Spg028585 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1

Overview
NameSpg028585
Typegene
OrganismLuffa cylindrica (Sponge gourd (cylindrica) v1)
DescriptionUnknown protein
Locationscaffold7: 16529450 .. 16537087 (-)
RNA-Seq ExpressionSpg028585
SyntenySpg028585
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideCDSthree_prime_UTR
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ATGAGACTTAGCTCCACTGACTGGGTGCCATCTACCATCAGTAGGAGTAGAGACCTCCCAAAACTCCCGCTTGTGCACTACCAGTGAGTTGGCAAATTTGTATACATAGGTGAGTTAATTGATCACGAGGCTCAAACTACGGATAAATGAAATGAAATGAATGAGAATGAGATGACCTAACCCTTAGGCCCTTAACTCGAATAAAATGTTAAAACCTTGATTGCTGCAAGTGTCTTGAAGTATTGCTACTTACTGAGTATTTTTCTTAAATACTCATTCTTTTCCCTTACATACAACTGCAGGTAGAGGTAAATGTGTACAGAACGCGTGACGGAGAGCTGCTGAGCCATGGATCTCCTTTAGGATAGTCTTCCGCATTTTGTGTTTTGAAATTCTTTTTTTGGAACTTGTATTGCGAATGATTTAAGGTTTATTCCGATCTAAGTTTTGTGTGAATGGCTAAAGTGTTCTTTTGTTCTGTTTTAACTGGGATCCCAGGCTGAAAAGTTTCGCAAAATTTCTAAGTATGTTTTCTTTAAATGATATTTCCTCGCTGTTCTTAGAAGTAGAATGAAATGTATGTAGTAACGACCTTAGGATCTAGGCATGAAAAGTAGGGTCGTTACAGTTGGTATCAGAGCTCTAGGTTATAGGTTCTGTAGACTGGTTTACATCGTAAACCTTAGGTATATCCATGGCTTATCAGCAAGCACCCGGTCACGCCAGGTACACCTTTGTTTATTTTGTAGCCTGCAAATGTTATATGTATTCGAAAAGTCTCATGTTGTGGAAAAGTATGAATGATGTTTGATATCGATGAATGGTTTAAAGGAATCGAGCTTGTTTAGTAAGATGATAAAAGATTTTGTGTGATAGATCATGCCTCCCCGAGCATGAGGTCATGGAAGAGGTCGAGGAAGAGATCGTGGTAGGGGTCGTACAGCCCCTGAACAAGTCGTGCCACCTGTGGAGCAAGGAGGAGATCTACCGGAAAACCCACAAGTGGAACAACCGGGTGGACAGCCGGGGCCTGCGGTAGGACCTGTCACAGTGGATATTCAGGCAATAGTTCATACCGCAGTTCAGGCTGCAGTTGCGGGCGTGCTTGCGGGGCGACAGGCCCAAGCGCCTCAGAACAACGAAGCCACCCTATCGCGGGAGGCTAGGTGCCTGAGAGATTTTAGGAAGTGGGATCCCTGTCCGTTCGATGGAGCCTCAAAGGACCCCACGGTGGCAGAGTTGTGGTTGTCCTCCATCGAGACTGTCTTTCGCCACATGAACTGCCCGGAGGACCATAAAGTTTACTGCTCCGTGTTCCTGTTACGAGATAACGCCTTGATTTGGTGGCAGTCAATCGAGAGGACTATAGACGTCAGCAACGGACCTGTCACATGGACTTAGTTCAGGGGGGAGTTCTTTAGGAAATATTACCCTGCAGCCTCCCGATTCAAGAAGCAAGCGGAGTTTGTGGCTCTTACGCAGGGAAACCGAACCGTAGAGGAATATGAGACAGAGTTCGCCAGACTGTCTCGGTTTGCTCCTGCCCTAGTAGCTGTAGAGGCTGATAAGGTAGAACGTTTCATCACAGGCTTAAGGGAAGAGATTCAGGGCAGTGTGGCAGCCCATGAACCCCAAGACTATGCCACAGCAGTCAGGGTGGCAGAGCTGATCGATCGACGACCGTCAGTTGTCTCTTCAGAACCTTCCTCGGGTCATAAGCGGAGGTACGATCAGATGAGCTCGAACACACAGCGGGGACACCGATACCCTAGACGAGGTCCGCCCCAGGACCGTCGACAGAAAGCACAGAATCAGCTAGGGCCTAACCAGAATAGGCCATTATGTCAGACGTGTAAGAAGTAGCACTGTTGCTTGGCAGGGACCCGTGTTTGTTTCAAGTGTGGTCGGGAAGGGCATATTGCGCCGAATTGTAATCAGAAGAAAACTAATTATGCCGACCAGCCGTCCAGTTCAAATCAGGCATCCGAGGTAAGACCAGCACAACATCAGGGCAAGATATTTGCCACTACCCGACAAGAGGCAGAGAACCTTAACGCAGTGGTGACAGGTACCATCCCTATCCTCGGCCATTATGCTTTTGTGTTGTTTGATTCGGGTTCAACACATTCTTTTATTTCTGCATCATTTGTAAGTCAAGCCAACCTAGAACTAGAGCCGTTGGGCTATGTTTTGTCAGTCTCCACCCCTGCGGGGATAACGTTACTAGCTAGGGAAGCGGTGAAAGCCTGCCAAATGATAGTGTCTGATCGATCAATGGATGTGACATTGATCGCCCTTGATATGAGTGATTTTGATGTTATCTTGGGAATGGAATGGTTGGCTTCTAATTATGCCAACATAGATTGTTATCGCAAGGAGGTTATCTTTAACCCTCCGTCAGAGGCAAGCTTCAAGTTTAAAGGATCGATGATCAAAGGTGCTCCTAAGGTGGTCTCTGCAATGAAGGCGAGGAAATTGATTAGCAAAGGAGCTTGGGGCTTACTGGCTAGCGTGGTTGACACAAAGAACACCGAGGTATCAATGACCTCAATACCGGTAGTGAGGGAATTCACAGATGTGTTCCCGGAGGATCTGACAGGACTACCGCCTGCACGAGAGGTTGACTTCTGCATTGAACTTGAGCCAGGGACTAATCCCATTTCTAAAGCTCCATATAGGATGGCTCCAGCGGAATTGAAAGAGCTTAAGGTGCAGATTCAGGAGCTGTTGGACAAAGGTTATATACGCCCCAGCGTCTCGCCATGGGGTGCTCCAGTTTTGTTTGTGAAAAAGAAGGATGGGACAATGCATTTGTGCATCGACTACCGGGAGCTGAACAAAGTGACCATAAAGAACAGATACCCCCTGCCCAGGATTGATGACCTCTTTGATCAGCTTCAAGGTGCAGCAGTGCTTTCTAAGATAGATCTACGGTCAGGTTATCATCAGCTGAGGATTAGAGAGGACAATATACCTAAGACAGCTTTTCGAACCAGGTATGGGCATTACAAATTTACTGTGATGTCCTTTGGGCTTACTAATGCTCCTGCAGTTTTCATGGACTTGATGAACAGAGTATTTAAGGAATTCCTTGATTCTTTCGTGATTGTTTTTATCGACGACATTCTTATCTACTCCAAGACAGAAGAGGAACATGAGGATCATCTCAGGAGAGTTCTAATCACCTTAAGAACGAACAAGTTGTATGCCAAATTCTCTAAATGTGAGTTTTGGCTACAACGAGTTTCCTTCTTAGGGCACGTGGTGTCGAAGGAAGGTGTCACAGTAGATCCAGCCAAAATAGAGGCAGTGACCAATTGGTCTCGACCCACTTCAGTCAGCGAGATTCGGAGTTTCTTGGGGTTAGCAGGATATTACCGTCGTTTTGTGCAAGACTTTTCCAGTATTGTTGCACCCCTAACTCAGTTGACTCGAAAGGGTACTCCGTTTTTGTGGAACGAAGCTTGTGAGGCAAGCTTCCAAGAGCTTAAGCAAAGACTTGTTTCGGCACCGGTATTTACAGTACCTGATGGTTCAGGAGAATTCGTTATTTACAGTGATGCTTCAAAGAAGGGACTGGGTTGTGTGTTAATGCAGCATGGTAAGGTCATTGCTTATGCGTCTCGTCAGCTGAAAGATTATGAGAAGAACTACCCGACCCATGACTTGGAATTGGCAGCAGTGGTCTTTGCCTTGAAGATTTGGAGACACTATTTATACGGAGAGAAAATCCAAATCTTCACAGACCACAAAAGTCTGAAATACCTCTTCACCCAGAAAGAGTTGAATATGAGGCAGCGAAGATGGTTAGAGTTAGTGAAAGATTATGATTGTGACATCCAGTACCACCCGGGCAAGGCAAATGTGGTTGCAGATGCCCTCAGTAGGAAGACTGCTCATGCGTCTGCTTTGATTACTACTCAGTCTCGTATATTGGATGACTTGGAACGTGTAGAGATTATGGTTGCAGTGGGCGAAGTTATAGCACGCCTAGCTCAGTTGACAGTTAAGTCGAGCTTGAGACAGAGGATCATAGATGCCCAACCAAGTGACCCTGACCTCGTTGTTAAACGCAGTCAAGTAGAGGCGGGGCAGGTGAACGAGTTCTCCTTATCTTCAGACCTCGGCTTGTGTTACTAGGGTCGCTTATGCGTACCTGGGAATGCCGATCTCAAACAGGAACTATTAGTAGAGGCACATAGTTCACCTTTTTCAATCCATCCAGGAAGTACGAAAATGTACCATGATTTAAAACAGTATTACTGGTGGCAGGGCATGAAAAGAGAGATAGCTGAGTTTGTTAGTAAGTGTTTTGTTTGTCAACAAGTAAAAGCCCCGAGACAGAAACCAGCAGGCTTGTTGCAGCCGCTGAGTGTCCCAGAATGGAAGTGGGAGCATATATCTATGGACTTCATCACAGGATTGCCTAGAACGGCCAAGGGTTACACCGTGATTTGGGTCATTATCGACAGACTCACCAAGTCAGCGCATTTTCTCCCTGGGAAGCCTACTTACACTGTTGAAAAGTGGGCACAGTTATATATGACAGAGATAGTCAAGCTTCATGGTGTGCCGGTATCAATCGTGTCAGATAGAGACCCTCGGTTCACGTCTAACTTCTGGAGGAGTCTGCAAAGAGCCTTGGGTACTCAGTTGCGTTTCAGTACAGCCTTTCACCCTCAGACAGATGGTCAAACTGAGCGATTGAACCAAACTCTAGAGGATATGTTGCGAGCATGTGTCTTGGATTTCTCAGGTAGTTGGGATGCACACCTGCACTTAATGGAATTTGCTTATAACAATAGTTATCAAGCAACCATCGGTATGTCACCGTTTGAGGCCCTCTATGGGAAGAGATGCAGGTCCCCTGTTTATTGGGATGAGGTCGGAGAACGTCAGTTGTTGGGACCTGAATTGATTCAAGCCTCCAGCGAGGCTATTTGCACAATCAGATCGAGGATGTTAACGGCTCAGAGCCGACAGAAGAGCTATGCAGATAC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mRNA sequence

ATGAGACTTAGCTCCACTGACTGGGTGCCATCTACCATCAGTAGGAGTAGAGACCTCCCAAAACTCCCGCTTGTGCACTACCAGCTGAAAAGTTTCGCAAAATTTCTAAGTCATGGAAGAGGTCGAGGAAGAGATCGTGGTAGGGGTCGTACAGCCCCTGAACAAGTCGTGCCACCTGTGGAGCAAGGAGGAGATCTACCGGAAAACCCACAAGTGGAACAACCGGGTGGACAGCCGGGGCCTGCGGTAGGACCTGTCACAGTGGATATTCAGGCAATAATCCGTGTGCCGCCGCCGCCCTTCCCCGACTCCAGATCTGCACGTCGCCGCCACCGCCGCCGCGAACCGCCGCCGGTAAATCTCATTCGAGCAGCCACAGCCACCCTCGGTTTCGTCCTTCGTTTCAGATCTGTTCGACGCCTTCAGCGAGTGACTTCCAATGTCAAGGTGCCCGTAGCGTTTGGAGGCCGAACTATCAAAGTTGAGCTATTTTGGACTGCTGGACAGCAAGCTGTGTTTCTATTTTGGATTTCTTTCCTTGTTGTAGTTTTCTTAAGAACCTTGGAGTTTAGGAATTTCTTGAAGGTTAATCAAGTATCTCCTTCACTAATGAATATGGTTGTTGTGTACTTGTGTTATGTACTGGGTGAAAGTGCTGGACTGTTTTATATTATAAATTGGCTGGTAGAGGTAAAGGTGTACAGAACGCGTGACGGAGAGCTGCTGAGCCATGGATCTCCTTTAGGATAG

Coding sequence (CDS)

ATGAGACTTAGCTCCACTGACTGGGTGCCATCTACCATCAGTAGGAGTAGAGACCTCCCAAAACTCCCGCTTGTGCACTACCAGCTGAAAAGTTTCGCAAAATTTCTAAGTCATGGAAGAGGTCGAGGAAGAGATCGTGGTAGGGGTCGTACAGCCCCTGAACAAGTCGTGCCACCTGTGGAGCAAGGAGGAGATCTACCGGAAAACCCACAAGTGGAACAACCGGGTGGACAGCCGGGGCCTGCGGTAGGACCTGTCACAGTGGATATTCAGGCAATAATCCGTGTGCCGCCGCCGCCCTTCCCCGACTCCAGATCTGCACGTCGCCGCCACCGCCGCCGCGAACCGCCGCCGGTAAATCTCATTCGAGCAGCCACAGCCACCCTCGGTTTCGTCCTTCGTTTCAGATCTGTTCGACGCCTTCAGCGAGTGACTTCCAATGTCAAGGTGCCCGTAGCGTTTGGAGGCCGAACTATCAAAGTTGAGCTATTTTGGACTGCTGGACAGCAAGCTGTGTTTCTATTTTGGATTTCTTTCCTTGTTGTAGTTTTCTTAAGAACCTTGGAGTTTAGGAATTTCTTGAAGGTTAATCAAGTATCTCCTTCACTAATGAATATGGTTGTTGTGTACTTGTGTTATGTACTGGGTGAAAGTGCTGGACTGTTTTATATTATAAATTGGCTGGTAGAGGTAAAGGTGTACAGAACGCGTGACGGAGAGCTGCTGAGCCATGGATCTCCTTTAGGATAG

Protein sequence

MRLSSTDWVPSTISRSRDLPKLPLVHYQLKSFAKFLSHGRGRGRDRGRGRTAPEQVVPPVEQGGDLPENPQVEQPGGQPGPAVGPVTVDIQAIIRVPPPPFPDSRSARRRHRRREPPPVNLIRAATATLGFVLRFRSVRRLQRVTSNVKVPVAFGGRTIKVELFWTAGQQAVFLFWISFLVVVFLRTLEFRNFLKVNQVSPSLMNMVVVYLCYVLGESAGLFYIINWLVEVKVYRTRDGELLSHGSPLG
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 38..84

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
Spg028585.1Spg028585.1mRNA