Pay0011925 (gene) Melon (Payzawat) v1

Overview


Name	Pay0011925
Type	gene
Organism	Cucumis melo L. var. inodorus cv. Payzawat (Melon (Payzawat) v1)
Description	Unknown protein
Location	chr06: 33939988 .. 33944885 (+)
RNA-Seq Expression	Pay0011925
Synteny	Pay0011925

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidethree_prime_UTR

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGGCATCATTCCCAATTACATCCCCAATAGCTATTAACCATTCCGAAAACAGAACTTCATCACTTACCTCGAGTCCAAGAAGCTCCGTTCCCCGACCTGAACTCTCCAGAATCAACACGCCTAACCTAATTTTAACTATAACTTCCCTCTCCGAACAACAACGGCAAAGTTCAACGATCCTCAATTCTTATCATAGTTCTACAAGTTCAGACCTTCTCGCCGCACCAACGACCGAAGCACGTGGTTGCACCGCCGTAGCTCCGCCGCTCGTTCGAATTAGGTCATGGAACTCTAGCTCGTGATGCACGCTCTTGTACCATTCTTACGATGCAATGCCGAAAGCTCCATAGCCATGCGAATCAACGCCTCAATCCCAATCTCTTGTAGGTTTCCTTTCTTTCTTTCTTTCTTTCTTACTTTCTTGCAACGATCGGGAAAACTGATTATTTTTCTTCGCTATTTTTCTTTCACAGTTTTGTTTGTATTTTAAGTTATTTAAAATTTTAGTTTTCTCCCGGACTCACTTTAAATCGATTTTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTCAATTTCAAAAGTGTGAAAATAAATGGTTATAACATCCATTTTTAGGGAAATTGTAAGAAAGAAAATATTCGACGAAATGTTATAGAAAAATCCAAATGGAATTATTTTTCTTTTAATAATTTTGTTTCATGGTGTAGAAATAGTTTGTCAATTTTTTATTTTAAAAAAATTACATTCTTTTTATTCAATGTGATTTTAATAAATTACATATTAAAAAAATAATGTTTTGATTTGTTTTGAACCTAAGTGTAATATATATATTGGATTGATATATATATATACACATAGTATATTATGGTTCATTTAAAAAAACAAGAGGTTTAAAAATAAACGTTTTAGCCCTAAAAGTTTTAAAAATATTTTAAATAGTCCTTGAATCAACTTTGGTTTAACTAACAAAACGTGACATATTGAATTGACAAAATTTTAACGAGATGGTATTAATAATTTGCTAATTCAATACGTAACTTAGTCAATTAACGACCAAAGTTATAATTAATTGAGGATCATTTATAAGTATTTTTTAATCTTCGAAGACTAAAGCGTTGGTTTTTAAATTTCAACTATCAAATAAACACTAACTTCAAACTTTGATGACTAAAAATATATGCTGGAAAAAGAAATTATATTGACTACGATAAACATGATTTCAAAACTCTTAATTTTCTATCGTTTTTACTCTTTGATATTTTTGCTATTTACTATTCATTATCACATAGTCTACGCACAAAATATATACTATTATAATTCAAATTAAAATTAACATATGGGTCTGTCACAGCTACCCTGAAATTTCGTATAGGATTTGCTCCTCAGAGTTTAAATATATATTTTTTGGAGCGGTTAAAAAACCTCTCTCCTATAAAAAGATAATTCCCTCCAATTTAGTCTAAAAAACTTCCCTCCAATTTACGTCGATCGGTGGGAAAGCTCAACCTCATTCCACCATTTGCCGAAAGCGCTTCGTCTCCTCGATATCTCGTAAGATAATCCCAACCTCTGAAATTTCTTCTACTTTTTCCTTGCTGTGGATCGCTAATCGAAATACTATTCATCTAATCGCAGATCAAACCAATGTCCACACCGATCGCAAGTTGCAATAAGCCTTCTCCTGGTGTAATCGCCTCCCCGGTCGTTGGATTTATCACTTCGGAGCATGATTTCGACATCGAGGTAAGTAAATTTCAGTTTACTAGCTAATAATCGCCCTTAACCCGAATAAATTATTCTGTTATTTGAGTGCGATATCTGTATTTAGCTGGATGAACTCAACGATGGATTTATTTGCGGTTTATATTCTTTAGGATTTCCATCATCTCTTACTGTTTTGTTTGAATCTCTCTGAGACTAGTCGTTTCTGATTTCATCCATATAAGAAAAGACCTGCTCTAATTGAGTTTTGTAGAGAACGAATTTTGGTATTGAATAATCGGAGTTCTCCTTATCCAAATTGACCGTAGGAACAACACAATTAAGCTTCGGTCGTTTTTTGATAATTTCTCATGTATCTACAAGACTCACAATATTAATCGATCGAAGGCCAATGCTACCACACTTGTCTGTTAGATTAACATAGCCATAGGGCATGAAGAACAATTTCATCCCTTTTACAATAGCTAGTACATATAGGTTAGATTATAAGTTTGGTATGTCGACTTTTAGGATTGTTTTAATTTATCTCTCTATTCAATTGTGTGTCTTATGTGTGATTTACATGTTTATCAAGCATCTCGATTAATTTTTGAGATATTTTTTGAAGTTTAAGGATTTGTTATGACAATTTAAGAGCTTATGACTAAGCTTACAATTCAATTCTAACCACACATGGATCATCATCTACAACCTTCTTTTCCCAAAGATGACAACCAGTTGAAATCATGCTTGAGCAAAAGCTCTTCATAATAATTAGGTCGAATCATCGACCTTTAGAATGATAACCGAAGCGATTCTCTTTTGAATTGCGCTTAGTTTGACTGAAGAGCATCAACTTTCATAGGGTAGATGGAGGAACAAGTGAAGAGATGGGGTATCATAAAAGTGAAATGATTGCTTGAGGGTAATTTAAAAGTGAATTTATCAGCTCGAAGCCAATTCTTCATTTCATCAAGAGAATTCTTGTCATAACGTCGAATGAGCCGATCTTCAACAAGGCTCTTTCTACTAGAATATTCTTCATTATTGGTTTGAGCATCGTCTTAGCTACAAAATTCTAGTTTTGATCAGATTCTCATTGACTTTTTGGTTCCAATTAGAAGGCAAGAAAATATGCTATCCAGTGGCAATTTAGGAGGAGAGAATAAACCTGAAAAGTGATCTTCCTGCACCTATCCTTTTACTAAGATATAAATTCTAATACGCCACCTTGTCCTCCTTTGAGCGACATTTTTAACCGGGAATACTTCATGTAAGTGAAAGACTATCCAAATTTTGCATCCAATAAAATACCTTTAGAAAAAAATGGATTTAACAGGGTGTTGGTTTGTATTATAATAGTTCGTGGAAGGTAGGATATAAGATCGGAAGTGAAGGTGAATAGAAACTAATAAACATTATAATAAATATTAAAAACTATAGCAAATAATGATTTGAAATAGTAATATTGTAGTTGGTTGTAGATTATAATAGTTGAAAACATCAACTATTTTAATTGAAAAACTAAACATTGAGTGGACTAAAATAGTTTGCTCGAAAAAAGTCAAGTTGGAAATCAAACACTTTCCTATAGGTTATGGAAAACTAAATGGAAAGGTTTAATTTCCAAGAATCTTCACATGTGCCTAGCCAGTGTAGCATGATTAAATTAATGGAATTCCCTGTGAGTTAATTTTGAGATATTAAGTTCAAGATTTATGGAAAGTACGATAATTAAAATTGGACAATTAAAGTATAAATAAAAAAATTGAACAAATTTTCAAATATGGAGACTAAATGGTATTTTTCAAAATTTAACTTTATGTCGAATATATTTATTAATTTAAATGGTGAATACACCGGCAAGTTATAGAATCTAAAAATTGAAAGTCGGAAAACACACGATCGAAAATTCAAATACATATTTAATACAAACTTGAAAGTTTCATAGGCGAAACCTGTAGTTCAATCTATTCTTTTAAACTTATTAGTAAAGTATTGTTTTAAAATTAAAGTACATATTGTTCTGCAGACATAATACCATTTCTGTAATATTTTAGGGTTTCTTGGTTTGACTTTCAATATAACAGGAAATTTGGTGTCACAAGGAGTCTTTTTTCTTTTTTTGCTAAGAACGAGGTCTCTCAGACATGTCAAAGTTTGCTGTCTGTCCTGATGGTCTCAGCTCTTCTCCCATAAACTTTCACCGAATTTCTACTTCCCTGTTTGATTTGTGGCTTGAATACTGGAAAAAGGGGAAATTCTAATTTAGTACCCATAATTTACAATTATAACTTTGTTCTAACTATAGTTTGTCATTTGTAAAGGAAAGACCGACTGATTTGAGGCTTCCTTTTACATTTCTCAAACCTTTGTTTAAGCGACTCTTATCAGCTTTCTTTGAGTGTATGGCCCACTAAACCTTGAAGACAAATTAAAAGAAGATAAAGAGAAAAAAGGGGTCTCACTGCTTCAATCTTCTCTTGGAAAAGATTCATTCAATTGGAATTGGACTGCCTTTTAAAAAGAATTGAGAAGGACACTGATTTAAGGCAACATCTTGATTTTATAGATTCCTTCATAAAAAGAAAACTCCTTCCATCCATCATTTTTTATAGAGTGCCCCCACTCCATTCTCCTCATTGCTTTTAATCATATACTATCATATTGTTTGAGATTAGTCTGCCTCAAATATAATTCCATTGCTCTGGGTTTCAACTCTCTACTAAACTTTATGTAAAGACACAATTATTGAAAGTGATTGTAAAATGTTTAAAATCATTTTTTATTTTTTGAAGAGCTGATTAAAGAAAATGGTTCAAAATTATTTTCTTACAAAGATCATGCTTGAAATTGATTTGTTATAAAGATCATGTTTGAGGTGTTTGAGATCCAGTATTATAGTCTATGGATTACAAATCTATAGACTAAAGACTATAAACTTATAATAGCTTTTGTGTTTGGAGGAAATAGATACTTGTGGGCTTCTTTTAGTAGTATATATCTTTCCCAACCTACATACACCAACCATTTGCTTCAAGCTAAAGTTTTTTTTTAGAAAAAAAAATCCAAATTTTGCTATTAATTTTTTTTAGATAAAAAGAGAAGACACCCAAATCCATTCAAAAGTTGCAAATGTGCTTCTTGATCTTTCTAAATTTTAAAATTAGCAATATAAATTAAAATTAAGACTTGAAATGGAAGTGAG

mRNA sequence

ATGGCATCATTCCCAATTACATCCCCAATAGCTATTAACCATTCCGAAAACAGAACTTCATCACTTACCTCGAGTCCAAGAAGCTCCGTTCCCCGACCTGAACTCTCCAGAATCAACACGCCTAACCTAATTTTAACTATAACTTCCCTCTCCGAACAACAACGGCAAAGTTCAACGATCCTCAATTCTTATCATAGTTCTACAAGTTCAGACCTTCTCGCCGCACCAACGACCGAAGCACGTGGTTGCACCGCCGTAGCTCCGCCGCTCTCTAAAAAACTTCCCTCCAATTTACGTCGATCGGTGGGAAAGCTCAACCTCATTCCACCATTTGCCGAAAGCGCTTCGTCTCCTCGATATCTCATCAAACCAATGTCCACACCGATCGCAAGTTGCAATAAGCCTTCTCCTGGTGTAATCGCCTCCCCGGTCGTTGGATTTATCACTTCGGAGCATGATTTCGACATCGAGGAAATTTGGTGTCACAAGGAGTCTTTTTTCTTTTTTTGCTAAGAACGAGGTCTCTCAGACATGTCAAAGTTTGCTGTCTGTCCTGATGGTCTCAGCTCTTCTCCCATAAACTTTCACCGAATTTCTACTTCCCTGTTTGATTTGTGGCTTGAATACTGGAAAAAGGGGAAATTCTAATTTAGTACCCATAATTTACAATTATAACTTTGTTCTAACTATAGTTTGTCATTTGTAAAGGAAAGACCGACTGATTTGAGGCTTCCTTTTACATTTCTCAAACCTTTGTTTAAGCGACTCTTATCAGCTTTCTTTGAGTGTATGGCCCACTAAACCTTGAAGACAAATTAAAAGAAGATAAAGAGAAAAAAGGGGTCTCACTGCTTCAATCTTCTCTTGGAAAAGATTCATTCAATTGGAATTGGACTGCCTTTTAAAAAGAATTGAGAAGGACACTGATTTAAGGCAACATCTTGATTTTATAGATTCCTTCATAAAAAGAAAACTCCTTCCATCCATCATTTTTTATAGAGTGCCCCCACTCCATTCTCCTCATTGCTTTTAATCATATACTATCATATTGTTTGAGATTAGTCTGCCTCAAATATAATTCCATTGCTCTGGGTTTCAACTCTCTACTAAACTTTATGTAAAGACACAATTATTGAAAGTGATTGTAAAATGTTTAAAATCATTTTTTATTTTTTGAAGAGCTGATTAAAGAAAATGGTTCAAAATTATTTTCTTACAAAGATCATGCTTGAAATTGATTTGTTATAAAGATCATGTTTGAGGTGTTTGAGATCCAGTATTATAGTCTATGGATTACAAATCTATAGACTAAAGACTATAAACTTATAATAGCTTTTGTGTTTGGAGGAAATAGATACTTGTGGGCTTCTTTTAGTAGTATATATCTTTCCCAACCTACATACACCAACCATTTGCTTCAAGCTAAAGTTTTTTTTTAGAAAAAAAAATCCAAATTTTGCTATTAATTTTTTTTAGATAAAAAGAGAAGACACCCAAATCCATTCAAAAGTTGCAAATGTGCTTCTTGATCTTTCTAAATTTTAAAATTAGCAATATAAATTAAAATTAAGACTTGAAATGGAAGTGAG

Coding sequence (CDS)

ATGGCATCATTCCCAATTACATCCCCAATAGCTATTAACCATTCCGAAAACAGAACTTCATCACTTACCTCGAGTCCAAGAAGCTCCGTTCCCCGACCTGAACTCTCCAGAATCAACACGCCTAACCTAATTTTAACTATAACTTCCCTCTCCGAACAACAACGGCAAAGTTCAACGATCCTCAATTCTTATCATAGTTCTACAAGTTCAGACCTTCTCGCCGCACCAACGACCGAAGCACGTGGTTGCACCGCCGTAGCTCCGCCGCTCTCTAAAAAACTTCCCTCCAATTTACGTCGATCGGTGGGAAAGCTCAACCTCATTCCACCATTTGCCGAAAGCGCTTCGTCTCCTCGATATCTCATCAAACCAATGTCCACACCGATCGCAAGTTGCAATAAGCCTTCTCCTGGTGTAATCGCCTCCCCGGTCGTTGGATTTATCACTTCGGAGCATGATTTCGACATCGAGGAAATTTGGTGTCACAAGGAGTCTTTTTTCTTTTTTTGCTAA

Protein sequence

MASFPITSPIAINHSENRTSSLTSSPRSSVPRPELSRINTPNLILTITSLSEQQRQSSTILNSYHSSTSSDLLAAPTTEARGCTAVAPPLSKKLPSNLRRSVGKLNLIPPFAESASSPRYLIKPMSTPIASCNKPSPGVIASPVVGFITSEHDFDIEEIWCHKESFFFFC

Homology

[Close]

BLAST of Pay0011925 vs. NCBI nr
Match: KAE8650057.1 (hypothetical protein Csa_023702 [Cucumis sativus])

HSP 1 Score: 96.3 bits (238), Expect = 2.7e-16
Identity = 59/81 (72.84%), Postives = 65/81 (80.25%), Query Frame = 0


Query: 1  MASFPITSPIAINHSENRTSSLTSSPRSSVPRPELSRINTPNLILTITSLSEQQRQSSTI 60
          MASFPI+SPIAINHSENRTSSLTSSPRSSVPRPELSRINTPNLI TITSLSEQQR S+  
Sbjct: 1  MASFPISSPIAINHSENRTSSLTSSPRSSVPRPELSRINTPNLISTITSLSEQQR-STEF 60

Query: 61 LNSYHSSTSSDLLAAPTTEAR 82
            S  ++  S  L   ++ AR
Sbjct: 61 RPSRRTNARSTWLRRRSSAAR 80

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Pay0011925 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Pay0011925 vs.


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Pay0011925 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
KAE8650057.1	2.7e-16	72.84	hypothetical protein Csa_023702 [Cucumis sativus]	[more]

BLAST of Pay0011925 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25

Position :

Zoom :

x 1


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 1..36

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Pay0011925.1	Pay0011925.1	mRNA