Spg008218 (gene) Sponge gourd (cylindrica) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGAAGTCACAAGTTGTTGCATCCAAAACAGGTACTTTTGTATTTGGAGGGAAGGTAGTATGTATTTTGTTGAAGATTCGTGCAAGAAGCAGTTGATTCCATTGTCCATTTCCTTCCTTCAATGGTTTGAAAATGTTTTAGTTGAGTTATTGCAGAACCCAGTTTCTTCTTTTTTCCATCTGAAAATTAAGGAGGAATTTGGAGTTATTAGATTGATTAAGTTCTATTCAAAGAATGAATGGTTTTTTGAATGTTCTGTTTGGCCTTCCACGGGTGGCAGAAGGATTATACAAGTTCCAGCCGGTTGGAACAAGAAGGGCTGGTACGTTTTTTGGGAAATGATTAGTGATTTTATTCTAAAGATTCTTCCTTCTGAAAATCAGCAAATTCCGCCATTGTCAAAAAATTTGAAGGGTTATCTGGTTTTGGATGATGAATCAGTAGAAAATGCCTCTTCATATTCATATGCCGATGTGGTCAAGCTAGGTGTCTCTAGTAAGAATTCCATTTCTTTGGATGGTTCAGCCAAAAATGCTAAGTTCTTTAATGAAAATTCTTTTTGGGTTCGAAAGAATTGGGATGTGCTGAATATAGATTTGGAAAACTCACTTGTTGTCTCTCGATTGATGGCCCATTACTCTTGGAGGGATGTTAAGATGGTCCTTGAGGATTATTTTCTTACTTCAATCTCGATCAACCCTTTTATGGACGATAAAGCCTTGATTCAGGTGGCTGTTGGTTTCTCGGATTTTTCTTTGGATGGTAAGTCGTAAGTGGAACATATATGAGAACCTTCATTTGAAACTGGAACTTTGGTCTCCTGAGAATCACTCCCAACCGAAATTTATGAAAAGCTATGGAGGATGGATTGCAATCAGGAATTTACCTTTAAATTTGTGGAGTCGTGCATCCTTTGAAGCTATTGGAAAGAATCTTGGAGGGCTGGTTAGTATTTCTTCTAAAACTCTTAATTTATTAGACTGTTCTGAAGCCTTCATTGAAATAGAAAAAAATTGTTGTGGCTTTATTCCTGCTGATATCAATGTAAAGATTGGTAATAAGCTCGAATTCCGCACTAGAGGCTAGGAATTCAAAGTTTGATTCAAGTGAAAAGTTATCAGCCAATGACTTTTCAAATTCCCTGAATTTAATAAGAGTCAAGGAAGTTGTGTTGGATGAAGATCTGTCTATTTTTAATGAGGGAGAGAGGGAGGCTGAATTGCCATTAAATCTGGAGAAATTTAATGAGGCTTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCATCTTTGCATGATGAGAGCATTAATAACGCTGGCTGTAAAGACTTTTCAAATTCCCTGGATTTAATAAGGGTCAAGCAAGTTGTGTTGGATGAAGAATTGACTATTTTTAATGAAGGAGAGAGGAAGGCTGAATTGCCATTAAATCAGGAGGTATTAATTGAGGCTTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCATCTTTGCATGTTGAGTGCATTAATAATGCTGGCTGTAAAGATTTTAATGCTAGCATTCAAGAGTCGGTTTCCATTCTCTCTCCTTCTAAAGATTTTAATGTTATTAATGTTTCCAGCCCTAAGGAAGTCCAGCAGCCTCAGTTCTTTGAACCTCCCTCCAAGAAGAATAATATCATTGATTGCAATTTAAAAGGTGATAATCAGCAGGTAATCTTAAAGACTTATTCTCGGAAAAAGGCTTCTTTATCATTGGCTGTTAAGTCCAATATCAATGTTGATCATTTGGAATCCGAATGTACTCAATTGATTGCTTCAAATAAGGTTTTGGGATCTTCAAATAACAGTGGAGGGAAGTCCAAGGATTTTATTGAATCGACCATTCAACTTCCAGGAGTAAAGGATTCTTTTGTTAGAGGTATTGCTTGTTCTTCTAACACAAAAGAGTATTCTTCCTTGGATTCAGATGATGAGTCATTGGTTAGTGTAAGCAGTGAGGATTCAGATTATTTGCATACTGAAGCAGATTGTGGGGAGCATTTTCAAGAAGATCAACTTGGTGAGTCTTTGATTTCCCTTTATTCAAAGAATGTTGATTGTTTAAGCAATCAGGATTCAATAGTACATGAATCTTTCTTGTCTCCTTCTCAAATTCCTAATCAATTCTCTTCAATAGTTGAAATTTGTGGATTTCAATTGCAAAAGATTTCTCCTCGGTCTCCTAAAGTTTTAGCTTGATTCTTTCTCAAATTAGTTATGAAGATTGTTTTGTGGGATACTTGGGGTCTCGGTGATTCTGAAGTAATACCTTCAAATATTTGTTCTGATTTAGTCTTAATTCAAAAATCCAAATGGTCGAAAATTGATATGAAATTCATTAAATTTGCATGGAGTTCAAGGTCTTTTGTGGAAACTTATGGAAATTCAGGATGGCTTCTTATTTTGTGGGTTGAGAGTAAACTTTCAGTGCTGGAATTCATAAAGGGAGGTTATTACAATTAAATGCATAACACTTCGTAAGAATATATGCTAGGTATCTAATGTGTATGGTCCAAATGATTTCAAGGAAAGGAGATTTCTATGGCCAGAATTCTTTTTCTATCTTATTTTTGCGCTGATCCAATGATGTATTGGTGGAGACTTCTATGGAAGCAAGTAGAGAGATTGGCTATATTCAAGTTAGGAAATGACTCTAAAAAATGATCATTGGGATGGTGCAACCTTTTTATGGTATATCTCTTTCCGTCAGCTTCTTAAGGAGGAAGAAATTATTGATTTCCAGCCGCTATTGGAGAGCTTAATTGGTTATATAGTGTCCGAAATTTCAGTCTTCTGCATTTGGTCCCTTGAGACATCGGTGTTGGGGAAAGATTTTGTCATCTTTCAAGCTTCAGTGGGTTCTTGATCAGTCATTCATAGGAATCGTGCTGCAGTTATTAATTGGTCCATCCCTTAAGCTTGCTTCTAAGTTGTTGTGGTCGAATGTAGTAAAAGCGGTATTTTCGGAGTTTCGGGTATTTTTGGAGATTTGGTTTGAAAGGAATAAGAGGGTTTTCCATGTTATATCTCTCCTTTGGAAGGATCGTTTCGATGATGCTCGTCTCAAAACTTCGTCTTGGTGTTCATTGTCCAAGCTCTTTTCAAGCTATTCTATTCAAGATATTTGCCTTAATTGGGATGCTTTTATTCTTCTATCTTAA ATGGAAGTCACAAGTTGTTGCATCCAAAACAGGTACTTTTGTATTTGGAGGGAAGGTAGTATGTATTTTGTTGAAGATTCGTGCAAGAAGCAGTTGATTCCATTGTCCATTTCCTTCCTTCAATGGTTTGAAAATGTTTTAGTTGAGTTATTGCAGAACCCAGTTTCTTCTTTTTTCCATCTGAAAATTAAGGAGGAATTTGGAGTTATTAGATTGATTAAGTTCTATTCAAAGAATGAATGGTTTTTTGAATGTTCTGTTTGGCCTTCCACGGGTGGCAGAAGGATTATACAAGTTCCAGCCGGTTGGAACAAGAAGGGCTGGTACGTTTTTTGGGAAATGATTAGTGATTTTATTCTAAAGATTCTTCCTTCTGAAAATCAGCAAATTCCGCCATTGTCAAAAAATTTGAAGGGTTATCTGGTTTTGGATGATGAATCAGTAGAAAATGCCTCTTCATATTCATATGCCGATGTGGTCAAGCTAGGTGTCTCTAGTAAGAATTCCATTTCTTTGGATGGTTCAGCCAAAAATGCTAAGTTCTTTAATGAAAATTCTTTTTGGGTTCGAAAGAATTGGGATGTGCTGAATATAGATTTGGAAAACTCACTTGTTGTCTCTCGATTGATGGCCCATTACTCTTGGAGGGATGTTAAGATGGTCCTTGAGGATTATTTTCTTACTTCAATCTCGATCAACCCTTTTATGGACGATAAAGCCTTGATTCAGGTGGCTGTTGGTTTCTCGGATTTTTCTTTGGATGGTAAGTCATTGGTAATAAGCTCGAATTCCGCACTAGAGGCTAGGAATTCAAAGTTTGATTCAAGTGAAAAGTTATCAGCCAATGACTTTTCAAATTCCCTGAATTTAATAAGAGTCAAGGAAGTTGTGTTGGATGAAGATCTGTCTATTTTTAATGAGGGAGAGAGGGAGGCTGAATTGCCATTAAATCTGGAGAAATTTAATGAGGCTTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCATCTTTGCATGATGAGAGCATTAATAACGCTGGCTGTAAAGACTTTTCAAATTCCCTGGATTTAATAAGGGTCAAGCAAGTTGTGTTGGATGAAGAATTGACTATTTTTAATGAAGGAGAGAGGAAGGCTGAATTGCCATTAAATCAGGAGGTATTAATTGAGGCTTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCATCTTTGCATGTTGAGTGCATTAATAATGCTGGCTGTAAAGATTTTAATGCTAGCATTCAAGAGTCGGTTTCCATTCTCTCTCCTTCTAAAGATTTTAATGTTATTAATGTTTCCAGCCCTAAGGAAGTCCAGCAGCCTCAGTTCTTTGAACCTCCCTCCAAGAAGAATAATATCATTGATTGCAATTTAAAAGGTGATAATCAGCAGGTAATCTTAAAGACTTATTCTCGGAAAAAGGCTTCTTTATCATTGGCTGTTAAGTCCAATATCAATGTTGATCATTTGGAATCCGAATGTACTCAATTGATTGCTTCAAATAAGGTTTTGGGATCTTCAAATAACAGTGGAGGGAAGTCCAAGGATTTTATTGAATCGACCATTCAACTTCCAGGAGTAAAGGATTCTTTTGTTAGAGGTATTGCTTGTTCTTCTAACACAAAAGAGTATTCTTCCTTGGATTCAGATGATGAGTCATTGGTTAGTGTAAGCAGTGAGGATTCAGATTATTTGCATACTGAAGCAGATTGTGGGGAGCATTTTCAAGAAGATCAACTTGTTATGAAGATTGTTTTGTGGGATACTTGGGGTCTCGGTGATTCTGAATGTCCGAAATTTCAGTCTTCTGCATTTGGTCCCTTGAGACATCGGTGTTGGGGAAAGATTTTGTCATCTTTCAAGCTTCAGTGGGTTCTTGATCAGTCATTCATAGGAATCGTGCTGCAGTTATTAATTGGTCCATCCCTTAAGCTTGCTTCTAAGTTGTTGTGGTCGAATGTAGTAAAAGCGGTATTTTCGGAGTTTCGGGTATTTTTGGAGATTTGGTTTGAAAGGAATAAGAGGGTTTTCCATGTTATATCTCTCCTTTGGAAGGATCGTTTCGATGATGCTCGTCTCAAAACTTCGTCTTGGTGTTCATTGTCCAAGCTCTTTTCAAGCTATTCTATTCAAGATATTTGCCTTAATTGGGATGCTTTTATTCTTCTATCTTAA ATGGAAGTCACAAGTTGTTGCATCCAAAACAGGTACTTTTGTATTTGGAGGGAAGGTAGTATGTATTTTGTTGAAGATTCGTGCAAGAAGCAGTTGATTCCATTGTCCATTTCCTTCCTTCAATGGTTTGAAAATGTTTTAGTTGAGTTATTGCAGAACCCAGTTTCTTCTTTTTTCCATCTGAAAATTAAGGAGGAATTTGGAGTTATTAGATTGATTAAGTTCTATTCAAAGAATGAATGGTTTTTTGAATGTTCTGTTTGGCCTTCCACGGGTGGCAGAAGGATTATACAAGTTCCAGCCGGTTGGAACAAGAAGGGCTGGTACGTTTTTTGGGAAATGATTAGTGATTTTATTCTAAAGATTCTTCCTTCTGAAAATCAGCAAATTCCGCCATTGTCAAAAAATTTGAAGGGTTATCTGGTTTTGGATGATGAATCAGTAGAAAATGCCTCTTCATATTCATATGCCGATGTGGTCAAGCTAGGTGTCTCTAGTAAGAATTCCATTTCTTTGGATGGTTCAGCCAAAAATGCTAAGTTCTTTAATGAAAATTCTTTTTGGGTTCGAAAGAATTGGGATGTGCTGAATATAGATTTGGAAAACTCACTTGTTGTCTCTCGATTGATGGCCCATTACTCTTGGAGGGATGTTAAGATGGTCCTTGAGGATTATTTTCTTACTTCAATCTCGATCAACCCTTTTATGGACGATAAAGCCTTGATTCAGGTGGCTGTTGGTTTCTCGGATTTTTCTTTGGATGGTAAGTCATTGGTAATAAGCTCGAATTCCGCACTAGAGGCTAGGAATTCAAAGTTTGATTCAAGTGAAAAGTTATCAGCCAATGACTTTTCAAATTCCCTGAATTTAATAAGAGTCAAGGAAGTTGTGTTGGATGAAGATCTGTCTATTTTTAATGAGGGAGAGAGGGAGGCTGAATTGCCATTAAATCTGGAGAAATTTAATGAGGCTTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCATCTTTGCATGATGAGAGCATTAATAACGCTGGCTGTAAAGACTTTTCAAATTCCCTGGATTTAATAAGGGTCAAGCAAGTTGTGTTGGATGAAGAATTGACTATTTTTAATGAAGGAGAGAGGAAGGCTGAATTGCCATTAAATCAGGAGGTATTAATTGAGGCTTTGGGTTCTCCAAAAGGTGCATCTTTGCATGTTGAGTGCATTAATAATGCTGGCTGTAAAGATTTTAATGCTAGCATTCAAGAGTCGGTTTCCATTCTCTCTCCTTCTAAAGATTTTAATGTTATTAATGTTTCCAGCCCTAAGGAAGTCCAGCAGCCTCAGTTCTTTGAACCTCCCTCCAAGAAGAATAATATCATTGATTGCAATTTAAAAGGTGATAATCAGCAGGTAATCTTAAAGACTTATTCTCGGAAAAAGGCTTCTTTATCATTGGCTGTTAAGTCCAATATCAATGTTGATCATTTGGAATCCGAATGTACTCAATTGATTGCTTCAAATAAGGTTTTGGGATCTTCAAATAACAGTGGAGGGAAGTCCAAGGATTTTATTGAATCGACCATTCAACTTCCAGGAGTAAAGGATTCTTTTGTTAGAGGTATTGCTTGTTCTTCTAACACAAAAGAGTATTCTTCCTTGGATTCAGATGATGAGTCATTGGTTAGTGTAAGCAGTGAGGATTCAGATTATTTGCATACTGAAGCAGATTGTGGGGAGCATTTTCAAGAAGATCAACTTGTTATGAAGATTGTTTTGTGGGATACTTGGGGTCTCGGTGATTCTGAATGTCCGAAATTTCAGTCTTCTGCATTTGGTCCCTTGAGACATCGGTGTTGGGGAAAGATTTTGTCATCTTTCAAGCTTCAGTGGGTTCTTGATCAGTCATTCATAGGAATCGTGCTGCAGTTATTAATTGGTCCATCCCTTAAGCTTGCTTCTAAGTTGTTGTGGTCGAATGTAGTAAAAGCGGTATTTTCGGAGTTTCGGGTATTTTTGGAGATTTGGTTTGAAAGGAATAAGAGGGTTTTCCATGTTATATCTCTCCTTTGGAAGGATCGTTTCGATGATGCTCGTCTCAAAACTTCGTCTTGGTGTTCATTGTCCAAGCTCTTTTCAAGCTATTCTATTCAAGATATTTGCCTTAATTGGGATGCTTTTATTCTTCTATCTTAA MEVTSCCIQNRYFCIWREGSMYFVEDSCKKQLIPLSISFLQWFENVLVELLQNPVSSFFHLKIKEEFGVIRLIKFYSKNEWFFECSVWPSTGGRRIIQVPAGWNKKGWYVFWEMISDFILKILPSENQQIPPLSKNLKGYLVLDDESVENASSYSYADVVKLGVSSKNSISLDGSAKNAKFFNENSFWVRKNWDVLNIDLENSLVVSRLMAHYSWRDVKMVLEDYFLTSISINPFMDDKALIQVAVGFSDFSLDGKSLVISSNSALEARNSKFDSSEKLSANDFSNSLNLIRVKEVVLDEDLSIFNEGEREAELPLNLEKFNEALGSPKGASLHDESINNAGCKDFSNSLDLIRVKQVVLDEELTIFNEGERKAELPLNQEVLIEALGSPKGASLHVECINNAGCKDFNASIQESVSILSPSKDFNVINVSSPKEVQQPQFFEPPSKKNNIIDCNLKGDNQQVILKTYSRKKASLSLAVKSNINVDHLESECTQLIASNKVLGSSNNSGGKSKDFIESTIQLPGVKDSFVRGIACSSNTKEYSSLDSDDESLVSVSSEDSDYLHTEADCGEHFQEDQLVMKIVLWDTWGLGDSECPKFQSSAFGPLRHRCWGKILSSFKLQWVLDQSFIGIVLQLLIGPSLKLASKLLWSNVVKAVFSEFRVFLEIWFERNKRVFHVISLLWKDRFDDARLKTSSWCSLSKLFSSYSIQDICLNWDAFILLS Homology
BLAST of Spg008218 vs. NCBI nr
Match: KAA0062564.1 (GPI-anchor transamidase isoform X1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 100.5 bits (249), Expect = 6.2e-17 Identity = 48/115 (41.74%), Postives = 69/115 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. NCBI nr
Match: XP_038903695.1 (uncharacterized protein LOC120090219 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 93.2 bits (230), Expect = 9.8e-15 Identity = 48/115 (41.74%), Postives = 67/115 (58.26%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. NCBI nr
Match: TYK21876.1 (hypothetical protein E5676_scaffold494G00090 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 3.2e-13 Identity = 45/109 (41.28%), Postives = 63/109 (57.80%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. NCBI nr
Match: KAA0035739.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold403G00100 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 7.1e-13 Identity = 45/107 (42.06%), Postives = 62/107 (57.94%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. NCBI nr
Match: KAA0036035.1 (putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X2 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 1.0e-11 Identity = 41/122 (33.61%), Postives = 66/122 (54.10%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7V5N8 (GPI-anchor transamidase isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold79G00520 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 100.5 bits (249), Expect = 3.0e-17 Identity = 48/115 (41.74%), Postives = 69/115 (60.00%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DE60 (zf-RVT domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold494G00090 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 88.2 bits (217), Expect = 1.5e-13 Identity = 45/109 (41.28%), Postives = 63/109 (57.80%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T2Y0 (zf-RVT domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold403G00100 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 87.0 bits (214), Expect = 3.4e-13 Identity = 45/107 (42.06%), Postives = 62/107 (57.94%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3BIE8 (Putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold248G00250 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 4.9e-12 Identity = 41/122 (33.61%), Postives = 66/122 (54.10%), Query Frame = 0
BLAST of Spg008218 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T3H6 (Putative 3,4-dihydroxy-2-butanone kinase isoform X2 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold112G00260 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 83.2 bits (204), Expect = 4.9e-12 Identity = 41/122 (33.61%), Postives = 66/122 (54.10%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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