MS021916 (gene) Bitter gourd (TR) v1
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: CDSpolypeptide Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.ATGGTTGGGGGAGGCCTTCTTCCACTTCCATGTTTCCGGACCCGGAAGCCCCAACCCGAACCCGACCGCGACCCGGTCCTGCTCGTCTCCGGCATTGGTGGCTCCATTCTTCACTCCAGGAACAAGAAGTTGTTCGGCTTAGAGACCCGGGTCTGGGTCCGGATCATCTTGGCCGAATTGCTCTTTAATGAGAGGCTCATCTCCTTATACAATCCCAAAACAGGTCCTTTCCTTACTCTCTCCCACTTCTCTGTTTCTTCACTTTTTTATTTTTGGGCATTTCTAGTTACTGGAGGTGGAACTCAACTAACTACTCATGTTTTTGGAATTTTGGGGTTCTTTTTAGGGTAAGTTTCAGTCAAAGCACTTCCTTTAAAGTGTTTTTTCTCTCTCTTCTTAGAGTAAAGGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTAATGCGTTTGGTTACTGCTTTGCCAAAACTGATTATGCAATACTAAGGAATCTCATGTTTTTTTTTCTCAAGATTCTTTGGTCAACCACTATAAAATCACCTTGGAGAATCTGGGTTTTTCTTGGAAGTTTTTTAAACTCAATATGATTTTATTTTAATTTTAAAGTGATTATTATTTGTTATACCAAACGCTGCAGATTAAAAAAAAACACGTCTTAGTCGTTAAAAAATTCTCAAGTTTGATGCTCTTATTAAGTGCTATTCTGTTTACCTTCTGGAAGGAGAAGTGGAATTTTATACGTTATCTATTAGATTACACGAAGTGGACTACGTTTTTCTGTCTTTACACTGTTAGTAGTAAGTCATGAGTGATGGCAATGTCTTGTTCCTTCAATAGTTCAAATAGGAAGGTGGTTTCACTAATATGAAGTGAAACTCGTGCAATATCTTCACGTACTTACATCTCCGACGAGTCACTATCTTCCTCCACATGCTGTTCTACATTTTTTTGGCTGATGCATAAGTATGCTTGGTTGTGCTTAGGAAGGAAGGAAGAAAGAATGCAACTTAATTCCATGTTTTAATTACATTTATTTGTGTTTTAAGTCAACTTCGGGTGGACCCAAAGGATCTGCATAAAACAGCATTTCGAACACACTAGGGCCATTATGAGTTATTGGTTATGCCTTTTGGCCTCCGGAACGCCCCTTCCACGTTTCAATGGATCATGAGTTTTCTTTGATGATATCTTGATTTACAGTGCCACTGTGAGAGATCATGCAGAACACTTAGCCTTGGTACTCCGGGCCTTAGCTACCAATAAGTTTGTGGCCAACCTAAAAAAATGTCAGTTTGCTGCCCAGCAAATTGAGTACCTTGGTCATTTGGTCTCAGCAACAGGGGTAGCTGCAGATCCTTCCAAATTGGAGGTGATGAAGGCTTGGCCCACACCGACTAACATTAAACAACTCTGGGGTTGACAAATCATTATCGGAAGTTTGTAGCGAATTATGGCTCCACTACTTTTTTGTTAACCCAGCAGCTTAAAAAGGATAATTTTGGTTGGACTGAGGACGCCTGGCGGGCTTTTGAACAGTCGAAGGATGCGATCATGAATGTACCAGTGTTGGGACTACCGAATTTTTCGCAACCCTTTGTGCTCGAGACTGATGCATCCGGGGTGGGTGTTGGTACCGTGTTGATGCAGAACCAACATCCTATTACTTTCTTTAGCCAAGCCTTGCCACCAATGCATCGTTTGAAAGCTATTTACGAGCATGAGTTAATGGCTGTTGTCTTTGGCGTGCATAAATGGCGACCTTATCTTCTGGGCAAGATGTTTACGGTGCGAACAGATCAAAAGAGTTTTAAATTCTTACTTGATCAGCGAGTTGTGGCAGGGGAATACCAACGTAGGATTGCTAAGTTACTTGGCTATGATTTTGTTATTGAATACAAATTGGGGTTGGATAATACAGCTGCCGACGCGTTATCTCGCATGCCCATGACCCTTGAATTGGTGCCTTAAGTGTTACCAGAGGGCTAAATGTGGCTATATTTATTCAGCAAGTAAATGATGATGTGAAATTGAGAGCAATTAGCTTGGCTATTACAAAAGGTCGGGAGGCTCCGGTGGGGTATATGGTGCGATGATTTACTATTGTACAAAGGTAAGATAGTATTACCCCCCCGAGGAATTTCATAGCGGGAAGTTTACTGGAAGGGTATGAAAGGTCGCATTCGGGATTTTGTGGCTGATTGCGTCATTTGCCAACAAGCCAAATGGTTGAGAATCCATATATATGAATTAAATTATCCAACCCATCAACTTAAGCTTTTGGGTTGAGCGGTAGTTTGTTCATCCTTAACATGATATCATAGCAGGAGGTGACCATACATCTGGTCTTTCATGTTTTCCAGCTTCAAAAGGTTGTGGGATTTAATCTACCCCTATTTCCAGTTCCCTCAATTTGCCCTATAACTTGTGTCTGATCTTGAAACCTTTGGAGTTGTTGAGTTTACGCAGGTCGACTGCGAACGAGGAAGATTTGGAAGTACTGATATGTTGGGATGTGGGATTCATTGAGGATGCTACATGGGAACTTGCTCCAACCATTGCTTCTCAATTCCCAGATTTCCACCTTGAGGACAAGGTGGCTTTGGGNNNNNNGGGAGGGGTAGACCCCAAATCACTAAATATTATACACGTAAGTGTGTGAGACAACGAGGAGCCACGTAAGCAATAGGTGAGGGGGAATTGTGTTTAGGCCTCAGGAATATTGTTAGTTAGGAAGAATGAGGTGTAAGGGCTGTATGTGTTGAGGGGAGAGGTTAAAATAGAAGTTTGTTGAGGGGAGGAGCATCTTTTTTGACATGGTGAAATTTGTAAGGTTCACCGAGTACATGAGAGAAAGTTGGGGAACTCTTAAAATCTCCCTTATTTGATGCTCTGTTTTGATAAATAATATTGAGCCGTATCAGAGTCCATAGTTGTCTGTTGAGTGGATGAGCAACAAACATGGAATTTGGGAACTAAAAGAAGGTTGTTCGATAGAGGCTTGGGGGCTAAATTAGGTTTTAGGGTTTGAGCTCATGCCCTTACATGGATCCAAAGTTTTAAGGAGTTGGGTTTATGCCCTCTCATGAAAATATGAGTAAAAAAATGTAAAAGTTCAAATACAAAATAAATAGAAAAGAATACTCGAGTAGGGAATGCATTAGGCCTCTCGGCCATATGCCTTTTTGGGGTTCTTGAGGTGTCTAATTCTTCTAGTCCAATCCCCTGCTGAGGATCCACCTTCCACCTATTGGGCATTTTCCTTCCATGAGTGTATCGCCCATGATTCTATGGCTAGCAAATGTTAGGGGTGTATATCGGTCATTCGAGTCGGTTTTTAGGCCAAAATCCCTACTGACCAACCTATGGTCGGTTTCCATAATTAGAAACCAACTGACCGGGGGAGAAAGTTGAGACGAAGAAGGACATGCATGAAGAAATTCTTAGAAAAAAAGTTGAGACGAAGATTGAGGGAGAAAGATTGTCGACATCGGCATCGGCGACGACATTGAAAAACAGAAGTTGATGAAAGAGGAGAAAAGTTAGGAGAGAAAGATTGTCGACGTTGGCGACAGCTTTAAAAGACAGAGGTTGATGAAGGGGGAGAGATGGCTTAGAGTGAGAGAGGGCAGAGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAGGGTAAAGAAAGCCCTAAATTTTGTTATGCATATATATAATTTTATAATTATATATATTTTTAATAATTAAATTAACAGTTGATCAGTCGGTTTGGACTAAATTTACCATAACCGACTGATCGACCGGTTGGTTTTGTGAACACAAAACCGACTCGACCGACCGACCGGTTTTAGTCGGTTGGGGTGGTTTTTCAGTCACTTTTGTACACCCCTAGCAAATGTTGTGATTTGGCAAGCAATGGTTGTTGGGTTTTGGATCATATCATCATGGGAGTGACCTTGATCACCTGTTGTGGCTCTGTCCTTTCTTAATCTCACTGTACGTGGCTTTTAGGAATGCTTTCAAAGTCAGTTTGGCTCCTCGTTAGTTGATCAGGGATGCTCTTGTTGAGCTATTTCTTCATCCTCCATTCTTGAGGAGAGGGAGGTTTTTATATGATGGATGGGTTTTGTTGGCGTGGTTTGTTCTATTTAATTGGAAGAATTAGGGGTTTTCAGGATAAAGTTGCTTCATGGTAGCATGTTTGGAGTGCATGCACACTTTAATGCCTCTTTGTGGGTATCTATCTACTGTATTTGGACTTCCCTTTTATGATTTCTTGTAACCTAGGAAGCACCGACACGCCAAAATGGGATGGGTGTCGGTGTCGGACACGTGTTCGACACGTGATTAAGGTGTCTGAAATTTTATTTTTTATTTTTAATTTTCGGACACGCAGTGAATACGCGTTTGACATGGACGGGATATGCCAGTGGGTTTTTTCTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCTTGTTAAAGCAAGTGTTTTTAATGAATTTGGACTTCGATATGGTTTTTTAATGAATTATTAGGCCCAAAGCTCATTAAGGTTATGTAAAAGTAAATCTAGTTTTAATTCTCTCCTCCCCTCTTGGAGTCACGCACGCAAGGTCAAATTAAACCTAGTCTATCTTTGGATGAGCCAGAATTGGAAGCCGTAGTTTTTATTGATGATGGGACTCAAATTGGTGAAGATGATACTAATAATGTTAGGGAAAATGTTTAGAAGGCTTTGTTCCATTTTGATTTATAGTTTTTGTTTGTAAGACTTGTTTTATTGGGTATTGGATGTTGTTTATGACATTGATTATTGCATCAATGTTATGTACCTATGGTATTTATGTTGATGTTTAAAGGTAAAAATAGTATTAAATATTGATAATATGAAAAATATGCACACATATATATATTAAAAAAAAATTAACATGTCCCAGTGTGTCGTGTCCTACTTTTTTGGAAATTGACGTGTCGCTGTGTCCATGTCGT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BLAST of MS021916 vs. NCBI nr
Match: XP_022144495.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Momordica charantia]) HSP 1 Score: 930.2 bits (2403), Expect = 6.5e-267 Identity = 447/447 (100.00%), Postives = 447/447 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. NCBI nr
Match: XP_004138893.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 810.8 bits (2093), Expect = 5.7e-231 Identity = 376/444 (84.68%), Postives = 411/444 (92.57%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. NCBI nr
Match: XP_008441766.1 (PREDICTED: phospholipase A(1) LCAT3 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 802.4 bits (2071), Expect = 2.0e-228 Identity = 377/448 (84.15%), Postives = 411/448 (91.74%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. NCBI nr
Match: XP_023546771.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]) HSP 1 Score: 797.7 bits (2059), Expect = 5.0e-227 Identity = 372/446 (83.41%), Postives = 410/446 (91.93%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. NCBI nr
Match: XP_022933151.1 (phospholipase A(1) LCAT3 [Cucurbita moschata]) HSP 1 Score: 795.4 bits (2053), Expect = 2.5e-226 Identity = 370/448 (82.59%), Postives = 410/448 (91.52%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q93V61 (Phospholipase A(1) LCAT3 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LCAT3 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 622.5 bits (1604), Expect = 3.8e-177 Identity = 301/446 (67.49%), Postives = 357/446 (80.04%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q71N54 (Lecithin-cholesterol acyltransferase-like 4 OS=Arabidopsis thaliana OX=3702 GN=LCAT4 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 1.3e-121 Identity = 213/421 (50.59%), Postives = 290/421 (68.88%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NCC3 (Phospholipase A2 group XV OS=Homo sapiens OX=9606 GN=PLA2G15 PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 64.7 bits (156), Expect = 3.0e-09 Identity = 59/211 (27.96%), Postives = 100/211 (47.39%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8VEB4 (Phospholipase A2 group XV OS=Mus musculus OX=10090 GN=Pla2g15 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 63.5 bits (153), Expect = 6.8e-09 Identity = 55/211 (26.07%), Postives = 101/211 (47.87%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q675A5 (Phospholipase A2 group XV OS=Rattus norvegicus OX=10116 GN=Pla2g15 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 60.5 bits (145), Expect = 5.7e-08 Identity = 54/211 (25.59%), Postives = 98/211 (46.45%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1CRS5 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Momordica charantia OX=3673 GN=LOC111014171 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 930.2 bits (2403), Expect = 3.1e-267 Identity = 447/447 (100.00%), Postives = 447/447 (100.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0LHR5 (Uncharacterized protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_2G093800 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 810.8 bits (2093), Expect = 2.8e-231 Identity = 376/444 (84.68%), Postives = 411/444 (92.57%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S3B3Q4 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103485824 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 802.4 bits (2071), Expect = 9.9e-229 Identity = 377/448 (84.15%), Postives = 411/448 (91.74%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1EYB8 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111439951 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 795.4 bits (2053), Expect = 1.2e-226 Identity = 370/448 (82.59%), Postives = 410/448 (91.52%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1IEK6 (phospholipase A(1) LCAT3 OS=Cucurbita maxima OX=3661 GN=LOC111472543 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 793.1 bits (2047), Expect = 6.0e-226 Identity = 368/446 (82.51%), Postives = 411/446 (92.15%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. TAIR 10
Match: AT3G03310.1 (lecithin:cholesterol acyltransferase 3 ) HSP 1 Score: 622.5 bits (1604), Expect = 2.7e-178 Identity = 301/446 (67.49%), Postives = 357/446 (80.04%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. TAIR 10
Match: AT4G19860.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 438.0 bits (1125), Expect = 9.4e-123 Identity = 213/421 (50.59%), Postives = 290/421 (68.88%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. TAIR 10
Match: AT1G27480.1 (alpha/beta-Hydrolases superfamily protein ) HSP 1 Score: 67.0 bits (162), Expect = 4.4e-11 Identity = 78/313 (24.92%), Postives = 121/313 (38.66%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. TAIR 10
Match: AT3G03370.1 (BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DegP protease 7 (TAIR:AT3G03380.1); Has 55 Blast hits to 55 proteins in 11 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 55; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 1.9e-06 Identity = 25/50 (50.00%), Postives = 36/50 (72.00%), Query Frame = 0
BLAST of MS021916 vs. TAIR 10
Match: AT3G03370.2 (FUNCTIONS IN: molecular_function unknown; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 13 plant structures; EXPRESSED DURING: 7 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: DegP protease 7 (TAIR:AT3G03380.1). ) HSP 1 Score: 51.6 bits (122), Expect = 1.9e-06 Identity = 25/50 (50.00%), Postives = 36/50 (72.00%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Bitter gourd (TR) v1
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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