Pay0022238 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonCDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGCTCCGGCCATCTCCGAGAGAGTCGAGCTCGCCAATTTTTGTCGCTCTAAGGACTGGTCCAAAGCTATTAGAGTCCTCGACTCGCTCATAGCAAAGTCCTGTACCGTTCAGGACATATGGTATTTTATCCATTCTTGCTCACTTCTCTTTGACTCGTTATCTTTTTCGATTTTCGTCAATCTTTTTGAAAGGACAGGCGAGTTGATTCAAGTCTAACTATCGGAATAACGGGTTTGCAGCAATAGAGCATTTTGTTACAGCCAATTGGAGCTTCACAAGCATGTAATTAAGGATTGTGATAGGGCGCTTCAACTGGATCCTTCGATTCTTCAAGCTTATGTGCTCAAAGGTGTCTTTTCAATTAGCTCGCTTCTCTTGTAGTTTTGAGCTGATTCTGATAATTCAATTATTGATGGGATAAAAAGTTGTGGCCGTAGCCTTTAATTTTTACACTTTCGGAACTCACTGGCATGTCGATTTGAGGGCTTTGGATTTTAGTTTTTCATTTCTTTTGTTTAATACTCACAACGGGTGAATGAGAGCAATAGGTGAATTCGAAGAAATTAACAACTAAATGAGGCATGAACTTCCGAATTGGGCACTGCAGCATCCGGTGACAAAAAAATGGTATATGAACGTTGGACCGGGGGTATTGGGGGGTGGGATTCATTATGTTTGTTCGTTTCACAGGTATGGGTTCCCAACGTTCAGCGAAACTATAATTATCTGATGGACCATGTGCTGTTGGTTTGAAATGAACATGTTATCGAACAATAAGAACGTCCATGTAGCAGAATTGCCTACGTAACATATATTTGCAGCTCACCAACGATACCAGATGGAGGGCATTTTTTAAGTATTTTTTGAAATTGTTATTTTGAGTTTTATCTTCAAAACCAGCCGTCGTTTTTGAGTAATTTATTCTGGGGTTAATTGTGATTTTTTGTTTTCTAACTTGTGTTTTTGTTTCTTGTCGAAATATAAATATTTTGAGATTTGTGGACAAATTTGTTGAGATCAGTCTGGAATTCTTGTTGTTTAGGTCATGCATACTTTGCCTTGGGAAAGAGAGGAGACGCTCTTTCTGTTTGGGAGAGAGGTTACCAGTATGCCTTGTGCCAATCTACAGACCTGAAGCAATTGCTAGAACTGGAAGAGCTTATGACAAGAGAAAAACAAGACAAAAACAATGTGGAAAATGGAGAGGTGGAATCTGGATTTTCAACCGTTGGTCTTGAATCAGGAGTTACATCCGTAAGCAAAAACTGTAGGGAAACAAACAATAATGTAGGTAAACTCATGGAACACCCTGATTTCTGCATGAAGCCAAGTGATTCATCTGAAGTTTGCAGCATTTCAAGTGACAATCTTGTAGTATGTGAAGGCGGATGTGAAGAAGTTGGTCCAAACAGAGACATTAAGTGCGAAAGCAATGGGTGTGCTGACAATGACGATACATTAAGTGATGCTTCCAAATTGCATGATTTAAGAAGTGATATGCCTGAGTTTTGTAATAAATCTACATTAACTGCTTTTCATAGCAAATCAAGTGATTCCACTGACATTGTAAGTAAGTCAAGTAAAATGTCAGAGGCCCGAGGTAATGTAAGTGATGAAGCCAGGAGAACCAAGAAATTCTCTGTTGCTAAAGTTTCAAAGACCAAGTCAATAAGTGTAGACTTCCGACTATCAAGAGGCATAGCTGAGGTGTCTACACTATATTTCTAGTTTATATAATGTGTTCTAGAACTTAAAGATAAATATTCTGAAGACTCACATCCTAATCTTTGGCAGGTCAATGAAGGGAAATATGCAAATGCTATTTCTATCTTTGACCAGGTAATTTCTGGTTCTTAGCAAGCGGTTCTCTCTTCTACTTTTTCCATTCGTAGTATGTGAATATATTTATGACAAATGGCTAGGAGAATAAGCCTAAACATCTTGAGAAGGTTAAGGACCATTTTCGTTTTCCACAGATATTGAAGGAAGATCCTAGTTATCCTGAGGCATTAATTGGAAGAGGAACAGCTTATGCATTTCAAAGAGAACTATATGCTGCTATTAGTGATTTTACAAAGGTATGTGAATGATAAGATGTGGAAGGGAAATATGATTTTTCGATTAAAGTTCTGTCAATCTAATCAAATATTAGGCATTAGAATCAAACCCATTTGCTGGTGAGGCATGGAAACGAAGAGGGCAGGCTCGGGCTGCATTAGGGGCATCTGCTGAGGTAAGTTCAGCATAAACTGTTTGAATTTATAAATCTTGGTCAACAATCCTTTTCTTTGATTATTTAAGAATGATCTCATGACCATGATTTCAAGGTTAATGCAATCTTTTCGCTGAAGCTAGTAGCTTGTTTGATTCTTATCATTTGGCTTGCCATGGCAGGAACTAGGATGATAATTTAGGAAATTATATATCTATATAGTTCTGGATTTTTGATATTATTTGTGAAAGTTTCGTTATTATTAGGAGCCACTTCATCTAGGTAATTTATGAATTTGAGAAGTTTGAAAGAAACACATTGGGTCATAGCCTTCCATGAATTTCCAAAGGCCCATTGAAAACCACAATTGGATTCAATTCCATTTGTTTGGAGCCTATATAGGCTAACAATAATGTGATACCACCTGCAAGTATGCACATGGTTCTAAGAGAAAACGCCACTACCATTTGGATAAAAGCATATAGTTCTTGGTAACAGTATTTCGATCCTCATAAACCCCCTTTCCCTCCTTGAATATCATAGAGACACAAACTTTCAGTTGACTGAAGGCCTCAGTTTGGGATTATATGACTAGGGATCTTTTGTAACTGTCATTTAGGTTTTATTTCCTTTTGGATTGGGGGCCCTCCATGTAGTTTGTTCATTTTTTAGCTAATTCTTTTGGTATGTTCTTGTACATGCTTTCATTTCTCTCAGTGAAGCTCTGTCTTATAAAAAAAGTCTTTCTATGAATTTTGCCCTCTAAGATCTCTATTAGTTCAGAAACTTTAAAAAGTGATCCAACATGTAGCCACAACTACGCTATTAATACCAAGAGGATGCTTCATCAAATGAATTGTGTTCCTTGTTCATCCATAACTGTCCTGTTATTTTTATGTGGAAAATTCATGGCCATATACTCTTGCTAATCTTCGGTTGTTTTATTTCAATATTTTAAAAATCAACCTTTTAATTGAAGCAACATCATATTGTAGTTAATGCATGTTCTAGGCACGTATGATATACTTTCTGGTGAAGAAAATTAACCTAAAACTTGCCAAGTGCATTGATATTTCGCAACCTTCAATTGGCTTGTATTGAACCTGAACTTAGATAAGTATTGCAATTTCTACTGTAAACTTAAACAAGTATTGCAATTTTTAACTTTTAATTTACTTCTGTTTAAAAATTATGGAAGTGTATGACTAGTAGGAAGTTAATTGGGATTGAAAAACGATACTCAAGTTGGGACTTAGTTATATGATCTACAGCCGAACTTTTGTTGAAATTTTTCATTGTGGGTTTTGGAAGATTGATTCAATGGTCAATCTGGTTCATTGATTAGACCTATTTTTGTGCCCGGGTTGATTGTTATTGAAATTAGCTAGTGTAAAAACTATTCTGTACTTTTTGTAAAAATTAGTCAATGAATACAGTGGAAGATGAACTGAAGGTAAAAATTGCTACACTTGTCCCAACTTAGGGTTTAATAGGATGAAATTGAAAGTTCAGAGTGGAAATTGATGCACTTGCTAAGTTCAAGGAAAATCAATTCCTTTCCTCTGTATTTATTACAAAGTACGATTGAGCATTAGGATTTAGGAACTTAGGTTCTGTTAGATTGTGTTTCCAAGAATTATCTTCTTCAATTGCTTACATCTTCTGTGTTGCTATATTCTTGACACAAATACATTTGTAATTAATTCCTTCTTGATTTAGGCAATTGAAGATTTAACTAAGGCCTTAGAGCTTGAGCCAAATTCTGCAGATATTTTACATGAAAGGGGTAATCTATCTAATACTTGCTCTTATTACATCATTTTGCCTTTTTAGTTGGTAGCCAAAAAGTTTATTCCCTGTTCTTCAGAGTTTTTATCACTTGAATGTAGGAATTGTTAATTTTAAATTCAAGGACTTCTATGCTGCCGTGGAGGACTTGTCTGAATGCCTGAAACTTGATGGGTGCAATACATCTGCATACACATACTTGGTGAGTCTCATACTTGCCTGATCATATTGGAGTCTAGCATATAATTATTAACCTTCTTCTGGGAGAAATCCTTATAGTCTGGACTATAAGCAGTAAATATGGTTTCCAGGGCTTGTCATTGTCTTCAATTGGTGATTACAAAAGGGCTGAGGAGGCACATTTGAAATCGATTCAATTAGATAGAAATTTTCTTGAGGCATGGGGCCATCTAACTCAGGTACGTACTGATGATCAACTTTCCTGTTTTACATTGGTGGATAGATTTGATCATGCTTACATAATGTTAAAATGGTATACCAGACATTCAGTTAATTAGCTAAGCAAGGTTACCGTGATTAATTTTGAATTATCTTCCTTCACAATCAAGCTTGTGAGTTTCTCTTTTACCAGTAGTAGTAATCTTTGAAGTTAGAACCTTCTACATGTTTTAGGTCGATTGATGGAAATTTTCAATACTTATCTACCAATTCATGACCTGTCAGTTCGGGAAATTTATTTATTTATTTTAATAATAAAAGATCATTTTTAAATTTTATTTTTTACTTAGTGATAGTTTAGCTGGGCTTTCTTTACAGACACGAATTCCTTTAATAATGTGAATTCCATGAAGTTCATTACCTTTGCGGCAATATACACTCATAAGCTAGCTATCAATAAGCCCCCATATGAAACCAAGAAAGTTCAAAATTGTTCACATGGTTCTCCAGTTGTAATGCCTATTCTTTTTGTTTATCGTTGAAGCCTTCTTAAGTGGGTAGCATGTGAATAGTGAATACTAAAGCTGTTTTC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MAPAISERVELANFCRSKDWSKAIRVLDSLIAKSCTVQDICNRAFCYSQLELHKHVIKDCDRALQLDPSILQAYVLKGHAYFALGKRGDALSVWERGYQYALCQSTDLKQLLELEELMTREKQDKNNVENGEVESGFSTVGLESGVTSVSKNCRETNNNVGKLMEHPDFCMKPSDSSEVCSISSDNLVVCEGGCEEVGPNRDIKCESNGCADNDDTLSDASKLHDLRSDMPEFCNKSTLTAFHSKSSDSTDIVSKSSKMSEARGNVSDEARRTKKFSVAKVSKTKSISVDFRLSRGIAEVNEGKYANAISIFDQILKEDPSYPEALIGRGTAYAFQRELYAAISDFTKALESNPFAGEAWKRRGQARAALGASAEAIEDLTKALELEPNSADILHERGIVNFKFKDFYAAVEDLSECLKLDGCNTSAYTYLGLSLSSIGDYKRAEEAHLKSIQLDRNFLEAWGHLTQFYQDLANSTKALECLHQVLQIDSTFGKAYHLRGLLYHGMGEHRKAIKDLSIGLKIENANIECLYLRASCYHAIGEYGLAVKDYDATLELDLDSMEKFVLQCLAFYQKEIALYTASKSNSEFCGFDIDGDIDPLFKEYWCKRLHPKDVCEKVFRQPPIRESLKKGRLRKQEHGMTKQKISLLLAADTTGRKIQYDCPGFLSNRRQHRMAGLAVIDVAQKVSRTWRAMQAEWKCSNKSNTKHGKRARRRERPSIASQNRGGAGCSTSGFSEPSSSSHLEDRLSGHNFISWQDIFSFAVKWRQISEPCDPVVWINKLSEEFNSGFGSHTPMILGQAKVVRYFPNFERTLEVAKTVIKHKSFVYNKSDLMVDLSDDEKLQNIMQAKSCSDLYKVIGEDFWLATWCNSTAFEGKQLEGTRITLVKTGERAFDFAIRTPCTPSRWEEFDAEMTMAWESICNAYCGENYGSMDFSTLETVRDSILRMIYYWYNFMPLSRGSAAVGFVVLLGLLLAANMEFCGNIPRGLQVDWEAMLNFDPNSFVDSVKSWLYPSLKMTTSWKEYPDVASTLKTTGSVVAALSSYDD Homology
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: F4JS25 (Suppressor of RPS4-RLD 1 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=SRFR1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 1313.1 bits (3397), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/1066 (62.38%), Postives = 833/1066 (78.14%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NBP0 (Tetratricopeptide repeat protein 13 OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TTC13 PE=2 SV=3) HSP 1 Score: 288.1 bits (736), Expect = 4.0e-76 Identity = 223/829 (26.90%), Postives = 396/829 (47.77%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q54VG4 (Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein OS=Dictyostelium discoideum OX=44689 GN=sgt PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 1.4e-09 Identity = 38/117 (32.48%), Postives = 67/117 (57.26%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: B0BN85 (Protein SGT1 homolog OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Sugt1 PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 65.5 bits (158), Expect = 4.2e-09 Identity = 38/106 (35.85%), Postives = 59/106 (55.66%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q9CX34 (Protein SGT1 homolog OS=Mus musculus OX=10090 GN=Sugt1 PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 62.4 bits (150), Expect = 3.5e-08 Identity = 33/91 (36.26%), Postives = 52/91 (57.14%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B1I4 (suppressor of RPS4-RLD 1 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103484823 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2107.0 bits (5458), Expect = 0.0e+00 Identity = 1046/1046 (100.00%), Postives = 1046/1046 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0KIG1 (TPR_REGION domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_6G493870 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1956.0 bits (5066), Expect = 0.0e+00 Identity = 977/1048 (93.23%), Postives = 996/1048 (95.04%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3CNB4 (Suppressor of RPS4-RLD 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold255G004340 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1940.6 bits (5026), Expect = 0.0e+00 Identity = 969/987 (98.18%), Postives = 969/987 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1BV54 (suppressor of RPS4-RLD 1 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111005818 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1875.5 bits (4857), Expect = 0.0e+00 Identity = 927/1047 (88.54%), Postives = 981/1047 (93.70%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1HH14 (suppressor of RPS4-RLD 1 isoform X1 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111463399 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1856.3 bits (4807), Expect = 0.0e+00 Identity = 923/1047 (88.16%), Postives = 976/1047 (93.22%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. NCBI nr
Match: XP_008440343.1 (PREDICTED: suppressor of RPS4-RLD 1 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2107.0 bits (5458), Expect = 0.0e+00 Identity = 1046/1046 (100.00%), Postives = 1046/1046 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. NCBI nr
Match: XP_004141990.1 (suppressor of RPS4-RLD 1 [Cucumis sativus] >KAE8647514.1 hypothetical protein Csa_003635 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2046.6 bits (5301), Expect = 0.0e+00 Identity = 1012/1046 (96.75%), Postives = 1026/1046 (98.09%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. NCBI nr
Match: XP_038883616.1 (suppressor of RPS4-RLD 1 [Benincasa hispida]) HSP 1 Score: 1999.9 bits (5180), Expect = 0.0e+00 Identity = 988/1045 (94.55%), Postives = 1013/1045 (96.94%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. NCBI nr
Match: TYK12842.1 (suppressor of RPS4-RLD 1 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1940.6 bits (5026), Expect = 0.0e+00 Identity = 969/987 (98.18%), Postives = 969/987 (98.18%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. NCBI nr
Match: XP_022133144.1 (suppressor of RPS4-RLD 1 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 1875.5 bits (4857), Expect = 0.0e+00 Identity = 927/1047 (88.54%), Postives = 981/1047 (93.70%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. TAIR 10
Match: AT4G37460.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 1313.1 bits (3397), Expect = 0.0e+00 Identity = 665/1066 (62.38%), Postives = 833/1066 (78.14%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. TAIR 10
Match: AT3G11540.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 1.0e-10 Identity = 65/298 (21.81%), Postives = 121/298 (40.60%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. TAIR 10
Match: AT4G08320.1 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.1e-07 Identity = 30/88 (34.09%), Postives = 53/88 (60.23%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. TAIR 10
Match: AT4G08320.2 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 57.0 bits (136), Expect = 1.1e-07 Identity = 30/88 (34.09%), Postives = 53/88 (60.23%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0022238 vs. TAIR 10
Match: AT3G11540.2 (Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein ) HSP 1 Score: 53.5 bits (127), Expect = 1.2e-06 Identity = 43/193 (22.28%), Postives = 82/193 (42.49%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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