTCAAACGATAGTGTTTTGAAGTCATCTAGAGTTGTTCAGCTCGTGGGTTACCTCAGATCTGTGTGGTTTAGTCGGTCAGTAGCTTCTTCTTTGAGTTTATGGTGATTCGAGGAGTGGGTTTTCGAATTCCAACGAGTTCAAGTGTGGGTAAGCACGTTTCAGCAAGCTTTCATGAAATTTTCATTGATTACAGTGTTATAATCGAATACTGATAATGCTCACTTACGTGCGTTATTTAGCCTTAAAAACCTAGGTAATTGTTTGGAAAGCAAGGACTTTGTATTTAAAATCTTATCATTTCAAGTCAATTTAGCAAAAGTTGTAGAATCATGAGGAAAATCTTAGAAATATAGAATTTAAGCTTAATTCTTAAAGTGTACAAAAAGAGATTATTTTTGTAAGAATTTATCCAAGTAATGTACAAAAAGGCTAGTGTGTGGCATCCATCAAATTTTAGAGCAACTTCAACTTTCAGCCAGTAGGTAGGAGTATGCTGAGAGGCAAGCTTAGACCTACTGGACTTATGCTAATAGGAGGGATGCCACCCTAAGGAGGGCGCTGCAATCAAATTTTTCAAAACCATATCAGGCCTTCCCAGTTTTTCCCGATGACTTGTTTAATCCTTGGATCCCTCCACCACCAGTTGAAAGAGAGGAAGAAGAGGAGGATGATTCGGGTCAGGAAGATTGATGAAGGAAAAAAAAGTTGGGCGAGCGTTATTTTTGTTCAAATATTTTTGTTGCTCACATATTCTTGACCCCAGTTTCTTTTGATTTTTCTGTTTTTATTTTTTGCTGTTTGTTTGTTTTCTGTTTTTCTAGGCCATGAAATTATCTGCTTGATGTAAATCTTTTCCTTTGTTTTTAATGAAATTTCTGAAGTGTTTTCTGTTCTATGGCATACTCATCATTCCTAACTTAACCATTTTCATTTTTGAAGTTTGGACTAGTTAGCTTAATTATATCAAGGTGTTATGATCTCCAGAGACCTTTTGCTTGAGCATTTCTTCTAGCCTGGTCATCGCTGCGGCAAGAAGATTCTGAGGTAGTATTGACTTATTTGATCCACCTTAAGCTTAATCTTAGTCCCGCGCTTAGTTTAAAATTCAGATAGAAAAGAATTAAGTTTTGGGGTATAATTATCATGTTAATAATTCATTGGGGACAATGAATAATTTAAGTTTGGGGGACTTTTAGATACTCCGCTTGTTTTGCTCAAGCATTCCTCTCCTTCATAATAATTTTTCTTGGTTGTTGAGTAACCAGGGACATTTGTGACACCCACAGTTTGTCTTTGCGTCAAAAGATGGCCTATGAAATATTGAAAAAAAAAAGATAAGAAGAAAAAAAATTATTTGCGGAAAAGAAAATTGTGGAAAATTTTGCTGAGAAAATTCATAGAGCAAAAGTTTTGAAGAATGAATGATAATCTAGCAGTTTTCTATCTCCCAGGGCTTAGGTGAGCTTCATCATAAAATGTCGCCATTCTGAGAAGCAAGGGATAGAATAACTAAGGATTTTTTTGAGCTAACAATGAGTATTTACCCTAATTGGTGATAAGTTTGAGGCAAGGGTATACTGCACCATAAAGTGGGTCATCTCATGCTTAAGAGCTTATGACTGTAAGGCTGTTTTAAGTCTGAAGAATAGAAAAAAATAAAACCCCTTAAAAAGTGTGTTTTAATATGTCTGATAATAGAGTTGGGTTGTGGTAAGTTCTTAGGATTGAGTTAAAGGTGGTGAATATTTGTTCAATGCTGAAAGAATTATTTTGCTGCAGCAGTGCTTGGTTTTGCAGAATGCTCAGGTAAAGGTTGAAGGTAGTGTTGGATTATCTGTTTTGATTAAGTGGTGCTATGACTAATGTTTTGAATTCTTAAAAGAAGGTTAGTTAGTATTGCTCGGGACGCACAATAGTTCAAGTTTGGGGGTATGATAACTCTCCAAAAGGGAGTTATTTCGGCCTTACTTCTATAGTGATTTGTGTGTCATTTGTGCCTAATAGGGTTGCTTTTAGATGAATATTATGTGTTTTAACATATTTAGAAGAATGGATGCTTTGGAAGTTATTCTGTGCAGAAAATAATACTGAGCGACTTGAGGGAGCAAAATCCATGATCCAGCAACGCAAGGAGCAAAACTGCCACGTGAGCCGCACGTGATTCATTAAATGAAGTGGCGTTAGCTGAATTGATCTCGGATTTAGGGAGCTTGGAGAGCCCTCCACGTGTAAAATTTGACCTAATTAGGGTTGACTCCACTCTATAAAAGGAAGTAGCCGTCTCAAGTCCAAAACAATTCCAAATTCGAGAAAGGAAAGTCTTATTCCATTCGTGGAGGTTTACTTTCCATCTTTGGAAGCCGAATAAGGGAGGAACGATTGGAGACTTCCAGACGACCATCAACTACGAATTTCTTCAAGGGAATTAATCTTTTCTTGTAAATTTCTTGTAGTTATGGATGCACATACTCAGATTGTAGCGTGTGTTATTTTGTACTCCATGAACTAAATTTACTTAAGTGTTGGTTAGGATCTATGTAATTTACATACTTCATTCTCTATGCAATTTATGTTGATTTGAGCATCTTGATTATTTGTTGTGCATATTCCTATTTTGTGCCCGCTTGGCCAACCGATATGAATATCACCTCTTAGTTTTAGGGATGATTTGAGAGGTGTGTGGCATTTAATCACACTAGATCATTATGTGTTGGTGGACGCCAGTAACCGACTTAGGGATAACGAGTCACCTAGTGCTTGATCGGTAGTATGTCATTGGAGTTGAAACCCATTCAAAAAAATCCAGAGTTCTGGGAGGATCCTACTGATAAGACTGCAAGAGAATTGCCTAATCAATATTATTGCTAGAGCATCTTTTAAAACAATTACAGAAATCTTAACCAACGCCTGTTTCCAATCTGTCTGCTTTATCCGTTTACTTTCTGCTCTGTTATTTCTTTTGCTTCAGCATTTTATCAAAATCAATCATTTTAACAACCTTGAAACCATTAAAGAGTTACATAAAATAGGTAGAGTGGAAGTTATTCAAAACCTCGTGGATATGATAAATTACTTATCACTTGTTGCAGACTATGTGCACTTGCATAGTATTCTAGAGAGCATTTTTATCATATTTTTACCCCACTCTAGAAAGCAACAAGTTTTTGGCGCCGTTGTCGGGGACTTGAATAAGTTTTTATCTGATCTGTTTTGTGTATGTGTTTTAGTGGTTTGGTGCTAAAACTTTTTTATTGTTTCCTTTGTTTTTGCAGGTGTGAGATTGGTGCATGAGCGATCCACTTGGGGTGAGATTCGAGCTTGATCCAGAAATTGAAAGGACATTCAGAAGAAGAAGGAGAGAGCAGCGAAGAAATCAAAATCCAATGGATAACGTGTCGCGTCTCCCAGAAATTCCAGAAGATCAAGTTGATCCCCAGCAGAATCGTGTGTTGTAG

mRNA sequence

ATGCGCGACAGGGGCGATAGCGTCGCGACGCTATTGGCAGATTTCCTATTTAATCTCGCGGCAGTAGGCTTCGTCGACAGCGTTCGCAAGATTTTTGGTGGTGATAGTAGGAAGCTTTCAGGCGCGGTAAGCAATGGGGTTCTCGTTCCGACGATTCCTCAACCCAATGTCTCCTCCTTGGTAGTCAAGCACCAGAACCAGTCGTTGCAGCCCCTCTCAAATGCGACAACATCGTCTTCTTTGCGTTTTTCAGAGATCCAGCGCGTGAGGGCCTTCCCAGTTTTTCCCGATGACTTGTTTAATCCTTGGATCCCTCCACCACCAGTTGAAAGAGAGGAAGAAGAGGAGGATGATTCGGCAGTGCTTGGTTTTGCAGAATGCTCAGATTGGTGCATGAGCGATCCACTTGGGGTGAGATTCGAGCTTGATCCAGAAATTGAAAGGACATTCAGAAGAAGAAGGAGAGAGCAGCGAAGAAATCAAAATCCAATGGATAACGTGTCGCGTCTCCCAGAAATTCCAGAAGATCAAGTTGATCCCCAGCAGAATCGTGTGTTGTAG

Coding sequence (CDS)

ATGCGCGACAGGGGCGATAGCGTCGCGACGCTATTGGCAGATTTCCTATTTAATCTCGCGGCAGTAGGCTTCGTCGACAGCGTTCGCAAGATTTTTGGTGGTGATAGTAGGAAGCTTTCAGGCGCGGTAAGCAATGGGGTTCTCGTTCCGACGATTCCTCAACCCAATGTCTCCTCCTTGGTAGTCAAGCACCAGAACCAGTCGTTGCAGCCCCTCTCAAATGCGACAACATCGTCTTCTTTGCGTTTTTCAGAGATCCAGCGCGTGAGGGCCTTCCCAGTTTTTCCCGATGACTTGTTTAATCCTTGGATCCCTCCACCACCAGTTGAAAGAGAGGAAGAAGAGGAGGATGATTCGGCAGTGCTTGGTTTTGCAGAATGCTCAGATTGGTGCATGAGCGATCCACTTGGGGTGAGATTCGAGCTTGATCCAGAAATTGAAAGGACATTCAGAAGAAGAAGGAGAGAGCAGCGAAGAAATCAAAATCCAATGGATAACGTGTCGCGTCTCCCAGAAATTCCAGAAGATCAAGTTGATCCCCAGCAGAATCGTGTGTTGTAG

Protein sequence

MRDRGDSVATLLADFLFNLAAVGFVDSVRKIFGGDSRKLSGAVSNGVLVPTIPQPNVSSLVVKHQNQSLQPLSNATTSSSLRFSEIQRVRAFPVFPDDLFNPWIPPPPVEREEEEEDDSAVLGFAECSDWCMSDPLGVRFELDPEIERTFRRRRREQRRNQNPMDNVSRLPEIPEDQVDPQQNRVL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 153..186

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg031012.1Spg031012.1mRNA