Spg021955 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GACGCTTAAACCAATAAAAAAAAGAGGCAGCGCCATATGATGTAAATATAATTATTTATGACTAGACAGCAATACTATAGATTATAATTGGGGTTCGTCTTGGTAGCAAAAAAAAAAAAAGGAATTCTTTTCTTCCTTTTCAAAAAAAAAAAAAGAAAAAAAGATCACATATATTTTTTCAAAAATAAAAAAATTTAACAGCAAATAAGTTCAAAGGAGATTTCAATATCAGACTCCGAGGCGGTGGGTCCCGACGCACGAACTCATCCAGTCAGATGCCACGTGGCCGAGATCCTCTACGGAATTCGTTGTGTACCTAATGGTGGAGCCGTTGACCAAAAGTCAAATGGCAGATCGGACGGCTGAGATTCTGCCTTCTACCCCGAGACTGATCGAACCGAAAGGGCCCTGCTCAGGTACCCAATCCCCATCCTCTCTCCTCAGTAGAGCTCCACAGGGGGCGCCAAAAAAGAAAAGAAAAAACCAAAGCCTCTGTGTCAAAAACGAACAAGGAAGAGAGAAGAAGAGAGAGCAAAGCAAAACAAAACACAAACAGAGAGACGGATTAACAGGCAAAGTCTTTGCAGAAGCTCGAGCTGCGGTTTCCACTGCTTTCTGGGTCAAGCATGGAGCTTCAGAATACAGTGAAAGAAGCCCTAAACGCACTGTACCATCACCCCGACGATGCCTTTCGTATGCAGGCCGATCGATGGCTTCAAGACTTCCAGCGTACTCTCGATGCCTGGCAGGTATTGGTTTCAATCACTTCCTCGCTTTTTGGGTGCTGGATTTCACTTGCTCGATTGGAAAAAGTGGTCGAGAGGACTTTGTGATTTGGGACTTTGATTGATTGGTTTAATGTTCTTTTGTTTGTATTTTGCTTAATTCGAATCAATAAGTAGAGTTTGGCGAGTTTTAGGTACTGTCCAAATGCTTCATATGCGTCGGGGAGTGAATTCTGTTGAAGGGATTCTTTACCAATTTCTGCTGTTAATCATTCACCTTGGAAGTTCTCTTATTTCATTTTTCTGTTCAACTCTACTCGGCTGCGGGAAAACGTTGGAAAAAGTAACACCATCAGACTTAAGAATGCGACCTTTACCTCCCTCCCCCCTTGTTATTTGGTCTTGTGATAGGTTCACGTATGTATTTTGATCGAATTCTGAACAGGGAATTATAAACCATTTAAAAAGAACAGATTTCACGCTCGAAAATGGAAAAAACTTGTAGAATGACATTGGTAATGCTATTTTAAAACGGACATATGCCATTCGGAAATTTATAATTTGAATTTTCTGGAGCTGATGCAACTAGCACATGTATTGAAATTATAATTTCCAAGCATCCAATTCACTTTATTGTCTCTGCCTACATCATTGAGGATAGACGTAGGAAAGATATCAACTGCTGTTTGCTTTCAGTAAGTTTCAAAATTGTTGCGTGGACCAATTTCCAGGAATAACTTAGATTGATTTGGACAGGTTCATATTTGGGTATATTTTCAAGTGTAGATCCATTAACATTTACTAGTAAAGGGTGTATCTTAATGATGAGATTTGCATTTGCTTTTAAAGATGCTGAAGGAGATGTGTTTGTAAGCTGTAACTGTTGAAAGCAAAACATACTCATGCTTAAATTTCAGCATTTTAATGGAATCATATTTGACAGACATGGATATTCGTTTTTGTATCCTCCGTTTCTTCTATGTTATTTTTGCTGCCTTTCTCATCAAATATGACCAGGTTAGATTCAATCTATCATTCATCTGGATATCTCTGGGTCCTCATACTGGAGTTCTGTCATGAATATATCCATAGCTCTTAAGTACTCTTCATTCCATACGAGCATCTGCTGCCCTTTGCAGCAGCCTTATAAATATTATTCATGTTTTTATTTAGGAAAGTTTACGGTTCTTATTCTTTTAGGTTGCTGATAATTTGCTTCACGAACCCACCAGCAATTTGGAAACTTTGATCTTTTGCTCTCAAACACTTAGAAGCAAGGTATCTTTCTTTGATCTGTCATTTTTAATTATGGAATATTGGTTCTTTGAAGTTATCTATTTATGAGTTCCTCAGTAATTAAATAAGGTTCATTCAAGCGTATCATAGTTGATCGTTTTCTGAGTTCTAGTCCACTATTTATCTAAACTAGGTACAGAGAGATTTTGAAGAACTGCCTTCTGAAGCTTTTCGACCCTTGCGTGACTCATTAAATGTAAGAATTTCGGTTTAAGTAGCTAAGCTCTTAATGAGCATCATTACAACTGTGCAAAATATGTGTGATGCCCTAATATTTTTCAACCTGGTAATGCCTGGTTGCTTTTTTCTGTTTCAAGGTGTGGCTTTGCTTTATGTTAGATATGGAATTTTTTAACTCCTAATGAACATCTGATCATACATCTACTTGAATCACACAGATTTTCAATGACACGAAATAATTTTGTGACTTCTAATTTCATGCTCAATTCATATTAGCCATGGACTTTTAAAACTATTCTTTACAGTACTTCCACTTAATTTGCAAGTGATGGAACTTGCACGACGCATATGTTATATGTAAGTCCCTAACGGTTACATGAATGTTTCTCAAATTTAGATTAGAGTGCTCATTAGTGGAGTGGTAAAGGATCTAAGCTGTGCCTTACAACTCAAGGACACAGTTGTACAACCTATAGAACACATCCTGTTCAAGTAAGGTCGTGATCTAAGTTGTGCCTTACAGAGTTTGGTGGCCGTTTCTCTCATAAATTATTATTTTACTATCTTGAAAAAAATTATTTTGGCATATATTTATGTTATTTGGAGGCCGAAGGTACTTAAAAATGATGTACAAGAAAGTCAGTATCAGATATTGTAGACATATAGAGAAAAACTCACTTATCATTACAATTTTAGACAGGTGTATGTGGCAATCAAGCCAATGTTGATTTTGATAACCATCTTTTGACATCAATCTGGCTTTTTTCCCCTCTCTCTTTCCCTACTGGTTAAGGGACATACTTAGTTCCACTTGGATGTAAGGACTTCGATTCGGTTAAACGGAGTTAGGTCTTAATAATTTTATTTTTTTGCTGTTCAATTATACTTATACGTTGTGAAAGGGGCTATTCTTTGCTGTTGCTTCATAAAACATCAGTTTCTTACCGTGCTTTATGGCAGCTAAAAGTTTTTTCCCAGGGAGAATGACCTTCACTTTTAAATTATGAAATTGATTGTTATAAAAACCCTAGCTTAGTACCGTTAAAATTCATTGTGGGAGATTTGGGTTGAGAGAAATGGAGTTTTCCCAGAATAAGTAGGAATTTTTGGGAAATTTGTGACATTATTATTTGTATGGTTTCTCTGTGGAGTGCTCTTGTAATTCTTTGACGTGGATTTGGGAGGATGCCTCATCCTTTCATTTTTGCAATTCTATCTATTAGTAAAATTCGTTTCTTAGAAATAACAAAGTTAGTAATGTAATACCCTTTTTTTTGGGTGTGGATCTGCAGAAATAGTAACCTTTTCACGTTAAAGGTCAAATGGGATTAAAGTTTTCTTCTAGCTTTTTGTTTAAAACATATAATCTGACCTATTATATTTGTGGTCAATTAATCTTTATGTGCAGAATTTATTAAGAAAATTTCACAAGGGCCCACCTAAAGTCCGAACTCAGGTATTTTCGTTCTGAAAGTTCACAAGATTATTGAATGCTTTTTCCCACTGATTGGAAGGAAAGATTCAGGTTAAATTTGGTTTTATAGATTAGCATAGCGGTGGCTGCATTAGCAGTACATGTTCCTGCTGATGATTGGGGCGAAGGTGGTATTGTCAATTGGCTCAGGAATGAGATGAACTCACATCCAGAGTATGTACCGGGATTTTTGGAGCTATTGACAGTTTTGCCTGAGGTATGAACTTGTGATATCTTTTTTTTATATTTGGAAGAAGTACTTCTAAATCTTATCCTCAAAACGACCAACATTAGAAATATATATTTTCTACATGAAAGTTGAATGCTACATTAACTATATTTCACCATGCTGAAAGAAAATGCATTTTCAATTTTTGTGTCTTGAAATTTTAACATATTTTTATTGAAATGTCCACTGAAGTATACAACTTGGCTGGATTATTGCATAATTATCCAATAGGGGCAGGCGATTACATGAATTATGATAGCTAATTGAATGAAATGCCTGATCCTTTGATTGTATCAAAATTTTCTATTAGATGTCACGTATAAGTAGCAGGCCATCAATTTCATAAAGTATGGACTTATCCAAAGAAAATTTCATAGAGAGTATGGTGAATTAAAACCTTAAATTTTTATTGACTAGTGGTTTTAGATTATGTGATTGCTATGACACATATGGTTTCATATGCTAGAATATTGTGAGAAAATTTCAGCTAATAGGGCATCGGCTGGAATATCTAATATCTTTCTCTGAAGAAACATTGAAGTGTTGAAGGGCTTTTAGGTACTTTTATGTGTGTATATCATAATTCCCAAAATGGTCAGTTATTTTTTGTTTCGTGGCATGTTTCCATGTTTCTTTGGCACCCCTCAATCAGGAAGTATACAATTACAAGATTGCAGCTCGCCCAGATAGACGCCGTCAATTTGAAAAGGAACTCACATCCCAAATGGAAGTTACCCTTAATATCTTGACAGCTTGTTTGAATATTAATGAGCTGAAGGAGCAGGTGGGACTTTTTTAATCATAAGAATTGCGTCCTATATCTGAAGTTTGGTCATTATGTCTTCCTACTCAAACAGAAGTTCCTCGATTTTTTATTCGCTTGGGTTTTATGGATGTTTCAGGTGCTCGAGGCATTTGCTTCTTGGCTTCGATTAAAGCATGGGTATGCCTGTTCTTCACGTCACTGTTTCTACACAATATATTAGATAGCACAAAAGATAGTTAGGAATGAAGTTCACTTTTTTAAATGTGTATGTGGTGCTGATGTACACGTGGGTATGTGAATTTGAAGTACGACTTGGGTATATTT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MVEPLTKSQMADRTAEILPSTPRLIEPKGPCSGTQSPSSLLSRAPQGAPKKKRKNQSLCVKNEQGREKKREQSKTKHKQRDGLTGKVFAEARAAVSTAFWVKHGASEYSERSPKRTVPSPRRCLSYAGRSMASRLPAYSRCLAGSYLGIFSSVDPLTFTSKGCILMMRFAFAFKDAEGDVFVADNLLHEPTSNLETLIFCSQTLRSKVQRDFEELPSEAFRPLRDSLNIRVLISGVVKDLSCALQLKDTVVQPIEHILFKNSNLFTLKNLLRKFHKGPPKVRTQISIAVAALAVHVPADDWGEGGIVNWLRNEMNSHPEYVPGFLELLTVLPEEVYNYKIAARPDRRRQFEKELTSQMEVTLNILTACLNINELKEQVLEAFASWLRLKHGIPGSVLASHPLVLTALASLNSELLSEASVNVISELIHYSAAGSSSGLPVHMPLIQVIVPQVMNLKAQLRDSSKDEEDVKAIARLFADMGDSYVELIATGSDESMIIVHALLEVTSHPEYDIASMTFNFWHSLQLNLTKRDAYTSFGNDASIEAERKRRLQIFCPVYESLVSLVSFRVQYPNDYQDLSYEDLKEFKQTRYGSDLLSFKVVTEQNEMFVSYPAVADVLIDAALVLGGDMTLKILYMRLMEAVTSCGNSEQTEWRPAEAALFCIRAISNYVSVAEAEIMPQVMGLLPKLPQQAQLLQTVCYTVGAYSKWLDASSSGQSILPSVIDILMSGMGTSEDSAAAAALAFRHICADCRRKLCGFLDGLFHIYNMTVNGESSLKVTAEDSLHLVEALSMVITELVPDQAKRALEALCLPVVAPLQEIVNQGLEVLNKKPSNELTVHIDRFAYIFRYVNHPEAVADAIQRLWPIFKAIFDIRAWDMRTMESLCRACKYAVRTSGRFMGITIGAMLEEIQGLYKQHHQPCFLYLSSEVIKIFGSDPSCASYLQSLIEALFMHTTRLLTNIQEFTARPDIADDCFLLASRCIRYCPQLFIPSSVFPELIDCSMVGITVQHREASNSILTFLADVFDLANSSKSEQYISRRDAIVIPRGHVILRILIAALTGALPSSRLEPVTYTLLALTRAYRAQALEWAKESVSLIPSTAVTEKERSRFLKALSDAASGCDINTLAVPIEELSDVCRRNRNVQEIVQGALRPLELNLLPVS Homology
BLAST of Spg021955 vs. NCBI nr
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BLAST of Spg021955 vs. NCBI nr
Match: XP_022134835.1 (transportin MOS14 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1723.4 bits (4462), Expect = 0.0e+00 Identity = 894/980 (91.22%), Postives = 910/980 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. NCBI nr
Match: XP_008453154.1 (PREDICTED: transportin-3 [Cucumis melo] >TYJ98595.1 transportin-3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1721.8 bits (4458), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/980 (91.43%), Postives = 910/980 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. NCBI nr
Match: XP_038879244.1 (transportin MOS14 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1720.7 bits (4455), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/980 (91.43%), Postives = 908/980 (92.65%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. NCBI nr
Match: KAA0057907.1 (transportin-3 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1719.9 bits (4453), Expect = 0.0e+00 Identity = 895/980 (91.33%), Postives = 909/980 (92.76%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8GUL2 (Transportin MOS14 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=MOS14 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1314.7 bits (3401), Expect = 0.0e+00 Identity = 687/982 (69.96%), Postives = 782/982 (79.63%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6P2B1 (Transportin-3 OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tnpo3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 235.3 bits (599), Expect = 3.4e-60 Identity = 236/973 (24.25%), Postives = 420/973 (43.17%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9Y5L0 (Transportin-3 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TNPO3 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 233.4 bits (594), Expect = 1.3e-59 Identity = 236/973 (24.25%), Postives = 418/973 (42.96%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9USZ2 (Uncharacterized protein C11G11.07 OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=SPBC11G11.07 PE=4 SV=2) HSP 1 Score: 183.3 bits (464), Expect = 1.5e-44 Identity = 213/995 (21.41%), Postives = 415/995 (41.71%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q99189 (mRNA transport regulator MTR10 OS=Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c) OX=559292 GN=MTR10 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 94.0 bits (232), Expect = 1.2e-17 Identity = 198/966 (20.50%), Postives = 388/966 (40.17%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I4B6 (transportin MOS14-like OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111470834 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1747.6 bits (4525), Expect = 0.0e+00 Identity = 950/1163 (81.69%), Postives = 989/1163 (85.04%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BZF9 (transportin MOS14 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111007010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1723.4 bits (4462), Expect = 0.0e+00 Identity = 894/980 (91.22%), Postives = 910/980 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BJN7 (Transportin-3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold350G002160 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1721.8 bits (4458), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/980 (91.43%), Postives = 910/980 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3BVJ5 (transportin-3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103493952 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1721.8 bits (4458), Expect = 0.0e+00 Identity = 896/980 (91.43%), Postives = 910/980 (92.86%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UT68 (Transportin-3 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold274G002080 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1719.9 bits (4453), Expect = 0.0e+00 Identity = 895/980 (91.33%), Postives = 909/980 (92.76%), Query Frame = 0
BLAST of Spg021955 vs. TAIR 10
Match: AT5G62600.1 (ARM repeat superfamily protein ) HSP 1 Score: 1314.7 bits (3401), Expect = 0.0e+00 Identity = 687/982 (69.96%), Postives = 782/982 (79.63%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Sponge gourd (cylindrica) v1
Date Performed: 2022-08-01
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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