MELO.jh001703.1 (gene) Melon (Harukei-3) v1.41

Overview
NameMELO.jh001703.1
Typegene
OrganismCucumis melo var. reticulatus cv. Harukei-3 (Melon (Harukei-3) v1.41)
DescriptionUnknown protein
Locationchr01: 24747623 .. 24754774 (-)
RNA-Seq ExpressionMELO.jh001703.1
SyntenyMELO.jh001703.1
Sequences
The following sequences are available for this feature:

Gene sequence (with intron)

Legend: exonCDSpolypeptidestart_codonstop_codon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
AAGTACTTACATTATCAACAACCTTATTTTGGATTGAGAATGCTTTATCACAAGTTAAGGTAAGTTGAGTGTTGACATCTGTTCTACAACTTTTATACTGTAACGAACCAACTTTTCGGACTAAGCTGAGGTTACTACTACATACCAAAACTCGACCACACAACATAAAATTTATAACGGACCGGTTACGATTTCTTAAAACGTTAGAAATATTACAAAAAAAAAAAAAAGTTTCAGGCCCTATTTGAAATCACAGTCACAAAAGTTTCAAATAAAAACTCAAGTCATCAGTTCAAAATCACAAACCAAATATTCTGACAAAAATACATAGCGGAAGCAATAAGAAAACCAGACGCGTCCATATGGCCTTCACGCGTCCTTCCCCGCTCGTCTGGCTCCTCTCACCGTGCCCTTACCTGAAAAGTTTAAGAAGAGAAAAGGGTGAGTATAAACATACCCAGTAAGGGACCCACTACTGGGCCCGTTAGGGAACAACAGTTAACTTCCTATTCAGGGGTACCCTACATAAAAAAAGATGGATGAGGGGTGGGTCTCGCGCGCGTTTTAGGGTTTAATTTTAAAAAAAAATTATTATTATATATATATATATAACTTTTAATAATTATAAATAATAATAATAATAAATAAAATATTATTATATATATATATATATATATATTAACTTTTAATAATTATAATTAATAATAATAATATATAAAATATTATTATATATATATACATATTAACTTTTAATAATTATAATTAATAATAATAATATATAAAATATTATTATATATATATACATATTAACTTTTAATAATTATAATTAATAATAATAATATATAAAATATTATATATATATATATATATATATATATATATTAACTTTTAATAATTAATTAATAATAATAATAATAATAATAATACTAATAATAATAATAATAAAAGATAATATTAATATTAAATTATATATAAAGGTTATAATAAATGATAATAATAATAATATAATTACTATTATATTATTATTATATAAATTTACAAATATTAATTTCAGAATTTCAGAAATTAATCCAAAATTTAACATTCCCGAAAAATTATGTAAAACGATAAAAGTTTACCTCGAAAATTCGGGGCGTTACATTCTTCCCTCCTTAGGAAACTTTCGTCCTCGAAAGTTTTATTCCTTGAACAGTTCGGGATAACGGGACCTCATGTCATCTTCACGCTCCCATGTAGCCTCTTCTACCCGGTGATTCCGCCATAAGACTTTAACCAAAGGGATTTCTTTATTCCTCAACGTTTTCACCTCCCTAGCAAGCACCTCAACGGGTTGTTCAGCATAGCTCAAGTTTTCATCAATCTCCAGTGGCTCGTAATCCACTACATGGGATGGATCTGGCACGTACTTCCTCAACATAGAAACATGAAACACATCATGAACTGTCGAGAGTGATGGTGGCAACGCCAAGCGATAAGCTACAGGGCCAATCCGCTCCAGAATCTCAAATGGCCCAACAAAACGGGGACTCAGCTTTCCCCTCCTTTCAAATCGTAAGACACCTCTCATAGGTGCTACCTTTAAGAACACCTTGTCCCCTATCGCAAATTCGAGATCCTTCCGCCTCACATCTGCATAACTCTTCTGCCTACTCTGAGCGGTATGCATGCGTGATCTAATCTTCTGTATCGCTTCGTTAGTAGACTGAACTAACTCCGGACCCATCAAACTCTGCTCACCCACCTCACCCCAGCAAACTGGGGATCTACAACATTTGCCGTACAAGGCCTCAAATGGTGTCATGCCAATAGTAGCCTGATAACTGTTATTATAAGCAAATTCCATCAAATGTAAGTGGGAGTCCCAGCTACCTGGAAATTCCAATGCACACGCTCGCAACATATCCTCTAAAACTTGGTTCAGACGCTCAGTCTGACCGTCAGTCTGTGGATGGAAAGCTGTACTAAAGTCTAACCTCGTGCCCATAGCCGTCTGCAAACCCTTCCAGAATTTGGAAGTGAAACGGGCATCTTTATCAGAAACAATCGACTCTGGCACTTCGTGTAATCTCACTATTTCAGACATGTACAGCTGTGCCCACTTACTAGCAGTATAGGTGGATTTACCCGGAACGAAATGCGCTGATTTGGTAAGTCTGTCCACCACAACCCAAATCACTGTAAAACCCCTCAGAGTTCTCGGCAGTCCTGTAATGAAATCCATGGACACGTTTTCCCACTTCCATTCCGGTATGCTCAAGGGTTGTAATAAACCCACTGGTTTCTGCCTTGGTGCCTTAACCTGCTGACACACCAAGCATTTACTAACAAATTCTGCTACCTCCCTCTTCATGTTACGCCACCAATAAACCCGCTTCAGGTCCTGATACATCTTCGTACTACCTGGGTGCATGGAAAATGGGGAACTGTGAGCCTCAGATAATAATTCTGTCTTAGCCGCACTATCCGACGGCACACAAAGGCATCTCTCAAACAAAAGTCCGCCATCAGAGGATAATGAGAACTCAACCGCTTGCCCTGCCTCTGCTAGGCTACGTTTCTCAACCAAATAAGGATCGTTACCCTGAGCATCAATGATCCTTTGCCTCAAGGTCGGCTGTACCGTCAACTGGGCTAACTGCATAGTGACTGCCCCCACTGACACTGCAATCTCAGCCCGCTCGAGATCCCGATGCAATGGGGCCTGTCGGGTAATAAGTGCTGCCGAATGTGATACCTTTCTACTAAGAGCATCAGCTACCACATTTGCCTTGCCTGGATGATACAGTATCTCACAATCGTAATCCTTCACTAACTCAAGCCACCTTCGCTGTCTCATATTCAATTCTTTCTGAGTAAAGAAGTATTTCAAGCTCTTATGATCCGTGAATATCTGTATCTTTTCACCATATAAGTAATGCCTCCATATTTTCAAAGCAAAAACCACCGCTGCCAACTCTAAATCATGTGTAGGGTAGTTCTGCTCATGACTCTTCAACTGACGAGACGCATAAGCGACCACCTTACCCTGTTGCATCAAAACACAACCCAAACCCTTCTTGGAAGCATCACTATAAATCACAAAACTGCCAGAACCATCAGGTACAGTAAGAACCGGTGCGGTAACTAGCTTCTGTTTAAGGTTCTGGAAACTGTCCTCACATGCCTTGCTCCAAACAAAAGGAGCTCCCTTCCTGGTCAACTGAGTAAGAGGAGTAGCTATACGAGAAAAGTTCTCCACAAACCGTCGATAATAACCTGCTAAACCCAGAAAGCTACGAACCTCACTGACTGTGGAAGGTCGGGTCCAACCGGTGACTGCCTCTATCTTAGCTGGATCCACAGAGACTCCAGCCTTAGAAACCACGTGGCCCAGAAAGGACACCTGCTTCAGCCAAAACTCGCATTTCGAGAACTTTGCATACAACTTATTATCCCGAAGTGTTTGCAAAACCATACGTAAATGCTCCTCATGTTCGGCCTCCGTCTTGGAGTATATCAAGATATCGTCGATAAACACGATCACAAAAGTATCTAGGAACTCCCTAAACACTCTGTTCATCAAGTCCATAAACACTGCCGGAGCATTCGTCAAACCAAAAGACATCACAATAAACTCGTAGTGTCCATATCTGGAACGAAATGCTGTCTTCGGTACATCACCATCCTTAATCCTCAGCTGATGGTATCCCGACCGAAGATCAATCTTAGAGAACACTGTGGCTCCCTGTAACTGGTCAAATAGATCGTCGATCCTGGGCAAGGGATATCTGTTCTTTACGGTTACCTTGTTCAACTCCCTATAGTCAATGCATAGACGCATCGATCCATCCTTCTTCTTAACGAATAAAACTGGCGCACCCCAAGGTGACACGCTCGGTCGAATGAATCCCTTATCAAGCAATTTCTGTAACTGCACCTTCAGTTCTTTCAGCTCTGCGGGGGCCATTCTGTAAGGGGCTCTGGATATAGGAACCGTGCCCGGCTCCAACTCTATGGCAAACTCAACCTCTCTGTGCGGAGGTAACCCCGGAAGTTCTTCAGGAAAGACATTCGGATAGTCTCTCACCACCGGAACCAAATATTCTGACAAAAATACATAGCGGAAGCAATAAGAAAACCAGACGCGTCCATATGGCCTTCACGCGTCCTTCCTGCCTCTCGTCGGTCTGCCCCTCGCTGTGCCTTTACCTGAAAAGTTTGAGAAGAGAAAAGGGTGAGTATAAACATACCCAGTAAGGGACCCACTACTGGGCCCGTTAGGGAACAACAGTTAACTTCCTATTCAGGGGTACCCTACATAACAGTCTAGTGGTTCCGTAGAACGCACATATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCGGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACACATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACACATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACACATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACACATCAGTCTAGTGCTCCCGAAGGATGCACATATCAGTAAGGCACACTACCCCATAGATGAAGCTAACTGTTACCCCTCAGTCCATACTAAACCGTCTACAACAGTCATACCCCATCAACACTCATATTACAAATTCGCCATAGGCTTTACCAGTCAGATAGTACAGGTTTAAACAACTACACCCTCAGTTGCCATACGCGTTTCCAATTCGCACACCATTATGGTAACCCCTAGACCCAATCAACTAATCAATCAAAATCGGATTCACTGTCCTTCCCCGTCCAAACTCCATGATCAATGTCCAGACCAATGACTACCACGTACCTAACCGTAACTTCAAGGTCCATCGACATACAATTCCAATCTACCACGTAGCCCATTAACATAACCACACTATACCGGACATCCAGCATCGGGGTCTATTAGCAAGCAACTCCTTATACCCGATAGCGTACAAGTTACAACTAGCGGTCGCGTTACTCTTACATCGGACAAGAATATAATAAAAATGCTTAAAAGTCA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mRNA sequence

AAGTACTTACATTATCAACAACCTTATTTTGGATTGAGAATGCTTTATCACAAGTTAAGTTAAGCTTTAAAACTACTCAAAGAAAACAAGTATTAAACAAAGAAGAGTCCTAGTAATATATGAAAGAGCAACAACGAACAAGGACGTCAAGTACAAACATGCGTCCATCTGATACTATTCAATATAATTTCCTGTGAATAAGTAAACTGTACCATCTGATACTATTGAAGAGTGTGGAGCACAACGGCAATAACCAAGCCTTGTTCTTCACTATTTTTCACCTTTTTTCCTATTCACACATTTTATCAAACACCTTCTAGGCCCTCTCTCTCCGTAAAAATAAATAAAATATTTTAAATTTTAAAAATAATTCTTTTATGACTAGTATTTCATCCTTTATTTGCCATGAAAAATAAAGTAAAAGATGGATAAAACATGG

Coding sequence (CDS)

ATGAAAGAGCAACAACGAACAAGGACGTCAAGTACAAACATGCGTCCATCTGATACTATTCAATATAATTTCCTGTGA

Protein sequence

MKEQQRTRTSSTNMRPSDTIQYNFL
Homology
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of MELO.jh001703.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO.jh001703.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
BLAST of MELO.jh001703.1 vs.
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BLAST of MELO.jh001703.1 vs.
Match NameE-valueIdentityDescription
InterPro
Analysis Name: InterPro Annotations of Melon (Harukei-3) v1.41
Date Performed: 2021-10-25
IPR TermIPR DescriptionSourceSource TermSource DescriptionAlignment
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 7..25
NoneNo IPR availableMOBIDB_LITEmobidb-litedisorder_predictioncoord: 1..25

Relationships

The following mRNA feature(s) are a part of this gene:

Feature NameUnique NameType
MELO.jh001703.1.t1MELO.jh001703.1.t1mRNA