MELO3C005957.jh1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41
Overview
Sequences
The following sequences are available for this feature:
Legend: exonstart_codonCDSpolypeptidestop_codon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.GAGATGGCATAGCAAAGGTGGGAAAGTTTGGTATATAGCTTAGTTTTACAGTAAATTCCAATAAACTAGAAATGGACAGCAGGGCGAATTAAGAGCCCACATGGCCACAACCCGCGAAAATCTGCCCGCTATTTCTTCTCGATTCTCATTCTCACCGCTCCGTCACTCTCGTCTCCTGTTTGTCTATGCAACGCCAGAAACACACAAACAGACAAAACAAGAACAATCCACGAACCGATCGCATCCAGTGACCGCCGGTGAACTCGATCATGGCTCAGAACCAGCTCATCGACTCCCTCACCTCCCATATCTCCCTATACCATTCTACATCCCTTCCCCTCAACCCTGATACCAATTCCAATCCCAGGTCCTCCATCCTCAAATGGTTCTCTTCTCTCAGCGTCCACCAACGCCAAGCTCATCTCACGGTCGTTGATTTCAAATTCGTCCAAATCCTCATCCAAATGGTGGCCGAAGTTCGCAGACGAGGACACGGTTTCTTTATCATCCTTCCAGACATTCTCTCCACCGACCCTCTGCACTTACCTAGCTTATGCTTTAAGAAGTCCCGCGGACTACTGTCTCGTGTCTCCGAGTCCAACGAGTCCCAAAGGATGATTTTTGAGTCCACTCGATTATTCGGTTCCAGGGAAGGCGACAAGCTCGAGGAATGTTCTTGTTCGTTGAAGAACATCGATTCTATAACTGTAAGCGAGGAATTCGTCTCAAATGTGGATAAATTCGTCGAGGCGATGGATGGAGTTTCAAATGGAGCGTTTTTGAGAGGTGAAGGGGGTGACCTGGCGTCCCATTGGGCTGAATTAAATTGGTTAAAAGCGAAAGGATACTACAGTATGGAGGCCTTTGTGGCGAATAAGTTGGAGGTGGCTTTGAGATTGTCATGGATGAACTTGAATAATGGAAAAAAAAGATCGGTAAAGTTCAAAGAGAAGGCTACAGCAACTGGCATGGCGACAAACGTGTTTTGGAGGAAAAAGGGATGCGTGGACTGGTGGGATAAATTGGATTATTCATCAAGGAAAAAAATTCTGACTGCAATTCTGGGGAAATCAGCAAAAAATTTGGTAATTCTGGGAACAGTACATGTTGTCCATCTTGTGTGCTTATTTAGTTGAAGCCGTTACAAATTATTTCACCATACTCGGGTTTCTGGTGCTTAATCCCTTTGTCTTCCTACTCAAAATATTATGGTCGATTATGTGGATTGAGATTATTTATTTATTCTTAATTTTTTAAATTTAAATTTAAATTTTAATTTAAATTTTGTTGTCGTTGTTGTTGGTTAAAAGCTAAGTCGAAAGAAAGTTGTTGGTATAAATGAAGATATTGGATTCGGATACATCTTAGGACAATTAGAAGCTTTATCACTTTCAATAGTAAGTTGAGGGGTAGGATTTTGGATTGTCCCCTACATCTTCTTGCTGTTTGGTAGATATTTTGAGTATAATGATATCAAGGGAAGTGATCCTAAGTCTGTTTCTTTGTGAGACTCTGTGGTGGATAAAGTTGGAAGCTGGTCAACCTCTTGGAAGAAAGGTTTCTTTTCTCAAGTAGGCATACTTATCCTAATCAAGTCTGTCTTAATCACATTCCTGTTTTATCCTTCTCACTTTTCAGGGTCCGTTTGAGGTGTCTAAGTGTTTGGAGAGATTGATACGTGACTCCCCCTAGGAAGGATTGCCTAAGGGAAAGGCAAAGGTTCACACTTGATTAAATAGGAGTTTAATGAGAGATTGATTTATTTGGGGAGTTTGGAAATCGAGAATCTTAGGATGTGTAACAAAACCCTTTTTAGCCAACTGGTTGCGGTGCTTGTCATGAGCCAAATTCATTGTGACGTTGGATCATTTCTTGTAAACATGTTCCCCATACTTTTAGGTGGTTGCCTAAAGGTATTAAAGGTACTCACAGGAATTTGTGGAGAGAAATTTCGAAAGCTTCTTTCATTCACTTGGTCCATTTTGTGGTGGGGGAGGGAAGAGATGCATACTTTCGGGAAGATCACTGGGTGGGGGAGAGTGCTTTTTGTGTCTTGTTTATTTGATTGTATCATCTGTCATCTTTTAAAAATCATTTCGTTGTTGATTGTCTATGTGGTCTAGGAGCTATTGTACCTTTTCATTCGAGTTTTGTTGTCCTCTTTCCGATAGGGAGACAATGGATGTAGTTCCTCTTCTTTCTTTACTCGAGAGTCACCCCTTTAGGTTGGGGAGAAGAGATGTCACATTTTGGAGCTTCAATCCTTTGGAAGGGTTTTCGTGGAAGTCTCTTTTTCAATGTTTGGTTGATCCTTCCTCCTTAAGCGTGTCTGTCTTTTTGGTGCTTTAGAGGATCAAGGTCCTTAGAAAGATGAGGTTCTTTTCTTGGTAGGTTCTTCAGGATTATGCTAACACGTTGGATAGGCTTCTTAGGATTCCTTGTTGGGTCTTTTTGTTGTATTCTTTGTCATAATGGAAAAGAATACTTGTACCACATTCTTCGAAGTTGTGACTTTGTGTGTGATGTTTAGGATTCTTTTTGGGCCTTTGCATGTCTTAAGTTGACTTATTTTAAAGGGGCTGAAAGGAAATATTATCGAGCCTTTTACGGTTGATTCAAACAAGGTGGCCTTGTTGCATCTTCAGTTTGCTGATGATACAATATTGTTTTGCTTGGGCAGAAAGGAGTCTTTCTTGACCCCTTAATCATATGGTGATGTTCTTTGAAGCCATGTCGAGTCTTAAAATCAACAGGAGTAAGTGCCAAATTTTGGGATTAATAGCAATCACGATAAGCTTAGGAGATTGGCGGAGGCGCTTGGTTTTGAAGTTGGTACTTTTCCTTCTTCCTACCTTGGGCTCCTTTTGTAAGGTAACCCAAGAGCTACGTCTTTTTAGAACCCTATTTTCTAGAAGTCCTGGAAGAGGTTAGCTTTGTGGAAGAAAGGTTTTTTTTTTTTCTTCTCTAGAACAGGTATGCTTACTCTGATCAAATTGGTGCTCAGTGGCATTCCTGTGTATTTTTTTCTCCCTTTTTTGGGTTTGTAGTTCAGTTTGTAAGTGCATGGAGAAGTTTATGAGAGATTTTCTTTGCGTAGGAGTAAGTGAAGGGAAGGGCTCTCATTTGATCAATTGGGAGGCTGTTGGTTGTCTTGTCAACTAGGGGGGTTGGAGTGGCAATTTAAGAATTCATAACAAGCTTTGTTGGCTAAGTGGCTTTGTGTTTCACCCTTGAGCATGAATCTTTGTGGTCATATCATAGCGAGTAAGCGTGACAACCGCTCTTTTGATTGGGTGCCAAAAGGGGTAAAGGCAAAACATTGGAACCTATGGAAAGACATGTCGCTTGAGCTTCCCACATTCACTTGGTTTTTTTGTGTTGGAGGGGACGATAAGGACATGTATTTGTGGGAAGATTTGTGGCGAGGGATAGTTCTCTTTCTTCTATTTTCCCCATCTCCATCATTTGTCTTCCTTTAAAAACCGTTTGGTCTCAAATTTCTTGGTTTGGTCTAGGAACTCTATGTCTTTTTCTTTTGGGTTTCTCCGTGATTTGCCCAATGGGGAATGACGAAGGTTGCCACTTTTCTTTCTTCATTTAAGGAGTTCAATTTTAGGGTGGGGAGGAGGGATGTTTGCATTTGGAGTCCAGCGAAAGATTTTTCTTGTAAATCCTTCTTCAGATTGTTGTTGGATTCCTTGCCCATTAGGGAGTTGGTTTTTGATGTGGTTTGGAGGATTAAGATTCCTAAGAAAGGTTAGTTTCTTTACTTGGCTAGTTTTGTTTGGTTGGGTGAACACTTTAGATAGGTTTGCTAGGAGGATGACCTCACTTGTGTAGCCTTTCTATTGTATTCTTTGTTGGAAGGTGGACGAAGACCTGGATCATCTCCTTTGGGCCTCAATTTGACTTCTTGTAATTATTCTATAGGTGTGATTTCACATAGTTGGAGTACCTTCTTGTAAAGGGAGTCCACTTTTTTTTGTTGGACTTGGTTTTATGCCAGTTTTTTTTTTTCTCAATGTAAGTTGTTAATTAGAAAAAAAAAAAAAAGATATATCAAGAGAAGTGAAGAGTGATATACTTGAGCGAGGGGCTTCAGGTAGTATGGAATAATATTTTCTCATCTTATCTCCAGTTTGCAGATGATATCTTTGAAAGCCTTTGTAATTTATCTCTGGTACTTTTTCAGCTTTGGCTCTTTTCATTATAAATGAAAAGTTTTAGTTTCCTTAAATAAAAAAGAAAACAAGAAGATAAAACTACGCTTGGTAACTAATTAACTAACTTAGCTGACGAGATACCAAACTATTTCATTAGGACTTGCTAATCAAGGTAACTACAAAAATATCCCTAACAAGCTTACATCATTCTTCTTCCCTAAAAAATTTAACTTATGTTTAATTTTGATACGTGTACAGCAGGTTTGAGATCTATCACCATATTTCAGCTAACTTTCAGTCGTTTTTTGAGTTTTCAGACGCATGAGATTCTGAGATGGACAAGTGGACTTGCGGAGCATGAGATGGGGCTCTTTAGTGCTGAATGGAATAGACCATTTAGGTACAATTGTACTACATCTCCACCTAGGTCCATGTTAACATCCCAGGCGGACTTGCATATTGACTTCAACATAATTCCGGCTACCCATTCTGGAAAACCTTATTTGTTAAGCAATATCTTTAGAAATTTGCTTGTGCTTCAGGATATTGTTACGATGGTATCATCGTGTCTTCATGATGAATACTATAAGTGTAATCTATTTTATAGCACTTTGGGTTCTATCTGTGCCATCCCTGATTGTATATTAAGAAAATTGCGGGAATTTCTTATGTTTATTTCACTTGATTGCACGAAATTTGAGCTTCTAGGAGAGGGGAATAGTAAGTCCTTTCCAAGTAAATCAAGAGAGCATGTAGGTGCTTCCAGTAGAAGGAAAAAGGGAAAGAGCCGGAAATCACAGAATCCTGTGCTGAGGGCATGTGTAGATGATT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MLSILCAYLVEAVTNYFTILGFLTHEILRWTSGLAEHEMGLFSAEWNRPFRYNCTTSPPRSMLTSQADLHIDFNIIPATHSGKPYLLSNIFRNLLVLQDIVTMVSSCLHDEYYKCNLFYSTLGSICAIPDCILRKLREFLMFISLDCTKFELLGEGNSKSFPSKSREHVGASSRRKKGKSRKSQNPVLRACVDDLSSNNFMKRQEYDKECGHRGGEVMTDSTTMSIMSKGNETCREIPADVSKTVHDQKMSVGKDQGSVRKKKKHKSKNSGGNSRLVEIRPSVGPAVKFSSPSFSSQDQVAELDKDSIFIKPSISNIKNDSTNNFDSSTVISSPLVLSNEPNREYESILNIEVHEVSGITKSVCQIGPGESQFSKGIIENQFLSSTMENSSSFMDCSAVPSHLPSLELKNIVKSDVNVKSSVRTCELGDKSSLLDKLPRTIDVKEKSCSSRHRFSGDTCNARTLNPLEHSPYEWHGVASLYIPSFNSHLPPATDRLHLDVGHNWHNHFRRSFTPAMHQSRNSSAKGGCNPILTRPLLMSLDWPPVLRSASGLASTMTSNHDIGFLSRRQSTFCQGFPNSSSQISTEDEKYSGKLTDFPDLSNNQDLADECDGNWISEEELEMHAVSGIDYNQYFGGGVMYWNPSDHHGTGFSRPPSLSSDDSSWAWREADMNRTVDDMVAFSSSYSNGLTSPTATSFCSPFDPLGSGKQALGYVVQGTDIPNNMLHSSTTMKDTVTEEDDPRSLPNFSSDVEGKAGDSHSFPILRPIVIPSMSRERSRSEFCHGYDHKSPCIPPTRREQSRVKRPPSPVVLCVPRAPIPPPPSPVSDSRKHRGFPTVRSGSSSPRHWGVKGWYPDGTNLEEACLRIDGAEVVWPNWRNKSNSNCSTVQPLSLIAVPQIALDQEHPDVAFPLFPPTISCSVKKESLSLMHNRLHDEIDSFCKHVAAENMAKKPYITWAVKRVTRSLQVLWPRSRTNIFGSNATGLSLPTSDVDLVVCLPPVRNLEPIKEAGILEGRNGIKETCLQHAARYLSNQEWVKSDSLKTVENTAIPIIMLVVEVPHDLITSSTSNMQSPKEESSAVSGEQDTNNLNDMASLEDSVLPKCLEVNYDSSISTKSVRIDISFKTPSHTGLQTSELVKELTEQFPATIPLALVLKKFLADRSLDQSYSGGLSSYCLVLLIIRFLQHEHHLGRPINQNFGSLLMDFLYFFGNVFDPRQMRISIQGSGVYIKRERGYSIDPLHIDDPLFPMNNVGRNCFRIHQCVKAFSEAYSIMESVLISLHDHGDASSDATNRMLQKIIPSIDLS Homology
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_016899000.1 (PREDICTED: LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103483113 [Cucumis melo]) HSP 1 Score: 2605 bits (6753), Expect = 0.0 Identity = 1293/1297 (99.69%), Postives = 1296/1297 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_011650624.1 (uncharacterized protein LOC101221970 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_011650626.1 uncharacterized protein LOC101221970 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031737476.1 uncharacterized protein LOC101221970 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031737477.1 uncharacterized protein LOC101221970 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031737478.1 uncharacterized protein LOC101221970 isoform X1 [Cucumis sativus] >XP_031737479.1 uncharacterized protein LOC101221970 isoform X1 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2514 bits (6516), Expect = 0.0 Identity = 1247/1283 (97.19%), Postives = 1266/1283 (98.67%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_031737480.1 (uncharacterized protein LOC101221970 isoform X2 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2505 bits (6493), Expect = 0.0 Identity = 1245/1283 (97.04%), Postives = 1264/1283 (98.52%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. NCBI nr
Match: KAA0048824.1 (hypothetical protein E6C27_scaffold171G00370 [Cucumis melo var. makuwa]) HSP 1 Score: 2504 bits (6490), Expect = 0.0 Identity = 1239/1245 (99.52%), Postives = 1242/1245 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. NCBI nr
Match: XP_031737482.1 (uncharacterized protein LOC101221970 isoform X3 [Cucumis sativus] >KGN56351.1 hypothetical protein Csa_009959 [Cucumis sativus]) HSP 1 Score: 2502 bits (6484), Expect = 0.0 Identity = 1243/1283 (96.88%), Postives = 1262/1283 (98.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q5XG87 (Terminal nucleotidyltransferase 4A OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TENT4A PE=1 SV=3) HSP 1 Score: 127.9 bits (320), Expect = 8.5e-28 Identity = 108/374 (28.88%), Postives = 165/374 (44.12%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q8NDF8 (Terminal nucleotidyltransferase 4B OS=Homo sapiens OX=9606 GN=TENT4B PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 1.1e-27 Identity = 104/385 (27.01%), Postives = 168/385 (43.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q68ED3 (Terminal nucleotidyltransferase 4B OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tent4b PE=1 SV=2) HSP 1 Score: 127.5 bits (319), Expect = 1.1e-27 Identity = 104/385 (27.01%), Postives = 168/385 (43.64%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q6PB75 (Terminal nucleotidyltransferase 4A OS=Mus musculus OX=10090 GN=Tent4a PE=2 SV=2) HSP 1 Score: 126.7 bits (317), Expect = 1.9e-27 Identity = 100/358 (27.93%), Postives = 158/358 (44.13%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy Swiss-Prot
Match: Q7KVS9 (Non-canonical poly(A) RNA polymerase protein Trf4-1 OS=Drosophila melanogaster OX=7227 GN=Trf4-1 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 125.2 bits (313), Expect = 5.5e-27 Identity = 103/379 (27.18%), Postives = 167/379 (44.06%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A1S4DTH3 (LOW QUALITY PROTEIN: uncharacterized protein LOC103483113 OS=Cucumis melo OX=3656 GN=LOC103483113 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2605 bits (6753), Expect = 0.0 Identity = 1293/1297 (99.69%), Postives = 1296/1297 (99.92%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5A7U0K0 (NTP_transf_2 domain-containing protein OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E6C27_scaffold171G00370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2504 bits (6490), Expect = 0.0 Identity = 1239/1245 (99.52%), Postives = 1242/1245 (99.76%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A0A0L8A8 (NTP_transf_2 domain-containing protein OS=Cucumis sativus OX=3659 GN=Csa_3G116880 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2502 bits (6484), Expect = 0.0 Identity = 1243/1283 (96.88%), Postives = 1262/1283 (98.36%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A5D3DAZ6 (Nucleotidyltransferase family protein isoform 1 OS=Cucumis melo var. makuwa OX=1194695 GN=E5676_scaffold291G00370 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2492 bits (6458), Expect = 0.0 Identity = 1235/1245 (99.20%), Postives = 1238/1245 (99.44%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. ExPASy TrEMBL
Match: A0A6J1E931 (uncharacterized protein LOC111431966 isoform X8 OS=Cucurbita moschata OX=3662 GN=LOC111431966 PE=4 SV=1) HSP 1 Score: 2290 bits (5935), Expect = 0.0 Identity = 1140/1285 (88.72%), Postives = 1193/1285 (92.84%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT4G00060.1 (Nucleotidyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 1133.2 bits (2930), Expect = 0.0e+00 Identity = 664/1312 (50.61%), Postives = 826/1312 (62.96%), Query Frame = 0
BLAST of MELO3C005957.jh1 vs. TAIR 10
Match: AT5G53770.1 (Nucleotidyltransferase family protein ) HSP 1 Score: 107.8 bits (268), Expect = 6.5e-23 Identity = 91/348 (26.15%), Postives = 147/348 (42.24%), Query Frame = 0
The following BLAST results are available for this feature:
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
Relationships
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
GO Annotation
GO Assignments
This gene is annotated with the following GO terms.
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