Sed0027986 (gene) Chayote v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: five_prime_UTRexonCDSpolypeptidethree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.CTTTTGTGAAAGATGAAGGCCAATCCACTCCCTCAAACTCTCCCTCTCCAATTCCCATTGCCAATCAAGCTCCCTCCAACCACCAGCATCCAATTTCCAGCCTCTCTAACTCCCAAAGCCACAACCATTTCCACATCCAACACCGGCCCGATATCGATCAATCCCGACGTCGTGGATGACACCGTCGCAGCCTTCTGGGACTACCAGTTCCTCTTCGTCTCACAACGAACCGAGACGGAGGATCCTGTCATCCTCCGTCTCGTCGAGGGGGAAATCCCAGAAGACTTCCCCGCCGGTACATACTACTTGGCTGGACCAGGTCTCTTCTCCGACGACCACGGCTCCACAGTCCACCCCCTCGACGGACATGGATACCTCAGAGCCTTCGTCTTTAACGACAACGACATGAAAGAAGCCACTTTCATGGCGAAGTACGTGAAGACGGAGGCGAAAATCGAGGAGCACGACTTAGAAACCGACACGTGGAGGTTCACTCACCGGGGCCCGTTCTCGGTGTTGAAGGGAGGCCGGAAGTTGGGGAATACTAAGGTGATGAAGAATGTTGCTAATACCAGCGTGCTGCGGTGGGGCCGCCGCCTTCTGTGCCTCTGGGAGGGCGGCGACCCGCACGAGATTTCGCCGGACACGTTGGATACTGTTGGGAAGTTTTGTGTAGTTGACGGTGGCTGTGGTGGTGATTCACCGGCCGGCGGCAGAGTTCACGGTGGTGGGTTTTGGCGTTTTGCTGCGGAGCTTTTGAAGCCTATACTCTACGGTTGGTATTTTGTGATGTTACTCATTTTTCATATTAATATATTCGTTAATTAATTTTTTTTTTTTTACATATGAGAGTGAGTTTCTCTTGGACTTGCTTAATAAGTTAATCTTTTATTAAAATAAAACTAGTACATGCTTCCAATAATAATGTGTCATATATAATAGAAGTATATAAAAAATGTATTAAAAAAATGATGATTTGATTAATAAGAGAGAATGATATATTAAAAACGTACATTATTAGCATGATAAACAATGAAAAGTATGTACTAAATATATTTTAGAAAGTATCCAAATATTACTCTCCTTAGGAGCTATTTAAAGTACCAAAAAAAAAAAAGGATTATTACAATGATGGTTGTTAGTCTACTAAGTATTTGAGGATAGATTATTTGAGTAATTACTATTCTACTCAATCTATAGTTTGAAAGGACCTCAAAATCATTAATTATGGTACGGCCAACTAGTTATTTATGTTCCACTTATCCATCCTCAACCATAAATTCAACACACAATAACACTAACTCATATAATAATTTCTTATCTACAATACAAATAATGATAAATGTTTTTTGATACAACAATATTGGGGGAAAGAAATTCGAACGAACGATAATAACTCATCAACAATGATTAATAACTTTGTCTCTCTTTAGATATGTGACTATCATAAATTGAAACCATAATGTCAAAGATTTGAATACTCTTATTTGACCACTAGATTAATTCATAACAACCATGATGATGATGATATTAGTACAATAACAACCATAATGTCAAAGATTTGAATACTTTTATTAGCCGATACTCGTTTGAGTTCTATGAACTCTGATACCATATTGAATTTTCTAAAACGTATGGTAGAAGATAAATATATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTCAGTCTTATAGTTTATGATATTGTAATCAAACCAACAATTCAATTAAAAATTAATAATATTAACCAAAATATCAAAAGGGTCGTTGGTTGTACGTTGGTTTCATTTACTTAATGATAATTCACTTCGATATCTTTTAGTAAGGAATTTTTTTCAACCCAAATGATAGTTTGTCAATCAATATTCTAATTAGAAATAATTGACTCAATTTCTGAATAGGTTTACTCACTGAAATGTTTGGAGCTCAAATCCCTTATTCTTCTTTTTCTTTATTTTATTTTTTAATTATATTGTTACACTCACTAATTCATCTCCACTCTAACCTTTTTCACACCAACTTAAATAAAAATGGCGATGCCAATGTAAGCAGTTGCTCAACAGTATGTCCAACGACCAGAGATTTTGGGTTCGAGTTCCCCACTCCTAATTGTTATAATCTCAAAAAAATAAAAATGATGATATAATTCATATAACAATTACGTACATTCCAAATTCATATAATAATAACTCATACAATCATTATTTACAACCTAAAGACAATAATAATAACTTACCAACAATCAGAACACATCAAAACTTATCCATCAAACCAAAGTTGAAAAGAAGAATATAATAAAAACTCTGATATTGTTATTGTTTAATAAGGGTTGGCTTTTTATTCCAAATACAAATACGGACGAAAAAGTAGCAATAGTCACATAAAAATAATATGTGTTGGTTTGAATTTAAAAATTGGCAATTTTGGTGGACATGCCATTTGTAAATTAAATAATAATATTAATTAGAATGTGGGTATAATTAACAAATTAATGGGGAATAATGGGCACAGGAGTTTTCAAGATGCCACCAAAGAGAATGTTGTCACATTATAAGCTGGACTCTCAAAGGAATCATCTTTTAATAATGTCATGCAATGCTGAGGATATGCTTCTTCCTTCTAGCAATTTCACATTTTATGGTAATATATCATATTTCTTCTTCCTATATTCATTTTTATTTGCAATAATTTTATTAATATCCTTACATTATACTTGTTAACAAGAACAATAACTCAATGGAATACGCACAATTTTACATAATTGTGAGACGTCCATGACTTAGATGTTATAAATTATACTTCCAACCTTTTACTTGTTTTTTTTTTTATCTGTACCTGTTTAGGTTTACTTATGTTGATATACTATTGAACTTTATATTACTTAGATATCAAAGAATTCTGTAGAAAATTAAATTCTAGAGAGGTGATCTCTAAATAATTCTCATTTTATTAAAATAAATAAACAAATTATATTTTAGCATTTTTTAATTATATCTTTTTCATTAGTGGATTTTGAAATTTACTCATAACAAACATGTGCATGAATACATATGATATTGAATGAGTAGAGGCATGACTTTAGAAGAGTAATCAAGTCACCTAAGAACAAAAGGTCAAATTTTTTTTTTTTTTTTTTAATTTATAAATGCATCATGCCATTACAACTTTATTTTTGTTGGCAAACAAAATGTCAATTAATACTAGAAGTGTTAAAGAAAATATGTTGAATTGAGTTGGATTATCAAGCGTTTAAATAAATGAAATTTTTATTAGTTTTATTCTTTAATTAATAAATAAGTATATTAGCTAGCATAAAATTAATTTTTATTAGTTCATTCTTTGGTACGCATTTTTTTCTATATATGAATCAAAATTGACTTGTCAATCATGTTTGAAAATAAGTATATATTTTGCATATTTACCTCTCATATTGTTTGTTATTTTTTCTTTTTTTAAACAAATGATCTAAACAATTAGATCACACTAACTCAGATGTTACATGTTACATTAATTGAAGTAGGTTCATTATTTAATTAAGGTTATTGATGTTACATGAATTGAGTTGGGTTCGATAATGATGTTACATGAACTGAGTTAGGTTAATTATTTAATTAAGGTTAATGATGGTACATGAATTGGGTTGGGTTCATTAAAGTTGTTGATGTTACATGAATTGAGTTAAATTCATTGTTTAATTAAGGTTATTTTTGGATTGAAGAAGCTGACAAGTTGAACAATTAGGTTAAATTTAAGATCGTGTCTTAATCTAGCCCAACCTAACTCTTTCATGAACACTTAAACTAATCCAATTAATTTATCAGATTAGTCAAATTTTAAAAAAATATTATAAATATGACCACTTAAAAAAAATGGAAATTTGTGTTGAATAGTCTAATTTTACAAAATAATCACAAATCTAGACAATTTTGATCTTTTTTTTGCATCCATATTCAAATATAGGATATAATCAATATTGATCATTCCATATAATTTACGGTATAATTTATATTATTGATACAATATTATATTTTATTAGTACAATATTGTATATTAATATGATATTATGTATTAATTATATCATATAATTTATGTACGGTATGACTATGGTTGCTAAATATTTTTTTTGTCAAGTATTGTAAATATTTTTTCAATTTGACATACTCTTAAAAATACTACCAAAAAAATGTAACAACCATAGTCATTTGTATTAATATTAATACTTTGTTAATAATACATAATATTGTATTAGTAATAAATCATACAATATTAAAAGCTATTAACGATTGTTCCTGCAAATATTTTAAAATTTGACTACATTTTTTTTTTAAAGAAAGAGTGTATTGGATCAATCCAATTTATTATTACATAGTTTAATTGACATCGTAGTACGAAATAATAAAATTAACTAGAACACATATTTAGCCTCTATTCATTAATGTTAATAATTTTTCTGTGTGAACAGAATTTGACAGTAATTTCAAGTTATTACAAAAGCAAGATTTTATAATTGATGATCACTTGATGATCCATGATTGGGCCTTTACGGATACTCATTACATCCTTTTTGCCAACCGAATTAAGCTGGATGTCATTGGTAAGTTTTTGTGGTACTTTGTTCTTATGATTATATGAATGGTATTTACCTTCACTAGTCCATTCTAAAAAATTATATTTACACCATAATTTCAAAAATAATTCATGTATAGTATGTGATCTTTTATCGATGATAAAACTCAATGAAGTATAGAATGCGTCTATCTCTAATTGAATCCTATCGATAATACAATTCAACCAGTAATAAGATTCAATTTGGATTTTCTCCTATAAATGTTTTAGTTTTGATTTTGTACTTTAGATAGAAATATATATATATATATATTTTTTTTATTACACATTCAAATCCGTTTACATACAATTCAAGAAATATAGTTCAAATAAATAGTAACTACCAAATTTAGTTGAGAATTTATCCTCCATAACATATTTTT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MKANPLPQTLPLQFPLPIKLPPTTSIQFPASLTPKATTISTSNTGPISINPDVVDDTVAAFWDYQFLFVSQRTETEDPVILRLVEGEIPEDFPAGTYYLAGPGLFSDDHGSTVHPLDGHGYLRAFVFNDNDMKEATFMAKYVKTEAKIEEHDLETDTWRFTHRGPFSVLKGGRKLGNTKVMKNVANTSVLRWGRRLLCLWEGGDPHEISPDTLDTVGKFCVVDGGCGGDSPAGGRVHGGGFWRFAAELLKPILYGVFKMPPKRMLSHYKLDSQRNHLLIMSCNAEDMLLPSSNFTFYEFDSNFKLLQKQDFIIDDHLMIHDWAFTDTHYILFANRIKLDVIGAMSAVSGINPMISALSVNTSKGTTPVYLLPRFGEDSNRDWRKAIQIPSRLWLLHVGNAFEVAPQDGNLDIQIHASVCSYQWFDFKNLFGYNWQTGKLDPSIMNLNGTKSELLPRLVKVSISLSNKGKCEECSVEPLNQWTKASDFPAINPKFSGLKNNYLYAAASSGTRRALPSFPFDTIVKLDTVTNEVRTWCAGNRRFVGEPIFVCKGDGEDDGYLLVVEYAVSIQRCYLAILDAQRIGEADAVVARLEVPKHLNFPLGFHGFWAAN Homology
BLAST of Sed0027986 vs. NCBI nr
Match: XP_038876141.1 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1039.3 bits (2686), Expect = 1.4e-299 Identity = 499/612 (81.54%), Postives = 544/612 (88.89%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. NCBI nr
Match: XP_022929872.1 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic [Cucurbita moschata] >KAG6575282.1 Carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]) HSP 1 Score: 1026.9 bits (2654), Expect = 6.9e-296 Identity = 494/616 (80.19%), Postives = 541/616 (87.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. NCBI nr
Match: XP_023548386.1 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 1026.5 bits (2653), Expect = 9.1e-296 Identity = 492/616 (79.87%), Postives = 542/616 (87.99%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. NCBI nr
Match: XP_022973887.1 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic [Cucurbita maxima]) HSP 1 Score: 1019.6 bits (2635), Expect = 1.1e-293 Identity = 487/616 (79.06%), Postives = 536/616 (87.01%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. NCBI nr
Match: XP_004140624.1 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic [Cucumis sativus] >KGN46518.1 hypothetical protein Csa_005368 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 1016.9 bits (2628), Expect = 7.2e-293 Identity = 488/615 (79.35%), Postives = 540/615 (87.80%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XJM2 (Carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=CCD7 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 786.9 bits (2031), Expect = 1.6e-226 Identity = 378/615 (61.46%), Postives = 471/615 (76.59%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7XU29 (Carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic OS=Oryza sativa subsp. japonica OX=39947 GN=CCD7 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 681.4 bits (1757), Expect = 9.4e-195 Identity = 327/563 (58.08%), Postives = 413/563 (73.36%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P74334 (Apocarotenoid-15,15'-oxygenase OS=Synechocystis sp. (strain PCC 6803 / Kazusa) OX=1111708 GN=sll1541 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 148.7 bits (374), Expect = 2.2e-34 Identity = 145/535 (27.10%), Postives = 218/535 (40.75%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9LRM7 (9-cis-epoxycarotenoid dioxygenase NCED6, chloroplastic OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=NCED6 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 2.4e-09 Identity = 75/351 (21.37%), Postives = 145/351 (41.31%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: A8Y9I2 (Carotenoid isomerooxygenase OS=Galleria mellonella OX=7137 GN=ninaB PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 9.6e-06 Identity = 64/250 (25.60%), Postives = 108/250 (43.20%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1ENV6 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111436349 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1026.9 bits (2654), Expect = 3.4e-296 Identity = 494/616 (80.19%), Postives = 541/616 (87.82%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1I8R3 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472478 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1019.6 bits (2635), Expect = 5.4e-294 Identity = 487/616 (79.06%), Postives = 536/616 (87.01%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KAN6 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G106700 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 1016.9 bits (2628), Expect = 3.5e-293 Identity = 488/615 (79.35%), Postives = 540/615 (87.80%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: T1UMH0 (Carotenoid cleavage dioxygenase OS=Cucumis melo OX=3656 GN=CCD7 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 1010.4 bits (2611), Expect = 3.3e-291 Identity = 481/613 (78.47%), Postives = 536/613 (87.44%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DS65 (carotenoid cleavage dioxygenase 7, chloroplastic OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111023796 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 980.3 bits (2533), Expect = 3.6e-282 Identity = 476/622 (76.53%), Postives = 531/622 (85.37%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. TAIR 10
Match: AT2G44990.1 (carotenoid cleavage dioxygenase 7 ) HSP 1 Score: 753.4 bits (1944), Expect = 1.4e-217 Identity = 368/615 (59.84%), Postives = 463/615 (75.28%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. TAIR 10
Match: AT3G24220.1 (nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 6 ) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 1.7e-10 Identity = 75/351 (21.37%), Postives = 145/351 (41.31%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. TAIR 10
Match: AT1G78390.1 (nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 9 ) HSP 1 Score: 53.9 bits (128), Expect = 5.2e-07 Identity = 34/118 (28.81%), Postives = 56/118 (47.46%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. TAIR 10
Match: AT1G30100.1 (nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 5 ) HSP 1 Score: 52.4 bits (124), Expect = 1.5e-06 Identity = 38/120 (31.67%), Postives = 56/120 (46.67%), Query Frame = 0
BLAST of Sed0027986 vs. TAIR 10
Match: AT3G14440.1 (nine-cis-epoxycarotenoid dioxygenase 3 ) HSP 1 Score: 49.7 bits (117), Expect = 9.8e-06 Identity = 35/118 (29.66%), Postives = 55/118 (46.61%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Chayote (edule) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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