Moc08g22500 (gene) Bitter gourd (OHB3-1) v2

Overview


Name	Moc08g22500
Type	gene
Organism	Momordica charantia cv. OHB3-1 (Bitter gourd (OHB3-1) v2)
Description	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022007
Location	chr8: 16484458 .. 16491991 (-)
RNA-Seq Expression	Moc08g22500
Synteny	Moc08g22500

Sequences

The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: polypeptideexonCDS

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

ATGCATGGGTCATGGCTTAAGAAAGTATATAGTAAGACTCTGGTGAGAGTTGGACTCTTTGAGAAAGTGAATGGGTGAGTGTCAGGGCCTCGGGTATAAATGGTCGGGGGCTGATACGTCACTAATTGAGTATCGAGGCCTCAGGTGAAAATGGTCGAGGGTAGATGCGATGAGTCTTTTGGGAGGAAAGCTATTGGGGCCTTGGGTAAAAATGGTCAAGGGCCGATAGATGGTGAAGTCATCGGAGCCTTGGGTAAAAATGGTCGAGGGCCGATGCGGTAGTGTCGGGGCTCTGGGTAAAAATGGTCAGGGGCCGACTCTACTCGAAGAAGTTAACTGTGGAGGGCTAGGATAGCTGTGATAATCGTAGAGGTACTTGAGATGTTAGGGAGACTCGAGGTCGGTAGTTAATTTGTTCATGGTTGTGGTTGTCGCCGAATGTTATAGAGTGTGCCTATGTTTGATTACATAATGTGATGAAGAGCATGACTATGAATGTTTTTATGATTTTGTTGAGCATGATGTGTGCGTGTGTTGGTGAGGGCTACTTACGGAGTATATTTATATACTCACCCCCCCCCCCCACCCTCTGCAATTATTGTTTCAGGTGAAGGATTTGTTGGCGACCATGGTGATGAGACGGAAGAGACATGACGAGCGAGGACCATAGGCTGCGTAGTTACTTTTGCTTAGCTTAAGTTTTAGATGGTTAAGACCCTATGTTTTGGTCGATAAACTATTTGACCTTATCTGAATAATTGGGAGGTTCCCACTTGTTGTTTATTTTATTTCGGGATAGATGTTTGTTTTAGTTTTCTTACATTCATTGAGTTTTGCATAGTTGGAATAATAAATTTGCCTCGTGAGGTTGTCCACGGATGTTGTTGATTGATGTTCTATAGAATTGATTCATTGTTAAATTGATGAGAGGTGAAGCTTGGTTTTATATATGTATTGTACAGGGAGTTGACACCTCGTGTTTGGGGTTAAGTTTAAATAGTTGGGTAGTTAACGAGACCTAGAAGTGTGTGGGAAATTCTGGGGCGTTACACTAGTTCTTAGGAAACCTTTGTTAAATTTCATTCTTGCTTTAATCAAAGTTTATTTCATTTGTATTTTATTCTAGTTCAGTCCTTTACCATTTTCTAACGAGTTTCAACTCCCTTCAAGTTCAAAAGAGAAGGTTAAGCTAGGGCTCGTTATACTTTGTTATTATTTAAATTCGATCAATGAAAATTATTTCTTTTATTTCTTTGAGAATTTTTCTTCCTTCAATTATGTACTACTTAAGTTTTCAACCACTCCGTGGAATGCCTTAGAAAAATTAATTAATTTTAACATGGTGGAAAAAATCCAAGTTGCATTTGGTGCATTTCTAGGTTAGTTTCTAAATTTTTCCTTAAGTGATTTCTTATGTTAGCCGCTAGGAAATTGATCTCTACAGTGAAGCCTAATACTAGAGAACGTTAGGTTAGTAAAATATTAGGTAACTAATATAGAATGTTTCTTAGACATAAACGCATAAACCACGGTCCTAAATATAGGCTCTCTGGCCCGTAAAAGCAAATGAGTTGATGCGCATGCTAGGATTATAAGCACGAATAGACATTTGACAGTAGGTTTGGGCTCTGAAATAACCAAAAGTGATTCGTGATAATAGTAGAACTCAGTTTTCAAAAAACTGCTAAGTAGCATCTGACGCTTTCTTCATTAATGTGTATTTTCTTCAACAAGTAAGGCACAAAGTAAAGACGTTGTTTTTATATCGAAGCTTGATATTTGCAAAATCAACTCATGACTTTATCACCTATTTTTAACAATAAAACTCGATTACGACTGGAAACATTTCATTTCAATTCGTTTTCAAAGCAAAAGTACCTGAGGATTATTCGATCTTGGAATTACTTCCTTGTATTACTTGTTACCGTGTATGATTGCACCTTTCTCTTATATTTTGTGGTAAAGAATATCCCAACACTTACTTAGAATCCCTCATAGCTAGATACCGCATTTCGAACTCCATTGGTCTACATCTACCTTTAGAGGGTTAAACGAGTTATAATCCACCTAAAGGGTGTGTAATTCTCTATATGAAAATGTTCAAGTCTGGCTTTAGGCTACCACTCCATGATACAAGGAATGATTCATTCCGCATCGGAATACCACTCCACGATAGAATGAATGATTCATTCCGCATCAGAATTATTGGATCGGCATTAAATTAATATTTAGACTACTAAATTAATTGAGAAAGTAAAATACCTTTGTAGAATCTCTCCACAAGACCTTCCTCGCTATGACTCGAACAATAGACCAAAGTTGGTGGGAACTCCTTGAAAGAAACGAGTGAGAATTTCAACAGAATTTGTAGAGAATGATGATGTGTTTTGGCTCATCCCAAAGGTCCTATTTATAAGAGCTTGAGGTAGAATCTTTTTAATATCACATATTAAAAAGTTTTATTTTATTTGATTCTCATAATATTTTATTAAATATTATCCTTTGAACGTATCAATTATAGAATCTCATGCCAAATAAAATATTTTAATATCTCATATTAAAATTTTATATTATTTGATTCACAATCAAATAGTTATTTTATTAGTACTTCTTATATATTAATAAAATATTAATTTTACTTTAAATGTATCAAATACATTAATTCATTATTCTCTTTATTATTTAATGTATTTCAAATACTTTAATAATAATGAATTTGAACATTTCAAATTTTATTTTATTTTAACATAATTTTATCCATTAATGTTACTATGAGCTAGCAAGAGGACCTTATAGACCTACAGTTTATAAGCTCCAAGATATAAAATTAATTAATTAAATTCATTAATTAATTAACTTTCATTCGTTAACTAAAGTTTACTCTACTATAAACCTAGAGTTACATTCTTACACACTGTAGAGCAAGTTTGTCCATGAATATAATCATTACATGCAAGTCAATTCTTCACGAGTTTTTCAAAATTATAGCTGGGTCAAAAGTCCGTTTTACCCCTGTAATTACATCTTATACCTTAAGTATCACTGATCCTCTAATGAACAACCGTTTATGATCTGACCATAAACTAAGTCCTTCTCGAGCTAGTGAGTGGGTGGGGTAGATTGTTAAAGTCCTAAAAACAGCACTTAAGGGAACTACTCATCTATTTACCCTATAATGGGAATGAGTGAATTCCATTGTGTGAGATTATGTTCCCAGCTCCCTTTTGGTCACGTCCCAAAAATAGTACCCTTATTGAATCGGTTACCAAAACCATTCTACCCATGTAAATCACTTCGGATTAAGATCGAGTCACATATGATCATCCTGTGAAATAATTATCTTATATTTTAACGGATTTACTAAGAAAGATGAAATACTTCGTGATCCAGTCTTATACAAACTCATTGTGTATGATACCACCACTCACATGCCTCCACATGAACAATGTTGGATCAAATAATCTGTAACATTTACAAAGTGGGTCATATCAATAGTGTTACCAGGATAAGGCGCCCCACCTTATCAATATACTATAAGCTCCTTAGGTTATAATTTGAACACGATTCTCTTATATGTCAACTACATACTATTCAATATTACATTTATAACCTTGGATTTTCCCAAAATTTGATAATATTTATACATAACAAAATAAAATAAAATAATTAGAATTTACATACTACGAGGCTGTAGGGCATAAATACTAACACTCCACCCCTTAGGTAAGGAGTTTTTGAACAAAAGAAACCTTGTCCTTGCACAACTCACTTCCAATGGATGGGGGATCCTATTCGGGGTCAGAGTTGTATGGTGATTGGAGTGCTCAAAGGATGGCGATTTCATGCTACTGAACACAGATCAACTTCTTGCCTGCATCGAAGTGAATAAGGCACCAACGGCAAGAGACAGTTGTTAGGGTTGACTTTTTTCTAATAGAAACATGTGTCGGTAGCCCTGTTTGACCACATTTTTTACCCTTTTCCCATCATTATTTGCCAAAAAGAAGCACAAAACTTTACCTTTGAAGAACGTTTCTTCAACGGTTTCCACCCGAACACCACCACCGTGTCTTCCTCGCTATCCTCTTGGGTCTCGAGACCGTGCTTGTGGGAGCACCTCTTTTGGAATGAGAGGGAGTATTGAGAGAGCTTGAGAGAGATTCAAATGGGAGTTCAGTCTTTTTTGTTCTGTACCTCTGTTTTTGCATAACTGCAAAAGAGGAAAGCAAAAACAGTGATGTGGGGAGTTACCCACGTCACTTAACTGCCCACTCCCATGCAATTTTGTAGGGGAGTTAAATATTAATAATATTTATATATATAATAAATAAATATATATAATAATTGATTAATCATATTAATTAATAAATATTAATTAATTATTAATCTAATTAATAATTAATTAATATATATATATATATATCAAATAATTAACACTTAATTATTTATCACATAAATAGAATCATATTCTATAGCATTTATCTCGTATAACCTATAGTTCTAATGTACATCTTATGCACATTATTTTTAACGTATAGATTTAATATAAATCTTATTCATATTAATTTTATTTGAATCTCATTCAAATAATTTCTCTCATAATATATAGTTTTAATTTAGAATTAACTATATATTATAATGTATCAATATACATATATTCCCTTGAGAAATTTGAACAGTTCAAATTCTTCCAAAAACTGGATCCTCGTTTTACCCATTAAGACCTAGCAAGGGGATCTAATGGACCTACAGATTAGAAGCTCCAACGATACAAGATTAATCGGTCAAACTCATTTACCGAGTTAATCAACATTCGTTAACTACGGGTCACTCCACTAAATACTCGCAGTTGCACTCTTCTCACTACAGAATGTTTTCGTGTCCACGGATATACGACCATTAATGACGAGTCAATCCTTTACGAGTGCTCGTAACTCAAGTTGGGTCAAATTACCGTTTTACCCACGAGTTACATCTTACTCCTTAAATACCACTGCTTT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mRNA sequence

ATGCATGGGTCATGGCTTAAGAAAGTATATAGTAAGACTCTGGTGAAAATGGTCGAGGGTAGATGCGATGAGTCTTTTGGGAGGAAAGCTATTGGGGCCTTGGGTAAAAATGGTCAAGGGCCGATAGATGGTGAAGTCATCGGAGCCTTGGAGATTGAAAGAACCTTTAAGAGGATAAGGAGTGAGCAAAGGTTGAGAAAAGATCGAGAAAATCAAAAAGAGAATGAAGTTGAAGAAGTAGAAGTTGAAGAAGATACCATCGAGATGAATAGAAATGCACAAGATCCACCACCTTCACAAGATCCACCTGTGAACGGAGATATGGCAGGTGAAGGAGCGGCAAACTGA

Coding sequence (CDS)

ATGCATGGGTCATGGCTTAAGAAAGTATATAGTAAGACTCTGGTGAAAATGGTCGAGGGTAGATGCGATGAGTCTTTTGGGAGGAAAGCTATTGGGGCCTTGGGTAAAAATGGTCAAGGGCCGATAGATGGTGAAGTCATCGGAGCCTTGGAGATTGAAAGAACCTTTAAGAGGATAAGGAGTGAGCAAAGGTTGAGAAAAGATCGAGAAAATCAAAAAGAGAATGAAGTTGAAGAAGTAGAAGTTGAAGAAGATACCATCGAGATGAATAGAAATGCACAAGATCCACCACCTTCACAAGATCCACCTGTGAACGGAGATATGGCAGGTGAAGGAGCGGCAAACTGA

Protein sequence

MHGSWLKKVYSKTLVKMVEGRCDESFGRKAIGALGKNGQGPIDGEVIGALEIERTFKRIRSEQRLRKDRENQKENEVEEVEVEEDTIEMNRNAQDPPPSQDPPVNGDMAGEGAAN

Homology

[Close]

BLAST of Moc08g22500 vs. NCBI nr
Match: XP_022154847.1 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022007 [Momordica charantia])

HSP 1 Score: 54.3 bits (129), Expect = 8.1e-04
Identity = 25/27 (92.59%), Postives = 26/27 (96.30%), Query Frame = 0


Query: 89  MNRNAQDPPPSQDPPVNGDMAGEGAAN 116
           MNRNAQDPPP Q+PPVNGDMAGEGAAN
Sbjct: 1   MNRNAQDPPPPQNPPVNGDMAGEGAAN 27

[Close]

BLAST of Moc08g22500 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1DMT3 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022007 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111022007 PE=4 SV=1)

HSP 1 Score: 54.3 bits (129), Expect = 3.9e-04
Identity = 25/27 (92.59%), Postives = 26/27 (96.30%), Query Frame = 0


Query: 89  MNRNAQDPPPSQDPPVNGDMAGEGAAN 116
           MNRNAQDPPP Q+PPVNGDMAGEGAAN
Sbjct: 1   MNRNAQDPPPPQNPPVNGDMAGEGAAN 27

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of Moc08g22500 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description
XP_022154847.1	8.1e-04	92.59	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022007 [Momordica charantia]	[more]

BLAST of Moc08g22500 vs. NCBI nr


Match Name	E-value	Identity	Description

BLAST of Moc08g22500 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description
A0A6J1DMT3	3.9e-04	92.59	LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC111022007 OS=Momordica charantia...	[more]

BLAST of Moc08g22500 vs. ExPASy TrEMBL


Match Name	E-value	Identity	Description

InterPro

Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (OHB3-1) v2
Date Performed: 2022-08-01


IPR Term	IPR Description	Source	Source Term	Source Description	Alignment
None	No IPR available	COILS	Coil	Coil	coord: 70..90
None	No IPR available	MOBIDB_LITE	mobidb-lite	disorder_prediction	coord: 63..115

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:


Feature Name	Unique Name	Type
Moc08g22500.1	Moc08g22500.1	mRNA