Pay0010033 (gene) Melon (Payzawat) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: polypeptideCDSexon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGTGTGCATCCTTCGGGAGCACTAGACTGATATGTGCATCCTTCGGGAGCACTAGACTGACATGTGCGTTCTACGGAACCACTAGACTGTTATGTAGGGTACCCCCGAATAGGAAGTTAACTGTTGTCCCTAACGGGCCCAGTAGTGGGTCCCTTACTGGGTATGTTTATACTCACCCTTTTCTCTTCTTTAACTTTTCAGGTAAGGGCACAGCGAGGGGCAGACCGACGAGAGGCAGGAAGGATGCGTGAAGGCCATATGGACGCGTCTGGTTTTCTTATTGCTTCCGCTGATGTTTTTGTTAGAATATTGGTTTTGTGATTTTGAGTTGACGACCTGAGTTTTTATTTGAAACTTTTGTGACTGTGATTTAAAATAGGGCCCGATACTGTTTTTTTGTAATATTTCTAACGTTTTAAGAAATCGTAACCGGTCCGTCATGAATTTTATGTTGTGTGGTCGAGTTTTGGTATTGAGTAGTGACCTCAGCTTAGTCCGGAAAGTTGGGTCGTTACAGTTGGTATCAGAGCCTAAGTTTTAGGTTCTGTAGACTGACTTATAATGTGAGTCTGTGTTTTGTGTCTTTATGGCTAAAACGATCCTTGCCACTCATCAGGTACGCTCTCATGAAAGTATATGTATAACTCTATATGCATTACCTTACCTAAGTTAAACTGCAAAGTTAATTACCATTTATGACTAAAGGGATCACTGGTGGTTGTTAGGGAAATGCCGCCAAGGAGAGGTGCACGTAGGGGTGGCCGAGGAGGCCGAGGAAGAGGAGCAAGACGCGTTCATCCTGAGGTGCAGCCCGTAGCCAAAGCCACTGACCTGACTGTGCCAGTTACTCATGCGGATCTAGCTGCCATGGAGCAGAGTTTAGAGATTTGATTATGCAGATGCGGGAGCAGCAGCAGCCTGCCCCGCCAGCTCCAGCACCAGCTCCTGCTCCAGCTCCGGCTCCAGTACCAGTTGCGCCCCAGGTTGTGCCGGATCAGTTGTCAGCAGAGGCTAAGCACCTAAGGGATTTCAGGAAGTATAATCCCACGACATTCGATGGGTCTTTGGAGGACCCCACCAGGGCTCAGCTGTGGTTATCGTCTTTGGAGACCATATTCCGATACATGAAATGCCCTGAGGATCAGAAAGTTCAGTGTGCTGTTTTTATGTTGACTGACAGAGGTACTGCATGGTGGGAGACTACAGAGAGAATGCTAAGTGGTGATGTGAGTCAGATCACGTGGCAACAGTTTAAGGAGAGTTTCTATGCGAAATTCTTCTCTGCTAGTTTGAGAGATGCCAAGCGGCAGGAGTTCCTGAACTTAGAGCAGGGTGACATGACAGTGGAGCAGTATGATGCGGAGTTTGACATGTTATCCCGCTTCGCTCCCGAGATGATAGCGACCGAGGCGGCCAGAGCTGATAAGTTTGTTAGAGGCCTCCGACTGGACATTCAGGGTTTGGTCCGAGCTTTCTGACCCGCTACTCATGCCGATGCACTGCGCCTGGCAGTGGATCTCAGTTTACAGGAGAGGGCTAACTCGTCTAAGACCGCTGGTAGAGGTTCAACATCGGGACAGAAGAGGAAGGCTGAGCAGCAGCCTGTTCCAGTGCCACAGCGGAACTTCAGGTCAGGTGGCGAGTTTCGCCGCTTCCAGCAGAAACCTTTTGAGGCTGGGGAAGCTGCCAGAGGGAAGTCGTGGTGTACCACTTGTGGGAAGCACCATCTGGGCCGTTGCTTATTCGGGACCAAAACTTGCTTTAAGTGTAGGCAAGAGGGTCATACAGCTGATAGATGCCCGTTGAGACTTACGAGGAACGCGCAGAATCAGGGAGCAGGTGCTCCACATCAGGGTAGGGTCTTTGCTACCAACAAGACTGAGGCTGAAAGGGCAGGCACAGTGGTGACAGGTACGCTTCCAGTATTGGGGCATTACGCCTTAGTTTTGTTTGATTCGGGATCGTCACATTCTTTTATCTCTTCCGCATTTGTGTTGCATGCCCGCTTAGAGGTAGAGCCCTTACACCATGTTCTATCAGTATCTACTCCTTCCGGGGAGTGTATGTTGTCGAAGGAAAAGGTGAAAGCATGCCAGATTGAGATAGCAGGCCATGTGATTGAAGTAACGCTGTTAGTCCTGGATATGCTCGACTTTGATGTAATCCTGGGTATGGATTGGTTGGCCGCTAACCACGCCAGCATAGATTGTTCCCGTAAGGAGGTAACGTTTAACCCTCCTCGATGGCCAGTTTTAAATTTAAGGGAGGAGGGTCAAGGTCGTTGCCTCAGGTAATCTCAGCCATCAGGGCCAGTAAACTGCTCAGTCAGGGTACTTGGGGTATCTTAGCGAGCGTGGTGGATACTAGAGAGGTCGATGTATCCCTGTCATCAGAACCGGTGGTGAGGGACTATCCGGATGTCTTTCCTGAAGAACTTCCAGGGTTACCTCCGCACAGAGAGGTTGAGTTTGCCATAGAGTTGGAGCCGGGCACGGTTCCTATATCCAGAGCCCCTTACAGAATGGCCCCCACAGAGCTGAAAGAACTAATGGTGCAGTTACAAGAATTGCTTGATAAGGGATTCATTCGACCGAGCGTGTCACCTTGGGGTGCGCCAGTTTTATTTGTTAAGAAGAAGGATGGATCGATGCGTCTATGCATTGACTACAGGGAGTTGAATAAGGTAACCGTTAAGAACAGATATCCCTTGCCCAGGATCGACGATCTATTTGACCAGTTACAGGGAGCCACAGTGTTCTCTAAGATTGATCTTCGGTCGGGATACCATCAGCTGAGGATTAAGGATGGTGATGTACCAAAGACAGCATTTCGTTCCAGGTATGGACACTACGAGTTTATTGTGATGTCTTTTGGTTTGACGAATGCTCCGGCAGTGTTTATGGACTTGATGAACAGAGTGTTTAGGGAGTTCCTAGATACTTTTGTGATCGTGTTTATCGACGATATCTTGATATACTCCAAGACGGAGGCCGAACATGAGGAGCATTTACGTATAGTTTTGCAAACACTTCGGGATAATAAGTTGTATGCAAAGTTCTCGAAATGCGAGTTTTGGCTGAAGCAGGTGTCCTTTCTGGGCCACGTGGTTTCTAAGGCTGGAGTCTCTGTGGATCCAGCTAAGATAGAGGCAGTCACCGGTTGGACCCGACCTTCCACAGTCAGTGAGGTTCGTAGCTTTCTGGGTTTAGCAGGTTATTATCGACGGTTTGTGGAGAACTTTTCTCGTATAGCTACTCCTCTTACTCAGTTGACCAGGAAGGGAGCTCCTTTTGTTTGGAGCAAGGCATGTGAGGACAGTTTCCAGAACCTTAAACAGAAGCTAGTTACCGCACCGGTTCTTACTGTACCTGATGGTTCTGGCAGTTTTGTGATTTATAGTGATGCTTCCAAGAAGGGTTTGGGTTGTGTTTTGATGCAACAGGGTAAGGTGGTCGCTTATGCGTCTCGTCAGTTGAAGAGTCATGAGCAGAACTACCCTACACATGATTTAGAGTTGGCAGCGGTGGTTTTTGCTTTGAAAATATGGAGGCATTACTTATATGGTGAAAAGATACAGATATTCACGGATCATAAGAGCTTGAAATACTTCTTTACTCAGAAAGAATTGAATATGAGACAGCGAAGATGGCTTGAGTTAGTGAAGGATTACGATTGTGAGATACTGTATCATCCAGGCAAGGCAAATGTGGTAGCTGATGCTCTTAGTAGAAAGGTATCACATTCAGCAGCACTTATTACCCGACAGGCCCCATTGCATCGGGATCTCGAGCGGGCTGAGATTGCAGTGTCAGTGGGGGCAGTCACTATGCAGTTAGCCCAGTTGACGGTACAGCCGACTTTGAGGCAAAGGATCATTGATGCTCAGAGTAACGATCCTTATTTGGTTGAGAAGCGTGGCCTAGCAGAGGCAGGGCAAGCGGTTGAGTTCTCCATATCCTCTGATGGTGGACTTTTGTTTGAGAGGCGCCTCTGTGTGCCATCAGATAGTGCGGTTAAACAGAATTATTATCTGAGGCTCACAGTTCCCCATTTTCATGCACCCGGGTAGTACGAAGATGTATCAGGACCTGAAGCGGGTTTATTGGTGGCGTAATATGATAAGAGAGGTAGCAGAATTTGTTAGTAAATGCTTGGTGTGTCAGCAGGTTAAGGCACCAAGGCAGAAACCAGCGGGTTTATTACAACCCTTGAGCATACCGGAATGGAAGTGGGAAAACGTGTCCATGGATTTCATTACAGGACTGCCGAGAACTCTGAGGGGTTTTACAGTGATTTGGGTTGTGGTGGACAGGCTTACCAAATCAGCGCACTTCGTTCCGGGTAAATCCACCTATACTGCTAGTAAGTGGGCACAGCTGTACATGTCTGAGATAGTGAGATTACATGGAGTGCCAGTGTCGATTGTTTCTGATAGAGATGCCCGTTTCACTTCCAAATTCTGGAAGGGTTTGCAGACTGCTATGGGCACGAGGTTAGACTTTAGTACAGCTTTCCATCCACAGACTGACGGTCAGACTGAGCGTCTGAACCAAGTTTTAGAGGATATGTTGCGAGCGTGTGCATTGGAATTTCCAGGTAGCTGGGACTCCCACTTGCATTTGATGGAATTTGCTTATAATAACAGTTATCAGGCTACTATTGGCATGGCACCATTTGAGGCCTTGTACGGCAAATGTTGTAGATCCCCGGTTTGCTGGGGTGAGGTGGGTGAGCAGAGATTGATGGGTCCTGAGTTAGTTCAGTCTACTAACGAAGCGATACAGAAGATTAGATCACGCATGCATACCGCTCAGAGTAGGCAGAAGAGTTATGCAGATGTGAGGCGGAAGGATCTTGAGTTTGAGGTGGGGACAAGGTGTTCTTAAAGTAGCACCTATGAAGGTGTCTTACGATTTGAAAGGAGGGGAAGCTGAGTCCCGTTTGTTGTTTTGGGCCGTTTGAGATTCTGGAGCGGATTGGCCCTGTAGCTTAT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MCASFGSTRLICASFGSTRLTCAFYGTTRLLCRVPPNRKLTVVPNGPSSGSLTGYVYTHPFLFFNFSDLIMQMREQQQPAPPAPAPAPAPAPAPVPVAPQVVPDQLSAEAKHLRDFRKYNPTTFDGSLEDPTRAQLWLSSLETIFRYMKCPEDQKVQCAVFMLTDRGTAWWETTERMLSGDVSQITWQQFKESFYAKFFSASLRDAKRQEFLNLEQGDMTVEQYDAEFDMLSRFAPEMIATEAARADKFVRGLRLDIQGLAEQQPISVPQRIFRSGGEFRRFRQKLFEAGEAARGKPLCTTCGKHHLVRCLFGTRICFKCRQEGHTADRCPMRLTGNAQNQEAGAPHQGKVFATNKTEAERAGTVVTGTLPVLGHYALVLFDSGSSHSFISSAFVLHARLEVEPLHHVLSVSTPSGECMLSKEKVKGCQIEITGHVIEVTLLVLDMLDFDVILGMDWLAANHASIDCSRKEVAFNPPSMASFKFKGEGSRSLPKVISAMRASKLLSQGTWSILASVVDTREVDVSLSSEPVVRDYPDVFPEELPGLPPHREIEFAIELEPGTVPISRAPYRMAPAELKELKVQLQELLDKGFIRPSVSPWGAPVLFVKKKDGSMRLCIDYRELNKVTVKNRYPLPRIDDLFDQLQGATVFSKIDLRSGYHQLRIKDGDVPKTAFRSRYGHYEFIVMSFGLTNAPTVFMDLMNRVFREFLDTFVIVFIDDILIYSKTEAEHEEHLRMVLQTLRDNKLYAKFSKCEFWLKQVSFLGHVVSKAGVSVDPAKIEAVTSWPRPSTVSEVRSFLGLAGYYRRFVENFSRIATPLTQLTRKGAPFVWSKACEDSFQNLKQKLVTAPVLTVPDGSGSFVIYSDASKKGLGCVLMQQGKVVAYASRQLKSHEQNYPTHDLELAAVVFALKIWRHYLYGEKIQIFTDHKSLKYFFTQKELNMRQRRWLELVKDYDCEILYHPGKANVVADALSRKVSHSAALITRQAPLHRDLERAEIAVSVGAVTMQLAQLTVQPTLRQKIIDAQSNDPYLVEKRGLAEAGQAVEFSISSDGGLLFERRLCVPSDSAVKTELLSEAHSSPFSMHPGSTKMYQDLKRVYWWRNMKRGGRIC Homology
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P20825 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 297 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=pol PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 7.4e-89 Identity = 164/417 (39.33%), Postives = 250/417 (59.95%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P04323 (Retrovirus-related Pol polyprotein from transposon 17.6 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=pol PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 330.5 bits (846), Expect = 7.4e-89 Identity = 166/411 (40.39%), Postives = 254/411 (61.80%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT41 (Transposon Tf2-12 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-12 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 328.6 bits (841), Expect = 2.8e-88 Identity = 187/577 (32.41%), Postives = 314/577 (54.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT34 (Transposon Tf2-1 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-1 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 328.6 bits (841), Expect = 2.8e-88 Identity = 187/577 (32.41%), Postives = 314/577 (54.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: P0CT35 (Transposon Tf2-2 polyprotein OS=Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843) OX=284812 GN=Tf2-2 PE=3 SV=1) HSP 1 Score: 328.6 bits (841), Expect = 2.8e-88 Identity = 187/577 (32.41%), Postives = 314/577 (54.42%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7SQU8 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold134G00040 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2026.5 bits (5249), Expect = 0.0e+00 Identity = 1050/1209 (86.85%), Postives = 1063/1209 (87.92%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7VPI8 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold40G001640 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2010.3 bits (5207), Expect = 0.0e+00 Identity = 1037/1210 (85.70%), Postives = 1057/1210 (87.36%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7UE75 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold428G00240 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2010.3 bits (5207), Expect = 0.0e+00 Identity = 1035/1174 (88.16%), Postives = 1050/1174 (89.44%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7TP96 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold588G00630 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1991.1 bits (5157), Expect = 0.0e+00 Identity = 1035/1239 (83.54%), Postives = 1059/1239 (85.47%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7T6R9 (Reverse transcriptase OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold3G00010 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 1987.2 bits (5147), Expect = 0.0e+00 Identity = 1025/1203 (85.20%), Postives = 1049/1203 (87.20%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. NCBI nr
Match: KAA0031931.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2026.5 bits (5249), Expect = 0.0e+00 Identity = 1050/1209 (86.85%), Postives = 1063/1209 (87.92%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. NCBI nr
Match: KAA0053368.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2010.3 bits (5207), Expect = 0.0e+00 Identity = 1035/1174 (88.16%), Postives = 1050/1174 (89.44%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. NCBI nr
Match: KAA0067481.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2010.3 bits (5207), Expect = 0.0e+00 Identity = 1037/1210 (85.70%), Postives = 1057/1210 (87.36%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. NCBI nr
Match: KAA0043391.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1991.1 bits (5157), Expect = 0.0e+00 Identity = 1035/1239 (83.54%), Postives = 1059/1239 (85.47%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. NCBI nr
Match: KAA0037291.1 (pol protein [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 1987.2 bits (5147), Expect = 0.0e+00 Identity = 1025/1203 (85.20%), Postives = 1049/1203 (87.20%), Query Frame = 0
BLAST of Pay0010033 vs. TAIR 10
Match: ATMG00860.1 (DNA/RNA polymerases superfamily protein ) HSP 1 Score: 123.2 bits (308), Expect = 1.3e-27 Identity = 60/131 (45.80%), Postives = 83/131 (63.36%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Payzawat) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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